趙昕 杜玉瑤 殷子揚 毛淑紅
(1. 天津科技大學(xué)生物工程學(xué)院,天津 300457;2. 工業(yè)發(fā)酵微生物教育部重點實驗室,天津 300457)
膽固醇7α-羥化酶(CYP7A1)又稱細胞色素P450 7A1酶,是肝臟特異性微粒體細胞色素P450家族7亞家族A成員[1]。在肝臟中,CYP7A1催化膽固醇轉(zhuǎn)化為7α-羥基膽固醇,從而促進膽汁酸的分解,CYP7A1為該反應(yīng)的限速酶[2],對維持體內(nèi)膽固醇代謝平衡起到關(guān)鍵的作用,其在保障膽固醇正常攝取、運輸和轉(zhuǎn)化方面有極其重要的作用。在體內(nèi),若膽固醇代謝異常易造成血管內(nèi)壁的膽固醇沉積,形成動脈粥樣硬化、膽結(jié)石等疾病,還可導(dǎo)致膽囊癌、結(jié)直腸癌等疾病的發(fā)生[3-4]。
22例攜帶GJB3基因c.538 C>T受檢者電話隨訪中,針對聽力情況特別是尖叫等高頻區(qū)域是否受損進行問詢,所有攜帶c.538的受檢者均表示聽力正常但未行耳鼻喉科專業(yè)檢查,其中包含1例c.538 C>T純合。GJB3基因c.538 C>T早期研究認為是常染色體顯性遺傳模式的高頻率聽力損失[7],但后期對于GJB3基因變異是否致病尚存在爭議[8],結(jié)合本次報道臨床對于GJB3基因c.538C>T的咨詢建議應(yīng)謹慎。
CYP7A1依賴于氧化酶和還原酶之間特定的電子傳遞鏈進行7位羥基化反應(yīng)[5]。CYP7A1電子傳遞機制如圖1,NADPH提供的兩個電子轉(zhuǎn)移到CPR的黃素腺嘌呤二核苷酸(FAD)區(qū)域,F(xiàn)AD接受電子會引起CPR的構(gòu)象變化,使FAD接近黃素單核苷酸(FMN)區(qū)域,之后FAD處的電子轉(zhuǎn)移到FMN;隨后CPR分子恢復(fù)到原來的構(gòu)象,允許FMN與CYP7A1分子電荷結(jié)合位點相互作用[6-9],然后電子流向CYP7A1的血紅素鐵區(qū)域,通過Fe=O機制介導(dǎo)膽固醇羥基化反應(yīng)[10],CYP7A1催化反應(yīng)可表示為:NADPH+H++O2+膽固醇→NADP++H2O+7α-羥基膽固醇。
圖1 膽固醇7α-羥化酶的電子傳遞機理Fig. 1 Electron transport mechanism of cholesterol 7α-hydroxylase
7α-羥基膽固醇不僅是一種膽固醇代謝產(chǎn)物,而且對膽汁酸合成、炎癥和腫瘤等方面的治療都有重要的作用。7α-羥基膽固醇在肝臟中被轉(zhuǎn)化為膽汁酸,從而促進膽汁酸的合成和分泌[11]。此外,7α-羥基膽固醇可以減少炎性細胞浸潤,降低炎癥水平,從而起到抗炎作用[12]。最后,7α-羥基膽固醇可以抑制癌細胞的增殖和轉(zhuǎn)移,具有一定的抗腫瘤作用[13]。因此構(gòu)建一株利用CYP7A1高效生產(chǎn)7α-羥基膽固醇的菌株具有極大的醫(yī)學(xué)價值和工業(yè)生產(chǎn)價值。
