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        甜瓜GATA基因家族的鑒定及表達(dá)分析

        2025-04-16 00:00:00侯銀鶴張永平姚東偉刁倩楠田守波喬宏宇曹燕燕
        江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2025年4期
        關(guān)鍵詞:白粉病甜瓜

        摘要:GATA轉(zhuǎn)錄因子是一類廣泛存在于真核生物中具有Ⅳ型鋅指結(jié)構(gòu)域的轉(zhuǎn)錄因子,在植物生長和發(fā)育過程中起重要作用。GATA基因家族已在各種植物中被發(fā)現(xiàn),但是目前尚無甜瓜GATA轉(zhuǎn)錄因子的報(bào)道。為此,利用生物信息學(xué)對甜瓜GATA家族基因成員進(jìn)行了全基因組鑒定與分析。結(jié)果表明,甜瓜基因組中共鑒定到25個(gè)GATA基因,這些基因不均勻地分布在10條染色體上。25個(gè)GATA基因編碼的氨基酸長度在131~565 aa之間,蛋白分子量在14.13~63.04 ku之間,等電點(diǎn)范圍介于3.63~9.71之間,80%定位在細(xì)胞核。根據(jù)進(jìn)化關(guān)系可將甜瓜GATA家族分為3個(gè)亞族,分別包含了6、8、11個(gè)成員。啟動子分析發(fā)現(xiàn),GATA基因家族上游存在大量與植物激素、光信號和逆境相關(guān)的順式作用元件,顯示可能存在多種轉(zhuǎn)錄調(diào)控?;蚪M織表達(dá)模式分析結(jié)果表明,約50%GATA家族成員在甜瓜不同組織中呈不同程度的特異性表達(dá)。采用qRT-PCR方法對白粉病菌脅迫下的6個(gè)甜瓜GATA基因的表達(dá)水平進(jìn)行分析,結(jié)果表明GATA基因家族可能參與甜瓜對白粉病菌侵染的響應(yīng)。

        關(guān)鍵詞:甜瓜;GATA轉(zhuǎn)錄因子;基因家族;表達(dá)模式;脅迫響應(yīng);白粉病

        中圖分類號:S652.01;S436.5" 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A

        文章編號:1002-1302(2025)04-0031-09

        收稿日期:2024-05-14

        基金項(xiàng)目:上海市科技興農(nóng)項(xiàng)目(編號:2022-02-08-00-12-F01118);上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院卓越團(tuán)隊(duì)項(xiàng)目(編號:滬農(nóng)科卓〔2022〕020)。

        作者簡介:侯銀鶴(1998—),女,內(nèi)蒙古赤峰人,碩士研究生,主要從事甜瓜抗病基礎(chǔ)研究。E-mail:983146431@qq.com。

        通信作者:曹燕燕,博士,助理研究員,主要從事甜瓜抗病機(jī)制研究。E-mail:cyy52128@163.com 。

        轉(zhuǎn)錄因子通過識別并結(jié)合目的基因啟動子區(qū)域的順式作用元件來調(diào)控基因表達(dá)[1]。它們在控制植物細(xì)胞分化[2]、花器官發(fā)育[3]、晝夜節(jié)律[4]、激素響應(yīng)[5]和抗病性[6]等方面起著重要作用。目前,甜瓜中的許多轉(zhuǎn)錄因子被鑒定和分析,如WRKY[7]、Dof[8]、NAC[9]和bHLH[10]等,然而,迄今未見關(guān)于甜瓜GATA轉(zhuǎn)錄因子家族研究的報(bào)道。

