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        寧波地區(qū)非綜合征型耳聾患兒耳聾基因熱點突變篩查分析

        2017-06-26 13:15:18高薇薇盧文翔張雷白云飛
        浙江醫(yī)學(xué) 2017年12期
        關(guān)鍵詞:突變率雜合耳聾

        高薇薇 盧文翔 張雷 白云飛

        寧波地區(qū)非綜合征型耳聾患兒耳聾基因熱點突變篩查分析

        高薇薇 盧文翔 張雷 白云飛

        目的 篩查分析寧波地區(qū)非綜合型耳聾(NSHL)患兒耳聾基因熱點突變情況,了解該地區(qū)耳聾患兒分子流行病學(xué)特征。方法 選取寧波市特殊教育中心就讀的重度、極重度NSHL患兒168例,應(yīng)用遺傳性耳聾基因檢測試劑盒,采用多重突變阻滯擴增系統(tǒng)毛細管電泳檢測技術(shù)進行4個遺傳性耳聾基因的29個位點的突變篩查。 結(jié)果 本研究NSHL患兒中檢出耳聾基因熱點突變58例(34.52%),其中單一GJB2基因熱點突變者43例,單一SLC26A4基因熱點突變者9例,GJB2基因合并SLC26A4基因熱點突變者3例,12S rRNA基因熱點突變3例;GJB2、SLC26A4、12S rRNA基因熱點總突變率分別為27.38%、7.14%和1.79%。在所有熱點突變中,以GJB2 235delC突變率最高(23.21%),其次是GJB2 299 del AT(5.36%)。 結(jié)論 寧波地區(qū)NSHL患兒熱點突變耳聾基因以GJB2基因和SLC26A4基因為主,且GJB2 235delC是最常見突變位點。

        遺傳性耳聾 非綜合征型耳聾 熱點突變 基因診斷

        我國每年患各種出生缺陷和先天殘疾的新生兒中,聽力殘疾是最常見,也是最嚴(yán)重的,其中遺傳因素導(dǎo)致的聽力殘疾超過半數(shù)。遺傳性耳聾按表型不同可分為綜合征型耳聾(syndromic hearing loss,SHL)和非綜合征型耳聾(nonsyndromic hearing loss,NSHL)。NSHL是指只有聽力損害,不伴有耳外組織的異常和病變,約占遺傳性耳聾的70%。國內(nèi)大規(guī)模的耳聾分子流行病學(xué)調(diào)查顯示,在NSHL患者中存在幾個熱點突變:GJB2基因突變、GJB3基因突變、線粒體12S RNA和SLC26A4基因突變[1]。這些熱點突變的發(fā)現(xiàn)為我國開展耳聾基因突變的篩查、診斷及阻斷提供了理論基礎(chǔ)。本研究對寧波地區(qū)NSHL患兒進行了4個遺傳性耳聾基因的29個位點的突變篩查,以了解該地區(qū)NSHL患兒耳聾基因熱點突變譜系及發(fā)生頻率,現(xiàn)報道如下。

        1 對象和方法

        1.1 對象 選取2015年7月至2016年12月在寧波市特殊教育中心及其附屬幼兒園(鄞州區(qū)小雨點聽力語言康復(fù)中心)就讀的具有完整聽力學(xué)資料的重度、極重度耳聾患兒168例,排除各類SHL及急慢性中耳炎、聽神經(jīng)性瘤、耳外傷等有明顯原因致聾的患兒。經(jīng)問卷調(diào)查及體格檢查,全部患兒為NSHL,其中男87例,女81例;年齡3~16(11.22±4.10)歲。本研究患兒均接受了耳聾基因檢測,并取得患兒及患兒家長的知情同意并簽署知情同意書。

        1.2 方法

        1.2.1 試劑和儀器 AGCU遺傳性耳聾基因檢測試劑盒(無錫中德美聯(lián)生物技術(shù)有限公司),磁珠法DNA提取試劑盒(長春市博坤生物科技有限公司),去離子甲酰胺(美國ABI公司),POP4膠(美國ABI公司),Life Pro擴增儀(杭州博日科技有限公司),3130XL型遺傳分析儀(美國ABI公司)。

