駱廣濤,王本忠
m iRNA-4465過表達(dá)對乳腺癌MDA-MB-231細(xì)胞遷移侵襲的影響及其機制
駱廣濤,王本忠
摘要目的探討miRNA-4465的過表達(dá)對乳腺癌MDAMB-231細(xì)胞遷移侵襲能力的影響及機制。方法將miRNA-4465的模擬物(minics)轉(zhuǎn)染入MDA-MB-231細(xì)胞,通過實時定量PCR檢測miRNA-4465的表達(dá)變化;運用Transwell實驗檢測轉(zhuǎn)染后細(xì)胞遷移和侵襲能力的改變。采用生物信息學(xué)技術(shù)預(yù)測miRNA-4465的潛在靶基因,并通過熒光報告載體實驗及Western blot加以證實。結(jié)果與陰性對照組相比,轉(zhuǎn)染miRNA-4465 minics組miRNA-4465表達(dá)水平明顯升高(P=0.001)。Transwell遷移實驗結(jié)果顯示轉(zhuǎn)染miRNA-4465 minics組細(xì)胞遷移能力減弱(P=0.001);Transwell侵襲實驗結(jié)果顯示轉(zhuǎn)染miRNA-4465 minics組細(xì)胞侵襲能力降低(P=0.010)。通過生物信息學(xué)技術(shù)預(yù)測了EZH2為miRNA-4465的潛在靶基因;熒光報告載體實驗結(jié)果顯示轉(zhuǎn)染miRNA-4465 minics+psiCHECK2-EZH2 3’UTR(野生型)后熒光素酶活性較轉(zhuǎn)染陰性對照序列(NC)+psiCHECK2-EZH2 3’UTR(野生型)降低66%(P=0.001)。此外將miRNA-4465轉(zhuǎn)染入MDA-MB-231細(xì)胞后EZH2蛋白表達(dá)降低。結(jié)論miRNA-4465能降低MDA-MB-231細(xì)胞的遷移和侵襲能力,這個過程可能是通過調(diào)控EZH2基因的表達(dá)實現(xiàn)的。
關(guān)鍵詞miRNA-4465;EZH2;乳腺腫瘤;轉(zhuǎn)移
2015-07-31接收
王本忠,男,教授,主任醫(yī)師,博士生導(dǎo)師,責(zé)任作者,E-mail:wangbenzhong2459@126.com
乳腺癌發(fā)生遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移是乳腺癌患者死亡的主要原因,因此研究乳腺癌轉(zhuǎn)移的相關(guān)機制對于提高轉(zhuǎn)移乳腺癌患者生存率和改善患者生活質(zhì)量具有重要意義。微小RNA(microRNA,miRNA)已經(jīng)證實能潛在促進(jìn)或抑制乳腺癌轉(zhuǎn)移[1]。近年來研究[2-4]表明,miRNA-26家族與多種腫瘤轉(zhuǎn)移侵襲有關(guān),如肺癌、肝癌及膀胱癌等。miRNA-26家族由miRNA-26a、miRNA-26b、miRNA-1297和miRNA-4465等 4個種子區(qū)序列相同(UCAAGUA)的miRNA組成。目前對于miRNA-26家族參與腫瘤轉(zhuǎn)移侵襲的研究主要集中在miRNA-26a、miRNA-26b、miRNA-1297,而miRNA-4465在乳腺癌轉(zhuǎn)移侵襲過程中的作用研究甚少。該研究擬通過將miRNA-4465 minics轉(zhuǎn)染入具有高侵襲性的乳腺癌MDA-MB-231細(xì)胞,檢測miRNA-4465對MDA-MB-231細(xì)胞遷移侵襲能力的影響,探討其作用的分子機制。
1.1材料乳腺癌MDA-MB-231細(xì)胞由中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院朱濤教授惠贈,細(xì)胞來源于美國模式培養(yǎng)物集存庫;牛血清白蛋白(BSA)、胎牛血清、DMEM培養(yǎng)基及Opti-MEM培養(yǎng)基購自Gibco公司;Transwell小室購自Corning公司;Lipofectamine 2000購自 Invitrogen公司;miRNA-4465 mimics購自銳博公司;Matrigel膠購自BD公司;EZH2抗體購自Cell Signaling Tech公司,GAPDH抗體購自Abcam公司;質(zhì)粒psiCHECK2及雙熒光素酶報告基因檢測試劑盒購自Promega公司;限制性內(nèi)切酶Xho I、Not I及逆轉(zhuǎn)錄試劑盒購自Fermentas公司;DNA連接試劑盒及實時定量PCR試劑盒購自TaKaRa公司;DNA小抽及中抽試劑盒購自Axygen公司。
