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        面向醫(yī)學(xué)科技評價(jià)的本體模型構(gòu)建研究

        2018-03-21 01:32:52,,,,,2
        關(guān)鍵詞:不端本體語義

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        醫(yī)學(xué)科技評價(jià)是醫(yī)學(xué)科研活動中的重要組成部分,是醫(yī)學(xué)科技管理工作中的核心內(nèi)容。好的科技評價(jià)方法與體系可以優(yōu)化科技資源的配置,提高科研人員的積極性,并對推進(jìn)科技制度創(chuàng)新的完善和發(fā)展、營造良好的科研氛圍具有重要的作用。

        本體(Ontology)最初是哲學(xué)領(lǐng)域概念,是對現(xiàn)實(shí)真實(shí)存在的客觀描述。20世紀(jì)90年代,本體概念被逐步引入人工智能、圖書情報(bào)和知識工程等領(lǐng)域,同時(shí)也被賦予了新的含義。圖書情報(bào)學(xué)領(lǐng)域?qū)<覐埿闾m通過對國內(nèi)外各領(lǐng)域本體定義的深入研究,認(rèn)為本體是通過描述、捕獲領(lǐng)域知識,確定領(lǐng)域內(nèi)共同認(rèn)可的概念和概念間的關(guān)系,以用于領(lǐng)域內(nèi)不同主體之間的交流與知識共享的形式化規(guī)范說明[1]。

        醫(yī)學(xué)科技評價(jià)數(shù)據(jù)涉及科研機(jī)構(gòu)、項(xiàng)目、科技人才、基金、專利等多項(xiàng)內(nèi)容,不同概念間關(guān)系較為復(fù)雜。當(dāng)前我國科技評價(jià)研究中存在科研數(shù)據(jù)組織系統(tǒng)性欠缺、關(guān)系揭示程度差等問題?,F(xiàn)存科研本體概念層次體系較為復(fù)雜,概念、屬性存在形式各有不同,這對本體的復(fù)用造成較大阻礙。構(gòu)建面向醫(yī)學(xué)科技評價(jià)的科研本體,能夠更好地滿足評價(jià)工作的實(shí)際需求,進(jìn)一步完善科技資源的組織方式,展示領(lǐng)域內(nèi)部的語義關(guān)系,從而提高醫(yī)學(xué)科技評價(jià)的效果。

        本文擬借鑒現(xiàn)有科研本體相關(guān)概念及本體構(gòu)建方法,在搜集、整合多來源科研信息的基礎(chǔ)上分析科研本體劃分的不同概念層次;通過復(fù)用現(xiàn)有科研本體及重構(gòu)科研信息,構(gòu)建面向醫(yī)學(xué)科技評價(jià)的科研本體,全方位展示醫(yī)學(xué)科技評價(jià)研究中科技評價(jià)對象之間的多種關(guān)系;以科研本體為基礎(chǔ),指導(dǎo)醫(yī)學(xué)科技評價(jià)工作,為建立高級別的醫(yī)學(xué)科技評價(jià)本體提供思路。

        1 科研本體研究現(xiàn)狀

        當(dāng)前科學(xué)研究工作已經(jīng)發(fā)生變化,大量數(shù)據(jù)出現(xiàn)并需要管理[2],醫(yī)學(xué)科技評價(jià)研究工作亦是如此。隨著本體技術(shù)的日益成熟,科研本體越來越多,但很多本體中同類概念及屬性仍以不同的形式存在和存儲,使本體之間的共享、復(fù)用存在較大問題?,F(xiàn)有科研本體,如康奈爾大學(xué)構(gòu)建的VIVO(http://vivoweb.org)本體被定義為可語義探索的科研網(wǎng)絡(luò),但VIVO本體的管理、更新、復(fù)用較為復(fù)雜,關(guān)系屬性類目繁多,不適用于科技評價(jià)需求,目前沒有解決學(xué)科領(lǐng)域本體的建設(shè);BIBO[3]本體對期刊、書目概念做了較好的層級體系劃分,但關(guān)系屬性揭示程度不強(qiáng)。