        1.2.2 DNA樣本的采集 先在干凈的15ml離心管上空白位置和管蓋上作好耳聾患兒代號標(biāo)記。耳聾患兒在取樣前30min內(nèi)停止進食。采樣人員用消毒棉簽輕輕刮取患兒口腔舌下及雙側(cè)頰黏膜口腔上皮細胞,輕輕地旋轉(zhuǎn)或刮動10次左右以保證獲得足夠的DNA,采集過程中注意避免用手觸及棉簽;采集完成后置于空氣中風(fēng)干片刻,再放回離心管并封口。

        1.2.3 檢測方法 采用磁珠法提取DNA。每例棉簽樣本用小剪刀剪取少量,可被150μl裂解液淹沒即可,提取的DNA直接用于PCR擴增。PCR擴增體系組成:Reaction Mix 5.0μl+Primers 2.0μl+熱啟動C-Taq酶0.3μl+模板(磁珠法提取)1.0μl+sdH2O 1.7μl。PCR擴增程序:預(yù)變性95℃5min,94℃1min、60℃1min、72℃1min(循環(huán)30次),終延伸72℃20min。

        1.2.4 熱點突變篩查 采用多重突變阻滯擴增系統(tǒng)毛細管電泳檢測技術(shù)篩查。取1μl PCR產(chǎn)物與10μl去離子甲酰胺和AGCU Marker SIZ-500混合物混勻,采用3130XL型遺傳分析儀檢測(進樣電壓3KV,時間10s),結(jié)果采用GeneMapper v3.2軟件進行分析。篩查4個遺傳性耳聾基因的29個位點的突變,包括GJB2基因(9、35、167、176、235、299、155、424、512)、GJB3基因(538、547)、SLC26A4基因(281、589、707、IVS7-2、1174、1226、1229、1238、1336、1548、1829、1975、IVS15+5、2027、2168)和12S rRNA基因(1494、1555、12201)。

        2 結(jié)果

        2.1 168例NSHL患兒耳聾基因熱點突變分析 本研究NSHL患兒中檢測到耳聾基因熱點突變者58例(34.52%),其中單一GJB2基因熱點突變者43例,單一SLC26A4基因熱點突變者9例,GJB2基因合并SLC26A4基因熱點突變者3例,12S rRNA基因熱點突變3例。GJB2基因熱點總突變率為27.38%(46/168),SLC26A4基因熱點總突變率為7.14%(12/168),12S rRNA基因熱點總突變率1.79%(3/168)。在上述所有熱點突變中,GJB2 235delC突變率最高,為23.21%(39/168);其次是GJB2 299 del AT,為5.36%(9/168);SLC26A4 1226G>A、2168A>G以及12S rRNA 1555A>G突變率均為1.79%(3/168);本研究患兒未檢出GJB3基因突變。168例NSHL患兒耳聾基因熱點突變分析見表1。

        表1 168例NSHL患兒耳聾基因熱點突變分析

        2.2 58例耳聾基因突變NSHL患兒突變熱點分析 由表2可見,46例GJB2基因熱點突變NSHL患兒中GJB2基因單個熱點突變的患者39例,分別為235delC純合突變21例,235delC雜合突變11例,299-300delAT雜合突變5例,176del16雜合突變1例,35delG雜合突變1例;GJB2基因2個突變熱點的患者4例,分別是299delAT/235delC復(fù)合雜合突變3例,176del16、235delC復(fù)合雜合突變1例;GJB2基因與SLC26A4基因復(fù)合突變的患者3例,分別是GJB2 235delC純合突變合并SLC26A4 1180delTTC雜合突變1例,GJB2 235delC雜合突變合并SLC26A4 2168A>純合突變1例,GJB2 299delAT/235delC雜合突變合并SLC26A4 2168A>G雜合突變1例。

        12例SLC26A4基因熱點突變NSHL患兒中,與GJB2基因復(fù)合突變3例,SLC26A4基因單一熱點突變9例:919A>G純合突變1例,1975G>C純合突變1例,雜合突變1例,1226G>A雜合突變3例,2168A>G雜合突變1例,1229C>T雜合突變2例。

