黃佳艷 馮小艷 沈林波 王文治 胡海燕 張樹珍
(1. 海南大學(xué)熱帶作物學(xué)院,海口 570228;2. 中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院熱帶生物技術(shù)研究所,???571101)
植物病程相關(guān)蛋白(pathogenesis related pro?teins, PRs)是一類在植物受到逆境脅迫后誘導(dǎo)產(chǎn)生并積累的蛋白質(zhì)的總稱[1]。根據(jù)蛋白結(jié)構(gòu)、理化性質(zhì)和生物活性等特征,將PR蛋白分成17個家族,即PR1-PR17[2]。其中PR10是一類分子量小、等電點(diǎn)呈酸性、無信號肽的胞內(nèi)蛋白[3]。PR10蛋白不僅參與植物對炎熱、寒冷、干旱、鹽堿、細(xì)菌、真菌等逆境脅迫的響應(yīng),還在植物抵抗病毒侵染過程中發(fā)揮重要作用[1-3]。辣椒(Capsicum annuum)CaPR10蛋白受煙草花葉病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)誘導(dǎo)表達(dá)水平顯著升高并發(fā)生磷酸化,增強(qiáng)了CaPR10的核酸酶活性,促使CaPR10對入侵的病毒RNA進(jìn)行切割,從而達(dá)到抗病毒的作用[4]。煙草(Nicotiana tabacum)NtPR10基因應(yīng)答TMV侵染,感、抗煙草品種在感染TMV后,其NtPR10表達(dá)水平整體呈現(xiàn)相反的變化趨勢,表明NtPR10可能在TMV侵染過程中發(fā)揮作用[5]。岷江百合(Lilium regale)編碼的LrPR10基因受黃瓜花葉病毒(Cucu?mber mosaic virus, CMV)誘導(dǎo)上調(diào)表達(dá),接種CMV 4 d后,LrPR10的表達(dá)水平達(dá)到最大值,為處理前的58倍,表明LrPR10可能在岷江百合抗CMV防御反應(yīng)中發(fā)揮作用[6]。煙草NbPR10a基因受煙草曲莖病毒(Tobacco curly shoot virus, TbCSV)誘導(dǎo)上調(diào)表達(dá),在煙草植株中沉默NbPR10a基因?qū)е耇bCSV積累量顯著增加,表明NbPR10a具有抵抗TbCSV侵染的作用[7]。
甘蔗(Saccharum spp.)是重要的糖料作物和能源作物,甘蔗糖約占我國食糖總產(chǎn)量的90%[8-9]。甘蔗線條花葉病毒(Sugarcane streak mosaic virus,SCSMV)是引起甘蔗花葉病的主要病原之一,其侵染甘蔗導(dǎo)致葉片褪綠斑駁、植株矮化、分蘗變少,繼而影響甘蔗的品質(zhì)和產(chǎn)量[10-11]。SCSMV在我國各大蔗區(qū)廣泛分布,對我國甘蔗產(chǎn)業(yè)的發(fā)展造成嚴(yán)重威脅[11]。其隸屬馬鈴薯Y 病毒科(Potyviridae)禾本科病毒屬(Poacevirus),基因組大小約10 kb,編碼1個多聚蛋白,該蛋白進(jìn)一步被蛋白酶水解成11個成熟的功能蛋白,從N端到C端依次是P1、HC?Pro、P3、P3N?PIPO、6K1、CI、6K2、VPg、NIa?Pro、NIb和CP[12-14]。其中,P1蛋白是RNA沉默抑制子,能夠抑制寄主的RNA沉默防御機(jī)制,從而幫助SCSMV成功侵染寄主[14-15]。
本課題組在前期研究中,以SCSMV編碼的P1蛋白為誘餌,采用酵母雙雜交(yeast two hybrid,Y2H)技術(shù)篩選獲得一個與SCSMV P1蛋白互作的甘蔗PR10蛋白,命名為ShPR10[15]。在本研究中,首先利用同源克隆技術(shù)克隆ShPR10基因的完整開放閱讀框(open reading frame, ORF)序列,并對其編碼蛋白進(jìn)行生物信息學(xué)和亞細(xì)胞定位分析;然后利用Y2H和雙分子熒光互補(bǔ)(bimolecular fluorescence complementation, BiFC)技術(shù)驗(yàn)證ShPR10與SCSMV P1的互作關(guān)系;最后采用農(nóng)桿菌共浸潤瞬時表達(dá)系統(tǒng)和Western blot技術(shù)分析ShPR10對SCSMV P1沉默抑制子活性的影響。研究結(jié)果揭示ShPR10在甘蔗應(yīng)答SCSMV侵染過程中的作用,為甘蔗抗SCSMV育種奠定基礎(chǔ)。
