開放科學(xué)(資源服務(wù))標(biāo)識(shí)碼(OSID):
AnalysisofGeneticDiversityinKeyTraitsofFoxtailMilletGermplasmResources
YANZhi-ming(CenterforAgriculturaleneticResourcesResearch,Shanxi AgriculturalUniversity,Taiuan,ShanxiO31)
AbstractObetie]IdrtundestadthgeneticdvesityoflocalfoxtaililtvarietisiSniandimproethutilati cyofgermplassous.etdxailidxpealatelsteaosdg neticdiversityiicsoftirinagooicdqalittraits,ogiprcipalmpontaalsisdsteraalyis.Rsule sults showed that among agronomic traits,grain weight per plant exhibited the largest coeficient of variation ( 22.07% ),while thousand-grain weightdemostratedtegestgeeticdiversityidex(.56)Forualittraitsudefatdisplaedelgestcofcitofan ( 18.82% ),andcrudeproteinshowedtheighestgeneticdiversityindex(1.41)indicatingrelativelyichgeneticdiversityamongthsted materials.Uoostigelatatrifaitstasovdateioftigete cantpostiveelaisndpmosielttioipalmpontalisaldt first five principal components accounted for a cumulative contribution rate of 83. 240% . Cluster analysis using Ward’s method classified the 30 foxtail varieties into five groups. Among these,Group II could serve as breeding materials for quality improvement,while Group IV could be utlizedasigieldmatealsfredingse.Cocusultslidafoudatiofopringthlatiofo tail millet germplasm resources.
Key WordsFoxtail millet;Germplasm resources;Agronomic traits;Quality traits;Genetic diversit
谷子是起源于我國(guó)的古老糧食作物之一,種植歷史悠久,具有抗旱、耐瘠、適應(yīng)性強(qiáng)等特點(diǎn)[1-3],在我國(guó)北方旱作農(nóng)業(yè)和食品消費(fèi)多元化需求方面占有重要地位。歷經(jīng)漫長(zhǎng)歲月的精心培育,依托復(fù)雜多元的種植環(huán)境,在自然法則的優(yōu)勝劣汰與人類智慧的定向篩選共同作用下,孕育出了琳瑯滿目、各具特色的地方谷子品種。隨著農(nóng)業(yè)生產(chǎn)力提高和生產(chǎn)條件改善,育成品種因生產(chǎn)力優(yōu)勢(shì)明顯,正逐漸取代大多數(shù)地方品種,但是現(xiàn)代育種逐漸陷入遺傳基礎(chǔ)狹窄[4-6],骨干親本少,進(jìn)而成為限制育種工作的主要瓶頸。地方品種不僅具有豐富的遺傳多樣性[],在應(yīng)對(duì)NaCl脅迫時(shí)還表現(xiàn)出廣泛的遺傳變異類型[8-9],充分利用地方品種來拓展我國(guó)谷子育種遺傳基礎(chǔ)是一個(gè)很好的途徑。作為我國(guó)粟類作物起源中心與主產(chǎn)區(qū),山西及其毗鄰生態(tài)區(qū)在長(zhǎng)達(dá)數(shù)千年的種質(zhì)資源系統(tǒng)演化過程中,不僅保存著豐富的傳統(tǒng)農(nóng)家種質(zhì)資源庫(kù),同時(shí)通過現(xiàn)代育種技術(shù)成功創(chuàng)制出系列高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)栽培品種。該研究以山西30份地方谷子品種為研究材料,分析其在農(nóng)藝特性與品質(zhì)特征方面的遺傳變異規(guī)律,以期為后續(xù)作物遺傳改良中的親本選配和優(yōu)異基因資源挖掘提供科學(xué)依據(jù)。
