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        重組DNA分子模型的再設(shè)計(jì)

        2021-12-29 16:33:14張艷娟
        中學(xué)生物學(xué) 2021年9期
        關(guān)鍵詞:深度學(xué)習(xí)模型

        張艷娟

        摘要 豐富重組DNA分子模型的內(nèi)涵,突破目的基因正連和倒連、單酶切和雙酶切差異等教學(xué)難點(diǎn),引導(dǎo)深度學(xué)習(xí)。

        關(guān)鍵詞 重組DNA分子 模型 深度學(xué)習(xí)

        中圖分類號(hào) G633.91

        文獻(xiàn)標(biāo)志碼 B

        文獻(xiàn)標(biāo)志碼 B

        “DNA重組技術(shù)的基本工具”是人教版高中生物選修3專題1第一節(jié)的內(nèi)容,教材給出了重組DNA分子的模擬制作活動(dòng)建議,也有教師嘗試過(guò)展板模型。模型直觀模擬了分子水平的操作,帶給學(xué)生“邊做邊學(xué)”的生動(dòng)體驗(yàn)。然而,由于模型設(shè)計(jì)的局限性還有一些難點(diǎn)有待突破,如限制酶如何選擇、目的基因正連和倒連、雙酶切與單酶切的區(qū)別等。為此,筆者嘗試對(duì)模型進(jìn)行再設(shè)計(jì),豐富模型內(nèi)涵,引導(dǎo)深度學(xué)習(xí)。

        1模型設(shè)計(jì)要點(diǎn)

        1.1含目的基因的DNA片段模型

        該模型有兩個(gè)設(shè)計(jì)要點(diǎn):1目的基因有方向性,反向連接會(huì)導(dǎo)致錯(cuò)誤表達(dá),所以用開(kāi)始和結(jié)束表明方向(目的基因不一定帶啟動(dòng)子和終止子,所以未標(biāo)啟動(dòng)子和終止子);2獲取目的基因時(shí)要既可用單酶切,又可用雙酶切。所以,目的基因兩側(cè)各設(shè)計(jì)了一個(gè)G↓AATTC的識(shí)別序列,并在目的基因左右兩側(cè)分別增加↓GATC和↓TCGA的識(shí)別序列。值得注意的是目的基因左側(cè)↓GATC和G↓AATTC之間要增加一個(gè)無(wú)關(guān)堿基對(duì),否則兩個(gè)酶切序列連起來(lái)中間會(huì)出現(xiàn)一個(gè)↓TCGA的識(shí)別序列,增加不必要的干擾;目的基因右側(cè)↓TCGA要設(shè)計(jì)在G↓AATTC的左側(cè)。這樣,可以在G↓AATTC酶切后模型的基礎(chǔ)上再切割↓TCGA位點(diǎn)。另外,如果↓TCGA在G↓AATTC的右側(cè),即使添加兩種限制酶(酶2和酶3),目的基因兩側(cè)也只有酶2切割后產(chǎn)生的黏性末端。

        1.2運(yùn)載體模型

        該模型模擬了最常用的運(yùn)載體——質(zhì)粒,模擬目標(biāo)是既要體現(xiàn)單酶切和雙酶切的區(qū)別,又要至少體現(xiàn)運(yùn)載體具備的兩個(gè)條件:具有1個(gè)至多個(gè)限制酶切割位點(diǎn)便于與外源基因連接、具有某些標(biāo)記基因便于重組DNA的檢測(cè)與鑒定。因此,質(zhì)粒上設(shè)計(jì)了三種限制酶的識(shí)別序列G↓AATTC、↓GATC和↓TCGA,其中↓GATC的識(shí)別序列位于標(biāo)記基因中。

        2模型制作方法

        根據(jù)教學(xué)需要設(shè)計(jì)了兩種模型:分組活動(dòng)模型和黑板展示模型。

        分組活動(dòng)模型(圖1)以學(xué)案的形式印發(fā)給學(xué)生,確保每一位學(xué)生都能親自動(dòng)手操作。為了使目的基因與質(zhì)粒的連接美觀規(guī)范,兩種DNA模型的寬度要相同、堿基大小和間距要一致。

        黑板展示模型(圖2)的要求是字大醒目,可在黑板上吸附和移動(dòng),并能多次重復(fù)使用。該模型利用“不織布”制作,方便折疊,經(jīng)久耐用。不織布的正面粘貼印有“A、T、C、G”四個(gè)字母的彩紙,代表四種脫氧核苷酸;背面粘貼軟磁片,可吸附在黑板上。為了延長(zhǎng)模型使用時(shí)間,彩紙上貼一層寬膠帶。各限制酶的切口提前剪開(kāi),斷開(kāi)處用透明膠帶粘起來(lái),把透明膠帶的一頭對(duì)折,使其失去粘性,方便手持操作。因透明膠帶粘在光滑的寬膠帶表面,所以將透明膠帶撕開(kāi)、粘上的操作可多次重復(fù)。為了展示目的基因與目的基因相連和質(zhì)粒與質(zhì)粒相連,目的基因和質(zhì)粒各做2個(gè)。

