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        雙硫死亡相關(guān)基因在結(jié)直腸癌中的表達(dá)及其臨床意義

        2024-12-31 00:00:00陳曉玲呂敏敏李燕賈亦真
        關(guān)鍵詞:生存分析生物信息學(xué)結(jié)直腸癌

        【摘 要】目的:識(shí)別雙硫死亡相關(guān)基因在結(jié)直腸癌中的表達(dá)模式。方法:嚴(yán)格選出TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中結(jié)直腸癌樣本開(kāi)展差異基因分析,并與已報(bào)道文獻(xiàn)中的雙硫基因取交集,篩選出雙硫死亡相關(guān)結(jié)直腸癌差異基因,在GEO數(shù)據(jù)庫(kù)和人類蛋白圖譜(humanprotein atlas,HPA)數(shù)據(jù)庫(kù)上進(jìn)一步驗(yàn)證了雙硫死亡相關(guān)基因的表達(dá),對(duì)基因SLC7A11 在人結(jié)直腸癌樣本中的表達(dá)進(jìn)行了qPCR驗(yàn)證。下載GSE184093數(shù)據(jù)集,利用上述篩選獲得的基因作為標(biāo)記,設(shè)置不同的閾值對(duì)癌癥和對(duì)照樣本進(jìn)行分類,并使用ROC曲線下面積(area under the curve,AUC)評(píng)估分類效果。通過(guò)K-M生存分析,鑒定標(biāo)記基因?qū)颊呖傮w生存率的影響,利用TIMER數(shù)據(jù)庫(kù)分析標(biāo)記基因的表達(dá)與免疫細(xì)胞浸潤(rùn)的相關(guān)性。結(jié)果:識(shí)別出了2個(gè)與結(jié)直腸癌相關(guān)的雙硫死亡相關(guān)基因。SLC7A11 和SLC3A2 這2個(gè)雙硫死亡相關(guān)基因均在結(jié)直腸癌患者中高表達(dá),并且SLC7A11 高表達(dá),結(jié)直腸癌患者預(yù)后良好,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(Plt;0.05);SLC3A2 高表達(dá),結(jié)直腸癌患者預(yù)后較差,但是差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.061)。使用SLC7A11 和SLC3A2 作為標(biāo)記,對(duì)樣本進(jìn)行分類鑒別結(jié)直腸癌,通過(guò)ROC曲線圖可以發(fā)現(xiàn),SLC7A11 和SLC3A2 對(duì)結(jié)直腸癌鑒別診斷的AUC分別為0.840(95%CI=0.663~1.000)和0.667(95%CI=0.395~0.938),SLC7A11 對(duì)鑒別診斷結(jié)直腸癌具有一定的準(zhǔn)確性,SLC3A2對(duì)鑒別診斷結(jié)直腸癌具有較低的準(zhǔn)確性。SLC7A11 和SLC3A2 在結(jié)直腸癌的免疫浸潤(rùn)中起著重要的作用,SLC7A11 表達(dá)與結(jié)腸腺癌中的CD8+T細(xì)胞、中性粒細(xì)胞、樹(shù)突狀細(xì)胞浸潤(rùn)水平正相關(guān)(Plt;0.001),SLC7A11 表達(dá)與直腸癌的CD8+T細(xì)胞、中性粒細(xì)胞浸潤(rùn)水平正相關(guān)(Plt;0.001)。SLC3A2 表達(dá)與結(jié)腸腺癌的CD8+T細(xì)胞、B細(xì)胞浸潤(rùn)水平負(fù)相關(guān)(Plt;0.01),與結(jié)腸腺癌的CD4+T細(xì)胞正相關(guān)(Plt;0.05)。結(jié)論:本研究發(fā)現(xiàn),SLC7A11 和SLC3A2 這2個(gè)雙硫死亡相關(guān)基因均在結(jié)直腸癌患者中高表達(dá),并與結(jié)直腸癌免疫浸潤(rùn)密切相關(guān),且SLC7A11 對(duì)結(jié)直腸癌鑒別診斷具有一定的準(zhǔn)確性,為結(jié)直腸癌提供了可靠和潛在的治療靶點(diǎn)。

