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        醫(yī)學(xué)形態(tài)學(xué)數(shù)字切片教學(xué)網(wǎng)絡(luò)平臺的建設(shè)及應(yīng)用

        2018-09-27 11:28:40成少利張秉義鄭黎明張耀杰
        關(guān)鍵詞:形態(tài)學(xué)顯微鏡實驗課

        成少利,張秉義,鄭黎明,張耀杰,柴 云

        西安交通大學(xué)醫(yī)學(xué)部基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院本科實驗中心, 西安 710061

        數(shù)字切片是指通過切片掃描系統(tǒng)采集的包含了玻璃切片上的所有信息(包括標(biāo)簽、組織)的圖片文件。這個圖片文件如同一張真實的切片標(biāo)本,可以通過電腦自由選取想觀察的部位,可以任意地放大或縮小,如同在光學(xué)顯微鏡下進(jìn)行觀察。醫(yī)學(xué)形態(tài)學(xué)涵蓋生物學(xué)、組織學(xué)、病理學(xué)、微生物學(xué)和寄生蟲學(xué),實驗課教學(xué)為其重要的組成部分,實驗課時占全部課程教學(xué)的一半,實踐與理論同等重要。實踐教學(xué)環(huán)節(jié)主要是切片標(biāo)本的觀察。傳統(tǒng)的實驗教學(xué)模式為教師利用玻璃切片標(biāo)本進(jìn)行示教、講解、觀察要點,然后學(xué)生通過光學(xué)顯微鏡進(jìn)行切片的觀察。這種教學(xué)模式對于學(xué)生熟練使用顯微鏡,訓(xùn)練其動手能力發(fā)揮了積極的作用[1]。但是傳統(tǒng)實驗教學(xué)模式存在幾點不足[2]:①教師對學(xué)生的指導(dǎo)是通過學(xué)生顯微鏡進(jìn)行的,學(xué)生和教師輪換觀察顯微鏡下目標(biāo)進(jìn)行交流,交流費時,甚至發(fā)生針對錯誤的觀察目標(biāo)交流,效果明顯不佳;②玻璃切片標(biāo)本隨著使用時間的延長,會存在切片褪色、破損而減少;③隨著現(xiàn)代診療技術(shù)的發(fā)展,一些常見病在未能經(jīng)歷全部的病程即被治愈,也有一些疾病徹底絕跡或罕見,難以獲得標(biāo)本,一旦破損,難以補(bǔ)充;④教師對學(xué)生的指導(dǎo)只能局限于上課時間并且必須在教學(xué)實驗室進(jìn)行,因而切片教學(xué)手段的革新必將對教學(xué)產(chǎn)生深遠(yuǎn)的影響。將數(shù)字切片掃描系統(tǒng)[3]引入傳統(tǒng)教學(xué)必將產(chǎn)生教學(xué)技術(shù)的風(fēng)暴,全面提升形態(tài)學(xué)實驗課的教學(xué)質(zhì)量。

        為了提高形態(tài)學(xué)實驗課程教學(xué)效果、節(jié)省課堂教學(xué)時間,也為了學(xué)生綜合能力培養(yǎng)提供時間保障,全面提升實驗教學(xué)的質(zhì)量,本科實驗中心于2017年9月建設(shè)了該教學(xué)平臺并應(yīng)用于醫(yī)學(xué)部各專業(yè)形態(tài)學(xué)基礎(chǔ)實驗課的教學(xué),取得了較好的教學(xué)效果,得到了師生的一致好評,現(xiàn)介紹如下。

        1 數(shù)字切片教學(xué)網(wǎng)絡(luò)平臺的建設(shè)

        1.1 數(shù)字切片教學(xué)網(wǎng)絡(luò)及硬件構(gòu)架

        ①利用網(wǎng)絡(luò)控制室和學(xué)生實驗室校園網(wǎng)標(biāo)準(zhǔn)布局,經(jīng)過反復(fù)調(diào)試,依托學(xué)校校園網(wǎng)布局完全可以達(dá)到該系統(tǒng)的要求,無需另行組建局域網(wǎng)[4];

        ②每個實驗室均由1臺路由器將1臺教師用計算機(jī)與24臺學(xué)生用計算機(jī)連接成網(wǎng);

        ③數(shù)字切片服務(wù)器通過校園網(wǎng)接入網(wǎng)絡(luò);

        ④數(shù)字切片掃描系統(tǒng)由網(wǎng)線與服務(wù)器連接,切片掃描完成后直接傳輸?shù)椒?wù)器(如圖1所示)。

        圖1 數(shù)字切片網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)網(wǎng)絡(luò)連接示意圖

        1.2 數(shù)字切片教學(xué)網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)

