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        金華地區(qū)慢性乙型肝炎患者HBV基因型及耐藥基因位點突變類型分析

        2017-08-11 08:51:48劉穎朱以軍王月
        浙江醫(yī)學(xué) 2017年14期
        關(guān)鍵詞:突變率基因突變乙型肝炎

        劉穎 朱以軍 王月

        金華地區(qū)慢性乙型肝炎患者HBV基因型及耐藥基因位點突變類型分析

        劉穎 朱以軍 王月

        目的 分析金華地區(qū)慢性乙型肝炎患者HBV基因型分布特征及HBV耐藥基因位點突變情況,并探討兩者的關(guān)系。方法 選取104例經(jīng)核苷(酸)類似物治療的慢性乙型肝炎患者為研究對象,采用Sanger雙脫氧法測序技術(shù)檢測患者血清HBV的基因型和10種常見的HBV P區(qū)耐藥基因位點突變情況,并分析兩者關(guān)系。 結(jié)果 本組慢性乙型肝炎患者中,HBV B基因型占46.15%,C基因型占53.85%,未發(fā)現(xiàn)其他基因型。檢測出發(fā)生耐藥基因位點突變61例,突變率為58.65%,其中C基因型占65.57%,B基因型占34.43%。HBV P區(qū)耐藥基因位點突變率最高的為M204V/I(73.85%),其次為L180M(36.92%)和A181V/T(23.08%)。HBVP區(qū)耐藥基因發(fā)生單位點突變的占50.82%,其中M204I突變類型最多(29.51%);發(fā)生多位點突變的占49.18%;以M204I和M204V/I+L180M兩種突變類型最常見。HBVC基因型的患者耐藥基因突變率高于B基因型的患者(71.43%vs 43.75%,P<0.05),其中C基因型的患者A181V/T位點突變率高于B基因型的患者(14.29%vs 2.08%,P<0.05)。 結(jié)論 金華地區(qū)慢性乙型肝炎患者HBV基因型以B、C基因型為主;HBV P區(qū)耐藥基因位點突變類型以M204I和M204V/I+L180M兩種類型最常見;HBV C基因型的患者比B基因型的患者更易發(fā)生耐藥突變,且更易發(fā)生A181V/T位點突變。

        慢性乙型肝炎 耐藥突變 基因型 核苷(酸)類似物

        HBV感染呈世界性流行,WHO估計全世界約有3.5~4億人感染HBV[1]。我國是一個肝炎大國,據(jù)2006年全國乙型肝炎流行病學(xué)調(diào)查數(shù)據(jù)顯示,我國1~59歲一般人群HBsAg攜帶率為7.18%,5歲以下兒童的HBsAg攜帶率為0.96%。據(jù)此推算,我國現(xiàn)有慢性HBV感染者約9 300萬人,其中慢性乙型肝炎患者約2 000萬人[2-3]。目前HBV已發(fā)現(xiàn)有A~I 9個基因型,在我國以C基因型和B基因型為主。研究表明,HBV基因型與疾病進展和干擾素(IFN)α治療效果有關(guān);與C基因型感染者相比,B基因型感染者較早出現(xiàn)HBeAg血清學(xué)轉(zhuǎn)換,較少進展為慢性肝炎、肝硬化和原發(fā)性肝癌;HBeAg陽性患者對IFNα治療的應(yīng)答率,B基因型高于C基因型,A基因型高于D基因型[1]。慢性乙型肝炎抗病毒治療的藥物主要為兩大類:IFN和核苷(酸)類似物(NAs)。目前臨床上應(yīng)用的抗HBV的NAs有5種:拉米夫定、阿德福韋酯、恩替卡韋、替比夫定和替諾福韋酯。隨著NAs長期廣泛的應(yīng)用,HBV反轉(zhuǎn)錄酶(RT)基因的突變也明顯增加,使慢性乙型肝炎的抗病毒治療變得更為復(fù)雜。因此,本研究探討金華地區(qū)HBV基因型分布和慢性乙型肝炎患者HBV P區(qū)耐藥基因突變情況,以期為臨床慢性乙型肝炎抗病毒治療提供參考,現(xiàn)報道如下。

        1 對象和方法

        1.1 對象 選取2015年10月至2016年10月本院收治的慢性乙型肝炎患者104例,其中男77例,女27例;年齡22~69(42.8±12.1)歲。所有患者均符合2011年中華醫(yī)學(xué)會肝病學(xué)和感染病學(xué)分會聯(lián)合修訂的《慢性乙型肝炎防治指南》的診斷標(biāo)準(zhǔn),且所有患者都有NAs抗病毒治療的用藥史。

