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        生姜根際姜瘟病拮抗菌的篩選及鑒定

        2012-04-29 03:53:56徐瑩瑩杜秉海丁延芹王翠翠王璇姚良同
        山東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2012年1期
        關(guān)鍵詞:篩選鑒定

        徐瑩瑩 杜秉海 丁延芹 王翠翠 王璇 姚良同

        摘要:從生姜根際土樣分離獲得了65個(gè)細(xì)菌分離物和42個(gè)放線(xiàn)菌分離物,通過(guò)離體拮抗試驗(yàn),篩選出對(duì)姜瘟病有良好拮抗效果的細(xì)菌一株,放線(xiàn)菌兩株,編號(hào)分別為H16-8、WFl和JW02-6。通過(guò)形態(tài)學(xué)觀察、生理生化測(cè)定以及16S rDNA序列分析,初步確定:H16-8為短短芽孢桿菌(Brevibacillus brevis),WF1為弗雷德氏鏈霉菌(Streptomyces fradiae),JW02-6為勞倫鏈霉菌(Streptomyces laurentii)。H16-8、WFl和JW02-6的16SrDNA序列的GenBank登錄號(hào)分別為:EU812754,F(xiàn)J972686和FJ972687。

        關(guān)鍵詞:生姜根際;姜瘟??;拮抗菌;篩選;鑒定

        中圖分類(lèi)號(hào):S476+.1文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)號(hào):A文章編號(hào):1001-4942(2012)01-0079-05

        姜瘟病主要是由青枯假單胞菌(Pseudomonassolanacearum)引起的。每年6~8月是該病發(fā)生和流行的高峰時(shí)期,此時(shí)北方正值高溫高濕天氣,是姜塊形成膨大旺盛期,病菌易侵入,侵染速度快,嚴(yán)重的可在半月左右造成全田無(wú)收,成為制約生姜優(yōu)質(zhì)高產(chǎn)的毀滅性病害之一。篩選抗病品種、施用化學(xué)農(nóng)藥等措施可防治姜瘟病的發(fā)生,但是輪作和篩選抗病品種周期長(zhǎng),使用化學(xué)農(nóng)藥不僅不能從根本上防治病原菌,又帶來(lái)了環(huán)境污染。而生物防治既可限制病原菌青枯假單胞菌的生長(zhǎng),又增加了根際有益微生物的數(shù)量和抑菌物質(zhì)的含量,是一種行之有效的方法。目前,雖然已有一些可防治姜瘟病的菌種被發(fā)現(xiàn),但是大多存在著難以在生姜根際長(zhǎng)期定殖的問(wèn)題。

        本研究討論的拮抗菌分離自生姜根際土壤,有利于其在根際的定殖,此外,拮抗菌的應(yīng)用還可以有效地促進(jìn)植株的生長(zhǎng)。從山東萊蕪采集發(fā)病區(qū)生姜根際土壤樣品,篩選到對(duì)姜瘟病具有很好生防應(yīng)用潛力的細(xì)菌1株,放線(xiàn)菌2株,其中H16-8被鑒定為短短芽孢桿菌(Brevibacillus brevis),WF1被鑒定為弗雷德氏鏈霉菌(Streptomyces fra-diae),JW02-6被鑒定為勞倫鏈霉菌(Streptomy-ces laurentii)。

        1.材料與方法

        1.1材料

        生姜根際土壤樣品:采集自山東省萊蕪市。

        供試病原菌:姜瘟病病原菌——青枯假單胞菌(Pseudomonas solanacearum),由山東省萊蕪市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院提供。

        培養(yǎng)基:牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基,高氏一號(hào)培養(yǎng)基,馬鈴薯蔗糖培養(yǎng)基,細(xì)菌及放線(xiàn)菌菌種鑒定培養(yǎng)基參見(jiàn)文獻(xiàn)[12,13]。

        試劑:分子生物學(xué)試劑購(gòu)于寶生物工程(大連)有限公司,DNA小量快速純化試劑盒(3S SpinAgarose Gel DNA purification Kit)購(gòu)于上海申能博彩生物科技有限公司。

