摘要:為研究DREBA6b基因在芹菜非生物脅迫中的作用機(jī)制,從轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中篩選出芹菜DREBA6b基因參考序列并設(shè)計(jì)引物從津南實(shí)芹中克隆到該基因全長(zhǎng)cDNA,并命名為AgDREBA6b,對(duì)該基因結(jié)構(gòu)、序列特征及系統(tǒng)進(jìn)化等進(jìn)行生物信息分析,并利用qPCR檢測(cè)該基因在非生物脅迫下的表達(dá)模式。結(jié)果表明:(1)理化性質(zhì)表明,AgDREBA6b含1個(gè)長(zhǎng)度為1 023 bp的開(kāi)放閱讀框,編碼340個(gè)氨基酸,含有典型的AP2轉(zhuǎn)錄因子保守結(jié)構(gòu)域;AgDREBA6b 蛋白是親水性蛋白,不具有信號(hào)肽和跨膜結(jié)構(gòu)。(2)同源序列比對(duì)顯示,AgDREBA6b蛋白與其他植物DREB蛋白具有高度保守性,與天竺葵和胡蘿卜親緣關(guān)系最近。啟動(dòng)子分析發(fā)現(xiàn)含13種順式元件,其中2種植物生長(zhǎng)發(fā)育元件、6種激素響應(yīng)元件和5種脅迫響應(yīng)元件。(3)qPCR分析顯示,AgDREBA6b基因在低溫、高溫、干旱、高鹽等逆境脅迫誘導(dǎo)下具有不同的表達(dá)模式,在低溫、干旱和鹽脅迫誘導(dǎo)后先上調(diào)再下調(diào),然而高溫下隨著時(shí)間的增加呈現(xiàn)持續(xù)上升趨勢(shì),說(shuō)明AgDREBA6b基因受非生物脅迫誘導(dǎo)表達(dá),尤其高溫響應(yīng)更為顯著。
關(guān)鍵詞:芹菜;AgDREBA6b;克??;基因表達(dá)模式;表達(dá)分析
中圖分類(lèi)號(hào):S188;S636.301" 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A
文章編號(hào):1002-1302(2025)04-0233-09
收稿日期:2024-05-07
基金項(xiàng)目:塔里木大學(xué)校長(zhǎng)基金(編號(hào):TDZKSS202245);大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計(jì)劃項(xiàng)目(編號(hào):202310757011);林下經(jīng)濟(jì)特種經(jīng)濟(jì)作物栽培技術(shù)示范基金(編號(hào):1117989)。
作者簡(jiǎn)介:謝芳杰(1995—),女,河南商丘人,碩士,講師,主要研究方向?yàn)槭卟诉z傳育種與分子生物學(xué)。E-mail:17778649365@163.com。
植物在自然環(huán)境狀態(tài)下遭受著各種非生物脅迫的威脅。非生物脅迫包括干旱、高溫、高鹽和低溫,對(duì)植物的適應(yīng)性、生物量和產(chǎn)量產(chǎn)生負(fù)面影響[1-2]。植物可通過(guò)轉(zhuǎn)錄因子(transcription factors,TF)調(diào)節(jié)應(yīng)激信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑中眾多基因的表達(dá)來(lái)對(duì)其進(jìn)行響應(yīng)[3]。通常響應(yīng)逆境脅迫的轉(zhuǎn)錄因子主要有AP2/ERF、WRKY(因其含色氨酸-精氨酸-賴(lài)氨酸-酪氨酸-甘氨酸-谷氨酰胺-賴(lài)氨酸保守序列得名)、bZIP、NAC和MYB等幾大類(lèi)[4]。其中,DREB(dehydration responsive element-binding protein)是轉(zhuǎn)錄因子AP2/ERF基因家族的一個(gè)分支,含有1個(gè)由60~70個(gè)氨基酸殘基組成的保守結(jié)構(gòu)域,位于第14位的V(纈氨酸)和第19位的E(谷氨酸)對(duì)轉(zhuǎn)錄因子與順勢(shì)元件的結(jié)合,使下游功能基因在干旱、高鹽和高溫等逆境脅迫中發(fā)揮重要調(diào)控作用[5]。