1.1.1 植物材料 甘蔗品種為ROC22,種植于中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院熱帶生物技術(shù)研究所海南文昌試驗(yàn)基地。野生型本氏煙草(Nicotiana benthamiana)種植于相對濕度60%、光照16 h/d、溫度25℃的培養(yǎng)箱中。
1.1.2 主要試劑 EZNA Plant RNA Kit購自O(shè)mega BIO?TEK公司;RevertAid First?Strand cDNA Synthesis Kit購自Thermo Scientific公司;Nimble Cloning試劑盒購自海南壹田生物科技有限公司;HiPure Gel Pure DNA Mini Kit購自Magen公司;2× Magic Green Taq Mix購自TOLOBIO公司;大腸桿菌(Escherichia coli)DH5α感受態(tài)細(xì)胞購自北京全式金生物技術(shù)有限公司;Y2H Gold酵母(Saccharomyces cerevisiae)感受態(tài)細(xì)胞和農(nóng)桿菌(Agrobacterium tumefaciens)GV3101感受態(tài)細(xì)胞購自上海唯地生物技術(shù)有限公司;Bsa I內(nèi)切酶、2× EasyClone Mix和pBWA(V)HS?ccdB載體購自武漢伯遠(yuǎn)生物科技有限公司;pNC?GADT7、pNC?BiFC?Ecn、pNC?BiFC?Enn、pNC?Cam33FN和pNC?Cam33HN載體由中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院熱帶生物技術(shù)研究所言普研究員饋贈;P1?18T、ShPR10?18T、GFP?18T、pGBKT7?P1和pCam3304?35S?GFP質(zhì)粒為課題組構(gòu)建并保存。
1.1.3 主要儀器 Biometra TAdvanced PCR儀購自德國Analytikjena公司;瓊脂糖凝膠電泳儀購自美國Bio?Rad公司;凝膠成像分析儀器購自上海天能科技有限公司;LSM800激光共聚焦顯微鏡購自德國卡爾蔡司光學(xué)有限公司;長波紫外燈購自上海路陽儀器有限公司。
1.2.1 RNA提取和cDNA第一鏈合成 稱取 0.1 g ROC22葉片,用液氮研磨成粉末,按照EZNA Plant RNA Kit說明書的步驟提取甘蔗總RNA。cDNA第一鏈合成用RevertAid First?Strand cDNA Synthesis Kit進(jìn)行,產(chǎn)物置于?20℃保存。
1.2.2 ShPR10基因的克隆及生物信息學(xué)分析 以酵母雙雜交文庫篩選獲得的ShPR10基因序列和NCBI數(shù)據(jù)庫中玉米(Zea mays, EU976710.1)、野生二粒小麥(Triticum dicoccoides, XM_037558368)及一粒小麥(Triticum monococcum, JX424309.1)的PR10序列為參考,設(shè)計(jì)ShPR10基因ORF序列的特異擴(kuò)增引物ShPR10?F和ShPR10?R(表1)。以ROC22葉片cDNA為模板,參照馮小艷等[16]的方法克隆ShPR10基因,并送生工生物工程(上海)股份有限公司測序。
表1 本研究使用的引物Table 1 Primers used in this study
利用ProtParam(http://expasy.org/tools/protparam.html)預(yù)測ShPR10編碼蛋白的理化性質(zhì);利用NP?SA?PRABI(https://www.so.com/s?ie=utf?8&src=360se7_addr&q=NPSA?PRABI)、TMHMM 2.0(http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/)和 SignalP 5.0(http://www.cbs.dtu.dk /services /Signal P/)分別預(yù)測ShPR10的二級結(jié)構(gòu)、跨膜特性和信號肽;利用Blastp在線工具查找ShPR10的同源氨基酸序列,使用DNAMAN軟件進(jìn)行同源氨基酸序列比對分析,并使用MEGA 11.0軟件構(gòu)建進(jìn)化樹。
