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        香蘇雜交豬KAT2B基因多態(tài)性與其生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)分析

        2024-01-01 00:00:00李吉鳳阮涌蔣傳美肖美美黃家錦許家利許厚強(qiáng)
        關(guān)鍵詞:生長(zhǎng)性狀實(shí)時(shí)熒光定量PCR

        摘要:【目的】了解香蘇雜交豬組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶P300/CBP結(jié)合因子(KAT2B)基因在組織中的表達(dá)量,篩選其單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位點(diǎn),并分析基因多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)性,為香蘇雜交豬新品系培育提供參考依據(jù)?!痉椒ā恳韵闾K雜交豬為研究對(duì)象,采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)KAT2B基因在3日齡和6月齡不同組織中的相對(duì)表達(dá)量,通過(guò)直接測(cè)序檢測(cè)KAT2B基因的SNP位點(diǎn),統(tǒng)計(jì)SNP位點(diǎn)等位基因頻率、基因型頻率、觀測(cè)雜合度(Ho)、期望雜合度(He)、有效等位基因數(shù)(Ne)及平均多肽信息含量(PIC)等,以卡方(χ2)檢驗(yàn)分析基因型是否處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài),分析不同基因型與香蘇雜交豬生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)性?!窘Y(jié)果】實(shí)時(shí)熒光定量PCR結(jié)果顯示,KAT2B基因在心臟、肝臟、脾臟、肺臟、腎臟和背最長(zhǎng)肌6個(gè)組織中均有表達(dá),與3日齡相比,6月齡KAT2B基因相對(duì)表達(dá)量在肝臟和脾臟組織中極顯著升高(Plt;0.01,下同),在肺臟中極顯著降低。KAT2B基因Exon-2、Exon-14和Exon-15區(qū)域均分別存在1個(gè)外顯子突變,分別為g.36682Ggt;A、g.104540Ggt;T和g.106651Agt;G,3個(gè)SNPs位點(diǎn)PIC均處于中度多態(tài)性水平且Hardy-Weinberg平衡。g.36682Ggt;A位點(diǎn)優(yōu)勢(shì)基因型為GA型,等位基因頻率Ggt;A;g.104540Ggt;T位點(diǎn)優(yōu)勢(shì)基因型為GG型,等位基因頻率Ggt;T;g.106651Agt;G位點(diǎn)優(yōu)勢(shì)基因型為AA型,等位基因頻率Agt;G。關(guān)聯(lián)分析結(jié)果表明,g.36682Ggt;A位點(diǎn)各基因型生長(zhǎng)性狀之間無(wú)顯著差異(Pgt;0.05),g.106651Agt;G位點(diǎn)AA基因型與AG基因型胸深存在顯著差異(Plt;0.05)?!窘Y(jié)論】香蘇雜交豬KAT2B基因在各組織中均有表達(dá)且存在3個(gè)SNPs位點(diǎn)(g.36682Ggt;A、g.104540Ggt;T和g.106651Agt;G),KAT2B基因可作為與香蘇雜交豬生長(zhǎng)性狀相關(guān)的候選基因。

        關(guān)鍵詞:香蘇雜交豬;KAT2B基因;實(shí)時(shí)熒光定量PCR;SNPs;生長(zhǎng)性狀

        中圖分類(lèi)號(hào):S828.89文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A文章編號(hào):2095-1191(2024)05-1463-08

        Association between KAT2B gene polymorphisms and growth traits in Xiangsu hybrid pigs

        LI Ji-feng,RUAN Yong,JIANG Chuan-mei,XIAO Mei-mei,HUANG Jia-jin,XU Jia-li,XU Hou-qiang*

        (Key Laboratory of Animal Genetics,Breeding and Reproduction in the Plateau Mountainous Region,Ministry ofEducation/Guizhou Key Laboratory of Animal Genetics,Breeding and Reproduction/College of Zoology,Guizhou University,Guiyang,Guizhou 550025,China)

