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        N端非催化結(jié)構(gòu)域?qū)ξ⑴菥鶤LW1褐藻膠裂解酶AlgL7酶學(xué)性質(zhì)的影響

        2023-09-13 02:52:38黃小藝李鶴賓陳艷紅姜澤東李清彪朱艷冰
        食品科學(xué) 2023年16期
        關(guān)鍵詞:褐藻海藻催化活性

        黃小藝,李鶴賓,陳艷紅,3,4,姜澤東,3,4,倪 輝,3,4,李清彪,3,4,朱艷冰,3,4,

        (1.集美大學(xué)海洋食品與生物工程學(xué)院,福建 廈門 361021;2.廈門醫(yī)學(xué)院藥學(xué)系,福建 廈門 361023;3.福建省食品微生物與酶工程重點實驗室,福建 廈門 361021;4.廈門市食品生物工程技術(shù)研究中心,福建 廈門 361021)

        褐藻是一種廣泛分布在海洋生態(tài)系統(tǒng)中的大型藻類。褐藻膠是褐藻細(xì)胞壁中一種主要的線性多糖,占褐藻干質(zhì)量的40%[1]。褐藻膠由D-甘露糖醛酸(β-Dmannuronic acid,M)和L-古羅糖醛酸(α-L-guluronic acid,G)通過1,4-糖苷鍵連接形成[2]。研究發(fā)現(xiàn),褐藻膠降解成褐藻膠寡糖后,生物利用性和生物活性顯著提高,包括抗凋亡、抗腫瘤、免疫調(diào)節(jié)、抗炎、抗菌和抗氧化等[3]。利用酶法制備褐藻膠寡糖具有反應(yīng)特異性高、反應(yīng)條件溫和、降低環(huán)境污染等優(yōu)點,在褐藻膠寡糖的制備中更具有優(yōu)勢[4]。

        褐藻膠裂解酶通過β-消除機制作用于褐藻膠的1,4-糖苷鍵,最終在產(chǎn)物末端六元環(huán)C4和C5位生成不飽和雙鍵,產(chǎn)生非還原端不飽和的褐藻膠寡糖[5-6]。褐藻膠裂解酶來源廣泛,包括細(xì)菌、真菌、病毒和軟體動物[5]。根據(jù)一級結(jié)構(gòu)差異,褐藻膠裂解酶可分為15 個多糖裂解酶家族;根據(jù)裂解方式不同,可分為內(nèi)切型和外切型褐藻膠裂解酶;根據(jù)底物特異性,可分為D-聚甘露糖醛酸鈉(polyM)偏好型、L-聚古羅糖醛酸鈉(polyG)偏好型和雙功能型褐藻膠裂解酶[7]。褐藻膠裂解酶的酶學(xué)性質(zhì)與其來源生物體和生存環(huán)境有一定關(guān)系[1],非催化結(jié)構(gòu)域可能影響褐藻膠裂解酶的催化性質(zhì)[2,8]。與其他多糖裂解酶一樣,褐藻膠裂解酶是一種包含催化和非催化多結(jié)構(gòu)域的裂解酶。褐藻膠裂解酶常見的非催化結(jié)構(gòu)域包括碳水化合物結(jié)合模塊(carbohydrate-binding module,CBM)[9-10]和F5/8 C型結(jié)構(gòu)域。通常來說,催化結(jié)構(gòu)域在識別、結(jié)合、降解底物方面扮演重要角色[11],而非催化模塊影響酶的生化特性[12]。

