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        急性髓細(xì)胞樣白血病中PXK的表達(dá)及臨床意義

        2024-01-26 14:31:14梁萍胡溢洪楊雨旋何旻蕙韓語(yǔ)誠(chéng)鄒先瓊
        激光生物學(xué)報(bào) 2023年5期
        關(guān)鍵詞:表達(dá)

        梁萍 胡溢洪 楊雨旋 何旻蕙 韓語(yǔ)誠(chéng) 鄒先瓊

        收稿日期:2023-07-10;修回日期:2023-09-07。

        基金項(xiàng)目:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(81760490);廣西自然科學(xué)基金項(xiàng)目(2020GXNSFDA238026)。

        作者簡(jiǎn)介:梁萍,實(shí)習(xí)生,主要從事腫瘤免疫研究。

        * 通信作者:鄒先瓊,教授,主要從事分子免疫方面的研究。E-mail: zouxq019@glmc.edu.cn。

        摘 要:含PX結(jié)構(gòu)域的絲氨酸/蘇氨酸激酶基因(PXK)是一種多組織廣譜表達(dá)的基因,在免疫相關(guān)疾病中發(fā)揮了重要作用。本研究的目的是通過(guò)多個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)中的多個(gè)生物信息學(xué)方法分析PXK與急性髓細(xì)胞樣白血病(AML)發(fā)生發(fā)展的相關(guān)性。利用UALCAN 數(shù)據(jù)庫(kù)在線分析 PXK 在 AML 不同亞型中的表達(dá)情況;利用LinkedOmics網(wǎng)站分析PXK表達(dá)水平與AML臨床病理特征的相關(guān)性;利用Kaplan-Meier Plotter數(shù)據(jù)庫(kù)分析PXK在AML中mRNA的表達(dá)情況,并評(píng)估PXK在AML中對(duì)生存率的影響;利用String和GEPIA數(shù)據(jù)庫(kù)分析PXK互作蛋白網(wǎng)絡(luò)及表達(dá)相關(guān)性;利用quanTIseq算法分析PXK基因與腫瘤浸潤(rùn)免疫細(xì)胞相關(guān)性;利用“xCell”R包分析PXK基因表達(dá)水平與多個(gè)免疫檢查點(diǎn)表達(dá)相關(guān)性;利用Metascape數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)PXK及其共表達(dá)基因進(jìn)行功能富集分析,并預(yù)測(cè)其生物學(xué)功能。結(jié)果顯示,PXK在多種癌癥腫瘤組織中較正常組織高表達(dá),在AML中的表達(dá)水平顯著上調(diào),并對(duì)AML患者的各臨床病理特征、生存率及預(yù)后產(chǎn)生影響,但高表達(dá)PXK的AML患者預(yù)后較好。PXK在AML組織中高表達(dá),并與AML的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān),可能是AML診斷、治療效果及預(yù)后評(píng)估的重要指標(biāo)之一。

        關(guān)鍵詞:急性髓細(xì)胞樣白血病;PXK;表達(dá);預(yù)后

        中圖分類號(hào):Q811.4? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?文獻(xiàn)標(biāo)志碼:ADOI:10.3969/j.issn.1007-7146.2023.05.008

        The Expression and Clinical Significance of PXK in Acute Myeloid Leukemia

        LIANG Ping1, 2a, HU Yihong1, 2b, YANG Yuxuan1, 2a, HE Minhui1, 2b, HAN Yucheng1, 2b, ZOU Xianqiong1, 2b*

        (1. Stomatological Hospital Affiliated to Guilin Medical University, Guilin 541004, China; 2. Guilin Medical University? a. College of Intelligent Medicine and Biotechnology; b. School of Basic Medicine, Guilin 541199, China)

