亚洲免费av电影一区二区三区,日韩爱爱视频,51精品视频一区二区三区,91视频爱爱,日韩欧美在线播放视频,中文字幕少妇AV,亚洲电影中文字幕,久久久久亚洲av成人网址,久久综合视频网站,国产在线不卡免费播放

        ?

        乳腺癌中關(guān)鍵基因及靶向治療化合物的篩選*

        2021-09-06 04:25:46劉敏黃健晏嬌艷楊燁袁艷何蕓宋孝晗莫非羅昭遜張姝
        關(guān)鍵詞:數(shù)據(jù)庫分析研究

        劉敏, 黃健,, 晏嬌艷, 楊燁, 袁艷, 何蕓, 宋孝晗, 莫非,, 羅昭遜, 張姝,**

        (1.貴州醫(yī)科大學(xué) 醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)學(xué)院 臨床檢驗(yàn)基礎(chǔ)與血液學(xué)教研室, 貴州 貴陽 550004; 2.貴州醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院 臨床檢驗(yàn)中心, 貴州 貴陽 550004; 3.貴州醫(yī)科大學(xué) 兒科學(xué)院, 貴州 貴陽 550004)

        乳腺癌(breast cancer, BC)是發(fā)生在乳腺上皮組織的惡性腫瘤[1],由于其發(fā)病早期缺乏典型性和特異性臨床癥狀及體征,多數(shù)患者臨床確診時已發(fā)展至中晚期,成為導(dǎo)致女性BC死亡的最大原因[2]。目前臨床診斷BC常用的病理學(xué)、影像學(xué)及血清腫瘤標(biāo)志物等方法存在的某些不足,限制了它們在BC診斷中的應(yīng)用。隨著基因組技術(shù)的發(fā)展,生物信息學(xué)廣泛應(yīng)用于基因表達(dá)譜分析,可以有效地識別差異表達(dá)基因(differentially expressed genes, DEGs)及其作用的相關(guān)通路,也發(fā)現(xiàn)某些疾病特異性的生物標(biāo)志物[3-4]。因此,本研究利用生物信息學(xué)相關(guān)工具從基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(gene expression omnibus,GEO)中檢索并整合分析與BC相關(guān)的數(shù)據(jù)集獲得DEGs,預(yù)測其功能及在BC中的作用;選取乳腺外科30對BC組織及癌旁組織,從mRNA水平和蛋白質(zhì)層面驗(yàn)證其表達(dá),同時采用Cmap (connectivity map, Cmap)數(shù)據(jù)庫分析和挖掘與DEGs具有相互作用的候選化合物,以期為研發(fā)治療BC的潛在化合物提供新的思路。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1數(shù)據(jù)集 從GEO數(shù)據(jù)庫下載3個獨(dú)立的BC微陣列數(shù)據(jù)集GSE109169、GSE42568和GSE15852。GSE109169數(shù)據(jù)集基于GPL5175(HuEx-1_0-st) Affymetrix Human Exon 1.0 ST Array[transcript (gene) version] 平臺,包括25例BC組織樣本和25例正常乳腺組織;GSE42568中有104例BC組織樣本和17例正常乳腺組織,是基于GPL570(HG-U133_Plus_2) Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array平臺檢測的;GSE15852數(shù)據(jù)集基于GPL96(HG-U133A) Affymetrix Human Genome U133A Array平臺,包含的BC組織樣本和正常乳腺組織均為43例。

        1.1.2樣本收集 收集2015年1月—2018年12月乳腺外科30對BC組織及癌旁組織(距腫瘤邊緣2~5 cm),均為女性,36~69歲、平均55.5歲,所有患者均經(jīng)病理學(xué)分析證實(shí)為BC,且為初次診斷。

        1.1.3主要試劑及儀器 TRIzol試劑及引物合成(上海生工生物工程有限公司),PrimeScriptTMⅡ 1st Strand cDNA Synthesis Kit及實(shí)時熒光定量PCR試劑[寶日醫(yī)生物技術(shù)(北京)有限公司],RIPA裂解液、BCA試劑盒及蛋白Marker(北京索萊寶科技有限公司),兔抗人的11個關(guān)鍵基因(Hub)基因編碼的蛋白一抗(abcam公司,基因中英文名見表1),兔抗人GAPDH一抗(沈陽萬類生物科技有限公司),羊抗兔二抗(Proteintech公司)。普通PCR儀(美國Thermo Scientific公司),實(shí)時熒光定量PCR儀(Roche),Western blot電泳儀、轉(zhuǎn)印系統(tǒng)、曝光儀[伯樂生命醫(yī)學(xué)產(chǎn)品(上海)有限公司]。