1.2方法
1.2.1細(xì)胞培養(yǎng)用含10%胎牛血清的DMEM培養(yǎng)基培養(yǎng) MDA-MB-231細(xì)胞,置于 5%CO2、37℃細(xì)胞培養(yǎng)箱中常規(guī)培養(yǎng),根據(jù)細(xì)胞狀態(tài)每隔2~3 d換新鮮培養(yǎng)基一次。
1.2.2實驗分組根據(jù)轉(zhuǎn)染情況將實驗分為陰性對照組(NC組)及 miRNA-4465 minics轉(zhuǎn)染組。轉(zhuǎn)染試劑選用Lipofectamine 2000,轉(zhuǎn)染步驟參考Lipofectamine 2000轉(zhuǎn)染試劑說明書。
1.2.3實時定量PCR運用實時定量PCR檢測轉(zhuǎn)染miRNA-4465 minics至MDA-MB-231細(xì)胞后miRNA-4465的相對表達(dá)量。miRNA-4465 minics序列:5′-CUCAAGUAGUCUGACCAGGGGA-3′。首先 TRIzol法抽提細(xì)胞總RNA,再使用逆轉(zhuǎn)錄試劑盒將總RNA逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA。反應(yīng)條件為42℃60min,70℃10 min。以逆轉(zhuǎn)錄得到的cDNA產(chǎn)物為模板,使用實時定量PCR檢測miRNA-4465的相對表達(dá)量,每個樣品設(shè)置2個復(fù)孔。內(nèi)參照為U6。HsamiRNA-4465引物序列F:5′-CUCAAGUAGUCUGAC-3′,R:5′-GTGCAGGGTCCGAGGT-3′;U6引物序列F:5′-GCTTCGGCAGCACATATACTAAAAT-3′,R:5′-CGCTTCACGAATTTGCGTGTCAT-3′。實時定量PCR反應(yīng)條件如下:95℃預(yù)變性40 s,95℃變性5 s,60℃退火30 s,共40個循環(huán),溶解曲線條件:95℃15 s,60℃1 min,95℃15 s。根據(jù)反應(yīng)結(jié)束后的Ct值(Ct值為反應(yīng)中每個反應(yīng)管內(nèi)的實時熒光信號達(dá)到設(shè)定的閾值所對應(yīng)的擴增循環(huán)數(shù)),通過2-ΔΔCt法計算樣品中miRNA-4465的相對表達(dá)量。
1.2.4細(xì)胞遷移和侵襲實驗在進(jìn)行侵襲實驗時,首先用50 mg/LMatrigel1∶8稀釋包被Transwell小室底部膜的上室面。消化細(xì)胞后離心棄去培養(yǎng)液,用含有牛血清白蛋白的無血清培養(yǎng)基重懸,調(diào)整細(xì)胞密度至4×108個/L。下室加入600μl含有10%胎牛血清的完全培養(yǎng)基,24~48 h后棄去下室培養(yǎng)基,90%乙醇溶液室溫固定30 min。晾干后使用0.1%結(jié)晶紫溶液室溫染色10 min。用棉簽擦去上室的細(xì)胞,檢測下室的細(xì)胞數(shù)目并隨機取5個視野拍照。遷移實驗不需要鋪Matrigel膠,其余實驗步驟與侵襲實驗一致。
1.2.5miRNA-4465靶標(biāo)基因預(yù)測由于miRNA與其潛在靶基因的結(jié)合具有一定的規(guī)律性,可以通過生物信息學(xué)技術(shù)進(jìn)行編程從而預(yù)測miRNA的潛在靶標(biāo)基因。通過在線miRNA靶基因預(yù)測工具TargetScan、PicTar和miRanda 3個數(shù)據(jù)庫共同預(yù)測miRNA-4465的潛在靶點。