        Abstract:【Objective】To understand the expression level of K(lysine)acetyltransferase 2B(KAT2B)gene in thetis-sues of Xiangsu hybrid pigs,to select the single nucleotide polymorphism(SNP)site of Xiangsu hybrid pigs,and to ana-lyze the association between gene polymorphism and growth traits,so as to provide reference for breeding new Xiangsu hybrid pigs.【Method】Xiangsu hybrid pigs were selected as the study object.Real-time fluorescence quantitative PCR was used to detect the relative expression of KAT2B gene in different tissues of 3 days and 6 months of age,and the SNP sites of KAT2B gene were detected by direct sequencing.Allele frequency,genotype frequency,heterozygosity(Ho),ex-pected heterozygosity(He),effective allele number(Ne)and average peptide information content(PIC)of SNP sites were measured.Chi-square test(χ2)was used to analyze whether the genotypes were in Hardy-Weinberg equilibrium state.Then analyzed the relationship between different genotypes and growth traits of Xiangsu hybrid pigs.【Result】Real-time fluorescence quantitative PCR results showed that KAT2B gene was expressed in 6 tissues of heart,liver,spleen,lung,kidney and longissimusdorsimuscle.Compared with 3 days of age,the relative expression level of liver and spleen was extremely significantly increased(Plt;0.01,the same below),while the relative expression level of lung was ex-tremely significantly decreased.Exon-2,Exon-14 and Exon-15 regions in KAT2B gene had one exon mutation,which were g.36682Ggt;A,g.104540Ggt;T and g.106651Agt;G,respectively.All the three SNPs sites were in moderate polymor-phism level and Hardy-Weinberg equilibrium.The dominant genotype of g.36682Ggt;A site was GA type,and the allele frequency Ggt;A;the dominant genotype of g.104540Ggt;T site was GG genotype,and the allele frequency Ggt;T;the domi-nant genotype of G.106651Agt;G site was AA,and the allele frequency was Agt;G.The results of association analysis showed that there was no significant difference between genotype and growth traits of g.36682Ggt;A sites(Pgt;0.05),and there was significant difference in chest depth between AA genotype and AG genotype at g.106651Agt;G(Plt;0.05).【Con-clusion】The KAT2B gene is expressed in all tissues of Xiangsu hybrid pigs and there are three SNPs sites(g.36682Ggt;A,g.104540Ggt;T and g.106651Agt;G),KAT2B gene can be used as a candidate gene related to growth traits of Xiangsuhy-brid pigs.

        Key words:Xiangsu hybrid pig;KAT2B gene;real-time fluorescence quantitative PCR;SNPs;growth traits

        Foundation items:National Natural Science Foundation of China(31860242);Guizhou Science and Technology Plan Project[QKHFQ〔2018〕4007(002)];Guizhou Agricultural Major Industrial Scientific Research Tackling Project(Qianjiaohe KY〔2019〕011)