        1.2 儀器和試劑 ABI3500測序儀(美國ABI公司)、PCR擴增儀(美國Thermo Fisher Scientific公司)、高速低溫離心機(美國Thermo scientific公司,型號FRESCO 17)、凝膠成像分析儀(美國BIO-RAD公司,型號ChemiDoc XRS+)、瓊脂糖凝膠電泳儀(美國BIO-RAD公司)。病毒基因組DNA/RNA提取試劑盒(北京天根生化科技有限公司)、普通DNA純化試劑盒(北京天根生化科技有限公司)、HBV耐藥基因突變檢測試劑盒(中山大學(xué)達安基因股份有限公司)、PCR擴增試劑(日本TaKaRa公司,型號PrimeSTAR HS PREMIX)。

        1.3 標(biāo)本采集 采用促凝分離膠真空采血管采集患者外周血3ml,離心后將血清轉(zhuǎn)移到1.5ml離心管中冷凍保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.4 HBV P區(qū)耐藥基因突變位點 包括10個位點:I169T、V173L、L180M、A181V/T、T184A/G/S/I/L/F、A194T、S202G/I、M204V/I、N236T、M250V/L/I。該10個位點均為國內(nèi)外臨床公認(rèn),且為美國FDA批準(zhǔn)用于治療HBV的所有NAs的耐藥突變相關(guān)位點。

        1.5 HBV基因型和HBV P區(qū)耐藥基因檢測 HBV P區(qū)耐藥基因檢測采用Sanger雙脫氧法測序技術(shù),使用HBV耐藥基因突變檢測試劑盒進行。PCR擴增出HBV P區(qū)基因,擴增產(chǎn)物經(jīng)凝膠電泳鑒定和純化后,進行測序PCR,將測序PCR產(chǎn)物純化后在ABI3500測序儀上進行測序。最后將測序得到的基因序列在CelLoud平臺數(shù)據(jù)庫進行比對,得到HBV基因型和耐藥突變位點。

        1.6 統(tǒng)計學(xué)處理 應(yīng)用SPSS17.0統(tǒng)計軟件;計數(shù)資料以頻數(shù)和構(gòu)成比表示,組間比較采用χ2檢驗;P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 HBV基因型分布 本組慢性乙型肝炎患者中B基因型有48例,占46.15%;C基因型有56例,占53.85%;未檢測到其他類型的基因型。

        2.2 HBV P區(qū)耐藥基因檢測結(jié)果 本組慢性乙型肝炎患者中有61例檢測到耐藥基因突變,突變率為58.65%。在所檢測的10個突變位點中有9個位點檢測到突變:L180M、A181V/T、T184A/G/S/I/L/F、S202G/I、M204V/I、N236T、M250V/L/I、V173L、I169T;A194T位點未檢測到突變。HBV P區(qū)耐藥基因位點突變率情況見圖1,突變類型見表1。

        圖1 HBV P區(qū)耐藥基因位點突變率情況

        由圖1可見,HBV P區(qū)耐藥基因位點突變率最高的為M204V/I,其次為L180M,第3為A181V/T。

        由表1可見,HBV P區(qū)耐藥基因發(fā)生單位點突變的有31例(50.82%),其中M204I突變類型最多;發(fā)生多位點突變的有30例(49.18%);未檢測到L180M位點單突變,L180M突變伴隨M204V/I突變出現(xiàn)。

        2.3 HBV基因型與HBV P區(qū)耐藥基因位點突變類型的關(guān)系 見表2。

        由表2可見,HBV B基因型的患者與C基因型的患者P區(qū)耐藥基因突變率比較有統(tǒng)計學(xué)差異(P<0.05),C基因型的患者高于B基因型的患者;其中C基因型的患者A181V/T位點突變率高于B基因型的患者(P<0.05)。

        3 討論

        目前已發(fā)現(xiàn)HBV基因型有A~I 9種基因型,我國主要以B基因型和C基因型為主。HBV基因型分布具有明顯的地理差異,我國北方以C基因型為主,我國南方以B基因型為主[4-6]。本組104例慢性乙型肝炎患者中,B基因型有48例,占46.15%;C基因型有56例,占53.85%,未發(fā)現(xiàn)其他基因型。這說明金華地區(qū)HBV基因型以B型和C型為主,C基因型略高于B基因型。這可能與金華地區(qū)流動人口較多有關(guān)。馬幼麗等[7]的研究結(jié)果提示浙江HBV基因型以C基因型為主。

        表1 HBV P區(qū)耐藥基因位點突變類型

        表2 HBV基因型與HBVP區(qū)耐藥基因位點突變類型的關(guān)系[例(%)]

