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        乙肝耐藥全基因測(cè)序分析研究

        2020-12-07 02:53:44姜靜萬浩李徐圖謝文英蔣麗琳楊瑞生張平孟冬梅
        中國醫(yī)學(xué)工程 2020年11期
        關(guān)鍵詞:突變率核苷類似物

        姜靜,萬浩,李徐圖,謝文英,蔣麗琳,楊瑞生,張平,孟冬梅

        (武漢康圣達(dá)醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)所有限公司 營銷感染市場(chǎng)部,湖北省 武漢市 430000)

        乙型肝炎病毒(HBV)感染是一個(gè)全球性健康問題,它增加了患者肝硬化、肝癌的風(fēng)險(xiǎn),需要終生治療。世界衛(wèi)生組織報(bào)道,每年約有88.7萬人死于HBV 感染所致的肝衰竭、肝硬化或原發(fā)性肝癌。全世界約有2.57 億人患有慢性乙型肝炎,其中非洲和亞洲的感染率最高[1]。在我國60%肝硬化和80%肝細(xì)胞癌患者由HBV 感染引起[2]。核苷(酸)類抗病毒藥物是目前治療慢性乙型肝炎的主流,但核苷類似物的長期使用導(dǎo)致患者體內(nèi)不同程度出現(xiàn)病毒耐藥突變。耐藥變異是HBV 經(jīng)過抗病毒藥物的選擇,逐漸對(duì)治療藥物失去敏感性,從而產(chǎn)生抗藥性的過程。HBV 耐藥性的出現(xiàn)是悄無聲息的,難以無法在第一時(shí)間發(fā)現(xiàn)。只有當(dāng)耐藥的HBV 繁殖到一定數(shù)量,才能通過現(xiàn)有的HBV-DNA 檢測(cè)技術(shù)發(fā)現(xiàn)[3]。HBV 在核苷(酸)類抗病毒藥物的作用下會(huì)發(fā)生一個(gè)或多個(gè)耐藥位點(diǎn)的突變。如何及時(shí)靈敏地預(yù)測(cè)耐藥株的出現(xiàn),為臨床醫(yī)生提供選擇最佳替換治療方案或重新選擇治療時(shí)機(jī)顯得尤為必要。分析HBV 耐藥突變位點(diǎn)對(duì)于臨床抗病毒治療方案的選擇以及流行病學(xué)的研究意義重大。筆者采用全基因測(cè)序方法,隨機(jī)選取分析了2019 年1 月至2019 年5 月126 例患者的耐藥基因檢測(cè)結(jié)果,為評(píng)價(jià)藥物治療效果和合理用藥提供理論基礎(chǔ),現(xiàn)報(bào)道如下。

        1 資料與方法

        1.1 研究對(duì)象

        本組126 例,男89 例,女37 例;年齡12~75 歲。所有患者均為接受核苷(酸)類藥物抗病毒治療的慢乙肝患者。核苷(酸)類藥物包括拉米夫定(LAM),阿德福韋(ADV),恩替卡韋(ETV),替比夫定(LdT)和替諾福韋酯(TDF)

        1.2 主要儀器和試劑

        巢式聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)所用儀器為BIO-RAD 基因擴(kuò)增儀,測(cè)序所用儀器為ABI 3700。采集患者血清,按試劑盒要求的步驟從血清中提取HBV DNA,所用試劑盒購自達(dá)安基因股份有限公司。進(jìn)行巢式PCR 引物進(jìn)行擴(kuò)增,擴(kuò)增完畢后,產(chǎn)物進(jìn)行基因測(cè)序,檢測(cè)其耐藥位點(diǎn)形式。所用試劑盒為BigDye Direct Sanger Sequencing Kit。

        1.3 HBV 耐藥位點(diǎn)分析

        為確定所研究病毒群體中是否存在與所用藥物有關(guān)的耐藥突變位點(diǎn),共分析25 個(gè)可能出現(xiàn)的耐藥突變位點(diǎn)。與HBV 標(biāo)準(zhǔn)序列片段進(jìn)行比對(duì),對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行位點(diǎn)突變分析。見表1。

        2 結(jié)果

        2.1 耐藥位點(diǎn)突變率統(tǒng)計(jì)結(jié)果

        126 例患者中,74 例(58.7%)檢測(cè)到耐藥位點(diǎn)突變,主要發(fā)生在204 位點(diǎn)和180 位點(diǎn),突變率占比分別為44%和33%。其次為181 位點(diǎn),突變率占13%。主要是與LAM 耐藥相關(guān)的位置。其他位點(diǎn)具體如圖1 所示。其中L180M+M204V+A181G/C 的突變,已有報(bào)道[4]稱可能對(duì)ETV 耐藥,可以更好指導(dǎo)用藥。