        0引言

        【研究意義】從江香豬是我國(guó)特色的地方小型豬種,具有耐粗飼,肉質(zhì)香嫩,營(yíng)養(yǎng)價(jià)值高等優(yōu)點(diǎn),但存在瘦肉率低,生長(zhǎng)發(fā)育慢等缺點(diǎn)(許厚強(qiáng),2019)。為改善從江香豬在生長(zhǎng)繁殖上的不足,課題組前期將從江香豬與蘇太豬雜交,培育出香蘇雜交豬新品系(倪萌萌等,2018;阮涌等,2018)。因此,研究香蘇雜交豬與生長(zhǎng)性狀相關(guān)基因多態(tài)性的關(guān)聯(lián)性,對(duì)培育生長(zhǎng)發(fā)育快、肉質(zhì)好、風(fēng)味佳的香蘇雜交豬新品系具有重要意義?!厩叭搜芯窟M(jìn)展】組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶P300/CBP結(jié)合因子[K(lysine)acetyltransferase 2B,KAT2B]是一種轉(zhuǎn)錄共激活因子,具有乙酰轉(zhuǎn)移酶活性并調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄、細(xì)胞周期進(jìn)程和分化的作用,參與控制肌源性轉(zhuǎn)錄和分化(Sartorelli et al.,1999;Nagy and Troa,2007),能與組蛋白及其他蛋白結(jié)合形成大蛋白復(fù)合物調(diào)節(jié)組蛋白乙酰化修飾(Jin et al.,2011)。有研究認(rèn)為KAT2B參與骨骼肌分化,在肌生成素啟動(dòng)子中起作用,當(dāng)成肌細(xì)胞退出細(xì)胞周期時(shí),KAT2B取代HDAC2并使MyoD乙?;?,誘導(dǎo)肌肉基因轉(zhuǎn)錄(Polesskaya et al.,2001;Cho et al.,2015)。KAT2B特異性缺失可顯著降低哺乳動(dòng)物細(xì)胞中組蛋白H3賴(lài)氨酸9(Histone 3 acetylation K9,H3K9)的乙?;―ominique and László,2017),KAT2B介導(dǎo)PLK4賴(lài)氨酸乙酰化負(fù)調(diào)控其激酶活性,從而控制人類(lèi)細(xì)胞中中心體數(shù)量,有助于維持基因組完整性(Fournier et al.,2016)。為研究KAT2A和KAT2B在動(dòng)物體內(nèi)的作用,Tushar等(2018)以斑馬魚(yú)為研究對(duì)象,在其發(fā)育早期階段進(jìn)行基因敲除試驗(yàn),發(fā)現(xiàn)斑馬魚(yú)心臟和肢體發(fā)育均受到影響。在骨肉瘤細(xì)胞研究中,KAT2B基因沉默可抑制自噬體數(shù)量,其在骨肉瘤癌細(xì)胞中正調(diào)控H3S28ph,通過(guò)靶向ATG5和ATG7調(diào)節(jié)H3S28磷酸化,促進(jìn)骨肉瘤癌細(xì)胞自噬(Kong et al.,2019)。在人成肌細(xì)胞研究中,發(fā)現(xiàn)KAT2B在肌肉分化過(guò)程中可調(diào)節(jié)層粘膠蛋白A/C-HDAC2的結(jié)合,而核纖層蛋白A和法尼化前層蛋白A促進(jìn)KAT2B向核層募集與纖層蛋白A/C結(jié)合,在肌管分化過(guò)程中,蛋白相互作用減少(Santi et al.,2020)。通過(guò)建立B細(xì)胞中缺乏GCN5和KAT2B小鼠模型,發(fā)現(xiàn)小鼠骨髓和外周器官成熟B細(xì)胞水平偏低,證實(shí)GCN5和KAT2B均為體內(nèi)B細(xì)胞發(fā)育所必需(Oksenychetal.,2021)。在KAT2A和KAT2B角質(zhì)形成細(xì)胞自我更新和分化功能研究中,發(fā)現(xiàn)二者之間存在差異,KAT2A基因缺失會(huì)導(dǎo)致表皮分化基因過(guò)早表達(dá),而KAT2B基因缺失會(huì)導(dǎo)致表皮延遲分化,二者間的相互作用對(duì)動(dòng)物體皮膚傷口正常愈合有重要作用(Walters et al.,2023)?!颈狙芯壳腥朦c(diǎn)】KAT2B在哺乳動(dòng)物生長(zhǎng)發(fā)育、DNA復(fù)制和修復(fù)、細(xì)胞周期和死亡、肌動(dòng)蛋白介導(dǎo)的細(xì)胞收縮、蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)和中心體復(fù)制調(diào)節(jié)中發(fā)揮作用(Bondy-Chorney et al.,2019)。目前已有研究發(fā)現(xiàn)KAT2B基因是我國(guó)4種主要肉用牛品種生長(zhǎng)性狀相關(guān)基因,可作為肉牛選育的重要分子標(biāo)記(Lin etal.,2022)。而有關(guān)豬KAT2B基因在各組織中的表達(dá)量及其基因多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀相關(guān)性鮮有文獻(xiàn)報(bào)道?!緮M解決的關(guān)鍵問(wèn)題】以香蘇雜交豬為研究對(duì)象,通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR,計(jì)算KAT2B基因在3日齡及6月齡心臟、肝臟、脾臟、肺臟、腎臟和背最長(zhǎng)肌6個(gè)組織中的相對(duì)表達(dá)量;以直接測(cè)序方法對(duì)KAT2B基因單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide polymorphism,SNP)進(jìn)行鑒定,篩選出KAT2B基因調(diào)控香蘇雜交豬生長(zhǎng)的關(guān)鍵SNP位點(diǎn),為培育香蘇雜交豬新品系提供理論依據(jù)。