        【關(guān)鍵詞】結(jié)直腸癌;生物信息學(xué);雙硫死亡;生存分析;免疫浸潤(rùn)

        【中圖分類號(hào)】R114 【文獻(xiàn)標(biāo)志碼】A 【收稿日期】2023-06-07

        結(jié)直腸癌(colorectal cancer,CRC)是常見(jiàn)的消化道惡性腫瘤之一,據(jù)Siegel RL等[1]的報(bào)道和2020年我國(guó)癌癥統(tǒng)計(jì)報(bào)告[2]顯示,結(jié)直腸癌的發(fā)病率和死亡率均呈上升趨勢(shì),并且有年輕化表現(xiàn),其惡性程度在世界排名第三位,死亡率高居第二位。雖然目前結(jié)直腸癌的診斷技術(shù)和治療方式均在不斷發(fā)展改善,但晚期結(jié)直腸癌患者預(yù)后極差,5年生存率不到12%[3]。因此,有必要深入挖掘結(jié)直腸癌的發(fā)生發(fā)展機(jī)制,為臨床結(jié)直腸癌的診斷治療提供新的思路。根據(jù)最新研究發(fā)現(xiàn),雙硫死亡是由細(xì)胞內(nèi)的雙硫化合物積累,引發(fā)雙硫應(yīng)激/脅迫,最終導(dǎo)致的細(xì)胞死亡[4]。而結(jié)直腸癌與雙硫死亡的相關(guān)性,還未有文獻(xiàn)報(bào)道。

        本研究基于TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)和已報(bào)道的雙硫死亡相關(guān)基因,識(shí)別結(jié)直腸癌中的雙硫死亡相關(guān)基因。并在GEO 數(shù)據(jù)庫(kù)和人類蛋白圖譜(human proteinatlas,HPA)數(shù)據(jù)庫(kù)上進(jìn)一步驗(yàn)證得到目的基因。分別使用ROC曲線下面積(area under the curve,AUC)和K-M生存曲線圖分析目的基因?qū)Y(jié)直腸癌鑒別診斷價(jià)值和對(duì)患者總體生存率的影響,最后利用TIMER數(shù)據(jù)庫(kù)分析目的基因表達(dá)與免疫細(xì)胞浸潤(rùn)的相關(guān)性。本課題組為結(jié)直腸癌提供潛在的治療靶點(diǎn)。技術(shù)路線見(jiàn)圖1。

        1 材料與方法

        1.1 從TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中鑒定雙硫死亡相關(guān)基因

        從TCGA 數(shù)據(jù)庫(kù)[5](https://portal.gdc.cancer.gov) 下載并整理TCGA-COAD 和TCGA-READ 項(xiàng)目STAR 流程的RNAseq數(shù)據(jù)并提取Counts格式的數(shù)據(jù)以及臨床數(shù)據(jù),去除沒(méi)有臨床數(shù)據(jù)的樣本,最終得到包括647個(gè)腫瘤組織和51個(gè)癌旁組織。雙硫死亡相關(guān)基因從文獻(xiàn)[4]中收集。將雙硫死亡相關(guān)基因與TCGA數(shù)據(jù)集中的DEGs取交集,得到目標(biāo)基因。

        1.2 基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)和蛋白質(zhì)圖譜(HPA)數(shù)據(jù)庫(kù)中SLC7A11、SLC3A2 轉(zhuǎn)錄和翻譯水平驗(yàn)證