        大多數(shù)褐藻酸裂解酶的活性和穩(wěn)定性較低[13],限制了該酶的廣泛應(yīng)用。褐藻膠裂解酶非催化結(jié)構(gòu)域的截短或重組可能改良酶催化性質(zhì)[7,14-16]。研究組前期從腐爛的海帶中分離得到海洋微泡菌ALW1(Microbulbifersp.ALW1)[17],基因組分析發(fā)現(xiàn)含有1 個預(yù)測為PL7家族的褐藻膠裂解酶AlgL7的編碼基因,該酶包含2 個非催化模塊CBM和F5/8 C型結(jié)構(gòu)域。為了解該酶非催化結(jié)構(gòu)域的功能,通過基因截短、蛋白質(zhì)表達(dá)和純化,研究非催化模塊對褐藻膠裂解酶AlgL7酶學(xué)性質(zhì)的影響,旨在解析該酶非催化結(jié)構(gòu)域與酶性質(zhì)的構(gòu)效關(guān)系,為酶的實踐應(yīng)用提供一定理論基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 材料與試劑

        微泡菌ALW1、大腸桿菌BL21(DE3)為本實驗室保存。

        海藻酸鈉、polyM、polyG 國藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司;EcoRI、BamHI、XhoI、T4DNA連接酶日本TaKaRa公司;細(xì)菌基因組提取試劑盒 天根生化科技(北京)有限公司;異丙基-β-D-硫代半乳糖苷(isopropyl-β-D-thiogalactoside,IPTG)、卡那霉素生工生物工程(上海)股份有限公司;3,5-二硝基水楊酸(3,5-dinitrosalicylic acid,DNS)試劑、2,2-聯(lián)喹啉-4,4-二甲酸二鈉(bicinchoninic acid kit,BCA)試劑盒廈門市淘爍生物科技有限公司;Ni Sepharose 6 Fast Flow美國GE Healthcare Life Sciences公司;其他化學(xué)試劑均為分析純產(chǎn)品。

        1.2 儀器與設(shè)備

        Sorvall LYNX 4000高速冷凍離心機 美國賽默飛世爾科技有限公司;恒溫振蕩搖床 上海智城分析儀器制造有限公司;水浴鍋 冠森生物科技有限公司;Epoch2T微量酶標(biāo)儀 美國伯騰儀器有限公司;聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)基因擴增儀伯樂生命醫(yī)學(xué)產(chǎn)品有限公司;鼓風(fēng)干燥箱 深圳市愛特爾電子科技有限公司;核酸電泳儀 美國GE Healthcare Life Sciences公司。

        1.3 方法

        1.3.1 褐藻膠裂解酶AlgL7的生物信息學(xué)分析

        利用ExPAsy網(wǎng)站中ProtParam工具對褐藻膠裂解酶AlgL7的氨基酸組成、理論分子質(zhì)量和等電點等理化性質(zhì)進(jìn)行預(yù)測。使用Clustal X2進(jìn)行多序列比對,MEGA 11.0軟件構(gòu)建褐藻膠裂解酶AlgL7的系統(tǒng)發(fā)育樹。利用NCBI的保守結(jié)構(gòu)域模塊進(jìn)行蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)域分析。

        1.3.2 褐藻膠裂解酶AlgL7及其截短體基因工程菌株構(gòu)建

        參照細(xì)菌基因組提取試劑盒方法提取菌株ALW1的基因組DNA,以該基因組為模板,基于AlgL7保守結(jié)構(gòu)域的預(yù)測結(jié)果,利用PCR分別擴增褐藻膠裂解酶AlgL7及其截短體(包括CD1和CD2)基因,引物序列如表1所示。獲得PCR產(chǎn)物后,CD1基因利用限制性內(nèi)切酶BamHI和XhoI進(jìn)行酶切,AlgL7和CD2基因利用EcoRI和XhoI進(jìn)行酶切,然后利用T4DNA連接酶分別將目的基因連接到pET-28a載體后,轉(zhuǎn)化至大腸桿菌BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞。利用含卡那霉素的平板篩選和菌落PCR鑒定后,重組質(zhì)粒送至廈門鉑瑞生物科技有限公司測序。

        表1 用于擴增AlgL7及其截短體的引物Table 1 Primers used for the amplification of AlgL7 and its truncations