        1材料與方法

        1.1試驗(yàn)材料

        選擇同一飼養(yǎng)條件6月齡香蘇雜交豬164頭,由貴州大學(xué)香豬育種場(chǎng)提供。通過(guò)耳緣靜脈或前腔靜脈采集5 mL血液置于EDTA抗凝管中。測(cè)量并記錄香蘇雜交豬的體重、體長(zhǎng)、體高、胸圍、腹圍、管?chē)?、胸深、胸寬和腿臀圍等生長(zhǎng)數(shù)據(jù)。選擇3日齡和6月齡健康狀況良好、體型大小相近的香蘇雜交豬各3頭,屠宰后采集其心臟、肝臟、脾臟、肺臟、腎臟和背最長(zhǎng)肌組織置于含有RNA保存液的凍存管中,-80℃保存?zhèn)溆?。?dòng)物試驗(yàn)由貴州大學(xué)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物倫理委員會(huì)批準(zhǔn),批準(zhǔn)號(hào)EAE-GZU-2022-E033。

        主要試劑:血液DNA提取試劑盒、StarScriptⅡRT Mix with gDNA Remover試劑盒和2×RealStar Fast SYBR qPCR Mix試劑盒購(gòu)自上海西寶生物科技有限公司;2×Hieff?PCR Master Mix購(gòu)自上海翌圣生物科技有限公司;DL2000 DNA Marker和核酸染料購(gòu)自上海索萊寶生物科技有限公司。主要儀器設(shè)備:NanoDrop 2000超微量分光光度計(jì)和RC-6 Plus高速冷凍離心機(jī)購(gòu)自美國(guó)賽默飛世爾科技公司;9902梯度PCR儀購(gòu)自美國(guó)ABI公司;Universal Hood II凝膠成像系統(tǒng)購(gòu)自美國(guó)Bio-Rad公司。

        1.2試驗(yàn)方法

        1.2.1引物設(shè)計(jì)與合成根據(jù)NCBI網(wǎng)站上發(fā)布的豬KAT2B的mRNA參考序列(XM_021071366.1)和全基因組序列(NC_010455.5),利用Primer Pre-mier 5.0設(shè)計(jì)實(shí)時(shí)熒光定量PCR引物及豬KAT2B基因外顯子區(qū)域PCR擴(kuò)增引物(表1),送至北京擎科生物技術(shù)有限公司合成,置于4℃保存。

        1.2.2血液DNA、組織RNA的提取及cDNA合成采用TRIzol試劑盒分別提取3日齡和6月齡香蘇雜交豬心臟、肝臟、脾臟、肺臟、腎臟和背最長(zhǎng)肌組織總RNA,溶于RNA se-Free ddH2O中,使用NanoDrop 2000超微量分光光度計(jì)檢測(cè)其濃度,1.5%瓊脂糖凝膠電泳驗(yàn)證其質(zhì)量,提取合格的RNA于-80℃保存?zhèn)溆?。采用StarScriptⅡRT Mix with gDNA Remover試劑盒對(duì)RNA進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,NanoDrop 2000分光光度計(jì)檢測(cè)cDNA濃度,所得合格cDNA于-20℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

