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        內(nèi)蒙古東北地區(qū)主要民族Y染色體STR基因座突變率的研究

        2019-03-27 12:28:23劉佳秀孫維克
        中國新通信 2019年22期
        關鍵詞:突變基因座

        劉佳秀 孫維克

        【摘要】? ? 收集中國內(nèi)蒙古東北地區(qū)主要民族(漢族和蒙古族)人群17萬份男性共計10萬個家族血樣本,統(tǒng)計24個Y-STR(DYS448、DYS389II、DYS518、DYS627、DYS19、DYS627、H4、DYS576、DYS456、DYS392、DYS449、DYS437、DYS460、DYS533、DYS391、DYS481、DYS439、DYS570、DYS385ab、DYS438、DYS390、DYS389I、DYS635、DYS393、DYS458)基因座突變情況,并與白人:DYS627、DYS576、DYS518、DYS449、DYS570、DYF387S1ab比較,調(diào)查分析其突變相關性。

        【關鍵詞】? ? 基因座? ? Y染色體? ? 突變

        Y染色體由于其單倍體父系遺傳的特點,所以Y染色體的遺傳標記代表的是家族遺傳標記。其在人類物種的起源、進化過程和后期的群體劃分以及現(xiàn)代法醫(yī)學實踐,具有非常重要的應用研究價值。

        本研究是采用YfilerTMPlusPCR直接擴增試劑盒,對內(nèi)蒙古東北地區(qū)的17萬名男性個體進行了遺傳突變率調(diào)查,研究在白種人群中快速變異的六個Y-STR基因座,在中國群體中是否同樣具有高度突變率,最終根據(jù)結果評價所研究的Y-STR法醫(yī)及社會應用價值。

        一、材料和方法

        1.1樣本采集

        采集17萬名健康成年男性個體的末梢血,吸附于采血卡的濾紙上,陰干后常溫保存待檢。

        1.2PCR擴增

        使用BSD-QP型打孔機(BSD公司,澳大利亞)打取直徑為1.2mm的圓形樣本,使用9700PCR儀(ABI公司,美國)與YfilerPlus復合擴增試劑盒(ABI公司,美國)進行PCR復合擴增,PCR擴增總體系為10ul。其中包含反應混合物4ul,引物2ul,水3ul。熱循環(huán)參數(shù):95℃1min;94℃4sec,61℃1min,60℃22min,共27個循環(huán);產(chǎn)物4℃保存。

        1.3擴增片段的電泳與分型檢測

        取擴增產(chǎn)物1ul加入甲酰胺與Liz600的混合液中,在3500XL全自動遺傳分析儀(ABI公司,美國)進行毛細管電泳,電泳結果數(shù)據(jù)在GeneMapperID-X軟件進行基因分析。

        1.4數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析

        利用赤峰市《Y-DNASTRs實戰(zhàn)應用平臺(V1.0)》數(shù)據(jù)庫分析引擎進行分析計算。

        二、結果與分析

        2.1結果

        獲取內(nèi)蒙古東北地區(qū)主要民族前7位高突變位點。用赤峰市《Y-DNASTRs實戰(zhàn)應用平臺(V1.0)》數(shù)據(jù)庫分析引擎,篩選17萬份合格樣本數(shù)據(jù),用同型聚合法,聚合為10萬個家族,對10萬個家族進行交叉比較,對36442個有家族間變異位點的值進行分類求和,檢測結果見表1。

        2.2分析:

        白人中高突變的6個Y-STR位點與內(nèi)蒙古東北地區(qū)主要民族遺傳高突變位點前7位比較如下:

        白人:DYS627、DYS576、DYS518、DYS449、DYS570、DYF387S1ab

        內(nèi)蒙:DYS576、DYS627、DYS518、DYS449、DYS458、DYS385ab、DYS570(注DYF387S1ab未做統(tǒng)計、比較)

        2.3結論:

        在DNA的任何區(qū)域內(nèi)都可能發(fā)生突變,在Y-STR基因座上也是如此。Y-STR的突變率明顯高于常染色體且涉及范圍較大,目前,人們對常用的Y-STR基因座的突變率進行了很多的研究。Y-STR突變的分子機制可能包括復制滑落或有缺陷的DNA復制修復機制。對于親代和子代之間的比較就可以對DNA遺傳標記的突變進行判斷。一般的突變都涉及一個重復單位的獲得或者丟失,例如由于突變,導致DYS576基因座上的等位基因19,在子代表現(xiàn)為18或者20。有關資料報道“在中國漢族人群的782對父子中發(fā)生41次突變,平均突變率為2.8×10-3,涉及DYS456等13個基因座,其中突變率最高的是DYS458,為10.4×10-3。突變率較低的是DYS389Ⅰ與DYS635,均為1.2×10-3,DYS393、DYS437、DYS438、DYS448未發(fā)現(xiàn)突變”。

        本次對內(nèi)蒙古東北地區(qū)主要民族36442個家系進行遺傳高突變位點的研究,發(fā)現(xiàn)了DYS576、DYS627、DYS518、DYS449、DYS458、DYS385ab、DYS570等七個Y-STR基因座具有高突變的特質,其突變率介于6.48%~10.41%。其中DYS576基因座的突變率最高,達到10.41%,其次為DYS627、DYS518、DYS449、DYS458、DYS385ab、DYS570。

        這七個高突變Y-STR基因座與美國白人中高突變的6個Y-STR基因座有所不同,DYS458的突變率達到7.51%,DYS385ab的突變率達到7.47%,DYS570的突變率為6.48%,DYS458、DYS385ab基因座的突變率均高于DYS570的突變率。我認為DYS627、DYS576、DYS518、DYS449、DYS570的突變率與民族、人種關系不大,應為人群高突變位點。2001年Kayser和Sajantila觀察了同一父子間2個Y-STR的突變后建議:在親權鑒定中只有3個或3個以上的Y-STR不同時方可做出排除的結論。若在實際工作中有三個Y-STR不同,首先應先確定是否為高突變位點,然后結合所采用的基因座數(shù)量差異基因座之間的差距步長(重復單位相差的數(shù)量),以及兩個個體之間的親緣距離等情況綜合考慮,如果有三個Y-STR均為高突變位點則不能輕易排除,需要增加位點進行驗證,或者結合常DNA進行驗證,慎重作出排除父權的結論。

        參? 考? 文? 獻

        [1]劉亞舉,郭麗紅,石美森等.河南漢族人群27個Y-STR基因座的突變觀察與分析[J].中國法醫(yī)學雜志,2016,31(1):22-26.

        [2]JohnMBulter.法醫(yī)DNA分型:STR遺傳標記的生物學\方法及遺傳學[M].侯一平,劉雅誠譯.科學出版社,2007:

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