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        類比思維下“PCR擴增DNA片段及凝膠電泳鑒定”的實驗教學(xué)組織

        2020-12-28 02:31:53孫寶山林偉周業(yè)宇
        中學(xué)生物學(xué) 2020年9期
        關(guān)鍵詞:科學(xué)思維教學(xué)設(shè)計

        孫寶山 林偉 周業(yè)宇

        摘要 運用“類比思維”的邏輯思維方法對DNA復(fù)制過程和PCR擴增過程、光合色素分離與瓊脂糖凝膠電泳實驗進(jìn)行類比,提升學(xué)生的生物學(xué)核心素養(yǎng)。

        關(guān)鍵詞 類比思維 科學(xué)思維 教學(xué)設(shè)計

        中圖分類號C633. 91 文獻(xiàn)標(biāo)志碼B

        1 設(shè)計思想

        類比是指根據(jù)兩個研究對象的相同或相似方面,來推斷它們在其他方面一致性的一種思維方法和推理形式,是科學(xué)思維的重要組成部分。學(xué)生應(yīng)該在學(xué)習(xí)中逐步發(fā)展科學(xué)思維,能基于生物學(xué)事實和證據(jù)采用演繹與推理的方法,說明生物工程與技術(shù)的原理及其與社會之間的關(guān)系。本課主要通過對DNA復(fù)制過程和PCR擴增過程、光合色素分離實驗原理與瓊脂糖凝膠電泳實驗原理等類比,推理建構(gòu)PCR擴增體系,理解物質(zhì)分離的原理,并認(rèn)識分子篩效應(yīng)和電荷效應(yīng)。

        2 教學(xué)背景分析

        本節(jié)課選自浙科版選擇性必修模塊3《生物技術(shù)與工程》,學(xué)習(xí)對象是高三年級學(xué)生。學(xué)生能夠概述DNA分子的構(gòu)成、雙螺旋結(jié)構(gòu)特點、細(xì)胞內(nèi)DNA復(fù)制方式和條件,認(rèn)同化學(xué)反應(yīng)中物質(zhì)和能量守恒規(guī)律,為實驗操作的順利開展和學(xué)習(xí)目標(biāo)的完成奠定了良好的基礎(chǔ)。另一方面,部分學(xué)生存在著DNA分子基本單位是核糖核苷酸、DNA分子復(fù)制是分段復(fù)制、DNA復(fù)制中只有DNA聚合酶參與等錯誤的認(rèn)知,給學(xué)習(xí)目標(biāo)的完成帶來干擾。

        3 學(xué)習(xí)目標(biāo)

        通過細(xì)胞內(nèi)DNA復(fù)制過程和PCR過程的比較,從物質(zhì)和能量觀角度,運用類比思維闡述PCR擴增體系的物質(zhì)和條件。

        通過比較光合色素提取分離實驗和瓊脂糖凝膠電泳實驗,運用類比推理、批判性思維,解釋在電場中不同大小DNA分子分離的原因。

        在小組交流和實驗操作活動中,小組內(nèi)成員主動合作,交流和討論,預(yù)測瓊脂糖凝膠電泳實驗結(jié)果,分析異常結(jié)果出現(xiàn)的原因。

        通過PCR技術(shù)應(yīng)用案例的討論,在科技造福于人類的態(tài)度和價值觀下,形成運用生物學(xué)知識解決社會問題的責(zé)任意識和敬畏生命的觀念。

        4 教學(xué)準(zhǔn)備

        全班學(xué)生分為A1(實驗組)、B1(對照組)、C1(Marker組)、C2(Marker組)共4個小組,選出小組長。在小組活動時,字母相同的兩個小組的活動任務(wù)相同。課前各組學(xué)生完成預(yù)習(xí)實驗方案材料提綱,自學(xué)實驗操作微課視頻。小組長課前th到實驗室配置預(yù)混液和制膠。

        5 教學(xué)過程

        5.1 創(chuàng)設(shè)學(xué)習(xí)情境,激發(fā)學(xué)習(xí)熱情

        教師創(chuàng)設(shè)情境,提出問題:新型冠狀病毒是一種RNA病毒,RNA結(jié)構(gòu)不穩(wěn)定,人們檢測新冠病毒時需首先將RNA逆轉(zhuǎn)錄為穩(wěn)定的DNA進(jìn)行測序檢測,但逆轉(zhuǎn)錄出的DNA含量極其微量。如何用生物技術(shù)和工程的方法,獲取大量具有相同遺傳信息的病毒DNA?