        1.2 方法

        1.2.1DEGs的識別 通過GEO2R篩選和鑒定BC組織和正常乳腺組織之間滿足條件的DEGs,以P<0.05和|log2FC|≥1為截斷值,其中l(wèi)og2FC<-1的DEGs認(rèn)為是下調(diào)DEGs,log2FC≥1的DEGs認(rèn)為是上調(diào)DEGs。使用Venn在線工具(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/)對3個獨(dú)立數(shù)據(jù)集中上調(diào)和下調(diào)的DEGs進(jìn)行可視化,并將3者交集部分的重疊DEGs用于后續(xù)分析。

        1.2.2DEGs的富集分析 利用DAVID數(shù)據(jù)庫(版本6.8,https://david.ncifcrf.gov/)[5]進(jìn)行基因本體論(gene ontology, GO)功能和京都基因與基因組百科全書(kyoto encyclopedia of genes and genome, KEGG)富集分析,了解重疊DEGs的生物學(xué)功能和作用的途徑。通過EXCEL和R軟件包“ggplot2”對結(jié)果進(jìn)行可視化,P<0.05認(rèn)為差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。

        表1 11個Hub基因中英名全稱Tab.1 Identified 11 Hub genes

        1.2.3蛋白互作(protein protein interaction, PPI)網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建與模塊化分析 將篩選出的所有DEGs導(dǎo)入到STRING中進(jìn)行蛋白質(zhì)相互作用分析,采用Cytoscape (https://cytoscape.org/)軟件將PPI網(wǎng)絡(luò)可視化后,使用MCODE插件篩選PPI網(wǎng)絡(luò)中score>10的模塊,此外,將該模塊中Degree≥10的基因作為后續(xù)研究對象。

        1.2.4Hub基因的生存分析與驗(yàn)證 (1)以Kaplan Meier Plotter(http://kmplot.com/analysis/)在線工具為基礎(chǔ),評價Hub基因在BC患者中的預(yù)后價值,并繪制Kaplan Meier生存曲線;利用基因表達(dá)譜交互分析(gene expression profiling interactive analysis, GEPIA)數(shù)據(jù)庫從基因?qū)用骝?yàn)證Hub基因在BC組織和正常乳腺組織中的表達(dá)情況,并將結(jié)果顯示在箱線圖中。(2)逆轉(zhuǎn)錄-實(shí)時熒光定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(quantitative and reverse transcription polymerase chain reaction, qRT-PCR)驗(yàn)證11個Hub基因在BC組織和癌旁組織中的表達(dá):TRIzol法提取BC組織及癌旁組織總RNA,并使用 Nanodrop 2000 進(jìn)行定量及純度測定,所得RNA均于-80 ℃保存;使用PrimeScriptTMⅡ 1st Strand cDNA Synthesis Kit將總RNA逆轉(zhuǎn)錄為cDNA后用于qRT-PCR,所用的引物序列見表2。(3)Western blot驗(yàn)證11個Hub基因編碼的蛋白在BC組織和癌旁組織中的表達(dá):RIPA裂解BC組織及癌旁組織并提取總蛋白,BCA法測定蛋白濃度;使用SDS-PAGE凝膠進(jìn)行電泳,200 mA恒定電流轉(zhuǎn)膜2 h,5%脫脂牛奶封閉2 h,使用相應(yīng)的一抗在4 ℃條件下孵育過夜,TBST洗膜3次后,將二抗于室溫下孵育1 h,孵育完成后TBST洗膜3次進(jìn)行曝光。

