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        沉默lncRNA RNF185-AS1通過靶向miR-637/HMGA1抑制膠質(zhì)瘤細胞增殖和侵襲

        2022-09-21 06:34:14姜健楠嚴章煒
        關(guān)鍵詞:報告基因熒光素酶細胞系

        徐 源,楊 杰,姜健楠,嚴章煒,劉 健,向 欣

        作者單位:貴州醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院神經(jīng)外科,貴陽 550004

        膠質(zhì)瘤是發(fā)病率最高的中樞神經(jīng)系統(tǒng)惡性腫瘤,起源于神經(jīng)外胚層的腦神經(jīng)膠質(zhì)細胞[1]。膠質(zhì)瘤呈現(xiàn)多灶發(fā)展,對放療和化療不敏感,且較易復(fù)發(fā),因而膠質(zhì)瘤患者的平均生存期較短,預(yù)后很差[2]。探究膠質(zhì)瘤細胞增殖、侵襲的分子機制對臨床的分子靶向診療可能具有重要價值。長鏈非編碼RNA(lncRNA)是一類沒有蛋白編碼潛能的單鏈RNA,長度通常大于200個核苷酸[3]。研究[4]顯示,lncRNA在膠質(zhì)瘤組織中高表達或表達缺失,能夠促進或抑制膠質(zhì)瘤細胞生長、侵襲,發(fā)揮癌基因或抑癌基因作用。RNF185-AS1定位于染色體22,是近年來新明確的一個lncRNA,RNF185-AS1在肝細胞癌中表現(xiàn)為癌基因作用,沉默RNF185-AS1能夠抑制肝細胞癌的生長、轉(zhuǎn)移[5]。RNF185-AS1在膠質(zhì)瘤中的表達和作用并無相關(guān)報道。miR-637是一種抑癌基因,過表達miR-637能夠抑制骨肉瘤、肝癌、卵巢癌等腫瘤細胞的增殖、侵襲[6]。該研究采用小干擾RNA沉默膠質(zhì)瘤細胞中RNF185-AS1表達,明確其對膠質(zhì)瘤細胞生長和侵襲的調(diào)控功能,探討miR-637在此過程中的作用。

        1 材料與方法

        1.1 實驗材料人腦星型膠質(zhì)正常細胞系HEB和人膠質(zhì)瘤細胞系(SNB-19、LN382、U87MG、U251)購自美國ATCC公司。LipofectamineTM 3000和qRT-PCR試劑盒購自美國Invitrogen公司。DMEM/F12培養(yǎng)基、胎牛血清、RPMI 1640培養(yǎng)基購自美國Gibco公司。pcDNA-sh-Con對照質(zhì)粒、miR-637 mimic、pcDNA-sh-RNF185-AS1質(zhì)粒(AACAAGTCAATAATGACGGAGCCTCGAGGTTTAGGGTGGT)、miR-Con mimic、雙熒光素酶報告基因載體(野生型pGL3-WT-RNF185-AS1和突變型pGL3-MUT-RNF185-AS1)購自上海生工生物工程有限公司。Transwell小室、基質(zhì)膠、MTT試劑盒購自美國Corning公司。雙熒光素酶報告基因試劑盒購自美國Promega公司。一抗兔源HMGA1、β-Tubulin、CDK3、Vimentin、N-Cadherin購自美國BD公司,二抗羊抗兔抗體購自上海碧云天生物科技有限公司。

        1.2 生物信息學(xué)方法通過GEPIA數(shù)據(jù)庫在線分析膠質(zhì)瘤組織和癌旁組織中RNF185-AS1的表達水平。通過linc2GO數(shù)據(jù)庫在線預(yù)測RNF185-AS1的靶基因,RNF185-AS1和miR-637存在互補核苷酸序列。