        學(xué)生自由發(fā)言,思考解決病毒基因的擴增和分離問題。

        設(shè)計意圖:教師利用社會熱點事件創(chuàng)設(shè)類比聯(lián)想的問題情境,將情境中隱含的現(xiàn)實問題轉(zhuǎn)變成科學(xué)問題。

        5.2 任務(wù)1:PCR擴增DNA片段及凝膠電泳鑒定課堂實驗操作

        學(xué)生根據(jù)課前任務(wù)分組和課前微課學(xué)習(xí),按照實驗操作流程(表1)進(jìn)行科學(xué)實踐。

        (1)實施PCR擴增(操作時間10 min,等待時間25 min)。學(xué)生根據(jù)反應(yīng)體系在離心管中加入相應(yīng)物質(zhì)后,將離心管放入PCR儀中按照設(shè)定程序進(jìn)行擴增。A1、B1組每位學(xué)生分別用移液器取20 μL的預(yù)混液加入微量PCR管中。將離心管放入PCR儀中,記號筆標(biāo)記后,按照設(shè)定程序進(jìn)行擴增。

        (2)實施瓊脂糖凝膠電泳(操作時間10 min,等待時間25 min)。分別加入不同樣品進(jìn)行點樣,并放入水平電泳槽中進(jìn)行電泳。CI、C2組學(xué)生在一次性手套上分別滴上4滴10 μL上樣緩沖液,分別加入2μL樣品(實驗組2滴、對照組2滴)混勻,點樣,最后分別加入7 μL 2 000 bp Marker和7μL 5 000 bp Marker。調(diào)節(jié)電壓120V,時間25 min進(jìn)行電泳。

        設(shè)計意圖:學(xué)生以小組為單位操作,小組內(nèi)成員根據(jù)課前設(shè)計的實驗方案,在小組長的指導(dǎo)下,使用微量移液器、PCR儀、瓊脂糖凝膠電泳儀等設(shè)備,互學(xué)合作完成實驗操作過程。這個過程可以培養(yǎng)學(xué)生的實驗方案的設(shè)計、實驗工具使用、實驗結(jié)果的呈現(xiàn)等科學(xué)探究能力。學(xué)生在等待實驗結(jié)果的同時,建構(gòu)PCR擴增體系。

        5.3 任務(wù)2:建構(gòu)PCR擴增的實驗體系

        學(xué)生閱讀教材和教師提供材料,運用類比思維,思考PCR擴增的條件和原料,解決以下問題:

        ①細(xì)胞內(nèi)DNA復(fù)制的條件和原料是什么?

        ②PCR過程中的條件和原料是什么?

        學(xué)生代表板書出DNA復(fù)制的相關(guān)條件,其余學(xué)生在學(xué)案上完成,寫出模板DNA、四種脫氧核苷酸作為原料、DNA聚合酶、解旋酶和引物、ATP等。接著,學(xué)生交流討論,比較DNA復(fù)制和PCR過程的異同,解決以下問題:

        ①DNA復(fù)制和PCR擴增的模板DNA是一樣的嗎?有什么區(qū)別呢?

        ②整條DNA分子和DNA片段在復(fù)制上會有什么區(qū)別和影響呢?氫鍵如何打開?

        ③在PCR擴增時需要加入解旋酶打開DNA雙鏈嗎?為什么?

        ④高溫下DNA聚合酶變性,如何讓擴增過程變得可持續(xù)?

        ⑤如何解決這一問題呢?在哪里尋找含有耐高溫的DNA聚合酶?

        然后,教師引導(dǎo)學(xué)生思考PCR過程的能量供應(yīng),回答以下問題:

        ①PCR過程的能量從哪里來?

