潘永娟, 金曉琴, 劉偉娜, 徐玲玲, 楊 莉
(浙江師范大學(xué) 化學(xué)與生命科學(xué)學(xué)院,浙江 金華 321004)
細(xì)胞凋亡(apoptosis)是在某些因素的誘導(dǎo)下,由細(xì)胞內(nèi)在的有規(guī)律的機(jī)制引起的、主動(dòng)的生理性細(xì)胞自殺[1].程序性細(xì)胞死亡(PCD)是指生物為維持內(nèi)環(huán)境穩(wěn)定,由多基因控制的細(xì)胞自主有序的死亡過(guò)程[2].細(xì)胞凋亡與PCD均涉及“主動(dòng)”的概念,學(xué)者們通常把這2個(gè)名詞等同使用.PCD在多細(xì)胞生物發(fā)育進(jìn)程及響應(yīng)生物或非生物脅迫刺激中均起到十分重要的作用[3].由于與人體健康和一些重大疾病有密切關(guān)系,PCD受到眾多生物學(xué)家的重視,成為20世紀(jì)90年代生命科學(xué)的研究熱點(diǎn)之一.
與細(xì)胞壞死不同,PCD涉及一系列基因的激活、表達(dá)及調(diào)控等,是生物對(duì)抗環(huán)境條件變化或緩和損傷而產(chǎn)生的主動(dòng)死亡過(guò)程[4].射線、溫度、活性氧等物理及化學(xué)因子均可誘導(dǎo)PCD發(fā)生[5].目前已有多篇文章就PCD形態(tài)學(xué)特點(diǎn)、分子機(jī)制、相關(guān)基因或蛋白,以及激發(fā)因子等展開詳細(xì)的綜述[6-10].現(xiàn)已發(fā)現(xiàn)Bcl-2蛋白家族、線粒體外膜VDAC(Voltage-depended anion channel),ANT(adenine nucleotide translocator),P53,Bax及DAD等蛋白均在PCD中起著重要的調(diào)控作用[11-15].眾多研究表明,抗細(xì)胞凋亡蛋白(defender against apoptotic cell death,DAD)與動(dòng)植物的生長(zhǎng)發(fā)育及多種生理與病理過(guò)程密切相關(guān).本文結(jié)合國(guó)內(nèi)外的研究,綜述了動(dòng)物與植物中DAD基因的發(fā)現(xiàn)、表達(dá)特性、蛋白結(jié)構(gòu)及功能等方面的研究進(jìn)展.有關(guān)DAD1在生理及醫(yī)學(xué)方面的研究進(jìn)展參見楊舒雅等[16]的綜述.
DAD基因最初從倉(cāng)鼠細(xì)胞系BHK21的溫度敏感突變系tsBN7中分離得到.在非致死溫度(39.5 ℃)培養(yǎng)條件下,tsBN7細(xì)胞發(fā)生凋亡,呈現(xiàn)染色質(zhì)固縮并沿核膜分布、細(xì)胞質(zhì)皺縮形成空泡、微絨毛消失及DNA片段化等現(xiàn)象.將人DADcDNA導(dǎo)入突變細(xì)胞,細(xì)胞恢復(fù)正常表型.隨后發(fā)現(xiàn)tsBN7細(xì)胞系中DADORF第38位鳥嘌呤(G)突變?yōu)橄汆堰?A),導(dǎo)致甘氨酸(Gly)突變成精氨酸(Arg),在非致死溫度(39 ℃)培養(yǎng)條件下DAD消失,繼而發(fā)生細(xì)胞凋亡.抗細(xì)胞凋亡蛋白(DAD)也因此而得名[17].
分支上的數(shù)值代表自展支持率/%
Nakashima等[17]同時(shí)也分離出倉(cāng)鼠和非洲爪蟾DADcDNA,發(fā)現(xiàn)人DAD氨基酸序列與倉(cāng)鼠的完全相同,與非洲爪蟾DAD相似度為91%.隨后,在秀麗新桿線蟲、大鼠、雞、蜘蛛、蝦、青石斑魚等動(dòng)物,擬南芥、水稻、蘋果、溫州蜜柑、大麥、豌豆、唐昌蒲、鳶尾、康乃馨及雪蓮等植物[18-21],以及衣藻和酵母等中相繼分離得到同源的DAD基因.與哺乳動(dòng)物不同,Southern雜交和基因組數(shù)據(jù)庫(kù)顯示擬南芥可能有2個(gè)以上DAD基因[22],大麥存在2個(gè)DAD基因[23],小麥中也分離出TaDAD2基因[24],推測(cè)植物中可能存在2個(gè)以上DAD基因.因此,把與動(dòng)物相似度較高的DAD基因命名為DAD1,另一個(gè)命名為DAD2.目前研究多集中于DAD1基因的表達(dá)與功能方面.
