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        一株纖維素降解菌的篩選與酶活力測定

        2015-12-21 03:28:47葉飛姚長宇張欣
        農(nóng)業(yè)與技術 2015年21期
        關鍵詞:纖維素酶鑒定

        葉飛++姚長宇++張欣

        摘 要:從吉林市左家林地土壤中分離得到一株纖維素酶產(chǎn)生菌,由形態(tài)觀察和18S rDNA序列分析,該菌株為真菌,屬散囊菌綱( Uncultured Eurotiomycetes),命名為JN510。該菌產(chǎn)生纖維素酶活力為2.32IU/mL,具有進一步研究價值。

        關鍵詞:纖維素酶;菌種篩選;鑒定;酶活力

        中圖分類號: Q936 文獻標識碼:A DOI:10.11974/nyyjs.20151132001

        纖維素是農(nóng)作物秸稈的主要成分之一,也是地球上含量最為豐富的可降解生物質,其為葡萄糖聚合物,以β-1,4糖苷鍵聚合。它的降解與轉化是生物圈碳素循環(huán)與生物能傳遞的重要環(huán)節(jié)。利用微生物對纖維素進行降解,對于自然界生物能源的利用具有重要意義。世界各國均積極開展對纖維素降解菌的研究[1]。東北地區(qū)作為我國的糧食主產(chǎn)區(qū),每年產(chǎn)生大量富含纖維素的農(nóng)業(yè)秸稈,傳統(tǒng)的焚燒污染環(huán)境且造成大量生物質浪費。

        本試驗從吉林市左家林地土壤中分離出一株纖維素降解菌,由菌絲、菌落形態(tài)以及16S rDNA初步鑒定為散囊菌綱( Uncultured Eurotiomycetes)。其具有較強纖維素酶產(chǎn)酶活性,對于纖維素的降解轉化具有積極意義,菌種具有進一步研究價值。

        1 材料與方法

        1.1 試驗材料與試劑

        1.1.1 試驗材料

        土壤樣品,采自吉林省吉林市左家地區(qū)林地;化學試劑均為分析純,購于北京化學試劑廠;羧甲基纖維素鈉(CMC-Na)購自生工生物工程(上海)有限公司。Biospin凝膠回收試劑盒,購自BioFlux公司;

        1.1.2 培養(yǎng)基

        富集培養(yǎng)基:MgSO·7H2O 4 0.1g,F(xiàn)eSO4·7H2O 0.1g, K2HPO4 1.0g, MnSO4 5×10-4g,CMC-Na 10.0g,蛋白胨10.0g,酵母膏10.0g,水1000ml,自然pH,121℃滅菌30min。

        剛果紅篩選培養(yǎng)基:KNO3 2.0g,MgSO4 0.5g,KH2PO4 1.0g,NaCl 1.0g,Na2HPO4 1.0g,蒸餾水500ml,加熱溶解后加入CMC-Na 20.0g、瓊脂20.0g、剛果紅0.2g充分溶解后,蒸餾水定容至1000ml,HCl調pH直至達到7.0~7.2,121℃滅菌30min,搖勻后倒平板。

        纖維素鈉篩選培養(yǎng)基:CMC-Na 5.0g,蛋白胨10.0g,酵母提取物5.0g,瓊脂12.0g,,水 1000ml,121℃滅菌30min,搖勻后到平板。

        產(chǎn)酶培養(yǎng)基:Na2HPO4 3.0g,NH4NO3 0.8g,CaCl2 0.5g,ZnSO40.01g,F(xiàn)eSO4·7H2O 0.01g,MgSO4·7H2O 0.5g,MnSO4·H2O 0.01g,CMC-Na 10.0g,蛋白胨1.0g,酵母膏1.0g, 水1000ml,HCl調pH值7.0~ 7.2,121℃滅菌30min,搖勻后到平板。

        PDA培養(yǎng)基:馬鈴薯200g,去皮切成小塊,用蒸餾水1000ml小火沸煮30min,8層紗布過濾,濾液補水至1000ml,調pH6.5。

        1.2 試驗方法

        1.2.1 樣品采集與菌種分離

        于左家地區(qū)林地,取腐殖質表層土壤5g土樣于三角瓶中,加入50ml無菌水,震蕩5min,至分散均勻。取5ml懸液于50ml富集培養(yǎng)基,28℃,80r/min震蕩培養(yǎng)5~7d。取富集培養(yǎng)液按10-1、10-2、10-3、10-4、10-5做系列稀釋,涂布于剛果紅篩選培養(yǎng)基,靜置30min后,28℃倒置培養(yǎng),分離有明顯透明水解圈的菌落。若菌落重疊可劃線分離菌株。

        1.2.2 菌株纖維素降解能力測定

        將分離獲得的菌株,液體培養(yǎng)后,按10-1、10-2、10-3、10-4、10-5做系列稀釋后涂布于剛果紅篩選培養(yǎng)基,靜置30min后,28℃倒置培養(yǎng),待菌落直徑1.0~5.0mm,取下培養(yǎng)基,于1%剛果紅溶液浸泡1h,棄去剛果紅溶液,于1mol/L NaCl溶液浸泡0.5h,棄去NaCl溶液,觀察并測量水解圈大小。

