亚洲免费av电影一区二区三区,日韩爱爱视频,51精品视频一区二区三区,91视频爱爱,日韩欧美在线播放视频,中文字幕少妇AV,亚洲电影中文字幕,久久久久亚洲av成人网址,久久综合视频网站,国产在线不卡免费播放

        ?

        葉子花重瓣品種DOD基因序列比對分析

        2014-09-10 02:23:40蘇進展王想蘭馮世秀王曉明胡章立
        草原與草坪 2014年2期
        關(guān)鍵詞:苞片重瓣甜菜

        蘇進展,王想蘭,馮世秀,王曉明,胡章立,陳 濤

        (1.廈門日懋城建園林建設(shè)股份有限公司,福建 廈門 361101;2.深圳市中國科學院仙湖植物園,廣東 深圳 518004;3.深圳大學 生命科學學院,廣東 深圳 518060;4.深圳市日昇園林綠化有限公司,廣東 深圳 518034)

        葉子花屬(Bougainvillea)植物是紫茉莉科(Nyctaginaceae)多年生灌木或喬木,有10余種,原產(chǎn)南美洲。栽培品種豐富,苞片顏色極其艷麗多樣,有單瓣與重瓣之分,是熱帶亞熱帶地區(qū)的重要觀賞植物,也是研究花色變異和表達的優(yōu)良材料[1]。重瓣葉子花早在20世紀60年代就陸續(xù)在菲律賓培育出來,苞片有紅色、粉紅色和橙色等[2,3],后在印度進一步培育出花葉重瓣品種[4]。

        與其他紫茉莉科和大多數(shù)石竹目(Caryophyllales)植物一樣,葉子花的苞片色素主要是甜菜色素(Betalain)。甜菜色素是一類植物次生代謝產(chǎn)生的生物堿,主要包括甜菜紅素和甜菜黃素[5]。形成甜菜色素的代謝途徑主要由DOPA4,5-雙加氧酶(DOD)催化調(diào)控[6]。研究發(fā)現(xiàn),編碼與葉子花同科的紫茉莉(Mirabilisjalapa)的DOD cDNA序列(MjDOD,AB435372.1),與甜菜(Betavulgaris:BvDOD,AJ583017)有67%的相似度,與大花馬齒莧(PhytolacagrandifloraPgDOD,AJ580598)的相似度為63%[7,8]。

        光葉子花(BougainvilleaglabraBgDOD,AB435373.1)苞片的DOPA4,5-雙加氧酶cDNA全長1 078 bp,具有一個870 bp的開放閱讀框(ORF),編碼268個氨基酸[8]。研究根據(jù)光葉子花DOD cDNA序列和蛋白質(zhì)序列(BAG80687.1)設(shè)計了一對葉子花DOD基因的特異性開放閱讀框引物BdodF/R,以具有不同苞片顏色的5個重瓣葉子花品種為材料,通過反轉(zhuǎn)錄克隆其DOD基因的開放閱讀框序列,經(jīng)序列比對來探討DOD基因與葉子花苞片不同顏色表達之間的相關(guān)性。

        1 材料和方法

        1.1 材料

        研究材料選擇苞片都是重瓣但顏色各不同或具花葉的5個重瓣葉子花栽培品種(表1)。各品種的花苞片均采自廣東省深圳市仙湖植物園葉子花保育與研發(fā)基地,用液氮取樣固定保存,供RNA提取。

        1.2 總RNA提取與cDNA合成

        采用新拓撲生物科技有限公司的新型植物總RNA提取試劑盒提取5個不同重瓣葉子花品種苞片的RNA(具體操作見NeoTopTMplant Total RNA Isolation Kit),以30 μL DEPC水溶解,于-80 ℃冰箱保存待用。取1 μL總RNA為模板,Random 6 mers為引物合成單鏈cDNA (具體操作見PrimerScriptTM1stStrand cDNA Kit),置于-20 ℃冰箱保存待用。

        表1 供試RNA提取的樣品材料Table 1 Material for RNA extraction

        1.3 DOD基因開放閱讀框克隆

        根據(jù)光葉子花DOD基因cDNA序列(BgDOD,AB435373.1)和氨基酸序列(BAG80687.1),由生工生物工程(上海)股份有限公司引物設(shè)計部設(shè)計和合成1對包含開放閱讀框序列的特異性引物,預期引物長度870 bp。所設(shè)計的引物序列為:BdodF:5′-ATGGGT GGGGAGAAAAAAATG-3′,BdodR:5′-CCAGA AAAAGCAAACACAAGAAG-3′。取1μL上述合成的單鏈cDNA為模板,BdodF/R為特異性引物PCR擴增cDNA序列,反應條件94 ℃ 4 min變性,94 ℃ 30 s、66 ℃ 30 s、72 ℃ 1 min,20個循環(huán),每一個循環(huán)降1 ℃,94 ℃ 30 s、50 ℃ 30 s、72 ℃ 1 min,20個循環(huán),72 ℃ 7 min,于4 ℃下保存。擴增產(chǎn)物用1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測后送InvitrogenTM廣州公司測序。

