摘要:探究WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族在多花黃精(Polygonatum cyrtonema Hua)適應(yīng)高溫脅迫中的作用,基于前期轉(zhuǎn)錄組分析鑒定到受高溫影響顯著下調(diào)的基因PcWRKY1,克隆了PcWRKY1基因,并利用生物信息學(xué)、RT-qPCR和玉米原生質(zhì)體瞬時(shí)轉(zhuǎn)化體系等技術(shù)對(duì)其編碼蛋白的基本特性、組織表達(dá)特異性、高溫脅迫下表達(dá)模式及功能進(jìn)行了分析。結(jié)果顯示:PcWRKY1基因CDS序列全長共1 560 bp,編碼519個(gè)氨基酸;PcWRKY1蛋白沒有跨膜結(jié)構(gòu),分子量為 56.93 ku,等電點(diǎn)為7.2,具有2個(gè)WRKY保守結(jié)構(gòu)域,屬于Group Ⅰa類群;RT-qPCR分析結(jié)果顯示,PcWRKY1基因在多花黃精不同組織中均有表達(dá),且在種子中表達(dá)量最高,其轉(zhuǎn)錄水平受高溫脅迫的抑制;玉米原生質(zhì)體中PcWRKY1定位于細(xì)胞核中,且高溫處理不影響其位點(diǎn);在玉米原生質(zhì)體中瞬時(shí)過表達(dá)PcWRKY1,與無高溫脅迫相比,抑制了過氧化氫酶(CAT)活性的增加,提高了高溫脅迫誘導(dǎo)的丙二醛(MDA)含量的增加,說明過表達(dá)PcWRKY1降低了原生質(zhì)體在高溫脅迫下的耐性。綜上所述,PcWRKY1可能在多花黃精響應(yīng)高溫脅迫中起負(fù)調(diào)控作用。
關(guān)鍵詞:多花黃精;WRKY轉(zhuǎn)錄因子;高溫脅迫;生物信息學(xué)分析;功能分析
中圖分類號(hào):S188;S567.23+9.01" 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A
文章編號(hào):1002-1302(2025)04-0200-09
收稿日期:2024-10-29
基金項(xiàng)目:國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃(編號(hào):2022YFD1601808);國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)(編號(hào):CARS-21);河南省現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)(編號(hào):HARS-22-11-G2)。
作者簡介:賈 慧(1999—),女,河南滎陽人,碩士研究生,主要從事中藥資源學(xué)研究。E-mail:2396554366@qq.com。
通信作者:臘貴曉,博士,副研究員,主要從事中藥材生態(tài)栽培、育種等研究。E-mail:zju-1@163.com。
多花黃精(Polygonatum cyrtonema Hua)為百合科(Liliaceae)黃精屬(Polygonatum)多年生草本植物,其根莖常被用作藥物和食物,具有降低血糖、抗癌、調(diào)節(jié)免疫力及抑菌等功效,是《中華人民共和國藥典》收錄的3種藥用黃精之一[1-2]。近年來,隨著對(duì)多花黃精的藥用價(jià)值和營養(yǎng)保健等功能的逐步挖掘,其原料的需求量也日益增加,致使價(jià)格不斷上漲,供不應(yīng)求。但掠奪式的采挖方式導(dǎo)致自然資源枯竭,野生產(chǎn)能急劇下降,遠(yuǎn)不能滿足市場需求,因此,越來越多的人開始選擇人工種植多花黃精[3]。