1材料與方法
1.1試驗(yàn)材料30份谷子材料均來自山西地方品種,詳見表1。
表1谷子試驗(yàn)材料
Table1 Experimental foxtail millet varieties
1.2試驗(yàn)地點(diǎn)試驗(yàn)在山西農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)業(yè)基因資源研究中心東陽(yáng)試驗(yàn)示范基地進(jìn)行。海拔 799.4~804.6m ,全年平均
氣溫達(dá) 9.7°C ,年降水量 440.7mm ,年日照時(shí)數(shù)約 2500h 。
試驗(yàn)田前季種植作物為玉米。
1.3試驗(yàn)方法該研究采用完全隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì),設(shè)置3個(gè)重復(fù)組,每重復(fù)包含2行小區(qū),行長(zhǎng)設(shè)定為 2.5m ,行間距為0.4m 。每個(gè)小區(qū)隨機(jī)選取10株,按照《谷子種質(zhì)資源描述規(guī)范和數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)》[\"]記錄全生育期(GP)、出苗至抽穗天數(shù)(SED)、千粒重(TGW)、單株穗重(PWP)單株粒重(GWP)、主穗長(zhǎng)度(MPL)、主莖直徑(MSD)、主莖節(jié)數(shù)(MSNN)、主莖長(zhǎng)度(MSL)粗脂肪含量(CFC)、粗蛋白含量(CPC),然后取平均值。
1.4數(shù)據(jù)分析該研究運(yùn)用Excel2010軟件對(duì)試驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,針對(duì)各性狀參數(shù)分別測(cè)算其極值范圍(最大值、最小值)集中趨勢(shì)(平均值)和離散程度(標(biāo)準(zhǔn)差、變異系數(shù))。在計(jì)算多樣性指數(shù)時(shí)采用以下方法劃分級(jí)別:計(jì)算參試材料最大值、最小值( min. )、最大值與最小值的差值 (d) 并劃分為6級(jí),分別為1級(jí)( Xi?min )、2級(jí)( mini?min+ 0.25d) ?3 級(jí) (min+0.25di?min+0.5d 、4級(jí)( Xi?min+0.75d )、5級(jí) (min+0.75dii?
),采用ShannonWeiner's多樣性指數(shù) (H′) 進(jìn)行遺傳多樣性評(píng)價(jià)[1],數(shù)學(xué)表達(dá)式為
,其中, n 表征特定性狀表型級(jí)別的總數(shù)目, Pi 代表該性狀第 i 個(gè)表型級(jí)別內(nèi)品種數(shù)量占群體總數(shù)的占比。
該研究采用SAS9.4統(tǒng)計(jì)分析軟件進(jìn)行相關(guān)性分析、主成分分析、聚類分析,其中聚類分析基于Ward最小方差法構(gòu)建品種分類體系。
2 結(jié)果與分析
2.1谷子品種性狀的遺傳多樣性分析
