劉欣,謝旺凱,孫祥威,陳治元,沈賢,薛向陽
(1.溫州醫(yī)科大學附屬第二醫(yī)院育英兒童醫(yī)院胃腸外科,浙江溫州325027;2.溫州醫(yī)科大學基礎醫(yī)學院微生物學與免疫學教研室,浙江溫州325035)
人巨細胞病毒(humancy to megalovirus,HCMV)是一種廣泛存在于人群中的病毒,屬于β皰疹病毒家亞科,包含236kb的雙鏈DNA基因組,其人群攜帶率在嬰幼兒約為20%,隨著年齡的增長在發(fā)展中國家可達100%[1]。在免疫功能正常的個體,HCMV感染通常無明顯臨床癥狀,而其在免疫功能缺陷的個體,如HIV患者,或者在接受器官移植的患者中會再次激活而導致嚴重的并發(fā)癥,甚至危及生命[2]。UL111A基因在HCMV中編碼細胞因子,其主要編碼cmvIL-10和LAcmvIL-10蛋白,由于它們與hIL-10有一定的同源性,可以通過與IL-10R結(jié)合而發(fā)揮免疫抑制調(diào)節(jié)功能[3-6]。目前AD169 UL111A基因在人包皮成纖維細胞(human foreskin fibroblast,HFF)中的轉(zhuǎn)錄本的情況還未見報道,本研究旨在探究HCMV增殖性感染不同時間點UL111A基因轉(zhuǎn)錄本特征及變化。
1.1 材料 HFF和293T細胞購自中國科學院細胞庫,AD169 病毒株購自美國ATCC,TRIzol、Lipofectamine 2000 購自美國Invitrogen公司,pcDNA3.1載體為本實驗室保存,反轉(zhuǎn)錄試劑盒(FSQ301)購自日本TOYOBO公司,HA-Tag兔抗(#3724)和羊抗兔IgG HRP偶聯(lián)(#7074)二抗購自美國CST公司,高保真酶購自南京諾唯贊生物科技有限公司,PCR反應試劑盒、pEASY-Blunt Zero Cloning Kit購自北京全式金生物有限公司,DNA回收試劑盒購自北京天根公司。
1.2 方法
1.2.1 AD169病毒感染HFF細胞:將1×105個HFF細胞鋪于6孔板中,過夜貼壁后換液,然后加入純DMEM培養(yǎng)基和感染復數(shù)MOL=1的AD169病毒液,放入37 ℃含5% CO2的培養(yǎng)箱中孵育2 h,每隔30 min取出搖晃1次,2 h后換成含10% FBS的DMEM培養(yǎng)基,放入培養(yǎng)箱繼續(xù)培養(yǎng),此時記為感染開始時間,隨后感染12 h,24 h,48 h,72 h,5 d,7 d,9 d后提取RNA用于后續(xù)實驗。
1.2.2 RNA提取和RT-PCR:根據(jù)TRIzol RNA提取試劑說明書,分別提取12 h,24 h,48 h,72 h,5 d, 7 d,9 d不同時間點的感染AD169病毒的HFF細胞的RNA,測濃度后按照ReverTra Ace?qPCR RT Master Mix with gDNA Remover試劑盒說明書,分別取 0.5 μg RNA反轉(zhuǎn)錄10 μL體系cDNA,各自取1 μL cDNA模板按照PCR反應試劑說明書行PCR檢測(循環(huán)數(shù)29個),引物為vIL-10AFP,vIL-10ARP,然后再分別取1 μL上述PCR產(chǎn)物稀釋50倍后再取1 μL作為模板行PCR檢測(循環(huán)數(shù)35個),引物為vIL-10CFP,vIL-10CRP,vIL-10EFP,vIL-10ERP,vIL-10GFP,vIL-10GRP,vIL-10IFP,vIL-10FRP,引物序列見表1。