        表2 引物序列Tab.2 Primer sequences

        1.2.5Hub基因編碼蛋白的免疫組織化學(xué)分析 (1)利用人類蛋白質(zhì)圖譜(the human protein atlas, HPA)數(shù)據(jù)庫:明確Hub基因編碼的蛋白在BC組織和正常乳腺組織中的表達(dá),并獲得具有代表性的免疫組織化學(xué)染色圖像。(2)免疫組織化學(xué)染色分析11個Hub基因編碼蛋白在BC組織和癌旁組織中的表達(dá)情況:將BC組織和癌旁組織用石蠟包埋,制成4 mm厚的切片,將切片脫臘、加熱修復(fù)抗原,使用山羊血清進(jìn)行封閉,一抗4 ℃過夜、PBS清洗后加二抗37 ℃孵育30 min,使用二氨基聯(lián)苯胺(DAB)顯色,蘇木素復(fù)染30 s使細(xì)胞核顯色、脫水、中性樹膠封片,最后觀察11個Hub基因編碼蛋白的表達(dá)。

        1.2.6候選化合物的鑒定 將篩選出的DEGs上傳到Cmap數(shù)據(jù)庫(https://portals.broadinstitute.org/cmap)。在排列的結(jié)果中,分?jǐn)?shù)從-1~1表示藥物與上傳DEGs之間的相關(guān)性;負(fù)值高的化合物表明其與DEGs的相關(guān)性越高,并且更有可能用于治療[6]。本研究保留P<0.05且值為-0.8~-1的化合物,并將這些化合物導(dǎo)入PubChem Compound網(wǎng)站繪制它們的三維結(jié)構(gòu)。

        1.3 統(tǒng)計學(xué)方法

        采用SPSS 24.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計分析,用非參數(shù)檢驗(yàn)分析Hub基因或其編碼蛋白在BC中的表達(dá),Kaplan-MeierPlotter數(shù)據(jù)庫分析Hub基因與BC患者預(yù)后的關(guān)系,P<0.05差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 DEGs篩選結(jié)果

        共篩選出294(110個上調(diào)、184個下調(diào))、2 854(1 345個上調(diào)、1 509個下調(diào))及818個(353個上調(diào)、465個下調(diào))DEGs,這些DEGs在BC組織和正常乳腺組織中表達(dá)比較,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(圖1A~C)。經(jīng)Venn在線工具取交集,共鑒定出115個重疊的DEGs,其中26個上調(diào)、89個下調(diào)(圖1D~E)。

        注:A~C分別為GSE15852(A),GSE42568(B)和GSE109169(C)的DEGs的火山圖,D~E為3個數(shù)據(jù)集中重疊DEGs的Venn圖,包括26個上調(diào)的DEGs (D)和89個下調(diào)的DEGs (E)。圖1 正常乳腺組織與BC組織中DEGs篩選結(jié)果Fig.1 Screening results of DEGs in normal breast tissue and BC tissue

        2.2 DEGs的功能富集分析

        2.2.1分子功能(molecular function, MF) 上調(diào)的基因主要富集在蛋白質(zhì)結(jié)合和染色質(zhì)結(jié)合,下調(diào)的基因主要富集在肝素結(jié)合和酮類固醇單加氧酶活性等。

        2.2.2細(xì)胞組分(cellular component, CC) 上調(diào)的基因主要涉及紡錘體微管、微管細(xì)胞骨架和核染色質(zhì)等,下調(diào)的基因主要涉及細(xì)胞外間隙和細(xì)胞外基質(zhì)等。

        2.2.3生物過程(biological process, BP) 上調(diào)的基因主要富集在細(xì)胞有絲分裂G2/M期過渡、DNA復(fù)制、細(xì)胞增殖的正調(diào)控和有絲分裂姐妹染色單體分離涉及的轉(zhuǎn)錄調(diào)控等,下調(diào)的基因主要富集在血管生成、磷脂酰肌醇3-激酶信號的正調(diào)控和肽基酪氨酸磷酸化的正調(diào)控中(圖2A~B)。

        2.2.4KEGG pathway結(jié)果 上調(diào)的DEGs富集在2條通路中(P>0.05,圖2C),下調(diào)的DEGs主要富集在PPAR signaling pathway(hsa03320)、AMPK signaling pathway(hsa04152)和Adipocytokine signaling pathway(hsa04920)等通路中(圖2D)。

        注:A~B分別為上、下調(diào)DEGs顯著富集的GO條目,C~D分別為上、下調(diào)DEGs顯著富集的KEGG條目,DEGs為差異表達(dá)基因,GO為基因本體論,KEGG為京都基因和基因組百科全書。圖2 BC中上調(diào)和下調(diào)差異表達(dá)基因的GO與KEGG富集結(jié)果Fig.2 GO annotation and KEGG enrichment results of up-regulated and down-regulated DEGS in BC