        1.3 細胞培養(yǎng)及轉(zhuǎn)染采用DMEM/F12培養(yǎng)基分別培養(yǎng)HEB、U87MG、U251細胞,采用RPMI 1640培養(yǎng)基分別培養(yǎng)SNB-19、LN382細胞,均含10%胎牛血清,培養(yǎng)在37 ℃恒溫培養(yǎng)箱。本研究選取對數(shù)生長期U251細胞隨機分為:sh-Con組(轉(zhuǎn)染sh-Con對照質(zhì)粒)和sh-RNF185-AS1組(sh-RNF185-AS1質(zhì)粒),根據(jù)LipofectamineTM 3000轉(zhuǎn)染試劑使用說明書進行轉(zhuǎn)染。

        1.4 qRT-PCR檢測RNF185-AS1、miR-637和HMGA1 mRNA表達采用TRIzol法提取腦星型膠質(zhì)正常細胞系和膠質(zhì)瘤細胞系總RNA,以逆轉(zhuǎn)錄后的cDNA為模版進行qRT-PCR反應(yīng)。引物如下,RNF185-AS1上游引物為5′- GTCACATGTGGGTTT CCCCT-3′,下游引物為5′- AACTGAACAAGCAGCC CTGT-3′;U6上游引物為5′-CTCGCTTCGGCAGCA CA-3′,下游引物為5′-AACGCTTCACGAATTTGCGT-3′;miR-637上游引物為5′-ACUGGGGGCUUUCG GGCUCUGCGU-3′,下游引物為5′-GCAGAGCCCG AAAGCCCCCAGU-3′;GAPDH上游引物為5′- GGATTTGGTCGTATTGGGCG-3′,下游引物為5′- CGGTGCCATGGAATTTGCC-3′;HMGA1上游引物為5′-AGCGAAGTGCCAACACCTAAG-3′,下游引物為5′-GCCCCTTGGTTTCCTTCCT-3′。以2-ΔΔCt法計算RNF185-AS1、miR-637和HMGA1 mRNA相對表達水平,HMGA1 mRNA和RNF185-AS1以GAPDH為內(nèi)參,miR-637以U6為內(nèi)參。

        1.5 MTT法檢測U251細胞的活力分別將sh-Con組和sh-RNF185-AS1組U251細胞按照150 μl/孔(3×103個)接種到96孔板。分別于接種1、2、3、4、5 d,每孔加入5 g/L的MTT試劑15 μl。培養(yǎng)3.5 h后終止培養(yǎng),吸去上清液,加入140 μl/孔的二甲基亞砜,震蕩25 min,保證結(jié)晶物溶解。酶聯(lián)免疫檢測儀波長設(shè)定為490 nm,分別測定各孔的吸光度(A)值。

        1.6 Transwell侵襲實驗檢測U251細胞侵襲能力分別將sh-Con組和sh-RNF185-AS1組U251細胞采用不含血清的DMEM/F12培養(yǎng)基重懸,將200 μl細胞懸液(3×104個)接種到鋪有基質(zhì)膠的Transwell上室,加入600 μl含血清的DMEM/F12培養(yǎng)基至Transwell下室,常規(guī)培養(yǎng)細胞。24 h后用甲醇固定上室40 min,用0.8%的結(jié)晶紫染色40 min,棉簽拭去未穿過基質(zhì)膠和上室膜上層的U251細胞。倒置顯微鏡下隨機選7個視野,記錄侵襲細胞數(shù)。

        1.7 雙熒光素酶報告基因檢測將構(gòu)建的熒光素酶報告基因質(zhì)粒(野生型WT-RNF185-AS1和突變型MUT-RNF185-AS1)分別與miR-Con或miR-637共轉(zhuǎn)染至U251細胞,常規(guī)培養(yǎng)48 h。按照雙熒光素酶報告基因檢測試劑盒的使用說明書,檢測每個共轉(zhuǎn)染組U251細胞的相對熒光素酶活性。