2.1.1農(nóng)藝性狀的遺傳多樣性分析。從30份參試谷子品種9個(gè)農(nóng)藝性狀的遺傳多樣性分析結(jié)果(表2)可以看出,單株粒重變幅為 9.00~26.80g ,變異系數(shù)最高,達(dá) 22.07% ;單株穗重次之,變異系數(shù)為 19.10% ,取值為 14.50~34.30g ;全生育期變幅為 110.00~130.00d ,離散程度最低,變異系數(shù)僅為 4.45% 。各性狀變異程度由強(qiáng)到弱依次為單株粒重、單株穗重、主莖直徑、主穗長(zhǎng)度、主莖長(zhǎng)度、千粒重、出苗至抽穗天數(shù)、主莖節(jié)數(shù)、全生育期。遺傳多樣性評(píng)估結(jié)果顯示,在參試性狀中,千粒重的遺傳多樣性指數(shù)最高,達(dá)到1.56;單株穗重的遺傳多樣性指數(shù)最低,為1.30。各性狀遺傳多樣性程度由高到低依次為千粒重 gt; 全生育期 gt; 出苗至抽穗天數(shù) gt; 主莖直徑 gt; 主莖長(zhǎng)度 gt; 主穗長(zhǎng)度 Σ=Σ 主莖節(jié)數(shù) gt; 單株粒重 gt; 單株穗重。2.1.2品質(zhì)性狀的遺傳多樣性分析。對(duì)30份參試谷子品種的2個(gè)主要品質(zhì)性狀(粗脂肪含量、粗蛋白含量)進(jìn)行遺傳多樣性分析,具體結(jié)果詳見表2。數(shù)據(jù)分析表明,在離散程度方面,粗脂肪含量的變異系數(shù)達(dá)到 18.82% ,明顯高于粗蛋白含量的變異系數(shù)( 15.26% ),顯示出前者在群體中具有更廣泛的表型分布范圍。在遺傳多樣性指數(shù)方面,粗蛋白含量的遺傳多樣性指數(shù)(1.41)大于粗脂肪含量的遺傳多樣性指數(shù)(1.30)。
表2參試谷子品種11個(gè)性狀的遺傳多樣性分析
Table2Genetic diversity analysis of 11 traits across tested varieties of foxtail millet
2.2相關(guān)性分析對(duì)30份谷子種質(zhì)資源的11個(gè)性狀進(jìn)行相關(guān)性分析,結(jié)果如表3所示,全生育期與出苗至抽穗天數(shù)呈極顯著正相關(guān) Πr=0.515,Plt;0.01) ,表明兩者存在緊密的時(shí)間依賴性。出苗至抽穗天數(shù)與主穗長(zhǎng)度 0.05)和主莖節(jié)數(shù) (r=-0.121,Plt;0.05) 呈顯著負(fù)相關(guān),與粗蛋白含量呈極顯著負(fù)相關(guān) (r=-0.557,Plt;0.01) ,表明早熟材料可能具有較高的蛋白質(zhì)含量。單株穗重與單株粒重( r= 0.894,Plt;0.01 )、主穗長(zhǎng)度
、主莖直徑L (r=0.728,Plt;0.01 )、主莖長(zhǎng)度( $\stackrel { \prime } { r } = 0 . 4 7 5 , P { lt; } 0 . 0 1 \$ 呈極顯著正相關(guān),這5個(gè)性狀在產(chǎn)量形成中具有協(xié)同作用。主穗長(zhǎng)度與主莖直徑( ζr=0.500,Plt;0.01; 、主莖長(zhǎng)度( r=0.611,Plt; 0.01)粗蛋白含量 (r=0.504,Plt;0.01) 呈極顯著正相關(guān),表明植株高大類型可能兼具較長(zhǎng)主穗和較好營(yíng)養(yǎng)品質(zhì)。主莖直徑與主莖長(zhǎng)度 $\stackrel { \prime } { r } = 0 . 4 6 2 , P { lt; } 0 . 0 5 \$ 粗蛋白含量( r=0.399 Plt;0.05 )呈顯著正相關(guān),反映莖稈結(jié)構(gòu)與營(yíng)養(yǎng)轉(zhuǎn)運(yùn)的關(guān)系。該研究發(fā)現(xiàn)多個(gè)性狀間存在顯著的遺傳相關(guān)性,為谷子育種中的性狀協(xié)同改良提供了理論依據(jù)。
2.3主成分分析對(duì)30份谷子種質(zhì)資源的11個(gè)性狀進(jìn)行主成分分析,結(jié)果如表4所示,以累計(jì)貢獻(xiàn)率大于 80% 為標(biāo)準(zhǔn)提取主成分,在11個(gè)主成分中,前5個(gè)主成分累計(jì)貢獻(xiàn)率達(dá) 83.240% 。第1主成分的特征值為4.180,貢獻(xiàn)率為38.000% ,主要作用性狀為單株穗重、單株粒重、主穗長(zhǎng)度、主莖直徑和主莖長(zhǎng)度;第2主成分的特征值為1.815,貢獻(xiàn)率為16.500% ,主要作用性狀為千粒重;第3主成分的特征值為1.322,貢獻(xiàn)率為 12.020% ,主要由全生育期和出苗至抽穗天數(shù)這2個(gè)發(fā)育期性狀決定;第4主成分的特征值為1.085,貢獻(xiàn)率為 9.870% ,關(guān)鍵性狀為粗脂肪含量;第5主成分的特征值為0.754,貢獻(xiàn)率為 6.850% ,主要作用性狀為主莖節(jié)數(shù)和粗脂肪含量,體現(xiàn)了莖稈形態(tài)與籽粒品質(zhì)的復(fù)合影響。