在構(gòu)建表達膽固醇7α-羥化酶的畢赤酵母基因工程菌株的基礎(chǔ)上,對7α-羥化酶進行理性設(shè)計與分子改造,對篩選獲得的高活性7α-羥化酶適配不同來源CPR,并在畢赤酵母中共表達,從而為7α-羥基膽固醇高效生產(chǎn)奠定基礎(chǔ)。
氣相色譜-質(zhì)譜法(GC?MS)分析條件:升溫程序:初始溫度50℃,保持2 min,以5℃/min升到270℃,保持0 min,再以2.5℃/min升到290℃,保持0 min;再以10℃/min升到310℃,保持4 min,不分流進樣,流速1 mL/min。
限制性核酸內(nèi)切酶(BamH I、EcoR I、Sal I和Sac I)、Goldstar best DNA聚合酶、Solution I連接酶、DNA提取純化試劑盒和DNA凝膠回收試劑盒均為TaKaRa公司產(chǎn)品,膽固醇為Diamond公司產(chǎn)品,7α-羥基膽固醇為Genewiz公司產(chǎn)品。
1.2.5 膽固醇的轉(zhuǎn)化 在YPD培養(yǎng)基上選取構(gòu)建成功的重組菌株的單菌落,接種到30 mL YPG培養(yǎng)基中,30℃、220 r/min的搖床培養(yǎng)24 h;按培養(yǎng)基2%接種量接種到50 mL BMGY培養(yǎng)基中進行富集培養(yǎng),30℃、220 r/min的搖床培養(yǎng)18 h,轉(zhuǎn)接到BMMY培養(yǎng)基,于30℃、220 r/min的搖床繼續(xù)培養(yǎng)24 h;加入0.01%底物膽固醇及1%誘導(dǎo)劑甲醇,繼續(xù)培養(yǎng)4 d,期間每24 h添加甲醇至1%的濃度。取發(fā)酵液10 mL,并加入等體積乙酸乙酯輕微振蕩萃取,離心后取上層有機相,濃縮至500 μL,使用薄層色譜(TLC)、氣相色譜-質(zhì)譜法(GC?MS)及蒸發(fā)光分析產(chǎn)物的生成情況。
蒸發(fā)光檢測分析條件:流動相為純甲醇,進樣量10 μL,載氣流速2.2 mL/min,載氣溫度90℃。
只有肯在泥濘的小路上摸爬滾打,才有機會踏上鋪滿鮮花的大道。今年33歲的王振東,現(xiàn)任哈佳項目部總工程師。對于一個80后青年來說,這已經(jīng)是值得稱傲的成就了,但是踏遍工程現(xiàn)場的艱辛腳印向我們展示了他的成功當之無愧。
1.2.1 重組質(zhì)粒pPIC3.5K?CYP7A1(WT/突變型)的構(gòu)建 以合成的CYP7A1(WT)基因為模板,通過特異性引物(表1)PCR擴增克隆出WT基因及突變基因H111A、I114A、V281A、W284A和G485A,用限制性核酸內(nèi)切酶BamH I和EcoR I對以上片段和pPIC3.5K質(zhì)粒進行雙酶切,切膠回收產(chǎn)物經(jīng)Solution I連接酶過夜連接,將連接的產(chǎn)物化轉(zhuǎn)至大腸桿菌E. coli JM 109,以卡那霉素抗性篩選重組轉(zhuǎn)化子并測序。得到E. coli JM 109/pPIC3.5K?CYP7A1(WT/突變型)。
表1 CYP7A1基因野生型及突變型引物Table 1 Wild-type and mutant primers of CYP7A1 gene
