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        基于群集性軌跡追蹤的疾病風(fēng)險(xiǎn)分析算法

        2022-06-06 06:31:21蔣皓宇
        科學(xué)與財(cái)富 2022年2期
        關(guān)鍵詞:數(shù)據(jù)分析

        摘?要:突發(fā)性群集性傳染性疫病,對人體生命安全和社會經(jīng)濟(jì)穩(wěn)定都造成了巨大威脅;還有一些如高血壓、類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎、微量元素缺乏癥等慢性病癥,與患者地理分布、飲食習(xí)慣等密切相關(guān)。傳統(tǒng)的傳染病與地域性慢性疾病十分依賴醫(yī)務(wù)人員的實(shí)際經(jīng)驗(yàn)與敏感程度。因此亟需開發(fā)一種能夠?qū)崿F(xiàn)群集性疾病軌跡追蹤的風(fēng)險(xiǎn)評估分析算法,及時(shí)發(fā)現(xiàn)可疑患者集聚人群有利于及早的采取應(yīng)對措施,最大程度減輕這類疾病對社會造成的影響。

        關(guān)鍵詞:數(shù)據(jù)分析;群集性疾病;軌跡追蹤;異常報(bào)警

        1概述

        群集性感染性疾病如嚴(yán)重急性呼吸綜合征(SARS)、甲型HIN1流感等的大面積爆發(fā),對人類生命安全與社會經(jīng)濟(jì)穩(wěn)定構(gòu)成了極大威脅。國家衛(wèi)生健康委副部級機(jī)關(guān)——國家疫病預(yù)防控制總局在印發(fā)的《關(guān)于做好2021-2022年流行季流感防控工作的通知》中,從加強(qiáng)疫病監(jiān)控預(yù)警與數(shù)據(jù)分析的研究、從加強(qiáng)流感疫苗供應(yīng)與調(diào)撥管理和疫苗數(shù)據(jù)的信息化管理、統(tǒng)籌醫(yī)療資源規(guī)范開展救治等七個(gè)方面強(qiáng)調(diào)了流感防控的措施。其中重點(diǎn)強(qiáng)調(diào)了信息系統(tǒng)的作用。充分發(fā)揮了信息系統(tǒng)在追蹤全國流感疫情動向,加強(qiáng)了流感活動強(qiáng)度等的監(jiān)控管理工作,增強(qiáng)了流感檢測敏感性與準(zhǔn)確率等方面的功能;發(fā)揮信息系統(tǒng)在疫苗信息報(bào)告、疫情調(diào)撥和流向信息等方面的關(guān)鍵功能,提升疫情管理水平。

        一些慢性病癥,如急性高血壓、類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎、微量元素缺乏癥等,與患者地理分布、飲食習(xí)慣等密切相關(guān),我國每年花費(fèi)大量的人力物力用于群集性疾病與慢性疾病的防治。通過臨床工作實(shí)踐中可以發(fā)現(xiàn),傳統(tǒng)的傳染病監(jiān)測極度依賴于醫(yī)務(wù)人員對這些疾病的敏銳性和警覺性,而且也只能針對能診斷明確的傳染病。事實(shí)上,對那些急性傳染病尤其是不明原因的傳染病要做出及時(shí)發(fā)現(xiàn)和判斷,最大程度化解公共衛(wèi)生風(fēng)險(xiǎn)十分依賴于臨床及早識別和發(fā)現(xiàn)患者。其中,及早識別出發(fā)病人群具有聚集性的特點(diǎn)具有十分重要的流行病學(xué)意義和社會意義;同樣,對于慢性疾病的管理以及某些地方病的流行狀況監(jiān)測也都依賴于一定物理空間區(qū)域內(nèi)患者群集性狀態(tài)的自動識別。因此,這種對群集性早期預(yù)警與風(fēng)險(xiǎn)等級評價(jià),無論對急慢性傳染病、慢性病管理均具有重要的臨床意義。通過開發(fā)能夠?qū)崿F(xiàn)群集性疾病軌跡追蹤的風(fēng)險(xiǎn)評估分析算法,及時(shí)發(fā)現(xiàn)可疑患者集聚人群有利于及早的采取應(yīng)對措施。