        表1 檢測(cè)位點(diǎn)及對(duì)應(yīng)核苷酸和氨基酸

        圖1 耐藥位點(diǎn)突變率

        2.2 耐藥突變位點(diǎn)連鎖分析結(jié)果

        在檢測(cè)到的發(fā)生耐藥突變的74 例患者中,發(fā)生耐藥位點(diǎn)連鎖突變的49 例,占66.2%。突變位點(diǎn)的連鎖模式達(dá)36 種,最主要的連鎖突變位點(diǎn)是M204V+L180M+S202G,占24.5%(12 例)。男性發(fā)生耐藥的例數(shù)為58 例,204 位點(diǎn)突變率為62%(39/58),180 位點(diǎn)突變率為53.4%(31/58),181位點(diǎn)突變率為22.4%(13/58),236 位點(diǎn)突變率為6.8%(4/58);女性發(fā)生耐藥的例數(shù)為16 例,其中204 位點(diǎn)突變率為50.0%(8/16),180 位點(diǎn)突變率為31.2%(5/16),181 位點(diǎn)突變率為6.25%(1/16);31~60 歲的患者中,180 位點(diǎn)變異率為61%(22/36),181 位點(diǎn)突變率為22.2%(8/36),204 位點(diǎn)變異率為83.3%(30/36),236 位點(diǎn)變異率為11.1%(4/36)。61 歲以上的患者中,180 位點(diǎn)變異率為45.5% (5/11),181 位點(diǎn)變異率為18.1%(2/11),204 位點(diǎn)變異率為45.5%(5/11),236 位點(diǎn)變異率為0。

        HBV P 區(qū)位點(diǎn)突變主要集中在180、181、204和236 位點(diǎn),其他位點(diǎn)也存在較低比例的變異。不同性別和不同年齡段的患者中,HBV P 區(qū)基因突變率尚不具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義上的顯著差異。通過測(cè)序技術(shù)檢測(cè)位點(diǎn)的突變,可以全面反映P 區(qū)位點(diǎn)的變異情況,為臨床用藥提供重要依據(jù)。應(yīng)當(dāng)指出的是,發(fā)生變異不一定耐藥,只有當(dāng)變異株成為優(yōu)勢(shì)株時(shí)才會(huì)發(fā)生耐藥。

        3 討論

        人們對(duì)HBV 感染的自然史和由此產(chǎn)生的疾病的治療潛力的認(rèn)識(shí)正在不斷提高。目前,用于乙型肝炎抗病毒治療的藥物一般有兩類,一類是干擾素(IFN),一類是核苷(酸)類似物,在我國準(zhǔn)許臨床治療應(yīng)用的核苷(酸)類似物主要有5種,包括LAM,ADV,ETV,LdT 和TDF[5]。核苷(酸)類似物在臨床治療應(yīng)用中為抗病毒首選藥物,其治療目的是抑制HBV 復(fù)制并最終阻止或延緩慢性乙型肝炎并發(fā)癥的發(fā)生[6]?,F(xiàn)階段的核苷類似物對(duì)病毒的抑制作用是通過影響反轉(zhuǎn)錄的啟動(dòng)及DNA 的延伸,使病毒的復(fù)制受到抑制而發(fā)揮效用[4]。

        如圖2 所示,核苷(酸)類似物間存在交叉耐藥點(diǎn)的問題。對(duì)于已發(fā)生變異的患者,建議臨床合理的選擇用藥,及時(shí)監(jiān)測(cè)耐藥突變位點(diǎn)的情況,避免出現(xiàn)多重耐藥而增加治療難度。若已出現(xiàn)多重耐藥,則更應(yīng)該監(jiān)測(cè)其耐藥突變位點(diǎn),合理優(yōu)化治療方案,避免病情失去控制而進(jìn)一步加重。

        圖2 HBV 對(duì)應(yīng)核苷(酸)類似物耐藥的基因突變位點(diǎn)

        對(duì)研究對(duì)象進(jìn)行分析得到的結(jié)果揭示耐藥發(fā)生率最高的是LAM,這也與已有文獻(xiàn)報(bào)道LAM 耐藥發(fā)生率高達(dá)65%~70%吻合[7]。在耐藥的處理方面最困難的是多重耐藥的出現(xiàn)。隨著臨床用藥,其他新的耐藥突變模式陸續(xù)出現(xiàn)。本研究中,A181T/V+N236T 位點(diǎn)突變占3 例,其聯(lián)合突變可導(dǎo)致LAM、LdT 和ADV 耐藥,并可顯著降低TDF的抗病毒活性。國內(nèi)的研究及發(fā)現(xiàn)了2 例rt250V/L,rt20I,rtlS0M 和rt204V,rt202G,rt184I新的突變組合。這種新的突變模式是否也會(huì)引起ETV 耐藥或其他耐藥還需進(jìn)一步驗(yàn)證。其中本次分析的患者中也發(fā)現(xiàn)了L180M+M204V+A181G/C的突變,已有文獻(xiàn)報(bào)道可能對(duì)ETV 耐藥[4]??傮w分析表明,男性的耐藥率比女性高。年齡上,61歲患者以上在236 位點(diǎn)的突變較少,可以指導(dǎo)臨床用藥。

        當(dāng)變異株最終推翻野生株的統(tǒng)治后,耐藥發(fā)展到臨床耐藥階段?;颊哐褐蠬BV DNA 水平會(huì)反彈,最終出現(xiàn)肝功能異常、肝臟組織學(xué)損傷。因此我們?cè)诓《緦W(xué)耐藥階段及基因耐藥階段就應(yīng)該盡早進(jìn)行干預(yù),及時(shí)阻止病毒學(xué)耐藥向臨床耐藥的惡性方向發(fā)展。更有利于指導(dǎo)用藥,減少多重耐藥突變的發(fā)生。耐藥變異位點(diǎn)的檢測(cè)和用藥期間的監(jiān)測(cè),可以指導(dǎo)臨床選擇和調(diào)整核苷酸類藥物,具有非常重要的臨床價(jià)值。

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