隨著溫室氣體濃度的逐年上升,全球氣候日益變暖,極端高溫的發(fā)生更為頻繁、強(qiáng)度更強(qiáng)、持續(xù)時(shí)間更久[4]。氣溫升高已成為限制植物生長和產(chǎn)量的主要非生物脅迫之一。當(dāng)植物遭受高溫脅迫時(shí),常常會(huì)對(duì)其生理、生化和發(fā)育造成嚴(yán)重的影響。例如高溫使蛋白質(zhì)變性、聚集和降解,同時(shí)抑制蛋白質(zhì)的合成,加速活性氧(ROS)的產(chǎn)生和葉綠素降解,增加膜脂的流動(dòng)性和滲透性,引起細(xì)胞器的功能紊亂,加速細(xì)胞衰老,引起植物光合作用器官的提前衰老等[5- 9]。而多花黃精作為中性需光植物,喜陰涼和濕潤的環(huán)境,但極端高溫災(zāi)害事件的頻發(fā),給多花黃精種植帶來極大阻礙。大田栽培過程中,夏季的極端高溫天氣會(huì)對(duì)多花黃精造成高溫脅迫,從而引起植物細(xì)胞膜損傷,損害葉綠體結(jié)構(gòu)導(dǎo)致凈光合速率下降,影響其根莖生長和有效活性成分的積累,嚴(yán)重的還會(huì)使多花黃精提前倒伏、病蟲害加重甚至整株死亡[10-11]。但是,目前對(duì)多花黃精在響應(yīng)高溫脅迫中的研究少之又少。因此,克隆調(diào)控多花黃精耐熱性相關(guān)的基因,并解析其在高溫脅迫的作用機(jī)制,不但有助于對(duì)多花黃精耐熱機(jī)制的理解,而且可以為多花黃精分子輔助育種提供新的理論依據(jù)。
研究報(bào)道,植物可以通過調(diào)控許多轉(zhuǎn)錄因子(TF)進(jìn)而調(diào)控相關(guān)基因的表達(dá),從而參與對(duì)外界脅迫的響應(yīng),如MYB、AP2/ERFBP、NAC和WRKY[12]。而植物特異性WRKY轉(zhuǎn)錄因子是一種研究最為廣泛的基因轉(zhuǎn)錄因子家族之一,能夠響應(yīng)不同非生物脅迫(寒冷、干旱、UV-B、高溫、鹽和堿性環(huán)境),并且通過結(jié)合下游基因啟動(dòng)子的W-box順式作用元件,以作為靶基因表達(dá)的抑制因子和激活因子,并在關(guān)鍵信號(hào)通路發(fā)揮重要作用[13]。AtWRKY57可以直接與RD29A和NCED3啟動(dòng)子區(qū)域的W-box結(jié)合,上調(diào)了這2個(gè)脅迫基因的表達(dá),而且擬南芥過表達(dá)植株的耐旱性也得到了增強(qiáng)[14];棉花中GhWRKY17的轉(zhuǎn)錄水平受到干旱脅迫、鹽脅迫和H2O2的誘導(dǎo),從而有可能調(diào)控下游耐性基因的表達(dá)增強(qiáng)其耐性[15];通過UV-B輻射處理,可以誘導(dǎo)擬南芥中3個(gè)AtWRKY基因和水稻中OsWRKY89的表達(dá),而它們通過調(diào)控蠟質(zhì)物質(zhì)合成的基因從而使其在葉片表面產(chǎn)生較厚的蠟質(zhì)物質(zhì),提高了對(duì)高溫的耐受性[16-17]。此外,越來越多的研究表明WRKY家族參與了植物對(duì)高溫脅迫的響應(yīng),當(dāng)植物受到高溫脅迫時(shí),其通過調(diào)控多種途徑的下游靶基因的表達(dá),從而響應(yīng)外部脅迫[18-19]。
目前,有關(guān)多花黃精WRKY轉(zhuǎn)錄因子的報(bào)道尚不多見,并且在高溫中的功能也并不清楚。因此,本研究以前期多花黃精在轉(zhuǎn)錄組學(xué)中鑒定得到的顯著受高溫下調(diào)的PcWRKY1為研究對(duì)象(數(shù)據(jù)未發(fā)表)為基礎(chǔ),克隆其基因編碼序列的全長,并利用生物信息學(xué)分析其基因,同時(shí)探究其在不同組織、高溫脅迫處理后的表達(dá)模式;同時(shí),又利用玉米原生質(zhì)體瞬時(shí)轉(zhuǎn)化體系對(duì)其正常條件和高溫脅迫下亞細(xì)胞定位和生理指標(biāo)進(jìn)行分析,初步確定PcWRKY1在高溫下的功能。以期對(duì)進(jìn)一步研究PcWRKY1在高溫中功能及其作用機(jī)制奠定基礎(chǔ),也為培育耐熱性強(qiáng)、適應(yīng)性廣的優(yōu)良多花黃精新品種提供優(yōu)良的基因資源。
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
以2年生多花黃精根莖為無性繁殖材料,于2023年10月種植于河南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技試驗(yàn)示范基地的多花黃精為試驗(yàn)材料,用于基因的克隆、表達(dá)模式分析;質(zhì)粒pCAMBIA1302-GFP由河南農(nóng)業(yè)大學(xué)胡秀麗教授提供,用于亞細(xì)胞定位和瞬時(shí)過表達(dá);暗培養(yǎng)的玉米自交系B73的第2張完全展開葉,用于提取玉米原生質(zhì)體。