        1.3.3 褐藻膠裂解酶AlgL7及其截短體的表達(dá)與純化

        將測序成功的褐藻膠裂解酶AlgL 7 及其截短體基因工程菌株按1%接種量接種至LB液體培養(yǎng)基(含50 μg/mL卡那霉素),37 ℃、180 r/min過夜培養(yǎng),當(dāng)OD600nm值達(dá)到0.6~0.8后加入IPTG(終濃度0.1 mmol/L),16 ℃誘導(dǎo)表達(dá)18~24 h。將發(fā)酵液4 ℃、5000×g離心10 min,棄上清液,加入緩沖液(50 mmol/L NaH2PO4、300 mmol/L NaCl、30 mmol/L咪唑,pH 8.0)懸浮菌體,在冰浴條件下進(jìn)行超聲破碎,條件為超聲5 s、間隙5 s,總時間15 min,功率300 W。將處理液4 ℃、12000×g離心20 min,得到粗酶液。參照Ni Sepharose 6 Fast Flow使用說明書,利用親和層析對重組酶進(jìn)行分離純化。利用十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳(sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis,SDS-PAGE)分析目的蛋白的純度和分子質(zhì)量,利用BCA試劑盒進(jìn)行蛋白質(zhì)定量。

        1.3.4 褐藻膠裂解酶活力的測定

        采用DNS法[18]。反應(yīng)體系為5 μL酶液(0.11 mg/mL)加入200 μL 5 mg/mL海藻酸鈉底物溶液(溶于50 mmol/L磷酸氫二鈉-磷酸二氫鈉緩沖液,pH 7.0),在最適溫度下溫浴15 min后,加入200 μL DNS試劑,沸水浴10 min,冷卻至室溫后,利用酶標(biāo)儀在波長540 nm測定吸光度。褐藻膠裂解酶的活力定義為:在一定條件下,每分鐘生成1 μmoL還原糖所需的酶量為1 個酶活力單位(U)。

        1.3.5 褐藻膠裂解酶AlgL7及其截短體的底物特異性

        分別配制質(zhì)量濃度為5 mg/mL海藻酸鈉、polyM、polyG溶液測定重組酶的活力,研究褐藻膠裂解酶AlgL7及其截短體的底物特異性。不同的底物與酶在最適溫度下孵育15 min后,利用DNS法測定酶活力。

        1.3.6 溫度對褐藻膠裂解酶AlgL7及其截短體活性和穩(wěn)定性的影響

        在不同溫度(20~60 ℃)下分別測定褐藻膠裂解酶AlgL7及其截短體的活力,研究酶的最適反應(yīng)溫度。分別將褐藻膠裂解酶AlgL7及其截短體在不同溫度(20~40 ℃)下放置15 min后,立即置于冰浴5 min,測定酶的殘余活力,研究酶的溫度穩(wěn)定性,以未經(jīng)熱處理的酶活力為100%。

        1.3.7 pH值對褐藻膠裂解酶AlgL7及其截短體活性和穩(wěn)定性的影響

        在不同pH值條件下分別測定褐藻膠裂解酶AlgL7及其截短體的活力,研究酶的最適反應(yīng)pH值。分別將褐藻膠裂解酶AlgL7及其截短體在不同pH值條件下25 ℃處理30 min后,測定酶的殘余活力,研究酶的pH值穩(wěn)定性,以未經(jīng)處理的酶活力為100%。所用緩沖液為50 mmol/L檸檬酸-Na2HPO4緩沖液(pH 3.0~6.0)、NaH2PO4-Na2HPO4緩沖液(pH 6.0~8.0)、Tris-HCl緩沖液(pH 8.0~9.0)和甘氨酸-NaOH緩沖液(pH 9.0~11.0)。

        1.3.8 褐藻膠裂解酶AlgL7及其截短體的動力學(xué)參數(shù)測定

        在不同海藻酸鈉底物質(zhì)量濃度(0.5~5 mg/mL)下測定褐藻膠裂解酶AlgL7及其截短體的活力,利用Lineweaver-Burk雙倒數(shù)作圖法,計算酶的米氏親和常數(shù)(Km)和最大反應(yīng)速率(Vmax)。