1.2.3 ShPR10的亞細(xì)胞定位 以GFP?18T質(zhì)粒為模板,GFP?p?F和GFP?p?R(表1)為引物擴(kuò)增綠色熒光蛋白GFP基因。以ShPR10?18T質(zhì)粒為模板,ShPR10?p?F和ShPR10?p?R(表1)為引物擴(kuò)增ShPR10基因。兩個基因擴(kuò)增產(chǎn)物分別通過瓊脂糖凝膠電泳后,切下目的條帶置于同一EP管中進(jìn)行回收?;厥债a(chǎn)物與經(jīng)Bsa I酶切線性化的pBWA(V)HS?ccdB載體進(jìn)行重組,重組體系:線性化的pBWA(V)HS?ccdB載體5 μL,回收產(chǎn)物5 μL,2× EasyClone Mix 10 μL,37℃反應(yīng)30 h獲得重組質(zhì)粒pBWA(V)HS?GFP?ShPR10。將該重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)入GV3101農(nóng)桿菌感受態(tài)細(xì)胞中,參考尹夢瑩等[17]的方法進(jìn)行農(nóng)桿菌侵染實(shí)驗(yàn),將帶有重組質(zhì)粒的農(nóng)桿菌注入本氏煙草葉片,48 h后在激光共聚焦顯微鏡下觀察葉片中熒光蛋白的位置。
1.2.4 Y2H驗(yàn)證ShPR10與SCSMV P1的互作 以ShPR10?18T質(zhì)粒為模板,ShPR10?JT?F和ShPR10?JT?R(表1)為引物擴(kuò)增ShPR10基因。按照Nimble Cloning試劑盒說明將ShPR10基因連接到pNC?GADT7載體上,獲得獵物質(zhì)粒pNC?GADT7?ShPR10。將獵物質(zhì)粒pNC?GADT7?ShPR10與課題組保存的誘餌質(zhì)粒pGBKT7?P1共同轉(zhuǎn)化Y2H Gold酵母菌株,轉(zhuǎn)化產(chǎn)物涂布于SD/?Trp/?Leu平板上,28℃培養(yǎng)至長出單菌落。挑取單菌落于SD/?Trp/?Leu液體培養(yǎng)基中培養(yǎng)至OD600值為1.0,用ddH2O將菌液進(jìn)行10倍系列稀釋,取4 μL分別點(diǎn)到SD/?Trp/?Leu和SD/?Trp/?Leu/?His/?Ade/X-α-Gal平板上,3-5 d后觀察菌落生長情況。以pGBKT7?53 和 pGADT7?T 組合為陽性對照,pGBKT7?Lam 和pGADT7?T 組合為陰性對照,pGBKT7 和pNC?GADT7?ShPR10組合、pGBKT7?P1和pNC?GADT7 組合為自激活驗(yàn)證。
1.2.5 BiFC驗(yàn)證ShPR10與SCSMV P1的互作 以P1?18T質(zhì)粒為模板,P1?JT?F和P1?JT?R(表1)為引物擴(kuò)增P1基因。以ShPR10?18T質(zhì)粒為模板,ShPR10?JT?F和ShPR10?JT?R1(表1)為引物擴(kuò)增ShPR10基因。參照Nimble Cloning試劑盒說明將ShPR10和P1基因分別連接到pNC?BiFC?Ecn和pNC?BiFC?Enn載體上,獲得重組質(zhì)粒pNC?BiFC?Ecn?ShPR10和pNC?BiFC?Enn?P1。將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)入GV3101農(nóng)桿菌,參照朱海龍等[18]的方法將含有pNC?BiFC?Ecn?ShPR10和pNC?BiFC?Enn?P1的農(nóng)桿菌等比例混合后注射本氏煙草葉片,48 h后在激光共聚焦顯微鏡下觀察拍照。以pNC?BiFC?Ecn和pNC?BiFC?Enn?P1組合、pNC?BiFC?Ecn?ShPR10和pNC?BiFC?Enn組合為對照。