試驗(yàn)試劑:KOD OneTM PCR Master Mix-Blue高保真酶(貨號(hào):KMM-201,TOYOBO,上海),RNA提取試劑盒(貨號(hào):R6827-01,Omega Bio-Tek,廣州)、HiScript Ⅱ 1st Strand cDNA Synthesis Kit (+gDNA wiper) 逆轉(zhuǎn)錄試劑盒(貨號(hào):R212-01,諾唯贊,南京)、小量瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒(貨號(hào):ZP202-2,莊盟,北京)、Taq Pro Universal SYBR qPCR Master Mix熒光定量試劑盒(貨號(hào):Q712-02,諾唯贊,南京)、限制性內(nèi)切酶(NEB,美國)、一步法無縫克隆試劑盒(貨號(hào):10923ES50,翊圣,上海)、大腸桿菌DH5α感受態(tài)(貨號(hào):DL1001,唯地,上海)、質(zhì)粒小提試劑盒(貨號(hào):DP103,天根,北京)、無內(nèi)毒素質(zhì)粒大提試劑盒(增強(qiáng)型)(貨號(hào):DP120,天根,北京)、纖維素酶Cellulose R-10(貨號(hào):MX7352,Yakult,日本)、離析酶Macerozyme R-10(貨號(hào):MX7351,Yakult,日本)、丙二醛(MDA)含量檢測試劑盒(貨號(hào):BC0025,索萊寶,上海)和過氧化氫酶(CAT)活性檢測試劑盒(貨號(hào):BC0205,索萊寶,上海),其他試劑均購自索萊寶。
1.2 PcWRKY1基因的克隆及生物信息學(xué)分析
1.2.1 基因克隆 以有1個(gè)完整頂芽的多花黃精根莖(2年生)為無性繁殖材料培育的多花黃精幼苗的葉片、根、莖和塊莖的混合材料為基礎(chǔ),利用RNA提取試劑盒提取總RNA,使用逆轉(zhuǎn)錄試劑盒逆轉(zhuǎn)錄生成cDNA;根據(jù)轉(zhuǎn)錄組所提供的臨時(shí)轉(zhuǎn)錄本為參考,設(shè)計(jì)特異性引物(F:5′-ATGGCTTCTTCAACTGGGAGTTT-3′,R:5′-TTAACATAGCAGCGATTCGATGAACA-3′),使用高保真酶進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增程序?yàn)椋?8 ℃ 5 min;98 ℃ 10 s,60 ℃ 5 s,68 ℃ 10 s,共計(jì)35個(gè)循環(huán);68 ℃、10 min,4 ℃保存;使用1%的瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行電泳檢測,檢測無誤后利用膠回收試劑盒切膠回收,回收產(chǎn)物送到生工生物工程(上海)股份有限公司進(jìn)行測序(試劑盒具體操作步驟見說明書)。
1.2.2 生物信息學(xué)分析 通過相關(guān)的在線生信網(wǎng)站(表1)對(duì)測序獲得PcWRKY1基因編碼蛋白的氨基酸數(shù)目、蛋白相對(duì)分子質(zhì)量、等電點(diǎn)、蛋白的親疏水性、跨膜區(qū)域、蛋白結(jié)構(gòu)域和蛋白的二級(jí)、三維結(jié)構(gòu)等;利用軟件MEGA 8.0和在線網(wǎng)站對(duì)其同源蛋白序列進(jìn)行進(jìn)化樹分析。
1.3 材料處理
1.3.1 組織特異性表達(dá)分析 2024年6月,取種植在現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技試驗(yàn)示范基地中多花黃精的根、莖、葉、塊莖以及保存的種子為試驗(yàn)材料,取樣后用液氮速凍放置于-80 ℃保存。
