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        生物技術(shù)綜合實(shí)驗(yàn)虛擬仿真項目的建設(shè)與應(yīng)用

        2022-04-27 09:40:08潘光鈺
        科教導(dǎo)刊 2022年8期
        關(guān)鍵詞:質(zhì)粒凝膠實(shí)驗(yàn)教學(xué)

        黃 晶,黃 江,潘光鈺,王 凜

        (桂林醫(yī)學(xué)院生物技術(shù)學(xué)院,廣西 桂林 541199)

        引言

        信息技術(shù)已深深植根于高校教學(xué)改革之中,線上教學(xué)資源日漸豐富,線上線下混合式教學(xué)模式受到了廣大師生的擁護(hù)。特別是在新冠疫情持續(xù)的特殊階段,線上教育資源的建設(shè)和利用越來越受到學(xué)校和師生的重視[1]。傳統(tǒng)實(shí)驗(yàn)教學(xué)中,教師是實(shí)驗(yàn)技能傳授的主體,是中心,學(xué)生的實(shí)驗(yàn)學(xué)習(xí)主要依賴于實(shí)體實(shí)驗(yàn)室環(huán)境。學(xué)生是實(shí)驗(yàn)技能的被動接受者,缺少主動鍛煉的必備條件,如:固定的學(xué)時數(shù)、耗材的限制、儀器設(shè)備的不足等等。隨著高校招生人數(shù)的不斷增加,實(shí)驗(yàn)教學(xué)資源面臨巨大壓力。由于傳統(tǒng)課堂實(shí)驗(yàn)教學(xué)條件和教學(xué)方式的限制,同時由于學(xué)生在專業(yè)知識掌握、學(xué)習(xí)興趣和動手操作能力方面的差異,都會影響學(xué)生實(shí)驗(yàn)技能的掌握和創(chuàng)新思維的鍛煉。虛擬仿真實(shí)驗(yàn)教學(xué)利用先進(jìn)的信息技術(shù),虛擬實(shí)驗(yàn)場景,借助網(wǎng)絡(luò)和終端設(shè)備(計算機(jī)/智能手機(jī)),通過交互式操作進(jìn)行線上實(shí)驗(yàn)教學(xué)。虛擬仿真實(shí)驗(yàn)教學(xué)實(shí)現(xiàn)了實(shí)驗(yàn)課程從教師主導(dǎo)過渡為學(xué)生自主,體現(xiàn)了以學(xué)生為中心的個性化學(xué)習(xí)模式,提高了學(xué)生的學(xué)習(xí)主動性,促進(jìn)了創(chuàng)新能力的培養(yǎng)[2]。虛擬仿真實(shí)驗(yàn)豐富了實(shí)驗(yàn)教學(xué)的形式,突破了實(shí)驗(yàn)教學(xué)對客觀條件的依賴,將逐步成為不可替代的實(shí)驗(yàn)教學(xué)平臺。

        生物技術(shù)是理論學(xué)習(xí)與實(shí)驗(yàn)操作并重的專業(yè),其實(shí)驗(yàn)教學(xué)的開展長期以來存在著一些制約因素,例如高成本實(shí)驗(yàn)無法在教學(xué)中普及、珍稀實(shí)驗(yàn)材料難以獲得、周期較長的實(shí)驗(yàn)無法在有限的實(shí)驗(yàn)學(xué)時內(nèi)開展等,這些問題都影響了本科生對生物技術(shù)專業(yè)相關(guān)實(shí)驗(yàn)原理與操作方法的掌握[3-4]。生物技術(shù)虛擬仿真實(shí)驗(yàn)可以解決傳統(tǒng)實(shí)驗(yàn)教學(xué)面臨的成本不斷增加、教學(xué)空間、時間受限、實(shí)驗(yàn)室安全等級不足等多方面限制。各高??梢罁?jù)學(xué)校特點(diǎn)與專業(yè)特色構(gòu)建虛擬仿真實(shí)驗(yàn)平臺,設(shè)計多種模擬實(shí)驗(yàn)操作的場景和流程[5-6],拓展課堂實(shí)驗(yàn)教學(xué)內(nèi)容,作為線下實(shí)驗(yàn)教學(xué)的補(bǔ)充,提高學(xué)生專業(yè)技能,為培養(yǎng)高素質(zhì)創(chuàng)新型生物技術(shù)人才提供支持[7]。

        本文以桂林醫(yī)學(xué)院生物技術(shù)學(xué)院虛擬仿真實(shí)驗(yàn)中心的分子生物學(xué)綜合實(shí)驗(yàn)為例,介紹虛擬實(shí)驗(yàn)在生物技術(shù)專業(yè)實(shí)驗(yàn)教學(xué)中的探索和應(yīng)用。

