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        二代測(cè)序技術(shù)在救治重癥監(jiān)護(hù)病房重癥下呼吸道感染中的實(shí)踐效果

        2018-11-02 05:03:22邢士剛
        醫(yī)藥前沿 2018年31期
        關(guān)鍵詞:病原體測(cè)序耐藥

        邢士剛

        (臨沂市中心醫(yī)院 山東 臨沂 276400)

        近年來(lái),隨著臨床器官移植、腫瘤化療患者的增多,廣譜抗生素、免疫抑制劑、抗腫瘤藥物和化療等臨床治療手段的廣泛開(kāi)展,以及我國(guó)人口老齡化進(jìn)程加快,免疫受損病人數(shù)量日益增多,重癥下呼吸道感染的比例呈明顯上升趨勢(shì);與此同時(shí),感染的病原微生物呈現(xiàn)多樣化和復(fù)雜化,細(xì)菌耐藥問(wèn)題日益突出,重癥下呼吸道感染的臨床救治業(yè)已成為研究焦點(diǎn)。重癥下呼吸道感染病原體通常不明確,當(dāng)前主要采用抗原/抗體免疫學(xué)方法、傳統(tǒng)微生物培養(yǎng)技術(shù)進(jìn)行診斷,但這些方法多存在培養(yǎng)周期長(zhǎng)、培養(yǎng)陽(yáng)性率低的問(wèn)題,同時(shí)非培養(yǎng)技術(shù)基于醫(yī)務(wù)人員對(duì)疾病的傾向性診斷,復(fù)雜疑難感染性疾病對(duì)病原普全面檢測(cè)需要通常無(wú)法得到滿(mǎn)足。二代測(cè)序技術(shù)是新型DNA/RNA測(cè)序方法,一方面具有更高通量和測(cè)速速度,另一方面理論上能夠?qū)⑺袧撛诓≡w無(wú)偏倚檢測(cè)出來(lái),所以在重癥下呼吸道感染診斷中該技術(shù)具有重要應(yīng)用價(jià)值。本研究選擇我院收治重癥下呼吸道感染患者120例,隨機(jī)分為實(shí)驗(yàn)組和常規(guī)組,常規(guī)組采用美羅培南降階梯經(jīng)驗(yàn)性廣譜抗菌治療,實(shí)驗(yàn)組采用NGS技術(shù)測(cè)定BALF和痰液明確病原微生物后選用相應(yīng)的抗菌藥物進(jìn)行治療。

        1.資料與方法

        1.1 一般資料

        本次研究分析我院收治的120例重癥下呼吸道感染患者,男性患者75例,女性患者55例,患者最小年齡28歲,最大年齡67歲,平均年齡(48.14±4.84)歲。將患者分成實(shí)驗(yàn)組和常規(guī)組,兩組各60例,兩組患者臨床資料差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,具備可比性(P>0.05)。

        1.2 方法

        1.2.1 常規(guī)組治療

        常規(guī)組患者采用美羅培南進(jìn)行治療,采用靜脈注射的方式,將100ml 5%的葡萄糖溶液與0.45g美羅培南混合,每天2~4次,連續(xù)治療兩周。

        1.2.2 實(shí)驗(yàn)組檢測(cè)和治療

        (1)樣本護(hù)理和DNA提?。喝?.5~3ml痰夜,經(jīng)玻璃珠混合震蕩后依據(jù)TIANamp Micro DNA Kit試劑盒步驟提取DNA。(2)文庫(kù)構(gòu)建和測(cè)序:應(yīng)用Agilent 2100 Bioanalyzer質(zhì)控文庫(kù)片段大小,應(yīng)用Qubit dsDNA HS Assay Kit質(zhì)控分析DNA文庫(kù)濃度,環(huán)化形成單鏈環(huán)形結(jié)構(gòu)。文庫(kù)環(huán)化后經(jīng)滾環(huán)復(fù)制生成DNB納米球,將其加載到測(cè)序芯片,通過(guò)BGISEQ-500測(cè)序。(3)數(shù)據(jù)分析:將長(zhǎng)度小于35bp和低質(zhì)量數(shù)據(jù)去除,通過(guò)BWA對(duì)比,去除高質(zhì)量數(shù)據(jù)中比對(duì)上人參考基因序列,剩下數(shù)據(jù)將低復(fù)雜度reads去除后,和專(zhuān)用微生物大數(shù)據(jù)比對(duì),按照細(xì)菌、病毒、真菌、寄生蟲(chóng)將比對(duì)后數(shù)據(jù)進(jìn)行分類(lèi)和排列。依據(jù)檢出毒力基因、耐藥基因的信息應(yīng)用抗菌藥物治療。