        GEO 數(shù)據(jù)庫(kù)[6](http://www. ncbi. nlm. nih. gov/geo)選取GSE134834 和GSE6988 數(shù)據(jù)集,全部來(lái)源為人類。通過(guò)GSE134834數(shù)據(jù)集中正常結(jié)直腸組織5例,結(jié)直腸癌組織5例驗(yàn)證結(jié)直腸腫瘤組織和正常組織中SLC7A11 和SLC3A2 表達(dá)水平。通過(guò)GSE6988數(shù)據(jù)集驗(yàn)證結(jié)直腸腫瘤組織和正常組織SLC3A2 的表達(dá)水平,GSE6988數(shù)據(jù)集中正常結(jié)直腸組織28例,結(jié)直腸癌組織82例。HPA是1個(gè)開(kāi)放的數(shù)據(jù)庫(kù),允許學(xué)術(shù)界和工業(yè)界的研究人員免費(fèi)訪問(wèn)來(lái)探索人類蛋白質(zhì)組。在本研究中,使用HPA數(shù)據(jù)庫(kù)[7](http:// www.proteinatlas.org),通過(guò)免疫組化方法驗(yàn)證了從正常細(xì)胞和腫瘤細(xì)胞中SLC3A2 的蛋白表達(dá)。

        1.3 基因SLC7A11 qPCR實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證

        使用結(jié)腸癌cDNA芯片(上海芯超),包括結(jié)直腸癌和癌旁各15 例標(biāo)本,檢測(cè)SLC7A11 基因和內(nèi)參基因b-Actin。SLC7A11 基因引物序列[8](Forward:5'-ATACGCTGAGTGTGGTTTGC-3',Reverse:5'-GTTCCACCCAGACTCGTA-3'),b-Actin基因引物序列(Forward:5'-GAAGAGCTACGAGCTGCCTGA-3',Reverse:5'-CAGACAGCACTGTGTTGGCG-3'),按照熒光定量PCR試劑的試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行操作,按以下擴(kuò)增程序進(jìn)行熒光定量PCR擴(kuò)增檢測(cè):預(yù)變性95℃ 5 min;循環(huán):變性95℃ 15 S,退火60℃ 30 S,延伸72℃ 30 S,循環(huán)40 次。實(shí)驗(yàn)結(jié)束后按照相對(duì)定量方法計(jì)算SLC7A11 基因表達(dá)。

        1.4 SLC7A11 和SLC3A2 對(duì)結(jié)直腸癌鑒別的診斷價(jià)值

        在本研究中,SLC7A11 和SLC3A2 對(duì)結(jié)直腸癌鑒別診斷價(jià)值,通過(guò)GSE184093數(shù)據(jù)集進(jìn)行分類分析,其中正常結(jié)直腸組織和腫瘤組織各9例樣本,使用SLC7A11 和SLC3A2 的表達(dá)量作為基因標(biāo)記物,并統(tǒng)計(jì)分類結(jié)果的特異性和敏感度,結(jié)果用ROC曲線展示,并計(jì)算AUC量化預(yù)測(cè)效果。在AUCgt;0.5的情況下,AUC越接近于1,說(shuō)明該變量在預(yù)測(cè)結(jié)局上診斷效果越好。0.50.9時(shí)有較高準(zhǔn)確性。AUC=0.5時(shí),說(shuō)明該變量不起作用,無(wú)診斷價(jià)值。

        1.5 結(jié)直腸癌患者SLC7A11 和SLC3A2 生存分析

        使用Kaplan-Meier Plotter 數(shù)據(jù)庫(kù)[9](http://kmplot. com/analysis/)中記錄的基因表達(dá)和患者生存時(shí)間數(shù)據(jù),對(duì)基因SLC7A11 和SLC3A2 對(duì)結(jié)直腸癌的影響進(jìn)行生存分析。

        1.6 結(jié)直腸癌中腫瘤浸潤(rùn)免疫細(xì)胞與SLC7A11 和SLC3A2表達(dá)相關(guān)性分析

        TIMER 數(shù)據(jù)庫(kù)[10](https://cistrome.shinyapps.io/timer/)可用于系統(tǒng)評(píng)價(jià)各種類型腫瘤的免疫細(xì)胞浸潤(rùn)。該數(shù)據(jù)庫(kù)用于分析樹(shù)突狀細(xì)胞(dendritic Cell)、中性粒細(xì)胞(neutrophil)、巨噬細(xì)胞(macrophage)、CD4+T細(xì)胞(CD4+ T cell)、CD8+T細(xì)胞(CD8+ T cell)和B細(xì)胞(B cell)的腫瘤浸潤(rùn)情況。

