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        論結(jié)構(gòu)化學(xué)中的量子化學(xué)計(jì)算方法

        2017-05-09 12:55:50張迪
        速讀·下旬 2016年10期
        關(guān)鍵詞:應(yīng)用

        摘 要:相較于傳統(tǒng)實(shí)驗(yàn)室測試來說,量子化學(xué)計(jì)算方法在實(shí)驗(yàn)化學(xué)研究、藥物學(xué)、含能材料等結(jié)構(gòu)化學(xué)領(lǐng)域中的應(yīng)用優(yōu)越性明顯。但需要注意的是,不同量子化學(xué)計(jì)算方法的特點(diǎn)和適用范圍有著一定的差異性,如何結(jié)合實(shí)際情況合理的進(jìn)行選擇至關(guān)重要?;谝陨希疚膹牧孔踊瘜W(xué)計(jì)算方法相關(guān)概述入手,分析了不同種類計(jì)算方法的原理和特點(diǎn),之后著重探討了從頭計(jì)算法、簡單分子與半經(jīng)驗(yàn)分子軌道法及神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)計(jì)算法等其他方法在結(jié)構(gòu)化學(xué)中的具體應(yīng)用,旨在為相關(guān)研究和實(shí)踐提供參考。

        關(guān)鍵詞:結(jié)構(gòu)化學(xué);量子化學(xué)計(jì)算方法;應(yīng)用

        作為研究化學(xué)問題的重要學(xué)科之一,量子化學(xué)側(cè)重于在量子力學(xué)理論指導(dǎo)下,完成問題研究過程。相比傳統(tǒng)實(shí)驗(yàn)室測試化學(xué)反應(yīng)以及儀器設(shè)備的運(yùn)用等,采用量子化學(xué)計(jì)算,可能對瞬間發(fā)生的反應(yīng)進(jìn)行計(jì)算,且對過渡態(tài)或激發(fā)態(tài)幾何構(gòu)型、活性位電荷轉(zhuǎn)移等進(jìn)行預(yù)測。但如何使這些優(yōu)勢充分發(fā)揮出來,仍是當(dāng)前結(jié)構(gòu)化學(xué)應(yīng)用量子化學(xué)計(jì)算方法中面臨的主要難題。因此,本文對結(jié)構(gòu)化學(xué)中量子化學(xué)計(jì)算方法的應(yīng)用研究,具有十分重要的意義。

        一、量子化學(xué)計(jì)算方法相關(guān)概述

        關(guān)于量子化學(xué),其主要通過Schrodinger方程進(jìn)行描述,整個電子體系中的電子結(jié)構(gòu),都可根據(jù)該方程進(jìn)行求解,將復(fù)雜原子體系特性表達(dá)出來。為使描述計(jì)算后的近似解更為精確,需在量子化學(xué)計(jì)算方法上進(jìn)一步簡化。從量子化學(xué)計(jì)算方法常見方法看,主要表現(xiàn)以下幾方面:

        第一,從頭計(jì)算方法。該方法運(yùn)用的基礎(chǔ)主要以軌道近似、Born-Oppenheimer近似與非相對論近似為主,且在基本物理常數(shù)包括電量、電子質(zhì)量以及Planck常數(shù)等,無需參考半經(jīng)驗(yàn)或經(jīng)驗(yàn)參數(shù),便可計(jì)算分子積分,完成量子力學(xué)方程求解過程。由于該算法應(yīng)用下得到的結(jié)果可靠性與準(zhǔn)確度都較高,所以應(yīng)用范圍也較廣。

        第二,簡單分子與半經(jīng)驗(yàn)分子軌道方法。對于簡單分子軌道法,較多如EHMO、HMO等方法都可作為該類型計(jì)算方法,在計(jì)算共軛體系方面極為適用。但需注意由于其包含較多近似內(nèi)容,僅可使簡單分子規(guī)律被推測出來。而從半經(jīng)驗(yàn)分子軌道方法看,間略微分重疊INDO、全略微分重疊CNDO等,都為計(jì)算主要類型。盡管其應(yīng)用下,對有機(jī)物平衡幾何構(gòu)型等計(jì)算都可適用,但由于其計(jì)算結(jié)果在特性上表現(xiàn)為定性、半定量等,所以可靠性、準(zhǔn)確性都難以保障,所以應(yīng)用范圍有一定的限制。

        第三,密度泛函理論。以廣義梯度近似GGA、自然密度泛函近似LSDA等為例,都為密度泛函理論的具體表現(xiàn),在“基”的選擇上,強(qiáng)調(diào)利用密度函數(shù)取代軌道波函數(shù)。從該理論優(yōu)勢看,密度泛函表現(xiàn)出計(jì)算速度快、結(jié)果精確等特征,特別在結(jié)合分子動力學(xué)下,可使理論化學(xué)研究更為深入。需注意的是該計(jì)算方法實(shí)際應(yīng)用中,也難與所有體系相吻合,如相比共價(jià)鍵與氫鍵,應(yīng)用于范德瓦爾鍵體系取得的效果并不明顯。