1.2.3 UL111A轉(zhuǎn)錄本檢測和測序鑒定:分別取 12 h,24 h,48 h,72 h,5 d,7 d,9 d不同時間點經(jīng)反轉(zhuǎn)錄cDNA,經(jīng)高保真酶PCR后行膠回收然后連pEASY-Blunt Zero Cloning載體經(jīng)Trans1-T1感受態(tài)細胞轉(zhuǎn)化后涂平板,37 ℃倒置過夜,挑選單克隆送測序鑒定。PCR引物為vIL-10AFP,vIL-10ARP(見表1),條件為94 ℃完全變性5 min,35個循環(huán)的 94 ℃變性30 s,58 ℃退火,72 ℃延伸1 min,最后充分延伸10 min。
1.2.4 真核表達載體pcDNA3.1-cmvIL-10、pcDNA3.1-LAcmvIL-10和pcDNA3.1-unspliced的構(gòu)建及鑒定:使用帶BamHI/EcoRI酶切位點的轉(zhuǎn)錄本編碼區(qū)特異性引物,同時在后向引物C端加入一個HA標簽序列,PCR擴增產(chǎn)物與pcDNA3.1載體經(jīng)過酶切酶連,構(gòu)建相應的載體,提取質(zhì)粒通過Lipofectamine 2000質(zhì)粒試劑轉(zhuǎn)染293T細胞,24 h后用RIPA裂解液裂解提取細胞蛋白,15%的SDS-PAGE膠進行電泳,轉(zhuǎn)膜,5%脫脂牛奶室溫封閉1 h,然后使用HA-Tag兔抗(1:1 000)4 ℃孵育過夜,TBST洗膜后,加入羊抗兔二抗(1:5 000)室溫孵育1 h,再次洗滌膜后曝光。
2.1 HCMV UL111A基因在增殖性感染期存在3 種形式的轉(zhuǎn)錄本 以UL111A全長通用引物PCR檢測AD169感染HFF細胞24 h的cDNA,結(jié)果見圖1,PCR產(chǎn)物經(jīng)測序,結(jié)果顯示的3個條帶分別為未剪切形式,LAcmvIL-10和cmvIL-10轉(zhuǎn)錄本序列。為了進一步探究轉(zhuǎn)錄本外顯子連接位點的堿基序列,圖2的測序峰圖呈現(xiàn)了結(jié)果的可靠性。U111A 3種轉(zhuǎn)錄本模式見圖3。
2.2 HCMV感染不同時間點UL111A轉(zhuǎn)錄本特征及其變化 為探索不同時間點是否存在不同的UL111A轉(zhuǎn)錄本特征變化,首先,我們使用UL111A特異性引物(見圖4)PCR檢測感染AD169 病毒的不同時間點HFF細胞的cDNA,并經(jīng)測序驗證,oLX2-12 以及oLX3-13 特異性引物擴增的產(chǎn)物顯示的2 個條帶分別為包含第1個內(nèi)含子和不包含第1個內(nèi)含子的模式,并且隨著時間的增加,剪切第1個內(nèi)含子模式越來越少。同樣的,oLX6-14和oLX6-15特異性引物擴增的產(chǎn)物主要顯示包含第2個內(nèi)含子的模式,在早期12 h或24 h,可見較弱剪切第2內(nèi)含子條帶模式。隨后我們以UL111A全長通用引物PCR檢測不同時間點感染HFF的cDNA,擴增產(chǎn)物經(jīng)切膠回收連載體,挑選大量單克隆送測序進一步檢測轉(zhuǎn)錄本占比的情況,表2顯示在感染的各個時間點,未剪切形式轉(zhuǎn)錄本皆占比最多,其次為LAcmvIL-10轉(zhuǎn)錄本,而cmvIL-10轉(zhuǎn)錄本只在感染的早期(24 h)和晚期 (9 d)被檢測到。
表1 UL111A相關引物
圖1 感染AD169病毒HFF細胞24 h cDNA反轉(zhuǎn)錄圖
圖2 不同轉(zhuǎn)錄本剪切位點峰圖
2.3 CmvIL-10、LAcmvIL-10 和unspliced 3 種轉(zhuǎn)錄本均能在293T細胞中有效表達 分別將3 種轉(zhuǎn)錄本編碼區(qū)序列所構(gòu)建的真核表達載體pcDNA3.1-cmvIL-10、pcDNA3.1-LAcmvIL-10 和pcDNA3.1- unspliced質(zhì)粒轉(zhuǎn)染293T細胞,24 h后提取的細胞蛋白經(jīng)Western blot驗證可見目的大小的特異性條帶,而轉(zhuǎn)染空載質(zhì)粒的293T細胞無特異性條帶,表明構(gòu)建的載體能在293T細胞中有效表達,見圖5。