        采用血液DNA提取試劑盒提取香蘇雜交豬血液DNA,并通過(guò)NanoDrop 2000超微量分光光度計(jì)檢測(cè)DNA的濃度及純度,以1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)其質(zhì)量,將提取的血液DNA樣品進(jìn)行等量混合,制備成DNA混池樣品,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.2.3 PCR擴(kuò)增及測(cè)序?qū)NA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,PCR反應(yīng)體系30.0μL:2×Hieff?PCR Master Mix 15.0μL,上、下游引物各1.5μL,DNA模板1.5μL,ddH2O 10.5μL。擴(kuò)增程序:94℃預(yù)變性5 min;94℃30 s,55~65℃30 s,72℃30 s,進(jìn)行35個(gè)循環(huán);72℃延伸10min。采用1.5%瓊脂糖凝膠電泳對(duì)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行檢測(cè)。最后將PCR擴(kuò)增產(chǎn)物送至北京擎科生物科技有限公司測(cè)序,采用DNAStar進(jìn)行測(cè)序結(jié)果與原始序列對(duì)比,篩選出SNPs位點(diǎn)。1.2.4 KAT2B基因相對(duì)表達(dá)量檢測(cè)分別以3日齡和6月齡的香蘇雜交豬心臟、肝臟、脾臟、肺臟、腎臟和背最長(zhǎng)肌組織的cDNA為模板,以GAPDH為內(nèi)參基因,利用2×RealStar Fast SYBR qPCR Mix試劑盒進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè),PCR反應(yīng)體系10.0μL:SYBR qPCR Mix(2×)5.0μL,上、下游引物各0.3μL,模板0.5μL,ddH2O 3.9μL。擴(kuò)增程序:95℃2 min;95℃15 s,62℃30 s,72℃30 s,進(jìn)行40個(gè)循環(huán);95℃15 s,60℃15 s,95.5℃5 s。采用2-ΔΔCt法計(jì)算KAT2B基因在香蘇雜交豬不同組織中的相對(duì)表達(dá)量。1.3統(tǒng)計(jì)分析

        利用Excel 2010計(jì)算篩選SNPs位點(diǎn)的等位基因頻率、基因型頻率、觀測(cè)雜合度(Ho)、期望雜合度(He)、有效等位基因數(shù)(Ne)及平均多肽信息含量(PIC)等,以卡方(χ2)檢驗(yàn)分析基因型是否處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)。使用SPSS 25.0中一般線(xiàn)性模型(GLM)將KAT2B基因SNPs位點(diǎn)不同基因型與香蘇雜交豬生長(zhǎng)性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,數(shù)據(jù)分析模型采用方程:Yijk=μ+Gi+Aj+eijk,式中,Yijk為生長(zhǎng)性狀測(cè)定值,μ為群體平均值,Gi為基因型效應(yīng),Aj為年齡效應(yīng),eijk為隨機(jī)殘差。采用SPSS 25.0進(jìn)行差異顯著性分析,使用GraphPad Prism 8.0作圖。

        2結(jié)果與分析

        2.1 KAT2B基因在香蘇雜交豬不同組織中相對(duì)表達(dá)量分析結(jié)果

        由實(shí)時(shí)熒光定量PCR測(cè)定KAT2B基因在香蘇雜交豬各組織中的相對(duì)表達(dá)量結(jié)果(圖1)可知,KAT2B基因在香蘇雜交豬心臟、肝臟、脾臟、肺臟、腎臟和背最長(zhǎng)肌組織中均有表達(dá),3日齡KAT2B基因的相對(duì)表達(dá)量排序?yàn)榉闻Kgt;脾臟gt;肝臟gt;腎臟gt;心臟gt;背最長(zhǎng)肌;6月齡排序?yàn)椋焊闻Kgt;脾臟gt;腎臟gt;肺臟gt;背最長(zhǎng)肌gt;心臟。與3日齡相比,6月齡肝臟和脾臟KAT2B基因相對(duì)表達(dá)量極顯著升高(Plt;0.01,下同),肺臟極顯著降低;3日齡和6月齡香蘇雜交豬KAT2B基因在心臟、腎臟和背最長(zhǎng)肌組織中的相對(duì)表達(dá)量無(wú)顯著差異(Pgt;0.05,下同)。3日齡香蘇雜交豬肺臟組織中的KAT2B基因相對(duì)表達(dá)量最高,6月齡肝臟組織該基因的相對(duì)表達(dá)量最高。