表311個(gè)性狀的相關(guān)性系數(shù)
注:*表示在0.05水平顯著相關(guān), ** 表示在0.01水平極顯著相關(guān)。 Note: indicated significant correlation( Plt;0.05) : ** indicated extremely significant correlation( Plt;0.01)
表4參試谷子品種11個(gè)性狀的主成分分析
Table 4Principal component analysis of 11 traits in tested foxtail millet varieties
2.4聚類分析采用Ward法對(duì)30份參試谷子品種的11個(gè)性狀進(jìn)行聚類分析,并構(gòu)建樹狀圖(圖1)和聚類數(shù)準(zhǔn)則圖(圖2)。依據(jù)立方聚類準(zhǔn)則和偽T方,在相關(guān)系數(shù) (R2) 為0.0306時(shí)將30份材料聚為5個(gè)類群,各類群性狀平均值如表5所示。第I類群包括12個(gè)品種,該群體的主要特點(diǎn)是農(nóng)藝性狀全生育期和出苗至抽穗天數(shù)均大于其他4個(gè)類群,主莖直徑、主穗長(zhǎng)度、單株粒重和單株穗重均大于第V類群且低于其他3個(gè)群體,品質(zhì)性狀粗脂肪含量大于第V類群且低于其他3個(gè)群體。第Ⅱ類群包括7個(gè)品種,農(nóng)藝性狀中出苗至抽穗天數(shù)和千粒重均低于其他4個(gè)類群。第Ⅱ類群包含5個(gè)品種,產(chǎn)量相關(guān)性狀(主莖長(zhǎng)度、主莖直徑、千粒重、主穗長(zhǎng)度)和品質(zhì)性狀(粗蛋白含量、粗脂肪含量)的均值均顯著高于其他4個(gè)類群。第V類群包含2個(gè)品種,該群體的特征為單株穗重和單株粒重明顯高于其他4個(gè)類群,而主莖節(jié)數(shù)和全生育期則明顯較短,品質(zhì)性狀方面粗蛋白含量明顯低于其他類群。第V類群包括4個(gè)品種,該類群的主莖直徑、主穗長(zhǎng)度、主莖長(zhǎng)度、單株粒重和單株穗重均低于其他4個(gè)類群;品質(zhì)性狀粗脂肪含量均低于其他4個(gè)類群,品質(zhì)性狀一般。
圖1基于11個(gè)性狀的30份谷子品種的聚類分析 Fig.1Clustering of 30 foxtail millet accessions using 11 agronomictraits
圖2參試谷子材料聚類數(shù)準(zhǔn)則
Fig.2Clusternumbervalidationfortested foxtailmilletaccessions
表55個(gè)類群11個(gè)性狀的平均值
Table5 Mean values of11 traits across5 clusters
3討論與結(jié)論
豐富的遺傳多樣性是品種選育的物質(zhì)基礎(chǔ)[12-17]。該研究對(duì)試驗(yàn)材料的11個(gè)性狀開展了遺傳多樣性分析,在農(nóng)藝性狀方面,單株粒重表現(xiàn)出最大的表型變異( CV=22.07% ,而全生育期表型最為穩(wěn)定( CV=4.45% )。遺傳多樣性指數(shù)分析顯示,千粒重具有最高的遺傳多樣性( H′=1.56 ,單株穗重的遺傳多樣性則相對(duì)較低( H′=1.30? 。在品質(zhì)性狀方面,粗脂肪含量的表型變異( CV=18.82% )高于粗蛋白含量( CV=15.26% ),但遺傳多樣性指數(shù)呈現(xiàn)相反趨勢(shì),粗蛋白含量的遺傳多樣性( H′=1.41 略高于粗脂肪含量( H′=1.30? 。整體而言,11個(gè)性狀的平均變異系數(shù)為 13.30% ,平均遺傳多樣性指數(shù)為1.43,表明地方品種群體蘊(yùn)藏著較為豐富的遺傳變異。值得注意的是,變異系數(shù)與遺傳多樣性指數(shù)之間不存在必然關(guān)聯(lián),表型變異大的性狀未必具有更高的遺傳多樣性,這為性狀選擇提供了重要理論依據(jù)。
