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        古籍書庫空氣真菌種屬調(diào)查

        2020-07-14 12:37:04任珊珊
        甘肅科技 2020年7期
        關鍵詞:孢屬孢霉鏈格

        任珊珊

        (國家圖書館,北京 100081)

        空氣微生物廣泛存在于環(huán)境中,主要包括細菌、真菌、病毒等生命體,其中已發(fā)現(xiàn)的真菌有4萬余種,主要粒徑分布在3~100μm[1]。它們的存在不僅威脅人類健康,更會對古籍、檔案和文物等造成不可逆轉(zhuǎn)的損壞。近年來,針對空氣中真菌的研究已經(jīng)成為圖書館、檔案和文博行業(yè)的基礎研究內(nèi)容之一。故宮博物院采用平皿沉降法在各個庫房采樣,其中書畫組存放的東西司庫等8個庫房主要有枝孢霉,黃曲霉等霉菌[2]。三峽博物館文物庫房中空氣真菌主要種屬為曲霉屬(70%)和青霉屬(13%)[3]。放線菌、枝孢屬、青霉屬和鏈格孢屬等大量存在于魏晉五號壁畫墓的墓室空氣中,成為威脅磚壁畫保存的重要污染源[4]。中國農(nóng)業(yè)大學圖書館空氣中霉菌主要為青霉屬和曲霉屬[5]。

        1 材料與方法

        1.1 實驗設備與試劑

        北京明杰藍天FA-1六級篩孔式空氣微生物采樣器,德國MEMMERT IPP200培養(yǎng)箱,上海博迅YXQ-LS-100G立式壓力蒸汽滅菌器,蘇州凈化SW-CJ-2FD雙人超凈臺,太倉強樂THZ-C型空氣恒溫振蕩器,德國SIGMA 3-30k離心機,日本Nikon 90i顯微鏡,美國Bio-Rad MyCylerPCR儀,北京六一DYY-6C電泳儀電源,上海精科WFH-201B紫外透射反射儀和四川優(yōu)普UPT-30L純水機等。

        瓊脂糖、瓊脂、葡萄糖、Tris-硼酸和無水乙醇等(國藥試劑);上樣緩沖液、DNA ladder和GoldView核酸染色劑(Solarbio);乳酸酚棉藍染色劑(青島海博);Taq聚合酶(Apexbio);通用型基因組提取試劑盒、為世紀瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒(康為世紀)等。

        1.2 樣品采集方法

        2019年4月在國家圖書館古籍書庫進行采樣。書庫配備有恒溫恒濕空調(diào)機組,用于控制書庫內(nèi)的溫度和相對濕度。采樣期間,書庫溫度為24℃,相對濕度為48%。采用撞擊式采樣法,參數(shù)設置為采樣速度28.3L/min,采樣2.5min。采樣時使用PDA培養(yǎng)基。培養(yǎng)基倒置放入生物培養(yǎng)箱。培養(yǎng)條件為28℃±1℃,培養(yǎng) 7d。

        1.3 形態(tài)學分析方法

        平板點植接種培養(yǎng),每皿三點。新接種的培養(yǎng)基倒置于生物培養(yǎng)箱中,28℃±1℃,培養(yǎng)7d。培養(yǎng)結束后記錄菌落形態(tài)。取小塊真菌培養(yǎng)物置于載玻片,乳酸酚棉藍染色法染色后置于顯微鏡下觀察真菌菌絲和孢子的形態(tài)特征。

        1.4 分子鑒定方法

        提取樣品總DNA。使用通用型基因組DNA提取試劑盒,根據(jù)操作說明提取篩選出的真菌基因組DNA。提取后的DNA于-80℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        目標片段擴增(PCR)。使用真菌ITS PCR通用引物。ITS1:5’-CTTGGTCATTTAGAGGAAGTAA-3’;ITS4:5’-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3’。配置PCR 反應體系。2XTaq-pcr MIX:25μL;ITS1(10μM):2μL;ITS4(10μM):2μL; 基因組 DNA:2μL;ddH2O:19μL, 總計50μL。反應程序為:95℃預變性5min;94℃變性 30s;55℃退火 30s;72℃延伸 1min;設定儀器后開始PCR擴增試驗,循環(huán)35次;72℃延伸10min。獲得PCR產(chǎn)物。