        1.3.9 褐藻膠裂解酶AlgL7及其截短體的酶解產(chǎn)物鑒定

        50 mL 5 mg/mL海藻酸鈉、polyG和polyM不同底物溶液中分別加入3 U褐藻膠裂解酶,于30 ℃條件下反應(yīng),每小時取樣一次,利用DNS法測定還原糖的釋放量;孵育8 h后,向反應(yīng)混合液中添加3 U褐藻膠裂解酶,繼續(xù)反應(yīng)9 h,還原糖的釋放量不再發(fā)生變化時,將反應(yīng)物沸水浴滅活10 min,4 ℃、11100×g離心20 min,收集上清液。加入3 倍體積無水乙醇,4 ℃靜置2 h后,4 ℃、18000×g離心20 min,取上清液,凍干得到褐藻膠寡糖產(chǎn)物。參照Li Zhipeng等[19]報道的液相色譜-質(zhì)譜方法鑒定酶解產(chǎn)物。

        1.4 數(shù)據(jù)處理

        2 結(jié)果與分析

        2.1 褐藻膠裂解酶AlgL7的序列分析

        微泡菌ALW1的褐藻膠裂解酶AlgL7基因(GenBank收錄號OM831233)有1893 個堿基對,預(yù)測編碼630 個氨基酸殘基的蛋白質(zhì),理論等電點(pI)為4.40,理論分子質(zhì)量為71.5 kDa。系統(tǒng)發(fā)育分析顯示,AlgL7與來自PL7家族的褐藻膠裂解酶處于同一分支(圖1a),表明該褐藻膠裂解酶屬于PL7家族。保守結(jié)構(gòu)域分析顯示,AlgL7含有CBM結(jié)構(gòu)域(Ile55~Tyr158)、F5/8 C型結(jié)構(gòu)域(Ala202~Val322)和C端催化結(jié)構(gòu)域(Phe364~His630)(圖1b)。C端催化結(jié)構(gòu)域命名為CD1,包含F(xiàn)5/8 C型結(jié)構(gòu)域和C端催化結(jié)構(gòu)域的截短酶命名為CD2(圖1b)。此外,序列比對確定了微泡菌ALW1來源的AlgL7中含有QIH(Gln497~His499)、RTELREMLR(Arg428~Arg436)和YFKAG(Tyr600~Gly604)3 個保守區(qū)域,推測它們與促進(jìn)底物識別和酶功能有關(guān)[20]。

        圖1 褐藻膠裂解酶AlgL7的系統(tǒng)發(fā)育(a)和結(jié)構(gòu)域(b)分析Fig.1 Phylogenetic analysis (a) and domain analysis (b) of alginate lyase AlgL7

        2.2 褐藻膠裂解酶AlgL7及其截短體的表達(dá)與純化

        成功構(gòu)建了AlgL7、截短體CD1和CD2的基因工程菌株,利用IPTG進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá)后,進(jìn)行重組蛋白的純化,SDS-PAGE分析顯示,目的蛋白成功純化,AlgL7、CD1和CD2的分子質(zhì)量分別約為71.5、32.0 kDa和60.0 kDa(圖2a),與蛋白質(zhì)的理論分子質(zhì)量吻合。酶活力分析結(jié)果表明,以海藻酸鈉為底物,AlgL7、CD1和CD2的比活力分別為125.1、125.9 U/mg和183.9 U/mg(圖2b)。AlgL7和CD2的酶活力相比,CBM結(jié)構(gòu)域截短會顯著增強酶的催化活性,CD2是AlgL7全長酶活力的1.47 倍,來自Vibrio natriegensSK42.001褐藻膠裂解酶Aly01FL的CBM截短體也顯示出類似酶活力增強的現(xiàn)象[21],來自Marinimicrobiumsp.H1褐藻膠裂解酶AlgH-I的CBM截短體顯示出酶活力降低的影響結(jié)果[16]。CD1和CD2酶活力相比,F(xiàn)5/8 C型結(jié)構(gòu)域截短會降低酶的催化活性,F(xiàn)lammeovirgasp.MY04來源褐藻膠裂解酶Aly5的F5/8 C截短體對海藻酸鈉的酶活力也低于野生型酶[22],說明F5/8 C型結(jié)構(gòu)域在維持酶活力方面具有重要作用。催化活性是酶應(yīng)用的一個重要指標(biāo),高活性褐藻膠裂解酶在工業(yè)上具有更大的應(yīng)用價值。

