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        木豆OFP蛋白基因家族鑒定與表達(dá)分析

        2025-04-16 00:00:00李程勛徐曉俞李愛(ài)萍
        江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2025年4期
        關(guān)鍵詞:表達(dá)分析

        摘要:了解OFP卵型家族蛋白(OVATE family proteins)在木豆中的特征,為木豆OFP基因的應(yīng)用提供參考。利用生物信息學(xué)方法對(duì)木豆OFP蛋白基因進(jìn)行全基因組鑒定及表達(dá)模式分析。結(jié)果表明,木豆含有21個(gè)OFP蛋白基因,家族成員間理化特性差異不大,均屬于不穩(wěn)定親水性蛋白,且均含有保守基序;進(jìn)化樹(shù)分析中木豆和擬南芥二者的OFP蛋白相互交錯(cuò)聚類在一起,親緣關(guān)系較近的OFP蛋白可能具有相似的功能;啟動(dòng)子順式響應(yīng)元件分析表明木豆OFP基因可能在逆境脅迫響應(yīng)、激素調(diào)節(jié)和生長(zhǎng)發(fā)育方面發(fā)揮重要作用;蛋白二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu)均以α-螺旋和無(wú)規(guī)則卷曲結(jié)構(gòu)為主要組成成分;組織特異性表達(dá)表明OFP基因在頂芽中的表達(dá)量較大,在根和葉中的表達(dá)量較小,具有組織表達(dá)差異;啟動(dòng)子順式響應(yīng)元件結(jié)合熱脅迫表達(dá)分析表明,高溫脅迫下CcOFP1表達(dá)量上調(diào),CcOFP9、CcOFP11表達(dá)量下調(diào)。研究結(jié)果為探索OFP蛋白基因在木豆生長(zhǎng)發(fā)育和非生物脅迫響應(yīng)方面的生物學(xué)功能提供依據(jù)。

        關(guān)鍵詞:木豆;OFP蛋白基因家族;表達(dá)分析

        中圖分類號(hào):S188;S529.01" 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A

        文章編號(hào):1002-1302(2025)04-0209-09

        收稿日期:2024-04-26

        基金項(xiàng)目:福建省科技計(jì)劃-省屬公益類科研院所基本科研專項(xiàng)(編號(hào):2024R10300010);福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院對(duì)外合作項(xiàng)目(編號(hào):DWHZ-2024-18);福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)(編號(hào):CXTD2021011-2);福建省人民政府、中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院“5511”協(xié)同創(chuàng)新工程(編號(hào):XTCXGC2021019)。

        作者簡(jiǎn)介:李程勛(1991—),男,福建南安人,碩士,助理研究員,主要從事作物遺傳育種及農(nóng)產(chǎn)品天然產(chǎn)物提取研究。E-mail:1219513539@qq.com。

        通信作者:李愛(ài)萍,研究員,主要從事作物遺傳育種及農(nóng)產(chǎn)品天然產(chǎn)物提取研究。E-mail:apl909@163.com。

        木豆(Cajanus cajan),豆科木豆屬,是一種多年生木本作物,別稱鴿豆、樹(shù)豆、柳豆等。木豆是世界第六大食用豆類,也是唯一的木本食用豆,木豆含有較高的蛋白質(zhì),被稱為“窮人的肉食”,是半干旱地區(qū)重要的食用豆類作物[1-2]。木豆還含有豐富的淀粉、氨基酸、纖維素、脂肪、維生素等[3-5],具有較高的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值。木豆葉具有清熱解毒、補(bǔ)腎健骨、止痛止血、降低血液中膽固醇含量等功效[6],能夠治療骨頭壞死、心血管疾病、肺病、口腔潰瘍等[7-8]。木豆具有良好的耐旱、耐瘠等抗逆性[9],能適應(yīng)各種類型的土壤,包括沙土、鹽漬土、壤土等[10],研究木豆生長(zhǎng)發(fā)育中抗逆響應(yīng)因子,可為木豆優(yōu)良品種的選育提供參考依據(jù)。熱脅迫會(huì)影響植物生物量的累積,造成產(chǎn)量下降,這種現(xiàn)象在熱帶、亞熱帶地區(qū)尤為明顯。當(dāng)前溫室效應(yīng)越來(lái)越嚴(yán)重,氣溫升高速度變快,前人研究表明,氣溫每升高3~4 ℃作物產(chǎn)量會(huì)下降15%~35%[11]。栽培木豆最佳溫度為25~35 ℃,在木豆生長(zhǎng)的季節(jié)中,最高溫度每上升 1 ℃,會(huì)造成木豆減產(chǎn)20.8%[12]。因此研究木豆高溫脅迫響應(yīng)因子,為木豆耐熱品種選育打下基礎(chǔ)。