        2.3 PPI網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建與Hub基因的識別

        構(gòu)建115個重疊DEGs的PPI網(wǎng)絡(luò),共包含115個節(jié)點(diǎn)和368條邊(圖3A),此外,識別了MCODE得分>10的子模塊(圖3B),該模塊包含20個點(diǎn),94條邊。同時,用模塊中Degree>10的11個Hub基因繪制PPI網(wǎng)絡(luò)圖(表1,圖3C),并將以上基因作為Hub基因進(jìn)行進(jìn)一步的生存分析。

        注:A為3個數(shù)據(jù)集的DEGs構(gòu)成的PPI網(wǎng)絡(luò),B為MCODE得分>10的子模塊,紅色節(jié)點(diǎn)表示上調(diào)的DEGs,藍(lán)色節(jié)點(diǎn)表示下調(diào)的DEGs,C為子模塊中Degree>10的Hub基因,DEGs為差異表達(dá)基因,PPI為蛋白互作。圖3 蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建和Hub基因的鑒定Fig.3 Construction of protein-protein interaction network and identification of Hub genes

        2.4 Hub基因mRNA和蛋白的表達(dá)及生存分析

        與癌旁組織或正常乳腺組織比較,BC組織中上述11個HubmRNA的表達(dá)上調(diào),且其編碼的蛋白表達(dá)也上調(diào),這與GEPIA數(shù)據(jù)庫分析所得結(jié)果趨勢一致(P<0.05,圖4A~C)。如圖4D所示,Kaplan-Meier-Plotter分析表明11個Hub基因均與BC患者的總體生存期(overall survival, OS)相關(guān)(P<0.05)。

        注:A為qRT-PCR檢測EZH2在BC及相應(yīng)的癌旁組織中的表達(dá),B為EZH2的Western blot表征結(jié)果,C為GEPIA數(shù)據(jù)庫中EZH2的表達(dá),紅色代表BC組織,灰色代表正常乳腺組織,D為EZH2的生存曲線;(1)與癌旁組比較,P<0.05。圖4 BC患者中11個Hub基因及其編碼蛋白的驗(yàn)證結(jié)果及生存曲線(以EZH2為例)Fig.4 Verification results and survival curves of 11 Hub genes and their encoded proteins in BC patients (take EZH2 as an example)

        2.5 Hub基因編碼的蛋白免疫組織化學(xué)分析

        免疫組織化學(xué)染色結(jié)果顯示,11個Hub基因編碼的蛋白在正常乳腺組織中呈現(xiàn)弱染色,而在BC組織中呈現(xiàn)強(qiáng)染色,這與HPA數(shù)據(jù)庫觀察到的11個Hub基因編碼的蛋白表達(dá)情況一致(圖5A~B)。

        注:A為EZH2免疫組化結(jié)果,B為HPA數(shù)據(jù)庫所得EZH2的免疫組化結(jié)果;(1)與BC組比較,P<0.05。 圖5 HPA數(shù)據(jù)庫及免疫組化分析11個Hub基因的表達(dá)(以EZH2為例)Fig.5 HPA Database and Immunohistochemical analysis of the expression of 11 Hub genes and their encoded proteins(take EZH2 as an example)

        2.6 候選化合物的鑒定

        基于Cmap數(shù)據(jù)庫的預(yù)測,本研究以P<0.05和連接性分?jǐn)?shù)為-8~-1為截斷標(biāo)準(zhǔn),共獲得6個化合物,分別為DL-thiorphan、repaglinide、phenoxybenzamine、cortisone、rottlerin和gliclazide (表3),這些化合物的負(fù)值較高,提示這些化合物具有逆轉(zhuǎn)BC相關(guān)的DEGs的能力。此外,圖6中展示了這些排名靠前的化合物的3D分子結(jié)構(gòu)示意圖。

        表3 Cmap數(shù)據(jù)庫識別的潛在的具有抗BC功能的化合物Tab.3 Potential compounds with anti-BC function identified by Cmap database