        3例 12S rRNA基因熱點突變 NSHL患兒中,1555A>G均質(zhì)性突變2例,1555A>G異質(zhì)性突變1例。其中2例1555A>G均質(zhì)性突變患兒為出生后用藥致聾,另1例異質(zhì)性突變患兒為先天性聾。

        表2 58例耳聾基因突變NSHL患兒突變熱點分析(例)

        3 討論

        遺傳因素能夠影響耳聾的發(fā)生、發(fā)展,通過確定耳聾患者及高危人群的遺傳因素,給予正確的指導(dǎo)及干預(yù)措施,可一定程度上預(yù)防耳聾新發(fā)及加重。目前發(fā)現(xiàn)的耳聾基因眾多,突變譜廣泛,國內(nèi)NSHL患者耳聾基因熱點突變的確定為尋找國內(nèi)多數(shù)NSHL的病因指明了方向。

        GJB2基因突變會導(dǎo)致耳蝸中的細胞縫隙連接中斷,導(dǎo)致聽覺功能失常。目前約有50%的常染色體隱性遺傳NSHL存在該基因耳聾突變[2]。GJB2基因突變導(dǎo)致的聽力損失多表現(xiàn)為先天性、雙側(cè)對稱性、非進行性重度或極重度耳聾。GJB2基因的突變幾乎覆蓋整個編碼區(qū),其突變位點具有明顯的種族差異性,歐美人群中GJB2基因突變最多見為30delG或 35delG的熱點突變[3],紀(jì)育斌等[4]2011年通過對國內(nèi)GJB2基因突變流行病學(xué)文獻的薈萃分析認(rèn)為國內(nèi)GJB2總體致病突變率為12.88%,總體突變率為19.41%。彭新等[5]報道揚州地區(qū)278例NSHL的GJB2基因突變率為31.7%,致病突變率為23.4%。張迪等[6]報道內(nèi)蒙古自治區(qū)355例NSHL患者GJB2基因突變率為14.93%;GJB2基因具有多種突變方式,國內(nèi)多項耳聾分子流行病學(xué)調(diào)查研究表明,GJB2基因以235delC突變最常見,其次為 299delAT、176del 16,而35delG突變少見。戴樸等[7]對1 680例NSHL患者進行耳聾分子流行病學(xué)研究,發(fā)現(xiàn)GJB2 235delC突變率較高,為18.16%。于飛等[8]研究提示國內(nèi)不同地區(qū)NSHL患者235delC突變率為6.59%~25.18%。楊雪等[9]報道貴州省356例NSHL患者GJB2基因最常見突變位點是235delC。本研究結(jié)果顯示,寧波地區(qū)NSHL患兒GJB2基因致病突變率為13.01%(22/168),突變率為27.38%(46/168),表明寧波地區(qū)耳聾基因突變以GJB2突變最普遍;本研究結(jié)果顯示235delC突變率最高,為23.21%,突變率明顯高于GJB2其他位點,其中純合突變有22例,雜合突變有17例,說明235del也是寧波地區(qū)NSHL患兒中最常見的突變位點。