        針對科研本體研究現(xiàn)狀及醫(yī)學(xué)科技評價(jià)實(shí)際需求,本文在借鑒VIVO、FOAF[4]、EuroCRIS[5]、BIBO、AMiner[6]等相關(guān)科研本體或知識圖譜中關(guān)于科技評價(jià)概念及屬性的同時(shí),根據(jù)當(dāng)前醫(yī)學(xué)科技評價(jià)工作的實(shí)際需求,將當(dāng)前科研領(lǐng)域的關(guān)注熱點(diǎn)——學(xué)術(shù)不端類別和科技創(chuàng)新納入本體模型的基礎(chǔ)上,確定醫(yī)學(xué)科技評價(jià)本體應(yīng)包含的體系框架(以下簡稱“框架”)(圖1)。

        圖1 醫(yī)學(xué)科技評價(jià)體系框架

        2 醫(yī)學(xué)科技評價(jià)本體構(gòu)建流程

        目前并沒有統(tǒng)一的本體構(gòu)建方法,應(yīng)用比較廣泛的本體構(gòu)建方法主要包括骨架法、METHONTOLOGY法、IDEF5法、TOVE法以及七步法[7]。Protégé具有圖形化的用戶界面,操作簡單,提供詳細(xì)的幫助文檔,支持模塊化設(shè)計(jì)[8]。本文擬結(jié)合骨架法和七步法,利用Protégé5.1構(gòu)建醫(yī)學(xué)科技評價(jià)本體。其流程見圖2。

        2.1 醫(yī)學(xué)科技評價(jià)對象

        醫(yī)學(xué)科技評價(jià)本體的相關(guān)概念、屬性、關(guān)系主要來自文獻(xiàn)調(diào)研、國外科研本體以及醫(yī)學(xué)科技評價(jià)領(lǐng)域?qū)<?。對國?nèi)外醫(yī)學(xué)領(lǐng)域開展的評價(jià)研究進(jìn)行調(diào)研時(shí),可將當(dāng)前醫(yī)學(xué)科技評價(jià)主體劃分為醫(yī)學(xué)科技機(jī)構(gòu)評價(jià)、人才評價(jià)以及成果評價(jià)(表1)。

        2.2 醫(yī)學(xué)科技評價(jià)本體類及其層次體系的構(gòu)建

        醫(yī)學(xué)科技評價(jià)本體層次體系的構(gòu)建主要是完善框架所包含大類的子類,分析子類的概念,定義子類的對象屬性及數(shù)據(jù)屬性。

        圖2 醫(yī)學(xué)科技評價(jià)本體構(gòu)建流程

        在醫(yī)學(xué)科技評價(jià)本體中,評價(jià)維度是指科研投入、科研產(chǎn)出及學(xué)術(shù)影響。科技投入反映機(jī)構(gòu)的基礎(chǔ)實(shí)力,是開展科技活動的前提和基礎(chǔ),包括人、財(cái)、物等的投入,該維度包括科研平臺和科研項(xiàng)目等方面;科技產(chǎn)出則是衡量科研機(jī)構(gòu)和科研人員創(chuàng)新能力的關(guān)鍵,是科技活動所產(chǎn)生的直接成果,該維度包括專利、專著、臨床指南等方面;學(xué)術(shù)影響是科技成果以及科研人員在學(xué)科領(lǐng)域內(nèi)產(chǎn)生的直接或間接影響[15],反映知識傳播的廣度和深度,該維度包括科研獎項(xiàng)、榮譽(yù)稱號、團(tuán)隊(duì)稱號等方面(表2)。

        表2 學(xué)術(shù)影響及下位概念(部分)

        本文中科研機(jī)構(gòu)有明確的研究方向和任務(wù),同時(shí)具備開展研究工作的基本條件,并組織一定水平的學(xué)術(shù)帶頭人和一定數(shù)量、質(zhì)量的研究人員長期從事醫(yī)學(xué)相關(guān)研究與開發(fā)活動。

        科研人員具備一定的生物醫(yī)學(xué)科學(xué)理論知識并從事科學(xué)研究工作,以及醫(yī)療健康設(shè)備開發(fā)、生命科學(xué)研究、流行病調(diào)查研究等。醫(yī)學(xué)科技評價(jià)所涉及的科研機(jī)構(gòu)和科研人員主要按照研究領(lǐng)域進(jìn)行劃分,因而本文選擇醫(yī)學(xué)學(xué)科中概念外延更加廣泛的學(xué)科分類,如“臨床醫(yī)學(xué)”、“基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)”及“預(yù)防醫(yī)學(xué)及衛(wèi)生學(xué)”等。