        1.7 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

        所有統(tǒng)計(jì)分析均采用R(4.2.1)版本進(jìn)行。使用pROC包對(duì)進(jìn)行分類效果評(píng)估的ROC 分析。正態(tài)計(jì)量資料采用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差形式表達(dá),非正態(tài)計(jì)量資料用中位數(shù)(四分位數(shù))[Md(P25,P75)]表示,計(jì)數(shù)資料用率、構(gòu)成比等形式表達(dá)。腫瘤樣本和正常樣本之間SLC7A11 和SLC3A2 的差異表達(dá)水平采用Mann-Whitney U 檢驗(yàn)和獨(dú)立樣本t 檢驗(yàn)。所有結(jié)果均使用ggplot2進(jìn)行可視化。高表達(dá)和低表達(dá)均是與非腫瘤細(xì)胞相比較。檢驗(yàn)水準(zhǔn)α=0.05。

        2 結(jié)果

        2.1 從TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中鑒定雙硫死亡相關(guān)基因

        TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中滿足p.adjlt;0.05且|log2FC|≥1閾值的genesymbol有15768個(gè),與文獻(xiàn)查詢到的6個(gè)雙硫死亡相關(guān)基因(包括:SLC7A11、SLC3A2、GLUT1、NCKAP1、WAVE2、Rac1)取交集后得到2 個(gè)雙硫死亡相關(guān)結(jié)直腸癌基因,分別是SLC7A11 和SLC3A2。具體見(jiàn)圖2A。SLC7A11 和SLC3A2 在腫瘤中均為高表達(dá),差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(Plt;0.001)。具體見(jiàn)圖2B。

        2.2 不同數(shù)據(jù)庫(kù)和人類蛋白質(zhì)圖譜(HPA)對(duì)SLC7A11 和SLC3A2 轉(zhuǎn)錄水平的驗(yàn)證

        通過(guò)GSE134834 數(shù)據(jù)庫(kù)驗(yàn)證,SLC7A11 和SLC3A2 在腫瘤組織中均高表達(dá),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(Plt;0.05);通過(guò)GSE6988數(shù)據(jù)庫(kù)驗(yàn)證,SLC3A2 在腫瘤組織中高表達(dá),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(Plt;0.001)。具體見(jiàn)圖3。通過(guò)HPA也驗(yàn)證了結(jié)直腸癌腫瘤組織中SLC3A2 的蛋白高表達(dá),圖中紅色方框?yàn)榉糯髤^(qū)域。具體見(jiàn)圖4。綜上所述,這些結(jié)果提示SLC7A11和SLC3A2 在結(jié)直腸癌患者中表達(dá)上調(diào),與TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)表達(dá)一致。

        2.3 基因SLC7A11 qPCR實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證

        通過(guò)qPCR實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,基因SLC7A11 在結(jié)直腸癌組織中高表達(dá),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(Plt;0.05)。具體見(jiàn)圖5。

        2.4 SLC7A11 和SLC3A2 對(duì)結(jié)直腸癌鑒別的診斷價(jià)值

        利用SLC7A11 和SLC3A2 2個(gè)基因作為標(biāo)記物,使用不同的閾值對(duì)樣本進(jìn)行分類,并評(píng)估分類的準(zhǔn)確性。通過(guò)ROC曲線圖可以發(fā)現(xiàn),SLC7A11 對(duì)結(jié)直腸癌鑒別診斷AUC=0.840,95%CI=0.663~1.000,SLC3A2 對(duì)結(jié)直腸癌鑒別診斷AUC=0.667,95%CI=0.395~0.938,SLC7A11 對(duì)結(jié)直腸癌鑒別診斷具有一定的準(zhǔn)確性。SLC3A2 對(duì)結(jié)直腸癌的診斷價(jià)值相對(duì)較低。具體見(jiàn)圖6。

