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        一株毒死蜱降解菌的分離與鑒定

        2020-06-27 14:07:57齊芬芳張金霞牛熙
        河南農(nóng)業(yè)·教育版 2020年5期
        關(guān)鍵詞:分離鑒定

        齊芬芳 張金霞 牛熙

        摘要:本研究從受毒死蜱污染的農(nóng)田中取樣,分離得到一株毒死蜱高效降解菌株,該菌株最高能夠耐受1000mg·L-1濃度的毒死蜱,72h對濃度100mg·L-1毒死蜱的降解率為52.34%。通過形態(tài)學(xué)、生理生化和分子學(xué)方法對該菌株進(jìn)行鑒定,確定為枯草芽孢桿菌。

        關(guān)鍵詞:毒死蜱;降解菌;分離;鑒定

        自有機(jī)氯農(nóng)藥在我國限用之后,有機(jī)磷農(nóng)藥(organo-phosphorus pesticides,OPs)就成為生產(chǎn)及推廣使用最多的一種農(nóng)藥,該農(nóng)藥在環(huán)境中降解快、殘毒低,而且具有成本低、藥效高、種類多、藥害小、選擇性高、治理范圍廣、比有機(jī)氯農(nóng)藥容易降解等優(yōu)點。但有機(jī)磷農(nóng)藥在土壤、水體、植物和動物體內(nèi)殘留,可隨著食物鏈的富集進(jìn)入人體,從而影響人類健康。研究有機(jī)磷農(nóng)藥降解對于保護(hù)環(huán)境、促進(jìn)人們健康具有重要意義。

        1971年,首次有研究表明,微生物可降解OPs,由于殺蟲劑二嗪農(nóng)的生物降解,有害病蟲褐飛虱的控制效率有所下降。繼而研究者通過富集、馴化、分離的純培養(yǎng)方法,篩選出多種能夠降解OPs的微生物,包括細(xì)菌、真菌、放線菌和藻類等,并對農(nóng)藥的降解途徑以及代謝方式進(jìn)行了研究。目前,農(nóng)藥的微生物降解是指利用微生物的代謝過程使農(nóng)藥的化學(xué)結(jié)構(gòu)發(fā)生改變,使其由有害的大分子化合物降解為無害的小分子化合物,直至CO2、H2O,實現(xiàn)無害化降解的過程,具有降解速度快、降解效果徹底、環(huán)境影響小、處理成本低等特點。微生物降解作為一種高效清除農(nóng)藥污染環(huán)境生物技術(shù)和目前降解OPs的主要手段,已成為OPs降解的研究熱點。

        本研究以毒死蜱作為目標(biāo)降解物,從自然環(huán)境中分離篩選高效降解菌株,為有機(jī)磷農(nóng)藥微生物降解的進(jìn)一步研究提供菌種資源和理論依據(jù)。

        一、材料與方法

        (一)土壤樣品

        土壤樣品采集于貴陽市某農(nóng)田。采樣深度為510cm。

        (二)主要培養(yǎng)基及試劑

        1、培養(yǎng)基。LB培養(yǎng)基:胰蛋白胨10g·L-1;NaCl10g·L-1;酵母粉5g·L-1;H2O1000mL(pH7.0)。如為固體平板則加入1.5%的瓊脂。將藥品倒入燒杯中,用玻璃棒攪拌使其完全溶解,用1mol·L-1的NaOH調(diào)節(jié)pH值在7.0,再分裝至250mL三角瓶中,至高壓滅菌鍋中滅菌后使用。

        毒死蜱無機(jī)鹽培養(yǎng)基:K2HPO41.5g·L-1;KH2PO40.5g·L-1;(NH42SO41.0g·L-1;NaCl 1.0g·L-1;Mg-SO4.7H2O 0.05g·L-1;H2O 1000mL(pH7.0)。農(nóng)藥按需添加,如為固體平板培養(yǎng)基則加入1.5%的瓊脂。配置好后121℃滅菌20min備用。

        2、主要試劑。毒死蜱原藥購自特安源生物科技公司;40%毒死蜱購自浙江東風(fēng)化工有限公司;無水乙醇、二甲苯、氯化鈉、磷酸二氫鉀、磷酸氫二鉀、鹽酸、石油醚、過氧化氫、氫氧化鈉、肌酸等常規(guī)試劑均為國產(chǎn)分析純。瓊脂糖凝膠回收試劑盒由天根生化科技(北京有限公司)生產(chǎn);引物由賽默飛世爾科技公司合成。