        圖2 褐藻膠裂解酶AlgL7及其截短體的SDS-PAGE(a)和酶活力(b)分析Fig.2 SDS-PAGE (a) and enzymatic activity (b) analysis of alginate lyase AlgL7 and its truncations

        2.3 褐藻膠裂解酶AlgL7及其截短體的底物特異性

        利用海藻酸鈉、polyM和polyG 3 種多糖作為底物進(jìn)行酶的底物特異性研究。如圖3所示,AlgL7、CD1和CD2對海藻酸鈉、polyM和polyG 3 種底物均有活性,說明非催化結(jié)構(gòu)域CBM和F5/8 C型結(jié)構(gòu)域未影響酶的底物特異性,它們對底物的催化活性不是必需,這與Yan Junjun等[16]報道的結(jié)果類似,底物特異性并沒有因為刪除CBM和F5/8 C型結(jié)構(gòu)域而發(fā)生變化。另外,與AlgL7相比,CD2對ployG的酶活力顯著提高,CD1和CD2對polyM的酶活力顯著降低,CD2對海藻酸鈉的酶活力顯著提高,說明非催化結(jié)構(gòu)域CBM和F5/8 C型結(jié)構(gòu)域影響了酶對不同底物的催化活性。

        圖3 褐藻膠裂解酶AlgL7及其截短體的底物特異性Fig.3 Substrate specificity of alginate lyase AlgL7 and its truncations

        CBM為碳水化合物活性酶內(nèi)的連續(xù)氨基酸序列,大多數(shù)獨立形成β-三明治形狀的折疊區(qū),參與酶與底物的結(jié)合與識別,以及產(chǎn)物的釋放[23-24]。與本研究結(jié)果不同,來自Agarivoranssp.L11褐藻膠裂解酶AlyL2的CBM13使該酶易于降解M-block底物[25]。與本研究結(jié)果類似,來源于Vibrio natriegensSK42.001褐藻膠裂解酶Aly01FL的CBM模塊缺失導(dǎo)致酶對PolyM催化活性降低[21]。本研究中,去除CBM結(jié)構(gòu)域的CD1和CD2截短酶對polyM酶活力顯著降低(圖3),說明非催化結(jié)構(gòu)域CBM可能影響了AlgL7對PolyM底物的結(jié)合與識別。據(jù)報道,PL7家族褐藻膠裂解酶的底物特異性與保守區(qū)的蛋白質(zhì)序列有關(guān)[26]。PL7家族的褐藻膠裂解酶包含3 個高度保守的區(qū)域(R/E)(S/T/N)EL、Q(I/V)H和YFKAG(V/I)YNQ,這些保守區(qū)域形成了β-三明治形狀的空腔結(jié)合底物。本研究中,褐藻膠裂解酶AlgL7包含QIH保守結(jié)構(gòu)域,是一個對polyM和polyG都起作用的雙功能褐藻膠裂解酶。

        F5/8 C型結(jié)構(gòu)域被稱為discoidin(DS)結(jié)構(gòu)域,它可以通過增強酶與底物的相互作用能提高糖苷水解酶的水解活性[27]。本研究中,與CD2相比,去除F5/8 C型結(jié)構(gòu)域的CD1截短酶對PolyG和海藻酸鈉的酶活力顯著降低(圖3),說明F5/8 C型結(jié)構(gòu)域可能影響了AlgL7對PolyG底物的相互作用。