        Abstract: PX domain containing serine/threonine kinase (PXK) is a multitissue, broad-spectrum expressed gene that plays an important role in immune-related diseases. The objective of this study was to analyze the relationship between PXK and the development of acute myelocytic leukemia (AML) by using bioinformatics methods in multiple databases. The UALCAN database was utilized to conduct an online analysis of PXK expression in various subtypes of AML. LinkedOmics was utilized to analyze the correlation between the expression level of PXK and the clinicopathologic features of AML. The Kaplan-Meier Plotter database was used to analyze the mRNA expression of PXK in AML and to evaluate the effect of PXK on survival in AML. PXK interacting protein network and expression correlation were analyzed by String and GEPIA databases. The correlation between PXK gene and tumor infiltrating immune cells was analyzed by quanTIseq algorithm, and “xCell” R package was used to analyze the correlation between PXK gene expression and multiple immune checkpoints. PXK and its co-expressed genes were functionally enriched in the Metascape database to anticipate their biological roles. The findings revealed that PXK was highly expressed in various cancer tumor tissues when compared to normal tissues, and the expression level of PXK in AML was significantly up-regulated, which had an effect on the clinicopathological features, survival rate, and prognosis of AML patients, whereas the prognosis of AML patients with high PXK expression was better. PXK is highly expressed in AML tissues and is closely related to the initiation and progression of AML, which may be one of the important indicators for the diagnosis, treatment and prognosis evaluation of AML.

        Key words: acute myeloid leukemia; PXK; expression; prognosis

        (Acta Laser Biology Sinica, 2023, 32(5): 450-459)

        急性髓細(xì)胞樣白血?。╝cute myelocytic leukemia,AML)是一種特征為骨髓譜系異常分化的母細(xì)胞的克隆擴(kuò)張的骨髓惡性疾?。?]。未成熟髓細(xì)胞增殖的后果包括未成熟祖細(xì)胞(母細(xì)胞)的積累、正常造血功能的受損,從而導(dǎo)致嚴(yán)重感染、貧血和出血[2]。每年的AML患者新增數(shù)量可達(dá)20 050例,易復(fù)發(fā)導(dǎo)致高死亡率[3],其兇險(xiǎn)程度可見(jiàn)一斑。成人急性白血病最常見(jiàn)的形式是AML[4],其生存期最短,5年生存率為24%,其病因是異質(zhì)性的,其中部分患者與之前接受治療、從事職業(yè)或暴露于環(huán)境中的DNA損傷藥物有關(guān),但大多數(shù)AML病例的病因仍不明確[1]。目前,大多數(shù)腫瘤都采用手術(shù)和放化療的方法。AML的標(biāo)準(zhǔn)誘導(dǎo)治療方案是“3+7”,即蒽環(huán)類藥物結(jié)合阿糖胞苷,對(duì)于挽救性治療,可以選擇靶向治療聯(lián)合強(qiáng)化療方案[5]。然而,放化療極易損傷患者周圍健康的組織,并且影響患者的身心健康。

        含PX結(jié)構(gòu)域的絲氨酸/蘇氨酸激酶(PX domain containing serine/threonine kinase,PXK)是斯洛布家族(slob family)中一類相對(duì)分子質(zhì)量較大的蛋白,分子質(zhì)量約為93 248 Da,在人類中其編碼基因定位于3p14.3,在多種組織中表達(dá),包括大腦、心臟、骨骼肌和外周血淋巴細(xì)胞[6]。PXK編碼包含N端PX結(jié)構(gòu)區(qū)的578個(gè)氨基酸殘基,中心為蛋白激酶樣結(jié)構(gòu)域和C端WH2結(jié)構(gòu)域[7]。PXK參與配體誘導(dǎo)的表皮生長(zhǎng)因子(epidermal growth factor receptor,EGFR)的內(nèi)化和降解[8]。PXK也可以結(jié)合和調(diào)節(jié)大腦Na、K-ATP酶亞基ATP1B1和ATP1B3,參與調(diào)節(jié)電興奮性和突觸傳輸[9]。PXK與多種自身免疫性疾病有相關(guān)性,是重要的免疫疾病標(biāo)志物。本研究的目的在于通過(guò)探究PXK對(duì)急性髓系白血病的發(fā)生發(fā)展作用,為AML的治療提供新的思路和方法。

        1 材料與方法

        1.1 PXK在AML及在其臨床亞型中的表達(dá)分析

        使用Kaplan-Meier Plotter數(shù)據(jù)庫(kù)分析比較PXK基因在正常外周血樣本和AML患者外周血樣本中 mRNA 的表達(dá)量[10]。通過(guò) UALCAN 數(shù)據(jù)庫(kù)(http://ualcan.path.uab.edu)獲得急性髓系白血病 TCGA 數(shù)據(jù),AML 總例數(shù)為171例,其中 M0(n=16)、M1(n=42)、M2(n=39)、M3(n=16)、M4(n=35)、M5(n=18)、M6(n=2)、M7(n=3)。通過(guò) UALCAN 數(shù)據(jù)庫(kù)在線分析 PXK 在 AML 不同亞型中的表達(dá)情況。