        1.4 DOD基因序列同源性和相似性分析比較

        通過轉(zhuǎn)錄組測序獲得不同葉子花品種的DOD cDNA序列,采用軟件ClustalX 2.0[9]進行同源性分析,并將序列數(shù)據(jù)在NCBI基因庫中進行Blast相似性檢索,應用軟件Mega5[10 ]對近緣物種進行相似性分析,采用最大似然法(Maximum Likelihood Method,ML)構(gòu)建相似性關(guān)系樹。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 DOD基因的PCR擴增

        5個不同葉子花品種的DOD cDNA經(jīng)過PCR擴增后獲得了特異性產(chǎn)物(圖1)。這些條帶介于700~1 000 bp,與預期長度相符。

        圖1 5個葉子花栽培品種DOD基因cDNAPCR擴增產(chǎn)物檢測Fig.1 Detection of DOD cDNA of five Bougainvillea cultivars from PCR amplification

        2.2 DOD基因同源性比較

        應用軟件ClustalX 2.0對5個重瓣葉子花品種的不同顏色苞片的DOD cDNA序列進行比對分析,結(jié)果顯示其序列基本相同,同源性達100%(圖2)。這些親緣關(guān)系密切的栽培品種,雖然其苞片顏色不同,但調(diào)控色素合成的功能基因并沒有差異。因此,重瓣葉子花品種的苞片顏色與DOD基因的表達似乎沒有直接關(guān)聯(lián),而應由其他功能基因調(diào)控。

        2.3 DOD基因相似性分析

        將轉(zhuǎn)錄組測序獲得5個品種的DOD cDNA序列數(shù)據(jù)與NCBI基因庫中近緣種進行Blast相似性檢索,重瓣葉子花品種的DOD cDNA序列與光葉子花的(BgDOD)相似度達99%,與紫茉莉的(MjDOD)達84%,與甜菜(BvDOD)達70%,與大花馬齒莧(PgDOD)達67%?;贒OD基因序列運用Mega5軟件和最大似然法(ML)對葉子花不同重瓣栽培品種及其近緣種進行相似性分析(圖3)。

        圖3 重瓣葉子花栽培品種及其近緣種DOD基因同源性分析Fig.3 Homologous analysis of multi-bracted Bougainvillea cultivars and their close relatives

        3 討論

        葉子花的苞片色彩多樣,但迄今尚未見有真藍色。不同色彩苞片的葉子花品種的色素生物合成調(diào)控基因序列的比對及其與苞片顏色差異表達的規(guī)律分析,對于新花色品種的分子育種具有重要價值。甜菜堿是紫茉莉科、莧科、藜科等大多數(shù)石竹目植物花果等器官顏色的主要色素。甜菜色素在植物不同器官中的含量和分布規(guī)律與顏色的表達密切相關(guān)。DOPA4,5-雙加氧酶(DOD)是甜菜色素生物合成過程中的關(guān)鍵酶,對研究花色表達調(diào)控至關(guān)重要[11]。從花色不同的大花馬齒莧、甜菜、紫茉莉和光葉子花中克隆的DOD基因,其序列均有不同程度的差異。試驗中的5個重瓣葉子花品種具有共同的來源,都是來自巴特葉子花(Bougainvillea×buttiana)的栽培品種。雖然這幾個品種各具有不同顏色的苞片,但調(diào)控其色素合成的DOD基因cDNA序列卻完全相同,表明不同苞片顏色的表達與DOD基因?qū)ι睾铣傻恼{(diào)控可能并非直接相關(guān)。甜菜色素是甜菜醛氨酸與不同氨基酸結(jié)合的衍生物,在植物體中表現(xiàn)為紅色、紫色和黃色等多種顏色,主要包括甜菜紅素和甜菜黃素兩種形式,且可隨pH值變化而轉(zhuǎn)變[12]。因此,形成葉子花品種不同苞片豐富色彩的物質(zhì)基礎(chǔ)及其表達調(diào)控值得進一步深入研究。

        參考文獻:

        [1] 陳濤.葉子花[M].北京:中國農(nóng)業(yè)出版,2008.

        [2] Pancho J V.Notes on two outstanding new cultivars ofBougainvilleain the Philippines[J].Lal Baugh J Mysore Hort Soc,1963,8(3):25-26.