相關(guān)性分析結(jié)果表明,11個(gè)性狀的關(guān)聯(lián)矩陣中10對(duì)性狀(全生育期與出苗至抽穗天數(shù),單株穗重與單株粒重、主穗長(zhǎng)度、主莖直徑、主莖長(zhǎng)度,單株粒重與主莖直徑,主穗長(zhǎng)度與主莖直徑、主莖長(zhǎng)度、粗蛋白含量,主莖節(jié)數(shù)與主莖長(zhǎng)度)存在極顯著正相關(guān),1對(duì)性狀(出苗至抽穗天數(shù)與粗蛋白含量)存在極顯著負(fù)相關(guān),其中,單株穗重與單株粒重的相關(guān)系數(shù)最大,為0.894,可以為谷子高產(chǎn)育種提供了關(guān)鍵表型選擇依據(jù)。此外,單株穗重、單株粒重、粗蛋白含量均與主穗長(zhǎng)度、主莖直徑、主莖長(zhǎng)度呈顯著正相關(guān)且相關(guān)系數(shù)在 0.399~0.728 ,可優(yōu)先篩選主穗長(zhǎng)度、主莖直徑和主莖長(zhǎng)度作為間接選擇指標(biāo),簡(jiǎn)化高產(chǎn)、高品質(zhì)種質(zhì)篩選流程,加速育種進(jìn)程。主穗長(zhǎng)度、主莖直徑和主莖長(zhǎng)度相互之間的相關(guān)系數(shù)為 0.462~0.611 ,相互之間均呈顯著正相關(guān),說明具有一定的遺傳連鎖關(guān)系。單株穗重和單株粒重與粗蛋白含量均呈不顯著相關(guān),說明這些性狀之間既存在緊密的關(guān)聯(lián)性又存在遺傳的復(fù)雜性。
該研究對(duì)參試品種11個(gè)性狀進(jìn)行了主成分分析,結(jié)果表明,前5個(gè)主成分累計(jì)解釋了 83.240% 的性狀變異,有效保留了原始數(shù)據(jù)的主要遺傳信息。具體而言:第1主成分綜合了單株穗重、單株粒重、主穗長(zhǎng)度、主莖直徑和主莖長(zhǎng)度5個(gè)關(guān)鍵農(nóng)藝性狀,貢獻(xiàn)了 38.000% 的變異信息;第2主成分以千粒重為核心因子,貢獻(xiàn)率為 16.500% ;第3主成分由全生育期和出苗至抽穗天數(shù)2個(gè)發(fā)育期性狀主導(dǎo),貢獻(xiàn)率為12.020% ;第4主成分主要反映粗脂肪含量的遺傳變異,貢獻(xiàn)率為 9.870% ;第5主成分則整合了主莖節(jié)數(shù)與粗脂肪含量的信息,貢獻(xiàn)率為 6.850% 。該分析成功將多維性狀數(shù)據(jù)降維為5個(gè)具有明確生物學(xué)意義的綜合因子,不僅簡(jiǎn)化了數(shù)據(jù)分析流程,更直觀揭示了谷子重要性狀的遺傳結(jié)構(gòu),為親本選擇提供了科學(xué)依據(jù)。
聚類分析結(jié)果表明,當(dāng)相關(guān)系數(shù) (R2) 達(dá)到0.0306時(shí),30份試驗(yàn)材料被有效劃分為5個(gè)遺傳類群,不同類群的性狀具有一定的差異。第I類群的全生育期和出苗至抽穗天數(shù)均為最大,此類群可作為晚熟材料供育種者使用。第I類群的出苗至抽穗天數(shù)為最小,該類群可作為早熟材料供育種者使用。第Ⅱ類群的主莖長(zhǎng)度、主莖直徑、千粒重、主穗長(zhǎng)度和粗蛋白含量、粗脂肪含量均為最大,可作為高品質(zhì)材料供育種者使用。第Ⅳ類群的單株穗重和單株粒重均為最大、全生育期為最小,可作為高產(chǎn)早熟材料供育種者使用。
谷子的農(nóng)藝性狀和品質(zhì)性狀受基因型和環(huán)境的共同影響[18-22]。但是地方種質(zhì)資源的創(chuàng)新利用可通過2條路徑實(shí)現(xiàn):其一,通過遺傳改良與種質(zhì)創(chuàng)新策略挖掘其潛在優(yōu)異基因資源;其二,基于已篩選的地方品種優(yōu)勢(shì)種質(zhì)材料,定向培育具有特異性狀的新種質(zhì)。尤其在品質(zhì)育種與特色性狀開發(fā)領(lǐng)域,地方品種因其豐富的遺傳多樣性及生態(tài)型特異性,展現(xiàn)出顯著的育種應(yīng)用潛力。
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