        1.2 PXK的表達(dá)與臨床病理特征之間的關(guān)系分析

        利用LinkedOmics網(wǎng)站分析PXK的表達(dá)水平與AML各臨床病理特征之間的關(guān)系[11]。

        1.3 PXK在AML中相關(guān)性基因分析

        利用UALCAN數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)PXK的相關(guān)性基因進(jìn)行分析,選取與PXK正相關(guān)的前50個(gè)基因。采用String數(shù)據(jù)庫(kù)(https://cn.string-db.org/)分析PXK信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路,構(gòu)建與其相互作用的蛋白網(wǎng)絡(luò),得到PXK的緊密相關(guān)基因。運(yùn)用 GEPIA數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行相關(guān)性分析驗(yàn)證[12]。

        1.4 PXK在AML中免疫細(xì)胞浸潤(rùn)水平分析

        應(yīng)用quanTIseq算法分析PXK在AML中的免疫細(xì)胞浸潤(rùn)情況[13]?;诜淳矸e算法的quanTIseq可以利用bulk samples的RNA_seq數(shù)據(jù)預(yù)測(cè)腫瘤樣本中不同種類免疫細(xì)胞的組成,支持包括B細(xì)胞、NK細(xì)胞、巨噬細(xì)胞、T細(xì)胞等11種類型的免疫細(xì)胞浸潤(rùn)水平分析[14]。鑒于PXK表達(dá)與免疫浸潤(rùn)的關(guān)聯(lián),我們接下來(lái)通過(guò)xCell R包分析研究PXK表達(dá)與免疫檢查點(diǎn)基因表達(dá)之間的相關(guān)性。

        1.5 PXK的表達(dá)量與AML患者預(yù)后相關(guān)性分析

        運(yùn)用Kaplan-Meier Plotter數(shù)據(jù)庫(kù)分析PXK的表達(dá)水平與AML患者的預(yù)后關(guān)系[15]。通過(guò)Kaplan-Meier Plotter可以檢索所感興趣的基因分析患者生存數(shù)據(jù),進(jìn)而了解患者的生存分析圖形和預(yù)后信息[16]。

        1.6 PXK及其共表達(dá)基因的基因本體(GO)富集分析和京都基因與基因組百科全書(shū)(KEGG)通路富集分析

        Metascape是一款涵蓋多種物種的基因組數(shù)據(jù)和生物信息學(xué)數(shù)據(jù)的基因功能注釋分析工具,可以快速進(jìn)行大規(guī)模的生物信息學(xué)分析[17]。篩選得出PXK的主要相關(guān)基因之后,采用Metascape數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)靶基因PXK進(jìn)行基因本體(gene ontology,GO)富集分析,注釋靶基因的生物學(xué)過(guò)程(biological process,BP)、細(xì)胞組分(cellular component,CC)和分子功能(molecular function,MF),確定其參與的主要代謝通路并進(jìn)行京都基因與基因組百科全書(shū)(Kyoto encyclopedia of genes and genome,KEGG)通路富集分析[18]。

        1.7 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

        AML與正常外周血樣本中PXK基因表達(dá),以及在AML各亞型(M0~M7)中的表達(dá)差異采用t檢驗(yàn)。PXK與主要相互作用基因的相關(guān)性和PXK基因表達(dá)與患者預(yù)后關(guān)系采用Kaplan-Meier模型進(jìn)行分析。PXK表達(dá)水平與免疫細(xì)胞浸潤(rùn)水平的相關(guān)性采用Spearman 秩相關(guān)檢驗(yàn)。所用數(shù)據(jù)采用在線統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,*P<0.05,**P<0.01,***P<0.001,P<0.05被認(rèn)為差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 PXK在AML及在其臨床亞型中的表達(dá)分析

        Kaplan-Meier Plotter數(shù)據(jù)庫(kù)分析結(jié)果表明,與正常外周血樣本相比,PXK基因在AML樣本中明顯高表達(dá),且差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)(圖1)。

