摘要:指出了聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)是目前的一種最基本也是應(yīng)用最廣泛的技術(shù)。由于PCR反應(yīng)的快速、靈敏、操作簡便等優(yōu)點(diǎn)使其在短短的數(shù)年時(shí)間即被廣泛應(yīng)用于各大領(lǐng)域。介紹了PCR反應(yīng)的原理以及常用的PCR反應(yīng)技術(shù),探討了該技術(shù)在醫(yī)學(xué)、食品工業(yè)、環(huán)境監(jiān)測、農(nóng)業(yè)中的運(yùn)用,以期提供參考。
關(guān)鍵詞:聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng);技術(shù);應(yīng)用
中圖分類號:TS907
文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A
文章編號:16r 4-9944(2018)8-0230-02
1 引言
20世紀(jì)80年代中期,Mullis發(fā)明了體外核酸擴(kuò)增技術(shù)——聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng),又稱PCR( PolymeraseChain Reaction)反應(yīng)。PCR反應(yīng)是一種在生物體外模擬生物體內(nèi)復(fù)制進(jìn)行特定的DNA片段的放大擴(kuò)增的分子生物學(xué)技術(shù)。PCR反應(yīng)具有特異性強(qiáng)、靈敏度高、易重復(fù)、簡便、快速等突出優(yōu)點(diǎn)使其在短短的數(shù)年時(shí)間即被廣泛應(yīng)用于各大領(lǐng)域如醫(yī)學(xué)診斷、環(huán)境監(jiān)測、食品行業(yè)、農(nóng)業(yè)、基因工程等。筆者將從PCR反應(yīng)的原理、技術(shù)及應(yīng)用方面進(jìn)行綜述。
2 PCR反應(yīng)的原理
DNA的半保留復(fù)制,具有高度的保真性,保證親代DNA和了代DNA具有相同的遺傳信息,為維持物種的穩(wěn)定性和連續(xù)性起著非常重要的作用。PCR反應(yīng)的基本原理就是模擬DNA的體內(nèi)復(fù)制過程進(jìn)行DNA的體外擴(kuò)增,通過設(shè)計(jì)特異性引物快速擴(kuò)增所需的目的DNA序列。該技術(shù)是在模板DNA、dNTP mix、特異性引物、耐熱的DNA聚合酶(Taq酶)和含Mg2+的緩沖液存在下的酶促反應(yīng),反應(yīng)需在PCR儀中完成。PCR反應(yīng)通常由變性、退火、延伸3個(gè)階段構(gòu)成:①變性。酶促反應(yīng)體系的溫度加熱至90~95℃,模板DNA雙鏈變性解離成單鏈DNA;②退火。溫度降至50~55℃,引物與單鏈DNA結(jié)合,形成局部雙鏈;③延伸。反應(yīng)體系的溫度升高至72℃,以dNTP為原料,經(jīng)熱穩(wěn)定的Taq酶的催化,合成一條與模板鏈互補(bǔ)的新DNA鏈。變性、退火、延伸這3個(gè)步驟就構(gòu)成了PCR的一個(gè)循環(huán),經(jīng)過大概30個(gè)循壞。就可以將待擴(kuò)增目的基因擴(kuò)增數(shù)百萬倍以上。
3 常用的PCR反應(yīng)技術(shù)
3.1 定量PCR技術(shù)
定量PCR技術(shù)是指以外參或內(nèi)參為標(biāo)準(zhǔn),通過對PCR終產(chǎn)物的分析或PCR過程的監(jiān)測,進(jìn)行PCR起始模板量的定量[1]。目前,采用定量PCR方法主要包括半定量PCR、熒光定量PCR、定時(shí)定量PCR等。比如,可以借助半定量PCR技術(shù)分析目的基因在植物或者動(dòng)物的不同組織和發(fā)育不同時(shí)期的表達(dá)情況,判斷該基因是組織特異性基因還是組成型基因,為基因功能的預(yù)測提供一定的基礎(chǔ)。
3.2 逆轉(zhuǎn)錄PCR(RT-PCR)技術(shù)
RT - PCR技術(shù),將RNA的逆轉(zhuǎn)錄(RT)和cDNA的聚合酶鏈?zhǔn)綌U(kuò)增反應(yīng)(PCR)二者相結(jié)合在一起。以RNA為模板,經(jīng)逆轉(zhuǎn)錄酶的催化合成cDNA,再以cD-NA為模板進(jìn)行PCR反應(yīng)。RT - PCR技術(shù)靈敏而且用途廣泛,可用于克隆mRNA的3和5的末端序列獲得基因的全場序列、檢測細(xì)胞或者組織中基因表達(dá)水平、測定細(xì)胞中RNA病毒的含量和直接克隆特定基因的cDNA序列等[2]。
3.3 巢式PCR技術(shù)
巢式PCR是一種變異的聚合酶鏈反應(yīng)(PCR),區(qū)別于一般的PCR反應(yīng)。它使用兩對PCR引物通過兩輪PCR反應(yīng)(Outcr PCR和Inner PCR)擴(kuò)增特異性的DNA片段。其中,第一對引物擴(kuò)增片段和普通PCR相似,其擴(kuò)增的產(chǎn)物為第二輪Inner PCR的模板。第二對引物為巢式引物,結(jié)合在第一輪PCR產(chǎn)物內(nèi)部,使得第二輪Inner PCR擴(kuò)增片段小于第一次擴(kuò)增。例如,利用巢式PCR技術(shù)可以快速檢測到病料中的豬瘟病毒,在豬瘟的早期檢測及預(yù)防、控制上起到重要的作用[3]。
