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        MBL基因單核苷酸多態(tài)性分布與類風濕性關節(jié)炎易感性相關性的研究

        2020-05-18 02:43:35侯玲王玉娜周永忠
        科技視界 2020年7期
        關鍵詞:核苷酸等位基因寧夏

        侯玲 王玉娜 周永忠

        摘 要

        [目的]分析MBL基因啟動子區(qū)-221G/C、-550G/C SNP位點在寧夏地區(qū)的分布特征,并探討其與類風濕性關節(jié)炎(RA)發(fā)病的相關性。[方法]采用聚合酶鏈式反應-限制性片段長度多態(tài)性分型法(PCR-RFLP)和聚合酶鏈式反應-序列特異性引物(PCR-SSP)技術,對400名寧夏健康個體及380名RA患者MBL-221G/C、MBL-550G/C進行基因分型。[結(jié)果](1)RA患者中:MBL-221G/C、MBL-550G/C的基因型頻率和等位基因頻率分布在不同年齡、不同性別組間的比較中均不存在統(tǒng)計學差異(P>0.05)。(2)在RA患者與健康對照組間的比較中,MBL-550G/C基因型頻率和等位基因頻率分布均存在統(tǒng)計學差異(P<0.05)。[結(jié)論](1)RA的發(fā)病在MBL-221和MBL-550多態(tài)位點不受年齡、性別、的影響。(2)MBL-550位的C等位基因可能是寧夏地區(qū)RA發(fā)生的危險因子。

        關鍵詞

        寧夏;甘露糖結(jié)合凝集素;單核苷酸多態(tài)性;類風濕性關節(jié)炎

        中圖分類號: R593.22 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 文獻標識碼: A

        DOI:10.19694/j.cnki.issn2095-2457.2020.07.057

        Abstract

        [Objective] To determine the distribution of Mannose-Binding Lectin(MBL)gene polymorphism in ?Ningxia,To study on the influence of MBL genepolymorphism in RA. [Methods]By using PCR-RFLP and SSP-PCR, we determined MBL genotype and haplotype of MBL-221G/C、MBL-550G/C in 400 healthy people which from Ningxia district, 380 RA patients of Ningxia district. [Results](1)At MBL-221G/C and MBL-550G/C, There were no statistically significant differences of nation、sex and age in either the frequency of genotypeor that of allele in MBL genepolymorphism of RA patients(P>0.05). (2)At MBL-550G/C, there were statistically significant differences in MBL genepolymorphism genetictype frequencies between RA patients and healthy(P<0.05).[Conclusion](1)The onset of RA is not affected by age ,gender and ethnicity. (2)At MBL-550G/C, C allele probably is one of the risk factors which may lead to RA disease in Ningxia district.

        Key words

        Ningxia;MBL;SNP;RA

        1975年,人們發(fā)現(xiàn)哺乳動物細胞內(nèi)可能存在一種能與甘露糖特異結(jié)合的蛋白質(zhì),1978年,Kawasaki T等[1]的研究證實這種蛋白質(zhì)的存在,隨后將此蛋白質(zhì)命名為甘露糖結(jié)合凝集素(MBL),并建立了MBL的cDNA克隆。人MBL基因全長7kb,位于第10號染色體長臂10q11.2-q21。種族、民族、年齡、應激狀態(tài)、基因變異及多態(tài)性等多種因素都會影響MBL血清水平[2]。其中結(jié)構(gòu)基因外顯子Ⅰ密碼子點突變和啟動子區(qū)SNP的調(diào)控對MBL血清濃度影響最大[3]。由于啟動子區(qū)呈現(xiàn)出單核苷酸多態(tài)性(SNP),對MBL基因的轉(zhuǎn)錄進行調(diào)控,從而使不同種族之間、甚至同一種族不同個體間的MBL血清水平差異顯著[4]。