HCMV是目前已知的最大的皰疹病毒,其編碼大量病毒基因組蛋白包括細胞因子、趨化因子和它們的受體,在機體發(fā)揮相應的免疫調(diào)節(jié)功能,并且與腫瘤等疾病有密切的關聯(lián)[7-10]。巨細胞病毒AD169株完整序列在1990年首次被研究報道,其編碼了超過200多個蛋白質(zhì)[11]。在我們的研究中首次報道了AD169病毒株感染HFF細胞后,UL111A基因在其增殖性感染的不同時間點轉(zhuǎn)錄本特征,通過RT-PCR和挑選單克隆實驗檢測到了cmvIL-10、LAcmvIL-10和未剪切形式轉(zhuǎn)錄本。CmvIL-10蛋白編碼UL111A基因3個外顯子序列的175個氨基酸,盡管它與hIL-10只有約27%的同源性,但是它可以通過與hIL-10R結(jié)合發(fā)揮免疫抑制作用,如降低單核細胞主要組織相容性復合物I(major histocompatibility complex I, MHC I)和MHC II的表達,降低內(nèi)皮細胞基質(zhì)金屬蛋白酶的活性,損傷體外內(nèi)皮細胞的遷移和細胞滋養(yǎng)層細胞的侵襲性[12-15]。hIL-10是一個多效價的細 胞因子,在機體炎癥和免疫功能發(fā)揮免疫抑制等作用[16]。LAcmvIL-10蛋白編碼包含第2個內(nèi)含子序列的139 個氨基酸,其終止密碼子在第2 個內(nèi)含子內(nèi),其N端127個氨基酸與cmvIL-10蛋白相同,C端12個氨基酸不同,相似的,LAcmvIL-10同樣發(fā)揮一部分的免疫抑制功能,如抑制人初始骨髓細胞和單核細胞MHC II的表達[17],然而其機制可能不同于cmvIL-10,如LAcmvIL-10不能誘導stat3的磷酸化,并且其下調(diào)MHC II不能通過hIL-10R的中和抗體拮抗,提示其可能通過其他途徑發(fā)揮功能[18]。未剪切形式蛋白編碼包含兩個內(nèi)含子序列的78個氨基酸,其終止密碼子在第一個內(nèi)含子內(nèi),這與先前的報道的ORF79高度同源,ORF79是HCMV Towne病毒株上的形態(tài)改變區(qū)域(mtr II),可以發(fā)揮致癌作用誘導惡性形成[19]。之前有研究報道[20],在AD169病毒感染的MRC-5細胞中,共發(fā)現(xiàn)8種轉(zhuǎn)錄本,但是關于各自生物學功能尚未進行深入研究。我們只發(fā)現(xiàn)其中3種轉(zhuǎn)錄本,可能是由于其他轉(zhuǎn)錄本存在極少,因此未能檢測到。UL111A基因編碼的cmvIL-10蛋白最早是在感染Towne株病毒的MRC-5細胞和感染AD169病毒的HEL299細胞的增殖性感染階段被發(fā)現(xiàn)[4,6],而其編碼的LAcmvIL-10蛋白則是在感染Toledo株病毒的人粒-巨噬祖細胞的潛伏感染階段被發(fā)現(xiàn),隨后的研究也證明了LAcmvIL-10蛋白同樣存在于感染了Toledo株病毒的HFF細胞的增殖性感染階段[5,21]。
圖3 UL111A 3種不同轉(zhuǎn)錄本mRNA和氨基酸模式圖
圖4 感染AD169病毒HFF細胞RT-nest PCR圖
表2 UL111A基因在AD169感染HFF細胞中的轉(zhuǎn)錄本情況
圖5 UL111A 3種轉(zhuǎn)錄本所構(gòu)建的真核表達載體Western blot驗證圖
總的來說,我們的研究闡明了感染AD169病毒的HFF在HCMV增殖性感染不同時間點的轉(zhuǎn)錄本特征及其變化,但關于其機制還有待進一步研究。