        2.4 溫度對AlgL7及其截短體活性和穩(wěn)定性的影響

        如圖4a所示,AlgL7和CD2在40 ℃時催化活性最高,CD1的最適反應(yīng)溫度為30 ℃,說明CBM對酶的最適反應(yīng)溫度無影響,F(xiàn)5/8 C型結(jié)構(gòu)域去除降低了酶的最適反應(yīng)溫度。大部分PL7家族褐藻膠裂解酶的最適反應(yīng)溫度為30~45 ℃,例如Serratia marcescensNJ-07來源褐藻膠裂解酶AlgNJ-07[28]、Flammeovirgasp.strain MY04來源褐藻膠裂解酶Aly2[29]和Vibrio furnissiiH1來源褐藻膠裂解酶AlyH1[30]的最適反應(yīng)溫度均為40 ℃。根據(jù)Meng Qing等[21]的研究報道,移除CBM結(jié)構(gòu)域并不改變褐藻膠裂解酶Aly01的最適反應(yīng)溫度。而褐藻膠裂解酶AlyL2中,截短CBM13結(jié)構(gòu)域,酶的最適反應(yīng)溫度降低了10 ℃[25]。另外,與本研究結(jié)果類似,來自Flammeovirgasp.MY04褐藻膠裂解酶Aly5中F5/8 C型結(jié)構(gòu)域的去除降低了酶的最適反應(yīng)溫度[22],表明F5/8 C型結(jié)構(gòu)域在酶的生化特性中與酶最適反應(yīng)溫度緊密相關(guān)。

        圖4 溫度對褐藻膠裂解酶AlgL7及其截短體酶活力(a)和穩(wěn)定性(b)的影響Fig.4 Effect of temperature on the activity (a) and stability (b) of alginate lyase AlgL7 and its truncations

        如圖4b所示,相較于AlgL7,截短酶CD2的熱穩(wěn)定性顯著增強,在20~35 ℃下孵育15 min,殘余酶活力保持在45%以上,表明非催化結(jié)構(gòu)域CBM的截短提高了酶的熱穩(wěn)定性。截短褐藻膠裂解酶的非催化結(jié)構(gòu)域后,該酶可能具有緊湊的三維結(jié)構(gòu),更有利于抵抗熱變性條件[7]。與本研究結(jié)果不同,褐藻膠裂解酶AlyL2的CBM提高了酶熱穩(wěn)定性[25]。另外,在20~35 ℃范圍內(nèi),截短酶CD1的溫度穩(wěn)定性低于截短酶CD2,說明F5/8 C型結(jié)構(gòu)域的去除降低了酶的溫度穩(wěn)定性。酶的溫度穩(wěn)定性提高有利于酶的工業(yè)應(yīng)用[31]。

        2.5 pH值對AlgL7及其截短體活性和穩(wěn)定性的影響

        如圖5a所示,AlgL7及其截短體的最適反應(yīng)pH值均為7.0,說明CBM和F5/8 C型結(jié)構(gòu)域?qū)γ傅淖钸m反應(yīng)pH值無影響。褐藻膠裂解酶AlgH結(jié)構(gòu)中F5/8 C型結(jié)構(gòu)域也不改變酶的最適反應(yīng)pH值[16]。如圖5b所示,截短體CD2在pH 3.0~6.0和8.0~11.0范圍內(nèi)的pH值穩(wěn)定性高于AlgL7,表明CBM的去除提高了酶在酸性和堿性條件下穩(wěn)定性。對褐藻膠裂解酶AlyL2-FL去除C端的CBM結(jié)構(gòu)域,最適反應(yīng)pH值由8.6降低至7.0,在pH 3.0~6.0范圍內(nèi)去除CBM的截短體保留酶活力遠(yuǎn)低于原始型酶。對褐藻膠裂解酶VxAly7B去除N端的CBM結(jié)構(gòu)域,酶的最適反應(yīng)pH值提高了0.6,在pH 3.0~6.0范圍內(nèi)殘余酶活力略高于原始型酶[32]。另外,本研究中截短酶CD2相較于CD1在pH 3.0~6.0和10.0~11.0范圍內(nèi)pH值穩(wěn)定性高于CD1(圖5b),表明F5/8 C型結(jié)構(gòu)域提高了酶在酸性和堿性條件下的穩(wěn)定性。

