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        基于R語言及6種分析方法的花生農(nóng)藝性狀綜合評(píng)價(jià)

        2025-03-27 00:00:00于沐楊海棠胡延嶺
        江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2025年3期
        關(guān)鍵詞:灰色關(guān)聯(lián)度農(nóng)藝性狀主成分分析

        摘要:利用遺傳變異、相關(guān)性、關(guān)聯(lián)度分析、通徑分析、主成分分析、TOPSIS等方法,對(duì)2017年國家北方片區(qū)花生新品種多點(diǎn)試驗(yàn)參試花生品種(系)的14個(gè)農(nóng)藝性狀進(jìn)行綜合評(píng)價(jià),以期為花生精準(zhǔn)高產(chǎn)育種和良種推廣提供理論依據(jù)。結(jié)果表明,14個(gè)農(nóng)藝性狀具有豐富的變異性,油酸、亞油酸含量在不同品種間差異較大,變異系數(shù)分別為20.40%、33.09%;出仁率、結(jié)果枝數(shù)、百仁重、側(cè)枝長、生育期、百果重、主莖高、莢果產(chǎn)量、脂肪含量、蛋白質(zhì)含量具有較小的變異性,均低于10%;相關(guān)性分析表明,莢果產(chǎn)量與脂肪含量、亞油酸含量、出仁率、百果重、結(jié)果枝數(shù)、百仁重、總分枝數(shù)、主莖高呈正相關(guān);關(guān)聯(lián)度分析表明,出仁率、生育期、脂肪含量、百果重等是影響產(chǎn)量的關(guān)鍵因素;通徑分析表明,主莖高對(duì)產(chǎn)量的直接影響最大;決策系數(shù)顯示,百果重、亞油酸含量是影響產(chǎn)量的主要性狀;主成分分析表明,14個(gè)農(nóng)藝性狀可歸納為株型、品質(zhì)等4個(gè)主成分因子,能代表83.692%的花生性狀原始信息量,主成分綜合得分和TOPSIS排名一致,顯示商花33號(hào)、鄭農(nóng)花22號(hào)這2個(gè)品種的綜合性狀較好。綜合結(jié)果表明,在以高產(chǎn)為花生選育目標(biāo)時(shí),應(yīng)重點(diǎn)提高百果重、出仁率,適當(dāng)控制總分枝數(shù)、結(jié)果枝數(shù)、單株結(jié)果數(shù)、側(cè)枝長、株高。

        關(guān)鍵詞:花生;農(nóng)藝性狀;灰色關(guān)聯(lián)度;主成分分析;TOPSIS分析

        中圖分類號(hào):S565.203" 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A

        文章編號(hào):1002-1302(2025)03-0054-07

        收稿日期:2024-01-16

        基金項(xiàng)目:河南優(yōu)勢特色農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)科技支撐行動(dòng)計(jì)劃(編號(hào):20230202002);鄭州市科技惠民計(jì)劃(編號(hào):2023KJHM0036)。

        作者簡介:于" 沐(1987—),女,河南正陽人,碩士,助理研究員,主要從事花生遺傳育種研究。E-mail:ym8926123@163.com。

        于" 沐,楊海棠,胡延嶺. 基于R語言及6種分析方法的花生農(nóng)藝性狀綜合評(píng)價(jià)[J]. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué),2025,53(3):54-60.

        doi:10.15889/j.issn.1002-1302.2025.03.008

        花生(Arachis hypogaea L.)作為油、食兼用的高脂肪高蛋白特色油料作物,在我國具有悠久的種植歷史[1]。近年來,在中央1號(hào)文件支持下,油料作物種植面積逐年增加。2022年全國花生種植面積為480萬hm2,產(chǎn)量超過1 800萬t,分別占全球的14.30%和36.30%;我國花生消費(fèi)量占世界的38.00%,為最大消費(fèi)國,進(jìn)口量為110萬t,占比32.90%,也是世界花生第一大進(jìn)口國[2],我國花生市場的供應(yīng)依然存在很大缺口。選育優(yōu)質(zhì)高產(chǎn)花生品種,對(duì)于發(fā)展特色油料作物、促進(jìn)花生產(chǎn)業(yè)發(fā)展、實(shí)現(xiàn)鄉(xiāng)村振興和農(nóng)業(yè)供給側(cè)結(jié)構(gòu)改革具有重要意義。

        農(nóng)藝性狀及其之間的相互作用對(duì)作物產(chǎn)量構(gòu)成因素的影響已被廣泛關(guān)注[3-6]。殷君華等利用變異性、主成分、通徑分析方法分析種植于同一地區(qū)的26個(gè)大果花生的9個(gè)主要農(nóng)藝性狀[7]。徐志軍等利用主成分分析法分析33份引進(jìn)花生資源在粵西地區(qū)的13個(gè)農(nóng)藝性狀[8]。范小玉等用遺傳變異、相關(guān)性、主成分分析法分析24個(gè)黃淮海中南片小?;ㄉ钠焚|(zhì)和農(nóng)藝共15個(gè)性狀[9]。但是,將R語言同遺傳變異、灰色關(guān)聯(lián)度、相關(guān)性、TOPSIS、主成分分析、通徑分析等統(tǒng)計(jì)方法相結(jié)合,分析產(chǎn)量和農(nóng)藝性狀之間關(guān)系的研究目前尚未見報(bào)道。為準(zhǔn)確、全面地剖析產(chǎn)量與各農(nóng)藝性狀間的主次關(guān)系與內(nèi)在聯(lián)系,利用6種分析方法以及R語言對(duì)12個(gè)參試花生品種(系)的14個(gè)農(nóng)藝性狀進(jìn)行分析,旨在明確花生高產(chǎn)育種的主攻方向,并為良種推廣提供理論依據(jù)。