DREB基因家族在不同物種間的基因數(shù)量、基因結(jié)構(gòu)及功能存在顯著差異,根據(jù)序列相似性可分為A1~A6亞族[6]。其中A1成員主要參與冷脅迫反應(yīng),A2成員主要參與干旱和高鹽應(yīng)激調(diào)節(jié)。A3~A6成員的功能與植物的生長(zhǎng)發(fā)育和非生物脅迫都有一定關(guān)系[7-9]。如大豆GmDREB2是A5組成員,它在擬南芥中的過(guò)表達(dá)使植物對(duì)干旱和高鹽脅迫的耐受性增強(qiáng),而不會(huì)引起生長(zhǎng)遲緩[10]。擬南芥A6組成員RAP2.4可在干旱脅迫條件下激活葉片中表皮蠟的生物合成[11]。作為PrPDAT2的上游調(diào)節(jié)因子,樹(shù)牡丹中PrDREB2D導(dǎo)致PrPDAT2表達(dá)降低,從而參與調(diào)控種子ALA積累[12]。以往大多數(shù)研究集中在A1組和A2組。然而,近年來(lái)關(guān)于A6型DREB基因研究成為國(guó)內(nèi)外熱點(diǎn)[13]。目前已在擬南芥(Arabidopsis thaliana)[14]、蘋(píng)果(Malus pumil)[15]、大豆(Glycine max)[5,16]、小麥(Triticum aestivum)[17]、油菜(Brassica napus)[18]和菠蘿(Ananas comosus)[19]等多種植物中分別鑒定出56、60、73、48、194、20個(gè)家族基因。
芹菜(Apium graveolens L.)為傘形科一年或多年生草本植物,原產(chǎn)于地中海沿岸的沼澤地帶,在中國(guó)已有2 000多年的栽培史。芹菜營(yíng)養(yǎng)豐富,具有較高的食用和藥用價(jià)值,日漸成為國(guó)內(nèi)外主要栽培的重要蔬菜之一[20-21]。津南實(shí)芹是天津津南區(qū)選育的優(yōu)良品種,葉片肥厚,商品性狀好,抗性強(qiáng)。本研究從津南實(shí)芹中克隆了1個(gè)AgDREBA6b基因,對(duì)其編碼氨基酸進(jìn)行生物信息學(xué)分析和蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位分析,并利用qPCR研究基因在非生物脅迫下(干旱、鹽、低溫和高溫)的特異性響應(yīng),旨在進(jìn)一步為AgDREBA6b基因參與芹菜的抗逆性分子機(jī)制和基因功能的研究提供理論依據(jù)。
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
供試材料為芹菜品種津南實(shí)芹,由南京農(nóng)業(yè)大學(xué)作物遺傳與種質(zhì)創(chuàng)新國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室提供。試驗(yàn)地點(diǎn)位于塔里木大學(xué)園藝與林學(xué)學(xué)院實(shí)驗(yàn)室,于2023年9月將種子播種并置于人工氣候室內(nèi)。參照文獻(xiàn)[22]設(shè)置培養(yǎng)條件,待芹菜植株長(zhǎng)至4月齡,進(jìn)行高溫(38 ℃)、低溫(4 ℃)、高鹽(200 mmol/L NaCl)、干旱(10%PEG-8000)脅迫,分別處理0、1、6、24 h,取成熟的葉片作為待測(cè)樣品,所有樣品均設(shè)置3次重復(fù)。放入液氮中速凍后,儲(chǔ)存于-80 ℃超低溫冰箱。
1.2 芹菜總RNA提取及cDNA合成