        類風濕性關節(jié)炎(RA)是一種病因不明的、以關節(jié)疼痛、腫脹、畸形為主要臨床特征的慢性全身性疾病,是遺傳因素與環(huán)境因素共同作用的多基因疾病。許多研究表明,MBL基因可能是影響RA疾病發(fā)病的候選基因[5-8]。本課題組在研究MBL基因外顯子Ⅰ密碼子點突變與寧夏地區(qū)RA相關性的基礎上,采用聚合酶鏈式反應-限制性片段長度多態(tài)性分型法(PCR-RFLP)和聚合酶鏈式反應-序列特異性引物(PCR-SSP)技術檢測MBL基因啟動子區(qū)SNP位點多態(tài)性在寧夏地區(qū)的分布特征,并探明其與RA的發(fā)病是否存在相關性。

        1 材料和方法

        1.1 材料

        1.1.1 樣本來源及處理

        基因組DNA樣本來源于寧夏不同地區(qū)。健康對照400例,來源于寧夏不同地區(qū)體檢健康人群,年齡在7歲-73歲之間,其中男性210例、女性190例。RA患者380例,樣本來源于住院患者,RA的診斷以美國風濕病學會(ARA)1987年修訂的RA分類標準為依據(jù),年齡在7歲-77歲之間,其中男性190例、女性190例。以上研究個體均無血緣關系,追溯3代均為同一民族個體,且在寧夏地區(qū)居住3代以上。根據(jù)知情同意原則,常規(guī)抽取所選個體的外周靜脈血2ml,加入0.2mlACD抗凝劑,充分混勻,進行DNA提取,之后加入100μl的DNA水化液完全溶解DNA,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.1.2 試劑與儀器

        DNA提取試劑盒(北京天根公司),電泳級瓊脂糖(上海生工生物工程技術服務有限公司),PCR引物由上海英駿生物有限公司合成,限制性內(nèi)切酶MspI購自大連寶生生物公司。PCR反應試劑包括:5×PCR反應液、2.5Mm dNTP及LA Taq DNA聚合酶(5U/μl)。丙烯酰胺溶液(Acr:Bis=29:1),分子大小標準物:MarkerⅠ、2000bp DNA Marker。硝酸銀染色試劑。瓊脂糖凝膠電泳試劑包括1×TAE電泳緩沖液、電泳上樣緩沖液、0.5μg/ml的溴化乙錠(EB)。

        臺式高速離心機(Eppendrof,Germany),MycycleTM Thermal Cycler型PCR儀(BIORAD公司)。DYY-8B型穩(wěn)壓電泳儀,DYY-32A型水平電泳槽,DYCZ-24A型垂直電泳槽(北京六一儀器廠)。凝膠電泳圖像分析系統(tǒng)(Bio-Rad,U.S.A)。

        1.2 方法

        1.2.1 RFLP-PCR法檢測MBL-221G/C、SSP-PCR法檢測MBL-550G/C

        根據(jù)全基因組PCR的引物設計原則,利用Primer Primer5.0軟件,自行設計PCR引物,MBL-221引物序列為:F: 5' –CGGTCCCATTTGTTCTCACTGCCCC-3',R: 5'- TGTGACACTGCGTGACTA-3'。MBL-550引物序列為:-550c: 5-TGC TTA CCC AGG CAA GCC TGT C-3,-550g: 5-TGC TTA CCC AGG CAA GCC TGT G-3,-550: ?5-CAG GCA GTT TCC TCT GGA AGG-3。

        PCR總反應體系為15μl, PCR反應條件:94°C預變性4分鐘后進入循環(huán),每個循環(huán)為:94℃變性30秒,63℃(MBL-221位點)、60℃(MBL-550位點)退火30秒、72℃延伸1.5分鐘,共循環(huán)30個周期,最后在72°C延伸10分鐘。MBL-221位點PCR產(chǎn)物為152bp,MBL-550位點PCR擴增產(chǎn)物為884bp。

