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        遼寧地區(qū)滿族FGA基因座突變分析1例

        2018-12-07 10:09:30王超武振東
        健康大視野 2018年21期
        關(guān)鍵詞:突變

        王超 武振東

        【摘 要】

        目的:探討FGA基因座突變產(chǎn)生的原因。方法:提取案例中孩子和父親兩份血樣DNA,通過PCR擴(kuò)增和毛細(xì)管電泳得到STR基因分型。發(fā)現(xiàn)突變后加做遺傳標(biāo)記,同時檢測性染色體基因座分型。結(jié)果:發(fā)現(xiàn)FGA基因座發(fā)生1步突變,計算親權(quán)指數(shù)大于10000,性染色體分型符合孟德爾遺傳規(guī)律。結(jié)論:鑒定人員應(yīng)詳細(xì)記錄具體突變情況、被鑒定人的民族等信息,以實現(xiàn)數(shù)據(jù)共享。

        【關(guān)鍵詞】 法醫(yī)遺傳學(xué);滿族;FGA基因座;突變

        【中圖分類號】R715 【文獻(xiàn)標(biāo)志碼】

        A 【文章編號】1005-0019(2018)21-233-01

        Analysis of a mutation in the FGA locus of Manchu in Liaoning area

        Abstract Objective: Explore the causes of mutations in the FGA locus. Methods:Two blood samples were taken from the child and father in the case, and STR genotyping was obtained by PCR amplification and capillary electrophoresis. After the mutation was found, the genetic marker was added and the sex chromosome locus typing was detected. Results:A 1-step mutation was found in the FGA locus, and the calculated parental index was greater than 10,000. The sex chromosome typing was consistent with Mendelian inheritance. Conclusion:The appraisers should record in detail the specific mutations, the ethnicity of the identified person, and other information to achieve data sharing.

        Key words:Forensic genetics; Manchu; FGA locus; Mutation

        目前,STR基因座已被廣泛應(yīng)用于親子鑒定和個體識別,而相關(guān)的鑒定實踐顯示,越來越多的STR變異現(xiàn)象被人們發(fā)現(xiàn),文獻(xiàn)報道的不同地區(qū)不同民族的STR基因座頻率有不近相同。本實驗室在實踐中發(fā)現(xiàn)一例少數(shù)民族基因突變現(xiàn)象,遂對此現(xiàn)象做一分析,以期為少數(shù)民族突變數(shù)據(jù)增加信息。

        1 材料和方法

        1.1 基本案情 曾某,男,滿族,因申報戶口需要,要求對其與女兒進(jìn)行親權(quán)鑒定。

        1.2 方法

        1.2.1 DNA提取 使用Chelex-100法提取曾某與其女兒兩份血樣基因座DNA。

        1.2.2 擴(kuò)增與分析 使用GoldeneyeRRDNA身份鑒定系統(tǒng)20A試劑(基點認(rèn)知技術(shù)(北京)有限公司)復(fù)合擴(kuò)增Amelogenin 基因座和19個STR基因座()。發(fā)現(xiàn)FGA基因座存在突變后,加測MicroreaderTM 23sp-D ID System試劑(閱微基因技術(shù)有限公司)和GoldeneyeRRDNA身份鑒定系統(tǒng)17X試劑(基點認(rèn)知技術(shù)(北京)有限公司),擴(kuò)增體系和熱循環(huán)反應(yīng)按照試劑盒說明書進(jìn)行,擴(kuò)增產(chǎn)物使用AB 3130XL(美國AB公司)遺傳分析儀電泳分離擴(kuò)增產(chǎn)物,GeneMapper ID-X v1.2軟件分析得到分型結(jié)果。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 常染色體檢驗結(jié)果 共檢測常染色體38個基因座和性別基因座,檢驗結(jié)果顯示陽性對照(9947A、F312)分型正確,陰性對照未見特異性譜帶,檢材分型如下,分型結(jié)果按SF/Z JD0105001-2016《親權(quán)鑒定技術(shù)規(guī)范》中方法計算累積親權(quán)指數(shù)。

        2.2 性染色體檢驗結(jié)果 使用DXS67

        95等16個X染色體STR基因座和Amelogenin基因座進(jìn)行檢測,檢驗結(jié)果顯示陽性對照9948分型正確,陰性對照未見特異性譜帶,孩子各基因座等位基因可從曾某的分型中找到來源,檢材分型如下。

