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        淺談包含突變位點(diǎn)的生物序列權(quán)利要求的支持性審查

        2021-08-23 03:13:51段珊
        錦繡·中旬刊 2021年10期
        關(guān)鍵詞:衣殼支持性殘基

        段珊

        摘要:本文從一件復(fù)審案例出發(fā),介紹了其中包含突變位點(diǎn)的生物序列的權(quán)利要求的支持性審查過(guò)程。包括用“包含”限定突變位點(diǎn),是否為開(kāi)放式限定的評(píng)判,以及將經(jīng)突變改造、功能活性得以改善的蛋白所包含的突變應(yīng)用于其他同類(lèi)蛋白的預(yù)期性尺度的評(píng)判。

        關(guān)鍵詞:生物序列;支持

        前言

        我國(guó)專(zhuān)利法第 26 條第 4 款規(guī)定,權(quán)利要求應(yīng)當(dāng)以說(shuō)明書(shū)為依據(jù),即所屬領(lǐng)域的技術(shù)人員,根據(jù)說(shuō)明書(shū)中的技術(shù)教導(dǎo)及其掌握的本領(lǐng)域中常規(guī)技術(shù)手段能夠得到或概括得出權(quán)利要求所限定的技術(shù)方案,也就是權(quán)利要求需要滿(mǎn)足“支持性”[1]。生物領(lǐng)域本身的復(fù)雜性導(dǎo)致判斷生物序列權(quán)利要求能否得到說(shuō)明書(shū)的支持存在一定的復(fù)雜性和特殊性。以下將結(jié)合一件復(fù)審案例,介紹其支持性的審查過(guò)程,以期對(duì)相關(guān)領(lǐng)域的支持性審查提供一定的借鑒和參考。

        一、案例介紹

        基本案情:

        案例涉及高轉(zhuǎn)導(dǎo)效率的rAAV載體、組合物及其使用方法。該案的發(fā)明點(diǎn)在于提供了AAV衣殼蛋白,其包含對(duì)VP3區(qū)中表面暴露之部分氨基酸或其組合的修飾,還提供了相應(yīng)的rAAV病毒體、核酸分子和rAAV載體,與野生型rAAV載體和病毒體相比,本案的rAAV載體和病毒體具有提高的轉(zhuǎn)導(dǎo)多種目的細(xì)胞、組織和器官的效率。

        前審階段以權(quán)利要求1-18不符合專(zhuān)利法第26條第4款的規(guī)定為由駁回了本申請(qǐng),駁回針對(duì)的權(quán)利要求1如下:

        1. 一種經(jīng)修飾的AAV衣殼蛋白:

        (a)其中所述經(jīng)修飾的AAV衣殼蛋白為經(jīng)修飾的AAV2衣殼蛋白,其包含對(duì)應(yīng)于SEQ ID NO:2的野生型AAV2衣殼蛋白之K490、K527、K549或K556位置上的谷氨酸(E)氨基酸殘基;

        (b)其中所述經(jīng)修飾的AAV衣殼蛋白為經(jīng)修飾的AAV2衣殼蛋白,其包含對(duì)應(yīng)于SEQ ID NO:2的野生型AAV2衣殼蛋白之K532位置上的精氨酸(R)氨基酸殘基;

        (c)其中所述經(jīng)修飾的AAV衣殼蛋白為經(jīng)修飾的AAV2衣殼蛋白,其包含對(duì)應(yīng)于SEQ ID NO:2的野生型AAV2衣殼蛋白之K544和K556位置上的谷氨酸(E)氨基酸殘基;或

        (d)其中所述經(jīng)修飾的AAV衣殼蛋白為經(jīng)修飾的AAV8衣殼蛋白,其包含對(duì)應(yīng)于SEQ ID NO:8的野生型AAV8衣殼蛋白之K547或K569位置上的谷氨酸(E)氨基酸殘基;并且

        其中包含所述經(jīng)修飾的AAV衣殼蛋白的載體的轉(zhuǎn)導(dǎo)效率高于對(duì)應(yīng)的未經(jīng)修飾的野生型AAV載體。

        駁回決定主要認(rèn)為本申請(qǐng)未證明對(duì)于任意的AAV2或AAV8,只需包含所列舉的任意單點(diǎn)突變,均可獲得使包含所述經(jīng)修飾的AAV衣殼蛋白載體的轉(zhuǎn)導(dǎo)效率高于野生型AAV載體的效果。僅能認(rèn)可SEQ ID NO:2的野生型AAV2衣殼蛋白之K527E、K532R、K490E、K549E或K556E;SEQ ID NO:8的野生型AAV8衣殼蛋白之K547E、K569E的單點(diǎn)突變,或SEQ ID NO:2的野生型AAV2衣殼蛋白之K544/K556E的雙點(diǎn)突變所獲得的AVV衣殼蛋白能夠得到說(shuō)明書(shū)的支持?;谏鲜隼碛烧J(rèn)為權(quán)利要求1得不到說(shuō)明書(shū)的支持。