        第四,其他計(jì)算方法。除上述量子化學(xué)計(jì)算方法外,其他如Xα方法、遺傳算法、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)方法等都較為常見。其中Xα方法一般可作為密度泛函理論中的一種,可使計(jì)算工作量減少,且計(jì)算精確度得到提高。再如遺傳算法,其應(yīng)用中通常以變異、雜交等遺傳算子為指標(biāo),完成計(jì)算過程。此外,神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)算法實(shí)現(xiàn)的依據(jù)多表現(xiàn)在人體神經(jīng)元方面,適用性較強(qiáng)。

        二、結(jié)構(gòu)化學(xué)中量子化學(xué)計(jì)算方法的應(yīng)用分析

        (一)結(jié)構(gòu)化學(xué)中從頭計(jì)算法的應(yīng)用

        從頭計(jì)算方法在優(yōu)勢上主要以可靠性、精確性較高,特別在計(jì)算機(jī)技術(shù)配合下,更使該計(jì)算方法的優(yōu)勢凸顯出來。一般對于晶體、分子或原子等性質(zhì)的預(yù)測、解釋,都可通過從頭計(jì)算方法實(shí)現(xiàn),而其他分子幾何構(gòu)型、化學(xué)反應(yīng)活化能、分子間作用力以及化學(xué)鍵等方面,從頭計(jì)算法的適用性都較強(qiáng)。例如,從頭計(jì)算法以往應(yīng)用下更側(cè)重于對無機(jī)化合物的處理,而當(dāng)前模擬化合物、功能材料、生物大分子以及有機(jī)化合物都可被計(jì)算出來。若實(shí)際計(jì)算中,能夠充分利用HONDO、GAMESS等計(jì)算軟件,更多大分子化合物如金屬原子簇合物、過渡金屬配合物等在計(jì)算中都可利用從頭計(jì)算法。

        (二)結(jié)構(gòu)化學(xué)中簡單分子與半經(jīng)驗(yàn)分子軌道法應(yīng)用

        對于簡單分子軌道法,盡管其計(jì)算近似較多,有一定的局限性,但在量子化學(xué)早期研究中應(yīng)用仍較為頻繁。以氧化還原電勢在有機(jī)共軛分子中的表現(xiàn)、酸堿反應(yīng)涉及的常熟以及定位活性指標(biāo)在有機(jī)反應(yīng)中的表現(xiàn)等,都可利用HMO進(jìn)行研究。對于版經(jīng)驗(yàn)分子軌道法,引入到結(jié)構(gòu)化學(xué)中,對許多如激發(fā)能、反應(yīng)熱、生成熱、原子化熱、電荷分布等,都可適用。但也要注意,雖然其在優(yōu)勢上表現(xiàn)為應(yīng)用范圍廣、計(jì)算工作量少,但最終的結(jié)果不具有較強(qiáng)的可靠性與準(zhǔn)確性,半定量、定性等特征極為明顯,所以該方法應(yīng)用下應(yīng)慎重。

        (三)其他算法應(yīng)用分析

        量子化學(xué)計(jì)算方法中,神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)、遺傳算法以及密度泛函理論等應(yīng)用都較為常見。以神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)為例,在反應(yīng)過程控制以及蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測中氨基酸序列的應(yīng)用等。再如遺傳算法,其最初由Holland提出,經(jīng)過較多學(xué)者研究分析,引入到化學(xué)、生物與材料領(lǐng)域中,尤其在化學(xué)反應(yīng)研究方面該算法應(yīng)用下更能取得良好效果。此外,密度泛函理論應(yīng)用,分子電子結(jié)構(gòu)、催化活性位選擇、電離能計(jì)算方面,都可被分析出來。

        量子化學(xué)計(jì)算方法的應(yīng)用是提高結(jié)構(gòu)化學(xué)研究水平的關(guān)鍵所在。實(shí)際應(yīng)用中,應(yīng)正確認(rèn)識量子化學(xué)計(jì)算方法的內(nèi)涵,將其中密度泛函、遺傳算法、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)、簡單分子軌道法以及從頭計(jì)算法的優(yōu)勢充分發(fā)揮出來,運(yùn)用于結(jié)構(gòu)化學(xué)中,以此使結(jié)構(gòu)化學(xué)研究水平得以提高,推動化學(xué)學(xué)科的整體發(fā)展。

        參考文獻(xiàn):

        [1]王憲位.蛋白質(zhì)分塊量子化學(xué)計(jì)算方法的發(fā)展和振動斯塔克效應(yīng)的研究[D].華東師范大學(xué),2014.

        [2]黃東楓,郭金福.量子化學(xué)計(jì)算在結(jié)構(gòu)化學(xué)課程教學(xué)中的應(yīng)用研究[J].廣東化工,2011(06):245-246.

        [3]顧斌斌,林厚文.量子化學(xué)計(jì)算~1H和~(13)C化學(xué)位移與~1H-~1H偶合常數(shù)在天然產(chǎn)物結(jié)構(gòu)鑒定中的運(yùn)用[J].國際藥學(xué)研究雜志,2015(06):706-712.

        作者簡介:

        張迪(1984—),女,吉林長春人,碩士,助教,研究方向:材料物理與化學(xué)。

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