        GATA基因家族是真核生物中廣泛存在的具有鋅指結(jié)構(gòu)的轉(zhuǎn)錄因子,是鋅指蛋白家族的成員之一。植物中的GATA轉(zhuǎn)錄因子大部分含有(CX2CX18CX2C)和(CX2CX20CX2C)鋅指結(jié)構(gòu),能與DNA序列WGATAR特異性結(jié)合,從而調(diào)控下游基因的表達(dá)[11-12]。GATA轉(zhuǎn)錄因子在植物生長發(fā)育過程中扮演著至關(guān)重要的角色。研究表明,GATA家族成員在調(diào)控植物生長發(fā)育、響應(yīng)環(huán)境脅迫以及參與激素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑等多種生物過程中具有關(guān)鍵作用[13-14]。研究發(fā)現(xiàn),將二穗短柄草基因BdGATA13在擬南芥中進(jìn)行異源表達(dá),與野生型植株相比,過表達(dá)植株葉片顏色更為深綠,花期延遲,對干旱脅迫的耐受性顯著增強(qiáng)[15]。番茄中SlGATA17基因的突變導(dǎo)致植株對鹽脅迫的耐受性降低,而在擬南芥中異源表達(dá)該基因能夠促進(jìn)種子在NaCl、脫落酸和甘露醇條件下萌發(fā)[16]。水稻中過表達(dá)OsGATA12基因,植株葉片綠色加深,葉和分蘗數(shù)減少,在高密植時(shí)單位面積的產(chǎn)量顯著增加[17]。以上研究結(jié)果表明,GATA家族基因在作物改良中具有較高的潛在應(yīng)用價(jià)值。目前,包括擬南芥[13]、玉米[18]、小麥[19]、葡萄[20]和油菜[21]在內(nèi)的許多植物中都已鑒定出GATA轉(zhuǎn)錄因子。

        甜瓜是一種重要的園藝經(jīng)濟(jì)作物,其產(chǎn)量和品質(zhì)的提升一直是育種研究的重要目標(biāo)。我國甜瓜的栽培面積和產(chǎn)量常年穩(wěn)居世界首位[22]。然而許多因素都會影響甜瓜的正常生長發(fā)育,如病原菌侵染、低溫和干旱脅迫等。白粉病是甜瓜生產(chǎn)中一種重要的世界性真菌性病害,其發(fā)病和傳播速度都極快。白粉病發(fā)病多集中于葉片,嚴(yán)重時(shí)亦可危害葉柄、莖蔓甚至是果實(shí),從而導(dǎo)致甜瓜的產(chǎn)量和品質(zhì)嚴(yán)重下降,造成巨大的經(jīng)濟(jì)損失[23-24]。GATA基因家族在植物生長發(fā)育和非生物脅迫響應(yīng)中的功能已有較多研究,但其在生物脅迫方面的研究較少。該基因家族已經(jīng)在多種植物中被鑒定和研究,但是甜瓜中GATA基因家族的全基因組鑒定以及其對白粉病菌的響應(yīng)目前都尚不清楚。本研究采用生物信息學(xué)手段對甜瓜GATA家族基因進(jìn)行了全基因組鑒定及分析,并進(jìn)一步借助Real-time PCR技術(shù)研究了該家族基因在白粉病菌脅迫下的表達(dá)模式。以期為深入解析甜瓜GATA家族基因的特征及其在抗病中的功能研究提供參考依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)時(shí)間及地點(diǎn)

        于2023年5月在上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院園藝研究所進(jìn)行試驗(yàn)。

        1.2 甜瓜GATA基因家族成員的鑒定及理化性質(zhì)分析

        為了研究甜瓜基因組中GATA家族基因的序列特征和功能,筆者以擬南芥的GATA蛋白序列作為查詢序列,在甜瓜基因組數(shù)據(jù)庫進(jìn)行BLASTP搜索,得到潛在的甜瓜GATA家族成員。同時(shí),在Pfam數(shù)據(jù)庫中獲取GATA保守結(jié)構(gòu)域序列生成隱馬爾可夫模型(HMM),利用HMMER 3.0軟件(默認(rèn)參數(shù))對甜瓜GATA蛋白進(jìn)行HMMER搜索。將以上2種方法所獲得的候選序列通過比較去掉冗余序列,作為甜瓜GATA家族候選成員。利用ExPASy在線網(wǎng)站對甜瓜GATA家族成員的蛋白質(zhì)分子量和等電點(diǎn)進(jìn)行預(yù)測,利用WoLF PSORT在線網(wǎng)站做亞細(xì)胞定位預(yù)測。

        1.3 甜瓜GATA基因家族系統(tǒng)進(jìn)化樹分析

        從TAIR數(shù)據(jù)庫中下載擬南芥GATA家族成員的氨基酸序列。利用MEGA 11.0軟件通過鄰接法構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,校驗(yàn)參數(shù)1 000次重復(fù),其他參數(shù)設(shè)為默認(rèn)值。

        1.4 甜瓜GATA基因家族染色體定位、基因結(jié)構(gòu)及保守結(jié)構(gòu)分析

        通過甜瓜基因組數(shù)據(jù)庫獲取GATA家族基因在染色體上的定位信息,并利用TBtools軟件對其染色體定位進(jìn)行可視化。進(jìn)一步利用TBtools軟件對甜瓜GATA家族基因結(jié)構(gòu)進(jìn)行解析,同時(shí)繪制該家族的外顯子-內(nèi)含子結(jié)構(gòu)圖。利用在線工具M(jìn)EME對GATA蛋白序列的保守結(jié)構(gòu)域進(jìn)行分析,將最大結(jié)構(gòu)域數(shù)目設(shè)定為6,其他參數(shù)保持默認(rèn)設(shè)置。