1.2.6熒光報告載體實驗從NCBI中下載人EZH2基因序列,采用Primer5.0軟件設(shè)計引物,并使用PCR法擴增EZH2 3’UTR。將EZH2 3’UTR序列插入到psiCHECK2質(zhì)粒中,并將miRNA-4465相應(yīng)識別位點突變后插入到psiCHECK2質(zhì)粒中構(gòu)建突變型質(zhì)粒。EZH2 3’UTR(野生型)引物序列F:5′-TATATTCTCGAGCATCTGCTACCTCCTCCCC-3′,R:5′-TATATGCGGCCGCCAAGTTCAAGTATTCTTAT-3′;Mut-EZH2 3’UTR(突變型)引物序列F:5′-CTTTTTATTGCCTTCTCAGGTCCTGCAAAGTGTTTG-3′,R:5′-CAAAACACTTTGCAGGACCTGAGAAGGCAATAAAAAG-3′。PCR反應(yīng)條件為:98℃5 s,98℃10 s,50℃5 s,72℃1 min,32個循環(huán)后72℃延伸2 min。分離PCR擴增的產(chǎn)物并純化。Xho I 和Not I雙酶切PCR產(chǎn)物及psiCHECK2質(zhì)粒,轉(zhuǎn)化篩選陽性克隆,挑克隆后接種于4 ml含氨芐青霉素抗性的LB培養(yǎng)液中,37℃恒溫?fù)u床培養(yǎng)10 h,小抽提取質(zhì)粒后測序。擴增克隆并提純質(zhì)粒。將MDAMB-231細(xì)胞傳至T25培養(yǎng)瓶中,待其細(xì)胞生長至30%~40%密度時將細(xì)胞消化,重懸并計數(shù),將細(xì)胞濃度調(diào)節(jié)至5×105/ml,向24孔板中每孔加入20μl細(xì)胞懸液(即1萬個細(xì)胞),用Lipofectamine 2000進(jìn)行組合轉(zhuǎn)染。實驗分組如下:野生型組:轉(zhuǎn)染入陰性對照序列+psiCHECK2-EZH2 3’UTR(野生型)和miRNA-4465minics+psiCHECK2-EZH2 3’UTR(野生型);突變型組:轉(zhuǎn)染入陰性對照序列+psi-CHECK2-Mut-EZH2 3’UTR(突變型)和miRNA-4465 minics+psiCHECK2-Mut-EZH2 3’UTR(突變型)。轉(zhuǎn)染24 h后收集細(xì)胞,加入100μl的細(xì)胞裂解液(Lysis Buffer),置于搖床避光孵育15 min。吸取細(xì)胞裂解混合液,10 000 r/min離心10 min,將上清液轉(zhuǎn)移至新的離心管中。在熒光素酶報告基因檢測儀上檢測螢火蟲熒光素酶的活性值。樣品熒光素酶活性=(海腎熒光素酶活性值-本底值)/(螢火蟲熒光素酶活性值-本底值)。每組實驗重復(fù)3次。
1.2.7Western blot法轉(zhuǎn)染后待細(xì)胞長滿6孔板,使用預(yù)冷的PBS清洗細(xì)胞2次。將PBS棄去,并迅速加入細(xì)胞裂解液進(jìn)行裂解。收取蛋白后采用標(biāo)準(zhǔn)曲線法檢測蛋白濃度,然后加入5×上樣緩沖液在100℃沸水浴中煮沸10 min。等量蛋白進(jìn)行SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳。電泳結(jié)束后使用PVDF膜進(jìn)行轉(zhuǎn)膜,轉(zhuǎn)膜條件為300 mA恒流60~90 min。轉(zhuǎn)膜后使用5%脫脂奶粉封閉PVDF膜1 h,一抗4℃孵育過夜。二抗室溫孵育1 h。使用化學(xué)發(fā)光儀進(jìn)行顯影。以GAPDH作為內(nèi)參蛋白。
1.3統(tǒng)計學(xué)處理采用SPSS 16.0及Excel軟件分析數(shù)據(jù),計量資料結(jié)果用±s表示。兩組均數(shù)比較采用t檢驗。
2.1MDA-MB-231細(xì)胞轉(zhuǎn)染m iRNA-4465 m inics后m iRNA-4465表達(dá)的改變miRNA-4465在NC組和miRNA-4465 minics轉(zhuǎn)染組的相對表達(dá)量分別為0.99±0.10、38.69±1.70。與NC組相比,miR-NA-4465 minics轉(zhuǎn)染組miRNA-4465表達(dá)水平明顯升高,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(t=39.275,P=0.001)。