1.3.2 高溫脅迫處理 2024年6月,取種植在現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技試驗(yàn)示范基地中多花黃精幼苗,移栽入新的花盆中,在人工氣候箱中進(jìn)行培養(yǎng)(培養(yǎng)溫度為白天28 ℃/夜晚22 ℃,光照14 h—黑暗 10 h),培養(yǎng)幼苗株高至20 cm左右,選取生長狀態(tài)一致的幼苗進(jìn)行高溫脅迫處理。高溫處理采取2種不同的處理方法:直接高溫處理,處理的溫度為40 ℃,高溫處理的時(shí)間為0、0.5、1、2、4、8、10 h;模擬大田高溫處理的方法為采用梯度升溫的方法,以2 ℃/h的升溫速度從28 ℃上升到40 ℃,并在40 ℃維持 2 h,共計(jì)高溫脅迫處理8 h。取樣后用液氮速凍放置于 -80 ℃ 保存;原生質(zhì)體的高溫脅迫處理?xiàng)l件是 38 ℃、30 min。
1.3.3 實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析 對(duì)所需進(jìn)行表達(dá)模式分析的材料利用RNA提取試劑盒提取RNA,經(jīng)檢驗(yàn)合格后逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA。利用Primer Premier 6.0設(shè)計(jì)所需特異性引物(F:5′-ATCCTCCATCTCTCCCGA-3′,R:5′-CCTCTTTGACGCCTTGCT-3′),使用SYBR Green熒光染料、Step One Plus熒光定量PCR儀(ABI,USA)進(jìn)行RT-qPCR檢測,用2-ΔΔCT法計(jì)算相對(duì)表達(dá)量數(shù)值。PcGAPDH為本試驗(yàn)的內(nèi)參基因(F:5′-CCATGGTCAACGTCGGAATC-3′,R:5′-GCGAAGATGTGGATGGCTTT-3′)。
1.4 PcWRKY1基因的瞬時(shí)過表達(dá)載體的構(gòu)建
使用同源重組的方法進(jìn)行載體的構(gòu)建。用限制性內(nèi)切酶NcoⅠ和SpeⅠ將pCAMBIA1302-GFP的質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切,完全酶切后純化回收并與純化回收的PcWRKY1基因進(jìn)行酶連,體系為:3 μL的PcWRKY1基因擴(kuò)增產(chǎn)物、2 μL回收后的酶切產(chǎn)物、5 μL 的同源重組酶,條件為:50 ℃、15 min。然后,將連接產(chǎn)物利用熱激法轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5α感受態(tài)后加入800 μL無抗性的LB培養(yǎng)基,37 ℃、220 r/min 活化1 h;涂于相應(yīng)抗性的LB固體平板,37 ℃培養(yǎng)至單菌落形成;在超凈工作臺(tái)中挑取陽性單菌落至1 mL相應(yīng)抗性的LB培養(yǎng)液中,37 ℃、220 r/min 擴(kuò)搖 16 h 后送生工生物工程(上海)股份有限公司進(jìn)行測序。測序結(jié)果使用DNAman 8.0軟件進(jìn)行序列比對(duì),比對(duì)結(jié)果無誤的菌液加入終濃度為25%的甘油置于-80 ℃冰箱保存,用于后續(xù)研究。其中PcWRKY1基因擴(kuò)增的同源重組引物為F:5′-acgggggactcttgaccatggaaATGGCTTCTTCAACTGGGAGTTT-3′,R:5′-aagttcttctcctttactagtACATAGCAGCGATTCGATGAACA-3′。
1.5 玉米原生質(zhì)體的提取和轉(zhuǎn)化
玉米原生質(zhì)體的提取和轉(zhuǎn)化參照Zhao等的方法[20]。