        2.2香蘇雜交豬KAT2B基因SNPs位點(diǎn)檢測(cè)結(jié)果結(jié)合香蘇雜交豬KAT2B基因PCR擴(kuò)增電泳結(jié)果(圖2)和測(cè)序結(jié)果對(duì)香蘇雜交豬KAT2B基因SNP位點(diǎn)進(jìn)行篩選(圖3)可知,香蘇雜交豬KAT2B基因Exon-2、Exon-14和Exon-15擴(kuò)增區(qū)域均分別存在1個(gè)外顯子突變,即g.36682Ggt;A、g.104540Ggt;T和g.106651Agt;G位點(diǎn)。

        2.3香蘇雜交豬KAT2B基因SNPs位點(diǎn)遺傳學(xué)分析結(jié)果

        由表2可知,香蘇雜交豬KAT2B基因g.36682Ggt;A、g.104540Ggt;T和g.106651Agt;G等3個(gè)SNPs位點(diǎn)PIC均處于中度多態(tài)性水平。g.36682Ggt;A位點(diǎn)的優(yōu)勢(shì)基因型為GA型,等位基因頻率Ggt;A;g.104540Ggt;T位點(diǎn)的優(yōu)勢(shì)基因型為GG型,等位基因頻率Ggt;T;g.106651Agt;G位點(diǎn)的優(yōu)勢(shì)基因型為AA型,等位基因頻率Agt;G。χ2檢驗(yàn)結(jié)果表明,3個(gè)SNPs位點(diǎn)(g.36682Ggt;A、g.104540Ggt;T和g.106651Agt;G)均處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)。

        2.4香蘇雜交豬KAT2B基因SNPs位點(diǎn)不同基因型與生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)性

        運(yùn)用SPSS 25.0對(duì)香蘇雜交豬KAT2B基因SNPs位點(diǎn)各基因型與其6月齡時(shí)的生長(zhǎng)性狀(體重、體長(zhǎng)、體高、胸圍、腹圍、管?chē)?、胸深、胸寬和腿臀圍)進(jìn)行關(guān)聯(lián)性分析。結(jié)果(表3)顯示,g.36682Ggt;A位點(diǎn)3個(gè)基因型生長(zhǎng)性狀之間無(wú)顯著差異。g.106651Agt;G位點(diǎn)AA基因型與AG基因型胸深存在顯著差異(Plt;0.05,下同)。

        3討論

        目前,有關(guān)KAT2B基因在不同組織和發(fā)育階段中表達(dá)量的研究較少。前人研究發(fā)現(xiàn),KAT2B基因在肺臟和心臟中相對(duì)表達(dá)量較高,在肝臟中相對(duì)表達(dá)量較低(Li etal.,2017)。而本研究通過(guò)實(shí)時(shí)熒光PCR對(duì)KAT2B基因在不同生長(zhǎng)階段香蘇雜交豬不同組織中的相對(duì)表達(dá)量進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果顯示,KAT2B基因在心臟、肝臟、脾臟、肺臟、腎臟和背最長(zhǎng)肌組織中均有表達(dá),3日齡KAT2B基因的相對(duì)表達(dá)量在肺臟組織中表現(xiàn)最高,背最長(zhǎng)肌組織中最低;6月齡時(shí)在肝臟組織中相對(duì)表達(dá)最高,在心臟組織中相對(duì)表達(dá)量最小,與前人的研究結(jié)果有所不同,猜測(cè)由于豬種和生長(zhǎng)階段不同導(dǎo)致。KAT2B基因的相對(duì)表達(dá)量整體上隨著香蘇雜交豬的生長(zhǎng)呈增加趨勢(shì),這一結(jié)論可為深入研究該基因調(diào)控豬生長(zhǎng)發(fā)育的功能機(jī)制提供參考依據(jù)。