3.4 原位PCR技術(shù)
原位PCR技術(shù)是在原位雜交和PCR技術(shù)的基礎(chǔ)上發(fā)展起來的分子生物學(xué)技術(shù)。原位PCR技術(shù)可在組織切片或組織細(xì)胞里進(jìn)行PCR反應(yīng),從而在細(xì)胞和分子水平上檢測到特定的基因序列,具有高度特異性、高度的敏感性和細(xì)胞定位準(zhǔn)確的能力[4]。比如,在病理學(xué)領(lǐng)域,原位PCR技術(shù)不僅可以用于檢測細(xì)胞或者微生物病原的核酸,還可用于分析腫瘤、遺傳性疾病等內(nèi)源基因的變化,以及跟蹤疾病與治療過程帶來的基因組改變,在分子水平上闡述疾病發(fā)生發(fā)展與致病因子之間的相互作用,在病理學(xué)研究與診斷中得到越來越廣泛的應(yīng)用[5]。
3.5 多重PCR技術(shù)
多重PCR在同一個(gè)PCR反應(yīng)系統(tǒng)中加入了兩對或兩對以上的寡核苷酸引物,并且同時(shí)能擴(kuò)增出數(shù)量較多的核酸片段的PCR,其反應(yīng)原理和操作過程一般與其他PCR相同[6]。
4 PCR反應(yīng)技術(shù)的應(yīng)用
4.1
PCR技術(shù)在醫(yī)學(xué)上的應(yīng)用
PCR技術(shù)由于其突出的優(yōu)點(diǎn),對腫瘤、遺傳病和感染性疾病的早期診斷,指導(dǎo)臨床治療和病情的觀察具有非常重要的意義。
4.1.1
Bart'S胎兒水腫綜合征
胎兒由于缺乏a珠蛋白基因表達(dá),宮內(nèi)嚴(yán)重貧血,多于孕晚期或出生后很快死亡。這種缺失型綜合征可用PCR鑒定基因擴(kuò)增產(chǎn)物的有無進(jìn)行基因的診斷,對Hb Bart's水腫胎早期流產(chǎn),是重要預(yù)防出生缺陷的措施[7]。
4.1.2 甲型肝炎的診斷與預(yù)防
通過PCR技術(shù)擴(kuò)增患者血液、尿液中甲型肝炎病毒( HAV)特異性基因片段(HAV- RNA)來作為HAV鑒定和檢測診斷手段,能有效對甲型肝炎進(jìn)行早期診斷以及預(yù)防其傳播流行。
4.2
PCR技術(shù)在食品工業(yè)中的應(yīng)用
民以食為天,健康、放心、安全的食品是每一個(gè)人心中的夢想。傳統(tǒng)食品中微生物致病菌的檢測的步驟繁瑣費(fèi)時(shí),并對那些難以人工培養(yǎng)的微生物無法檢測。PCR技術(shù)剛好可以解決傳統(tǒng)微生物檢測所面臨的難題,檢測人員可以借助PCR反應(yīng)檢測食品中的沙氏門菌、大腸桿菌、金黃色葡萄球菌,讓人們的食品更加安全。
4.3
PCR技術(shù)在環(huán)境監(jiān)測中的應(yīng)用
近年來隨著PCR技術(shù)應(yīng)用的發(fā)展,對大氣、土壤、水等方面的環(huán)境監(jiān)測發(fā)揮著越來越重要的作用。譬如,用熒光定量PCR技術(shù)檢測環(huán)境激素一二惡英,其結(jié)果與其他生物學(xué)方法高度一致,并且靈敏、快速、經(jīng)濟(jì)的特點(diǎn)可作為大量污染點(diǎn)和基層單位進(jìn)行二惡英樣本的預(yù)篩手段[8]。
4.4
PCR技術(shù)在農(nóng)業(yè)中的應(yīng)用
PCR技術(shù)在農(nóng)業(yè)中也有有非常廣泛的應(yīng)用如轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測、作物的遺傳育種。植物從萌發(fā)到衰老整個(gè)生命周期除了可以看到的外在的因素的影響,電受到內(nèi)在的因素基因的調(diào)控。研究整個(gè)周期過程基因表達(dá)的變化是揭示生長發(fā)育機(jī)理的重要手段。定量RTPCR是研究植物基因表達(dá)水平變化的一項(xiàng)重要技術(shù)。譬如,為了減少秋季低溫使得霜期提前,影響棉花的產(chǎn)量和晶質(zhì),人類一直在積極探索能夠促進(jìn)植物早花的分子機(jī)理與機(jī)制。研究發(fā)現(xiàn)從棉花中克隆了一個(gè)成花素類似基因GhFTL1,通過對其功能進(jìn)行初步分析,在擬南芥中組成型表達(dá)GhFTLl時(shí),轉(zhuǎn)基因擬南芥開花比野生型明顯提早,為借助基因工程手段調(diào)控棉花的開花時(shí)間具有重要的理論指導(dǎo)意義[9]。
5 結(jié)論
隨著科學(xué)的不斷發(fā)展,PCR技術(shù)也在不斷創(chuàng)新與完善,它將滲透到生活的各個(gè)領(lǐng)域,人類將在農(nóng)業(yè)、食品、醫(yī)藥、基因工程方而取得更大的突破!
參考文獻(xiàn):
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6]趙紅慶,宛錫銅,黃留玉,多重PCR技術(shù)在病原檢測中的應(yīng)用[J].生物技術(shù)通訊,2008,18(9):863~865.
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