        2.5 結(jié)直腸癌患者SLC7A11 和SLC3A2 的生存分析

        通過(guò)K-M 生存曲線分析SLC7A11 和SLC3A2 基因?qū)颊呖傮w生存率的影響,可以發(fā)現(xiàn),SLC7A11 高表達(dá),結(jié)直腸癌患者預(yù)后較好,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(Plt;0.05);SLC3A2 高表達(dá),結(jié)直腸癌患者預(yù)后較差,但是差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.061)。具體見(jiàn)圖7。

        2.6 結(jié)直腸癌腫瘤浸潤(rùn)免疫細(xì)胞與SLC7A11 和SLC3A2 表達(dá)相關(guān)分析

        在本研究中,進(jìn)一步利用TIMER數(shù)據(jù)庫(kù)來(lái)分別評(píng)估結(jié)直腸癌中免疫浸潤(rùn)水平與SLC7A11 和SLC3A2 表達(dá)之間的相關(guān)性。SLC7A11 表達(dá)與結(jié)腸腺癌中的CD8+ T 細(xì)胞(r=0.358)、中性粒細(xì)胞(r=0.267)、樹(shù)突狀細(xì)胞(r=0.171)浸潤(rùn)水平呈正相關(guān)(Plt;0.001),SLC7A11 表達(dá)與直腸癌的CD8+ T細(xì)胞(r=0.365)、中性粒細(xì)胞(r=0.336)浸潤(rùn)水平呈正相關(guān)(Plt;0.001),具體見(jiàn)圖8。SLC3A2 表達(dá)與結(jié)腸腺癌的CD8+ T細(xì)胞(r=-0.184)、B細(xì)胞(r=-0.158)浸潤(rùn)水平呈負(fù)相關(guān)(Plt;0.01),與結(jié)腸腺癌的CD4+ T細(xì)胞(r=0.11)呈正相關(guān)(Plt;0.05),具體見(jiàn)圖9。

        3 討 論

        大量研究報(bào)道了多種其他基因也與結(jié)直腸癌相關(guān)[11-13],然而其發(fā)病機(jī)制仍不明確,患者的5年生存率尚待提高。因此,為提高結(jié)直腸癌的預(yù)防、早期診斷、個(gè)體化治療及預(yù)后的評(píng)估,非常有必要進(jìn)一步識(shí)別潛在的分子生物標(biāo)志物和治療靶點(diǎn)。近期一項(xiàng)研究表明[4],當(dāng)腫瘤細(xì)胞高表達(dá)SLC7A11蛋白時(shí),在葡萄糖饑餓的條件下,細(xì)胞胞內(nèi)的胱氨酸等二硫化物會(huì)發(fā)生異常積累,后者會(huì)誘導(dǎo)二硫化物應(yīng)激/脅迫,導(dǎo)致肌動(dòng)蛋白細(xì)胞骨架之間的異常二硫鍵交聯(lián),最終引起肌動(dòng)蛋白網(wǎng)絡(luò)崩潰,從而形成腫瘤細(xì)胞死亡。這種因葡萄糖缺乏而誘導(dǎo)的高表達(dá)SLC7A11 癌細(xì)胞死亡不屬于任何一種已知的細(xì)胞死亡類型,不但不能被一般細(xì)胞死亡抑制劑或敲除鐵死亡/細(xì)胞凋亡關(guān)鍵基因所阻止,且硫醇氧化劑(如二酰胺和馬來(lái)酸二乙酯)則可以顯著增強(qiáng)這種細(xì)胞死亡,因而該死亡方式被命名為雙硫死亡。研究還發(fā)現(xiàn)[4],高表達(dá)SLC7A11 的癌細(xì)胞在葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)體(glucose transporter,GLUT)抑制劑的誘導(dǎo)下可發(fā)生雙硫死亡,進(jìn)而抑制腫瘤生長(zhǎng),且對(duì)正常組織無(wú)明顯毒性,有望成為腫瘤治療的新策略。因此,本研究旨在基于生物信息學(xué)方法識(shí)別雙硫死亡相關(guān)基因與結(jié)直腸癌的關(guān)系,并評(píng)估結(jié)直腸癌免疫細(xì)胞浸潤(rùn)情況。