        該系統(tǒng)主要由安裝在數(shù)字切片服務(wù)器內(nèi)的DSE系統(tǒng)和數(shù)字切片庫構(gòu)成。借助數(shù)字切片教學(xué)網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng),可通過IE瀏覽器進(jìn)行數(shù)字切片網(wǎng)絡(luò)瀏覽、數(shù)字切片網(wǎng)絡(luò)化后臺管理。登錄地址:http://202.117.227.18/DSE

        用管理員身份登錄后可以設(shè)置用戶名以及登錄密碼,同時可以賦予不同用戶以不同權(quán)限(如是否具有修改權(quán)限)。

        數(shù)字切片庫需按教學(xué)大綱要求進(jìn)行標(biāo)注,界面目錄可以按照電子書的方式翻頁觀察,操作便捷。數(shù)字切片庫后臺圖像處理功能,可對數(shù)字切片進(jìn)行顏色調(diào)節(jié)、清晰度調(diào)節(jié)、顏色增強(qiáng)調(diào)節(jié)、伽瑪校正等操作。該系統(tǒng)提供拍照功能,制成數(shù)字切片文件。一張數(shù)字切片可生成任意數(shù)量的JPG、BMP圖像。

        在教師或?qū)W生的服務(wù)器終端計算機(jī),通過IE瀏覽器可用兩種模式觀察數(shù)字切片,模擬顯微鏡固定放大倍率觀察,包括4倍、10倍、20倍、40倍、100倍;無極變倍觀察,通過鼠標(biāo)滾輪上下滾動任意調(diào)節(jié)的連續(xù)變倍,調(diào)節(jié)范圍為0.4倍至80倍[5]。

        1.3 全自動掃描顯微平臺及數(shù)字切片庫的建設(shè)

        全自動數(shù)字切片掃描系統(tǒng)由一臺全自動數(shù)字顯微鏡以及與它相連的專業(yè)控制盒組成。通過全自動掃描平臺的掃描與控制軟件系統(tǒng),將傳統(tǒng)的玻璃切片進(jìn)行逐行逐列掃描,通過軟件進(jìn)行無縫拼接,生成包括傳統(tǒng)玻璃切片內(nèi)預(yù)取的興趣區(qū)所有信息,即一整張全視野的數(shù)字化切片圖像文件[6-7]。

        根據(jù)教學(xué)大綱的要求,我們與相關(guān)專業(yè)授課教師反復(fù)商討確定切片內(nèi)容,并由經(jīng)驗豐富的教師精心挑選結(jié)構(gòu)典型、染色最佳的玻璃切片進(jìn)行掃描,掃描完成后,上傳服務(wù)器數(shù)字切片庫內(nèi),最后通過數(shù)字切片教學(xué)網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)的專業(yè)軟件對切片庫中數(shù)字切片按照課程的章節(jié)分門別類進(jìn)行歸類。所有切片按照實驗教學(xué)進(jìn)度設(shè)置子目錄,以方便對切片進(jìn)行管理和學(xué)習(xí)。待這些工作完成后,組織專業(yè)課教師對每張數(shù)字切片進(jìn)行標(biāo)注,便于學(xué)生自學(xué)。總計完成組織學(xué)數(shù)字切片62張,14 947MB(15G)。包括上皮、固有結(jié)締組織、骨和軟骨、血液、肌組織、神經(jīng)組織;神經(jīng)、循環(huán)、免疫、內(nèi)分泌、消化、呼吸、泌尿、男女生殖等章節(jié)。病理學(xué)切片75張,總共45 251MB(45G),包括腫瘤、循環(huán)、消化、呼吸、泌尿、女性生殖系統(tǒng)、傳染病、變性、血液循環(huán)障礙、炎癥和適應(yīng)等章節(jié)(如圖2所示)。

        2 應(yīng)用效果

        該系統(tǒng)于2017年上半年建成病理學(xué)切片庫,并應(yīng)用于醫(yī)學(xué)部2015級臨床醫(yī)學(xué)、口腔、預(yù)防、法醫(yī)專業(yè)和2014級留學(xué)生臨床醫(yī)學(xué)專業(yè),共計35個班級,600余名學(xué)生的病理學(xué)實驗課教學(xué),目前共完成28 096人時數(shù);2017年下半年建成組織學(xué)切片庫,用于對2016級臨床醫(yī)學(xué)、口腔、預(yù)防、法醫(yī)專業(yè)以及八年制臨床醫(yī)學(xué)專業(yè),共計32個班級,600余名學(xué)生的組織學(xué)實驗課教學(xué)中,共完成17 256人時數(shù),取得了較好的教學(xué)效果,受到授課教師和學(xué)生的一致好評:98%的學(xué)生對該系統(tǒng)非常滿意;90%的學(xué)生認(rèn)為該系統(tǒng)明顯提高了教學(xué)效果;95%的學(xué)生表示該系統(tǒng)節(jié)省了實驗學(xué)習(xí)時間。實驗課教師也普遍反映數(shù)字切片網(wǎng)絡(luò)教學(xué)系統(tǒng)提高了實驗課教學(xué)效果,學(xué)生的學(xué)習(xí)興趣明顯提高。