        注:A為DL-thiorphan,B為Repaglinide,C為Phenoxybenzamine,D為Cortisone,E為Rottlerin,F(xiàn)為Gliclazide。圖6 Cmap數(shù)據(jù)庫分析獲得的6個候選化合物的3D化學(xué)構(gòu)象Fig.6 3D chemical conformation of 6 candidate compounds obtained by Cmap database analysis

        3 討論

        BC是女性最為常見的惡性腫瘤之一,且發(fā)病率逐年增長,成為威脅女性健康的“頭號殺手”,BC的診斷、治療及預(yù)后已成為當(dāng)代學(xué)者研究的熱點(diǎn)。為了解BC患者DEGs的潛在生物學(xué)功能及它們與患者預(yù)后的關(guān)系,本研究利用綜合的生物信息學(xué)分析篩選出115個重疊的DEGs,其中26個上調(diào)、89個下調(diào)。為挖掘DEGs的關(guān)聯(lián)性及其中的Hub基因,本研究進(jìn)行了PPI分析和模塊分析,共獲得11個Hub基因(SMC4、GINS2、CDC45、EZH2、RRM2、MELK、PRC1、CDK1、HMMR、TOP2A和AURKA)。利用GEPIA數(shù)據(jù)庫分析這些Hub基因的表達(dá)差異,通過qRT-PCR進(jìn)行驗(yàn)證,發(fā)現(xiàn)它們在BC中的表達(dá)均上調(diào),這一結(jié)果與GEO數(shù)據(jù)庫中的趨勢一致,本研究通過HPA數(shù)據(jù)庫、Western blot和免疫組織化學(xué)染色進(jìn)一步觀察并驗(yàn)證上述基因編碼的蛋白質(zhì)在BC中的表達(dá),也呈現(xiàn)相同的表達(dá)趨勢。為進(jìn)一步研究其生物學(xué)功能和作用途徑,本研究通過DAVID數(shù)據(jù)庫對這些重疊的DEGs進(jìn)行GO與KEGG富集分析,結(jié)果表明它們富集的GO條目主要有蛋白質(zhì)結(jié)合(protein binding)、肝素結(jié)合(heparin binding)、細(xì)胞增殖的正調(diào)控和血管生成等方面;KEGG pathway分析結(jié)果主要包含p53信號通路、PPAR信號通路(hsa03320)和AMPK信號通路(hsa04152),研究表明這些通路與BC的發(fā)生發(fā)展有關(guān)[7-9]。以上結(jié)果說明DEGs可能通過這些信號通路來發(fā)揮作用。

        本研究發(fā)現(xiàn)11個Hub基因與腫瘤密切相關(guān),其中EZH2可以調(diào)控蛋白質(zhì)的磷酸化過程。EZH2是PRC2的核心成分,在早期發(fā)育中具有重要作用,其失調(diào)與各種腫瘤的發(fā)生密切相關(guān),可通過組蛋白修飾和沉默表觀遺傳基因而促進(jìn)上皮惡性腫瘤[10]。Moore等[11]發(fā)現(xiàn)EZH2通過磷酸化p38蛋白,促進(jìn)BC轉(zhuǎn)移。Zheng等[12]發(fā)現(xiàn)EZH2在口腔鱗狀細(xì)胞癌中表達(dá)上調(diào),過表達(dá)的EZH2通過在pY705位點(diǎn)磷酸化STAT3,減少了FoxO1的表達(dá),促進(jìn)口腔鱗癌細(xì)胞上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化、遷移和侵襲。李朝夕等[13]的結(jié)果顯示EZH2與BC密切相關(guān),相對于癌旁組織,EZH2蛋白在BC組織中的表達(dá)上調(diào),其可能是BC細(xì)胞增殖、浸潤和轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵分子。GO分析表明MELK、CDK1、HMMR和AURKA這4個基因均與細(xì)胞周期調(diào)控相關(guān),其中,MELK是一種新的癌基因,屬于絲氨酸/蘇氨酸激酶Snfl/AMPK家族中的成員。大量研究表明,MELK是細(xì)胞周期調(diào)控因子,對有絲分裂過程至關(guān)重要[14]。Tang等[15]通過Transwell實(shí)驗(yàn)和Western blot發(fā)現(xiàn)MELK可能通過上調(diào)Twsit1、Slug、MMP7和N-cadherin促進(jìn)肺腺癌的遷移和侵襲,此外,他們還發(fā)現(xiàn)抑制MELK的表達(dá)可誘導(dǎo)肺癌細(xì)胞的凋亡。CDK1的激活可以磷酸化靶蛋白并產(chǎn)生相應(yīng)的生理效應(yīng),如調(diào)節(jié)細(xì)胞周期和促進(jìn)細(xì)胞增殖。李振淼等[16]發(fā)現(xiàn)miR-383通過下調(diào)CDK1等細(xì)胞周期相關(guān)蛋白的表達(dá)抑制小鼠卵泡顆粒細(xì)胞的增殖。HMMR是一種致癌基因,在多種腫瘤中高表達(dá),不僅在腫瘤的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮重要作用,還可以促進(jìn)肺腺癌的轉(zhuǎn)移[17]。AURKA屬于絲氨酸/蘇氨酸激酶家族,它作為一種致癌基因,在多種癌癥中高表達(dá),如腎上腺皮質(zhì)癌、肝細(xì)胞癌和前列腺癌等。研究報道稱AURKA的上調(diào)可促進(jìn)細(xì)胞增殖,與膀胱癌的不良預(yù)后相關(guān)[18]。