        利用UALCAN數(shù)據(jù)庫(kù)分析PXK在AML不同臨床亞型中表達(dá)情況,PXK在M3和 M2中高表達(dá),在M6和M7中表達(dá)最低。其中,M0-vs-M2(P=4.661×10-2),M0-vs-M3(P=0.008×10-2),M0-vs-M4(P=4.209×10-2),M1-vs-M3(P=0.058×10-2),M2-vs-M3(P=0.036×10-2),M3-vs-M4(P=0.051×10-2),M3-vs-M5(P=0.011×10-2),M3-vs-M7(P=2.821×10-2),表達(dá)差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義 (圖 2)。

        2.2 PXK的表達(dá)與臨床病理特征之間的關(guān)系分析

        PXK表達(dá)與AML的臨床病理分級(jí)、臨床M分期、年齡、人種等相關(guān)。PXK在不同的病理分級(jí)中表現(xiàn)顯著,stage IV期顯著高于stage Ⅱ期、stage Ⅲ期(圖3a)。在臨床M分期中,M1分期的PXK表達(dá)較其他分期組顯著提高(圖3b)。PXK的表達(dá)隨著患者的年齡增大而增高(圖3c)。在臨床T分期中,T2分期的PXK表達(dá)顯著高于其他分期組(圖3d)。在全球三大人種中,PXK在亞洲人種的表達(dá)顯著高于其他人種(圖3e)。未進(jìn)行放療的患者中PXK的表達(dá)量低于放療患者的表達(dá)量(圖3f)。PXK表達(dá)與AML的種族(P=2.046)、年齡(P=-5.285×10-2)、放療(P=1.327×10-1)、S分期(P=2.427)、M分期(P=1.614×10-1)、T分期(P=4.755×10-1)相關(guān),差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。

        2.3 PXK與AML中相互作用蛋白的關(guān)系

        采用String數(shù)據(jù)庫(kù)分析獲得與PXK互作的蛋白網(wǎng)絡(luò),蛋白質(zhì)互作作用(protein protein interaction,PPI)富集P=2.81×10-5,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(圖4)。在PPI網(wǎng)絡(luò)中分析得出與PXK主要相互作用的有酪氨酸蛋白激酶BLK (BLK proto-oncogene, Src family tyrosine kinase,BLK)、核糖核酸酶P蛋白亞基p14 (ribonuclease P/MRP subunit p14,RPP14)、酪氨酸蛋白磷酸酶非受體22型 (protein tyrosine phosphatase non-receptor type 22,PTPN22)、含PHD和RING 指形結(jié)構(gòu)域的蛋白質(zhì)1 (PHD and ring finger domains 1,PHRF1)和UDP-N乙酰葡糖胺:betaGalβ-1,3-N-乙酰葡糖胺基轉(zhuǎn)移酶2 (UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2,B3GNT2)。同時(shí)利用GEPIA數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)PXK與BLK、RPP14、PTPN22、PHRF1和B3GNT2分別進(jìn)行相關(guān)性分析,結(jié)果顯示,PXK與BLK、PTPN22、RPP14之間有顯著的相關(guān)性,PXK vs BLK(P=0.045),PXK vs PTPN22(P=1.8×10-5),PXK vs RPP14(P=0.02)(圖5)。

        2.4 PXK基因與免疫細(xì)胞浸潤(rùn)水平的關(guān)系

        quanTIseq分析結(jié)果顯示,PXK基因表達(dá)水平與多種免疫細(xì)胞類型,包括B細(xì)胞、CD8+T細(xì)胞、CD4+T細(xì)胞和巨噬細(xì)胞,存在顯著的相關(guān)性(P<0.05)。另外,我們發(fā)現(xiàn),在急性髓系白血病中,PXK基因表達(dá)水平與CD8+T細(xì)胞的浸潤(rùn)程度呈現(xiàn)顯著的正相關(guān)性(P<0.001),有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(圖6)。