        擴增反應結(jié)束后,取PCR產(chǎn)物3μl與0.5μl電泳上樣緩沖液混勻,依次上樣于2%的瓊脂糖凝膠中,以2000bp DNA Marker做參照,電泳30分鐘后,將瓊脂糖凝膠用0.5μg/ml的溴化乙錠染色15-20分鐘,然后用蒸餾水漂洗2次,紫外燈下判讀PCR擴增情況和MBL-550位基因型。樣本DNA的PCR擴增產(chǎn)物在 Marker兩側(cè)有兩個泳道,若Marker左側(cè)泳道未出現(xiàn)DNA條帶而右側(cè)出現(xiàn)DNA條帶則為野生純合子GG,若Marker左側(cè)泳道出現(xiàn)DNA條帶而右側(cè)未出現(xiàn)DNA條帶則為突變純合子CC,若Marker左側(cè)泳道出現(xiàn)DNA條帶同時右側(cè)也出現(xiàn)DNA條帶則為雜合子GC。

        然后將MBL-221位點PCR擴增產(chǎn)物進行MspI內(nèi)切酶酶切,總反應體系為10μl, 37℃水浴酶切1~2h。酶切產(chǎn)物經(jīng)8%非變性凝膠電泳和硝酸銀染色,用凝膠電泳圖像分析系統(tǒng)分析結(jié)果并記錄其基因型,野生純合子GG(127bp,25bp),突變純合子CC(152bp),雜合子GC(152bp,127bp,25bp)。

        1.2.2 統(tǒng)計學方法

        研究對象與Hardy-Weinberg平衡的符合程度用?字2檢驗;MBL基因型頻率與等位基因頻率采用頻率計數(shù)法,組間基因型頻率及等位基因頻率比較采用?字2檢驗。均應用SPSS統(tǒng)計軟件進行統(tǒng)計,以P<0.05為差異具有統(tǒng)計學意義。

        2 結(jié)果

        2.1 MBL-221 RFLP-PCR結(jié)果、MBL-550 SSP-PCR結(jié)果

        在寧夏地區(qū)健康對照和RA患者中,均檢出MBL-221和MBL-550位點具有單核苷酸多態(tài)變異。

        2.2 寧夏地區(qū)MBL基因單核苷酸多態(tài)性分布特征及其與RA相關性

        對健康對照的?字2檢驗結(jié)果顯示,本研究人群符合Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05),具有群體代表性。在分析健康對照和RA患者MBL-221、MBL-550位點多態(tài)性時,進行了性別和年齡分組,年齡段分組依據(jù)聯(lián)合國世界衛(wèi)生組織提出的年齡分段標準,44歲以下為青年人,45歲以上為中老年人。

        2.2.1 寧夏RA患者MBL-221、MBL-550位點多態(tài)性

        MBL-221G/C、MBL-550G/C的基因型頻率和等位基因頻率分布在不同年齡、不同性別組間的比較中均不存在統(tǒng)計學差異(P>0.05)(表1,表2)。

        2.2.2 寧夏健康對照和RA患者MBL基因頻率和等位基因頻率的比較

        在RA患者與健康對照組間的比較中,MBL-221G/C的基因型頻率和等位基因頻率在兩組間的比較中均無統(tǒng)計學差異(P<0.05)(表3)。MBL-550G/C基因型頻率在兩組間存在統(tǒng)計學差異(P<0.05),MBL-550位點C等位基因頻率在RA中的分布高于對照組,其差異性具有統(tǒng)計學意義(P=0.047,OR=1.26,95%CI:1.00~1.59)(表4)。

