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        第29 屆國際生物學(xué)奧林匹克競賽試題實(shí)驗(yàn)2 演化、生態(tài)學(xué)和行為學(xué)

        2021-07-01 03:24:52張雁云范六民
        生物學(xué)通報(bào) 2021年7期
        關(guān)鍵詞:培養(yǎng)皿答題菌落

        張 立 張雁云 范六民 周 潔 楊 揚(yáng)

        (1 北京師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 北京 100875 2 北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 北京 100871 3 華中師范大學(xué)第一附屬中學(xué) 湖北武漢 430223 4 清華大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 北京 100084)

        總分:100 分

        時間:90 min

        一般信息

        ●總分:100 分。

        ●考試時間:90 min。

        ●請將你的學(xué)生號碼勾選在標(biāo)題頁的框中。

        ●請將所有問題的答案寫在所提供的、獨(dú)立的答題紙上。在試卷上的答案一律無效。

        ●為了使用黃色的旗幟(在你的桌子上的標(biāo)志),只需將其置于桌子左側(cè)墻上的旗臺上。

        ●請確保你的位置上包含所有材料和設(shè)備。如果缺少任何東西,你必須在開始哨聲后15 min內(nèi)將黃旗置于旗架上。15 min 后申報(bào)缺少任何物品將不予考慮。

        ●如遇緊急情況,請將你的黃旗置于旗架上。

        ●建議你開始實(shí)驗(yàn)前,仔細(xì)閱讀整個實(shí)驗(yàn)流程,便于合理安排時間。

        ●在考試結(jié)束時立即停止答題。將全部試卷與答題紙放入信封中。實(shí)驗(yàn)監(jiān)考人員將收取信封。

        祝你好運(yùn)。

        在下表單元格中寫下相鄰單元格中提示的數(shù)字。

        17

        A 部分 生物多樣性模型研究

        這個星球上大約有1 000 萬種不同的真核生物。加上原核生物會極大增加人們對地球上現(xiàn)存物種數(shù)量的估計(jì)。地球上為什么有如此之高的生物多樣性,一直是演化和生態(tài)學(xué)的核心問題之一。Rainey 和Travisano(1998)試圖通過實(shí)驗(yàn)室研究回答此問題的某些方面。他們使用了一種普遍流行的好氧細(xì)菌——熒光假單胞菌(Pseu‐domonas fluorescens)作為研究的模式生物。

        他們的研究從P. fluorescens單態(tài)的種群開始,讓細(xì)菌細(xì)胞在靜止態(tài)的液體培養(yǎng)基(在不震蕩的燒杯)中生長??捎谩肮饣汀泵枋鲎嫦确N群的形態(tài),因?yàn)樗鼈兛稍谂囵B(yǎng)皿上形成光滑菌落。研究表明,在熒光假單胞菌P. fluorescens中也可能形成其他2 種形態(tài):皺紋擴(kuò)散型和模糊擴(kuò)散型(圖1)。

        圖1 3 種不同形態(tài)的熒光假單胞菌P. fluorescens:平滑型(SM)、皺紋擴(kuò)散型(WS)和模糊擴(kuò)散型(FS)

        細(xì)菌菌落系的建立和進(jìn)化過程是通過在靜態(tài)環(huán)境中培養(yǎng)7 d(28℃在25 mL 液體培養(yǎng)基的燒杯中)實(shí)現(xiàn)的。7 d 后,Rainey 和Travisano 從第1 個細(xì)菌菌落系中轉(zhuǎn)移了1 個細(xì)菌樣本里的細(xì)胞(該菌落系已在靜態(tài)環(huán)境中培養(yǎng)了7 d),利用轉(zhuǎn)移出的樣本建立第2 個菌落系。然后,他們使第1 個和第2 個菌落系分別在靜止和搖晃的環(huán)境中再進(jìn)化7 d。(在每天結(jié)束時,將部分燒杯的子樣品轉(zhuǎn)移到具有新鮮培養(yǎng)基的新燒杯中以保持菌落系的演化)(圖2)

        圖2 Rainey 和Travisano 進(jìn)行實(shí)驗(yàn)的示意圖

        這里,你將扮演Rainey 和Travisano 的角色,試著理解他們觀察到的結(jié)果?,F(xiàn)在給你一些含有菌落系的培養(yǎng)皿,這些菌落系的獲得與Rainey 和Travisano 所做實(shí)驗(yàn)的方法完全一致,這些培養(yǎng)皿中菌落系是從演化中的種群的不同階段采樣進(jìn)行創(chuàng)建的(圖2)。

        表型多樣性的變化

        計(jì)數(shù)你在每個培養(yǎng)皿上觀察到的不同形態(tài)菌落的數(shù)量(假設(shè)每個培養(yǎng)皿代表其原始種群)。對于每個培養(yǎng)皿,可使用以下公式計(jì)算異質(zhì)性水平(H):