        學(xué)術(shù)不端行為也稱“不正當(dāng)?shù)难芯啃袨椤?,指學(xué)術(shù)共同體成員違反學(xué)術(shù)準(zhǔn)則、損害學(xué)術(shù)公正的行為[16]。近年來有關(guān)中國研究學(xué)者學(xué)術(shù)不端的報(bào)道屢見報(bào)端,國內(nèi)相關(guān)機(jī)構(gòu)、高校陸續(xù)出臺學(xué)術(shù)不端管理方法、學(xué)術(shù)風(fēng)氣建設(shè)意見。其中《關(guān)于加強(qiáng)我國科研誠信建設(shè)的意見》《學(xué)位論文作假行為處理辦法》《高等學(xué)校預(yù)防與處理學(xué)術(shù)不端行為辦法》等多項(xiàng)文件明確定義了學(xué)術(shù)不端的類型,進(jìn)一步規(guī)范了科研學(xué)術(shù)生態(tài)環(huán)境。本文在總結(jié)分析國家政策文件、高校及期刊學(xué)術(shù)不端管理辦法的基礎(chǔ)上,總結(jié)了適用于醫(yī)學(xué)科技評價(jià)的學(xué)術(shù)不端類型(表3)。

        根據(jù)上述類別概念劃分類的層次體系,在Protégé中進(jìn)行構(gòu)建(圖3)。

        表3 醫(yī)學(xué)科技評價(jià)本體“學(xué)術(shù)不端”類別概念及定義

        圖3 醫(yī)學(xué)科技評價(jià)本體層次體系的劃分

        2.3 醫(yī)學(xué)科技評價(jià)本體關(guān)系屬性構(gòu)建

        本體關(guān)系屬性的構(gòu)建是本體具有語義關(guān)系的關(guān)鍵,關(guān)系屬性一般連接兩個(gè)實(shí)體。本文主要是通過各類實(shí)體之間的實(shí)際關(guān)系和參照各類科研本體及知識圖譜之間的語義關(guān)系確定關(guān)系屬性。具體確定為21種關(guān)系,其中關(guān)系“vivo:has_affiliated_organization”、“vivo:has_collaborator”、“vivo:is_predecessor_of”及“ vivo:participates_in”復(fù)用于科研本體“VIVO”,關(guān)系“affects與affected_by”、“funds與funded_by”以及“teacher_of與student_of”這3對類間關(guān)系為互逆(inverse)關(guān)系。

        在8類語義類型21種關(guān)系中,高頻類是“科研機(jī)構(gòu)”與“科研人員”,“科研機(jī)構(gòu)”與除“學(xué)術(shù)不端”之外的6個(gè)類都有語義關(guān)系,“科研人員”與除“地理區(qū)劃”之外的6個(gè)類都有語義關(guān)系;中頻類是“科研產(chǎn)出”“學(xué)術(shù)影響”,“學(xué)術(shù)影響”與另外5個(gè)類產(chǎn)生聯(lián)系,“科研產(chǎn)出”與另外3個(gè)類產(chǎn)生聯(lián)系;低頻類是“科研投入”、“醫(yī)學(xué)學(xué)科”、“地理區(qū)劃”以及“學(xué)術(shù)不端”,“科研投入”與另外3個(gè)類產(chǎn)生聯(lián)系,“醫(yī)學(xué)學(xué)科”、“地理區(qū)劃”以及“學(xué)術(shù)不端”分別與另外2個(gè)類產(chǎn)生聯(lián)系。

        利用Protégé設(shè)置關(guān)系屬性,定義屬性的定義域(domain)和值域(range)(表4)。

        2.4 專家咨詢過程

        根據(jù)本文目的,邀請中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)信息研究所等單位共10余名專家作為咨詢對象。專家遴選的標(biāo)準(zhǔn)如下:對醫(yī)學(xué)科技評價(jià)及相關(guān)指標(biāo)體系具有深入認(rèn)識及了解,長期從事中國醫(yī)院科技量值(Science and Technology Evaluation Metrics)評價(jià)研究,具有豐富的實(shí)踐經(jīng)驗(yàn)。