使用植物組織總RNA提取試劑盒(擎科生物科技股份有限公司,北京)提取芹菜葉片中的總RNA,并用1%(體積分?jǐn)?shù))瓊脂糖凝膠電泳和紫外分光光度計(jì)Nano Drop 2000(賽默飛世爾科技公司,美國(guó))檢測(cè)RNA的質(zhì)量及濃度。將質(zhì)量檢測(cè)合格的總RNA使用GoldenstarTM RT6 cDNA Synthesis Mix Rnasin selected試劑盒(擎科,北京)中按照推薦的反應(yīng)體系將其反轉(zhuǎn)錄成單鏈cDNA,并用紫外分光光度計(jì)Nano Drop 2000測(cè)定cDNA的濃度,然后保存在-20 ℃冰箱中備用,用于非生物脅迫基因表達(dá)模式分析(選用處理時(shí)間為0 h的cDNA為基因克隆試驗(yàn)的擴(kuò)增模板)。
1.3 AgDREBA6b基因克隆
以擬南芥AP2/ERF轉(zhuǎn)錄因子家族為信息探針,結(jié)合芹菜轉(zhuǎn)錄組為基礎(chǔ),檢索得到芹菜AgDREBA6b的基因序列,使用Primer Premier 5.0軟件設(shè)計(jì)擴(kuò)增引物F(5′-ATGATGACAGGTGGTATAG-3′)和R(5′-CTGACGTCATCCCTGATGTCATAA-3′)。以“津南實(shí)芹”cDNA為模板進(jìn)行擴(kuò)增,PCR反應(yīng)條件如下:94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸60 s,72 ℃延伸10 min,30個(gè)循環(huán)。將PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行1.0%瓊脂糖凝膠電泳,然后用DNA凝膠回收試劑盒回收目的條帶,與pUCm-T載體連接并轉(zhuǎn)化至DH5α化學(xué)感受態(tài)細(xì)胞中,然后送至北京擎科生物科技股份有限公司進(jìn)行測(cè)序。
1.4 AgDREBA6b生物信息學(xué)分析
利用ORF Finder(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/)對(duì)AgDREBA6b基因序列進(jìn)行翻譯并獲得其蛋白序列。運(yùn)用ExPASy(https://web.expasy.org/)預(yù)測(cè)AgDREBA6b蛋白的相對(duì)分子質(zhì)量、原子總數(shù)、等電點(diǎn)以及親疏水性。使用SOPMA和在線(xiàn)網(wǎng)站phyre(http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/)分別分析該基因的二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu)。使用WoLF PSORT預(yù)測(cè)該基因的亞細(xì)胞定位。利用TMHMM 2.0 Server在線(xiàn)網(wǎng)站(http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM)和SignalP-4.1(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/)分別預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)的跨膜結(jié)構(gòu)域和信號(hào)肽。使用NCBI的BLAST搜索其他植物的DREB氨基酸序列,使用DNAMAN軟件進(jìn)行氨基酸多序列比對(duì),并使用MEGA 5.0軟件基于鄰位相連法構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)(自展值為1 000)。使用PlantCARE在線(xiàn)軟件(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/)分析啟動(dòng)子序列上的順式作用元件。
1.5 熒光定量qRT-PCR分析