        本研究還發(fā)現(xiàn)GINS2、RRM2和CDC45這3個基因均與DNA的復(fù)制或修復(fù)相關(guān)。GINS2是GINS復(fù)合物的成員,在DNA復(fù)制過程中發(fā)揮重要作用[19]。研究報道稱GINS2在多種侵襲性腫瘤中表達(dá)上調(diào),Yu等[20]通過綜合的生物信息學(xué)分析表明GINS2可作為BC患者預(yù)后的生物標(biāo)志物,這與本研究的結(jié)果一致。RRM2是一種參與DNA修復(fù)和合成的限速酶,在Mazzu等[21]的研究中,他們在前列腺癌細(xì)胞中敲低RRM2,發(fā)現(xiàn)其致癌能力受到抑制,而過表達(dá)RRM2則促進(jìn)前列腺癌細(xì)胞的上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化,此外,他們還在臨床隊列中證實(shí)了RRM2的高表達(dá)與前列腺癌患者的不良預(yù)后相關(guān)。CDC45作為DNA復(fù)制的起始因子,研究表明在非小細(xì)胞肺癌(non-small-cell lung cancer,NSCLC)中,CDC45的下調(diào)誘導(dǎo)G2/M期細(xì)胞周期阻滯并在體外和體內(nèi)抑制細(xì)胞增殖,它可能是NSCLC中的致癌基因[22]。此外,SMC4、PRC1和TOP2A均被報道在細(xì)胞分裂過程中發(fā)揮重要作用。SMC4是SMC家族中的一員,在細(xì)胞分裂中起著至關(guān)重要的作用[23],研究表明,SMC4在舌鱗癌細(xì)胞、結(jié)直腸癌、肝癌和BC等多種癌癥中表達(dá)上調(diào)。鄭世楊等[24]的研究表明敲低SMC4基因的表達(dá)可抑制MDA-MB-231細(xì)胞的增殖、遷移及侵襲能力,其機(jī)制可能與PI3K/AKT信號通路的激活相關(guān)。PRC1蛋白是一種微管相關(guān)蛋白,與細(xì)胞的有絲分裂相關(guān),它被報道在包括宮頸癌和BC在內(nèi)的多種癌癥中表達(dá)上調(diào),且韓兆東等[25]發(fā)現(xiàn)PRC1的高表達(dá)與前列腺癌的惡性程度及患者的預(yù)后相關(guān),但其具體機(jī)制有待進(jìn)一步探索。TOP2A在DNA合成,轉(zhuǎn)錄以及有絲分裂過程中染色體分離時起重要作用[26]。TOP2A基因位于17q12-21,其表達(dá)與細(xì)胞增殖[27]和細(xì)胞周期[28]有關(guān)。