        3 討論與總結(jié)

        醫(yī)學(xué)教育的目標(biāo)是不斷提高教學(xué)質(zhì)量,提高學(xué)生的學(xué)習(xí)興趣和分析問題、解決問題的能力,為社會培養(yǎng)創(chuàng)新型、實用型的醫(yī)學(xué)人才。在醫(yī)學(xué)院校的形態(tài)學(xué)教學(xué)中,應(yīng)根據(jù)科學(xué)技術(shù)的發(fā)展,不斷革新教育教學(xué)手段,克服傳統(tǒng)教學(xué)中的不足之處是教學(xué)發(fā)展的主題。西安交通大學(xué)醫(yī)學(xué)部充分利用學(xué)校互聯(lián)網(wǎng)環(huán)境和原有的顯微數(shù)碼互動系統(tǒng),將傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)病理切片數(shù)字化,建成醫(yī)學(xué)形態(tài)學(xué)數(shù)字切片教學(xué)網(wǎng)絡(luò)平臺并應(yīng)用于2015級、2016級臨床醫(yī)學(xué)、口腔、預(yù)防、法醫(yī)等專業(yè)的組織學(xué)和病理學(xué)形態(tài)學(xué)教學(xué),得到師生一致好評。

        圖2 數(shù)字切片網(wǎng)絡(luò)教學(xué)系統(tǒng)

        該系統(tǒng)的優(yōu)勢主要體現(xiàn)在:① 建立形態(tài)學(xué)數(shù)字切片實驗教學(xué)平臺,進(jìn)行數(shù)字切片庫管理、教師授課與學(xué)生學(xué)習(xí)等,使教師與管理員更專注于教學(xué)本身,減少了在教室與課程管理上的精力與時間,方便了學(xué)生的自學(xué),提高了練習(xí)效果[8]。也可應(yīng)用于病理醫(yī)師的在職遠(yuǎn)程教育和學(xué)習(xí)。②與Motic數(shù)碼互動系統(tǒng)一體化整合,進(jìn)行傳統(tǒng)數(shù)碼顯微鏡與數(shù)字切片互動教學(xué)和學(xué)習(xí),既注重了學(xué)生的操作能力,也培養(yǎng)了學(xué)習(xí)的簡便性與興趣性[9]。③將傳統(tǒng)切片數(shù)字化,有利于檢索與實驗教學(xué)。通過局域網(wǎng)教學(xué),使實驗教學(xué)更方便,提高了教學(xué)效果及效率。玻璃切片標(biāo)本數(shù)字化與傳統(tǒng)的切片示教系統(tǒng)相比,切片的清晰度改善十分突出,對切片的細(xì)節(jié)觀察具有明顯優(yōu)勢[10]。④該系統(tǒng)使用十分方便,省去了諸多環(huán)節(jié),如切片發(fā)放、顯微鏡調(diào)節(jié)、興趣目標(biāo)尋找等,可以增加原來示教切片的瀏覽,使實驗內(nèi)容得到擴(kuò)充,為教學(xué)改革、學(xué)生綜合能力和分析能力的培養(yǎng)提供了可能。⑤傳統(tǒng)教學(xué)中由于切片數(shù)量所限,有些切片標(biāo)本不足以每人一張,只能示教。使用該系統(tǒng),每個學(xué)生均可以通過網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)瀏覽。⑥在計算機(jī)上可以多張切片同時打開,以便對不同切片標(biāo)本的比較觀察和學(xué)習(xí)。⑦通過Internet跨越時空進(jìn)行數(shù)字切片的瀏覽,有助于克服傳統(tǒng)的在“規(guī)定時間、規(guī)定地點的實驗室”學(xué)習(xí)的限制。

        通過數(shù)字切片網(wǎng)絡(luò)應(yīng)用與管理系統(tǒng)的建設(shè),克服了傳統(tǒng)實驗室課學(xué)習(xí)的限制,實現(xiàn)了以學(xué)生為主的教育理念。方便、人性化的教學(xué)提升了醫(yī)學(xué)形態(tài)學(xué)實驗教學(xué)的效果,進(jìn)而全面提升形態(tài)學(xué)實驗教學(xué)的質(zhì)量。

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