        OFP(OVATE family proteins)卵形家族蛋白是植物所特有的一類轉(zhuǎn)錄因子,在番茄中首次被報(bào)道[13],其C端有1段約70個(gè)氨基酸的保守結(jié)構(gòu)域,該結(jié)構(gòu)域被命名為OVATE結(jié)構(gòu)域。

        目前OFP蛋白的研究在擬南芥(Arabidopsis thaliana)、水稻(Oryza sativa)、小麥(Triticum aestivum)、玉米(Zea mays)和番茄(Solanum lycopersicum)等中均有報(bào)道[14-17],OFP蛋白具有調(diào)控植株生長(zhǎng)發(fā)育的多種功能,比如能調(diào)控果實(shí)形態(tài)[13]、次生細(xì)胞壁形成[18]、胚囊和維管束發(fā)育等[19]。擬南芥中AtOPF1通過(guò)抑制赤霉素生物合成途徑中關(guān)鍵酶基因AtGA20ox1的轉(zhuǎn)錄活性,抑制細(xì)胞伸長(zhǎng),造成植株矮?。?0],同時(shí)AtOPF1與BLH3(bel1-like homeodomain 3)互作調(diào)控?cái)M南芥從營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)階段轉(zhuǎn)變到生殖生長(zhǎng)階段,與ATH1(homeobox gene 1)互作調(diào)控?cái)M南芥莖的生長(zhǎng)、開(kāi)花時(shí)間和花基邊界形成[21],與KNAT5(knotted1-like homeobox gene 5)互作調(diào)控?cái)M南芥?zhèn)雀鶖?shù)目和根長(zhǎng)[22];AtOPF5蛋白和BLH1-KNAT3蛋白復(fù)合物互作負(fù)調(diào)控?cái)M南芥早期胚囊的發(fā)育[23];AtOFP4與KNAT7互作調(diào)控次生壁的形成[24];AtOFP15和AtOFP16可能參與調(diào)控?cái)M南芥莢果形態(tài)[25-26]。

        OFP蛋白在植物非生物逆境脅迫中也具有很重要的作用,擬南芥中AtOFP8對(duì)干旱和高溫敏感,過(guò)量表達(dá)AtOFP8增強(qiáng)了擬南芥對(duì)干旱的耐受性;水稻OsOFP6正向調(diào)控水稻耐冷性[14];油桐(Vernicia fordii)VfOFP7在低溫下被明顯誘導(dǎo)[27];在小麥冷馴化研究中得出需要多個(gè)TaOFP基因來(lái)維持細(xì)胞穩(wěn)態(tài),表明TaOFP在小麥抗寒性的獲得中起到重要作用[28];多個(gè)蘋果(Malus pumila Mill.)OFP家族基因在低溫中表達(dá)上調(diào),OFP家族基因在高低溫、干旱和鹽脅迫中均有一定的響應(yīng)[29]。

        OFP基因家族在植物生長(zhǎng)發(fā)育和非生物逆境脅迫中起著重要的調(diào)控作用,尤其在高低溫、干旱等非生物脅迫中發(fā)揮著重要的作用,目前有關(guān)木豆OFP基因家族的相關(guān)研究未見(jiàn)報(bào)道。本研究通過(guò)生物信息學(xué)方法鑒定木豆全基因組中的OFP成員(稱為CcOFP),進(jìn)一步分析其蛋白理化性質(zhì)、基因結(jié)構(gòu)、保守基序、家族進(jìn)化關(guān)系、蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)、蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)和蛋白互作網(wǎng)絡(luò),并利用轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析基因組織表達(dá)特性和高溫脅迫下的表達(dá)模式,為后續(xù)進(jìn)一步解析CcOFP基因生長(zhǎng)發(fā)育調(diào)控機(jī)制和耐逆功能提供理論參考依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)時(shí)間和地點(diǎn)