        3模型使用策略

        該模型構(gòu)建活動(dòng)適合在學(xué)生初步了解相關(guān)知識(shí)的基礎(chǔ)上,進(jìn)行深入拓展探究,所以安排在“DNA重組技術(shù)的基本工具”第1課時(shí)后。

        3.1目的基因和質(zhì)粒的再認(rèn)識(shí)

        為提高課堂效率,教師在課前下發(fā)印有模型的學(xué)案,請(qǐng)學(xué)生將目的基因所在DNA和質(zhì)粒DNA沿實(shí)線剪下來(lái),并將質(zhì)粒首尾相連成環(huán)狀備用。課上,在學(xué)生觀察模型后,教師提出問(wèn)題:1什么是目的基因?2目的基因的方向會(huì)不會(huì)影響其表達(dá)?3從DNA中分離出目的基因需具備幾個(gè)限制酶酶切位點(diǎn),水解幾個(gè)磷酸二酯鍵?4目的基因所在DNA被切割后會(huì)斷成幾部分?5質(zhì)粒的化學(xué)本質(zhì)是什么?6質(zhì)粒作為運(yùn)載體必須具備哪些條件?7質(zhì)粒被一種限制酶切割后會(huì)形成幾個(gè)DNA片段,出現(xiàn)幾個(gè)游離的磷酸基團(tuán)?被兩種限制酶切割呢?8如何區(qū)分不同長(zhǎng)度的DNA片段以便找到所需的DNA片段?接著,補(bǔ)充介紹凝膠電泳技術(shù),幫助學(xué)生理解限制酶切割后應(yīng)對(duì)DNA片段進(jìn)行分離和鑒定,以防止切割后的DNA片段再度連接。

        3.2體驗(yàn)重組質(zhì)粒的構(gòu)建

        教師展示圖3,提出問(wèn)題:如何選擇獲取目的基因和切割質(zhì)粒的限制酶,切割后的末端應(yīng)具備什么特點(diǎn)?學(xué)生分析可知,不能選用酶1,因?yàn)闀?huì)破壞標(biāo)記基因,從而確定兩種可行方案:1使用酶2進(jìn)行單酶切;2使用酶2和酶3進(jìn)行雙酶切。

        為了更好地對(duì)比體驗(yàn)單酶切和雙酶切的區(qū)別,學(xué)生先嘗試用酶2切割目的基因所在DNA片段和質(zhì)粒。教師提出問(wèn)題,引導(dǎo)學(xué)生思考:假如借助凝膠電泳技術(shù)分離和純化了目的基因片段,排除了目的基因兩側(cè)的DNA片段。現(xiàn)將很多目的基因和切割后的質(zhì)粒放進(jìn)一個(gè)容器,加入DNA連接酶后會(huì)產(chǎn)生多少種連接方式?學(xué)生兩人一組將各自切割后得到的目的基因和質(zhì)粒放在一起,模擬可能的連接方式。學(xué)生代表利用黑板展示模型匯報(bào),可能的連接方式有6種:目的基因自身環(huán)化、質(zhì)粒自身環(huán)化、目的基因和目的基因連接、運(yùn)載體和運(yùn)載體連接、目的基因和運(yùn)載體連接(其中包括目的基因正連和倒連兩種情況)。接著,啟發(fā)學(xué)生思考:如何減少錯(cuò)誤連接,提高轉(zhuǎn)基因的成功率呢?學(xué)生自然會(huì)想到雙酶切,接著分組模擬體驗(yàn)酶2和酶3切割后的DNA片段連接方式,分析雙酶切(圖4)比單酶切(圖5)的優(yōu)越性。雙酶切排除了目的基因和質(zhì)粒的自身環(huán)化現(xiàn)象,也避免了目的基因倒連,但仍存在目的基因和目的基因、運(yùn)載體和運(yùn)載體相連的情況,所以轉(zhuǎn)基因后需進(jìn)行目的基因的檢測(cè)與鑒定。教師追問(wèn),啟發(fā)學(xué)生思考:如果標(biāo)記基因?yàn)榘逼S青霉素抗性基因,如何鑒定目的基因是否導(dǎo)入?如果標(biāo)記基因?yàn)榘逼S青霉素抗性基因,酶3位于抗四環(huán)素基因中,如何鑒定目的基因是否導(dǎo)入?

        4教學(xué)反思

        該重組DNA分子模型補(bǔ)充設(shè)計(jì)了目的基因的方向性、從一種限制酶識(shí)別序列增加到三種限制酶識(shí)別序列,深入淺出地破解了目的基因正連和倒連、單酶切和雙酶切的差異等難點(diǎn)問(wèn)題,并將限制酶與凝膠電泳技術(shù)有機(jī)銜接,豐富模型內(nèi)涵。教師創(chuàng)設(shè)了驅(qū)動(dòng)深度學(xué)習(xí)的真實(shí)情境,促使學(xué)生主動(dòng)參與中解決有挑戰(zhàn)性的問(wèn)題發(fā)展了科學(xué)思維。手腦并用的真實(shí)體驗(yàn)有利于模型建構(gòu)內(nèi)化為自覺(jué)的思維習(xí)慣和能力。

        參考文獻(xiàn):

        汪林靜.設(shè)計(jì)展板模型突破基因工程的教學(xué)難點(diǎn)[J].生物學(xué)教學(xué),2014,39(9):33.

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