        1.2拮抗菌的篩選

        分別采用細(xì)菌和放線(xiàn)菌培養(yǎng)所需的不同培養(yǎng)基,通過(guò)梯度稀釋法,從生姜根際土樣中分別獲得細(xì)菌和放線(xiàn)菌分離物。采用稀釋涂布平板法,即取100μl經(jīng)12h培養(yǎng)的病原菌菌液涂布于拮抗篩選培養(yǎng)基平板上,再將待試菌接種于培養(yǎng)基上,37℃培養(yǎng)24-48h,通過(guò)觀察抑菌圈的有無(wú)及大小進(jìn)行拮抗活性檢測(cè),篩選出對(duì)姜瘟病病原菌具拮抗活性的細(xì)菌和放線(xiàn)菌,分別記錄其編號(hào),并轉(zhuǎn)接到相應(yīng)分離培養(yǎng)基斜面上保存。

        1.3菌種鑒定

        形態(tài)學(xué)特征、生理生化特性檢測(cè)及16SrDNA序列的擴(kuò)增方法見(jiàn)參考文獻(xiàn)[13,14]。

        1.4DNA提取和PCR反應(yīng)

        具體方法參閱文獻(xiàn)[15,16],用相應(yīng)的液體培養(yǎng)基接種拮抗菌,培養(yǎng)24h,收集菌液提取總DNA。

        PCR反應(yīng)體系為:Taq DNA聚合酶0.5μl,10×Buffer(Mg2+)2.5μl,dNTP(10mmol/L)0.5μl,引物1μl,模板1μl,ddH2O補(bǔ)足至25μl。

        反應(yīng)條件:95℃5min;94℃1min;56℃1min,72℃1.5min,30個(gè)循環(huán);72℃延伸10min。

        用3S柱離心式瓊脂糖DNA小量,陜速純化試劑盒(3S spin Agarose Gel DNA purification kit)純化PCR產(chǎn)物。

        1.5 16S rDNA序列測(cè)定及分析

        16S rDNA的測(cè)序工作由南京金斯瑞生物科技有限公司完成,序列相似性分析通過(guò)NCBI的BLAST程序比對(duì)(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/),利用MEGA4.0軟件進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析,采用Neighbor-Joining算法和Jukes-Cantor模型構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。自展次數(shù)設(shè)定為1000,自展檢驗(yàn)結(jié)果低于50的數(shù)值不顯示在圖上。

        2.結(jié)果與分析

        2.1拮抗菌的篩選

        通過(guò)梯度稀釋法從生姜根際土壤樣品中篩選出65個(gè)細(xì)菌分離物和42個(gè)放線(xiàn)茵分離物。經(jīng)過(guò)初篩及復(fù)篩,獲得拮抗效果良好且穩(wěn)定的細(xì)菌1株,編號(hào)為H16-8;放線(xiàn)菌2株,編號(hào)為WF1和JW02-6。

        從圖1中可以看出,H16-8、WF1和JW02-6都對(duì)Pseudomonas solanacearum具有較好的拮抗效果。

        2.2形態(tài)學(xué)特征

        H16-8的菌體大小為(0.50~0.55)μm×(1.10~1.20)μm,G+,短桿狀,產(chǎn)芽孢且孢囊膨大,在LB平板上培養(yǎng)24h后,菌落為微黃色,粘稠厚重,不透明,表面濕潤(rùn)光滑,邊緣較規(guī)則。WF1孢子絲直或柔曲,孢子卵圓形或不規(guī)則圓形,表面光滑;JW02-6孢子絲直、彎曲,孢子卵圓形,表面光滑(圖2)。

        2.3生理生化特性

        菌株H16-8在牛肉膏蛋白胨和LB培養(yǎng)基上生長(zhǎng)均形成微黃色不透明菌落,而在馬鈴薯蔗糖培養(yǎng)基上生長(zhǎng)則形成乳白色粘稠不透明菌落;WF1和JW02-6的培養(yǎng)特性見(jiàn)表1。

        H16-8、WF1和JW02-6的主要生理生化特性見(jiàn)表2和表3。其中,細(xì)菌菌株H16-8與其模式種在大多數(shù)生理生化指標(biāo)上具有相同的特征,但在pH5.5及50℃條件下的生長(zhǎng)情況與模式菌株性狀不符,說(shuō)明H16-8更耐酸、耐熱。根據(jù)放線(xiàn)菌的分類(lèi)和鑒定,WF1和JW02-6具有典型的鏈霉菌屬特征。其中,WF1與鏈霉菌屬弗雷德氏鏈霉菌的生物學(xué)特性相似,如弗雷德氏鏈霉菌可水解淀粉,使明膠液化和牛奶胨化,分解纖維素,硝酸鹽還原力強(qiáng),不產(chǎn)生H2S,但WF1不能分解纖維素,且兩者的碳源代謝不完全一致,弗雷德氏鏈霉菌可利用葡萄糖、果糖和蔗糖,而WF1僅能利用果糖。鏈霉菌屬勞倫鏈霉菌可水解淀粉,使明膠液化,可利用阿拉伯糖、果糖和甘露醇,而JW02-6能利用葡萄糖和木糖,不能利用甘露醇。篩選菌株與模式菌株之間的這些不同性狀,可能是菌株間確實(shí)存在差異,也可能是由菌株不