1.2.2 畢赤酵母/pPIC3.5K?CYP7A1(WT/突變型)菌株的構(gòu)建 將測序正確的重組質(zhì)粒pPIC3.5K?CYP7A1(WT/突變型)用Sal I限制性核酸內(nèi)切酶單酶切線性化;電轉(zhuǎn)至畢赤酵母GS115感受態(tài)細胞中,使用含0.5 mg/mL G418的YPD和2.0 mg/mL G418的YPD培養(yǎng)基篩選高拷貝菌株,提取菌株基因組進行PCR驗證,以獲得重組菌株。
1.2.3 不同來源CPR與CYP7A1共表達畢赤酵母菌株的構(gòu)建 將實驗室保存的5種含不同來源CPR的質(zhì)粒pPICZX?CPR用Sac I限制性核酸內(nèi)切酶單酶切線性化后電轉(zhuǎn)至含CYP7A1(WT)基因的畢赤酵母感受態(tài)細胞中;5種CPR分別為人源氧化還原蛋白(hCPR)、釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)來源氧化還原蛋白(ScCPR)、黑曲霉(Aspergillus nige)來源氧化還原蛋白(AnCPR)、大鼠來源氧化還原蛋白(RatCPR)及羅漢果來源氧化還原蛋白(SgCPR);使用含300 μg/mL博來霉素的YPDS和2.0 mg/mL G418的YPD培養(yǎng)基篩選高拷貝菌株,提取菌株基因組進行PCR驗證,以獲得重組菌株。
1.2.4 G485A與SgCPR共表達畢赤酵菌株的構(gòu)建 將重組質(zhì)粒pPICZX?SgCPR用Sac I限制性核酸內(nèi)切酶單酶切線性化,將線性化的質(zhì)粒加入含CYP7A1(G485A)基因的畢赤酵母感受態(tài)細胞中,使用含300 μg/mL博來霉素YPDS和2.0 mg/mL G418的YPD培養(yǎng)基篩選高拷貝菌株,提取菌株基因組進行PCR驗證,以獲得重組菌株。
實際上,縱觀近幾年的郵品拍賣,只要是精品、珍品,就能引起買家的追逐,不僅成交相當活躍,而且市場潛力十分可觀。如被稱為我國“十大珍郵”之一的“全國山河一片紅”郵票,單枚價格的漲勢就十分驚人:早在1977年,就有150元一枚的身價;1987年,它的身價又漲至800元;到了1993年,成交價為3萬元;在1997年,北京的一場藝術(shù)品拍賣會上,一枚的成交價高達17萬元。2000年廣州國際郵票錢幣博覽會上,一枚《全國山河一片紅》郵票更是賣到18.5萬元。據(jù)業(yè)內(nèi)人士介紹,該郵票在拍賣場上,只要一亮相就深受藏家追捧,幾乎沒有流拍的事情發(fā)生。由此可見,只要投資者收藏有重大紀念事件方面的郵票,增值的可能性很大。
薄層色譜分析條件:展開劑為石油醚∶乙酸乙酯=2∶1,用含10%濃硫酸的無水乙醇噴灑TLC板,高溫加熱顯色后,可清晰分辨膽固醇及產(chǎn)物7α-羥基膽固醇所在的位置。
師:同學(xué)們,老師覺得作者很了不起,廣玉蘭樹形比較高大,我們平時看它只看到葉子,四季常青,感到冬季給我們帶來生機。但是陳荒煤卻不這樣認為,他覺得藏在葉子里面的花更有生機。因此他著意來描寫它。一株樹上的花數(shù)世同堂,生生不息。有四種形態(tài),其實作者也是有所側(cè)重,寫出了別人看不到,想不到的地方。你覺得他想突出哪種形態(tài)是最有生命力?