根據(jù)推導(dǎo)的氨基酸序列,對(duì)美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)信息中心(NCBI)已登錄的DAD1基因進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析,如圖1所示,DAD1基因可聚類為動(dòng)物、植物和酵母3大類:衣藻與其他植物DAD1基因相似度較低;除衣藻外,植物DAD1基因再次聚類為單子葉植物和雙子葉植物兩大亞類;脊椎動(dòng)物DAD1基因聚類為一個(gè)亞類,而無(wú)脊椎動(dòng)物的DAD1基因與脊椎動(dòng)物DAD1基因、植物平行聚類.聚類分析表明DAD1基因無(wú)論是在低等真核生物酵母,還是高等真核生物動(dòng)物中都是高度保守的,但在無(wú)脊椎動(dòng)物中進(jìn)化相對(duì)較快.
對(duì)GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中已有信息的分析表明,除單細(xì)胞生物衣藻DAD1與酵母Ost2p較為特殊,分別編碼108與130個(gè)氨基酸[25-26]外,絕大多數(shù)生物的DAD1蛋白由113~117個(gè)氨基酸組成.其中,動(dòng)物和單子葉植物的DAD1蛋白由113~114個(gè)氨基酸組成,而雙子葉植物的DAD1蛋白氨基酸長(zhǎng)度為116~117.Moharikar等[26]分析發(fā)現(xiàn),人、小鼠、大鼠、豬、牛、非洲爪蟾、蘋果和衣藻DAD1蛋白預(yù)測(cè)的等電點(diǎn)為7.38~7.83,粘液菌、搖蚊、雞、擬南芥、水稻、番茄、矮牽牛、大麥和煙草DAD1蛋白預(yù)測(cè)的等電點(diǎn)為8.81~9.07,而豌豆DAD1蛋白預(yù)測(cè)的等電點(diǎn)為6.32.但是否意味著預(yù)測(cè)的等電點(diǎn)就是DAD蛋白的實(shí)際等電點(diǎn),仍有待試驗(yàn)驗(yàn)證.
Makishima等[27]發(fā)現(xiàn)DAD1是定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜的內(nèi)在蛋白,預(yù)測(cè)其可能有2段跨膜區(qū)域,其N端和C端均朝向胞質(zhì)一側(cè);而Kelleher等[28]發(fā)現(xiàn)DAD1具有3段跨膜區(qū),其N端朝向胞質(zhì)一側(cè),而C端朝向糙面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)(rough endoplasmic reticulumn,RER)腔.應(yīng)用TMHMM Server v.2.0軟件(http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/)對(duì)擬南芥DAD1(GenBank登錄號(hào):Q39080.2)氨基酸序列分析發(fā)現(xiàn),AtDAD1具有3段跨膜區(qū)(見圖2),分別是30~52,59~81,96~115氨基酸區(qū)段,在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上的分布朝向與文獻(xiàn)[28]的研究結(jié)果類似.AtDAD2(GenBank登錄號(hào):NP-565807)序列分析結(jié)果與AtDAD1類似.
圖2 擬南芥DAD1跨膜結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)
人DAD1基因定位于染色體14 q11~q12之間,大鼠DAD1基因定位于14號(hào)染色體[29],而雞T-細(xì)胞中DAD1基因位于受體α鏈恒定基因(T-cell receptor alpha chain constant region,TCRAC)下游6.3 Kb處,包含2個(gè)翻譯的外顯子及1個(gè)不被翻譯的外顯子,其中第2個(gè)內(nèi)含子中包含1段反向的恒定區(qū)(constant region,CR)重復(fù)序列[30].人神經(jīng)細(xì)胞瘤DAD1 mRNA逆轉(zhuǎn)錄后插入基因組的假基因DADR定位于染色體12p11.2~12p12.1之間,該區(qū)域也是多個(gè)可能致癌基因的分布區(qū)域[31].韓永華等[32]檢測(cè)到薏苡DAD1基因定位于第9號(hào)染色體短臂,與著絲粒的百分距離為67.44±1.45.此外,我們根據(jù)擬南芥DAD1基因序列(GenBank登錄號(hào):NC003070)分析,發(fā)現(xiàn)擬南芥DAD1基因中具有4個(gè)外顯子,內(nèi)含子區(qū)域中無(wú)其他基因.