        其中,fi是培養(yǎng)皿上形態(tài)i的頻率,n是培養(yǎng)皿上存在的菌落類型數(shù)。

        A-1)根據(jù)從這些培養(yǎng)皿上觀察到的結(jié)果,填寫在答題紙的表1 中(保留小數(shù)點(diǎn)后2 位)。

        培養(yǎng)皿A0 A7 B7 A14 B14 SM計(jì)數(shù)WS計(jì)數(shù)FS計(jì)數(shù)SM頻次WS頻次FS頻次 H

        A-2)根據(jù)得到的數(shù)據(jù),在答題紙上用“√”表示下列陳述是否正確。

        a)多樣性更可能是由于表型可塑性而非突變所導(dǎo)致

        b)靜態(tài)環(huán)境提供了更多的生態(tài)位,增加了多樣性

        c)觀察到的多樣性是由祖先種群中存在的突變引起的

        d)較大的子樣本導(dǎo)致較高的異質(zhì)性

        e)由于世代時間短和種群規(guī)模大,用細(xì)菌進(jìn)行該實(shí)驗(yàn)是更合適的

        A-3)假設(shè)只有3 種細(xì)菌形態(tài),計(jì)算最大可實(shí)現(xiàn)的異質(zhì)性。

        B 部分 對種群演化模型的研究

        研究種群遺傳學(xué)的主要模型之一是賴特-費(fèi)舍爾模型(Wright-Fisher model,以現(xiàn)代進(jìn)化論的2位創(chuàng)始人R. A. Fisher 和Sewall Wright 命名)。

        在最簡單的形式下,該模型假設(shè)種群中有固定數(shù)量的單倍型個體。個體是無性繁殖的,只復(fù)制自身進(jìn)行繁殖。為創(chuàng)造下一代,從當(dāng)前一代中隨機(jī)選擇一個個體,并向下一代提供一個后代。這一過程會被重復(fù),直至下一代的種群大小與現(xiàn)在的種群大小相同。請注意,一些個體可能只是偶然地被多次選為下一代的父母。在此步驟之后,下一代將替換當(dāng)前的一代。此整個過程將被依次重復(fù),從而創(chuàng)建未來的后代。

        如果一個種群中的所有個體都具有相同的適合度,則每個個體被選為父母的可能性是相同的,但如果他們的適合度不同,則對抽樣過程進(jìn)行加權(quán),以便更適合的個體被挑選出。

        在你的筆記本電腦上,有一個應(yīng)用程序顯示了賴特-費(fèi)舍爾模型的預(yù)期結(jié)果(在桌面上,轉(zhuǎn)到IBO2018Task2,雙擊“WF_model.py”并等待應(yīng)用程序啟動)??刹僮? 個變量,可移動滑塊以改變每個變量的值。在你為每個參數(shù)選擇了期望值之后,只需點(diǎn)擊,便可看到在賴特-費(fèi)舍爾模型中給定所選的參數(shù)后異質(zhì)性(H)是如何隨時間變化的(請參見A 部分中對H的正式定義)。

        圖3 賴特-費(fèi)舍爾模型應(yīng)用程序的界面

        使用此應(yīng)用程序,回答以下問題(請記住,該模型純粹是給定參數(shù)的函數(shù)運(yùn)算結(jié)果)。

        B-1)在答題卡中,用“√”表示以下陳述是否正確。

        A)增加世代數(shù)會改變平衡狀態(tài)下的異質(zhì)性

        B)在任何參數(shù)設(shè)置下,縮小種群規(guī)模都不會增加平衡狀態(tài)下的異質(zhì)性

        C)減小種群規(guī)??杉铀倨胶猱愘|(zhì)性的實(shí)現(xiàn)

        D)增加突變率可加速平衡異質(zhì)性的實(shí)現(xiàn)

        E)當(dāng)沒有突變時,增加選擇強(qiáng)度可降低平衡狀態(tài)下的異質(zhì)性

        B-2)選出一個最符合模擬結(jié)果的平衡異型性方程(N代表種群大小,μ代表突變率),在答題紙上打“√”。

        C 部分 研究黑腹果蠅(Drosophila melano‐gaster)幼蟲的攝食行為

        有2 種類型的果蠅幼蟲:活躍的好動者和不愛活動的靜棲者?;钴S的好動者通過調(diào)動媒介尋找食物,而不愛活動的靜棲者則沒有。這些覓食策略似乎是由遺傳決定的。

        在筆記本電腦上的一系列視頻(IBO2018Task3)中,你可見到在一個種群中不同類型幼蟲的5 個連續(xù)世代(Gen1 至Gen5)。

        C-1)通過觀看果蠅幼蟲的影片,填寫下表(使用與A 部分相同的方法計(jì)算H值,小數(shù)點(diǎn)后保留2 位)。

        注意:對于被統(tǒng)計(jì)為“靜棲者”的幼蟲,在整個影片片段中,其全部身體應(yīng)留在或接觸到食物邊界內(nèi)(鏡頭中的2 個深灰色圓圈對應(yīng)于2 個食物斑塊)。