        SLC26A4基因突變可引起NSHL及SHL。在NSHL中,SLC26A4基因與常見的一種內(nèi)耳畸形-大前庭導(dǎo)水管綜合征的發(fā)病有直接因果關(guān)系,國內(nèi)各地區(qū)有關(guān)SLC26A4基因突變率的報道并不一致:梁鵬飛等[10]報道陜西省 800例NSHL患者SLC26A4基因突變率為18.88%;劉水霞等[11]報道廣西地區(qū)127例NSHL患者SLC26A4基因突變率為2.36%;牟書瑜等[12]報道大連地區(qū)5 266例耳聾患者中SLC26A4基因突變率為9.72%。不同種族人群中SLC26A4基因突變譜不同,國內(nèi)SLC26A4基因突變熱點主要是IVS7-2A>G:袁永一等[13]對國內(nèi)2 352例重度、極重度耳聾人群進行了SLC26A4基因全序列分析,發(fā)現(xiàn)IVS7-2A>G位點突變率達到11.52%;何本超等[14]對湖北天門市52例聾啞兒童基因檢測發(fā)現(xiàn)SLC26A4基因突變率為17.30%,以IVS7-2A>G位點突變最為常見。本研究結(jié)果顯示SLC26A4基因熱點突變率為7.14%(12/168),其中純合突變3例,分別是1975G>C、919A>G和2168A>G,此3例患兒臨床診斷均為大前庭導(dǎo)水管綜合征,其它熱點突變?yōu)殡s合突變,分別為1975G>C、2168A>G、1226G>A和1229C>T,并未發(fā)現(xiàn)國內(nèi)報道最多的IVS 7-2 A>G突變。除了選擇對象的不同,推測可能確實存在地區(qū)間的差異。受實驗條件限制,由于此基因的遺傳特性,雙等位基因突變可以導(dǎo)致耳聾表型的發(fā)生,對單雜合突變和復(fù)合雜合突變的耳聾患者,檢測結(jié)果受目前耳聾基因突變位點數(shù)目及種類的限制,不能檢出全部已知SLC26A4基因突變位點,所以SLC26A4基因單雜合突變患者應(yīng)進一步做基因測序明確病因。

        線粒體12S rRNA基因突變跟母系遺傳有關(guān),該突變攜帶者應(yīng)用氨基糖苷類藥物可造成不可逆的聽力損害。目前,mtDNA12S rRNA A1555G點突變導(dǎo)致的藥物性耳聾已成為公認(rèn)的突變致聾位點,紀(jì)育斌等[15]綜合16篇研究對象為NSHL患者的文獻數(shù)據(jù),初步得出中國患者A1555G突變率為6.62%(230/3473)。本研究結(jié)果顯示12S rRNA突變率為1.79%(3/168),低于國內(nèi)其他報導(dǎo),其中2例為1555 A>G均質(zhì)性突變,此2例患兒均為出生后用藥致聾;另1例為異質(zhì)性突變,該患兒致聾病因與其有一定相關(guān)。目前在對這3個患兒母系家庭成員進行相關(guān)調(diào)查,擬行基因突變的篩查,找出攜帶該基因突變的氨基糖苷類藥物敏感聽力正常個體,通過科普宣教、指導(dǎo)用藥、遺傳咨詢、產(chǎn)前診斷等干預(yù)措施,能阻斷該基因突變在此類家族中繼續(xù)傳遞。

        總之,耳聾基因熱點突變篩查對于耳聾阻斷意義重大。對多數(shù)耳聾患者可以從分子學(xué)進行診斷,利用基因快速檢測技術(shù)篩查耳聾人群和突變基因攜帶者,通過產(chǎn)前診斷技術(shù)預(yù)防后代耳聾的發(fā)生。

        [1] 戴樸.遺傳性耳聾的預(yù)防和阻斷[J].中華醫(yī)學(xué)雜志,2007,87(40): 2811-2813.

        [2] Walsh T,Shahin H,Elkan-Miller T,et al.Whole exome sequencingand homozygosity mapping identify mutation in the cell polarity protein GPSM2 as the cause of nonsyndromic hearing loss DFNB82[J].Am J Hum Genet,2010,87(1):90-94.

        [3] Putcha G V,Bejjani B A,Bleoo S,et al.A multicenter study of the frequency and distribution of GJB2 and GJB6 mutations in a large North American cohort[J].Genet Med,2007,9(7):413-426.

        [4]紀(jì)育斌,蘭蘭,王大勇,等.中國非綜合征型聾患者GJB2基因突變流行病學(xué)文獻薈萃分析[J].聽力學(xué)及言語疾病雜志,2011,19(4): 323-327.

        [5] 彭新,關(guān)兵,徐英,等.揚州市278例非綜合征性耳聾患者常見耳聾基因突變檢測結(jié)果分析[J].中國眼耳鼻喉科雜志,2013,13(4):254-257.

        [6] 張迪,韓東一,段宏,等.新型多基因檢測技術(shù)對內(nèi)蒙古自治區(qū)355例非綜合征性聾患者的檢測分析[J].臨床耳鼻咽喉頭頸外科雜志, 2015,29(22):1941.