        1.2.3 纖維素酶活力測定

        采用DNS法(3,5-二硝基水楊酸法)測定纖維素酶活力 [2]。酶活力定義為:1min內催化纖維素水解生成1μmol葡萄糖所需的酶量為1IU。

        1.2.4 菌株表型特征鑒定

        取無菌水一滴至于干凈玻片,接種環(huán)挑取少許菌絲涂布,風干固定,顯微觀察菌株形態(tài)。

        1.2.5 菌株的18S r DNA鑒定

        CTAB法提取菌株基因組DNA,分析18S r DNA進行軍中鑒定。PCR反應體系(50μL):dd H2O 34.0μL,10×buffer 5.0μL,d NTP4.0μL,F(xiàn)P2μL,RP2μL,Taq酶 1μL,模板DNA 2μL。引物序列:FP 5'-ATTGGAGGGCAAGTCTGGTG-3';RP 3' –CCGATCCCTAGTCGGCATAG-5'。PCR反應條件:94℃,5min;94℃變性1min,60℃退火1min,72℃延伸1min,35個循環(huán); 72℃,10min。PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳鑒定,送至英濰捷基公司測序。序列于GeneBank由BLAST進行序列同源性分析,確定菌種屬。

        2 結果與分析

        2.1 菌株的分離和纖維素降解能力初步鑒定結果

        由剛果紅篩選培養(yǎng)基水解圈初步判斷,實驗分離得到多種具有纖維素降解能力的菌株。其中3種疑似真菌類菌株,具有較為明顯纖維素降解能力。

        取這3種菌株,于剛果紅篩選培養(yǎng),用1%剛果紅溶液浸泡后1mol/L NaCl溶液浸泡脫色,測量水解圈大小,結果見表1。由表1可知,1號菌水解圈直徑/菌落直徑為8.8,遠高于2號菌和3號菌。初步表明,1號菌具有較明顯纖維素降解能力。

        2.2 菌株的纖維素酶活力測定結果

        取1號菌、2號菌、3號菌,DNS法測定纖維素酶活力,結果見圖1。由圖1可知,在3種菌株中,1號菌纖維素酶活力最高,為2.32IU/mL。將1號菌命名為JN510。由纖維素酶活力判斷,其具有進一步研究的價值。

        2.3 JN510菌株表型特征鑒定結果

        JN510菌株于PDA培養(yǎng)基28℃下培養(yǎng),生長快速。3d后呈白色絨毛狀氣生菌絲;繼續(xù)培養(yǎng),菌落轉為綠褐色;繼而顏色逐漸加深。菌落毛絨狀。鏡檢結果見圖2。

        2.4 18S rDNA序列分析結果

        JN510菌株基因組 DNA進行PCR 擴增,產(chǎn)物進行瓊脂糖電泳,結果見圖3。由圖可知,引物對18S r DNA 序列擴增效果良好,擴增片段約500bp。

        回收片段,送英濰捷基公司測序。獲得序列經(jīng)GeneBank比對,該菌種與序列號為EU368286.1的Uncultured Eurotiomycetes具有99%的親緣關系,結合文獻所列形態(tài)學特征的描述,將其鑒定為散囊菌綱(Uncultured Eurotiomycetes)[3,4]。

        3 討論

        吉林市左家地區(qū)林地腐殖質表層土壤中存在大量可以降解纖維素的纖維素酶產(chǎn)生菌。其可應用于生物化工過程,如秸稈發(fā)酵生產(chǎn)燃料乙醇等工藝。這些菌對于富含纖維素的的轉化利用以及農(nóng)業(yè)秸稈回收利用具有重要意義。

        纖維素酶包括β-葡萄糖苷酶、內切葡聚糖酶、外切葡聚糖酶。3者協(xié)同作用降解纖維素生成葡萄糖。不同菌種產(chǎn)生上述3種酶的濃度與活力不同。雖然自然界中纖維素降解菌種類較多,但是秸稈等生物質中的纖維素往往與木質素、脂質等交聯(lián)存在。使得自然界中纖維素降解菌的降解能力不理想,降低了秸稈等富含纖維素生物質的開發(fā)利用。因此可以考慮構建不同纖維素降解菌,以及纖維素降解菌與木質素降解菌等降解菌的混合菌系。以此來轉化纖維素,提高降解效率。

        本實驗獲得的纖維素降解菌JN510具有較強纖維素降解能力,具有良好的開發(fā)前景,值得進一步研究。

        參考文獻

        [1]頓寶慶,吳薇,王旭靜,等.一株高纖維素酶活力纖維素分解菌的分離與鑒定[J].中國農(nóng)業(yè)科技導報,2008,10(1):113-117.

        [2] Ghose TK. Measurement of cellulase activities[J]. Pure Appl Chem, 1987, 59(2): 257- 268.

        [3] 魏景超. 真菌鑒定手冊[M]. 上海: 上??茖W技術出版社,1979:129-135.

        [4] 戴芳瀾. 中國真菌總匯[M]. 北京: 科學出版社,1979:1527.

        作者簡介:葉飛(1978-),男,副教授,主要從事應用微生物學研究。

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