        (三)菌株的富集與初篩

        稱取土樣3g于毒死蜱無機(jī)鹽培養(yǎng)基中,在37℃搖床120r·min-1培養(yǎng)5d,再以10%接種量轉(zhuǎn)入新鮮的毒死蜱無機(jī)鹽培養(yǎng)基中,培養(yǎng)基中毒死蜱濃度(mg·L-1)為0、50、100、200。將最后一次培養(yǎng)液取樣進(jìn)行梯度稀釋,涂布于毒死蜱無機(jī)鹽瓊脂平板,于37℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。待長出單菌落時,挑取同批相比較大單菌落于添加50mg·L-1毒死蜱的LB普通瓊脂平板上連續(xù)劃線5次純化菌落,直到菌落表面顏色、質(zhì)地等形態(tài)特征完全一致,顯微鏡下進(jìn)一步確定純種,對所得降解菌株進(jìn)行保種。將純化菌株接種于100mg·L-1的毒死蜱無機(jī)鹽培養(yǎng)基中,梯度增加毒死蜱濃度至1000mg·L-1,篩選高效降解菌株。

        (四)高效降解菌株的篩選

        1、標(biāo)準(zhǔn)曲線的制定。根據(jù)毒死蜱在波長為292nm時有紫外特殊吸收峰的特性,通過分光光度法來確定在波長為292nm時樣品的吸光值。以石油醚為溶劑,配制1000mg·L-1的毒死蜱母液。再根據(jù)需要稀釋成濃度(mg·L-1)為20、40、60、80、100、120、140、160、180、200的待測溶液。以石油醚為空白對照,采用紫外分光光度計在波長為292nm時測定吸光值,記錄毒死蜱濃度和對應(yīng)的吸光值,重復(fù)三次。然后以毒死蜱濃度為橫坐標(biāo),吸光值為縱坐標(biāo),繪制毒死蜱的標(biāo)準(zhǔn)曲線,求得回歸方程和R2。

        2、降解菌種子培養(yǎng)液的制備。在LB液體培養(yǎng)基中富集篩選出的高耐藥性菌株,當(dāng)菌液達(dá)到對數(shù)增長期時,吸取1.5mL培養(yǎng)液至離心管中,以10000r·min-1離心1min收集菌體,用0.9% NaCl洗滌,分別懸浮于無機(jī)鹽液體培養(yǎng)基中。

        3、降解菌降解率測定。將毒死蜱母液稀釋成100mg·L-1,過濾除菌,加入到100mL滅菌無機(jī)鹽培養(yǎng)基中。以10%的接種量將種子液加入到100mg·L-1毒死蜱無機(jī)鹽培養(yǎng)基中37℃120r·min-1培養(yǎng)3d,以未加菌的毒死蜱無機(jī)鹽培養(yǎng)基作為空白對照,培養(yǎng)好的菌液為待測樣品。每處理重復(fù)三次。取待測液體培養(yǎng)基50mL,加石油醚50mL,振蕩4min,靜置分層;重復(fù)提取兩次,合并兩次提取液后吸取上清液用紫外分光光度計測取其OD292值,根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線得出培養(yǎng)液中毒死蜱的質(zhì)量濃度,計算毒死蜱的降解率,以確定高效降解菌。降解效率公式為:

        (五)高效降解菌株的鑒定

        1、形態(tài)學(xué)鑒定。將菌株劃線于LB瓊脂平板上,37℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)16h,挑取單菌落進(jìn)行革蘭氏染色,鏡下觀察菌體。

        2、生理生化鑒定。參照《常見細(xì)菌系統(tǒng)鑒定手冊》和《伯杰氏細(xì)菌鑒定手冊》的方法,對篩選得到的高效降解菌進(jìn)行生理生化試驗鑒定,包括葡萄糖發(fā)酵、乳糖發(fā)酵、蔗糖發(fā)酵、山梨醇發(fā)酵、淀粉水解明膠液化、MR、過氧化氫酶、V-P、檸檬酸鹽利用、接觸酶、氧化酶、硝酸鹽還原和吲哚試驗。

        3、分子鑒定。試劑盒提取目的菌株總DNA,16SrDNA特異性引物進(jìn)行擴(kuò)增,引物序列為:P16SL:5'-GAGA-GTTTGATCCTGGCTCAG-3';P16SR:5'-GCCCCCGT-CAATTCCTTTGAG-3'。PCR反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性5min;95℃變性30s,54℃退火40s,72℃延伸50s,30個循環(huán);72℃延伸10min。PCR產(chǎn)物切膠測序。

        測序后的16SrDNA序列在NCBI中Blast比對同源性。選擇同源關(guān)系較近的序列,采用MEGA7進(jìn)行聚類分析,構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。

        二、結(jié)果與分析

        (一)高效降解菌的分離

        以毒死蜱為唯一碳源,從受污染的農(nóng)田土壤樣品中篩選出57株降解毒死蜱的菌株。純化后梯度增加毒死蜱濃度至1000mg·L-1,分離到1株具有高耐藥性的降解菌株,編號為B19。