        表4 醫(yī)學(xué)科技評價(jià)本體關(guān)系屬性

        通過現(xiàn)場展示的方式展示本體模型,收集專家有關(guān)本體的意見反饋。專家就本體劃分的維度、語義關(guān)系的設(shè)置展開了討論,提出以下建議:一是考慮醫(yī)學(xué)研究的全面性,指標(biāo)體系中“醫(yī)學(xué)學(xué)科”維度參照教育部學(xué)科分類,能夠較全面地揭示當(dāng)前醫(yī)科科研內(nèi)容,諸如“生物信息學(xué)”“互聯(lián)網(wǎng)+醫(yī)療”等交叉學(xué)科研究領(lǐng)域的揭示需深入思考;二是優(yōu)化科研網(wǎng)絡(luò)的揭示效果,傳統(tǒng)指標(biāo)體系中各指標(biāo)彼此互不干涉,通過構(gòu)建各語義類型之間的關(guān)系有助于科研網(wǎng)絡(luò)的揭示,進(jìn)一步豐富語義關(guān)系類型。

        3 醫(yī)學(xué)科技評價(jià)本體檢索及可視化展示

        Protégé作為本體建設(shè)軟件,能夠進(jìn)行推理、檢索以及可視化展示。本文在完成本體層次體系構(gòu)建以及關(guān)系屬性定義后,已初步構(gòu)建完成醫(yī)學(xué)科技評價(jià)本體,但仍需驗(yàn)證各語義類型之間的關(guān)系揭示效果。本文選擇“科研機(jī)構(gòu)”和“科研人員”作為檢索詞進(jìn)行展示。 在檢索框中輸入“科研機(jī)構(gòu)”和“科研人員”的結(jié)果如圖4、圖5所示。分別展開上位類,出現(xiàn)與之相關(guān)的各類實(shí)體。通過語義關(guān)系,證明“科研機(jī)構(gòu)”不僅與各上位類語義類型存在關(guān)系,其下位類之間也存在關(guān)聯(lián)。“科研人員”不僅能夠通過參與科研項(xiàng)目、產(chǎn)出科研成果對學(xué)術(shù)影響產(chǎn)生積極作用,其本身學(xué)術(shù)不端行為亦會對“學(xué)術(shù)影響”造成負(fù)面影響。語義關(guān)系的揭示是本文研究的重點(diǎn)。通過梳理醫(yī)學(xué)科技評價(jià)相關(guān)概念及屬性,構(gòu)建完成適用于醫(yī)學(xué)科技評價(jià)的本體模型,發(fā)現(xiàn)各語義類型之間的相關(guān)關(guān)聯(lián)。圖6展示了8類語義類型及21種語義關(guān)系之間的關(guān)聯(lián)。

        圖4 醫(yī)學(xué)科技評價(jià)本體“科研機(jī)構(gòu)”檢索結(jié)果

        通過可視化可直觀展示了解高頻語義類型及其彼此之間的關(guān)系,同時(shí)高頻概念的統(tǒng)計(jì)能夠?yàn)獒t(yī)學(xué)科技評價(jià)研究提供新的研究角度。如通過對“學(xué)術(shù)不端”的分析,發(fā)現(xiàn)其對“科研人員”“科研機(jī)構(gòu)”“學(xué)術(shù)影響”均造成重要影響。

        4 討論

        本文從醫(yī)學(xué)科技評價(jià)實(shí)際需求入手,建立了醫(yī)學(xué)科技評價(jià)本體,采用模塊化的方法從評價(jià)維度和基本信息兩方面構(gòu)建了包含科研機(jī)構(gòu)、科研人員、學(xué)術(shù)影響在內(nèi)的8大類語義類型,每類語義類型可重復(fù)使用并易于更新維護(hù)。同時(shí)完善了科研機(jī)構(gòu)、人員、學(xué)術(shù)影響之間的語義關(guān)系,將學(xué)術(shù)不端納入本體模塊,從而進(jìn)一步完善了醫(yī)學(xué)科技評價(jià)體系,明確了醫(yī)學(xué)科技評價(jià)研究領(lǐng)域的研究方向。

        但本文仍存在著一定的局限性,如本體語義關(guān)系揭示不足、推理效果欠佳等,對于科研評價(jià)的信息需求不夠明了,對于科研產(chǎn)出相關(guān)信息未明確標(biāo)準(zhǔn)化。下一步應(yīng)在擴(kuò)展語義類型及關(guān)系的基礎(chǔ)上,創(chuàng)建醫(yī)學(xué)科技評價(jià)實(shí)例,完善語義推理規(guī)則。

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