1.5.1 原生質(zhì)體的提取 剪下玉米黃化苗(從玉米幼苗出土后約5 cm后置于黑暗條件下培養(yǎng)10~12 d)的第2張葉片,用鋒利的刀片將其切成1~2 mm 的細(xì)絲,然后浸入20 mL的酶解液中[1.5%(質(zhì)量體積比) 纖維素酶、0.3%(質(zhì)量體積比)離析酶、600 mmol/L甘露醇、1 mmol/L MES(一水合物)、1 mmol/L氯化鈣、0.1%(質(zhì)量體積比)牛血清蛋白和0.035%(體積比)β-巰基乙醇,pH值5.8];然后將其放入避光的真空泵中抽真空1 h;取出酶解液置于水平搖床上40 r/min、25 ℃避光酶解3 h;然后80 r/min、25 ℃劇烈振蕩5 min;最后利用300目細(xì)胞篩過濾掉未酶解組織,收集過濾液至 50 mL 離心管中,100 g離心3 min,輕棄上清液,加入5 mL洗脫緩沖液[600 mmol/L甘露醇、4 mmol/L MES(一水合物)、20 mmol/L氯化鉀,pH值 5.8]再次100 g離心3 min,重復(fù)1次;再加入10 mL的洗脫緩沖液,用移液槍輕吹混勻,置于冰上黑暗靜置30 min;然后100 g離心3 min,輕棄上清液,在沉淀中加入約5 mL的Mmg[400 mmol/L甘露醇、15 mmol/L 六水氯化鎂、4 mmol/L MES(一水合物),pH值5.8]重懸浮原生質(zhì)體,使用細(xì)胞計(jì)數(shù)板調(diào)整溶液中原生質(zhì)體密度為2×105 個(gè)/mL后用于下步試驗(yàn)。
1.5.2 質(zhì)粒的大量提取 從-80 ℃保存的構(gòu)建好的甘油菌中吸取50 μL菌液,接種5 mL的相應(yīng)抗性液體LB培養(yǎng)基中37 ℃、220 r/min培養(yǎng)至D600 nm為1.6~1.8;取上步2 mL的菌液于200 mL的LB液體培養(yǎng)基中,37 ℃,220 r/min培養(yǎng)至D600 nm為2.0。然后利用無內(nèi)毒素質(zhì)粒大提試劑盒提取質(zhì)粒,質(zhì)粒的終濃度應(yīng)大于1 μg/μL(試劑盒具體操作步驟見說明書)。
1.5.3 原生質(zhì)體的轉(zhuǎn)化 將上述大量提取的 10 μg 的質(zhì)粒DNA和100 μL的原生質(zhì)體(濃度約為5×105個(gè)/mL)分別加入2 mL的離心管底部,移液槍輕吹混勻;加入等體積的PEG轉(zhuǎn)化試劑[40%(質(zhì)量體積比) PEG 4000、200 mmol/L甘露醇和 100 mmol/L 氯化鈣],然后輕輕混勻,置于25 ℃黑暗條件下培養(yǎng) 40 min;用440 μL的W5[600 mmol/L甘露醇、3 mmol/L MES(一水合物)和20 mmol/L氯化鉀,pH值5.8]輕輕混勻后100 g離心3 min后輕棄上清,重復(fù)2~3遍,直至完全清洗干凈;最后置于1 mL的原生質(zhì)體培養(yǎng)液[600 mmol/L甘露醇、3 mmol/L MES(一水合物)和4 mmol/L氯化鉀,pH值5.8],25 ℃ 黑暗條件下培養(yǎng)16 h用于后續(xù)研究。
1.6 亞細(xì)胞定位的觀察
將35S:AtIMP4-mCherry分別與重組質(zhì)粒35S:PcWRKY1-GFP和35S:GFP混勻后,利用PEG-Ca介導(dǎo)的玉米原生質(zhì)體瞬時(shí)轉(zhuǎn)化技術(shù)轉(zhuǎn)化入玉米原生質(zhì)體,培養(yǎng)結(jié)束后,用激光共聚焦顯微鏡(Nikon AIR HD25,日本)進(jìn)行觀察,其中AtIMP4是擬南芥中定位于細(xì)胞核的蛋白。觀察GFP熒光的最大激發(fā)波長為488 nm,最大發(fā)射波長為 507 nm;觀察mCherry熒光的最大激發(fā)波長為 587 nm,最大發(fā)射波長為610 nm。
1.7 生理指標(biāo)的測定
收集高溫脅迫處理后以及未處理的原生質(zhì)體進(jìn)行MDA含量和CAT活性測定,測定的方法參照試劑盒說明書進(jìn)行。
2 結(jié)果與分析
2.1 PcWRKY1基因的克隆及生物信息學(xué)分析