        HBV P區(qū)位點的基因突變是HBV對NAs發(fā)生耐藥的重要原因之一。本研究結(jié)果顯示,在104例慢性乙型肝炎患者中,有61例患者發(fā)生了不同程度的HBV P區(qū)耐藥基因突變,突變率為58.65%。其中發(fā)生單位點突變有31例,多位點突變有30例。突變率最高的突變位點是M204V/I位點,突變率為73.85%,其次是L180M位點,但是L180M突變是伴隨M204V/I突變出現(xiàn),未檢測到L180M單位點突變。這與文獻報道的結(jié)果相一致[8-9]。有研究指出L180M這個位點的伴隨性突變能夠增強HBV的復(fù)制能力,同時抵抗拉米夫定的病毒抑制作用[10]。本研究中HBV P區(qū)耐藥基因突變模式多樣,61例發(fā)生HBV P區(qū)耐藥基因突變的慢性乙型肝炎患者中,有30例(49.18%)患者發(fā)生多位點突變。這提示,金華地區(qū)慢性乙型肝炎的患者發(fā)生HBV P區(qū)耐藥基因突變率較高且易發(fā)生多位點耐藥基因突變;在發(fā)生A181V/T位點突變中,C基因型患者的突變率明顯高于B基因型。

        《HBV耐藥專家共識:2009年更新》中指出拉米夫定常見耐藥相關(guān)變異為204I/V±rtLl80M,其中rtM204V多與rtL180M變異聯(lián)合出現(xiàn),rtM204I變異可單獨出現(xiàn)。阿德福韋耐藥相關(guān)變異為rtN236T與rtA181V/T變異,2個位點變異可單獨或聯(lián)合出現(xiàn)。恩替卡韋相關(guān)變異是在rtM204V+rtL180M變異基礎(chǔ)上,聯(lián)合rtT184、rtS202或rtM250 3個位點中至少1個位點的氨基酸替代變異。替比夫定常見的耐藥相關(guān)位點為rtM204I[11]。本研究結(jié)果顯示,在所檢測到耐藥基因突變類型中以M204I和M204V/I+L180M兩種類型最常見,占50.82%(31/61),這個結(jié)果與北京佑安醫(yī)院的研究結(jié)果相同[12]。這兩種突變類型是拉米夫定和替比夫定耐藥最易發(fā)生的類型,說明金華地區(qū)慢性乙型肝炎耐藥以拉米夫定和替比夫定為主。L180M+M204V+其他的耐藥基因突變類型占18.03%(11/61),說明金華地區(qū)發(fā)生恩替卡韋的耐藥率相對較高。因此采用基因測序技術(shù)檢測HBV P區(qū)耐藥基因突變對于抗病毒療效檢測和抗病毒方案的制定與調(diào)整有重要的意義。

        綜上所述,本研究對金華地區(qū)HBV基因型分布特征和HBV P區(qū)耐藥基因突變位點類型進行初步探討,結(jié)果發(fā)現(xiàn)金華地區(qū)慢性乙型肝炎患者HBV基因型以B、C基因型為主;HBV P區(qū)耐藥基因位點突變類型多樣,以M204I和M204V/I+L180M兩種類型最常見;HBV C基因型的患者比B基因型的患者更易發(fā)生耐藥突變,且更易發(fā)生A181V/T位點突變。

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        Genotypes and mutation patterns of HBV gene in chronic hepatitis B patients in Jinhua

        LIU Ying,ZHU Yijun,WANG Yue. Department of Central Laboratory,Jinhua Central Hospital,Jinhua 321000,China

        Chronic hepatitis B Resistance mutation Genotype Nucleoside analogues

        2017-04-21)

        (本文編輯:李媚)

        10.12056/j.issn.1006-2785.2017.39.14.2017-905

        321000 金華市中心醫(yī)院中心實驗室

        劉穎,E-mail:liuyingtj2008@sina.com

        【 Abstract】 Objective To analyze genotypes and mutation patterns of HBVgene in chronic hepatitis B patients in Jinhua. Methods One hundred and four patients with chronic hepatitis B who were treated with nucleoside analogues,were enrolled in the study.Sanger sequence analysis of HBV genotypes and 10 common sites of HBV P region were performed. Results There were 46.15%cases of B genotype and 53.85%of C genotype among 104 chronic hepatitis B patients.Other genotypes were no detected.HBV P gene mutation were detected in 61 cases (58.65%);there was 65.57%in HBV C genotype and 34.43%in B genotype.M204V/I was the most common site of HBV P gene mutation (73.85%),followed by L180M (36.92%)and A181V/T (23.08%).50.82%cases had single site mutation and the most mutation pattern was M204I(29.51%);and 49.18%had multiple sites mutation;the most common mutation patterns were M204I and M204V/I+L180M.The resistance mutation rate in C genotype was higher than that in B genotype(71.43%vs 43.75%,P<0.05)and the mutation rate of A181V/T in C genotype cases was higher than that in B genotype cases(14.29%vs 2.08%,P<0.05). Conclusion Genotype B and C are the main genotypes of HBVin this study.The most common mutation patterns of HBVP gene were M204I and M204V/I+L180M.Genotype C patients had more mutations than genotype B and the A181V/T mutation pattern was more common in genotype C.

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