        另外,報(bào)告顯示,數(shù)字賦能智慧醫(yī)療已成為主流趨勢,大數(shù)據(jù)分析也將在疾病監(jiān)控、輔助決策、健康管理等領(lǐng)域發(fā)揮重要作用,而NB-IoT+物聯(lián)網(wǎng)芯片等融合應(yīng)用,也將彌補(bǔ)傳統(tǒng)醫(yī)療設(shè)備的缺點(diǎn),成為移動醫(yī)療設(shè)備的標(biāo)配。在平臺層,云計(jì)算、大數(shù)據(jù)、人工智能、區(qū)塊鏈等技術(shù)將推動醫(yī)療信息化及遠(yuǎn)程醫(yī)療平臺改造升級。

        2021年12月28日,由工信部聯(lián)手我國衛(wèi)生部門保健委、我國發(fā)展改革委等部門和有關(guān)單位共同頒布的《"十四五"醫(yī)藥裝備產(chǎn)業(yè)健康發(fā)展計(jì)劃》于二十八日對外公開發(fā)布。當(dāng)中明確提出,推進(jìn)智慧醫(yī)藥技術(shù)裝備健康發(fā)展。要求進(jìn)一步利用計(jì)算機(jī)技術(shù)進(jìn)行智慧診斷,以提高我國對老年人的醫(yī)療健康信息技術(shù)服務(wù)保障能力,計(jì)劃中同樣作出了戰(zhàn)略部署。

        總之,三個(gè)方面決定了本文章提出方法的意義。一是社會防疫需求,突發(fā)性群集性傳染性疾病,如SARS、甲型HIN1流感、新冠肺炎等的大面積爆發(fā),對人類生命安全與社會經(jīng)濟(jì)穩(wěn)定構(gòu)成了極大威脅;二是慢性疾病需要進(jìn)行防治,某些慢性疾病,如高血壓、微量元素缺乏癥等,與患者地理分布、飲食習(xí)慣等密切相關(guān)。我國每年花費(fèi)大量的人力物力用于相關(guān)疾病的防治。三是老齡化的越來越嚴(yán)峻,隨著老齡化程度提高,未來我國老年人數(shù)將逐步上升。老齡化的增加將造成老年人群體醫(yī)藥、護(hù)理需求量的大幅增加,醫(yī)療行業(yè)亟需升級。

        本文提出了一種群集性/慢性疾病早期自動報(bào)警、初步特征分析方法,其特征在于包括活動軌跡追蹤模塊、自動報(bào)警展示模塊;運(yùn)用算法對醫(yī)療機(jī)構(gòu)病歷數(shù)據(jù)庫的定時(shí)掃描,結(jié)合患者個(gè)體行動軌跡的分析,能夠?qū)Τ霈F(xiàn)的突發(fā)群集性疾病實(shí)現(xiàn)自動報(bào)警,避免目前因人工上報(bào)造成的防控遲滯,為重大突發(fā)群集性疾病爭取到寶貴的防控時(shí)間。

        2方法分析

        2.1活動軌跡追蹤模塊

        利用患者使用的可公布、共享的定位方式,或與移動通訊運(yùn)營商協(xié)議,經(jīng)主管部門允許,通過病人手機(jī)終端獲得患者物理空間GPS定位信息,自動對預(yù)設(shè)地區(qū)就診人群在特定時(shí)間段內(nèi)具有相同患者活動軌跡的特定事件進(jìn)行群集性分析,包括活動軌跡提取及聚類分析。活動軌跡追蹤模塊工作時(shí),包括如下步驟。

        2.1.1活動軌跡獲取

        利用帶有定位功能的智能穿戴、移動設(shè)備獲取速度、方向、位置和時(shí)間戳四維信息,同時(shí)對冗余軌跡數(shù)據(jù)進(jìn)行壓縮。軌跡數(shù)據(jù)由一系列的數(shù)據(jù)點(diǎn)構(gòu)成,用表示;具體步驟如下。

        步驟一:利用滑動窗口W和均值技術(shù)從軌跡數(shù)據(jù)中濾除噪點(diǎn),得到處理后的數(shù)據(jù)點(diǎn)集;

        步驟二:對上述數(shù)據(jù)點(diǎn)集進(jìn)行停留點(diǎn)檢測,所述停留點(diǎn)是指具有代表性的數(shù)據(jù)點(diǎn),使數(shù)據(jù)點(diǎn)集就變成有意義的地方集;