        1.5 甜瓜GATA基因家族成員啟動子順式作用元件分析

        使用TBtools軟件從下載的甜瓜基因組數(shù)據(jù)庫中提取甜瓜CmGATA基因起始密碼子上游2 000 bp序列,利用在線網(wǎng)站Plant CARE分析各基因啟動子區(qū)域中可能存在的順式作用元件[25]。

        1.6 甜瓜GATA家族基因表達(dá)量分析

        為研究GATA基因在甜瓜中的表達(dá)情況,從甜瓜基因組數(shù)據(jù)庫中獲取全部GATA基因在不同組織(根、葉、雄花、雌花、果實(shí))的FPKM值,利用TBtools(https://www.biorxiv.org/ content/early/2018/03/27/289660)完成聚類和作圖分析。

        1.7 白粉病菌接種處理與Real-time PCR分析

        該研究以抗白粉病高代自交系甜瓜J152為試材,在植物培養(yǎng)箱中培養(yǎng)至3葉1心時(shí)用于白粉病菌接種試驗(yàn)。白粉病菌具體接種方法參照Cao等的研究[26]。分別于接種后0、1、2、3 d采集接種的甜瓜葉片,液氮速凍后置-80 ℃冰箱保存。所有處理重復(fù)3次,每次重復(fù)10株幼苗。甜瓜RNA的提取及用于qRT-PCR的體系和方法參照Cao等的研究[26]。以甜瓜CmActin作為內(nèi)參基因[27]。通過Primer 5 軟件設(shè)計(jì)qRT-PCR所需的特異性引物,引物序列見表1。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 甜瓜GATA基因家族成員的鑒定、理化性質(zhì)及亞細(xì)胞定位分析

        本研究綜合利用Blast和HMM 2種方法共鑒定到25個(gè)甜瓜GATA基因,依據(jù)其在染色體上的位置

        信息依次命名為CmGATA1~CmGATA25(表2)。CmGATA家族基因編碼的氨基酸長度在131 (CmGATA6)~565 (CmGATA17) aa之間,蛋白質(zhì)分子量在14.13(CmGATA6)~63.04(CmGATA17) ku之間,蛋白質(zhì)等電點(diǎn)范圍介于3.63(CmGATA6)~9.71(CmGATA16)之間。亞細(xì)胞定位預(yù)測發(fā)現(xiàn),有20個(gè)蛋白定位于細(xì)胞核中,占總數(shù)的80%;CmGATA2蛋白定位在線粒體中,CmGATA12、CmGATA19和CmGATA20蛋白定位在葉綠體中,CmGATA5蛋白定位在細(xì)胞質(zhì)中。

        2.2 甜瓜GATA家族系統(tǒng)進(jìn)化分析

        為了揭示甜瓜CmGATA家族成員之間的進(jìn)化關(guān)系,以擬南芥GATA基因家族為參考,采用鄰接法對甜瓜CmGATA蛋白構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(圖1),根據(jù)親緣關(guān)系和序列的相似性將25個(gè)GATA蛋白劃分為Ⅰ~Ⅲ 3個(gè)亞族,每個(gè)亞族分別有6、8、11個(gè)成員。每個(gè)亞族成員同源性較高,具有較近的進(jìn)化關(guān)系。

        2.3 甜瓜GATA基因家族成員保守結(jié)構(gòu)域與基因結(jié)構(gòu)分析

        基因的保守結(jié)構(gòu)域在其生物學(xué)功能方面發(fā)揮了重要作用。具有相似motif的序列可為基因家族成員間的遺傳關(guān)系和進(jìn)化歷程提供重要線索。本研究利用在線工具M(jìn)EME對甜瓜GATA家族蛋白進(jìn)行預(yù)測分析,同時(shí)利用最大似然法構(gòu)建進(jìn)化樹,并利用TBtools將其與保守基序預(yù)測結(jié)果進(jìn)行可視化。結(jié)果(圖2)表明,甜瓜GATA家族存在6個(gè)保守基序(motif1~motif6),其中2個(gè)GATA蛋白含有1個(gè)motif,9個(gè)GATA蛋白含有2個(gè)motif,13個(gè)GATA蛋白含有4個(gè)motif,1個(gè)GATA蛋白含有3個(gè)motif。23個(gè)GATA蛋白都包含motif1和motif5。在系統(tǒng)發(fā)生樹中,親緣關(guān)系較近的家族成員通常含有相似的motif,說明同一類群的GATA蛋白可能具有相似的功能。