        在本研究中,通過(guò)生物信息學(xué)分析識(shí)別出了2個(gè)雙硫死亡相關(guān)基因與結(jié)直腸癌密切相關(guān),包括基因SLC7A11 和SLC3A2,它們均在結(jié)直腸癌中高表達(dá)。通過(guò)K-M 生存曲線分析發(fā)現(xiàn),SLC7A11 高表達(dá),與預(yù)后良好相關(guān)。SLC7A11 基因可能被認(rèn)為是一種潛在的預(yù)后標(biāo)志物。SLC7A11 和SLC3A2 基因均為溶質(zhì)載體家族(solute carrier family,SLC)中的成員,后者是人類基因組中僅次于G蛋白偶聯(lián)受體的第二大基因家族,參與介導(dǎo)代謝物和溶質(zhì)跨細(xì)胞膜的轉(zhuǎn)運(yùn)[14]。SLC7A11 是一種重要的跨膜蛋白,其參與氨基酸代謝來(lái)維持胞內(nèi)氧化還原的穩(wěn)態(tài),與SLC3A2 共同組成System Xc-。SLC7A11 作為SystemXc-的功能亞基發(fā)揮主要生物學(xué)功能和轉(zhuǎn)運(yùn)活性,而SLC3A2 作為伴侶蛋白參與維持SLC7A11 的穩(wěn)定性,它們以1∶1的比例攝入胞外的Cys2并排出胞內(nèi)的谷氨酸(glutamate,Glu)[15]。進(jìn)入細(xì)胞質(zhì)的Cys2迅速還原為Cys用于合成GSH[16]。如前所述,SLC7A11促進(jìn)葡萄糖依賴性,導(dǎo)致具有高SLC7A11 表達(dá)的癌細(xì)胞對(duì)葡萄糖缺乏具有更高的敏感性[17]。

        雙硫死亡相關(guān)基因一方面與結(jié)直腸癌的發(fā)生發(fā)展或有密切關(guān)系,另一方面又在結(jié)直腸癌的免疫浸潤(rùn)中起著重要的作用。進(jìn)一步利用TIMER數(shù)據(jù)庫(kù)來(lái)分別評(píng)估結(jié)直腸癌免疫浸潤(rùn)水平與SLC7A11和SLC3A2 表達(dá)之間的相關(guān)性中,發(fā)現(xiàn)SLC7A11 的表達(dá)與結(jié)腸腺癌中的CD8+ T細(xì)胞、中性粒細(xì)胞、樹(shù)突狀細(xì)胞浸潤(rùn)水平呈正相關(guān),與直腸癌的CD8+ T 細(xì)胞、中性粒細(xì)胞浸潤(rùn)水平呈正相關(guān)。SLC3A2 的表達(dá)與結(jié)腸腺癌的CD8+ T細(xì)胞、B細(xì)胞浸潤(rùn)水平呈負(fù)相關(guān),與結(jié)腸腺癌的CD4+ T細(xì)胞呈正相關(guān)。有研究表明[18],CD4+T細(xì)胞具有較高的免疫抑制作用,通過(guò)抑制有效地抗腫瘤免疫,促進(jìn)腫瘤進(jìn)展。B細(xì)胞也被證明在調(diào)節(jié)與腫瘤、自身免疫和炎癥相關(guān)的免疫反應(yīng)中發(fā)揮重要作用[19]。CD8+ T細(xì)胞可以分化為細(xì)胞毒性T淋巴細(xì)胞,后者具有抗腫瘤作用。有研究報(bào)道,中性粒細(xì)胞是腫瘤微環(huán)境中重要的炎癥性浸潤(rùn)細(xì)胞,與腫瘤的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān),腫瘤相關(guān)中性粒細(xì)胞可以極化為抗腫瘤表型(N1型)和促腫瘤表型(N2型)[20]。綜上所述,免疫浸潤(rùn)與結(jié)直腸癌發(fā)生發(fā)展密切相關(guān),但機(jī)制復(fù)雜。CD8+T細(xì)胞和中性粒細(xì)胞(N1型)均具有抗腫瘤作用,這些免疫細(xì)胞的升高,可能也與SLC7A11 高表達(dá),結(jié)直腸癌患者總體生存期反而較長(zhǎng)這一結(jié)果有一定的聯(lián)系。

