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        兩種菌體前處理方法對MALDI-TOFMS鑒定臨床分離菌效果的影響

        2020-01-08 11:40:22楊銘華闞秀梅孫喜娟晏培杰宋娜
        國際感染病學(xué)(電子版) 2019年3期
        關(guān)鍵詞:培養(yǎng)箱乙腈菌落

        楊銘華,闞秀梅,孫喜娟,晏培杰,宋娜

        哈爾濱市兒童醫(yī)院檢驗科,黑龍江 哈爾濱 150010

        1 材料與方法

        1.1 材料 菌株來源:由實驗室保存和分離的43種臨床常見菌株。主要試劑和儀器:MALDI-TOFMS微生物樣品處理試劑,384目標板,組分I(包括乙腈,甲酸,純水)6,000 μL,組分II(包括乙腈,三氟乙酸,純水)200 μL哥倫比亞血液板,沙寶弱片[賽默飛世爾科技(中國)有限公司]。基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜系統(tǒng)(Microflex,北京布魯克科技有限公司),生物安全柜(Biobse B2-x),恒溫培養(yǎng)箱(Thermo Fisher 3111),紅外接種環(huán)滅菌器(UniPower-I),渦旋混合器(GL-88B),緊湊型離心機(LX-300)。

        1.2 方法

        1.2.1 菌株傳代 將在哥倫比亞血液平板上收集的革蘭氏陽性細菌(16株)和革蘭氏陰性菌(14株)雜交,并將真菌(13株)用沙寶弱板培養(yǎng)。傳代培養(yǎng)條件:將細菌置于37 ℃,含5%CO2培養(yǎng)箱中18-24小時,并在35 ℃真菌培養(yǎng)箱中制備霉菌24-48小時。

        1.2.2 儀器校準 在測試之前,使用單個大腸桿菌ATCC 25922菌落作為儀器校準標準。

        1.2.3 提取方法 將20-30 μL組分I加入每個離心管(200 μL)中,從上部菌落中取出單個菌落,并與1 μL無菌接種環(huán)或移液管尖端混合?;旌喜u動5分鐘后,將1 μL樣品加入到靶板中并使其風(fēng)干,加入1 μL組分II以覆蓋樣品點并使其風(fēng)干。每個樣品平行檢測3次[1]。

        2 結(jié)果

        見表1。

        3 討論

        在這項研究中,43種臨床分離株以兩種不同的方式進行預(yù)處理,并通過MALDI-TOFMS進行鑒定。結(jié)果表明,MALDI-TOFMS鑒定革蘭氏陽性菌和真菌的準確率明顯高于提取方法后的涂片處理。可以看出,適當?shù)奈⑸镱A(yù)處理可以改善MALDI-TOFMS鑒定。蛋白質(zhì)指紋精確度和穩(wěn)定性以上結(jié)果與趙桂明等的結(jié)果一致直接應(yīng)用快速且易于處理,但對其他細菌代謝物更敏感、更容易變化。但是,甲酸-乙腈提取可以從細菌中提取蛋白質(zhì)。得到的圖中蛋白質(zhì)離子峰的強度是一致的。但提取方法得到的離子峰的信號峰值相對較高,包括更多蛋白質(zhì)標記物[2]。有研究[3]使用直接涂抹和提取方法鑒定和驗證了200株肺炎野生菌株。該比率為100%,通過比較細菌肺炎的特征峰,可以鑒定亞種,為鑒定肺炎克雷伯菌提供了一種快速有效的方法。

        表1 臨床分離菌的檢測效果

        總之,為了檢測更具體的離子峰并提高蛋白質(zhì)指紋的準確性和可重復(fù)性,本研究提出使用提取方法預(yù)處理微生物樣品。這樣可以優(yōu)化工藝步驟,減少樣品損失,建立標準的微生物檢測過程,并提高質(zhì)譜鑒定的準確性,對未來的檢測工作都具有非凡的意義。

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