        1 實(shí)驗(yàn)項目建設(shè)內(nèi)容

        在生物技術(shù)綜合實(shí)驗(yàn)虛擬仿真項目建設(shè)中遵循“科學(xué)規(guī)劃、資源共享、突出重點(diǎn)、注重創(chuàng)新”的指導(dǎo)思想,堅持“學(xué)生為本,服務(wù)教學(xué)”的基本原則,將生物化學(xué)、分子生物學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、遺傳學(xué)、實(shí)驗(yàn)動物學(xué)、生物工程、生物醫(yī)學(xué)工程等生物學(xué)學(xué)科的教學(xué)資源進(jìn)行有機(jī)整合,以案例式教學(xué)模式,將已有的教學(xué)資源進(jìn)行集成并數(shù)字化,把生物技術(shù)的相關(guān)課程聯(lián)系起來,建立虛擬仿真實(shí)驗(yàn)項目。

        生物技術(shù)綜合實(shí)驗(yàn)由移液槍基本操作、重組質(zhì)粒提取、DNA瓊脂糖凝膠電泳、醫(yī)學(xué)細(xì)胞培養(yǎng)綜合實(shí)驗(yàn)、普通PCR、紫外分光光度計檢測RNA 濃度及純度、RNA 逆轉(zhuǎn)錄、熒光定量PCR、蛋白質(zhì)變性與SDS-PAGE 電泳、Western Blot 檢測蛋白表達(dá)等多個虛擬仿真實(shí)驗(yàn)組成。本實(shí)驗(yàn)的目的是使學(xué)生熟悉分子細(xì)胞生物學(xué)實(shí)驗(yàn)常規(guī)儀器設(shè)備的使用,包括移液槍、搖床、離心機(jī)、電泳儀、細(xì)胞培養(yǎng)箱、超凈工作臺、紫外分光光度計以及PCR 儀等;掌握質(zhì)粒提取、DNA 電泳、細(xì)胞培養(yǎng)、逆轉(zhuǎn)錄、熒光定量PCR、蛋白質(zhì)電泳及Western Blot 等原理、相關(guān)知識點(diǎn)和具體實(shí)驗(yàn)操作;串聯(lián)分子克隆、細(xì)胞培養(yǎng)、基因相對定量檢測以及蛋白分析等知識,使學(xué)生所學(xué)分子生物學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、遺傳學(xué)以及基因工程等知識融會貫通,系統(tǒng)地掌握生物技術(shù)核心知識(見圖1)。

        圖1

        2 軟硬件環(huán)境

        本虛擬仿真實(shí)驗(yàn)系統(tǒng)通過Web 環(huán)境運(yùn)行,利用手機(jī)或電腦可隨時訪問桂林醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)生物技術(shù)虛擬仿真實(shí)驗(yàn)教學(xué)中心平臺,進(jìn)行相關(guān)虛擬仿真實(shí)驗(yàn)操作。

        2.1 客戶端到服務(wù)器的帶寬要求

        本平臺所含實(shí)驗(yàn)項目,大小約為65 M,在2M帶寬下,客戶端在30 秒內(nèi)可完成下載。相關(guān)數(shù)據(jù)采用使用與下載協(xié)同模式,校園網(wǎng)和普通寬帶用戶均可正常訪問。平臺利用桂林醫(yī)學(xué)院信息中心服務(wù)器,設(shè)置并發(fā)響應(yīng)數(shù)量為50,能夠完全滿足教學(xué)使用。

        2.2 用戶操作系統(tǒng)要求

        本虛擬仿真實(shí)驗(yàn)平臺可在Windows xp 及以上版本運(yùn)行,在IOS 或Android 系統(tǒng)可通過輸出htmal5 版本運(yùn)行。瀏覽器需要安裝flash 插件,其他無特殊要求。計算機(jī)硬件配置要求:推薦使用Intel 雙核及以上級別CPU;系統(tǒng)內(nèi)存4G以上;顯示器分辨率不低于1280Χ720;系統(tǒng)硬盤剩余空間不小于4G。

        3 虛擬仿真實(shí)驗(yàn)教學(xué)的實(shí)施

        本項目各實(shí)驗(yàn)包含實(shí)驗(yàn)?zāi)康?,?shí)驗(yàn)原理,教學(xué)視頻,虛擬操作,結(jié)果展示,思考題等模塊。虛擬實(shí)驗(yàn)操作分為:預(yù)習(xí)實(shí)驗(yàn),配制試劑、儀器使用,實(shí)驗(yàn)操作,結(jié)果分析等。學(xué)生首先通過視頻示教的方法學(xué)習(xí)實(shí)驗(yàn)原理及相關(guān)知識,掌握實(shí)驗(yàn)所需試劑、耗材和儀器,然后通過模擬實(shí)驗(yàn)操作全過程,牢記實(shí)驗(yàn)程序及實(shí)驗(yàn)操作的要點(diǎn)。

