(1.南華大學(xué),湖南 衡陽 421001;2.湘潭市中心醫(yī)院,湖南 湘潭 411100)
胚胎干細(xì)胞(embryonic stem cells,ESCs)來自于哺乳動物囊胚的內(nèi)細(xì)胞團(tuán)(ICM)并且具有在體外無限復(fù)制、自我更新和向各譜系細(xì)胞分化的潛能[1]。PHC1蛋白(也稱rae28)是哺乳動物和果蠅多梳家族蛋白(Polycomb Group protein,PcG)PRC1復(fù)合物的重要一員,蛋白結(jié)構(gòu)本身含有SAM(sterile alpha motif)結(jié)構(gòu)域和鋅指(zinc finger)結(jié)構(gòu),其中SAM結(jié)構(gòu)域介導(dǎo)PHC1與其它蛋白的相互作用使其發(fā)生寡聚化,而鋅指結(jié)構(gòu)域能夠和核酸結(jié)合,兩者對于cPRC1介導(dǎo)的基因沉默都發(fā)揮重要作用[2-3]。
有研究表明,胚胎干細(xì)胞體內(nèi)發(fā)育和體外分化伴隨著由表觀遺傳學(xué)機(jī)制介導(dǎo)的mESCs多能干性基因的逐漸關(guān)閉以及分化相關(guān)基因逐漸開啟過程[1,4]。故PHC1可不完全通過cPRC1介導(dǎo)的表觀遺傳學(xué)機(jī)制介導(dǎo)靶基因的沉默參與多能干性的維持[5]。因此,本研究擬通過慢病毒介導(dǎo)沉默mESCs中PHC1基因的表達(dá),初步探討沉默PHC1基因后對mESCs的多能干性的影響及其可能的機(jī)制。
Empty vector 為PLKO克隆載體,購自addgene;shRNA PHC1質(zhì)粒、PGL-3nanog 4.8 reporter、PHC1、nanog、sox2、oct4質(zhì)粒均前期構(gòu)建完成,保存于-80 ℃冰箱;胎牛血清FBS購自Gibco,高糖購自Corning,0.1% geltin明膠、PHC1、nanog、oct4、sox2抗體均購自abcam;actin抗體、RIPA裂解液購自碧云天;轉(zhuǎn)染試劑盒購自百恩維生物,Lipo2000購自sigma;shRNA序列合成及測序為擎科生物;ECL顯色液購自Thermo;Brilliant SYBR Green qRT-PCR Master Mix購自Takara;Luciferase Assay Kit 購自sigma。
將shRNA PHC1和PLKO空載質(zhì)粒分別與包裝質(zhì)粒PSPAX,PMD共轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞,48 h后收病毒,濃縮、離心并感染mESC細(xì)胞,感染mESCs 后24 h添加polybrene加強(qiáng)感染效率,48 h后加puro篩選3~5天得到穩(wěn)定的PHC1敲降mESC細(xì)胞系,并進(jìn)行后續(xù)實驗。本實驗RNA干擾設(shè)計圖見圖1。shRNA:5′-CCGGCACCTGAACCAACCTCTAAACCTC GAGGTTTAGAGGTTGGTTCAGGTGTTTTTG-3′。
圖1 RNA干擾設(shè)計圖
待測mESCs棄培養(yǎng)基,PBS清洗待測細(xì)胞3遍,置于冰上,加入RIPA和蛋白酶抑制劑使細(xì)胞裂解,吹打裂解細(xì)胞并收集至2 mL EP管中,超聲破碎后離心收集蛋白,BCA法蛋白定量,10%濃度的SDS-PAGE凝膠分離蛋白,將分離的蛋白轉(zhuǎn)至PVDF膜上,按100 V恒壓電泳,轉(zhuǎn)膜時間約120 min,5%的脫脂奶粉室溫封閉1 h,剪膜,加入待測一抗,4 ℃搖床過夜孵育,PBST洗膜3次,10 min/次,二抗室溫孵育1 h,洗膜同前。ECL顯影曝光條帶并分析結(jié)果。
37 ℃水浴鍋內(nèi)復(fù)蘇mESCs,隨后加入適量完全培養(yǎng)基離心、重懸并輕輕吹打,轉(zhuǎn)移至提前0.1% geltin明膠包被培養(yǎng)皿中,37 ℃、5%CO2飽和濕度培養(yǎng)。mESCs培養(yǎng)基濃度與成份配比,50 mL為例:FBS 7.5mL、Glutamax 500 μL、P/S 500 μL、NEAA 500 μL、β-巰基乙醇 3.5 μL、LIF 5 μL、高糖H-DMEM補足50 mL。293T細(xì)胞培養(yǎng)基濃度和成份配比,50 mL為例:FBS 5 mL、Glutamax 500 μL、P/S 500 μL、NEAA 500 μL、高糖H-DMEM補足50 mL。