        首先,檢測定位點(diǎn)pi'與其后繼點(diǎn)pi+1'間的距離,有無超過給定閾值的軌跡;然后,用它檢測所定位點(diǎn)與距離閾值范圍內(nèi)的最后一次后繼pk'之間的時(shí)間間隔;如果時(shí)間間隔超過了給定的距離閾值,則該定位點(diǎn)為停留點(diǎn);最后從pk'的后繼點(diǎn)迭代檢查,直到所有數(shù)據(jù)點(diǎn)集檢查完;

        步驟三:進(jìn)行軌跡壓縮;在步驟二獲得的數(shù)據(jù)點(diǎn)集的基礎(chǔ)上,采用道格拉斯-普克算法進(jìn)行壓縮,過程如下:

        a.把曲線的首末點(diǎn)連成一個(gè)平行直線,可以求得曲線上每個(gè)點(diǎn)到直線的垂直間距,并找出最高間距值dmax;

        b.用dmax與預(yù)設(shè)的閾值D相比較時(shí),若dmax

        c.否則,必須保留dmax對應(yīng)的位置點(diǎn),并以該點(diǎn)為界,將曲線劃為兩部分,再重復(fù)以上過程,直至所有dmax均小于D,如此即實(shí)現(xiàn)對曲線的壓縮;

        d.當(dāng)每個(gè)曲線都處理完畢時(shí),順序銜接每個(gè)分割節(jié)點(diǎn)而產(chǎn)生的折線,即為原始曲線的路徑。

        2.1.2活動軌跡數(shù)據(jù)分析

        通過對資料預(yù)處理后軌跡數(shù)據(jù)處理,分析并提取有價(jià)值的信息,通過時(shí)空環(huán)境中事故調(diào)查、群體監(jiān)控;發(fā)現(xiàn)頻繁時(shí)序模式,利用公眾性規(guī)律或公眾性的頻繁路徑,實(shí)現(xiàn)地點(diǎn)預(yù)測、病員相似性預(yù)測;通過周期性的活動行為,預(yù)測病員未來的行為;具體步驟如下:

        步驟一:先進(jìn)行軌道相似性度量,通常用一個(gè)距離函數(shù)來進(jìn)行;首先,界定點(diǎn)和軌道中間的一致性,假定點(diǎn)q和軌道A相同,q和A間的一致性通常界定如下:

        P'的運(yùn)動軌跡在A上和d(.)測量間距最小的地點(diǎn);在推算二點(diǎn)間距時(shí),通常使用L-P范數(shù),或歐氏距離,切比雪夫距或曼克頓間距等計(jì)算方法測量間距;

        如使用切比雪夫距離:在兩個(gè)n維矢量a(x11,x12,…,x1n)與b(x21,x22,…,x2n)間的切比雪夫距離為,

        接著,通過計(jì)算DTW距離來確定軌跡與軌跡的相似性,DTW距離如下:

        h,r為軌跡A,B的長度;

        給定軌跡A<a1,a2,...an>和軌跡B<b1,b2,...bm>,Head(A)表示a1,Rest(A)表示<a2,a3...an>。

        步驟二:對軌跡進(jìn)行聚類,并分析公共規(guī)律行為;采用的密度最大值聚類算法MDCA,其核心步驟是:

        a.將數(shù)據(jù)組分割為基本簇,對數(shù)據(jù)集中選擇較大的密度點(diǎn)pMax,再根據(jù)間距排列得出SpMax;然后對數(shù)據(jù)序列的前m個(gè)樣本數(shù)量加以判定,假設(shè)對象密度等于或超過density0,則把當(dāng)前對象加入到基本簇Ci中;從數(shù)據(jù)集合剔除Ci中隱含的所有對象,并管理剩余的數(shù)據(jù)集合,選擇最高密度點(diǎn)pmax’,并建立基本群Ci+1;如此循環(huán)操作,直至所有數(shù)據(jù)集合剩余對象的最高密度系數(shù)均等于density0。

        b.通過凝聚層次聚類的思想,結(jié)合距離最近的基本簇,得到最終的簇劃分,在簇中選取相距最近的兩個(gè)簇加以合并;合并條件為:簇間距小于等于dist0;若每個(gè)簇與簇間距小于dist0,終止合并操作。

        c.處理剩余點(diǎn)。如保留噪聲:則掃描各個(gè)殘余對象,將其中與某些簇距離小于或等于dist0的對象歸入其中的間距最近的簇;與任何簇的間距均等于的dist零的對象作為噪音。假設(shè)不保持噪音:則將任何剩余對象都劃給相距最近的簇。

