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        熒光定量PCR檢測HCV核酸提取法臨床價值分析

        2013-09-19 06:51:52張為民龔文波
        中國實用醫(yī)藥 2013年18期
        關鍵詞:異丙醇丙型肝炎重復性

        張為民 龔文波

        丙肝是因感染丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)引起的病毒性肝炎,主要是通過母嬰、血液和體液傳播[1]。丙肝病理機制主要為免疫病理損害,因其易發(fā)展為肝硬化或肝癌,臨床對此疾病重視程度很高。HCV屬黃病毒科,擁有單股正鏈RNA[2],臨床上主要以HCV RNA含量作為丙肝的確診實驗,而常選用的丙型肝炎病毒RNA熒光定量檢測試劑盒中上核酸的提取方法通常有兩種,即氯仿-異丙醇法和核酸分離柱法?,F(xiàn)對兩種核酸提取法結果和重復性進行對比,其結果如下。

        1 資料與方法

        1.1 一般資料 標本來源為本院2011年3月至2012年6月間肝炎門診初步診斷為丙型肝炎患者血清120份。其中男性65人,女性55人。男性平均年齡為(56.2±2.1)歲,女性平均年齡為(55.1±1.9)歲。血清標本內部差異無統(tǒng)計學意義。

        1.2 儀器與試劑 Roche公司LightCycler熒光定量PCR分析儀。氯仿-異丙醇法和核酸分離柱法提取試劑及擴增試劑均購自凱杰生物工程(深圳)有限公司,試劑盒最低檢測限為5.0×1012IU/mL。檢測抗-HCV采用第三代ELISA抗-HCV試劑盒。

        1.3 方法 分別按試劑盒的說明書進行RNA提取,然后再使用儀器對其擴增,分析提取效率。重復性檢測:取上述中等含量的HCV RNA血清標本1份,分別用上述兩種方法各提取核酸8次,進行熒光定量PCR檢測,定量結果計算對數(shù)值比較兩種方法提取的重復性。

        1.4 質量控制 每次檢驗都必須做室內質控,必須在質控范圍內,實驗結果才可靠,才有研究價值。

        1.5 統(tǒng)計學方法 應用SPSS軟件對數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計學分析,采用卡方檢驗,以P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。

        2 結果

        2.1 兩種核酸提取法提取RNA效率比較 兩種核酸提取法均以HCV RNA≥1.0×103copies/ml為HCV RNA為陽性標本,兩種方法比較結果如表1所示。氯仿-異丙醇法提取RNA陽性率為78.3%,而核酸分離柱法提取 RNA陽性率為81.7%。χ2=0.42,P>0.05。兩者差異無統(tǒng)計學意義,可見兩種方法提取RNA的效率接近(核酸分離柱法稍好一點),都可以較好地提取RNA。

        表1 120份標本兩種核酸提取法HCV RNA結果對比(n)

        2.2 抗-HCV與HCV RNA結果比較 如表2所示。兩種方法的HCV RNA與抗-HCV檢出率比較,χ2=18.44,P<0.05(氯仿-異丙醇法);χ2=13.98,P <0.05(核酸分離柱法);兩種方法差異有統(tǒng)計學意義。

        表2120份標本抗-HCV與HCV RNA結果比較(n,%)

        2.3 重復性對比 取中等含量的HCV RNA標本1份,分別用兩種方法各提取核酸8次,提取完成后進行熒光定量PCR檢測,定量結果的對數(shù)值分別如表3所示,兩種方法的變異系數(shù)差異顯著,即核酸分離柱法的重復性好于氯仿-異丙醇法。

        表3 兩種核酸提取法的重復性對比(n,%)

        3 討論

        丙肝是因感染丙型肝炎病毒(HCV)引起的病毒性肝炎,傳播途徑主要有母嬰傳播、血液傳播以及體液傳播。丙型肝炎全球都有流行,據(jù)世界衛(wèi)生組織統(tǒng)計,每年新發(fā)丙型肝炎病例就有3.5萬例[3]。感染HCV可導致肝臟慢性炎癥壞死和纖維化,可發(fā)展為肝硬化甚至肝細胞癌(HCC)。研究顯示,未來20年內與HCV感染相關的死亡率將繼續(xù)增加,對患者的健康和生命危害極大,因此丙型肝炎已成為嚴重的社會和公共衛(wèi)生問題[4]。