        目標片段的確定與回收。取PCR產(chǎn)物進行2%瓊脂糖凝膠電泳試驗,待DNA Marker各條帶跑開顯示清晰后,結束電泳。紫外燈下觀察凝膠中的DNA條帶,并切出含有目標DNA的凝膠。根據(jù)回收試劑盒提供的方法進行DNA回收。

        基因測序及序列分析。將回收產(chǎn)物送至北京睿博興科公司進行測序。利用BLAST方式將測序所得序列在GenBank數(shù)據(jù)庫中進行比對,獲得和測序DNA序列同源性最高的真菌ITS序列,確認樣品的種屬信息。

        2 結果與分析

        采集得到的樣品根據(jù)形態(tài)特征可歸類為5種真菌,分別編號為 F-01、F-02、F-03、F-04 和 F-05。對它們進行純化培養(yǎng),觀察其菌落及菌體形態(tài),并進行后續(xù)的分子鑒定工作。

        2.1 優(yōu)勢真菌的形態(tài)學觀察

        將選出的5種真菌進行點種純化培養(yǎng)7d后,觀察其真菌菌落形態(tài),可發(fā)現(xiàn)不同真菌產(chǎn)生的色素各不相同,菌落質(zhì)地也有很大區(qū)別,具體特征見表1。

        表1 真菌菌落形態(tài)特征

        用乳酸酚棉藍染色法挑菌制片,鏡檢觀察真菌菌體形態(tài),放大倍數(shù)均為400×,結果如圖1所示。可以看出:F-01菌絲分隔,分生孢子梗較短,分生孢子呈棒狀;F-02菌絲不分隔,分生孢子梗較長。分生孢子球形或橢圓形;F-03菌絲分隔,孢子呈卵圓形;F-04細胞個體為圓形或卵圓形,有明顯的壓制現(xiàn)象;F-05分生孢子頭近球形,小梗雙層,放射狀排列,頂端有鏈形孢子。

        圖1 真菌顯微形態(tài)特征

        2.2 優(yōu)勢真菌的分子鑒定

        提取5種優(yōu)勢真菌的基因組DNA,利用真菌ITS PCR擴增通用引物對基因組DNA進行PCR擴增,得到目標基因,即真菌ITS基因。瓊脂糖凝膠電泳確認后回收DNA,結果如圖2所示。將獲得的產(chǎn)物測序后,得到其序列信息。在GenBank中比對得到同源性最高的DNA片段的GenBank登錄號,確定優(yōu)勢真菌的種屬信息,見表2。得到結果:古籍書庫空氣中的優(yōu)勢真菌有鏈格孢屬的極細鏈格孢霉,擬青霉屬的擬青霉SL95,枝孢霉屬的枝孢樣枝孢霉,隱球酵母屬的大隱球酵母和曲霉屬的雜色曲霉。

        圖2 優(yōu)勢真菌ITS基因凝膠電泳

        表2 菌種鑒定信息

        3 討論

        在古籍書庫中進行空氣真菌采樣,篩選出5種優(yōu)勢真菌,結合形態(tài)學和分子鑒定結果,發(fā)現(xiàn)這五種真菌分別為鏈格孢屬的極細鏈格孢霉,擬青霉屬的擬青霉SL95,枝孢霉屬的枝孢樣枝孢霉,隱球酵母屬的大隱球酵母和曲霉屬的雜色曲霉。這與2013年所作調(diào)查北京市居家環(huán)境空氣中主要真菌種類青霉屬、枝孢屬、曲霉屬、鏈格孢屬和莖點霉屬接近[6]。本次研究明確了古籍書庫中優(yōu)勢空氣真菌種類,可為書庫的日常有害生物預防和真菌爆發(fā)性增長時的治理提供必要的技術支持。

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