1.2.6 ShPR10對SCSMV P1沉默抑制子活性的影響 以P1?18T質(zhì)粒為模板,P1?JT?F和P1?JT?R1(表1)為引物擴(kuò)增P1基因。以ShPR10?18T質(zhì)粒為模板,ShPR10?JT?F和ShPR10?JT?R(表1)為引物擴(kuò)增ShPR10基因。按照Nimble Cloning試劑盒說明將P1和ShPR10基因分別連接到植物表達(dá)載體pNC?Cam33FN(帶Flag標(biāo)簽)和pNC?Cam33HN(帶HA標(biāo)簽),獲得重組質(zhì)粒pNC?Cam33FN?P1和pNC?Cam33HN?ShPR10。將pNC?Cam33FN?P1、pNC?Cam33HN?ShPR10和課題組保存的pCam3304?35S?GFP質(zhì)粒分別轉(zhuǎn)化GV3101農(nóng)桿菌。參考Chen等[19]方法將攜帶pCam3304?35S?GFP、pNC?Cam33FN?P1和pNC?Cam33HN?ShPR10質(zhì)粒的3種農(nóng)桿菌等比例混合后注射本氏煙草葉片,以攜帶pCam3304?35S?GFP、pNC?Cam33FN?P1和pNC?Cam33HN空質(zhì)粒的3種農(nóng)桿菌混合注射為對照。此外,為了說明ShPR10本身不具有沉默抑制子的活性,將攜帶pCam3304?35S?GFP、pNC?Cam33HN?ShPR10和pNC?Cam33FN空質(zhì)粒的3種農(nóng)桿菌混合注射煙草葉片。注射4 d后,在長波紫外燈下觀察注射區(qū)域GFP的熒光強(qiáng)度并采用數(shù)碼相機(jī)拍照記錄。在紫外燈下剪下注射區(qū)域的煙草葉片,參考Chen等[19]方法進(jìn)行總蛋白提取和Western blot檢測GFP、P1和ShPR10蛋白的表達(dá)水平,使用Image J軟件對蛋白條帶進(jìn)行定量分析。
以甘蔗ROC22葉片cDNA為模板,ShPR10?F和ShPR10?R為引物進(jìn)行擴(kuò)增,獲得一條600 bp左右的條帶(圖1?A),與預(yù)期大小相符?;厥赵摋l帶將其連接至T載體并送測序。結(jié)果(圖1?B)顯示,克隆獲得甘蔗ShPR10基因的完整ORF,其長度為570 bp,編碼189個氨基酸,其氨基酸序列中含有以“GxGGxG”為特征的P?loop基序。
ProtParam分析表明,ShPR10的分子量為21.17 kD,等電點(diǎn)為4.77,為酸性蛋白;不穩(wěn)定系數(shù)為70.86,為不穩(wěn)定蛋白;脂溶指數(shù)為48.47,總平均親水性是?0.93,可能是親水性蛋白。NPSA?PRABI預(yù)測表明(圖2),ShPR10中無規(guī)則卷曲占比為51.85%,α-螺旋占比為35.98%,延伸鏈占比為7.41%,β-轉(zhuǎn)角占比為4.76%。TMHMM 2.0分析表明(圖3),ShPR10蛋白無跨膜結(jié)構(gòu)域。SignalP 5.0分析表明(圖4),ShPR10蛋白不含信號肽,是非分泌蛋白。
圖2 ShPR10蛋白二級結(jié)構(gòu)預(yù)測Fig. 2 Secondary structure prediction of ShPR10 protein
圖3 ShPR10蛋白跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測Fig. 3 Transmembrane structure prediction of ShPR10 protein
圖4 ShPR10蛋白信號肽預(yù)測Fig. 4 Signal peptide prediction of ShPR10 protein