通過NCBI數(shù)據(jù)庫獲得全長人源CYP7A1基因(GenBank: NP_000771.2),由金唯智生物技術(shù)有限公司按照畢赤酵母密碼子偏愛性進行優(yōu)化合成。質(zhì)粒pPIC3.5K(含有卡那霉素抗性基因)、pPICZX(含有博來霉素抗性基因)、大腸桿菌Escherichia coli JM 109、畢赤酵母GS115均由本實驗室保存。
通常,根據(jù)測量方法來劃分,可以將地面三維激光掃描技術(shù)分成兩種,分別是移動式及固定式激光掃描系統(tǒng)。[2]其中,固定式激光掃描系統(tǒng),與傳統(tǒng)測量中的全站儀是十分相似的,由內(nèi)置數(shù)碼相機、控制系統(tǒng)及激光掃描儀等多個部分組成。但是相對于全站儀來說,固定式激光掃描儀收集的是整個系列的“點云”數(shù)據(jù)信息,而不是分散的單點三維坐標,其主要特征是掃描面積大、速度較快、精準度較高以及具備良好的野外操作性。而移動式激光掃描系統(tǒng),是以車載平臺為基礎(chǔ),由慣性導(dǎo)航系統(tǒng)、全球定位系統(tǒng)與固定式三維激光掃描系統(tǒng)相結(jié)合而組成的。
薄層色譜定性分析結(jié)果(圖2)顯示,圖中藍色的樣品點為7α-羥基膽固醇,粉色的樣品點為膽固醇。畢赤酵母GS115即使在投底物膽固醇的情況下,也不會將膽固醇轉(zhuǎn)化為7α-羥基膽固醇,而重組菌株具有催化膽固醇生成目的產(chǎn)物7α-羥基膽固醇的能力。
ADP受體拮抗劑噻吩并吡啶抑制ADP誘導(dǎo)的血小板聚集和活化,通過與P2Y型特殊巰基受體結(jié)合,抑制ADP受體的激活,常用于臨床的有氯吡格雷、替格瑞洛和普拉格雷,有關(guān)專家在相關(guān)章節(jié)已經(jīng)闡述。需要指出的是正在服用氯吡格雷患者,如準備進行CABG,除非血運重建緊急程度大于出血風(fēng)險,擬行擇期冠狀動脈旁路移植術(shù)的患者,建議擇期手術(shù)前停用氯吡格雷5天~7天。
圖2 重組畢赤酵母催化膽固醇TLC結(jié)果圖Fig. 2 TLC analysis of biotransformation result of cholesterol catalyzed by recombinant P. pastoris
氣相色譜-質(zhì)譜法(GC?MS)定性分析結(jié)果顯示,圖3?A為7α-羥基膽固醇標品的質(zhì)譜圖,特征峰出現(xiàn)在m/z 456(分子離子峰)、129、95、73和57的位置。圖3?B為重組菌株轉(zhuǎn)化產(chǎn)物的質(zhì)譜圖,特征峰與7α-羥基膽固醇標品的質(zhì)譜圖的特征峰相同,證明重組菌株生成的產(chǎn)物為7α-羥基膽固醇。
圖3 重組畢赤酵母催化生成7α-羥基膽固醇的GC-MS分析圖Fig. 3 GC-MS analysis of the 7α-hydroxycholesterol catalyzed by recombinant P. pastoris
將利用分子生物學(xué)改造獲得的5株突變株,進行催化膽固醇能力分析,轉(zhuǎn)化產(chǎn)物經(jīng)TLC分析(圖2)、蒸發(fā)光檢測(圖4),與野生型相比發(fā)現(xiàn),對111、114和284位點突變后酶的活性消失,說明這些位點對CYP7A1的活性有關(guān)鍵作用。對281和485的位點突變后,CYP7A1仍然具有活性,其中281位點的纈氨酸突變?yōu)楸彼岷?,活性稍有降低,為突變前?7.86%,而485位點的甘氨酸突變?yōu)楸彼岷?,活性提高,是野生型?08.71%,之后選取突變體G485A進行后續(xù)研究。