        通過基因結(jié)構(gòu)分析,可以得出以下結(jié)論:CmGATA基因家族中,除了CmGATA22只含有1個(gè)外顯子而不含內(nèi)含子之外, 其他的CmGATA基因均

        包含多個(gè)外顯子和內(nèi)含子。具體而言,這些基因的外顯子數(shù)量介于2~11個(gè)之間,而內(nèi)含子數(shù)量則在1~10個(gè)之間。特別值得注意的是,CmGATA9基因的外顯子和內(nèi)含子數(shù)量均為最多,分別為11、10個(gè)(圖2)。

        2.4 甜瓜GATA基因家族的染色體定位

        根據(jù)CmGATA在甜瓜染色體上的位置信息,通過利用MG2C在線工具繪制甜瓜GATA染色體物理圖譜并進(jìn)行基因定位(圖3)。25個(gè)CmGATA家族基因不均勻地分布在甜瓜10條染色體上,其中4號和5號染色體上分布的基因數(shù)量最多,各分布4個(gè)基因;3號和11號染色體上分布的基因數(shù)量最少,均只有1個(gè)基因。1號和10號染色體上未檢測到CmGATA基因。除CmGATA12基因位于染色體中部外,其余CmGATA基因均分布在染色體的兩端。部分基因在某些染色體上呈聚類分布的現(xiàn)象,如CmGATA7、CmGATA8和CmGATA9在4號染色體上緊密地排列,CmGATA19和CmGATA20在8號染色體上緊密地排列,CmGATA21和CmGATA22緊密排列在9號染色體上。

        2.5 甜瓜GATA基因家族的啟動子順式作用元件分析

        為了探究甜瓜GATA家族基因的調(diào)控機(jī)制,本研究對CmGATA家族成員上游2 000 bp啟動子序列進(jìn)行順式作用元件分析。由圖4可見,CmGATA家族基因啟動子中存在大量植物激素響應(yīng)元件,包括水楊酸、茉莉酸甲酯、生長素、赤霉素和脫落酸,表明甜瓜CmGATA基因參與了甜瓜的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)過程。此外,在CmGATA家族基因啟動子中還鑒定到大量光響應(yīng)元件以及多種逆境脅迫響應(yīng)元件 (低溫響應(yīng)元件、厭氧誘導(dǎo)響應(yīng)元件、防衛(wèi)和脅迫響應(yīng)元件等),這說明CmGATA基因可能在甜瓜響應(yīng)逆境脅迫過程中發(fā)揮重要作用。

        2.6 甜瓜GATA基因家族的組織表達(dá)模式分析

        為闡明GATA基因在甜瓜器官發(fā)育中的潛在作用,本研究利用甜瓜基因組數(shù)據(jù)對其在5個(gè)組織器官(根、葉、雄花、雌花、果實(shí))中的組織表達(dá)模式進(jìn)行分析。分析結(jié)果(圖5)表明,CmGATA家族基因在甜瓜不同組織中存在差異表達(dá)。其中,CmGATA1、CmGATA3、CmGATA6和CmGATA8在各組織中均高量表達(dá)(FPKMgt;10),其中,CmGATA1在雄花中表達(dá)量最高,CmGATA3和CmGATA6在雌花中的表達(dá)量最高,CmGATA8在雄花和雌花中的表達(dá)量最高;CmGATA9、CmGATA15、CmGATA16、CmGATA23和CmGATA24在除果實(shí)以外的其他各組織中均高量表達(dá),其中,CmGATA9和CmGATA24在根中的表達(dá)量最高,CmGATA15和CmGATA16在葉中的表達(dá)量最高,CmGATA23在雌花中的表達(dá)量最高;CmGATA5和CmGATA18主要在葉片中表達(dá),而在其他組織中的表達(dá)量較低;CmGATA10在雌花和根中優(yōu)勢表達(dá);CmGATA13在葉中的表達(dá)量最高;CmGATA17在除葉以外的其他各組織中均高量表達(dá),尤其在果實(shí)和根中的表達(dá)量最高;CmGATA20和CmGATA25在雄花和雌花中高量表達(dá)。其余大部分基因在不同組織中的表達(dá)量較低,且在各組織間無顯著差異。