氨基酸序列同源比對分析結(jié)果(圖5)顯示,甘蔗ShPR10與玉米ZmPR10、柳枝稷(Panicum virgatum)PvPR10、普通小麥(Triticum aestivum)TaPR10、光稃稻(Oryza glaberrima)OgPR10、短花稻(Oryza brachyantha)ObPR10、多年生黑麥草(Lolium perenne)LpPR10、烏拉爾圖小麥(Triti?cum urartu)TuPR10、硬直黑麥草(Lolium rigidum)LrPR10和野生二粒小麥TdPR10的氨基酸序列具有較高相似度,分別為91.53%、82.01%、76.56%、76.50%、76.17%、75.92%、75.52%、75.13%和72.40%。為進(jìn)一步分析甘蔗ShPR10蛋白與其他物種PR10蛋白的進(jìn)化關(guān)系,使用MEGA 11.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,結(jié)果(圖6)表明,甘蔗ShPR10蛋白與玉米ZmPR10的親緣關(guān)系最近。
圖5 甘蔗ShPR10與其他物種PR10的氨基酸序列比對Fig. 5 Amino acid sequence alignment between ShPR10 protein from sugarcane and PR10 from other species
圖6 甘蔗ShPR10與其他物種PR10蛋白的系統(tǒng)進(jìn)化樹分析Fig. 6 Phylogenetic tree analysis of ShPR10 protein from sugarcane and PR10 proteins from other species
將GFP基因融合在ShPR10基因的5′端,成功構(gòu)建亞細(xì)胞定位載體pBWA(V)HS?GFP?ShPR10。將該載體通過農(nóng)桿菌介導(dǎo)侵染煙草表皮細(xì)胞,在激光共聚焦顯微鏡下觀察GFP?ShPR10融合蛋白的綠色熒光在煙草細(xì)胞內(nèi)的分布情況。結(jié)果(圖7)顯示,綠色熒光主要分布在細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核,表明ShPR10主要定位于細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核。
圖7 ShPR10在本氏煙草表皮細(xì)胞中的定位Fig. 7 Localization of ShPR10 in N. benthamiana epidermal cells
Y2H試驗(yàn)結(jié)果顯示(圖8),所有組合在SD/?Trp/?Leu培養(yǎng)基上正常生長,表明所有組合均成功轉(zhuǎn)化酵母菌。轉(zhuǎn)入pGBKT7和pNC?GADT7?ShPR10組合、pGBKT7?P1 和pNC?GADT7組合的酵母菌與陰性對照組(pGBKT7?Lam和 pGADT7?T組合)一樣,在SD/?Trp/?Leu/?His/?Ade/X-α-Gal培養(yǎng)基上不生長,表明pNC?GADT7?ShPR10和pGBKT7?P1質(zhì)粒無自激活活性。轉(zhuǎn)入pGBKT7?P1和pNC?GADT7?ShPR10組合的酵母菌和陽性對照(pGBKT7?53和 pGADT7?T組合)一樣在SD/?Trp/?Leu/?His/?Ade/X-α-Gal培養(yǎng)基上長出藍(lán)色菌落,表明ShPR10在酵母細(xì)胞中與P1互作。
圖8 Y2H驗(yàn)證ShPR10與SCSMV P1的互作Fig. 8 Verification of the interaction between ShPR10 and SCSMV P1 by Y2H assay
BiFC試驗(yàn)結(jié)果顯示(圖9),含pNC?BiFC?Ecn?ShPR10和pNC?BiFC?Enn?P1質(zhì)粒的農(nóng)桿菌共注射煙草,在煙草細(xì)胞中產(chǎn)生綠色熒光信號,而陰性對照組(pNC?BiFC?Ecn和pNC?BiFC?Enn?P1組合、pNC?BiFC?Ecn?ShPR10和pNC?BiFC?Enn組合)無熒光信號。以上結(jié)果表明ShPR10和P1在煙草細(xì)胞中互作。
圖9 BiFC驗(yàn)證ShPR10與SCSMV P1的互作Fig. 9 Verification of the interaction between ShPR10 and SCSMV P1 by BiFC assay