        本試驗(yàn)于2023年5月在福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院科研綜合實(shí)驗(yàn)樓作物研究所實(shí)驗(yàn)室內(nèi)完成。

        1.2 CcOFP基因家族成員鑒定

        從NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)下載木豆基因組和蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)。利用數(shù)據(jù)庫(kù)下載OFP的隱馬爾可夫模型,利用hmmsearch得到候選基因家族成員,利用已發(fā)表的擬南芥OFP蛋白基因家族成員的氨基酸序列為探針,進(jìn)行BLASTp比對(duì)獲得同源蛋白序列,結(jié)合hmmsearch和BLASTp結(jié)果,利用NCBI-CDD數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)一步確認(rèn)鑒定的OFP蛋白序列中的OFP結(jié)構(gòu)域。利用ExPASy數(shù)據(jù)庫(kù)分析蛋白質(zhì)的理化特性。

        1.3 系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)比對(duì)

        提取擬南芥和木豆OFP蛋白氨基酸序列,利用MEGA 7.0軟件構(gòu)建木豆和擬南芥OFP蛋白系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù),采用MUSCLE方法進(jìn)行多序列比對(duì),采用Neighbor-Joining方法構(gòu)建進(jìn)化樹(shù),Bootstrap值設(shè)定為1 000,其他參數(shù)采用默認(rèn)值,利用iToL軟件對(duì)進(jìn)化樹(shù)進(jìn)行美化。

        1.4 CcOFP基因結(jié)構(gòu)與氨基酸保守基序分析

        利用MEME數(shù)據(jù)庫(kù)分析木豆OFP蛋白的氨基酸保守基序,motif值設(shè)為11,其他參數(shù)采用默認(rèn)值,利用TBtools軟件繪制基因結(jié)構(gòu)和保守基序圖。

        1.5 CcOFP基因啟動(dòng)子順式作用元件分析

        利用Plant CARE對(duì)木豆OFP基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游2 000 bp序列的順勢(shì)作用元件進(jìn)行預(yù)測(cè),利用TBtools軟件繪制啟動(dòng)子順式作用元件結(jié)構(gòu)圖。

        1.6 木豆OFP蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu)分析

        利用SOPMA和SWISS-MODEL數(shù)據(jù)庫(kù)分別對(duì)木豆OFP蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測(cè)。

        1.7 木豆OFP蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析及可視化

        利用String數(shù)據(jù)庫(kù)以擬南芥OFP蛋白模型構(gòu)建木豆OFP蛋白互作網(wǎng)絡(luò)[30],并利用Cytoscape軟件繪圖。

        1.8 CcOFP基因組織表達(dá)差異和高溫脅迫響應(yīng)分析

        通過(guò)NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)下載木豆根、莖、頂芽、葉及42 ℃脅迫下的RNA-Seq數(shù)據(jù),登錄號(hào)見(jiàn)表1和表2,利用TBtools中的Trimmomatic對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)量控制,通過(guò)Kallisto分析得到OFP基因的表達(dá)量矩陣,利用TPM值進(jìn)行熱圖繪制[31]。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 木豆OFP蛋白基因家族成員鑒定及其理化特性分析

        由表3可知,共鑒定到木豆OFP蛋白基因21個(gè),依次命名為CcOFP1~CcOFP21,CcOFP蛋白序列長(zhǎng)度為155~403個(gè)氨基酸(aa),根據(jù)數(shù)據(jù)庫(kù)中基因位置信息得出,2、3、7、11號(hào)染色體上各分布有2個(gè)CcOFP基因;1、4、8號(hào)染色體上各有1個(gè)CcOFP基因,還有10個(gè)CcOFP基因未定位。

        蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)與蛋白質(zhì)功能息息相關(guān),利用ExPASy數(shù)據(jù)庫(kù)的ProParam工具對(duì)CcOFP蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)進(jìn)行分析,結(jié)果見(jiàn)表2。CcOFP蛋白等電點(diǎn)在4.55~9.87之間,其中偏堿性(等電點(diǎn)>7)的CcOFP蛋白有11個(gè),偏酸性(等電點(diǎn)<7)的有10個(gè);不穩(wěn)定系數(shù)為41.01~75.24,均屬于不穩(wěn)定蛋白;脂溶指數(shù)為52.59~83.45;總平均親水性均<0,均為親水性蛋白。

        2.2 OFP蛋白基因家族的進(jìn)化分析

        將木豆OFP基因家族成員(21個(gè))和擬南芥OFP基因家族成員(18個(gè))的蛋白質(zhì)序列進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)構(gòu)建,結(jié)果見(jiàn)圖1。結(jié)果顯示,39個(gè)OFP蛋白成員被分為3個(gè)類群,分別為GroupⅠ、GroupⅡ和GroupⅢ。GroupⅠ由2個(gè)擬南芥OFP蛋白和1個(gè)木豆OFP蛋白組成,GroupⅡ由7個(gè)擬南芥OFP蛋白和9個(gè)木豆OFP蛋白組成,GroupⅢ由9個(gè)擬南芥OFP蛋白和11個(gè)木豆OFP蛋白組成。在進(jìn)化樹(shù)中CcOFP16蛋白和AtOFP14蛋白的親緣關(guān)系較近,CcOFP7蛋白和AtOFP13蛋白的親緣關(guān)系較近,CcOFP12蛋白和AtOFP8蛋白的親緣關(guān)系較近,CcOFP17蛋白和AtOFP5蛋白的親緣關(guān)系較近,推測(cè)他們可能具有相似的基因功能,在OFP進(jìn)化樹(shù)的分支中木豆和擬南芥二者相互交錯(cuò)聚類在一起,說(shuō)明OFP的進(jìn)化速度較快,且在進(jìn)化過(guò)程中產(chǎn)生了較大的分化。

        2.3 CcOFP的基因結(jié)構(gòu)域Motif分析

        基于CcOFP基因組和編碼區(qū)序列繪制基因結(jié)構(gòu)圖,結(jié)果見(jiàn)圖2;利用MEME軟件對(duì)木豆OFP蛋白保守基序進(jìn)行預(yù)測(cè),繪制Motif結(jié)構(gòu)圖,結(jié)果見(jiàn)圖3。在CcOFP基因家族中,CcOFP13、CcOFP18各有1個(gè)內(nèi)含子,CcOFP17沒(méi)有3′和5′非編碼區(qū),CcOFP1、CcOFP8沒(méi)有3′非編碼區(qū)。

        保守基序的分析有利于探索蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)組成,分析結(jié)果表明,木豆OFP蛋白家族具有3~9個(gè)保守基序(motif),全部成員均含有motif1、motif2、motif3保守基序,且先后順序都一致,說(shuō)明OFP蛋白

        家族在木豆中比較保守。

        2.4 CcOFP基因啟動(dòng)子順式響應(yīng)元件分析

        通過(guò)對(duì)CcOFP基因啟動(dòng)子的順式響應(yīng)元件進(jìn)行分析,得到圖4。CcOFP基因家族啟動(dòng)子序列含有17類順式響應(yīng)元件,包括4類脅迫響應(yīng)元件:低溫響應(yīng)、厭氧脅迫響應(yīng)、防御和壓力響應(yīng)、干旱響應(yīng);5類激素響應(yīng)元件:赤霉素響應(yīng)、茉莉酸甲酯響應(yīng)、脫落酸響應(yīng)、水楊酸響應(yīng)、生長(zhǎng)素響應(yīng);8類生長(zhǎng)相關(guān)順式作用元件:光響應(yīng)、胚乳表達(dá)調(diào)控、晝夜節(jié)律調(diào)控、分生組織表達(dá)、種子特異性調(diào)控、柵欄葉肉細(xì)胞分化調(diào)控、類黃酮生物合成基因調(diào)控、根特異性元件。其中豐度最大的為光響應(yīng)元件,共有214個(gè)響應(yīng)元件,厭氧脅迫響應(yīng)元件和茉莉酸甲酯響應(yīng)元件豐度也較大,分別有31個(gè)和30個(gè)。表明CcOFP基因在逆境脅迫響應(yīng)、激素調(diào)節(jié)和生長(zhǎng)發(fā)育方面發(fā)揮重要作用。