        [7] 戴樸,劉新,于飛,等.18個省市聾校學(xué)生非綜合征性聾病分子流行病學(xué)研究 (I)-GJB2 235delC和線粒體DNA12S rRNA A 1555G突變篩查報告[J].中華耳科學(xué)雜志,2006,4(1):1-5.

        [8]于飛,戴樸,韓東一,等.中國部分地區(qū)非綜合征型耳聾患者GJB2基因233~235delC突變頻率分析[J].中國耳鼻咽喉頭頸外科,2006, 13(3):223-226.

        [9] 楊雪,王幼勤,郭洪源,等.貴州省356例非綜合征型聾患者常見致聾基因突變分析[J].聽力學(xué)及言語疾病雜志,2017,25(1):9-13.

        [10] 梁鵬飛,王淑娟,王劍,等.陜西省800例非綜合征型聾患者常見致聾基因突變分析[J].聽力學(xué)及言語疾病雜志,2015,23(1):11-15.

        [11] 劉水霞,胥亮,陳柏文,等.廣西地區(qū)127例非綜合征性聾患者常見致聾基因突變位點的篩查分析[J].臨床耳鼻咽喉頭頸外科雜志, 2015,29(22):1954-1958.

        [12] 牟書瑜,劉琳,崔玲,等.大連地區(qū)耳聾人群常見聾病基因突變的研究[J].大連醫(yī)科大學(xué)學(xué)報,2015,(1):34-36.

        [13] 袁永一,黃莎莎,王國建,等.27個省市聾校學(xué)生基于SLC26A4基因IVS7-2A>G突變的全序列分析[J].中華耳科學(xué)雜志,2011,9(1): 17-23.

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        [15]紀(jì)育斌,王秋菊,蘭蘭,等.國內(nèi)線粒體DNA 12S rRNA A 1555G突變的流行病學(xué)文獻分析[J].聽力學(xué)及言語疾病雜志,2010,18(1): 6-10.

        Screening of hot-spot deafness gene mutations among children with non-syndromic hearing loss in Ningbo region

        GAO Weiwei,LU Wenxiang,ZHANG Lei,et al.Ningbo College of Health Sciences,Ningbo 315800,China

        Hereditary hearing loss Non-syndromic hearing loss Hot-spot mutation Genetic diagnosis

        2017-03-19)

        (本文編輯:李媚)

        10.12056/j.issn.1006-2785.2017.39.12.2017-595

        浙江省教育廳科研項目(Y201534685)

        315100 寧波衛(wèi)生職業(yè)技術(shù)學(xué)院(高薇薇);無錫中德美聯(lián)生物技術(shù)有限公司研發(fā)部(盧文翔);浙江大學(xué)明州醫(yī)院耳鼻咽喉科、浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬邵逸夫醫(yī)院耳鼻咽喉頭頸外科(張雷);東南大學(xué)分子電子學(xué)國家重點實驗室(白云飛)

        高薇薇,E-mail:wiwi_g@163.com

        【 Abstract】 Objective To screen the hot-spot deafness gene mutation in children with non-syndromic hearing loss (NSHL)in Ningbo region. Methods One hundred and sixty eight NSHL children were enrolled from Ningbo Special Education Center for the study.The screening of 29 hot-spot mutations of 4 deafness genes was performed by multiple ARMS capillary electrophoresis using AGCU genetic deafness gene detection kit. Results Among 168 children,the deafness gene mutations were detected in 58 cases (34.52%),including 43 cases with single hotspot mutation in GJB2 gene,9 with hotspot mutations in single SLC26A4 gene,and 3 with GJB2 gene and SLC26A4 gene mutation,and 3 with 12S rRNA gene mutation.The total hot spot mutation rate of GJB2 gene was 27.38%,that of SLC26A4 gene was 7.14%,and that of 12S rRNA gene was 1.79%.The mutation rate of GJB2 235delC was the highest(23.21%),followed by GJB2 299 del AT(5.36%)in all hotspots. Conclusion GJB2 and SLC26A4 are the main genes associated with non-syndromic deafness patients in Ningbo area,and GJB2 235delC is the most common mutation site.

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