為了分析ShPR10對P1沉默抑制子活性的影響,將攜帶pCam3304?35S?GFP、pNC?Cam33FN?P1和pNC?Cam33HN?ShPR10質(zhì)粒的3種農(nóng)桿菌混合后共注射本氏煙草葉片,以攜帶pCam3304?35S?GFP、pNC?Cam33FN?P1和pNC?Cam33HN空質(zhì)粒的3種農(nóng)桿菌共注射為對照,注射4 d后在紫外燈下觀察GFP熒光強(qiáng)度。結(jié)果顯示,對照組注射區(qū)域表現(xiàn)出很強(qiáng)的GFP熒光(圖10?A,右下),證明P1具有沉默抑制子活性,而pCam3304?35S?GFP、pNC?Cam33FN?P1和pNC?Cam33HN?ShPR10共注射區(qū)域的GFP熒光強(qiáng)度明顯減弱(圖10?A,左下),表明ShPR10削弱了P1的沉默抑制子活性。此外,為了說明ShPR10本身不具有沉默抑制子活性,將攜帶pCam3304?35S?GFP、pNC?Cam33HN?ShPR10和pNC?Cam33FN空質(zhì)粒的3種農(nóng)桿菌共注射煙草葉片,結(jié)果觀察到非常微弱的GFP熒光(圖10?A,上中),說明ShPR10不具有沉默抑制子活性。
圖10 ShPR10對SCSMV P1沉默抑制子活性的影響Fig. 10 Effect of ShPR10 on the activity of SCSMV P1 silencing suppressor
Western blot檢測注射區(qū)域的蛋白水平(圖10?B)顯示,pCam3304?35S?GFP、pNC?Cam33FN?P1和pNC?Cam33HN?ShPR10共注射區(qū)域的GFP蛋白水平低于對照組,這與圖10?A中該區(qū)域的GFP熒光強(qiáng)度弱于對照組的結(jié)果相一致。Flag抗體檢測P1蛋白水平,結(jié)果顯示該區(qū)域中P1的蛋白水平與對照組相比無明顯差異。HA抗體檢測ShPR10蛋白水平,結(jié)果顯示該區(qū)域ShPR10正常表達(dá)。以上結(jié)果說明,ShPR10的表達(dá)削弱了P1的沉默抑制子活性,但對P1蛋白的含量無明顯影響。
PR10蛋白具有分子量在17-22 kD、等電點(diǎn)呈酸性、不含信號肽、定位于胞內(nèi)等特征[3,20]。本研究克隆獲得的甘蔗ShPR10基因,其編碼蛋白分子量為21.17 kD,等電點(diǎn)為4.77,無信號肽,定位于細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核,符合PR10的基本特征。大部分PR10蛋白含有一個以“GxGGxG”為序列特征的P?loop基序,該基序與核酸酶活性密切相關(guān)[1]。從草莓(Fragaria ananassa)[21]、辣椒[4]、葡萄(Vitis vini?fera L.)[22]、玉米[23]、花生(Arachis hypogaea L.)[24]、牛茄子(Solanum surattense)[25]、麻風(fēng)樹(Jatropha curcas)[26]和可可樹(Theobroma cacao)[27]中分離到的PR10蛋白都具有一個P?loop基序,體外實(shí)驗(yàn)也都證實(shí)這些PR10蛋白具有核酸酶活性。PR10的核酸酶活性對于植物抵御病原微生物入侵至關(guān)重要。辣椒CaPR10具有核酸酶活性,能對入侵的病毒RNA進(jìn)行切割,從而起到抗病毒的作用[4]。可可樹利用其編碼蛋白TcPR10的核酸酶活性降解可可叢枝病菌(Moniliophthora perniciosa)的RNA,從而發(fā)揮抗菌作用[27]?;ㄉ鶤hPR10具有核酸酶活性,能抑制尖孢鐮刀菌(Fusarium oxysporum)和立枯絲核菌(Rhizoctonia solani)的生長,將AhPR10的第54位氨基酸由賴氨酸突變成天冬酰胺后,AhPR10的核酸酶活性和抗菌作用均消失,表明AhPR10的核酸酶活性對其抗菌作用至關(guān)重要[24]。本研究從甘蔗中克隆獲得的ShPR10基因,其編碼蛋白含有一個P?loop基序,推測該蛋白具有核酸酶活性,可能在甘蔗抵抗病原微生物入侵過程中發(fā)揮作用。