        世代數(shù)靜棲者(計(jì)數(shù))好動者(計(jì)數(shù))靜棲者(頻率)好動者(頻率) H 1 2 3 4 5

        C-2)根據(jù)以上結(jié)果,指出以下每個陳述是否正確,用“√”在答題紙上作答。

        A)果蠅幼蟲的覓食行為遵循最佳覓食理論,這意味著每一世代將根據(jù)環(huán)境因素選擇最佳的覓食測量

        B)果蠅幼蟲的覓食行為遵循有條件的策略,這是一種能使個體改變行為的機(jī)制,在這里指靜棲者與好動者的覓食行為

        C)結(jié)果與負(fù)的頻率依賴性選擇一致

        D)假設(shè)負(fù)的頻率依賴性選擇對覓食策略起作用,沒有一種策略可在種群中固定下來

        可通過考慮種群本身或考慮生物相互作用(例如,競爭)對種群動態(tài)的影響預(yù)測隨時間變化的種群規(guī)模。下面介紹2 種模型,就是當(dāng)考慮種群隨時間變化的方式時,分別代表了這2 種方法(考慮種群和考慮物種間作用)。

        I:邏輯斯蒂增長的不連續(xù)模型:

        St:第t世代靜棲者的種群數(shù)量

        Rt:第t世代好動者的種群數(shù)量

        rS:靜棲者的種群內(nèi)稟增長率

        rR:好動者的種群內(nèi)稟增長率

        KS:靜棲者的承載力

        KR:好動者的承載力

        αRS:靜棲者對好動者通過競爭產(chǎn)生的對種群增長的影響

        αSR:好動者對靜棲者通過競爭產(chǎn)生的對種群增長的影響

        C-3-1)根據(jù)模型I 和模型II 完成下表。模型參數(shù)如下(小數(shù)點(diǎn)后保留2 位):

        模型I:

        3 r K 500

        模型II:

        rS KS 3 2 500 0.1 rR KR αSR αRS 500 0.1

        世代數(shù)0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 1 0模型Ⅰ靜棲者(計(jì)數(shù))184.00模型Ⅱ靜棲者(計(jì)數(shù))184.00模型Ⅱ好動者(計(jì)數(shù))262.00 427.79 343.22 408.41 196.94 120.45 381.17 371.71 539.93 368.38 34.89 571.68 459.81 424.04 459.64 522.19 11 12 13 14 15 182.86 516.81 497.54 432.68 589.09 510.47

        進(jìn)行了一項(xiàng)更廣泛的研究,以探討黑腹果蠅(D. melanogaster)幼蟲攝食策略頻率的長期變化。研究結(jié)果如下表所示。

        C-3-2)計(jì)算模型Ⅰ和模型Ⅱ所預(yù)測的攝食策略的頻率,并填寫下表(對于模型Ⅰ,由于在種群中除了靜棲者之外還有好動者,所以,用靜棲者的數(shù)量除以2 倍的K值計(jì)算靜棲者的頻率);保留小數(shù)點(diǎn)后2 位數(shù)。

        模型Ⅰ和模型Ⅱ需要一些初始值進(jìn)行預(yù)測,以下哪一個初始值是最好的?(用“√”在答題紙上作答)

        A)靜棲者:289,好動者:212

        B)靜棲者:205,好動者:295

        C)靜棲者:523,好動者:300

        D)靜棲者:307,好動者:514

        世代數(shù)模型Ⅱ的預(yù)測結(jié)果靜棲者模型Ⅱ的預(yù)測結(jié)果好動者研究結(jié)果靜棲者0.41 0.54 0.61 0.62 0.91 0.32 0.68 0.63 0.46 0.27 0.84 0.67 0.47 0.39 0.42 0.54 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 1 0模型Ⅰ的預(yù)測結(jié)果靜棲者11 12 13 14 15

        皮爾遜相關(guān)

        皮爾遜相關(guān)是估算2 組數(shù)據(jù)之間相關(guān)性的數(shù)學(xué)函數(shù)。(x1,…,xn和y1,…,yn)相關(guān)系數(shù)的計(jì)算公式如下:

        樣本x樣本y觀察到的靜棲者的頻率模型Ⅰ所預(yù)測的靜棲者的頻率觀察到的靜棲者的頻率模型Ⅱ所預(yù)測的靜棲者的頻率相關(guān)系數(shù)

        C-4)計(jì)算期望相關(guān)性的相關(guān)系數(shù)(r)并填寫下表。

        C-5)在答題紙中用“√”表示以下陳述是否正確。

        A)邏輯斯蒂增長曲線模型I 解釋了在給定參數(shù)的情況下所觀察到的頻率變化

        B)你的計(jì)算結(jié)果表明,在模型中加入競爭因素,明顯增加了模型和觀察之間的契合度

        C)需要研究參數(shù)空間以確定這些模型用于解釋觀測現(xiàn)象的能力

        D)相關(guān)性檢測表明,競爭無法導(dǎo)致靜棲者和好動者出現(xiàn)頻率的改變

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