動(dòng)物DAD1幾乎在所有組織中表達(dá),但在不同動(dòng)物、不同組織中表達(dá)強(qiáng)度存在差異,并且DAD1下調(diào)表達(dá)發(fā)生在PCD之前.青石斑魚EaDAD1轉(zhuǎn)錄水平在脾臟和肝臟組織中高于其他組織,而注射了脂多糖的各組織中DAD1表達(dá)水平高于未處理的組織[18].牦牛BgDAD1 mRNA在脾臟、心臟、肝臟和腎臟中均可檢測(cè)到,而在肌肉和乳腺中沒有發(fā)現(xiàn)[33].海灣扇貝大部分組織均表達(dá)DAD1基因,但受傷處表達(dá)水平顯著增高[34].此外,DAD1表達(dá)水平與溫度關(guān)系密切.如在大腹圓蛛不同組織中均可檢測(cè)到DAD1,但其表達(dá)水平受溫度影響,低溫(4 ℃)與高溫(37 ℃)條件下mRNA水平明顯高于25 ℃時(shí)的表達(dá)水平[35].Moharikar等[26]發(fā)現(xiàn)在紫外光照射下衣藻細(xì)胞DAD1基因表達(dá)在PCD啟動(dòng)時(shí)急劇下降.
與動(dòng)物相似,植物中DAD基因時(shí)空表達(dá)范圍十分廣泛,在所有組織及發(fā)育各階段均有表達(dá),但表達(dá)強(qiáng)度存在顯著差異,且大多數(shù)植物DAD1隨著組織的衰老表達(dá)下調(diào).如AtDAD1在擬南芥所有組織中均可檢測(cè)到,但在成熟及角果干化階段轉(zhuǎn)錄水平下降[22].玉米ZmDAD1在衰老組織及新陳代謝活躍的組織中表達(dá)量較高[36].GhDAD1在棉花各組織中均有表達(dá),但在花和種胚等幼嫩組織中表達(dá)水平較高,在纖維等衰老組織中表達(dá)水平較低[37].小麥TaDAD2在所有組織中均表達(dá),在葉中表達(dá)水平最高,花與穗中的表達(dá)水平相對(duì)較低[24].豌豆、鳶尾花和康乃馨衰老花瓣中DAD1基因的表達(dá)也呈下調(diào)模式[38-39].桂花OfDAD1處于鈴梗期表達(dá)量最高,隨著花瓣逐漸開放,DAD1表達(dá)急劇下降,后期雖緩慢回升,但仍維持在較低的水平[40].?dāng)M南芥與柑橘DAD1轉(zhuǎn)錄水平也隨著花和葉片的衰老逐步降低[41].但是,蘋果MpDAD1隨著花和葉片的衰老表達(dá)水平逐步增加[42].從DAD基因的表達(dá)結(jié)果中推測(cè),DAD基因家族不同成員的表達(dá)模式可能不同,其生物學(xué)功能也存在差異.
由此可見,無(wú)論動(dòng)物還是植物中,DAD基因的時(shí)空表達(dá)范圍都較為廣泛,在大部分組織及生長(zhǎng)發(fā)育各階段均有表達(dá),但其表達(dá)強(qiáng)度和模式存在明顯的差異,其表達(dá)也受到激素、溫度等因素的影響,這也間接證明了該基因在生物的生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中具有十分重要的生物學(xué)功能.
倉(cāng)鼠溫度敏感型tsBN7細(xì)胞株中DAD1基因第38位鳥嘌呤G突變?yōu)橄汆堰蔄,導(dǎo)致DAD1蛋白在非致死溫度下消失,引發(fā)tsBN7細(xì)胞凋亡,DAD1也因此被認(rèn)為是細(xì)胞凋亡的負(fù)調(diào)控因子[17].人、擬南芥和水稻DAD1 cDNA能夠阻止tsBN7在非致死溫度下的細(xì)胞凋亡,表明動(dòng)物與植物DAD1具有相似的生物學(xué)功能[17,22].