        在xCell R包分析中,我們選擇了38個(gè)常見(jiàn)的免疫檢查點(diǎn)基因, 橫坐標(biāo)代表不同腫瘤組織,縱坐標(biāo)代表不同的免疫浸潤(rùn)評(píng)分,不同顏色代表相關(guān)系數(shù),負(fù)值代表負(fù)相關(guān),正值代表正相關(guān),相關(guān)性越強(qiáng)顏色越深。有趣的是,我們發(fā)現(xiàn)在 AML中,PXK的表達(dá)與15個(gè)免疫檢查點(diǎn)標(biāo)志物顯著相關(guān),如CD8+T細(xì)胞、CD4+T細(xì)胞、B細(xì)胞等。這些結(jié)果表明,PXK可能在AML的免疫浸潤(rùn)和免疫逃逸中起著至關(guān)重要的作用。

        2.5 PXK的表達(dá)與AML患者預(yù)后的關(guān)系

        運(yùn)用Kaplan-Meier Plotter數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)734個(gè)樣本進(jìn)行總生存期(overall survival,OS)預(yù)后分析,對(duì)353個(gè)樣本進(jìn)行無(wú)病生存期(event free survival,EFS)預(yù)后分析,得出PXK低表達(dá)組無(wú)病生存時(shí)間及總體生存時(shí)間更短,預(yù)后更差,P<0.05具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(圖7)。

        2.6 PXK共表達(dá)基因的GO注釋分析和KEGG通路富集分析

        為闡明PXK的作用機(jī)制,通過(guò)Metascape數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)PXK共表達(dá)基因進(jìn)行了GO及KEGG富集分析。結(jié)果表明,PXK共表達(dá)基因顯著參與對(duì)雌二醇的反應(yīng)、動(dòng)作電位、糖穩(wěn)態(tài)、行為白細(xì)胞遷移、蛋白同源寡聚化、囊泡介導(dǎo)的轉(zhuǎn)運(yùn)調(diào)節(jié)、細(xì)胞-細(xì)胞連接組裝、內(nèi)分泌系統(tǒng)發(fā)育、激素介導(dǎo)的信號(hào)通路、蛋白質(zhì)成熟、髓系細(xì)胞分化的調(diào)節(jié)、對(duì)傷害反應(yīng)的正向調(diào)節(jié)、對(duì)無(wú)機(jī)物的反應(yīng)以及固有免疫反應(yīng)等(圖8)。此外,PXK共表達(dá)基因也在在響應(yīng)細(xì)胞周期調(diào)控、DNA損傷修復(fù)和細(xì)胞凋亡過(guò)程中顯著富集(圖8)。

        3 討論

        有關(guān)數(shù)據(jù)表明,成年人最常見(jiàn)的急性白血病類型是急性髓系白血病,發(fā)病率高達(dá)75%~80%。成年AML患者(18~60歲)5年后的總體生存率約為 40%,老年AML患者(>60歲)的總體生存率僅為10%左右[19]。急性髓系白血病是目前全球發(fā)病率和死亡率較高的惡性腫瘤之一,其復(fù)雜的分子機(jī)制和不同亞型異質(zhì)性大導(dǎo)致傳統(tǒng)的放療以及誘導(dǎo)方案無(wú)法給患者帶來(lái)最優(yōu)治療效果。因此,通過(guò)尋找 AML發(fā)生發(fā)展的關(guān)鍵分子或靶點(diǎn),深入探討PXK的發(fā)病機(jī)制,對(duì)于早期干預(yù)AML的發(fā)生發(fā)展以及判斷預(yù)后,從而降低急性髓系白血病患者的發(fā)病率和死亡率具有重要意義。