以多花黃精的根、莖、葉和塊莖混合組織提取的總RNA逆轉(zhuǎn)錄合成的cDNA為模版,利用轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)提供的參考轉(zhuǎn)錄本設(shè)計(jì)引物,PCR擴(kuò)增獲得PcWRKY1的CDS序列,回收測序后分析其長度為 1 560 bp(圖1-A中泳道1、2和3所示),與參考轉(zhuǎn)錄本的序列一致。對(duì)其編碼蛋白序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析,結(jié)果顯示其編碼蛋白的相對(duì)分子質(zhì)量為56.93 ku,理論等電點(diǎn)為7.20,屬于中性蛋白;跨膜結(jié)構(gòu)分析結(jié)果表明,該蛋白不具有跨膜結(jié)構(gòu)(圖1-B);保守結(jié)構(gòu)域分析結(jié)果表明,該蛋白含有2個(gè)WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族所特有的保守結(jié)構(gòu)域,且每個(gè)保守結(jié)構(gòu)域中含有1個(gè)七肽保守基序(WRKYGQK)和C2H2(C-X4-C-X23-H-X1-H)型鋅指基序(圖1-C、圖1-D),屬于WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族Group Ⅰa類群;信號(hào)肽分析結(jié)果表明,該蛋白不存在信號(hào)肽(圖 1-E);蛋白親疏水性分析結(jié)果表現(xiàn),其可能是一種親水性蛋白(圖1-F);蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果顯示其含無規(guī)卷曲含量較多(圖1-G),說明預(yù)測蛋白的結(jié)構(gòu)可靠性較低;通過亞細(xì)胞預(yù)測網(wǎng)站分析,其亞細(xì)胞位點(diǎn)都是細(xì)胞核,位于其他部位的可能性都很低。
2.2 PcWRKY1進(jìn)化樹分析
對(duì)多花黃精PcWRKY1基因編碼的蛋白序列通過數(shù)據(jù)庫(https://www.uniprot.org/)進(jìn)行蛋白序列比對(duì),從結(jié)果中篩出13個(gè)物種中同源蛋白序列,利用軟件MEGA 8.0中的鄰接法(neighbor-joining,NJ)構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,結(jié)果(圖2)表明,多花黃精中的PcWRKY1與石刁柏(Asparagus officinalis L.)的親緣關(guān)系最為接近,其次是深圳擬蘭(Apostasia shenzhenica)與黃石斛(Dendrobium catenatum L.);與鳳梨(Ananas comosus)的親緣關(guān)系最遠(yuǎn)。
2.3 PcWRKY1組織表達(dá)模式分析
為了檢驗(yàn)PcWRKY1在多花黃精各個(gè)組織中的表達(dá)情況,利用RT-qPCR方法分析了PcWRKY1在2年生的多花黃精的根、莖、葉、塊莖和種子中的表達(dá)情況,結(jié)果(圖3)顯示,PcWRKY1在多花黃精的根、莖、葉、塊莖和種子均有表達(dá),其表達(dá)量由高到低的組織部位分別種子、塊莖、根、莖和葉片,其中在根和塊莖中的表達(dá)量無明顯差異。
2.4 PcWRKY1基因表達(dá)受高溫脅迫的抑制
為了進(jìn)一步確定PcWRKY1基因的表達(dá)是否受高溫的影響,對(duì)已有1個(gè)完整頂芽的多花黃精根莖(2年生)為無性繁殖材料培育的幼苗分別進(jìn)行高溫梯度處理和模擬大田高溫處理, 然后選取中上部成
熟葉片提取總RNA,通過RT-qPCR分析PcWRKY1在高溫脅迫下表達(dá),結(jié)果如圖4-A所示,以正常條件下作為對(duì)照,PcWRKY1在高溫脅迫下的轉(zhuǎn)錄水平降低了10倍,說明高溫脅迫顯著抑制了它的表達(dá);此外,高溫梯度處理顯示,PcWRKY1的表達(dá)量在2 h受到顯著抑制,并且隨著高溫處理時(shí)間的增加到 10 h 后又恢復(fù)至原始水平(圖4-B)。
2.5 高溫脅迫對(duì)PcWRKY1亞細(xì)胞位點(diǎn)影響分析