        (二)降解效率的測定

        采用紫外分光光度法測定標(biāo)準(zhǔn)濃度毒死蜱,以毒死蜱濃度為橫坐標(biāo)(x),毒死蜱在292nm的吸光值為縱坐標(biāo)(y),繪制毒死蜱的標(biāo)準(zhǔn)曲線(見圖1),得線性回歸方程為:y=0.0154x+0.0579,R2=0.9991,結(jié)果顯示在0~200mg·L-1毒死蜱濃度范圍內(nèi)有良好的線性關(guān)系,此線性方程可以用來計算樣品中毒死蜱的濃度。

        將篩選出的高效降解菌株種子液以10%的接種量接種于100mg·L-1的毒死蜱無機(jī)鹽液體培養(yǎng)基中,在37℃、120r·min-1培養(yǎng)72h,利用石油醚萃取后用紫外分光光度計測量OD292,以計算降解率。菌株B19在100mg·L-1毒死蜱中培養(yǎng)72h對毒死蜱的降解效率為52.34%。

        (三)菌株的鑒定

        1、菌株的形態(tài)。通過形態(tài)學(xué)觀察,對菌株B19形態(tài)特征(見圖2a、圖2b)進(jìn)行描述,結(jié)果如下:菌落在LB培養(yǎng)基上為圓形或近圓形,呈皺褶狀,干燥(見圖2a)。制成裝片在顯微鏡下觀察為革蘭氏染色陽性菌,桿狀,末端圓(見圖2b)。

        2、菌株的生理生化特征。對菌株B19進(jìn)行生理生化試驗,特征見表1。結(jié)合生理生化特征,將該菌初步鑒定為枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)。

        3、分子學(xué)鑒定。

        (1) PCR擴(kuò)增。提取菌株B19的基因組DNA作為模板,以16SrDNA的特異性引物進(jìn)行擴(kuò)增,產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳,120v電壓電泳40min,出現(xiàn)900bp左右的條帶,切膠測序見圖3。

        (2)測序結(jié)果分析。將菌株B19的16S rDNA核苷酸序列在NCBI中進(jìn)行Blast比對,結(jié)果表明,菌株B19與枯草芽孢桿菌的同源性高達(dá)99%,說明該菌株在分子系統(tǒng)發(fā)育分類學(xué)上屬于枯草芽孢桿菌,學(xué)名為Bacillus subtilis。對該序列用MEGA7軟件中的鄰接法進(jìn)行聚類分析(見圖4),可以看出其與枯草芽孢桿菌同源性最高,歸為同一支。綜合形態(tài)學(xué)及生理生化特征分析,將菌株B19鑒定為枯草芽孢桿菌。

        三、結(jié)論與討論

        毒死蜱作為我國有機(jī)磷農(nóng)藥中廣泛使用的農(nóng)藥之一,其殘留問題已引起農(nóng)藥界的極大關(guān)注。李文華從蘋果園中分離到三株對毒死蜱具有高效降解能力的降解細(xì)菌HP-1、HP-2和HP-3,將其分別鑒定為人蒼白桿菌,硝基還原假單胞菌:微嗜酸寡養(yǎng)單胞菌。在pH7.2和28℃條件下培養(yǎng)7d,細(xì)菌HP-1、HP-2和HP-3對100mg·L-1的毒死蜱降解率分別可以達(dá)到50.6%、59.5%和45.6%。張群等測定了一株從污染淤泥中分離的高效降解菌寡氧單孢菌對100mg·L-1毒死蜱4d的降解效率約為60%。

        本研究從常年施用毒死蜱農(nóng)藥的農(nóng)田土壤中篩選出1株能以毒死蜱為唯一碳源和能源的高效降解菌B19,該菌株最高能夠耐受1000mg·L-1濃度的毒死蜱,對濃度100mg·L-1毒死蜱72h的降解率為52.34%。結(jié)合形態(tài)學(xué)、生理生化、16SrDNA序列同源性以及聚類分析,將該菌鑒定為枯草芽孢桿菌。

        枯草芽孢桿菌作為一種極具研究開發(fā)潛力的微生物菌種,具有安全、高效、環(huán)保的特點,在環(huán)境污染處理中占據(jù)著重要地位。范迪等研究發(fā)現(xiàn):添加枯草芽孢桿菌和光合細(xì)菌能夠顯著凈化水禽養(yǎng)殖水質(zhì),有效改善養(yǎng)殖環(huán)境。何芝菲從果園土壤中分離到1株枯草芽孢桿菌(Bacillussubtilis),對100mg·L-1氯氰菊酯120h降解率為30.25%,對氯氰菊酯有明顯的降解作用。

        本研究篩選出的對有機(jī)磷農(nóng)藥具有高效降解能力菌株枯草芽孢桿菌B19,來源于土壤,能夠適應(yīng)土壤環(huán)境,可作為有機(jī)磷農(nóng)藥微生物降解的優(yōu)良菌株材料進(jìn)行下一步研究。

        作者簡介:齊芬芳(1986-),女,湖南株洲市人,碩士,講師,研究方向:有機(jī)磷農(nóng)藥微生物降解。

        (責(zé)任編輯 曹雯梅)

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