        申請(qǐng)人提出了復(fù)審請(qǐng)求,認(rèn)為對(duì)于每一條要求保護(hù)的經(jīng)修飾的AAV衣殼蛋白,權(quán)利要求均限定了突變的賴(lài)氨酸位點(diǎn)以及相應(yīng)的突變成的氨基酸,對(duì)于所限定的突變信息說(shuō)明書(shū)記載了包含這些位點(diǎn)的突變蛋白及其改善的活性。根據(jù)同類(lèi)蛋白結(jié)構(gòu)、活性上的相似性,本領(lǐng)域技術(shù)人員可以合理預(yù)期權(quán)利要求1所述經(jīng)突變的AAV衣殼蛋白會(huì)具有相比未突變時(shí)的相應(yīng)蛋白改善的轉(zhuǎn)導(dǎo)效率。認(rèn)為權(quán)利要求1可以得到說(shuō)明書(shū)的支持。

        復(fù)審合議組則認(rèn)為權(quán)利要求1中“包含”屬于開(kāi)放式限定,意味著除權(quán)利要求中所限定的對(duì)應(yīng)位置的氨基酸殘基外,AAV2衣殼蛋白上其他位置的氨基酸殘基是不確定的。作為AAV病毒包裝所必需的結(jié)構(gòu)蛋白衣殼蛋白,維持特定的結(jié)構(gòu)功能域?qū)τ谄湔9δ艿陌l(fā)揮是重要的。本申請(qǐng)說(shuō)明書(shū)并未表明任意序列的AAV2衣殼蛋白與權(quán)利要求所限定的這些單突變或雙突變的組合仍能發(fā)揮與本申請(qǐng)SEQ ID NO:2制備的突變蛋白同樣的效果。本領(lǐng)域技術(shù)人員難以預(yù)料不同突變位點(diǎn)的組合會(huì)導(dǎo)致多肽的空間結(jié)構(gòu)發(fā)生怎樣的變化,以及會(huì)對(duì)衣殼蛋白行使正常的病毒包裝功能產(chǎn)生怎樣的影響。另一方面,從眾多序列、功能不確定的多肽中篩選出具有不影響衣殼蛋白結(jié)構(gòu)和病毒包裝的AAV2衣殼蛋白變體序列,進(jìn)一步篩選出轉(zhuǎn)導(dǎo)效率提高的多肽還需要本領(lǐng)域技術(shù)人員付出大量的勞動(dòng)。故權(quán)利要求1得不到說(shuō)明書(shū)的支持。

        最終申請(qǐng)人將權(quán)利要求中的修飾蛋白進(jìn)一步限定為本申請(qǐng)實(shí)施例驗(yàn)證的具體蛋白,認(rèn)為修改后的權(quán)利要求可以得到說(shuō)明書(shū)的支持。合議組認(rèn)為所指出的權(quán)利要求得不到說(shuō)明書(shū)支持的缺陷已不存在,撤銷(xiāo)了駁回決定。

        結(jié)語(yǔ)

        目前,對(duì)于用“包含”或“具有”限定生物序列,通常認(rèn)為其屬于開(kāi)放式限定,意味著在所述序列的兩端還可以添加任意數(shù)量、種類(lèi)的氨基酸或核苷酸殘基,認(rèn)為這一限定方式得不到說(shuō)明書(shū)的支持。然而,本案權(quán)利要求1是用“包含”限定氨基酸位點(diǎn),而非氨基酸序列,故在審查實(shí)踐中,對(duì)上述撰寫(xiě)方式存在兩種解讀,一種是認(rèn)為“包含”意味著所限定的蛋白中其他位置的氨基酸殘基是不確定的,一種是認(rèn)為“包含”意味著僅包含所限定的具體位點(diǎn)的氨基酸殘基突變,其他位置的氨基酸殘基是確定的。本案駁回決定、前置審查意見(jiàn)和復(fù)審?fù)ㄖ獣?shū)均認(rèn)為以“包含”的開(kāi)放式限定其上帶有的突變位點(diǎn),實(shí)質(zhì)上涵蓋了除實(shí)施例驗(yàn)證的具有相對(duì)于對(duì)應(yīng)野生型AAV載體轉(zhuǎn)導(dǎo)效率提高以外的其他修飾的AAV載體的技術(shù)方案。以上案例可對(duì)判定“包含”限定突變位點(diǎn)的技術(shù)方案能否得到說(shuō)明書(shū)的支持提供一定的借鑒和參考。

        此外,對(duì)于多數(shù)經(jīng)突變改造功能活性得以改善的蛋白而言,維持特定的結(jié)構(gòu)功能域?qū)τ谄湔9δ艿陌l(fā)揮是重要的,本領(lǐng)域技術(shù)人員難以預(yù)料不同突變位點(diǎn)的組合會(huì)導(dǎo)致多肽的空間結(jié)構(gòu)發(fā)生怎樣的變化,以及對(duì)蛋白的最終功能會(huì)產(chǎn)生怎樣的影響,在此基礎(chǔ)上進(jìn)一步篩選出具有改善功能的蛋白還需要本領(lǐng)域技術(shù)人員付出大量的勞動(dòng),在未對(duì)蛋白的結(jié)構(gòu)信息進(jìn)行清楚限定的情況下不能得到說(shuō)明書(shū)的支持。

        參考文獻(xiàn)

        [1]中華人民共和國(guó)國(guó)家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局.專(zhuān)利審查指南[M].北京:知識(shí)產(chǎn)權(quán)出版社,2010.

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