為了進(jìn)一步確定PcWRKY1的亞細(xì)胞位點(diǎn),本研究首先用植物蛋白亞細(xì)胞定位預(yù)測網(wǎng)站預(yù)測,結(jié)果顯示PcWRKY1定位于細(xì)胞核中。然后,本試驗(yàn)利用同源重組的方法構(gòu)建了一個(gè)35S:PcWRKY1-GFP(綠色熒光蛋白標(biāo)記的融合載體),用已知定位細(xì)胞核的AtIMP4偶聯(lián)櫻桃紅熒光蛋白的融合載體35S:AtIMP4-mCherry作為對(duì)照,利用PEG介導(dǎo)的玉米原生質(zhì)體瞬時(shí)表達(dá)體系進(jìn)行共表達(dá)。共表達(dá)的原生質(zhì)體在黑暗條件下,25 ℃培養(yǎng)16 h后在激光共聚焦顯微鏡下進(jìn)行熒光觀察。結(jié)果如圖5所示,在正常條件下,PcWRKY1的綠色熒光信號(hào)與AtIMP4的櫻桃紅熒光相重合,這說明PcWRKY1定位于細(xì)胞核中。
此外,為了確定高溫脅迫是否會(huì)影響其亞細(xì)胞定位,對(duì)培養(yǎng)后的原生質(zhì)體進(jìn)行高溫處理,處理的條件為38 ℃、30 min,結(jié)果如圖5顯示,當(dāng)高溫處理后,PcWRKY1的亞細(xì)胞位點(diǎn)與不進(jìn)行高溫處理一樣。這些結(jié)果說明,PcWRKY1的亞細(xì)胞位點(diǎn)跟網(wǎng)絡(luò)
預(yù)測的結(jié)果一致,定位于細(xì)胞核中,且位點(diǎn)不受高溫影響。
2.6 PcWRKY1提高了玉米原生質(zhì)體在高溫脅迫中的耐性
為了研究PcWRKY1在高溫中的作用,利用PEG介導(dǎo)的玉米原生質(zhì)體中瞬時(shí)遺傳轉(zhuǎn)化技術(shù),將PcWRKY1過表達(dá)轉(zhuǎn)化入玉米原生質(zhì)體中,黑暗培養(yǎng)16 h后再進(jìn)行高溫38 ℃、30 min的脅迫處理,以不進(jìn)行高溫處理的作為對(duì)照組,然后對(duì)其MDA含量和CAT活性進(jìn)行測定, 結(jié)果如圖6所示, 在玉米原
生質(zhì)體中瞬時(shí)過表達(dá)PcWRKY1提高了高溫誘導(dǎo)MDA含量的增加,降低了CAT活性的提高。這些結(jié)果可以說明,PcWRKY1過表達(dá)顯著降低了玉米原生質(zhì)體在高溫脅迫下的耐性。
3 討論與結(jié)論
近年來,由于溫室氣體的大量排放,全球日益變暖, 氣候變暖導(dǎo)致的高溫已經(jīng)成為全球主要的自然災(zāi)害之一。高溫脅迫往往通過改變植物生化、生理和代謝過程,最終引起植物的萎蔫、生殖系統(tǒng)發(fā)育異常,顯著影響了植物的產(chǎn)量和品質(zhì)[21-22]。而許多轉(zhuǎn)錄因子有助于植物對(duì)不利環(huán)境條件的耐受性,并被廣泛用作作物育種的潛在候選基因[23]。
WRKY轉(zhuǎn)錄因子作為植物中所特有的一種轉(zhuǎn)錄因子家族,已經(jīng)越來越多被報(bào)道在植物響應(yīng)高溫脅迫中起著重要作用[24-26],但在多花黃精中的研究卻少之又少。本研究在前期通過對(duì)多花黃精在高溫脅迫下的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究發(fā)現(xiàn)PcWRKY1顯著受高溫脅迫抑制的基礎(chǔ)上,從根、莖、葉和塊莖混合組織中,克隆獲得了轉(zhuǎn)錄因子PcWRKY1的CDS序列,經(jīng)測序發(fā)現(xiàn)其CDS序列全長共1 560 bp;根據(jù)測序得到的CDS所翻譯的氨基酸序列中,分析發(fā)現(xiàn)其具有2個(gè)WRKY保守的結(jié)構(gòu)域,該結(jié)構(gòu)域中含有WRKYGQK的七肽核心基序和C2H2(C-X4-C-X23-H-X1-H)鋅指結(jié)構(gòu),屬于WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族GroupⅠa類群;系統(tǒng)進(jìn)化樹分析結(jié)果顯示PcWRKY1與石刁柏的親緣關(guān)系最為接近,說明它們之間的功能可能存在相似性;對(duì)PcWRKY1在不同組織的表達(dá)模式分析,發(fā)現(xiàn)其在根、莖、葉、塊莖和種子中均有表達(dá),且在種子中表達(dá)量最高;利用PEG介導(dǎo)的玉米原生質(zhì)體瞬時(shí)轉(zhuǎn)化體系,對(duì)PcWRKY1在正常和高溫脅迫下的亞細(xì)胞位點(diǎn)進(jìn)行了分析,與已知報(bào)道的WRKY亞細(xì)胞位點(diǎn)一樣,都定位于細(xì)胞核,并且其位點(diǎn)還不受高溫脅迫的影響。