        3 討論

        我國類風濕性關節(jié)炎(RA)患病率約為0.3%,患者人數(shù)超過了500萬,本病是造成我國人群喪失勞動力,甚至致殘的主要病因之一,嚴重影響人們的生活質(zhì)量并加重家庭經(jīng)濟負擔。血清MBP作為一種急性反應蛋白會受RA疾病本身的影響,而研究MBL基因單核苷酸多態(tài)性與RA相關性的優(yōu)勢在于MBL多態(tài)性不受RA病程的影響。因此,探討MBL基因作為影響RA疾病發(fā)病候選基因的可能性并對其進行群體遺傳結(jié)構(gòu)分析,在篩選RA易感人群,并采取有效的預防和治療措施等方面都具有潛在的應用前景。RA是遺傳因素與環(huán)境因素共同作用的多基因疾病,關于MBL基因單核苷酸多態(tài)性與RA的可能聯(lián)系研究較多,許多研究結(jié)果表明MBL和RA的發(fā)生和發(fā)展可能存在相關性[5-8]。本課題組采用PCR-SSP和PCR-RFLP檢測技術研究了MBL基因啟動子區(qū)MBL-221G/C、MBL-550G/C兩個SNP位點多態(tài)性分布特征及其與寧夏地區(qū)RA發(fā)病的相關性。在RA患者與健康對照組間的比較中,MBL-221G/C的基因型頻率和等位基因頻率在兩組間的比較中均無統(tǒng)計學差異(P>0.05)。因此,在寧夏地區(qū),MBL-221位單核苷酸多態(tài)性可能與RA的發(fā)病不具有相關性。Ip[9]等對中國南方RA病人與健康對照的MBL表型、基因型及啟動子多態(tài)性進行研究發(fā)現(xiàn),啟動子區(qū)第550位多態(tài)性在兩組間差異顯著,RA病人血清中MBL水平顯著低于健康對照。本研究結(jié)果顯示,MBL-550G/C基因型頻率和等位基因頻率在兩組間存在統(tǒng)計學差異(P<0.05),RA患者變異純合基因型CC頻率顯著高于健康對照(P=0.009),MBL-550位變異型C等位基因頻率在RA中的分布高于對照組,其差異性具有統(tǒng)計學意義(P=0.047,OR=1.26,95%CI:1.00~1.59)。此研究結(jié)果提示,MBL-550位單核苷酸多態(tài)性可能與寧夏地區(qū)RA的發(fā)病具有相關性,MBL-550位變異型C等位基因可能是寧夏地區(qū)RA發(fā)病的候選基因。比較中國南方和北方寧夏地區(qū)MBL-550位點的多態(tài)性變異和與RA疾病的相關性,結(jié)果是一致的。

        對RA患者的研究結(jié)果顯示,MBL-221G/C、MBL-550G/C兩個位點的基因型頻率和等位基因頻率分布在不同民族、不同年齡、不同性別組間的比較中均不存在統(tǒng)計學差異(P>0.05)。

        綜上所述,本研究結(jié)果提示:RA的發(fā)病在MBL-221和MBL-550多態(tài)位點不受年齡、性別和民族因素的影響。MBL-221位點的多態(tài)性變異可能與寧夏地區(qū)RA發(fā)生不相關,而MBL-550位點的多態(tài)性與寧夏RA發(fā)病關系更為密切,其變異等位基C可能是寧夏地區(qū)RA發(fā)生的危險因子。RA是一種復雜的由多種遺傳因素和環(huán)境因素共同作用的自身免疫性疾病,MBL作為機體天然免疫的第一道防線,其生物學功能的重要性已被充分肯定,個體MBL基因變異,MBL血清水平低下或功能缺損,從而導致補體凝集素途徑的活化不足,在明確MBL缺損后,用外源性MBL治療已顯示出臨床應用價值。本研究結(jié)果可為針對性地治療RA提供依據(jù),并提示在臨床工作中基于不同的基因型采取相應的干預措施。而有關MBL途徑活化補體系統(tǒng)和免疫調(diào)控的機制、MBL與細胞受體識別并結(jié)合的機制和調(diào)節(jié)作用等問題,本課題組會在前期工作的基礎上做進一步的深入研究,以期可以對于RA的早期診斷、預防和治療提供思路。

        參考文獻

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