秦鵬鈞
摘 要:隨著人們生活水平的提高,人們對食品安全問題越來越重視。研究和建立食源性致病菌快速檢測方法越來越受到社會的廣泛關(guān)注。本文主要從分子生物學(xué)角度綜述起在食品檢驗(yàn)中的應(yīng)用,包括聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)及相關(guān)技術(shù)、寡核苷酸探針技術(shù)、DNA指紋圖譜技術(shù)等。
關(guān)鍵詞:食品安全;分子生物學(xué);食品檢測
近年來,世界各地區(qū)食品安全惡性事件頻繁發(fā)生。據(jù)報(bào)道,2020年7月29日,約旦首都安曼發(fā)生大規(guī)模食物中毒事件,導(dǎo)致至少700人中毒,其中一名兒童死亡。此外,因食品安全問題,美國先后召回2 800萬箱谷物早餐制品、5.5億枚雞蛋。食品安全問題給各個國家和人民帶來了巨大的損失和痛苦。
傳統(tǒng)培養(yǎng)方法檢測微生物時,受到食品環(huán)境脅迫或受損的微生物細(xì)胞通常需要在特殊的培養(yǎng)條件才能恢復(fù)生長,導(dǎo)致其難以被分離。發(fā)展及時、準(zhǔn)確檢出食品中微生物的技術(shù)迫在眉睫,這一現(xiàn)象促進(jìn)了以PCR等為代表的分子生物學(xué)技術(shù)在食品微生物及相關(guān)領(lǐng)域研究中的應(yīng)用和發(fā)展。分子生物學(xué)技術(shù)具有快捷、靈敏、準(zhǔn)確等優(yōu)點(diǎn),可精確確定存在于食品中的微生物種類及菌群情況。
1 聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)及相關(guān)技術(shù)
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)是由K. Mullis建立的一種體外擴(kuò)增特異DNA片段的技術(shù)。它利用變性與復(fù)性原理,使用DNA聚合酶,在引物和dNTP的參與下,在數(shù)小時內(nèi)在體外對特異DNA片段進(jìn)行百萬倍擴(kuò)增[1]。這種技術(shù)具有靈敏度高、特異性強(qiáng)、操作簡便等特點(diǎn)。
1.1 多重PCR技術(shù)
食品中通常含有不止一種致病菌,而普通PCR技術(shù)僅可對單一致病菌進(jìn)行定量定性分析,在此技術(shù)基礎(chǔ)上衍生了多重PCR技術(shù),通過對引物、溫度等條件的改變,可對兩種或兩種以上致病菌進(jìn)行同時檢測,是食源性致病菌檢測的重要發(fā)展發(fā)向。Elizaquivel等運(yùn)用該技術(shù)對沙門菌、金黃色葡萄球菌和大腸桿菌進(jìn)行同時檢測[2]。
1.2 RT-PCT
RT-PCT(反轉(zhuǎn)錄PCR),以mRNA為模板,通過反轉(zhuǎn)錄酶逆轉(zhuǎn)錄cDNA,然后將此為模板,使用特異性引物,擴(kuò)增目的序列[3]。該法可在基因表達(dá)水平層面上檢測細(xì)胞或者組織,還可以檢測細(xì)胞中RNA病毒的含量或直接擴(kuò)增特定基因的cDNA等。
1.3 實(shí)時定量熒光PCR技術(shù)
該技術(shù)是將熒光分子加入反應(yīng)體系中,然后通過檢測熒光信號來實(shí)時反映DNA量,可以實(shí)時觀測到PCR產(chǎn)物。而多重實(shí)時熒光定量PCR可實(shí)現(xiàn)大腸桿菌、沙門菌和金葡球菌的同時、高效共檢。相關(guān)人員利用該方法,對40份食品樣品中的單增李斯特氏菌進(jìn)行了檢測,其靈敏度達(dá)只需19個細(xì)菌就可以得到陽性結(jié)果[4]。
2 以16S rRNA為靶基因進(jìn)行的檢測技術(shù)
16S rRNA存在于所有原核細(xì)胞中,有較高的拷貝數(shù),其序列中含可變區(qū)及高度保守區(qū),因此可設(shè)計(jì)群、屬、種特異性探針進(jìn)行微生物檢測。對細(xì)菌中的16S rRNA基因進(jìn)行測序是當(dāng)前細(xì)菌鑒定的“金標(biāo)準(zhǔn)”。馮金牛等人利用該方法對鴨疫里默氏桿菌DNA進(jìn)行檢測的最小檢出量為1.907×10-5 g/L,菌液的最小檢出量為1.5×104 CFU/mL[5]。
3 DNA指紋圖譜技術(shù)