圖4 突變畢赤酵母產(chǎn)率比較圖Fig. 4 Production abilities of the mutants when compared with the wild type
將不同來源CPR與CYP7A1共表達,轉(zhuǎn)化結(jié)果如圖5所示,ScCPR、AnCPR、hCPR、RatCPR和SgCPR都能與CYP7A1適配,所獲得的重組菌株催化膽固醇的能力均有提高,其中CYP7A1與SgCPR共表達使7α-羥基膽固醇的產(chǎn)率與CYP7A1野生型菌株相比提高了82.26%,但與人源CYP7A1同源的hCPR在共表達過程中適配性沒有SgCPR顯著。突變體G485A與SgCPR共表達畢赤酵母催化膽固醇的能力顯著提高,與CYP7A1野生型菌株相比,產(chǎn)物產(chǎn)率提高了133.79%,產(chǎn)量為0.25 mg/L。
將全長的人源CYP7A1基因在畢赤酵母中進行表達,將畢赤酵母全細胞催化的發(fā)酵液進行萃取濃縮,用于薄層色譜(TLC)和氣相色譜-質(zhì)譜法(GC?MS)分析,檢測后確定發(fā)酵液中含有的產(chǎn)物為7α-羥基膽固醇。
圖5 CYP7A1與不同來源CPR共表達畢赤酵母對膽固醇轉(zhuǎn)化能力的影響Fig. 5 Effects of P. pastoris co-expressed with CYP7A1 and CPR from different sources on cholesterol conversion
目前報道的膽固醇7α-羥化酶主要是在大腸桿菌中異源表達,但CYP7A1為膜蛋白,存在純化步驟復(fù)雜、純化蛋白濃度低、不能翻譯修飾蛋白等問題。而且為了實現(xiàn)羥化酶在大腸桿菌中的高效表達,需要將N末端跨膜錨定結(jié)構(gòu)域(氨基酸2-24)的氨基酸序列優(yōu)化為MAKKT[14],并且為了在層析過程中溶解膜并保持蛋白質(zhì)解聚,需要在純化過程中添加表面活性劑,如Triton X?100、Emulgen 913等[15]。不僅如此,還需要使用辛基氨基瓊脂糖4B柱和陽離子交換層析等對蛋白進行進一步純化[16]。為避免復(fù)雜的蛋白純化步驟,實驗選取畢赤酵母為表達宿主,它能識別真核基因,幫助其進行轉(zhuǎn)錄翻譯后修飾,并且可以通過高密度發(fā)酵提高CYP7A1表達量和催化效率[17]。
目前對CYP7A1分子對接的研究主要集中在酶活性位點[18],而實驗是通過Discovery studio軟件的半柔性分子對接抓取與膽固醇小分子作用關(guān)鍵蛋白質(zhì)位點,定點突變?yōu)楸彼帷8鶕?jù)對接結(jié)果(圖6),選取5個位點定點突變?yōu)楸彼幔謩e得到H111A、I114A、V281A、W284A和G485A突變體,這些位點存在于CYP7A1活性口袋附近,主要作用力為疏水作用力以及氫鍵相互作用,疏水作用可以維持活性中心空間結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性。對111、114及284位點突變后酶的活性消失,說明這些位點對CYP7A1的活性有關(guān)鍵作用,這些位點突變后可能改變了傳遞電子的能力或改變結(jié)合口袋的結(jié)構(gòu)等。對281及485突變后催化活性變低或變高,可能是由于氨基酸極性不同導(dǎo)致的活性不同,氨基酸可分為親水氨基酸和疏水氨基酸,親水氨基酸對水分子具有一定的親和性,疏水氨基酸對脂溶性物質(zhì)的親和性更高。由于膽固醇為非極性分子,根據(jù)“相似相溶”的性質(zhì),較容易與疏水氨基酸相互作用。