        2.2自動報(bào)警展示模塊

        通過預(yù)先設(shè)定的掃描病情相關(guān)參數(shù)、掃描時(shí)間和空間半徑對聚集性、群體性發(fā)生的事件進(jìn)行自動分析顯示并實(shí)時(shí)報(bào)警;達(dá)到預(yù)先設(shè)定的群集性標(biāo)準(zhǔn)時(shí),自動報(bào)警生成并存檔目標(biāo)病例的統(tǒng)計(jì)表,同時(shí)自動在當(dāng)?shù)氐貓D中直觀標(biāo)注發(fā)病地點(diǎn).自動報(bào)警展示模塊工作時(shí),按如下步驟進(jìn)行。

        步驟一:進(jìn)行病例特征數(shù)據(jù)分析,在系統(tǒng)展示屏幕上選擇需要監(jiān)控的流行性疾病,通過GPS地圖展示其歷史數(shù)據(jù)以及趨勢,并通過海量病例分析模塊得到相關(guān)特征數(shù)據(jù),包括時(shí)空相關(guān)特征。

        步驟二:閾值自動報(bào)警,通過醫(yī)療專家的從醫(yī)經(jīng)驗(yàn),預(yù)先設(shè)置病例異常的條件和病例數(shù)異常閾值,以此分析所采數(shù)據(jù),判斷特征數(shù)據(jù)是否達(dá)到預(yù)設(shè)觸發(fā)條件,如果達(dá)到預(yù)設(shè)觸發(fā)條件,則自動化報(bào)警,可使用t檢驗(yàn)法,格拉布斯檢驗(yàn)法,狄克遜檢驗(yàn)法費(fèi)明細(xì)數(shù)據(jù)異常,過程如下:

        a.用Dixon法分析數(shù)據(jù)的異常狀態(tài),設(shè)樣本為,其順序統(tǒng)計(jì)量為:x(1)<x (2)<…<x (n);

        b.其中x(1)為最小,x(n)為最大,當(dāng)序列統(tǒng)計(jì)變量x(i)滿足正態(tài)分配時(shí),Dixon提供了對各種樣本總量為n時(shí)統(tǒng)計(jì)變量D的運(yùn)算公式;

        c.當(dāng)顯著水平α為0.05或0.01時(shí),Dixon就給予了其臨界值D1-α(n);

        d.如果某樣本的統(tǒng)計(jì)量D>D1-α(n),則x(n)為異常值,如果某樣本的統(tǒng)計(jì)量D′> D1-α(n),則x(1)為異常值,否則為正常值。

        3結(jié)語

        實(shí)現(xiàn)群集性疾病的早期識別預(yù)警具有重要的實(shí)際意義。通過本方法對患者相關(guān)信息的不同字段的設(shè)定、抓取,結(jié)合就診前特定時(shí)段內(nèi)GPS定位個(gè)體行動軌跡分析,能夠?qū)崿F(xiàn)對單位時(shí)間內(nèi)目標(biāo)病例空間分布特征的分析,初步分析提取突發(fā)群集性疾病空間分布特征、單位面積內(nèi)數(shù)目、疾病發(fā)生的強(qiáng)度等信息;同時(shí)還可應(yīng)用于類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎、微量元素缺乏癥等慢性病的防治。通過對其進(jìn)行初步特征分析與風(fēng)險(xiǎn)評估,衛(wèi)生醫(yī)療能夠及早制訂應(yīng)對預(yù)案,達(dá)到提高群集性/慢性疾病群防群控的效果和目的。

        參考文獻(xiàn)

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        作者簡介:

        蔣皓宇,男,生于2001年8月,漢族,江蘇淮安人,揚(yáng)州大學(xué)本科在讀,計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)專業(yè)。

        基金項(xiàng)目:本文系江蘇省大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計(jì)劃項(xiàng)目,項(xiàng)目編號:202111117113Y

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