英國遺傳學(xué)家Jefferys等在1984年將人源小衛(wèi)星DNA用作基因探針,同人體核DNA的酶切片段雜交,獲得了長度不等的雜交帶圖紋,因?yàn)楂@得的圖紋幾乎都不相同,其個體識別能力足以與手指指紋相媲美。目前,隨著科技的發(fā)展,已衍化出多種技術(shù)。
3.1 變性梯度凝膠電泳標(biāo)記技術(shù)(DGGE技術(shù))
DGGE技術(shù)是在變性劑的作用下從而使DNA片段電泳遷移率發(fā)生變化,使片段大小相同堿基不同的DNA片段分開。在食品中微生物的分離、鑒定中使用廣泛,也可以確定生物群落的變化。Ampe等利用該技術(shù)檢測酸化木薯淀粉發(fā)酵過程中的生物群落,檢測到鏈球菌、乳球菌等微生物[6]。
3.2 溫度梯度凝膠電泳技術(shù)(TGGE技術(shù))
TGGE技術(shù)是在DGGE基礎(chǔ)上進(jìn)一步發(fā)展的技術(shù),與DGGE不同的是,該技術(shù)在引物的5端加入3 050 bp的GC片段且有溫度梯度變化[7]。該技術(shù)的特點(diǎn)是可以發(fā)現(xiàn)目前尚未被認(rèn)識的腸道細(xì)菌,但在食品檢驗(yàn)中的應(yīng)用較少。
3.3 隨即擴(kuò)增多態(tài)DNA技術(shù)(RAPD技術(shù))
RAPD技術(shù)的特點(diǎn)是引物隨機(jī),擴(kuò)增后會得到不同大小的DNA,通過分子標(biāo)記,對不同大小的DNA進(jìn)行差異性分析。該技術(shù)以整個細(xì)菌DNA基因組為對象,特異性和敏感性較高,在分子生物學(xué)研究甚少的領(lǐng)域或者分子生物學(xué)特征不明確或不了解基因組DNA序列的真菌和乳酸菌的檢測中都可以應(yīng)用該技術(shù)。實(shí)際應(yīng)用中在品種純度檢測方面應(yīng)用較多。如余四斌等人利用該技術(shù)快速鑒定雜交水稻種子的純度[8]。
3.4 核糖體RNA基因分析技術(shù)
現(xiàn)存的所有生物基本都含有核糖體,且rRNA序列在同種生物細(xì)胞中的差異很小,在不同的生物種群中可以通過對比堿基進(jìn)行分析,相應(yīng)的技術(shù)方法即是核糖體RNA基因分析技術(shù),在菌株的分離鑒定中有極大的優(yōu)勢。該技術(shù)可用于副溶血性弧菌、李斯特菌、沙門氏菌、霍亂弧菌等的檢測[9]。
4 分子印跡技術(shù)
1975年Southern首先提出了分子印跡的概念。原理是將一個具有特定形狀和大小的、可識別的分子作為模板分子,將其溶于交聯(lián)劑中,再加入特定的功能單體聚合物后,形成高度交聯(lián)的聚合物,其內(nèi)部包埋有可與功能單體相互作用的模板分子,然后利用物理或化學(xué)方法將模板分子洗脫,這樣聚合物母板上留下了與模板分子形狀相似的孔穴,且孔穴內(nèi)各功能基團(tuán)的位置與所用的模板分子互補(bǔ),可與模板分子發(fā)生特殊的結(jié)合作用,從而實(shí)現(xiàn)對模板分子的識別[10]。近年來,分子印跡技術(shù)運(yùn)用十分廣泛,無論是DNA、RNA還是蛋白質(zhì)層面的檢測都可運(yùn)用該技術(shù)。
4.1 Western blotting
Western blotting即為蛋白質(zhì)印跡法。它的原理是抗原抗體的特異性結(jié)合。將從待測樣品中提取的分子大小不同的蛋白質(zhì)(抗原)混合物用凝膠電泳法分離后,將其轉(zhuǎn)移到固定支持物上,用帶有標(biāo)記的抗體做探針與之雜交,通過放射自顯影等技術(shù)檢測基因表達(dá)的產(chǎn)物。金明國等人就是利用通過Western blotting技術(shù)準(zhǔn)確檢測馬檳榔甜蛋白[11]。
4.2 Dot blotting
Dot blotting即為斑點(diǎn)印跡技術(shù)。它是一種酶免疫分析技術(shù)。它的原理是用點(diǎn)滴法或電斑法將抗原轉(zhuǎn)移到尼龍膜上或硝基纖維膜上。該法敏感度極高,毫/微克水平的特異性抗原也可以成功檢出。斑點(diǎn)印跡技術(shù)對實(shí)驗(yàn)室及設(shè)備的要求低,是比較容易掌握的一門技術(shù)。楊靖亞等人利用斑點(diǎn)印跡法技術(shù)特異性檢測致病性副溶血弧菌,靈敏度高、操作簡單,可用肉眼判定結(jié)果[12]。
參考文獻(xiàn)
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[12]楊靖亞,張建,趙勇,等.Western斑點(diǎn)印跡法檢測致病性副溶血弧菌[J].食品科學(xué),2010(20):413-416.