研究認(rèn)為,WRKY家族常常通過識(shí)別靶基因啟動(dòng)子中所含的順式作用元件W-box并與其結(jié)合,從而調(diào)控植物中的各種靶基因信號(hào)通路從而應(yīng)對(duì)各種脅迫。如百合中的LIWRKY39作為LIMBF1c上游調(diào)控因子,結(jié)合LIMBF1c啟動(dòng)子上保守的W-box順式作用元件,激活了LIMBF1c的轉(zhuǎn)錄活性從而正調(diào)控百合的耐熱性[27]。在擬南芥中過表達(dá)小麥TaWRKY1和TaWRKY33,激活了下游脅迫反應(yīng)相關(guān)基因從而調(diào)節(jié)對(duì)高溫的耐受性[28]。此外,WRKY可以調(diào)控下游與熱脅迫相關(guān)基因的表達(dá),調(diào)控抗氧化防護(hù)酶的活性,從而提高植物的耐熱性。如在辣椒中,CaWRKY40參與了植物對(duì)高溫脅迫的響應(yīng),通過提高高溫脅迫下相關(guān)熱脅迫應(yīng)答蛋白編碼基因的轉(zhuǎn)錄(如HSP等標(biāo)志基因)來響應(yīng)高溫;同時(shí)在其煙草轉(zhuǎn)基因植株中顯示,過表達(dá)降低了煙草對(duì)高溫處理的敏感性,而缺失突變體正好相反[29-30]。此外,在煙草中過表達(dá)小麥TaWRKY10后,降低了由高溫脅迫誘導(dǎo)升高的MDA含量,提高了受高溫脅迫促進(jìn)的抗氧化防護(hù)酶的活性,從而降低了由高溫脅迫帶來的損傷[31];并且在玉米中高溫能夠誘導(dǎo)ZmWRKY106基因的表達(dá),并且在其擬南芥過表達(dá)株系中可以通過誘導(dǎo)抗氧化防護(hù)酶的活性,從而提高轉(zhuǎn)基因株系的耐熱性[32]。水稻中的OsWRKY10能夠與VQ8相互拮抗從而調(diào)控水稻熱脅迫下ROS穩(wěn)態(tài)以及熱休克轉(zhuǎn)錄因子和蛋白基因的表達(dá),從而適應(yīng)高溫脅迫[33]。然而,植物中也有一些WRKY對(duì)高溫耐受性起負(fù)調(diào)控作用,如在擬南芥中的過表達(dá)向日葵HaWRKY6會(huì)顯著降低其對(duì)高溫的耐受性[34]。在本研究中,利用RT-qPCR分析PcWRKY1的轉(zhuǎn)錄水平顯著受到高溫的抑制,并且對(duì)其進(jìn)行高溫處理2 h時(shí),表達(dá)量最低,說明其對(duì)高溫脅迫較敏感;同時(shí)利用玉米原生質(zhì)體瞬時(shí)轉(zhuǎn)化體系,瞬時(shí)過表達(dá)PcWRKY1后,對(duì)其在高溫脅迫下的生理指標(biāo)進(jìn)行了測定,發(fā)現(xiàn)瞬時(shí)過表達(dá)PcWRKY1進(jìn)一步升高了由高溫造成的MDA含量的增加,降低了受高溫脅迫提高的CAT活性的增加,說明PcWRKY1的過表達(dá)加重了高溫脅迫對(duì)玉米原生質(zhì)體造成的氧化損傷,降低了其在高溫脅迫中的耐性。這些結(jié)果表明PcWRKY1在多花黃精適應(yīng)高溫脅迫中起負(fù)調(diào)控作用。為進(jìn)一步分析和確認(rèn)PcWRKY1具體調(diào)控哪些基因的表達(dá)進(jìn)而參與高溫脅迫,可以通過DAP-sequence、ChIP、EMSA等試驗(yàn)篩選和驗(yàn)證。
本研究從多花黃精中克隆得到了一個(gè)顯著受高溫抑制的WRKY轉(zhuǎn)錄因子GroupⅠa類群成員PcWRKY1,其CDS序列長為1 650 bp,編碼519個(gè)氨基酸。并且利用玉米原生質(zhì)體瞬時(shí)表達(dá)體系,發(fā)現(xiàn)其過表達(dá)降低了玉米原生質(zhì)體在高溫脅迫下的耐性,推測其在多花黃精高溫脅迫響應(yīng)中起負(fù)調(diào)控作用。這可以為闡述多花黃精在適應(yīng)高溫脅迫中的作用機(jī)制及開展分子育種研究提供理論依據(jù)。
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