        同生長(zhǎng)環(huán)境造成的。

        2.4 16S rDNA序列分析

        PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳,凝膠成像,如圖3所示。

        經(jīng)測(cè)序分析,由菌株H16-8、WF1和JW02-6總DNA擴(kuò)增的16S rDNA序列長(zhǎng)分別為:1413bp,1406bp和1400bp,將得到的序列提交GenBank獲得注冊(cè)號(hào):EU812754、FJ972686和FJ972687。

        如圖4所示,H16-8位于系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)中短芽孢桿菌屬(Brevibacillus)分支中,與Brevibacillusbrevis(AY887081)有較近的親緣關(guān)系。圖5則顯示菌株WF1和JW02-6都位于鏈霉菌屬(Strep-tomyces)分支中,分別與Streptomyces fradiae(AB184068)和Streptomyces laurentii(AB184669)有較近的親緣關(guān)系。

        通過(guò)對(duì)其形態(tài)學(xué)、培養(yǎng)性狀及生理生化反應(yīng)結(jié)果進(jìn)行分析,可以初步判定拮抗細(xì)菌H16-8為短短芽孢桿菌(Brevibacillus brevis),拮抗放線(xiàn)菌WF1為弗雷德氏鏈霉菌(Streptomyces fradiae),JW02-6為勞倫鏈霉菌(Streptomyces laurentii)。

        3.討論與結(jié)論

        生物防治可作為解決土傳病害的一條有希望的途徑。利用拮抗菌防治植物病害已被認(rèn)識(shí)和廣泛應(yīng)用,從自然界尋找和篩選新的生防菌對(duì)生物防治具有重大意義。因此,利用拮抗菌防治姜瘟病具有廣闊的應(yīng)用前景。

        但一些實(shí)驗(yàn)室表現(xiàn)良好的生防菌株在進(jìn)行田間試驗(yàn)時(shí),出現(xiàn)拮抗效果不穩(wěn)定的現(xiàn)象,這主要與生防菌在作物根際的定殖能力、競(jìng)爭(zhēng)作用及外界環(huán)境影響等因素有關(guān)。生防細(xì)菌防病效果取決于它在適當(dāng)?shù)臅r(shí)間定殖于適當(dāng)?shù)奈恢?,并產(chǎn)生適量的抗菌物質(zhì),不同環(huán)境條件下生防細(xì)菌產(chǎn)生的抗菌物質(zhì)的量不同。本試驗(yàn)從微生物生態(tài)學(xué)角度出發(fā),從生姜根際篩選得到了具有較好應(yīng)用潛力的3個(gè)拮抗菌菌種資源短短芽孢桿菌H16-8,弗雷德氏鏈霉菌WF1和勞倫鏈霉菌JW02-6。目前關(guān)于植物細(xì)菌性青枯病的生物防治,國(guó)內(nèi)外研究工作很多,但針對(duì)姜瘟病的研究則較少。同時(shí),鏈霉菌可產(chǎn)生眾多次生代謝產(chǎn)物,已經(jīng)成為重要的生防菌種而被廣泛研究。而本實(shí)驗(yàn)也證明了兩株分別屬于弗雷德氏鏈霉菌和勞倫鏈霉菌的放線(xiàn)菌菌株對(duì)部分致病菌具有拮抗能力。

        利用這些具有生防能力的菌株產(chǎn)生的次生代謝產(chǎn)物制備生物農(nóng)藥,具有無(wú)污染、不易使有害生物產(chǎn)生抗藥性等特點(diǎn)。因此,本實(shí)驗(yàn)所獲得拮抗菌可作為進(jìn)一步研究姜瘟病拮抗菌拮抗機(jī)制的實(shí)驗(yàn)材料,深入探討其生防機(jī)制及應(yīng)用前景,促進(jìn)高效低毒農(nóng)藥的開(kāi)發(fā)利用。

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