        2.7 甜瓜GATA基因在白粉病菌脅迫下的表達(dá)分析

        利用熒光定量PCR(qRT-PCR)技術(shù),分析了受白粉病菌侵染0、1、2、3 d后甜瓜GATA家族部分基因的表達(dá)特性。 結(jié)果(圖6)表明, 受白粉病菌侵染

        后,CmGATA2、CmGATA5、CmGATA10的表達(dá)水平呈顯著上調(diào)趨勢,CmGATA6和CmGATA18的表達(dá)水平呈下調(diào)趨勢,CmGATA24的表達(dá)水平呈先下調(diào)后上升的趨勢。據(jù)此可知,甜瓜GATA家族基因可能參與響應(yīng)白粉病菌侵染的過程,并且各基因具有不同的響應(yīng)模式。

        3 結(jié)論與討論

        目前甜瓜中已有多個(gè)基因家族被鑒定和研究,如MAPK[28]、 bHLH[29]、 MLO[30]、SnRK2[31]、PP2C[32]、

        HDM[33]、VQ[34]、HD-Zip[35]等,但至今未見關(guān)于甜瓜GATA轉(zhuǎn)錄因子基因家族的相關(guān)報(bào)道。GATA轉(zhuǎn)錄因子參與調(diào)控植物中的許多重要生理和生化過程,在植物光響應(yīng)調(diào)控[36]、葉綠素生物合成、激素響應(yīng)[37]以及碳、氮代謝[38]等生物學(xué)過程中發(fā)揮重要作用[39]。迄今GATA轉(zhuǎn)錄因子基因家族已在包括擬南芥在內(nèi)的多種物種中被鑒定,然而在甜瓜中還未見報(bào)道。本研究利用生物信息學(xué)對甜瓜CmGATA基因家族成員進(jìn)行了全基因組水平上的鑒定和分析,獲得了25個(gè)CmGATA基因,這與桑樹(23個(gè))[40]、黃瓜(26個(gè))[21]、二穗短柄草(28個(gè))[41]和谷子(28個(gè))[42]中鑒定到的結(jié)果十分接近。CmGATA基因分布在甜瓜10條染色體上,其中,4號和5號染色體上的基因數(shù)量最多,1號和10號染色體上未鑒定到CmGATA基因。

        對基因進(jìn)行蛋白亞細(xì)胞定位預(yù)測可有助于深解該基因的功能。甜瓜GATA家族基因蛋白的亞細(xì)胞定位預(yù)測結(jié)果顯示,80%的CmGATA蛋白定位在細(xì)胞核中,少部分定位在葉綠體、線粒體和細(xì)胞質(zhì),說明多數(shù)CmGATA可能在細(xì)胞核中行使其生物學(xué)功能。這與GATA在高粱[43]和楊梅[44]中的亞細(xì)胞定位預(yù)測結(jié)果相似??赏ㄟ^構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,將甜瓜 GATA家族成員分為3個(gè)亞家族,這與其在漢麻[45]和高粱[43]中的分類結(jié)果一致。

        順式作用元件能夠與轉(zhuǎn)錄因子相互作用,從而調(diào)控基因的表達(dá),在植物生長發(fā)育、響應(yīng)激素和逆境脅迫等方面均發(fā)揮著重要作用[46]。研究發(fā)現(xiàn),GATA轉(zhuǎn)錄因子GNC和CGA1可通過響應(yīng)光、赤霉素和細(xì)胞分裂素信號來調(diào)節(jié)擬南芥的生長發(fā)育[47];用水楊酸和茉莉酸甲酯處理二穗短柄草后,一些GATA基因的表達(dá)水平發(fā)生顯著變化[41]。對葡萄進(jìn)行激素處理后發(fā)現(xiàn),水楊酸處理能夠顯著誘導(dǎo)VvGATA20、VvGATA26和VvGATA5的表達(dá),茉莉酸甲酯處理能夠顯著誘導(dǎo)VvGATA3、VvGATA4和VvGATA7的表達(dá),說明這些基因可能在水楊酸和茉莉酸信號轉(zhuǎn)導(dǎo)中發(fā)揮著重要作用[20],在辣椒GATA家族基因啟動子序列中也鑒定出包括茉莉酸甲酯、脫落酸、水楊酸、赤霉素和生長素在內(nèi)的大量激素響應(yīng)元件,干旱、低溫、厭氧誘導(dǎo)相關(guān)的應(yīng)激響應(yīng)元件,分生組織表達(dá)響應(yīng)元件,以及防衛(wèi)和脅迫響應(yīng)元件等,進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),一些CaGATA基因在多種非生物脅迫下受到顯著調(diào)控,而CaGATA21和CaGATA27對植物激素處理具有高度響應(yīng)[48]。本研究在甜瓜CmGATA家族基因啟動子區(qū)也鑒定到多個(gè)生長素、赤霉素、脫落酸、茉莉酸和水楊酸等激素響應(yīng)元件,表明CmGATA基因家族同樣可能參與這些激素的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)過程,低溫、防衛(wèi)和脅迫響應(yīng)元件等多個(gè)逆境相關(guān)作用元件的存在也暗示CmGATA基因家族可能參與甜瓜逆境響應(yīng)過程。