        PXK是斯洛布家族中重要的一員,介導(dǎo)與肌動(dòng)蛋白相互作用、調(diào)節(jié)質(zhì)膜Na+-K-ATP酶參與調(diào)節(jié)電興奮性和突觸傳遞過(guò)程、參與EGFR的內(nèi)化和降解以及信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)等重要生物學(xué)過(guò)程[20]。隨著對(duì)PXK的深入研究,越來(lái)越多的研究表明,其與免疫疾病的發(fā)生發(fā)展有著密不可分的聯(lián)系。PXK在惡性腫瘤中表現(xiàn)出一定的作用,例如,王信等[21]研究發(fā)現(xiàn),PXK mRNA在系統(tǒng)性紅斑狼瘡(systemic lupus erythematosus,SLE)患者外周血白細(xì)胞中表達(dá)上調(diào),與患者的抗SmD1抗體的產(chǎn)生及 C3、C4的下降有一定相關(guān)性。對(duì)系統(tǒng)性硬化癥(systemicscleroderma,SSc)的研究發(fā)現(xiàn),PXK蛋白激酶區(qū)域與另一個(gè)鋅指基因1(JAZF1)并列編碼一種核蛋白,并作為轉(zhuǎn)錄抑制因子發(fā)揮作用,與體內(nèi)的膠原沉積和骨形態(tài)發(fā)生有關(guān),從而影響皮膚疾?。ㄈ鏢Sc和SLE)的關(guān)鍵過(guò)程[22]。在不明原因復(fù)發(fā)性妊娠丟失(unexplained recurrent pregnancy loss,URPL)研究中發(fā)現(xiàn),子宮內(nèi)膜異位癥患者卵巢的卵母細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組與健康供體的卵母細(xì)胞核的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行比較時(shí),PXK表達(dá)水平顯著下調(diào)[23]。PXK與SLE的自身抗體產(chǎn)生相關(guān)[24],而抗磷脂抗體與URPL患者高發(fā)病率有關(guān),因此推測(cè),PXK可能通過(guò)自身免疫影響不孕,卵巢早衰等與URPL相關(guān)聯(lián)。此外,PXK基因在腎嫌色細(xì)胞癌、彌漫性大B細(xì)胞淋巴瘤、皮膚黑素瘤、肝細(xì)胞肝癌、胃癌的表達(dá)水平均高于鄰近癌旁組織,PXK與AML預(yù)后分析和腫瘤突變負(fù)荷有顯著相關(guān)性[25]。惡性細(xì)胞生長(zhǎng)的特征是由突變或異常的外部信號(hào)傳導(dǎo)引起的正常細(xì)胞內(nèi)信號(hào)傳導(dǎo)的破壞。磷酸肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B (AKT)/哺乳動(dòng)物雷帕霉素(mTOR)途徑的靶標(biāo)(PI3K/AKT/mTOR途徑)在AML中異常上調(diào),是造血細(xì)胞的核心,并調(diào)節(jié)增殖、分化和存活等關(guān)鍵功能[26]。使用特異性抑制劑靶向 PI3K/AKT/mTOR 通路可抑制白血病細(xì)胞生長(zhǎng)[27]。抑制PI3K/AKT/NF-κB通路的活化可以抑制AML細(xì)胞的惡性生物學(xué)行為,進(jìn)而誘導(dǎo)細(xì)胞程序性死亡[28]。然而,關(guān)于PXK在AML中的作用較少有報(bào)道。本研究通過(guò)綜合多個(gè)在線數(shù)據(jù)庫(kù)和在線工具的生物信息學(xué)方法,對(duì)PXK在AML中的表達(dá)情況及其發(fā)生發(fā)展進(jìn)行了分析,為AML在臨床上的診斷及治療提供了新的思路。