        目前,與豬生長(zhǎng)性狀相關(guān)的基因已有較多研究報(bào)道,如pGH基因與大白豬的20日齡體重以及2月齡體重相關(guān),且CC基因型在生長(zhǎng)性狀上優(yōu)于CT和TT基因型(趙聰哲等,2019);PPARGC1A基因與豬的平均日增重和達(dá)到目標(biāo)體重日齡相關(guān),可能影響個(gè)體的生長(zhǎng)發(fā)育(白瑩等,2020);ENO3基因多態(tài)性與大白豬日增重、眼肌面積及體重達(dá)100kg時(shí)的日齡相關(guān)(趙玉強(qiáng)等,2022)。DKK1基因多態(tài)性與香蘇雜交豬的體高、胸圍、管?chē)⑿厣詈屯韧螄嚓P(guān)(許家利等,2022),PRKAA2基因多態(tài)性與體重、體長(zhǎng)、體高、胸圍、腹圍、管?chē)?、胸深和臀腿圍均具有不同程度相關(guān)性,2個(gè)基因都可作為培育新品系的主效候選基因,可能對(duì)豬的生長(zhǎng)性能產(chǎn)生影響(許家利,2022)。本研究的結(jié)果表明,香蘇雜交豬KAT2B基因的3個(gè)外顯子突變位點(diǎn)均處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài),其g.36682Ggt;A、g.104540Ggt;T和g.106651Agt;G位點(diǎn)的PIC處于中度多態(tài)性水平,可進(jìn)行生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)分析。

        KAT2B最早發(fā)現(xiàn)于1996年,與其他諸多乙酰轉(zhuǎn)移酶一樣能催化組蛋白的乙?;?,而組蛋白在被修飾后,能對(duì)下游基因的轉(zhuǎn)錄起到調(diào)節(jié)作用(Clements et al.,1999)。此外,有研究表明KAT2B還能修飾許多代謝酶,通過(guò)乙?;揎椪{(diào)節(jié)酶活性進(jìn)而調(diào)節(jié)糖代謝反應(yīng)以及營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的代謝途徑等(Drazic etal.,2016)。有關(guān)KAT2B基因在畜禽育種中的研究已有相關(guān)報(bào)道,Moisa等(2013)研究發(fā)現(xiàn),在安格斯和安格斯×西門(mén)特閹牛的生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中,KAT2B基因不足以促進(jìn)前脂肪的生成反應(yīng),但在育肥階段肌肉中KAT2B基因表達(dá)存在時(shí)間與飼料處理的交互作用,表明KAT2B基因可能參與了牛的生長(zhǎng)發(fā)育。Sen等(2018)研究發(fā)現(xiàn),KAT2A和KAT2B基因通過(guò)調(diào)節(jié)H3K9乙?;龠M(jìn)斑馬魚(yú)和小鼠顱面軟骨和骨的生長(zhǎng)及分化。Lin等(2022)對(duì)中國(guó)4個(gè)地方牛品種富牛、秦川牛、牦牛和柴達(dá)木牛的KAT2B基因多態(tài)性檢測(cè),發(fā)現(xiàn)有3個(gè)基因多態(tài)性與牛體測(cè)量性狀相關(guān)。本研究通過(guò)直接測(cè)序發(fā)現(xiàn)香蘇雜交豬KAT2B基因外顯子區(qū)域存在3個(gè)SNPs位點(diǎn),在6月齡的香蘇雜交豬群體中,g.106651Agt;G位點(diǎn)AA基因型與AG基因型胸深存在顯著差異。因此,KAT2B基因g.106651Agt;G位點(diǎn)可應(yīng)用于香蘇雜交豬的后續(xù)育種工作。

        4結(jié)論

        香蘇雜交豬KAT2B基因在心臟、肝臟、脾臟、肺臟、腎臟和背最長(zhǎng)肌組織中均有表達(dá)且存在3個(gè)SNPs位點(diǎn),分別是g.36682Ggt;A、g.104540Ggt;T和g.106651Agt;G,其中g(shù).106651Agt;G的胸深有顯著差異,KAT2B基因可作為香蘇雜交豬生長(zhǎng)性狀相關(guān)的候選基因。

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        (責(zé)任編輯李洪艷)

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