        人類SLC7A11-SLC3A2 復(fù)合物的結(jié)構(gòu)和Erastin結(jié)合該復(fù)合物的高分辨率結(jié)構(gòu)已經(jīng)有相關(guān)研究報(bào)告和解析[21-22],這可能為合理設(shè)計(jì)有效的雙硫死亡誘導(dǎo)劑提供結(jié)構(gòu)基礎(chǔ),從而產(chǎn)生更有效的治療策略。目前,針對(duì)SLC7A11 的疫苗已經(jīng)研制成功,但要達(dá)到抑制SLC7A11 的效果可能需要大劑量疫苗,而后者的安全性仍有待探索,還有其毒副作用也需要進(jìn)一步評(píng)估[23]。因此,開(kāi)發(fā)靶向SLC7A11 和或者SLC3A2 的新型高效小分子藥物可能是未來(lái)治療結(jié)直腸癌疾病的發(fā)展方向之一。本研究發(fā)現(xiàn),SLC7A11 和SLC3A2 這2 個(gè)雙硫死亡相關(guān)基因均在結(jié)直腸癌患者中高表達(dá),并與結(jié)直腸癌免疫浸潤(rùn)密切相關(guān),且SLC7A11 對(duì)結(jié)直腸癌鑒別診斷具有一定的準(zhǔn)確性,本課題組的發(fā)現(xiàn)為結(jié)直腸癌提供了可靠和潛在的治療靶點(diǎn)。

        參考文獻(xiàn)

        [1] Siegel RL,Miller KD,F(xiàn)uchs HE,et al. Cancer statistics,2021[J].

        CA Cancer J Clin,2021,71(1):7-33.

        [2] 劉宗超,李哲軒,張 陽(yáng),等. 2020 全球癌癥統(tǒng)計(jì)報(bào)告解讀[J].

        腫瘤綜合治療電子雜志,2021,7(2):1-14.

        Liu ZC,Li ZX,Zhang Y,et al. Interpretation on the report of global

        cancer statistics 2020[J]. J Multidiscip Cancer Manag Electron Version,

        2021,7(2):1-14.

        [3] 王 琦,雷雯淇,程 琳,等. BCAP31在結(jié)直腸癌組織中的表

        達(dá)及其臨床意義[J]. 現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué),2023,31(4):693-697.

        Wang Q,Lei WQ,Cheng L,et al. The expression and clinical significance

        of BCAP31 in colorectal cancer tissues[J]. J Mod Oncol,2023,31

        (4):693-697.

        [4] Liu XG,Nie LT,Zhang YL,et al. Actin cytoskeleton vulnerability

        to disulfide stress mediates disulfidptosis[J]. Nat Cell Biol,2023,25

        (3):404-414.

        [5] Love MI,Huber W,Anders S. Moderated estimation of fold change

        and dispersion for RNA-seq data with DESeq2[J]. Genome Biol,2014,

        15(12):550.

        [6] Lewis BP,Burge CB,Bartel DP. Conserved seed pairing,often

        flanked by adenosines,indicates that thousands of human genes are microRNA

        targets[J]. Cell,2005,120(1):15-20.

        [7] Uhlén M,F(xiàn)agerberg L,Hallstr?m BM,et al. Proteomics. Tissuebased

        map of the human proteome[J]. Science,2015,347(6220):1260419.

        [8] Ding CG,Ding XM,Zheng J,et al. miR-182-5p and miR-378a-

        3p regulate ferroptosis in I/R-induced renal injury[J]. Cell Death Dis,

        2020,11(10):929.

        [9] Gy?rffy B,Lanczky A,Eklund AC,et al. An online survival analysis

        tool to rapidly assess the effect of 22 277 genes on breast cancer prognosis

        using microarray data of 1 809 patients[J]. Breast Cancer Res Treat,

        2010,123(3):725-731.