實驗中涉及的氨基酸極性從大到小的順序為:His>Trp>Gly>Ala>Val>Ile,突變體485位點甘氨酸突變?yōu)闃O性更小的丙氨酸后,與膽固醇形成的疏水鍵的作用力更強,催化活性提高;突變體281位點纈氨酸突變?yōu)闃O性更大丙氨酸后,與膽固醇形成的疏水鍵的作用力減弱,催化活性降低;其次也可能是由于突變位點距離膽固醇C?7位距離的不同導(dǎo)致活性不同,突變位點與膽固醇分子對接位置如圖7所示。281位點與膽固醇C?17位上的側(cè)鏈相連,與C?7位距離較遠,而485位點與A環(huán)相連,與C?7位距離較近,改變485位點氨基酸的大小對催化C?7羥基化有較大的影響。綜上所述281和485位點可以作為改造位點,將其突變?yōu)楦邮杷陌被峄蚋淖?85位點氨基酸的大小會對酶與底物結(jié)合有進一步影響。
圖6 CYP7A1與膽固醇分子對接結(jié)果圖Fig. 6 Docking results of CYP7A1 and cholesterol molecules
圖7 CYP7A1與膽固醇分子對接結(jié)果的二維平面圖Fig. 7 2D floor plan of docking results of CYP7A1 and cholesterol molecules
畢赤酵母為真核表達系統(tǒng),自身含有CPR可幫助CYP7A1轉(zhuǎn)移電子,但通過異源表達不同來源的CPR可增加產(chǎn)物7α-羥基膽固醇的產(chǎn)量。實驗表明,ScCPR、AnCPR、hCPR、RatCPR和SgCPR與CYP7A1共表達菌株催化膽固醇的能力均有提高,并且SgCPR與G485A適配后催化能力更加顯著。雖然CPR的過表達能夠增強CYP7A1在畢赤酵母的羥基化水平,但并不是與CYP7A1基因同源的人源CPR與其適配性最好,可能是由于CYP?CPR相互作用時,不同CPR中的FMN結(jié)構(gòu)域附近特定殘基組成不同導(dǎo)致的,F(xiàn)MN區(qū)域正電荷氨基酸數(shù)量顯著影響其相互作用[19]。
既然幼兒園里吃到的水產(chǎn)品不足,那么家里就要每周至少吃一次水產(chǎn)品了。當然為了安全起見,應(yīng)給孩子吃刺少的魚比如龍利魚、鱈魚、桂魚。這里特別要注意一類海魚(如金槍魚、沙丁魚、三文魚),青皮紅肉,富含歐米伽3脂肪酸和蝦青素,是適合全家人的健康食品,但是這類魚同時富含組氨酸,如果加熱時間不夠長或者不新鮮都可能造成組胺中毒。所以,吃這類魚一定要選新鮮的,然后充分加熱。當然還可以吃蝦,建議把蝦去頭之后再做,因為重金屬都蓄積在蝦頭中。
因此在畢赤酵母中異源表達其他CYP450時,可添加外源CPR提高轉(zhuǎn)化率。根據(jù)相關(guān)文獻報道,CYP450與CPR相互作用中存在著一定的比例,選取合適的比例可以大大提高酶的催化活性[20],因此進一步實驗可以通過CYP7A1適配不同濃度SgCPR,提高CYP7A1的轉(zhuǎn)化能力。
重組畢赤酵母生產(chǎn)7α-羥基膽固醇,是通過膽固醇7α-羥化酶在畢赤酵母異源表達的催化膽固醇實現(xiàn)的,其難點在于7α-羥基膽固醇的產(chǎn)量很低,只有產(chǎn)物濃度濃縮10-20倍才可用儀器檢測到,因此并不是酶沒有表達,而是產(chǎn)物濃度低到難以用蒸發(fā)光等儀器發(fā)現(xiàn)。并且膽固醇為脂溶性物質(zhì),難于進入細胞進行催化反應(yīng),即使在助溶劑的幫助下其溶解度也很低,因此找到膽固醇進入細胞的更有效辦法,可顯著提高7α-羥基膽固醇產(chǎn)量。
構(gòu)建CYP7A1異源表達平臺并對其轉(zhuǎn)化膽固醇能力進行研究,獲得全細胞催化膽固醇生產(chǎn)7α-羥基膽固醇的重組畢赤酵母菌株,通過定點突變及適配不同來源CPR進一步提高了7α-羥基膽固醇產(chǎn)量。實驗為7α-羥基膽固醇的高效生產(chǎn)奠定了良好的基礎(chǔ),也為CYP450的高效表達提供了有效方法。