        圖5 pH值對褐藻膠裂解酶AlgL7及其截短體酶活力(a)和穩(wěn)定性(b)的影響Fig.5 Effects of pH on the activity (a) and stability (b) of alginate lyase AlgL7 and its truncations

        2.6 褐藻膠裂解酶AlgL7及其截短體的動力學(xué)參數(shù)

        如表2所示,以海藻酸鈉為底物,AlgL7的Km和Vmax值最低,CD2的Km和Vmax值最高,表明CBM結(jié)構(gòu)域降低了酶的最大反應(yīng)速率,但提高了酶與底物之間的親和力,促進(jìn)AlgL7與海藻酸鈉的結(jié)合;F5/8 C型結(jié)構(gòu)域提高了酶的最大反應(yīng)速率,但降低了酶與底物之間的親和力。相似的研究結(jié)果出現(xiàn)在Marinimicrobiumsp.H1來源褐藻膠裂解酶AlgH中,不含CBM的截短酶Km和Vmax值增大[16]。然而,在不同褐藻膠裂解酶中,CBM表現(xiàn)出不同的影響,例如CBM32降低了褐藻膠裂解酶VxAly7B對海藻酸鈉的親和力[32]。

        表2 褐藻膠裂解酶AlgL7及其截短體對海藻酸鈉的動力學(xué)參數(shù)Table 2 Kinetic parameters of alginate lyase AlgL7 and its truncations on sodium alginate

        2.7 褐藻膠裂解酶AlgL7及其截短體的酶解產(chǎn)物分析

        利用液相色譜-質(zhì)譜分析AlgL7、CD1和CD2降解海藻酸鈉、polyG和polyM的終產(chǎn)物組成。如圖6所示,AlgL7能夠?qū)⒑T逅徕c降解生成聚合度為2、3和4的寡糖,降解polyG和polyM的主要產(chǎn)物為二糖和三糖(圖6a~c),表明AlgL7是一種內(nèi)切型褐藻膠裂解酶。CD1和CD2降解海藻酸鈉、polyM和polyG的產(chǎn)物均為二糖和三糖(圖6d~i)。上述結(jié)果表明,CBM和F5/8 C型結(jié)構(gòu)域?qū)γ附猱a(chǎn)物沒有顯著差異,表明非催化結(jié)構(gòu)域在底物降解模式中沒有發(fā)揮重要作用。

        圖6 褐藻膠裂解酶AlgL7及其截短體酶解產(chǎn)物的質(zhì)譜分析Fig.6 Mass spectra of the enzymatic hydrolysates obtained using AlgL7 and its truncations

        3 結(jié)論

        克隆表達(dá)了微泡菌ALW1來源的褐藻膠裂解酶全長酶AlgL7及其兩個截短酶CD1(催化結(jié)構(gòu)域)、CD2(包含F(xiàn)5/8 C型結(jié)構(gòu)域和催化結(jié)構(gòu)域)。酶學(xué)性質(zhì)的比較分析顯示,CBM結(jié)構(gòu)域降低了酶的催化活性、熱穩(wěn)定性和Vmax值,但提高了酶與底物的親和力;F5/8 C型結(jié)構(gòu)域提高了酶的催化活性、最適反應(yīng)溫度、熱穩(wěn)定性和Vmax值,但降低了酶與底物的親和力。截短體CD2的酶活力和熱穩(wěn)定性得到顯著提高,能降解海藻酸鈉生成聚合度低的褐藻膠寡糖二糖、三糖和四糖。本研究明確了非催化模塊CBM和F5/8 C型結(jié)構(gòu)域?qū)衷迥z裂解酶AlgL7酶學(xué)性質(zhì)的影響,獲得了具有優(yōu)良性質(zhì)的截短酶CD2,擴大該褐藻膠裂解酶的應(yīng)用范圍。

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