        在丙型肝炎的診治上,建立針對HCV的高靈敏度、特異性和穩(wěn)定性的檢測方法具有重要意義,若能早期診斷并治療,對疾病的預后也有正面影響。熒光定量PCR(RQ-PCR)是是1996年由美國ABI公司推出的一種新定量試驗技術[5],它是通過熒光染料或熒光標記的特異性的探針,對PCR產物進行標記跟蹤,實時在線監(jiān)控反應過程,結合相應的軟件可以對產物進行分析,計算待測樣品模板的初始濃度。目前RQ-PCR檢測HCV RNA在臨床已廣泛應用,RQ-PCR技術融合了PCR技術與DNA探針雜交技術的優(yōu)點,實驗的整個過程只在加樣時打開1次反應管,在PCR的每個循環(huán)中可以直接監(jiān)測到熒光信號的變化,根據(jù)PCR反應酶動力學特點,分析軟件會自動對DNA進行定量,因此也有人稱RQ-PCR為實時熒光定量PCR[6](real-time quantitative PCR)。其優(yōu)點較多,敏感、特異、快速、無污染等都是其優(yōu)勢之處。但是熒光定量PCR的實驗要求較高,即對采用的樣品、試劑都需達到一定的標準才能完成成功檢測。其中將核酸提取出來,作為熒光定量PCR反應的模板,這一步相當重要。模板的差異可直接影響PCR擴增效果與HCV RNA的檢測結果。

        本文通過比較兩種核酸提取方法的提取效率與重復性,來為臨床選擇更好的核酸提取方法,以提高臨床上對于HCV診斷。實驗結果顯示,120份血清標本中氯仿-異丙醇法的核酸提取效率為78.3%(陽性例數(shù)為94例),核酸分離柱法的提取效率為81.7%(陽性例數(shù)為98例);兩者提取效率相近(核酸分離柱法稍好一點),都基本可以滿足臨床的需要,P>0.05,差異無統(tǒng)計學意義。

        在抗-HCV抗體與HCV RNA結果比較中,抗-HCV抗體陽性率顯著高于HCV RNA檢出率(P<0.05),其原因可能是試劑盒因素導致抗-HCV抗體假陽性抑或大多數(shù)患者使用的干擾素抗病毒治療,干擾和抑制了病毒的復制,卻不影響其抗體的存在;因此可以知道,單獨抗-HCV抗體陽性已不能診斷HCV是否感染,同時也不能作為臨床選擇抗病毒治療和監(jiān)測療效的依據(jù)。血清中的HCV RNA是病毒復制和肝炎進程的確切標志,檢測血清HCV RNA是診斷HCV病毒感染的金標準,而抗體僅作為篩查或輔助判斷的指標存在。

        在重復性對比試驗中,氯仿-異丙醇法的變異系數(shù)為38.13%,而核酸分離柱法的變異系數(shù)僅為11.98%。兩者差異有統(tǒng)計學意義,可知核酸分離柱法的重復性明顯好于氯仿-異丙醇法。

        綜上所述,作者所測的兩種HCV RNA提取法,即核酸分離柱法和氯仿-異丙醇法,在RNA提取效率上相差無幾,但是在重復性對比中,核酸分離柱法則明顯優(yōu)于氯仿-異丙醇法,并且其避免了使用有毒試劑,對檢測人員更安全,因此在臨床上更推薦使用核酸分離柱法。在血清檢測中,血清是否溶血往往會影響到檢測結果,在檢測過程中,標本的成分含量差異、生產廠家試劑、采用的不同核酸提取方法,都會影響標本中HCV RNA模板的質量,從而對丙型肝炎的篩查、診斷造成影響。因此,不僅僅是核酸的提取法,臨床上對于丙肝的準確診斷,還需在其他方面投入一定精力,以期達到更好的結果。

        [1] 姚磊,張征,黃紹光,等.乙型肝炎不同血清學模式HBV DNA定量檢測及其與Pre-S1關系的研究.重慶醫(yī)學,2006,35(1):60-62.

        [2] 李金明.實時熒光PCR技術.北京:人民軍醫(yī)出版社,2007.

        [3] 劉佳,徐軍,王雪飛,等.3種HBV DNA提取方法對熒光定量PCR檢測結果影響的比較.中華檢驗醫(yī)學雜志,2008,31(7):780-783.

        [4] 姚航平,夏大靜,張立煌,等.慢性丙型肝炎的細胞凋亡調節(jié)蛋白、白細胞分化抗原54和白介素18的水平及意義.中華檢驗醫(yī)學雜志,2001,1(25):49.

        [5] 趙秀麗,單實年,張建瓊,等.樹狀DNA技術在HCV檢測中的應用.臨床檢驗雜志,2003,1(21):27.

        [6] 王志明,譚復明,陳偉華,等.輸血后丙型肝炎病毒感染的血清病毒定量研究.中華傳染病雜志,2000,1(18):37.

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