        2.5 木豆OFP蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu)分析

        對(duì)木豆OFP蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測(cè)分析,結(jié)果見(jiàn)表4。21個(gè)木豆OFP蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)均含有α-螺旋、β-轉(zhuǎn)角、延伸鏈和無(wú)規(guī)則卷曲結(jié)構(gòu),其中α-螺旋結(jié)構(gòu)數(shù)量比例為20.37%~56.77%,β-轉(zhuǎn)角結(jié)構(gòu)數(shù)量比例為0.80%~9.03%, 延伸鏈

        結(jié)構(gòu)數(shù)量比例為6.72%~20.44%,無(wú)規(guī)則卷曲結(jié)構(gòu)數(shù)量比例為26.45%~69.00%??梢?jiàn)木豆OFP蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)是以α-螺旋和無(wú)規(guī)則卷曲結(jié)構(gòu)為主要組成成分。

        對(duì)木豆OFP蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測(cè)分析,結(jié)果見(jiàn)圖5。由圖5可見(jiàn),木豆OFP蛋白的空間結(jié)構(gòu)主要由α-螺旋和無(wú)規(guī)則卷曲結(jié)構(gòu)組成,β-轉(zhuǎn)角和延伸鏈結(jié)構(gòu)較少。

        2.6 木豆OFP蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析

        利用string數(shù)據(jù)庫(kù)以擬南芥OFP蛋白模型構(gòu)建木豆OFP蛋白互作網(wǎng)絡(luò)(圖6)。結(jié)果顯示CcOFP6、CcOFP8、CcOFP9、CcOFP10、CcOFP14、CcOFP16、CcOFP17、CcOFP18、CcOFP19、CcOFP20、CcOFP21共11個(gè)蛋白參與互作,存在23條互作關(guān)系。

        2.7 OFP基因的組織表達(dá)和高溫脅迫表達(dá)分析

        通過(guò)對(duì)木豆根(S1)、莖(S2)、頂芽(S3)、葉(S4)的RNA-Seq數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,得出OFP基因在不同組織部位的表達(dá)水平(圖7)。由圖7可以看出,OFP基因在頂芽中的表達(dá)量較大,在根和葉中的表達(dá)量較小,其中CcOFP7、CcOFP12和CcOFP14在頂芽中具有較高的表達(dá)量,CcOFP15在莖中也有較高的表達(dá)量,CcOFP8、CcOFP13、CcOFP21在各個(gè)組織中表達(dá)量均較低或未表達(dá)。

        通過(guò)木豆42 ℃高溫脅迫下的RNA-Seq數(shù)據(jù)分析,得出OFP基因在高溫脅迫下的表達(dá)水平(圖8)。由圖8可見(jiàn),在高溫脅迫下大部分OFP均有響應(yīng),其中CcOFP2、CcOFP3、CcOFP6、CcOFP12、CcOFP13、CcOFP18、CcOFP19、CcOFP20、CcOFP21的表達(dá)量較小,CcOFP1、CcOFP8具有較為明顯的上調(diào)表達(dá),CcOFP7、CcOFP9、CcOFP10、CcOFP11、CcOFP14具有較為明顯的下調(diào)表達(dá)。

        3 討論

        本研究利用生物信息學(xué)方法鑒定出木豆OFP蛋白家族成員21個(gè),OFP家族的成員數(shù)量在不同物種間存在差異,呈現(xiàn)出單子葉植物的OFP家族成員多于雙子葉植物的趨勢(shì),比如單子葉植物玉米有44個(gè)[32],谷子(Setaria italica)有34個(gè)[33],水稻有31個(gè)[34],雙子葉植物擬南芥有18個(gè)[16],葡萄(Vitis vinifera)有17個(gè)[35], 油桐有12個(gè)[27],推測(cè)在植物