PR10蛋白家族成員眾多,在亞細(xì)胞水平的分布也多種多樣[3]。例如,辣椒[28]、玉米[23]和大豆(Glycine max)[29]編碼的PR10蛋白定位在細(xì)胞質(zhì)中;楊樹(Populus simonii×P. nigra)[30]和剛毛檉柳(Tamarix hispida)[31]編碼的PR10蛋白定位在細(xì)胞核上;人參(Panax ginseng C. A. Meyer)編碼的PgPR10?1蛋白在細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核中均有分布[32];葡萄編碼的VpPR10.2蛋白主要分布在細(xì)胞壁、細(xì)胞質(zhì)和葉綠體,在細(xì)胞核中也有少量分布[22];花旗松(Pseudotsuga menziesii)編碼的DF?PR10蛋白定位在細(xì)胞壁和細(xì)胞質(zhì)中[33];罌粟(Papaver somniferum)編碼的PR10蛋白Ps?NCS2定位在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上[34]。本研究對甘蔗ShPR10蛋白進(jìn)行亞細(xì)胞定位分析,結(jié)果顯示ShPR10定位在細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核中,與人參PgPR10?1蛋白的亞細(xì)胞定位相同。蛋白的功能與其所在的亞細(xì)胞位置密切相關(guān),相同亞細(xì)胞定位的PR10蛋白可能行使相似的生物學(xué)功能。人參PgPR10?1蛋白能增強(qiáng)植株對假單胞菌(Pseudomonas syringae)、尖孢鐮刀菌和貴腐霉菌(Botrytis cinerea)的抗性[32],由此推測甘蔗ShPR10蛋白可能也具有抗菌活性。
RNA沉默是植物抵抗病毒侵染的重要機(jī)制[35]。為了對抗這一機(jī)制,病毒進(jìn)化出RNA沉默抑制子來干擾植物的RNA沉默[36]。而植物又可通過其編碼蛋白與病毒RNA沉默抑制子相互作用,削弱抑制子的沉默抑制活性,進(jìn)而增強(qiáng)植株對病毒的抗性[19,37-38]。例如,玉米編碼的紫黃質(zhì)脫環(huán)氧化酶ZmVDE與甘蔗花葉病毒(Sugarcane mosaic virus,SCMV)編碼的HC?Pro抑制子互作并削弱HC?Pro的抑制子活性,從而減少SCMV在植物體內(nèi)的積累[19];煙草編碼的鈣調(diào)素樣蛋白rgs?CaM與多種病毒編碼的RNA沉默抑制子的dsRNA結(jié)合區(qū)域結(jié)合,并通過自噬樣蛋白降解途徑降解RNA沉默抑制子,從而削弱RNA沉默抑制子的活性,增強(qiáng)寄主對病毒的抗性[37];甜橙(Citrus sinensis)編碼的脫水素蛋白CtCOR15與柑橘衰退病毒(Citrus tristeza virus,CTV)編碼的p20抑制子互作,CtCOR15蛋白的表達(dá)削弱了p20的沉默抑制活性[38]。本課題組前期以SCSMV編碼的RNA沉默抑制子P1為誘餌,從甘蔗cDNA文庫中篩選獲得一個與P1互作的甘蔗ShPR10蛋白[15]。本研究利用Y2H和BiFC技術(shù)進(jìn)一步證實(shí)了P1和ShPR10的互作關(guān)系。此外,本研究還分析了ShPR10對P1沉默抑制活性的影響,結(jié)果顯示ShPR10的表達(dá)削弱了P1的沉默抑制活性,但對P1蛋白的含量無明顯影響,表明ShPR10不是通過改變P1蛋白的含量來影響P1的沉默抑制活性。RNA沉默抑制子可以通過結(jié)合siRNA、dsRNA和RNA沉默通路上的關(guān)鍵蛋白來發(fā)揮其抑制作用,ShPR10與P1的互作可能阻礙了P1與siRNA、dsRNA和RNA沉默通路蛋白的結(jié)合,從而削弱P1的沉默抑制活性[39]。
從甘蔗葉片中克隆獲得ShPR10基因的完整ORF,其編碼蛋白含有一個P?loop基序,分子量為21.17 kD,等電點(diǎn)為4.77,無信號肽和跨膜結(jié)構(gòu)域,定位在細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核。ShPR10與SCSMV編碼的P1蛋白互作,ShPR10的表達(dá)削弱了P1的沉默抑制子活性,但對P1蛋白的含量無明顯影響。