待測細(xì)胞均采用Trizol提取RNA,參照反轉(zhuǎn)錄試劑盒RT-PCR逆轉(zhuǎn)錄為cDNA ,然后根據(jù)Brilliant SYBR Green qRT-PCR Master Mix試劑說明書程序進(jìn)行qRT-PCR測定基因表達(dá)。qRT-PCR 10 μL反應(yīng)體系:cDNA 0.3 μL、SYBR 5 μL、F 0.2 μL、R 0.2 μL、ddH2O 4.3 μL。本文中所用的qRT-PCR引物如下:PHC1:F:5′-GAGTCAGACAGAGCACCAGC-3′,R:5′-CTGCACTGCTTGTCGTTCAT-3′;Actin:F:5′-GTGTGACGACGAGGAGAC-3′,R:5′-CGATGGACGGGAAGACAG-3′;nanog:F:5′-TGAGCTATAAGCAGGTTAAGAC-3′,R:5′-CAATGGATGCTGGGATACTC-3′;oct4:F:5′-CACGAGTGGAAAGCAACTCAG-3′,R:5′-CTGGGAAAGGTGTCCCTATAG-3′;sox2:F:5′-CGAGATAAACATGGCAATCAAATG-3′,R:5′-AACG TTTGCCTTAAACAAGACCAC-3。
PHC1、nanog、sox2、oct4、DAPI免疫熒光染色,具體步驟為:棄培養(yǎng)基,PBS漂洗3遍,4%的多聚甲醛固定樣本,避光15 min,PBS漂洗3遍,加入封閉液0.5 mL/孔,封閉30 min后棄去,4 ℃避光過夜孵育一抗,次日PBST漂洗3次,5 min/次,孵育二抗,室溫避光約2 h后吸走二抗,PBST洗3次,5 min/次,DAPI核染12孔板,0.5 mL/孔,10 min后吸走再用PBST洗3遍,5 min/次封片,激光共聚焦顯微鏡觀察、拍照并保存。
提前一天24孔板準(zhǔn)備dox誘導(dǎo)的nanog過表達(dá)細(xì)胞系,待細(xì)胞密度生長到65%~75% 時,采用Lipo2000共轉(zhuǎn)PGL-3 nanog 4.8 kb reporter (或PGL-3空載質(zhì)粒)、TOMATO-PHC1(或TOMATO空載質(zhì)粒)、Renilla質(zhì)粒(內(nèi)參質(zhì)粒)、sox2、oct4等相關(guān)質(zhì)粒,每組實驗設(shè)置3個副孔,轉(zhuǎn)染12 h后,PBS潤洗細(xì)胞3次,隨后加入40 μL Passive Lysis Buffer,于不透光的96孔板中加入100 μL的Luciferase Assay Buffer II,再加入20 μL的細(xì)胞裂解液,混勻,檢測firefly luciferase activity,得A值;另加入100 μL Stop & Glo Reagent,混勻,檢測Renilla luciferase activity,得B值(兩次檢測均使用同一臺酶標(biāo)儀),計算A/B值,作圖。PGL-3 nanog 4.8 kb reporter 示意圖如圖2。
圖2 PGL-3 nanog 4.8kb Luciferase Reporter示意圖
mESCs經(jīng)慢病毒介導(dǎo)感染shRNA后,電子顯微鏡下觀察mESCs細(xì)胞形態(tài),對照組mESCs呈圓形,核大質(zhì)少,邊界清楚(control和Empty vector組),而實驗組(shPHC1組)mESCs邊緣變的銳利,形態(tài)變的不規(guī)則,細(xì)胞出現(xiàn)明顯的分化現(xiàn)象(圖3),qRT-PCR 、Western blot灰度掃描結(jié)果均顯示PHC1在RNA和蛋白水平表達(dá)均明顯下調(diào)(P<0.05)(圖4)[6],shRNA沉默PHC1蛋白效果理想。
圖3 慢病毒介導(dǎo)的PHC1敲降細(xì)胞系(400×)實驗組mESCs中沉默PHC1蛋白后,各組細(xì)胞形態(tài);Scale Bar=100 μm
圖4 qRT-PCR及Western-Blot檢測PHC1表達(dá)A:qRT-PCR檢測PHC1的mRNA表達(dá)量;與control組比較,*P<0.05;與Empty vector組比較,#P<0.05;B:Western blot檢測PHC1蛋白;與control組比較,*P<0.05;與Empty vector組比較,#P<0.05
PHC1與nanog、sox2、oct4的免疫熒光染色分析示PHC1基因敲降的mESCs,nanog、sox2、oct4蛋白的表達(dá)同時下調(diào),且與PHC1具有下調(diào)共定位現(xiàn)象(圖5A白色箭頭所指),對其進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析,nanog下調(diào)最為顯著(nanog約60%,sox2約32%,oct4約26%)(圖5B)。同時qRT-PCR檢測多能干性基因nanog、sox2、oct4表達(dá),與control、Empty vector相比,均出現(xiàn)明顯下調(diào),且nanog下調(diào)最顯著(圖6)。