        由于新藥開發(fā)是一個耗時、高風(fēng)險的過程,在這種情況下,通過基因表達(dá)譜技術(shù)尋找抗BC的藥物靶點(diǎn),利用藥物重新定位技術(shù)探索現(xiàn)有藥物的新療效,可成為提高藥物開發(fā)投入產(chǎn)出比、降低失敗風(fēng)險的有效措施[29]。本研究共鑒定了6個候選的化合物,其中Rottlerin是一種從天然植物中提取的多酚類化合物,具有抗腫瘤活性,常用作PKCδ的特異性抑制劑。研究表明抑制基質(zhì)金屬蛋白酶(matrix metalloproteinase, MMP)的表達(dá)可以抑制癌癥的轉(zhuǎn)移[30]。Lin等[31]發(fā)現(xiàn)使用Rottlerin阻斷PKCδ的表達(dá)可減弱MMP-9的表達(dá)并使細(xì)胞遷移能力減低,從而達(dá)到治療BC的目的。臨床上對于三陰性BC患者常選擇順鉑作為化療藥物,Pabla在順鉑誘導(dǎo)的腎損傷的研究中發(fā)現(xiàn)Rottlerin可以改善這一現(xiàn)象[32],該藥是否可用于減弱順鉑對BC患者所致的腎損傷還有待進(jìn)一步研究?;谶@些觀察結(jié)果,本研究認(rèn)為Rottlerin有望成為治療BC的候選化合物。其他5個化合物在BC中的作用目前尚未報道,其藥理作用有待進(jìn)一步驗(yàn)證。

        綜上所述,本研究利用生物信息學(xué)和實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證鑒定出的11個Hub基因可作為BC患者預(yù)后的生物靶標(biāo),其中GINS2、RRM2和CDK1在DNA復(fù)制中發(fā)揮重要作用,MELK、CDC45、HMMR和AURKA均參與細(xì)胞周期的調(diào)控,SMC4、PRC1和TOP2A在細(xì)胞分裂中發(fā)揮重要作用,Rottlerin有望成為治療BC的候選化合物,但其作用的具體機(jī)制仍需要進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。

        猜你喜歡
        數(shù)據(jù)庫分析研究
        FMS與YBT相關(guān)性的實(shí)證研究
        遼代千人邑研究述論
        隱蔽失效適航要求符合性驗(yàn)證分析
        視錯覺在平面設(shè)計中的應(yīng)用與研究
        科技傳播(2019年22期)2020-01-14 03:06:54
        EMA伺服控制系統(tǒng)研究
        電力系統(tǒng)不平衡分析
        電子制作(2018年18期)2018-11-14 01:48:24
        數(shù)據(jù)庫
        財經(jīng)(2017年2期)2017-03-10 14:35:35
        電力系統(tǒng)及其自動化發(fā)展趨勢分析
        數(shù)據(jù)庫
        財經(jīng)(2016年15期)2016-06-03 07:38:02
        數(shù)據(jù)庫
        財經(jīng)(2016年3期)2016-03-07 07:44:46
        久久久久亚洲av无码专区体验| 亚洲一区二区三区偷拍厕所| 欧美丰满熟妇xxxx性ppx人交| 欧美男生射精高潮视频网站| 好看的欧美熟妇www在线| 国产久热精品无码激情 | 99久久国产综合精品女乱人伦| 亚洲在线一区二区三区四区| 国产亚洲一本二本三道| 人妖一区二区三区四区 | 国产午夜精品视频在线观看| 日本天堂免费观看| 99久久婷婷国产综合精品电影| 亚洲综合中文字幕乱码在线| 久久99热精品免费观看麻豆| 精品熟女视频一区二区三区国产| 国产精品国产高清国产专区| 成人毛片一区二区| 女性自慰网站免费看ww| 亚洲国产天堂av成人在线播放| 亚洲精品一区二区高清| 久久婷婷人人澡人人爽人人爱| 亚洲精品国产综合一线久久| 国产精品午夜福利亚洲综合网| 精品久久久久久综合日本| 久久9精品区-无套内射无码| 2019年92午夜视频福利| 999精品免费视频观看| 在线观看国产自拍视频| 丰满精品人妻一区二区 | 草逼视频免费观看网站| 青青青爽在线视频观看| 人人添人人澡人人澡人人人人| 小12箩利洗澡无码视频网站| 一区二区三区夜夜久久| 一区二区三区国产高清视频| 扒开腿狂躁女人爽出白浆 | 四虎国产精品视频免费看| 91精品国产综合久久青草| 中文字幕丰满人妻av| 亚洲av福利无码无一区二区|