AgDREBA6b基因引物由Primer 6.0軟件設(shè)計(jì)(F:5′-TCCAAGCCCAGATCCAACTCCA-3′;R:ACCAAAGTCGGGTTCGGTTCTT-3′)。以Actin作為內(nèi)參基因,引物為(F:5′-GAAATCACAGCACTTGCACC-3′;R:5′-AAGCCTTTGATCTTGAGAGC-3′),將反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物稀釋10倍后作為qPCR反應(yīng)模板。qPCR按照2×T5 Fast qPCR Mix(SYBR Green Ⅰ)(全式金生物科技股份有限公司,北京)推薦的反應(yīng)體系,并使用Bio-Rad-CFX96TM實(shí)時(shí)PCR系統(tǒng)(Bio-Rad,CA,USA)完成擴(kuò)增。每個(gè)反應(yīng)3次技術(shù)重復(fù)。該基因的qPCR分析以芹菜Actin為內(nèi)參基因,通過(guò)2-ΔΔCT法計(jì)算目的基因的相對(duì)表達(dá)量[23],以相對(duì)表達(dá)平均值±標(biāo)準(zhǔn)誤表示(n= 3)。
1.6 數(shù)據(jù)處理與分析
所用數(shù)據(jù)處理軟件為SPSS 20,AgDREBA6b基因相對(duì)表達(dá)量采用單因素方差分析和多重比較Tukey檢驗(yàn)顯著性,顯著差異性水平設(shè)為0.05。
2 結(jié)果與分析
2.1 芹菜AgDREBA6b基因克隆與序列分析
以芹菜葉片總RNA反轉(zhuǎn)錄得到的cDNA為模板,設(shè)計(jì)引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,得到 1 023 bp 的目的基因條帶,其長(zhǎng)度與預(yù)期基本一致(圖1)。將其命名為AgDREBA6b基因(GenBank登錄號(hào):OR727346)。該基因包含1個(gè)1 023 bp的完整開(kāi)放閱讀框,預(yù)測(cè)編碼了340個(gè)氨基酸。保守結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)包含AP2結(jié)構(gòu)域(PF00847),其中60個(gè)氨基酸殘基的結(jié)構(gòu)域可與DNA結(jié)合,存在于轉(zhuǎn)錄過(guò)程,屬于典型的DREB1/CBF轉(zhuǎn)錄因子。
2.2 AgDREBA6b蛋白理化性質(zhì)及跨膜結(jié)構(gòu)分析
通過(guò)ExPASy在線(xiàn)軟件分析芹菜AgDREBA6b蛋白理化性質(zhì),結(jié)果(圖2)表明,芹菜AgDREBA6b蛋白分子式為C1 670H2 569N443O526S14,原子總數(shù)為 5 222,相對(duì)分子量為37.72 ku,理論等電點(diǎn)(PI)為6.54,表明芹菜AgDREBA6b為酸性蛋白??偲骄H水性值為-0.614,具有較強(qiáng)的親水性。蛋白質(zhì)不穩(wěn)定指數(shù)為53.35,脂溶性指數(shù)為57.71,推測(cè)為不穩(wěn)定性蛋白。該蛋白氨基酸序列共20種氨基酸組成,其中絲氨酸數(shù)量最多,為47個(gè)(占13.8%),半胱氨酸和色氨酸數(shù)量最少,均為4個(gè),占比均為1.2%(表1)。共有33個(gè)帶負(fù)電荷的殘基(Asp+Glu)和32個(gè)帶正電荷的殘基(Arg+Lys)。
2.3 芹菜AgDREBA6b蛋白二、三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)和亞細(xì)胞定位分析