        進(jìn)化過(guò)程中OFP家族發(fā)生了收縮。進(jìn)一步通過(guò)蛋白質(zhì)理化分析和保守基序分析發(fā)現(xiàn)木豆OFP蛋白均為不穩(wěn)定的親水性蛋白,均含有motif1、motif2、motif3保守基序,蛋白二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu)均以α-螺旋和無(wú)規(guī)則卷曲結(jié)構(gòu)為主要組成成分,表明木豆OFP蛋白家族成員間存在保守性,這與程欣在番茄OFP基因家族中的研究結(jié)果[36]一致。

        植物逆境響應(yīng)方面,AtOFP8對(duì)干旱和高溫敏感,過(guò)量表達(dá)AtOFP8增強(qiáng)了擬南芥對(duì)干旱的耐受性[37],CcOFP12與AtOFP8結(jié)構(gòu)相近,同時(shí)在CcOFP5、CcOFP8、CcOFP11、 CcOFP12、 CcOFP17基

        因啟動(dòng)子上發(fā)現(xiàn)干旱響應(yīng)元件,因此推測(cè)CcOFP12基因可能在木豆抗旱過(guò)程中起到重要作用。在CcOFP1、CcOFP9、CcOFP11、CcOFP15、CcOFP16和CcOFP18基因啟動(dòng)子上發(fā)現(xiàn)低溫響應(yīng)元件,推測(cè)這些CcOFP基因可能在木豆高低溫脅迫過(guò)程中起到重要作用,結(jié)合高溫脅迫表達(dá)分析,得出CcOFP1基因啟動(dòng)子響應(yīng)高溫脅迫信號(hào),基因表達(dá)量上調(diào);CcOFP9和CcOFP11基因啟動(dòng)子響應(yīng)高溫脅迫信號(hào),基因表達(dá)量下調(diào),其他CcOFP高溫響應(yīng)基因可能通過(guò)蛋白互作來(lái)響應(yīng)高溫脅迫信號(hào)。

        生長(zhǎng)發(fā)育響應(yīng)方面,本研究OFP進(jìn)化樹(shù)的分支中木豆和擬南芥二者相互交錯(cuò)聚類在一起,兩者有多個(gè)基因具有較近的親緣關(guān)系,因此可能具有相似的功能,比如擬南芥AtOPF5蛋白負(fù)調(diào)控?cái)M南芥早期胚囊的發(fā)育[23],木豆CcOFP17蛋白與AtOPF5蛋白具有較近的親緣關(guān)系,推測(cè)CcOFP17蛋白對(duì)木豆早期胚囊的發(fā)育起到調(diào)控作用。同時(shí)CcOFP基因啟動(dòng)子也具有光響應(yīng)、胚乳表達(dá)調(diào)控、晝夜節(jié)律調(diào)控等多種生長(zhǎng)相關(guān)順式作用元件,可以進(jìn)一步對(duì)其進(jìn)行相應(yīng)的功能特性研究。在組織特異性表達(dá)方面,CcOFP7、CcOFP12和CcOFP14在頂芽中具有較高的表達(dá)量,CcOFP15在莖中有較高的表達(dá)量,表明木豆OFP基因可能主要參與芽的生長(zhǎng)調(diào)控。

        4 結(jié)論

        綜上,本研究利用生物信息學(xué)方法對(duì)木豆OFP蛋白基因家族進(jìn)行了較為全面的分析,鑒定出21個(gè)木豆OFP蛋白家族成員,具有較高的保守性,均屬于不穩(wěn)定親水性蛋白,空間結(jié)構(gòu)主要由α-螺旋和無(wú)規(guī)則卷曲結(jié)構(gòu)組成。啟動(dòng)子順式響應(yīng)元件分析結(jié)合高溫脅迫表達(dá)分析篩選出高溫響應(yīng)候選基因CcOFP1、CcOFP9和CcOFP11,組織表達(dá)分析篩選出頂芽發(fā)育響應(yīng)候選基因CcOFP7、CcOFP12和CcOFP14,莖發(fā)育候選基因CcOFP15。

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