        ②高溫確實可以提供能量,但這只能給氫鍵斷裂提供能量。形成磷酸二酯鍵需要的能量來自哪里?

        ③體內(nèi)DNA復(fù)制誰提供磷酸二酯鍵形成的能量來自哪里?

        ④為什么ATP能夠提供能量?

        ⑤是高能磷酸鍵斷裂提供能量,PCR體系中為什么沒有加入ATP了嗎?

        設(shè)計意圖:教師引導(dǎo)學(xué)生類比細(xì)胞內(nèi)DNA復(fù)制和體外PCR擴增的過程,從PCR擴增的模板、酶、原料和能量的角度聯(lián)想,引導(dǎo)學(xué)生運用模型和建模、類比推理的思維方式,推理出PCR擴增的條件和原理,建構(gòu)出PCR擴增體系,從而培養(yǎng)學(xué)生的模型和建模、演繹和推理、批判性思維等一系列科學(xué)思維的生物學(xué)學(xué)科核心素養(yǎng)。另一方面,部分學(xué)生認(rèn)為PCR體系中DNA擴增的能量來源于加熱,因此教師引導(dǎo)學(xué)生對dNTP和ArIP的結(jié)構(gòu)進(jìn)行類比,推理出dNTP(四種三磷酸脫氧核苷酸)中含有高能磷酸鍵斷裂提供能量,斷裂后作為DNA合成的原料,幫助學(xué)生形成物質(zhì)與能量觀。

        5.4任務(wù)3:PCR原理的展示與評價

        學(xué)生觀看PCR過程視頻,解說關(guān)鍵過程,解決以下問題:

        ①體內(nèi)DNA復(fù)制需要引物嗎?

        ②設(shè)計的引物在DNA上位置距離較近,對擴增出的DNA有什么影響?

        ③根據(jù)以上的原理,引物設(shè)計時需要注意哪些問題?

        學(xué)生自由發(fā)言,通過DNA復(fù)制和PCR過程進(jìn)行類比,認(rèn)識到PCR擴增的特殊性和相似性,發(fā)現(xiàn)并解決引物設(shè)計的相關(guān)問題,從而認(rèn)同科學(xué)家正是對體內(nèi)DNA復(fù)制過程的模仿,發(fā)明了具有劃時代意義的聚合酶鏈反應(yīng)。

        設(shè)計意圖:教師通過學(xué)生解說PCR擴增視頻,評價課堂學(xué)習(xí)效果,體現(xiàn)出“教學(xué)評”的一致性。在解說中的生生、師生互動,生成問題,在類比的基礎(chǔ)上實現(xiàn)創(chuàng)新,歸納出PCR過程的特點是便捷、快速和靈敏。

        5.5任務(wù)4:理解瓊脂糖凝膠電泳原理,預(yù)測并分析實驗結(jié)果

        教師引導(dǎo)學(xué)生回憶光合色素提取和分離實驗,比較光合色素的提取和分離實驗和瓊脂糖凝膠電泳實驗的異同,思考以下問題:

        ①不同大小DNA分子可以利用溶解度不同進(jìn)行分離嗎?

        ②DNA有哪些特性有助于對其進(jìn)行分離?什么方法可以實現(xiàn)分離?

        ③電泳時選用的介質(zhì)是什么?為什么選擇瓊脂糖凝膠作為介質(zhì)呢?

        ④電泳時除了加入凝膠,還加入了什么物質(zhì)?

        ⑤電泳緩沖液有什么作用?

        學(xué)生自由發(fā)言,類比光合色素的提取和分離實驗和瓊脂糖凝膠電泳實驗進(jìn)行,結(jié)合兩者的相似性和特殊性,認(rèn)識到瓊脂糖凝膠電泳實驗的原理是分子篩效應(yīng)和電荷效應(yīng)。

        設(shè)計意圖:教師引導(dǎo)學(xué)生運用類比和推理的思維方式,比較光合色素的提取和分離與瓊脂糖凝膠電泳原理的差異,歸納出瓊脂糖凝膠電泳的原理和操作原因。

        接著,小組討論,預(yù)測并分析實驗結(jié)果。由小組組長組織,在實驗方案中畫出預(yù)期實驗結(jié)果,并選擇一人匯報討論結(jié)果。電泳組CI和電泳組C2兩位學(xué)生將電泳膠放入DNA圖譜觀察儀器中,利用同屏技術(shù)在展示瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果。

        各小組比較預(yù)期結(jié)果與實際電泳條帶差異,分析異?,F(xiàn)象出現(xiàn)的原因,并解決以下問題:

        ①DNA分子為什么需要放入DNA圖譜觀察儀器中觀察?