Nishii等[43]應(yīng)用基因敲除技術(shù)沉默小鼠DAD1基因,發(fā)現(xiàn):DAD1雜合突變小鼠呈現(xiàn)胸腺發(fā)育不完全及足的并趾現(xiàn)象,但仍可繁殖后代;而DAD1純合突變小鼠胚細(xì)胞則表現(xiàn)為嚴(yán)重的發(fā)育障礙或死亡,不能培育成完整個(gè)體.體外胚泡培養(yǎng)中DAD1雜合缺失突變雌性小鼠的細(xì)胞呈現(xiàn)畸形[44].缺失DAD1基因的小鼠晶胚細(xì)胞N-糖基化蛋白質(zhì)表達(dá)異常,胚胎發(fā)育遲緩,中胚層與外胚層凋亡水平增加[45].上述研究結(jié)果表明DAD1具有拮抗PCD的能力.DAD1的轉(zhuǎn)錄水平在T細(xì)胞生成過(guò)程中是變化的,呈先下降后上升的趨勢(shì),并在成熟胸腺細(xì)胞中轉(zhuǎn)錄水平達(dá)到最高,表明DAD1可增強(qiáng)免疫系統(tǒng)T細(xì)胞的增殖,是成熟T細(xì)胞發(fā)揮功能所必需的,但并不能使胸腺T細(xì)胞免于凋亡[46].
Bcl-2能夠阻止細(xì)胞色素c從線粒體釋放到細(xì)胞質(zhì),從而抑制PCD發(fā)生.Bcl-2家族中成員Mcl-1 C端BH2結(jié)構(gòu)域?qū)AD1的活性發(fā)揮是必要的.Mcl-1可抑制DAD1缺失導(dǎo)致的細(xì)胞凋亡,推測(cè)DAD1蛋白作為哺乳動(dòng)物細(xì)胞死亡的抑制因子,可能在Bcl-2蛋白的下游發(fā)揮作用[27].Makishima等[27]以DAD1為誘餌,發(fā)現(xiàn)人B細(xì)胞庫(kù)中Mcl-1可與DAD1發(fā)生蛋白互作,進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn)DAD1蛋白C端59~113氨基酸序列能夠與Mcl-1蛋白BH2結(jié)構(gòu)域互作.
DAD1與酵母Ost2p序列有40%的相似性,而Ost2p是酵母OST復(fù)合物的組成亞基之一,推測(cè)DAD1也可能是OST復(fù)合物的亞基組分[27].OST復(fù)合物的功能是在糙面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔內(nèi)催化高甘露寡聚糖轉(zhuǎn)移到新生多肽的天冬酰胺殘基上,對(duì)新合成蛋白質(zhì)進(jìn)行N-糖基化修飾[47].Kelleher等[28]將DAD1與其他3個(gè)OST組分(核糖體結(jié)合蛋白R(shí)Ⅰ,核糖體結(jié)合蛋白R(shí)Ⅱ及膜蛋白OST48)同時(shí)純化,證實(shí)4組分間能相互交聯(lián),為DAD1是OST復(fù)合物組成亞基提供了生化證據(jù).DAD1蛋白N端前28個(gè)氨基酸能夠與Ost48蛋白C端互作[48].將擬南芥DAD1序列提交至互作蛋白質(zhì)預(yù)測(cè)軟件STRING(http://string.embl.de/)分析,發(fā)現(xiàn)AtDAD1與GCS(Glucosidase 1),AT1G24320,STT3B(Staurosporin and temperature senstive 3-like b)等N-糖基化相關(guān)蛋白可能互作(見圖3),其結(jié)果仍有待于進(jìn)一步驗(yàn)證.
DAD1基因缺失可引起OST48快速降解,在一定程度上導(dǎo)致核糖體蛋白解聚,并伴隨N-糖基化活性喪失.PCD發(fā)生于DAD1蛋白消失24 h后,說(shuō)明DAD1缺失不立即啟動(dòng)PCD,但影響OST48和核糖體蛋白的穩(wěn)定性,造成OST復(fù)合物功能失活[49],推測(cè)其可能的機(jī)制是DAD1蛋白缺失引起OST復(fù)合物快速降解,新生肽不能進(jìn)行糖基化修飾,而未能糖基化或錯(cuò)誤折疊的蛋白在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中積聚,引起內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的應(yīng)力反應(yīng)(stress response),促使PCD相關(guān)基因活化.Roboti等[50]也證實(shí)DAD1能夠調(diào)控OST的穩(wěn)定性,增強(qiáng)蛋白質(zhì)的N-糖基化.