2.2MDA-MB-231細(xì)胞轉(zhuǎn)染m iRNA-4465 m inics后遷移和侵襲能力的改變
2.2.1對細(xì)胞遷移能力的影響Transwell遷移實驗結(jié)果顯示NC組和miRNA-4465 minics轉(zhuǎn)染組細(xì)胞計數(shù)分別為156.67±9.29、85.67±6.03,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(t=34.715,P=0.001),見圖1。Transwell遷移實驗結(jié)果表明轉(zhuǎn)染miRNA-4465后MDAMB-231細(xì)胞遷移能力降低。
2.2.2對細(xì)胞侵襲能力的影響結(jié)果顯示NC組和miRNA-4465 minics轉(zhuǎn)染組侵襲細(xì)胞計數(shù)分別為159.67±18.18、93.00±11.00,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(t=10.151,P=0.010),見圖2。Transwell侵襲實驗實驗結(jié)果表明轉(zhuǎn)染miRNA-4465后MDA-MB-231細(xì)胞侵襲能力降低。
2.3生物信息學(xué)技術(shù)預(yù)測 EZH2為 m iRNA-4465的靶標(biāo)基因通過生物信息學(xué)技術(shù)預(yù)測了EZH2可能為miRNA-4465的潛在靶基因。圖3中為TargetScan軟件測出EZH2 3’UTR第250~257位(即斜體字部分)為miRNA-4465結(jié)合靶點。
2.4熒光報告載體實驗證實m iRNA-4465與EZH2基因的靶向關(guān)系結(jié)果顯示轉(zhuǎn)染入psi-CHECK2-EZH2 3’UTR(野生型)+miRNA-4465 minics后熒光素酶活性較轉(zhuǎn)染陰性對照序列(NC)+psiCHECK2-EZH2 3’UTR(野生型)降低66.0%,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.001);而轉(zhuǎn)染入psi-CHECK2-Mut-EZH2 3’UTR(突變型)+miRNA-4465 minics后熒光素酶活性較陰性對照序列(NC)+psi-CHECK2-Mut-EZH2 3’UTR(突變型)變化不大(下調(diào)3.0%,P=0.767),見圖4。熒光報告載體實驗證實miRNA-4465可以與EZH2 3’UTR結(jié)合,表明EZH2是miRNA-4465的直接作用靶點。
2.5MDA-MB-231細(xì)胞轉(zhuǎn)染m iRNA-4465 m inics后EZH2蛋白的表達(dá)變化與NC組相比,將miRNA-4465 minics轉(zhuǎn)染乳腺癌MDA-MB-231細(xì)胞后EZH2蛋白表達(dá)降低。見圖5。
miRNA是一類長度約為19~23個核苷酸的內(nèi)源性非編碼RNA,可以通過其種子序列與靶基因的mRNA3’非翻譯區(qū)(3’UTR)結(jié)合而抑制靶基因的轉(zhuǎn)錄和翻譯。目前已知的促進(jìn)乳腺癌轉(zhuǎn)移的miRNA有miRNA-21、miRNA-22、miRNA-103、miRNA-182、miRNA-143和miRNA-520c等;而抑制乳腺癌轉(zhuǎn)移的miRNA有miRNA-20a/b、miRNA-126、miRNA-205、miRNA-15b和miRNA-200家族等[5]。miRNA-26家族成員中miRNA-26a已經(jīng)證實能抑制乳腺癌細(xì)胞的增殖和遷移能力[6],而具有與miRNA-26a相同種子序列的miRNA-4465是否具有此功能尚不明確。本實驗將miRNA-4465 minics轉(zhuǎn)染入MDA-MB-231細(xì)胞后,成功上調(diào)了miRNA-4465的表達(dá)。