        ②如何知道PCR擴增后的分離的DNA片段的長度?

        ③如果希望知道PCR擴增出的DNA含量,可以通過什么辦法?

        部分學(xué)生指出肉眼下難以觀察到DNA分子。教師引導(dǎo)學(xué)生結(jié)合實驗前加入的Red 4S 2.5 μL熒光染料,認(rèn)識到在紫外光下能激發(fā)出熒光。學(xué)生觀察Marker條帶,思考認(rèn)識到的Marker的作用。

        設(shè)計意圖:在學(xué)習(xí)小組組長的組織下,組內(nèi)成員討論交流,畫出預(yù)測的實驗結(jié)果,在正常結(jié)果與預(yù)期結(jié)果的對比中,思考異常結(jié)果出現(xiàn)的原因和實驗的改進(jìn)方向。學(xué)生通過實驗結(jié)果的預(yù)測,提高實驗預(yù)測能力,并在組內(nèi)成員的討論交流中,學(xué)會運用科學(xué)術(shù)語闡明實驗結(jié)果,形成主動合作意識;針對電泳出現(xiàn)的異常結(jié)果的分析和討論中,提高問題解決能力,逐步增強對科學(xué)探究的好奇心和求知欲。

        5.6任務(wù)5:實驗的拓展與應(yīng)用

        學(xué)生舉例說明PCR技術(shù)的應(yīng)用實例。師生共同交流,思考PCR技術(shù)的應(yīng)用實例:化石中的古生物、歷史人物的殘骸,還是幾十年前兇殺案中兇手所遺留的毛發(fā)、皮膚或血液,只要能分離出一丁點的DNA,就能用PCR加以放大,進(jìn)行比對。

        設(shè)計意圖:通過PCR技術(shù)應(yīng)用的案例的探討,學(xué)生能夠認(rèn)識到科技能夠造福于人類的態(tài)度和價值觀,形成運用生物學(xué)知識解決社會問題的意識。

        在本課的教學(xué)組織中,由于DNA分子和PCR過程微觀和動態(tài),而類比推理屬于合情推理,結(jié)論的正確與否與類比對象的屬性的認(rèn)識程度密切相關(guān)。因此,教師在教學(xué)中提供了豐富的案例事實作為支撐,盡量引導(dǎo)學(xué)生利用圖形、微課和視頻等直觀材料輔助教學(xué),通過動手實踐,實證得出實驗結(jié)果,幫助學(xué)生克服對抽象過程認(rèn)識的困難,對類比對象屬性的認(rèn)識更為科學(xué)全面。在高中生物教學(xué)中,很多概念與知識點十分龐雜和瑣碎,概念與概念之間如果缺乏有效的銜接,學(xué)生學(xué)習(xí)和記憶的難度將大大增加。類比思維的運用可有效幫助學(xué)生能發(fā)現(xiàn)類比對象與學(xué)習(xí)內(nèi)容之間的共性、差異和特殊性,啟發(fā)學(xué)生的思維,使生物概念間建立起高效的網(wǎng)絡(luò)化聯(lián)系。

        參考文獻(xiàn):

        [1]王娜、賴邵華、韋艷艷,運用“類比推理”的邏輯思維方法建構(gòu)“自養(yǎng)生物”概念[J].生物學(xué)教學(xué),2017,42(9):69-70.

        [2]中華人民共和國教育部,普通高中生物學(xué)課程標(biāo)準(zhǔn)(2017年版)[M].北京:人民教育出版社,2018.

        [3]徐孫煒.淺談類比推理在高中生物學(xué)教學(xué)中的運用[J].中學(xué)生物學(xué),2016,32(11):14-15.

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