DGL1,STT3A,STT3B:OST復(fù)合物亞基;GCS1:葡萄糖苷酶AT1G24320:α-葡萄糖苷酶;AT1G52600:信號(hào)肽ATG1:擬南芥跨膜蛋白;AT1G77350與AT4G29735:未知蛋白
在植物中,AtDAD1基因具有一定的抵御細(xì)胞凋亡的能力[51].超表達(dá)AtDAD1基因擬南芥植株較野生型更為強(qiáng)壯,可耐受高濃度H2O2處理,葉片糖含量顯著提高,推測(cè)AtDAD基因可能參與植物的生長(zhǎng)發(fā)育,并在抵御PCD過(guò)程中發(fā)揮作用[52].?dāng)M南芥突變體npr1-3與npr1-3過(guò)量表達(dá)病程相關(guān)基因非表達(dá)子(nonexpresser of pathogenesis related gene,NPR1)轉(zhuǎn)基因株系基因差異表達(dá)譜分析發(fā)現(xiàn),AtDAD1基因表達(dá)差異顯著,表明DAD1是植物系統(tǒng)獲得性抗性所必需的[53].孫建富等[21]從雪蓮cDNA文庫(kù)中分離SiDAD1基因,獲得的轉(zhuǎn)基因煙草提高了對(duì)干旱、高鹽的耐受性,減緩了其在逆境條件下的衰老.在本氏煙葉片中過(guò)量表達(dá)小麥TaDAD2基因可抑制細(xì)胞凋亡,沉默TaDAD2基因能促進(jìn)小麥拮抗小麥條銹菌(Pucciniastriiformisf. sp.tritici)浸染,并且發(fā)現(xiàn)TaDAD2在小麥條銹病侵染初期抑制PCD,但在侵染后期階段不起作用或促進(jìn)PCD的發(fā)生[24].平邑甜茶中的MhDAD基因表達(dá)水平隨著逆境脅迫程度的加劇而不斷下降,植物抵御脅迫能力下降[54]. 徐玲玲等[55]分離了本氏煙(Nicotianabenthamiana)NbDAD1基因,發(fā)現(xiàn)NbDAD1超表達(dá)抗性植株在長(zhǎng)勢(shì)、形態(tài)等方面與對(duì)照無(wú)明顯差異,而攜帶HAtag標(biāo)簽NbDAD1基因超表達(dá)株表現(xiàn)出腋芽分蘗數(shù)減少,推測(cè)DAD1在植物生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中也起到十分重要的作用.
如上所述,DAD基因是高度保守的內(nèi)源性抑制細(xì)胞凋亡基因,定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜,是OST復(fù)合物的亞基組分之一,幾乎在各種組織和各個(gè)發(fā)育階段都會(huì)被檢測(cè)到.在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中,DAD蛋白對(duì)新合成的蛋白質(zhì)進(jìn)行糖基化修飾;DAD缺失或突變后,導(dǎo)致OST復(fù)合物功能失活,大量非正常蛋白積累于內(nèi)質(zhì)網(wǎng),誘發(fā)PCD;超表達(dá)DAD基因能夠抑制與延緩植物PCD,促進(jìn)拮抗生物或非生物脅迫.
現(xiàn)有研究結(jié)果使人們對(duì)DAD蛋白的生物學(xué)功能有了一定的了解,但仍有許多疑問(wèn)懸而未決.例如:在擬南芥、大麥與小麥中推測(cè)可能或發(fā)現(xiàn)有2個(gè)DAD基因,在其他植物中是否也有多個(gè)DAD基因?這些基因間屬于功能互補(bǔ)還是同時(shí)發(fā)揮作用?DAD等OST復(fù)合物到底對(duì)哪些特定蛋白質(zhì)進(jìn)行糖基化修飾,這些蛋白質(zhì)在生物發(fā)育進(jìn)程中起何作用?DAD蛋白除了參與糖基化修飾、延緩PCD發(fā)生外,是否還具有其他重要的生物學(xué)功能?上述問(wèn)題的解決,將對(duì)DAD基因應(yīng)用于腫瘤發(fā)病機(jī)制研究、新藥開發(fā)、農(nóng)作物抗逆性狀的遺傳改良、優(yōu)良種質(zhì)資源的開發(fā)與利用提供理論基礎(chǔ).
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