        基因的組織表達(dá)模式通常與其功能密切相關(guān)。組織特異性表達(dá)分析表明,玉米GATA家族中有4個(gè)GATA基因幾乎在所有玉米組織中高表達(dá),11個(gè)GATA基因幾乎在所有組織中均不表達(dá),其他GATA基因呈現(xiàn)出組織特異性表達(dá)模式[49]。黃瓜中17個(gè)GATA基因顯示組成型表達(dá),其他一些GATA基因則呈組織特異性表達(dá)模式[21]。辣椒中大多數(shù)GATA基因在花芽、花和葉片中優(yōu)先表達(dá)[48]。本研究通過甜瓜轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析了GATA家族基因在根、葉、雄花、雌花和果實(shí)5個(gè)組織部位中的表達(dá)水平。結(jié)果顯示,甜瓜CmGATA基因存在多種組織表達(dá)模式。如CmGATA3和CmGATA6在各組織中均高量表達(dá),預(yù)示其功能具有多樣性;CmGATA5和CmGATA18只在葉中高表達(dá),暗示這2個(gè)基因可能在甜瓜葉片發(fā)育過程中發(fā)揮重要作用。甜瓜CmGATA家族基因的組織表達(dá)模式分析結(jié)果可為進(jìn)一步研究該家族基因的生物功能提供參考依據(jù)。

        盡管植物GATA轉(zhuǎn)錄因子在生長和發(fā)育方面的功能已被廣泛研究,但其在植物免疫中的作用目前仍知之甚少。研究發(fā)現(xiàn),玉米感染黑粉病和病毒病以及遭受蟲害后,ZmGATA37基因顯著上調(diào)表達(dá)[49],小麥TaGATA1基因在對紋枯病菌的抗性應(yīng)答過程中表達(dá)水平顯著上調(diào)[50],葡萄VdGATA2可作為轉(zhuǎn)錄激活劑并通過活性氧途徑增強(qiáng)其對白粉病的抗性[50],而小麥DvGATA轉(zhuǎn)錄因子基因在Pm21介導(dǎo)的白粉病抗性中發(fā)揮重要作用[51]。另有研究表明,GATA家族基因可能參與了黃瓜對白粉病菌、霜霉病菌和根結(jié)線蟲[21]以及葡萄對霜霉病菌的響應(yīng)[20];二穗短柄草中大部分BdGATA基因參與調(diào)控對稻瘟病菌的響應(yīng)[41]。本研究中受白粉病菌侵染后,CmGATA2、CmGATA5和 CmGATA10表達(dá)水平顯著上調(diào),說明這3個(gè)基因可能在應(yīng)答白粉病菌脅迫過程中發(fā)揮重要作用,而其抗病調(diào)控機(jī)制仍需進(jìn)一步研究。

        綜上所述,該研究利用生物信息學(xué)方法分析了甜瓜GATA家族成員的理化性質(zhì)、系統(tǒng)進(jìn)化、基因結(jié)構(gòu)、染色體定位、組織表達(dá)模式以及對白粉病菌脅迫的響應(yīng)等,這為進(jìn)一步研究該家族基因的生物功能提供了數(shù)據(jù)支撐,同時(shí)為甜瓜抗病分子育種提供了潛在基因資源。未來研究將繼續(xù)深入挖掘甜瓜GATA家族成員的生物學(xué)功能,探索家族成員之間的相互作用以及與激素等其他信號通路的關(guān)系以及其在甜瓜抗病性中的作用機(jī)制,為培育抗病性強(qiáng)、產(chǎn)量高的甜瓜新品種提供理論依據(jù)。

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