二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果表明,AgDREBA6b蛋白由26.47%的α-螺旋、61.76%的無(wú)規(guī)則卷曲、10%的延伸鏈、1.76%的β轉(zhuǎn)角組成(圖2-A)。根據(jù) AlphaFold DB model(gene ID:A0A165XQ40)構(gòu)建的模型與其序列的一致性達(dá)到" 87.92%, 三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)
測(cè)和同源建模分析表明,與二級(jí)分析結(jié)果基本一致(圖2-B)。亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)顯示,AgDREBA6b基因編碼的蛋白定位于細(xì)胞核。利用TMHMM 2.0 Server在線(xiàn)軟件預(yù)測(cè)了芹菜AgDREBA6b蛋白跨膜區(qū),結(jié)果表明該蛋白無(wú)跨膜區(qū),屬于非跨膜蛋白。SignalP-4.1預(yù)測(cè)結(jié)果顯示,該蛋白中存在信號(hào)肽的概率僅為0.45%,這表明芹菜AgDREBA6b為非分泌蛋白。NetPhos 3.1 Server預(yù)測(cè)存在58個(gè)磷酸化位點(diǎn),其中38個(gè)是絲氨酸(Ser),17個(gè)是蘇氨酸(Thr),3個(gè)是酪氨酸(Tyr)(圖2-C)。
2.4 AgDREBA6b蛋白質(zhì)的同源比對(duì)和進(jìn)化分析
將AgDREBA6b基因編碼的氨基酸序列在NCBI上進(jìn)行BLAST比對(duì),結(jié)果表明AgDREBA6b與其他植物DREB轉(zhuǎn)錄因子具有較高的同源性(圖3)。它與天竺葵(Heracleum sosnowskyi,KAK1361703.1)和胡蘿卜(Daucus carota,AIX48026.1)編碼的同源蛋白質(zhì)相似性達(dá)到最高,分別為89.44%和85.00%,推測(cè)它們可能具有相同的生物學(xué)功能。然而,與伊德斯種咖啡(Coffea eugenioides,XP_027178525.1)和楊梅(Morella rubra,KAB1199840.1)的相似性較低,分別為52.05%和53.35%。利用MEGA 5.0軟件將該基因編碼的氨基酸序列與NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中登錄的27種植物中的DREB序列構(gòu)建neighbor-joining(NJ)系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)(圖4)。結(jié)果表明,AgDREBA6b與天竺葵和胡蘿卜DREB蛋白聚為同一支,親緣關(guān)系較接近;與其他物種如木薯、橡膠樹(shù)、麻風(fēng)樹(shù)、毛白楊和銀白楊的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。
2.5 啟動(dòng)子分析
順式調(diào)控序列是非編碼DNA的線(xiàn)性核苷酸區(qū)域,其定位會(huì)因基因活動(dòng)而改變。啟動(dòng)子區(qū)的順式作用元件可調(diào)控基因的轉(zhuǎn)錄活性,通過(guò)分析順式作用元件組成,可了解基因的功能及其表達(dá)潛力。通過(guò)Plant CARE分析芹菜AgDREBA6b啟動(dòng)子區(qū)域 1 023 bp 序列,發(fā)現(xiàn)該區(qū)域含有13種順式作用元件,包括2個(gè)植物生長(zhǎng)發(fā)育響應(yīng)元件、6個(gè)植物激素響應(yīng)元件、5個(gè)脅迫響應(yīng)元件(表2)。植物生長(zhǎng)發(fā)