        1.8 Western blot實驗檢測HMGA1蛋白及相關(guān)表型蛋白表達RIPA裂解液提取sh-Con組和sh-RNF185-AS1組蛋白樣品,配制SDS-PAGE凝膠,蛋白上樣電泳。濕式轉(zhuǎn)膜法轉(zhuǎn)至硝酸纖維素膜,用封閉液搖床孵育3 h。加入一抗HMGA1(1 ∶1 000)、CDK3(1 ∶2 000)、Vimentin(1 ∶3 000)、N-Cadherin(1 ∶2 000)、β-Tubulin(1 ∶2 000),4 ℃孵育15 h。封閉液洗膜3次,加入二抗(1 ∶5 000),室溫孵育3 h。封閉液洗膜3次,加入電化學(xué)顯色試劑,通過凝膠成像儀顯色和拍照。

        2 結(jié)果

        2.1 膠質(zhì)瘤組織和細胞系中RNF185-AS1的表達水平GEPIA數(shù)據(jù)庫在線分析顯示(圖1),RNF185-AS1在膠質(zhì)瘤組織中相對表達顯著高于癌旁組織(P<0.01)。qRT-PCR結(jié)果顯示(圖2),與HEB細胞相比,膠質(zhì)瘤細胞中RNF185-AS1表達水平均明顯增加(P<0.01),選取RNF185-AS1表達水平最高的U251進行后續(xù)實驗。

        2.2 sh-RNF185-AS1質(zhì)粒的沉默效率qRT-PCR結(jié)果顯示,sh-RNF185-AS1組和sh-Con組U251細胞中RNF185-AS1表達分別為(1.17±0.34)和(6.89±0.29),表明沉默RNF185-AS1的膠質(zhì)瘤細胞系構(gòu)建成功(P<0.01)。

        2.3 沉默RNF185-AS1對U251細胞增殖的影響MTT法檢測顯示(圖3),在接種細胞后2、3、4、5 d,sh-RNF185-AS1組U251細胞增殖活力均顯著低于sh-Con組(P<0.05),提示沉默RNF185-AS1抑制U251細胞的增殖活力。

        圖1 膠質(zhì)瘤組織和癌旁組織中RNF185-AS1的相對表達

        圖2 膠質(zhì)瘤細胞系和人腦星型膠質(zhì)正常細胞中RNF185-AS1的相對表達

        圖3 沉默RNF185-AS1對U251細胞增殖活力的影響

        2.4 沉默RNF185-AS1對U251細胞侵襲的影響Transwell侵襲實驗顯示(圖4),sh-RNF185-AS1組和sh-Con組侵襲細胞數(shù)分別為(48.78±12.83)個和(172.81±18.95)個,與sh-Con組相比,sh-RNF185-AS1組侵襲細胞數(shù)目顯著減少(P<0.01),提示沉默RNF185-AS1抑制U251細胞的侵襲能力。

        圖4 沉默RNF185-AS1對U251細胞侵襲能力的影響 結(jié)晶紫×100

        2.5 RNF185-AS1與miR-637的靶向結(jié)合作用linc2GO數(shù)據(jù)庫預(yù)測顯示(圖5),RNF185-AS1與miR-637存在部分連續(xù)互補的核苷酸序列。雙熒光素酶報告基因檢測顯示(圖6),轉(zhuǎn)染野生型WT-RNF185-AS1后,miR-637組的相對熒光素酶活性顯著低于miR-Con組(P<0.01),表明RNF185-AS1的靶基因是miR-637。

        圖5 RNF185-AS1與miR-637特異性互補的核苷酸序列

        2.6 沉默RNF185-AS1表達對miR-637和HMGA1 mRNA表達的調(diào)控作用qRT-PCR檢測顯示,sh-RNF185-AS1組和sh-Con組U251細胞中miR-637表達分別為(4.73±0.47)和(1.07±0.29),sh-RNF185-AS1組明顯高于sh-Con組(P<0.01)。sh-RNF185-AS1組和sh-Con組U251細胞中HMGA1 mRNA表達分別為(0.99±0.18)和(4.51±0.73),sh-RNF185-AS1組明顯低于sh-Con組(P<0.01),表明沉默RNF185-AS1能夠靶向正調(diào)控miR-637表達,抑制HMGA1 mRNA表達。