        [3] Pancho J V.Notes on double bracted bougainvillea in the Philippines[J].Lal Baugh J Mysore Hort Soc,1967,12(2):30-32.

        [4] Data S K,Banerji B K.Los Banos Vatriegata'-a new double bracted chlorophyll variegated bougainvillea induced by gamma rays[J].Journal of Nuclear Agriculture and Biology,1990,19(2):134-136.

        [5] Gao Y Y,Liu X.Reseach Progress on Betalain[J].China Food Additives,2005(1):65-70.

        [6] Yoshikazu T,Sasaki N,Ohmiya A.Biosynthesis of plant pigments:anthocyanina,betalains,carotenoids[J].The Plant Journal,2008(54):733-749.

        [7] Christinet L,Burdet F X,Zaikoet M,etal.Characterization and functional identification of a novel plant 4,5-extradiol dioxygenase involved in betalain pigment biosynthesis inPortulacagrandiflora[J].Plant Physol,2004,134:265-274.

        [8] Sasaki N,Abe Y,Godaet Y,etal.Detection of DOPA4.5-Dioxygenase(DOD) Activity Using Recomebinant Protein Prepared from Escherichia coli cells Harboring cDNA Encoding DOD from Mirabilis jalapa[J].Plant Cell Physiol,2009,50(5):1012-1016.

        [9] Larkin M A,Blackshields G,Brown N P,etal.Clustal W and Clustal X version 2.0[J].Bioinformatics,2007,23(21):2947-2948.

        [10] Tamura K,Peterson D,Peterson N,etal.MEGA5:Molecular Evolutionary Genetics Analysis using Maximum Likelihood,Evolutionary Distance,and Maximum Parsimony Methods[J].Molecular Biology and Evolution,2011,28:2731-2739.

        [11] Sasaki N,Wada K,Koda T,etal.Isolation and Characterization of cDNAs Encoding an Enzyme with Glucosyltransferase Activity for cyclo-DOPA from Four O'clocks and Feather Cockscombs[J].Plant Cell Physiol,2005,46(4):666-670.

        [12] Azeredo H M C.Betalains:properties,sources,applications and stabilities a review[J].International Journal of Food Science and Technology,2009,44:2365-2376.

        猜你喜歡
        苞片重瓣甜菜
        山茶花SEPALLATA(SEP)家族基因克隆及表達分析
        西藏苔蘚植物新記錄科
        ——苞片苔科
        4種姜荷花苞片色素成分特征分析
        甜菜應答鹽脅迫的RING型E3連接酶基因的鑒定與分析
        辣椒甜菜,各有所愛
        韓國認定“重瓣金光菊(幼葉與莖)”為新食品原料
        珙桐苞片發(fā)育過程中內(nèi)源激素的變化特征
        單瓣榆葉梅育苗和重瓣榆葉梅嫁接及整形修剪技術(shù)
        新疆產(chǎn)區(qū)有機甜菜栽培技術(shù)探討
        中國糖料(2016年1期)2016-12-01 06:49:04
        荷蘭特矮重瓣大花向日葵
        久久精品亚洲中文无东京热| 人妻体体内射精一区二区| 18成人片黄网站www| 日韩精品国产自在欧美| 亚洲一区二区三区麻豆| 99视频在线精品免费观看6| 中年熟妇的大黑p| 亚洲tv精品一区二区三区| 日本视频一区二区三区三州| 亚洲精品久久久久一区二区| 免费国产裸体美女视频全黄 | 男女上床免费视频网站| 男人和女人做爽爽视频| 蜜臀av一区二区| 国产日产亚洲系列av| 亚洲视频免费在线观看| 国产精品久久久久乳精品爆| 在线观看91精品国产免费免费| 中文字幕av人妻一区二区| 精品亚洲天堂一区二区三区| 熟女精品视频一区二区三区| 亚洲中文字幕在线爆乳| 91人妻一区二区三区蜜臀| 成人国成人国产suv| 国产成人www免费人成看片| 国产精品亚洲综合色区丝瓜| 亚洲乱码中文字幕视频| 国产免费av片无码永久免费| 99久久人妻无码精品系列蜜桃| 99国语激情对白在线观看| 少妇久久久久久被弄高潮| 亚洲色自偷自拍另类小说| 国产av一区二区凹凸精品| 中文字幕隔壁人妻欲求不满 | 成人日韩熟女高清视频一区| 亚洲视频一区| 亚洲国产成人aⅴ毛片大全| 成年人干逼视频水好多| 国产精品免费精品自在线观看| 久久这里都是精品一区| 不卡免费在线亚洲av|