育響應(yīng)元件包含1個(gè)GATA-motif和1個(gè)GT1-motif共2個(gè)光響應(yīng)元件。植物激素響應(yīng)元件在3種元件中占了最大的比例,其中含有1個(gè)ABRE脫落酸響應(yīng)元件,4個(gè)茉莉酸甲酯應(yīng)答元件(2個(gè)CGTCA-motif和2個(gè)TGACG-motif),1個(gè)P-box赤霉素應(yīng)答元件。脅迫響應(yīng)元件含有2個(gè)抗氧化應(yīng)答元件(ARE)、1個(gè)低溫應(yīng)答元件(LTR)和2個(gè)干旱誘導(dǎo)元件(MBS)。總的來(lái)說(shuō),這些結(jié)果推測(cè)AgDREBA6b基因參與了芹菜對(duì)植物發(fā)育、激素及脅迫的響應(yīng)。
2.6 芹菜AgDREBA6b基因在非生物脅迫下的表達(dá)水平
本研究基于轉(zhuǎn)錄組并利用qPCR技術(shù)對(duì)該基因在不同脅迫各時(shí)期下(0、1、6、24 h)的表達(dá)模式驗(yàn)證分析。由圖5可知,高溫、低溫、高鹽和干旱脅迫均能誘導(dǎo)芹菜AgDREBA6b基因的表達(dá)。其中AgDREBA6b基因處于高溫脅迫時(shí),表達(dá)量逐漸上升,在24 h脅迫處理時(shí),表達(dá)量達(dá)到峰值,是0 h的15.89倍,高于同期其他脅迫下的表達(dá)量。低溫、高鹽及干旱脅迫下,AgDREBA6b基因表達(dá)量變化曲線(xiàn)相似,均表現(xiàn)為先上升,達(dá)到峰值后下降。低溫脅迫下,1 h處理時(shí),表達(dá)量變化不明顯,到達(dá)6 h時(shí),表達(dá)量出現(xiàn)峰值,約為0 h的24.39倍,高于任何時(shí)期及脅迫下的表達(dá)量,隨后表達(dá)量逐漸下降;AgDREBA6b基因?qū)Ω啕}脅迫的響應(yīng)相較遲鈍,1 h時(shí),表達(dá)量有所上調(diào),為0 h的2.47倍,在6 h時(shí)出現(xiàn)峰值,為0 h的6.45倍,24 h時(shí)表達(dá)量有所下降,與1 h時(shí)的表達(dá)量近乎相等;干旱脅迫下,1 h時(shí),表達(dá)量幾乎沒(méi)有變化,6 h處理時(shí)表達(dá)量到達(dá)峰值,約為0 h的13.12倍,隨后表達(dá)量逐漸下降。
3 討論
植物在不良環(huán)境會(huì)進(jìn)化出一系列自身內(nèi)在的
分子機(jī)制,以響應(yīng)環(huán)境脅迫。非生物脅迫是影響植物生長(zhǎng)發(fā)育、質(zhì)量和產(chǎn)量主要因素之一[24]。DREB轉(zhuǎn)錄因子能夠與DRE/CRT順式作用元件或具有DRE元件核心序列特異性結(jié)合,從而在植物遭遇極端溫度、干旱和高鹽等非生物脅迫反應(yīng)中起著重要的調(diào)控作用[25]。本研究利用Li等已發(fā)布的芹菜基因組[26],使用PCR擴(kuò)增技術(shù)在津南實(shí)芹中克隆得到了1個(gè)AgDREBA6b基因,該基因包含高度保守的AP2/ERF DNA結(jié)合域,這與其他關(guān)于DREB轉(zhuǎn)錄因子家族研究結(jié)果[27]一致。蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)表明,無(wú)規(guī)則卷曲和α-螺旋是芹菜DREB蛋白二級(jí)機(jī)構(gòu)的主要組成部分,這與譚萌萌等在細(xì)葉百合中研究[28]一致。經(jīng)同源序列比對(duì)和系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析,顯示該蛋白與天竺葵和胡蘿卜同源性相似性較高,且親緣關(guān)系較接近,暗示可能具有相似或者相近的生物學(xué)功能。對(duì)啟動(dòng)子分析發(fā)現(xiàn),AgDREBA6b含有13種順式作用元件,其中植物激素響應(yīng)元件和脅迫響應(yīng)元件比例較高,推測(cè)該基因在脅迫中起著重要轉(zhuǎn)錄調(diào)控功能。