        2.3 統(tǒng)計分析 常染色體STR遵循孟德爾遺傳定律,生物學(xué)父親會將其每個基因座上一對等位基因中的一個隨機(jī)遺傳給孩子,即孩子每個基因座上一對等位基因中的一個來自生父。根據(jù)上述分型結(jié)果,除FGA基因座外,孩子各基因座等位基因可從曾某的分型中找到來源。在FGA基因座,孩子的基因型為“22”,曾某的基因型為“23,24”,曾某不能提供給孩子必需的等位基因“22”,不符合遺傳規(guī)律。按照《親權(quán)鑒定技術(shù)規(guī)范》SF/Z JD0105001-2016中不符合遺傳規(guī)律情形時親權(quán)指數(shù)的計算方法,F(xiàn)GA基因座的親權(quán)指數(shù)為0.0030。根據(jù)中國滿族群體調(diào)查數(shù)據(jù)[1]和漢族群體調(diào)查數(shù)據(jù)[2],對曾某與孩子檢驗結(jié)果進(jìn)行統(tǒng)計分析,累積親權(quán)指數(shù)為1.65×1012。

        3 討論

        在親權(quán)鑒定實踐中,一般認(rèn)為發(fā)現(xiàn)3個或3個以上STR基因座違反孟德爾遺傳定律時才得出排除結(jié)論。若只有1個或2個STR基因座違反孟德爾遺傳規(guī)律時,為避免因STR基因突變導(dǎo)致錯誤地排除親子關(guān)系,應(yīng)增加遺傳標(biāo)記進(jìn)行檢測,根據(jù)所測結(jié)果進(jìn)行綜合分析,以排除或認(rèn)定親子關(guān)系。本案例在應(yīng)用GoldeneyeRDNA檢測系統(tǒng)發(fā)現(xiàn)突變后,及時增加MicroreaderTM 23sp-D檢測系統(tǒng),將常染色體檢測系統(tǒng)增加至39個基因座,同時又補(bǔ)充檢測性別染色體檢測系統(tǒng),以獲取更多的遺傳信息。

        研究表明,STR基因座發(fā)生突變的主要機(jī)制是由于復(fù)制滑鏈錯配,即在DNA復(fù)制過程中,DNA聚合酶發(fā)生滑脫,重復(fù)序列易堿基錯配,形成一個或數(shù)個重復(fù)序列的環(huán)狀結(jié)構(gòu),如繼續(xù)復(fù)制,就會出現(xiàn)新生鏈加長或縮短的現(xiàn)象[3]。本案例中FGA基因座突變?yōu)闇p少一個重復(fù)單位,這在STR基因座突變中比較少見,大多數(shù)研究結(jié)果顯示STR基因座突變中重復(fù)序列的增加比減少更為常見[4,5]。通常STR基因座核心序列重復(fù)次數(shù)越多,基因的突變率越高。突變率最高的基因座,同時也是多態(tài)性最高的基因座,具有更多的等位基因。目前,常用的STR基因座突變率在0.1%-0.5%。FGA等位基因的范圍在12.2-51.2,觀察到的等位基因數(shù)目達(dá)80個,共有69種變異[6],突變率在0.2%-0.22%之間。根據(jù)蔡穎[7]等研究,中國不同地區(qū)同一STR基因座突變率無顯著差異,但中國人群的突變數(shù)據(jù)中僅個別標(biāo)明了研究的民族,民族也是STR基因座突變率差異的原因之一。所以為了更全面的了解中國人群中STR基因座的突變規(guī)律,鑒定人員在實際工作中應(yīng)多加注意,詳細(xì)記錄具體的突變情況、被鑒定人的民族等信息,實現(xiàn)數(shù)據(jù)共享。

        參考文獻(xiàn)

        [1] 那春福,魏建生,金萍.遼寧清原縣滿族19個STR基因座遺傳多態(tài)性[J].中國法醫(yī)學(xué)雜志,2015,30(5):511-512.

        [2] B Xie,L Chen ,Y Yang, et al.Genetic distribution of 39 STR loci in 1027 unrelated Han individuals from Northern China[J].Forensic Science International Genetics,2015,11(19):205–206.

        [3] Jeffreys A J,Barber R,Bois P,et al. Human minisatellites, repeat DNA instability and meiotic recombination[J]. Electrophoresis,2015,20(8):1665-1675.

        [4] Lu D,Liu Q,Wu W,etal. Mutation analysis of 24 short tandem repeats in Chinese Han population[J]. International Journal of Legal Medicine,2012,126(2):331-335.

        [5] 李茜,程良紅,魏天莉,等. 親子鑒定中STR基因座的基因突變分析[J].中國法醫(yī)學(xué)雜志,2008,23(6):394-396.

        [6] 李成濤,郭宏,趙珍敏,等.親權(quán)鑒定中常用STR基因座的基因組學(xué)和遺傳學(xué)分析[J].法醫(yī)學(xué)雜志,2008,24(3):214-220.

        [7] 蔡穎,周廣彪,趙書民,等.中國人群親權(quán)鑒定常用STR基因座平均突變率的估計[J].中國司法鑒定,2010,52(5):56-59.

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