        [10] Li TW,F(xiàn)an JY,Wang BB,et al. TIMER:a web server for comprehensive

        analysis of tumor-infiltrating immune cells[J]. Cancer Res,

        2017,77(21):108-110.

        [11] 孫 娟,張金秀,廖 存,等. MOB3B在結(jié)直腸癌中的表達(dá)及

        其與生存預(yù)后的關(guān)系[J]. 結(jié)直腸肛門(mén)外科,2023,29(1):47-52.

        Sun J,Zhang JX,Liao C,et al. Expression of MOB3B in colorectal cancer

        and its relationship with survival prognosis[J]. J Colorectal Anal

        Surg,2023,29(1):47-52.

        [12] 路麗禎,何 雙,溫菲菲,等. 結(jié)直腸癌中Keap1、Nrf2、Gpx4表

        達(dá)與鐵死亡的相關(guān)性分析及臨床意義[J]. 臨床與實(shí)驗(yàn)病理學(xué)雜志,

        2023,39(2):139-145.

        Lu LZ,He S,Wen FF,et al. Correlation of Keap1,Nrf2,Gpx4 with ferroptosis

        in colorectal carcinoma and its clinical significance[J]. Chin J

        Clin Exp Pathol,2023,39(2):139-145.

        [13] 張新燕,劉英香,趙國(guó)棟. 結(jié)直腸癌中SAA2表達(dá)與腫瘤免疫

        微環(huán)境的關(guān)系[J]. 中國(guó)免疫學(xué)雜志,2022,38(20):2495-2500.

        Zhang XY,Liu YX,Zhao GD. Expression of SAA2 in colorectal cancer

        and its association with tumor immune microenvironment[J]. Chin J Immunol,

        2022,38(20):2495-2500.

        [14] Kandasamy P,Gyimesi G,Kanai Y,et al. Amino acid transporters

        revisited:new views in health and disease[J]. Trends Biochem Sci,

        2018,43(10):752-789.

        [15] Robert SM,Buckingham SC,Campbell SL,et al. SLC7A11 expression

        is associated with seizures and predicts poor survival in patients

        with malignant glioma[J]. Sci Transl Med,2015,7(289):289ra86.

        [16] Combs JA,DeNicola GM. The non-essential amino acid cysteine

        becomes essential for tumor proliferation and survival[J]. Cancers,2019,

        11(5):678.

        [17] Shin CS,Mishra P,Watrous JD,et al. The glutamate/cystine xCT

        antiporter antagonizes glutamine metabolism and reduces nutrient flexibility[

        J]. Nat Commun,2017,8:15074.

        [18] Takeuchi Y,Nishikawa H. Roles of regulatory T cells in cancer

        immunity[J]. Int Immunol,2016,28(8):401-409.

        [19] Sarvaria A,Madrigal JA,Saudemont A. B cell regulation in cancer

        and anti-tumor immunity[J]. Cell Mol Immunol,2017,14(8):662-674.

        [20] 周 興,王 英,張清,等. 中性粒細(xì)胞在腫瘤進(jìn)展及治療中

        的作用[J]. 重慶理工大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)),2021,35(9):194-203.

        Zhou X,Wang Y,Zhang Q,et al. The role of neutrophils in tumor progress

        and anti-tumor therapeutics[J]. J Chongqing Univ Technol Nat Sci,

        2021,35(9):194-203.

        [21] Oda K,Lee YC,Wiriyasermkul P,et al. Consensus mutagenesis

        approach improves the thermal stability of system xc - transporter,xCT,

        and enables cryo-EM analyses[J]. Protein Sci,2020,29(12):2398-

        2407.

        [22] Yan RH,Xie EJ,Li YN,et al. The structure of erastin-bound

        xCT-4F2hc complex reveals molecular mechanisms underlying erastininduced

        ferroptosis[J]. Cell Res,2022,32(7):687-690.

        [23] Ruiu R,Rolih V,Bolli E,et al. Fighting breast cancer stem cells

        through the immune-targeting of the xCT cystine-glutamate antiporter

        [J]. Cancer Immunol Immunother,2019,68(1):131-141.

        (責(zé)任編輯:周一青)

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