隨后運用Transwell遷移和侵襲實驗檢測了轉(zhuǎn)染miRNA-4465 minics后細(xì)胞遷移和侵襲能力的改變,結(jié)果顯示MDA-MB-231細(xì)胞遷移和侵襲能力均顯著降低。TargetScan、PicTar和miRanda三種在線預(yù)測工具預(yù)測miRNA-4465潛在的靶標(biāo)基因。TargetScan預(yù)測EZH2可能是miRNA-4465的靶標(biāo)基因。本實驗挑選了EZH2作為下一步的研究基因是因為:①EZH2蛋白在乳腺癌等多種惡性腫瘤內(nèi)高表達(dá);②EZH2蛋白與乳腺癌的侵襲轉(zhuǎn)移密切相關(guān)[7];③此前已經(jīng)有研究[6]表明在乳腺癌細(xì)胞中miRNA-26a能調(diào)控EZH2基因的表達(dá)。miRNA-4465作為miRNA-26a同家族成員,具備相同的種子序列,也可能與EZH2 mRNA 3’UTR結(jié)合使其降解。在通過生物信息學(xué)技術(shù)預(yù)測了EZH2可能是miRNA-4465的下游靶標(biāo)基因后,采用熒光報告載體實驗驗證了miRNA-4465與EZH2基因的靶向關(guān)系。人EZH2基因是果蠅zeste基因增強子的同源基因,屬于多梳蛋白復(fù)合物(PcG)基因家族成員。EZH2蛋白作為EZH2基因的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物,是表觀遺傳學(xué)中多梳阻遏蛋白PRC2的一個重要的催化亞基,它具有組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶的活性,能將組蛋白H3上第27位賴氨酸三甲基化(H3K27me3),從而沉默下游基因。
目前關(guān)于miRNA-26家族調(diào)控EZH2基因的研究主要集中在miRNA-26a中。Zhang et al[8]通過研究證實在乳腺癌組織中miRNA-26a的表達(dá)降低,而EZH2基因表達(dá)升高。通過將外源性的miRNA-26a轉(zhuǎn)染至乳腺癌MCF-7細(xì)胞后,原先高表達(dá)的EZH2表達(dá)降低。Jansen etal[9]在他莫昔芬耐藥乳腺癌細(xì)胞中也發(fā)現(xiàn)EZH2基因在上游受到miRNA-26a的調(diào)控。本實驗結(jié)果表明了miRNA-4465與EZH2的靶向作用關(guān)系,而EZH2已經(jīng)證實能促進(jìn)乳腺癌的侵襲轉(zhuǎn)移,miRNA-4465對MDA-MB-231細(xì)胞遷移侵襲能力的影響是否是通過調(diào)控EZH2基因?qū)崿F(xiàn)的,還需要進(jìn)一步研究。
根據(jù)miRNA-4465在乳腺癌轉(zhuǎn)移過程中所扮演的角色可以為未來開展乳腺癌治療提供新思路,即通過外源性導(dǎo)入miRNA-4465從而抑制乳腺癌的轉(zhuǎn)移。已經(jīng)有研究者發(fā)現(xiàn)通過外源性導(dǎo)入miRNAs能通過增加抗瘤活性從而抑制腫瘤的侵襲轉(zhuǎn)移[10]。鑒于表觀遺傳學(xué)在乳腺癌發(fā)生發(fā)展過程中的重要作用,靶向抑制EZH2的表達(dá)也有可能成為乳腺癌治療的一個新策略。目前人們已經(jīng)研發(fā)了一些高選擇性的EZH2抑制劑,如GSK126及GSK343等[11]。miRNA-4465和EZH2均有可能作為轉(zhuǎn)移性乳腺癌的治療新靶點,為未來乳腺癌的治療提供新的方向。
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中圖分類號R 737.9
文獻(xiàn)標(biāo)志碼A
文章編號1000-1492(2015)11-1570-05
基金項目:安徽省自然科學(xué)基金(編號:11040606M180)
作者單位:安徽醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院乳腺外科,合肥230022
作者簡介:駱廣濤,男,碩士研究生;