        本研究結(jié)果表明,PXK在多種惡性腫瘤中表達(dá)異常,在AML腫瘤組織中高表達(dá),并與臨床病理分期呈負(fù)相關(guān)關(guān)系,有利于PXK患者生存。PXK 在 AML M3 和 M2亞型中高表達(dá),在 M6 和 M7 中低表達(dá),說(shuō)明PXK高水平表達(dá)或具有緩解AML惡化程度的功能。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),PXK表達(dá)與急性髓系細(xì)胞樣白血病的臨床病理分級(jí)、臨床M分期、年齡、人種顯著相關(guān)。除了闡明PXK在AML中的臨床意義,本研究還進(jìn)一步分析了與PXK相關(guān)的基因和蛋白質(zhì)的相互作用,同時(shí)驗(yàn)證在急性髓系細(xì)胞樣白血病中PXK主要相關(guān)基因,結(jié)果表明,PXK基因與BLK、PTPN22和RPP14具有顯著相關(guān)性。Uniport數(shù)據(jù)庫(kù)顯示,BLK是參與B淋巴細(xì)胞發(fā)育、分化和信號(hào)傳導(dǎo)的一種非受體酪氨酸激酶。研究表明,BLK基因參與PI3K/AKT/NF-κB信號(hào)通路的激活及細(xì)胞周期信號(hào)的增強(qiáng)[29],且BLK多態(tài)性與系統(tǒng)性硬化癥[30]、類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎易感性有顯著相關(guān)性[31]。PTPN22作為 T 細(xì)胞受體信號(hào)傳導(dǎo)的負(fù)調(diào)節(jié)因子,可以正向調(diào)節(jié)Toll樣受體誘導(dǎo)的1型干擾素產(chǎn)生,并促進(jìn)由1型干擾素介導(dǎo)的宿主抗病毒反應(yīng)。PTPN22通過(guò)T細(xì)胞中的14-3-3τ激活PI3K通路[32]。PTPN22基因被抑制后,通過(guò)AKT和細(xì)胞外信號(hào)調(diào)節(jié)激酶(ERK)信號(hào)通路,可引起T細(xì)胞白血病細(xì)胞系(Jurkat)凋亡的發(fā)生[33]。PTPN22基因的變異與系統(tǒng)性紅斑狼瘡[34]和類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎易感性有關(guān)[35]。RPP14是核糖核酸酶P的成分,核糖核酸酶復(fù)合物通過(guò)切割其5'末端產(chǎn)生成熟的tRNA。BLK和PTPN22基因在PI3K/AKT/NF-κB信號(hào)通路的激活過(guò)程中起著重要作用,而PXK的多態(tài)性與系統(tǒng)性紅斑狼瘡、系統(tǒng)性硬化癥相關(guān),與BLK、PTPN22、RPP14基因顯著相關(guān),提示PXK可能通過(guò)PI3K/AKT/NF-κB信號(hào)通路介導(dǎo)AML細(xì)胞增殖、侵襲和轉(zhuǎn)移,從而影響AML的發(fā)生發(fā)展。PXK作為一種免疫相關(guān)性細(xì)胞因子,與CD4+T細(xì)胞、CD8+T細(xì)胞、B細(xì)胞、巨噬細(xì)胞的表達(dá)呈正相關(guān),與CD8+T細(xì)胞、CD4+T細(xì)胞、B細(xì)胞等15個(gè)免疫檢查點(diǎn)標(biāo)志物相關(guān)(P<0.005),表明PXK可調(diào)控免疫細(xì)胞的活性,在AML的免疫浸潤(rùn)和免疫逃逸中或起著至關(guān)重要的作用。在OS和EFS預(yù)后分析中發(fā)現(xiàn),高表達(dá) PXK 組的 AML 患者較低表達(dá)組患者預(yù)后差,說(shuō)明PXK具有作為預(yù)測(cè) AML 患者預(yù)后的新的生物標(biāo)志物的潛力。PXK及其相關(guān)基因主要富集在對(duì)雌二醇的反應(yīng)、動(dòng)作電位、糖穩(wěn)態(tài)、行為白細(xì)胞遷移、蛋白同源寡聚化,這些基因在響應(yīng)細(xì)胞周期調(diào)控、DNA損傷修復(fù)和細(xì)胞凋亡過(guò)程中顯著富集。這提示這些基因可能與細(xì)胞周期調(diào)控相關(guān)的蛋白質(zhì)及細(xì)胞黏附和遷移相關(guān)的蛋白質(zhì)相互作用,從而介導(dǎo)AML細(xì)胞增殖、侵襲和轉(zhuǎn)移等過(guò)程。

        綜上所述,本研究揭示了PXK的低水平表達(dá)與AML的惡性程度以及患者的不良預(yù)后顯著相關(guān),推測(cè) PXK對(duì)于AML的發(fā)生發(fā)展具有抑制作用,對(duì)于預(yù)測(cè)腫瘤的療效以及預(yù)后具有重要意義。PXK可能是一個(gè)潛在的腫瘤預(yù)后生物標(biāo)志物。此外,PXK可能通過(guò)PI3K/AKT/NF-κB信號(hào)通路抑制AML的發(fā)生發(fā)展。本研究為探討PXK在AML中的具體作用機(jī)制提供了新的方向,為PXK作為AML預(yù)防或治療藥物應(yīng)用于臨床治療提供了一定的理論基礎(chǔ)。然而,本研究中采用的生物信息學(xué)方法顯示的是基于不同的數(shù)據(jù)庫(kù)分析得到的結(jié)果,由于不同數(shù)據(jù)庫(kù)收集的樣本量不同,分析結(jié)果也不盡相同。PXK在腫瘤中的作用機(jī)制尚不清楚,仍需要進(jìn)一步深入研究。

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