        2.7 沉默RNF185-AS1表達對HMGA1蛋白及相關(guān)表型表達的影響Western blot檢測顯示(圖7),沉默RNF185-AS1表達后,HMGA1蛋白表達顯著降低,細胞增殖表型蛋白CDK3表達降低,細胞侵襲表型蛋白Vimentin、N-Cadherin信號通路表達降低,表明U251細胞增殖能力和侵襲能力均降低。

        圖6 雙熒光素酶報告基因?qū)嶒烌炞CRNF185-AS1與miR-637的靶向結(jié)合

        圖7 沉默RNF185-AS1表達對U251細胞HMGA1蛋白及相關(guān)表型表達的影響

        3 討論

        大量研究[7]表明,lncRNA的表達異常與膠質(zhì)瘤的發(fā)生存在顯著相關(guān)性,是膠質(zhì)瘤血管生成、放療抵抗、化療抵抗的標志物。lncRNA參與調(diào)節(jié)膠質(zhì)瘤細胞的免疫反應(yīng)、增殖活性、炎癥反應(yīng)、鐵死亡等關(guān)鍵細胞過程,在膠質(zhì)瘤中發(fā)揮細胞調(diào)節(jié)因子作用[8]。lncRNA如NFIA-AS2在膠質(zhì)瘤組織中過度表達,其高表達與膠質(zhì)瘤患者的不良預(yù)后密切相關(guān),可能是無病生存期和總生存期的獨立預(yù)后因素[9]。如TTN-AS1在膠質(zhì)瘤組織和細胞系中表達上調(diào),沉默TTN-AS1表達能夠抑制膠質(zhì)瘤細胞的增殖、遷移、侵襲并加速細胞的凋亡[10]。RNF185-AS1是一個新型致癌作用的lncRNA,Huang et al[5]研究顯示,RNF185-AS1在肝細胞癌組織和細胞系中高度表達,高水平RNF185-AS1與晚期TNM分期、遠處轉(zhuǎn)移和較差的總生存率相關(guān),敲低RNF185-AS1通過結(jié)合并抑制miR-221-5p,抑制肝細胞癌細胞增殖、遷移和侵襲。本研究顯示,RNF185-AS1在膠質(zhì)瘤組織和細胞系中高度表達,沉默RNF185-AS1能夠顯著抑制膠質(zhì)瘤U251細胞的增殖活力和侵襲,表明RNF185-AS1在膠質(zhì)瘤中發(fā)揮致癌基因的作用。

        大量研究[11]顯示,lncRNA能夠阻斷微小RNA(miRNA)在膠質(zhì)瘤發(fā)生中的作用,恢復(fù)miRNA靶基因功能,從而調(diào)控膠質(zhì)瘤的進展。如lncRNA XIST通過靶向miR-133a促進膠質(zhì)瘤U251細胞的增殖、遷移、侵襲[12]。如lncRNA GAS5-AS1通過靶向miR-106b-5p抑制膠質(zhì)瘤U87MG和U251細胞的增殖、遷移、侵襲[13]。本研究通過生物信息學(xué)分析顯示,RNF185-AS1可能在膠質(zhì)瘤細胞中與miR-637互補結(jié)合。雙熒光素酶報告基因?qū)嶒炦M一步證實RNF185-AS1能夠互補結(jié)合miR-637。研究[14]顯示,miR-637在膠質(zhì)瘤組織中表達顯著下調(diào),過表達miR-637能夠抑制膠質(zhì)瘤細胞的增殖和侵襲。本研究通過qRT-PCR結(jié)果顯示,沉默RNF185-AS1表達可上調(diào)膠質(zhì)瘤U251細胞中miR-637的表達。以上結(jié)果表明,RNF185-AS1直接靶向miR-637抑制膠質(zhì)瘤的發(fā)生發(fā)展。高遷移率族蛋白A1(high mobility group A1,HMGA1)是miR-637在膠質(zhì)瘤細胞中的直接靶基因,miR-637通過抑制HMGA1表達發(fā)揮抑癌基因作用[15]。本研究顯示,沉默RNF185-AS1表達后,HMGA1基因表達降低,間接證明RNF185-AS1通過靶向miR-637調(diào)節(jié)HMGA1基因的表達。

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