近年來(lái),隨著不同物種中DREB家族基因陸續(xù)被克隆和功能分析,在植物脅迫響應(yīng)中的作用正逐漸被揭示。如過(guò)表達(dá)VuDREB2A-CA提高了豇豆在干旱和熱脅迫下的抗氧化能力、滲透調(diào)節(jié)能力和光合產(chǎn)量[29]。CiDREB6主要在高溫和干旱條件下被誘導(dǎo),而在低溫和高鹽條件下則沒(méi)有被誘導(dǎo)[30]。在麻風(fēng)樹(shù)中,冷、鹽和干旱脅迫會(huì)誘導(dǎo)JcDREB的表達(dá),但ABA(脫落酸)無(wú)法誘導(dǎo)該基因表達(dá)[31]。藥用植物香鱗毛蕨在干旱、NaCl和高溫處理時(shí),DfDREB基因表達(dá)均上調(diào),但在低溫脅迫 1~6 h和24 h時(shí)無(wú)明顯變化[32]。茶樹(shù)CsDREB-A2能快速響應(yīng)高溫和干旱脅迫,但對(duì)低溫脅迫的響應(yīng)較為緩慢[33]。以上研究表明DREB基因可以提高植物對(duì)非生物脅迫的耐受性,但其響應(yīng)的表達(dá)模式有所不同[34]。DREB通常能夠通過(guò)基因表達(dá)量上調(diào)來(lái)應(yīng)對(duì)各種脅迫[24]。如苦蕎在經(jīng)歷干旱脅迫 6~12 h后,F(xiàn)tDREB1和FtDREB2基因表達(dá)量幾小時(shí)內(nèi)達(dá)到最高,之后開(kāi)始下降,但均高于脅迫前[35],二穗短柄草中DREB1G基因亦是如此[36]。在日本結(jié)縷草葉片中,ZjDREB1.4在低溫、高鹽和干旱脅迫下基因表達(dá)量均表現(xiàn)出上調(diào),其中低溫脅迫中上調(diào)最為顯著[37]。李彤等的研究表明,CsDREB-A4b基因的相對(duì)表達(dá)量在高溫(38 ℃)脅迫處理后顯著高于脅迫處理前[38]。本研究中AgDREBA6b受到低溫、干旱和鹽脅迫誘導(dǎo)后基因表達(dá)先上調(diào)再下調(diào),其中在6 h達(dá)到峰值,24 h表達(dá)下調(diào)。高溫脅迫下,AgDREBA6基因表達(dá)量隨著時(shí)間的增加呈現(xiàn)持續(xù)上升趨勢(shì),但該脅迫處理并未出現(xiàn)拐點(diǎn),值得進(jìn)一步研究。值得注意的是,脅迫1 h時(shí),AgDREBA6b在4種脅迫下基因表達(dá)量變化并不明顯,當(dāng)處理時(shí)間增加至6 h,該基因被顯著誘導(dǎo),可能由于芹菜植株在初期剛感應(yīng)到脅迫信號(hào),AgDREBA6b需進(jìn)行與啟動(dòng)子結(jié)合后才能被誘導(dǎo)表達(dá)。當(dāng)脅迫在植株體內(nèi)積累到一定時(shí)期,對(duì)基因轉(zhuǎn)錄量的誘導(dǎo)才得以體現(xiàn)。綜上所述,AgDREBA6b在干旱、鹽、低溫和高溫脅迫下基因表達(dá)量均高于0 h,這與前人研究一致,說(shuō)明該基因積極參與芹菜非生物脅迫響應(yīng)的分子信號(hào)途徑。然而,基因之間存在相互促進(jìn)和制約關(guān)系,僅憑表達(dá)分析模式來(lái)確定單個(gè)基因的功能并不完全合理。因此,今后可通過(guò)在芹菜中過(guò)表達(dá)或抑制表達(dá)驗(yàn)證其功能性。
4 結(jié)論
本研究從津南實(shí)芹中克隆獲得1個(gè)AgDREBA6b基因,并對(duì)AgDREBA6b基因進(jìn)行生物信息學(xué)分析和基因的表達(dá)模式分析,發(fā)現(xiàn)AgDREBA6b在響應(yīng)多種非生物脅迫時(shí),基因表達(dá)量均出現(xiàn)不同程度的上調(diào)現(xiàn)象,從而推測(cè)AgDREBA6b是調(diào)控芹菜抗逆的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子。本研究結(jié)果為AgDREBA6b基因的后續(xù)功能驗(yàn)證提供了參考,同時(shí)可為預(yù)測(cè)其他物種的功能性DREB基因提供一定的依據(jù)。
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