        1.3 觀察指標(biāo)

        對(duì)兩組患者的治療效果和不良反應(yīng)發(fā)生情況進(jìn)行對(duì)照。

        1.4 療效判定標(biāo)準(zhǔn)

        患者下呼吸道感染癥狀完全消退,生命體征正常為有效;患者下呼吸道感染癥狀得到改善,生命體征正常為改善;患者下呼吸道感染癥狀沒(méi)有任何改善,生命體征不正常為無(wú)效。

        1.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

        本次研究采用SPSS22.0進(jìn)行相關(guān)數(shù)據(jù)分析,采用標(biāo)準(zhǔn)差進(jìn)行計(jì)量資料分析,采用(%)進(jìn)行計(jì)數(shù)資料分析,結(jié)合χ2檢驗(yàn),P<0.05為差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2.結(jié)果

        2.1 兩組臨床治療效果對(duì)照

        實(shí)驗(yàn)組的治療有效率高于常規(guī)組,差異明顯(P<0.05)。結(jié)果見(jiàn)表1。

        表1 兩組臨床治療效果對(duì)照

        2.2 兩組不良反應(yīng)發(fā)生率對(duì)照

        實(shí)驗(yàn)組不良反應(yīng)發(fā)生率顯著低于常規(guī)組,組間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。見(jiàn)表2。

        表2 兩組不良反應(yīng)發(fā)生率對(duì)照

        3.討論

        重癥下呼吸道感染在重癥監(jiān)護(hù)病房具有較高發(fā)生率,該患者發(fā)病后需及時(shí)接受有效治療,否則會(huì)嚴(yán)重威脅患者健康和安全。下呼吸道感染的癥狀包括呼吸短促、虛弱、發(fā)燒、咳嗽和疲勞[3]。有許多癥狀符合下呼吸道感染的特征,最常見(jiàn)的兩種是支氣管炎和水腫,流感也對(duì)上呼吸道和下呼吸道產(chǎn)生影響。具體治療中醫(yī)生應(yīng)該在掌握導(dǎo)致感染的病原體的基礎(chǔ)上,合理的采用抗菌藥物[2]。臨床治療中一般都是采用抗生素治療,但是醫(yī)院內(nèi)大量的使用頭孢菌素,導(dǎo)致假單孢銅綠桿菌的耐藥性增強(qiáng),在治療中更加困難。所以,在采用抗生素治療前,首先應(yīng)明確病原體,并依據(jù)毒力基因、耐藥基因確定治療方案。

        重癥下呼吸道感染病原體通常不明確,當(dāng)前主要采用抗原/抗體免疫學(xué)方法、傳統(tǒng)微生物培養(yǎng)技術(shù)進(jìn)行診斷,但這些方法多存在培養(yǎng)周期長(zhǎng)、培養(yǎng)陽(yáng)性率低的問(wèn)題。二代測(cè)序技術(shù)是新型DNA/RNA測(cè)序方法,該技術(shù)基于對(duì)核酸分子的檢測(cè),敏感性高,耗時(shí)短,不依賴(lài)于傳統(tǒng)的病原學(xué)培養(yǎng),前期抗生素應(yīng)用對(duì)檢測(cè)影響??;能夠同時(shí)檢測(cè)細(xì)菌、真菌、病毒、寄生蟲(chóng)等各類(lèi)病原體,特異性高,同時(shí)可以檢出毒力基因、耐藥基因的信息;檢測(cè)通量極大,一次可以檢測(cè)出超過(guò)1千萬(wàn)條序列,理論上檢測(cè)病原體通量可以達(dá)到1千萬(wàn);不僅可以發(fā)現(xiàn)已知病原體,而且可以發(fā)現(xiàn)完全未知的病原體。

        本研究中,實(shí)驗(yàn)組采用NGS技術(shù)測(cè)定BALF和痰液明確病原微生物后選用相應(yīng)的抗菌藥物進(jìn)行治療。實(shí)驗(yàn)組治療效果明顯好于常規(guī)組,實(shí)驗(yàn)組不良反應(yīng)發(fā)生率低于常規(guī)組,兩組差異顯著(P<0.05)。可見(jiàn),在重癥下呼吸道感染治療中采用二代測(cè)序技術(shù),可以指導(dǎo)抗菌藥物應(yīng)用,做到精準(zhǔn)治療,從而降低耐藥菌株的耐藥性,提升治療效果,具有較高推廣價(jià)值。

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