        3.1 以瓊脂糖凝膠電泳檢測RNA 純度為例

        通過在虛擬實(shí)驗(yàn)平臺模擬該實(shí)驗(yàn)(圖2),可使學(xué)生掌握瓊脂糖凝膠的配置方法,電泳技術(shù)等。具體操作過程:將凝膠板放置在模具中→插入梳子→選擇正確的凝膠濃度→正確操作電子天平稱取瓊脂糖→加入適量的緩沖液→選擇正確的時間進(jìn)行加熱→冷卻凝膠至60℃→加入適量核酸染料→倒入凝膠板中等待凝膠完全凝固→拔去梳子將凝膠放入電泳槽中→向電泳槽中加入適量的緩沖液→正確配置12 ul樣品→加樣→輸入適當(dāng)電壓電泳30 min正確連接電泳儀→正確連接電泳儀→電泳結(jié)束后在凝膠成像系統(tǒng)里觀察條帶并判斷正確的條帶。

        圖2

        3.2 以堿裂解法提取質(zhì)粒DNA 為例

        通過虛擬實(shí)驗(yàn)操作(圖3),熟悉掌握質(zhì)粒DNA減法提取的原理、操作注意事項和試驗(yàn)方法。具體操作過程:實(shí)驗(yàn)前準(zhǔn)備(滅菌)→收集細(xì)菌(離心)→重懸菌液(P1)→裂解菌液(P2)→酸堿條件下質(zhì)粒DNA復(fù)性→柱平衡→收集上清液→清洗質(zhì)粒DNA→曬干殘余漂洗液→洗脫質(zhì)?!鷾y濃度→質(zhì)粒保存。

        圖3

        傳統(tǒng)教學(xué)相關(guān)實(shí)驗(yàn)課程需要教師提前做大量準(zhǔn)備工作,實(shí)驗(yàn)只能進(jìn)行一次。如果學(xué)生實(shí)驗(yàn)失敗,通常因?qū)W時數(shù)、實(shí)驗(yàn)場地等原因失去重新操作的機(jī)會。利用虛擬仿真實(shí)驗(yàn),學(xué)生可以更好地預(yù)習(xí)和復(fù)習(xí),掌握實(shí)驗(yàn)中的關(guān)鍵節(jié)點(diǎn),更好地完成課堂實(shí)驗(yàn)。在生物技術(shù)綜合實(shí)驗(yàn)虛擬仿真平臺上,學(xué)生們可隨時通過特定賬號在校內(nèi)外登錄網(wǎng)絡(luò)終端,聯(lián)網(wǎng)自學(xué)并進(jìn)行模擬實(shí)驗(yàn),根據(jù)專業(yè)和興趣自主安排學(xué)習(xí)內(nèi)容、學(xué)習(xí)時間和進(jìn)度,實(shí)現(xiàn)線上自主學(xué)習(xí)并獲得學(xué)習(xí)反饋評價,還可與教師進(jìn)行討論、答疑及互動。

        4 結(jié)語

        教育部2015 年公布100 所國家級虛擬仿真實(shí)驗(yàn)教學(xué)中心名單后,國內(nèi)虛擬仿真實(shí)驗(yàn)建設(shè)加快了步伐。2018 年《教育部關(guān)于開展國家虛擬仿真實(shí)驗(yàn)教學(xué)項目建設(shè)工作的通知》要求進(jìn)一步深化和拓展虛擬仿真實(shí)驗(yàn)教學(xué)項目建設(shè)工作,助推信息技術(shù)與實(shí)驗(yàn)教育教學(xué)深度融合,助推高等教育教學(xué)質(zhì)量變軌超車。[8]

        生物技術(shù)虛擬仿真綜合實(shí)驗(yàn)極大地減少了相關(guān)實(shí)驗(yàn)教學(xué)設(shè)施的購置、節(jié)約了實(shí)驗(yàn)成本,減少了實(shí)驗(yàn)場地的使用,降低了教師資源的浪費(fèi),避免了有毒有害試劑對人體的傷害風(fēng)險,從而保障經(jīng)濟(jì)、安全可靠的實(shí)驗(yàn)教學(xué),同時推動了教學(xué)信息化建設(shè)[9]。綜合實(shí)驗(yàn)虛擬仿真項目建成后,同學(xué)們通過教學(xué)平臺虛擬完成實(shí)驗(yàn)操作流程,得到實(shí)驗(yàn)結(jié)果,系統(tǒng)還會對錯誤操作步驟進(jìn)行糾正,指導(dǎo)學(xué)生正確地開展實(shí)驗(yàn)。學(xué)生通過綜合虛擬仿真實(shí)驗(yàn)的訓(xùn)練,對相關(guān)知識進(jìn)行預(yù)習(xí)和復(fù)習(xí),或開展課外實(shí)驗(yàn),拓寬視野,提高獨(dú)立思考和創(chuàng)新實(shí)踐能力[10]。總之,生物技術(shù)綜合實(shí)驗(yàn)虛擬仿真實(shí)驗(yàn)項目能夠和真實(shí)實(shí)驗(yàn)課堂相互補(bǔ)充,實(shí)現(xiàn)線上教育與線下教育的完美融合。

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