Luciferase Reporter結(jié)果證明nanog、sox2、oct4三者共存時,其luciferase熒光值最高,nanog單獨存在時次之,sox2、oct4二者存在時較低(圖7A);而當(dāng)PHC1與nanog共存時,其luciferase熒光值強(qiáng)于nanog自身,低于nanog、sox2、oct4共存時,PHC1單獨存在時,PHC1并未激活PGL-3 nanog 4.8 kb reporter的熒光值(圖7B)。
圖5 PHC1、nanog、sox2、oct4免疫熒光染色A:免疫熒光染色,白色箭頭示PHC1敲降的細(xì)胞同時下調(diào)nanog、sox2、oct4的表達(dá)。Scale Bar為20 μm,100×B:PHC1與nanog、sox2、oct4下調(diào)共定位結(jié)果與nanog組比較,*P<0.05;與sox2組比較,#P<0.05
圖6 qRT-PCR檢測多能干性基因與control組比較,*P<0.05;與Empty vector組比較,#P<0.05
圖7 PHC1與nanog的轉(zhuǎn)錄調(diào)控檢測A:nanog、sox2、oct4的轉(zhuǎn)錄活性檢測與小組b比較,*P<0.05;與小組c比較,#P<0.05;B:PHC1、nanog的轉(zhuǎn)錄活性檢測與小組b比較,*P<0.05; +表示轉(zhuǎn)染該質(zhì)粒
在以往的研究已經(jīng)表明PcG都能作用于大量的調(diào)節(jié)細(xì)胞命運相關(guān)的基因,激活基因轉(zhuǎn)錄,這些基因的活化會促進(jìn)細(xì)胞進(jìn)入分化狀態(tài)[1,7-8]。另外,PcG的結(jié)合部位富集有編碼一些信號傳導(dǎo)通路的基因TGF、BMP、Wnt和FGF,這些通路在分化譜系過程以及各組織干細(xì)胞中具有重要作用[4],也有研究證實沉默RING1A/B能夠引起mESCs的分化[9],基于以上研究,本實驗設(shè)計了在mESCs中沉默PHC1蛋白,并探討其與多能干性基因nanog的轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制。
本實驗顯示,敲降PHC1基因后,mESCs呈現(xiàn)分化狀態(tài),初步證明PHC1基因在維持mESCs多能干性方面具有重要作用。同時nanog、sox2、oct4的RNA及蛋白表達(dá)下調(diào),并存在下調(diào)共定位現(xiàn)象,且nanog的下調(diào)最顯著。推測敲降PHC1蛋白后可能是通過參與影響nanog的轉(zhuǎn)錄調(diào)控,進(jìn)一步影響nanog、oct4、sox2的核心轉(zhuǎn)錄調(diào)控,前期有研究證實,在mESCs中,細(xì)胞的多能干性很大程度上是由nanog、sox2、oct4(“鐵三角”)調(diào)控[10-12],既能相互調(diào)控,同時也能調(diào)控其自身表達(dá)[13],其中oct4和sox2能形成異源二聚體轉(zhuǎn)錄復(fù)合物,且這三種轉(zhuǎn)錄因子共同結(jié)合到基因的啟動子區(qū),激活調(diào)控維持ESC多能干性狀態(tài)基因的表達(dá)[14],抑制胚層相關(guān)基因的表達(dá);于是進(jìn)一步完善nanog Luciferase Reporter實驗,提示PHC1與nanog之間可能會形成某種復(fù)合物參與nanog的轉(zhuǎn)錄調(diào)控。結(jié)果證實,敲降PHC1蛋白后可能是因為影響了nanog的轉(zhuǎn)錄調(diào)控,從而參與了核心轉(zhuǎn)錄因子nanog、sox2、oct4之間的相互轉(zhuǎn)錄機(jī)制,而細(xì)胞內(nèi)nanog、oct4與sox2蛋白量的微小變化改變了轉(zhuǎn)錄因子在細(xì)胞內(nèi)的比例,從而影響它們對互作蛋白選擇的偏好性,改變了細(xì)胞內(nèi)基因整體的表達(dá)譜,使胚胎干細(xì)胞出現(xiàn)分化,參與mESCs多能干性維持。
綜上所述,本實驗結(jié)果初步表明,敲降PHC1基因后可能是通過影響nanog的轉(zhuǎn)錄調(diào)控,從而參與了核心轉(zhuǎn)錄調(diào)控“鐵三角”(nanog、oct4、sox2)之間的相互轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制,導(dǎo)致mESCs的分化,參與mESCs多能干性的維持。