        1" 材料與方法

        1.1" 試驗(yàn)材料與設(shè)計(jì)

        參試品種(系)隨機(jī)區(qū)組排列,小區(qū)面積為 13.34 m2,重復(fù)3次,種植密度為15萬穴/hm2。試驗(yàn)材料和數(shù)據(jù)均來自2017年國家北方片區(qū)花生多點(diǎn)試驗(yàn)。參試品種(系)共12個(gè),分別為花育33號(hào)(CK)、花育9122、花育9301、花育9510、冀農(nóng)10-26-12-3、農(nóng)大花201、商花33號(hào)、宇花18、云花1號(hào)、鄭農(nóng)花22號(hào)、中花224、周科花16。

        1.2" 農(nóng)藝性狀測定

        性狀指標(biāo)參照姜慧芳等的方法[10]測定,包含生育期(V1)、主莖高(V2)、側(cè)枝長(V3)、總分枝數(shù)(V4)、結(jié)果枝數(shù)(V5)、單株結(jié)果數(shù)(V6)、百果重(V7)、百仁重(V8)、出仁率(V9)、莢果產(chǎn)量(V10)、脂肪含量(V11)、蛋白質(zhì)含量(V12)、油酸含量(V13)、亞油酸含量(V14)。

        1.3" 數(shù)據(jù)分析

        使用Microsoft Excel整理數(shù)據(jù),通過DPS 18.1軟件作灰色關(guān)聯(lián)度、TOPSIS綜合評(píng)價(jià)[11],使用SPSS軟件作相關(guān)分析、通徑分析、主成分分析,使用 R4.2.1 繪制可視化圖。

        2" 結(jié)果與分析

        2.1" 主要農(nóng)藝性狀的遺傳變異性

        變異系數(shù)多用來衡量性狀指標(biāo)的離散程度,變異系數(shù)值越小表示穩(wěn)定性越好[12]。參試品種農(nóng)藝性狀的變異系數(shù)范圍為0.40%~33.09%(表1)。變異系數(shù)依次為亞油酸含量gt;油酸含量gt;單株結(jié)果數(shù)gt;總分枝數(shù)gt;結(jié)果枝數(shù)gt;主莖高gt;百仁重gt;側(cè)枝長gt;莢果產(chǎn)量gt;百果重gt;出仁率gt;蛋白質(zhì)含量gt;脂肪含量gt;生育期;其中,變異系數(shù)最大的是亞油酸含量(33.09%),表明品種間亞油酸含量變異豐富;生育期的變異系數(shù)(0.40%)最小,表明在品種間差異較小。綜上表明,花生農(nóng)藝性狀遺傳變異豐富,亞油酸含量改良潛力最大;出仁率、蛋白質(zhì)含量、脂肪含量、生育期在品種間差異不大,改良較難。

        2.2" 農(nóng)藝性狀與產(chǎn)量間相關(guān)性分析

        由表2可知,莢果產(chǎn)量與主莖高、出仁率、脂肪含量、亞油酸含量、百仁重、總分枝數(shù)、百果重、結(jié)果枝數(shù)呈正相關(guān),與蛋白質(zhì)含量、油酸含量、單株結(jié)果數(shù)、側(cè)枝長、生育期呈負(fù)相關(guān)。農(nóng)藝性狀間也存在相關(guān)性,側(cè)枝長與主莖高呈極顯著正相關(guān)(Plt;0.01);總分枝數(shù)與單株結(jié)果數(shù)、結(jié)果枝數(shù)三者之間均呈極顯著正相關(guān)(Plt;0.01);百果重與百仁重呈極顯著正相關(guān)(Plt;0.01);百仁重與出仁率呈顯著正相關(guān)(Plt;0.05);生育期與出仁率呈顯著負(fù)相關(guān)(Plt;0.05);油酸含量與主莖高、百仁重、出仁率呈顯著負(fù)相關(guān)(Plt;0.05),與單株結(jié)果數(shù)顯著正相關(guān)(Plt;0.05)。

        圖1中,橫縱坐標(biāo)上的數(shù)值均為各性狀的數(shù)值范圍,線條為表型性狀的趨勢線,圓圈代表性狀表型值,若線條與圓圈分布不一致則相關(guān)系數(shù)小,反之則相關(guān)性大;數(shù)字字號(hào)的大小代表相關(guān)系數(shù),字號(hào)越小則相關(guān)性越?。?3]。主莖高與側(cè)枝長呈極顯著正相關(guān),兩者之間相關(guān)系數(shù)最大(r=0.93);油酸與亞油酸含量的相關(guān)系數(shù)最?。╮=-1.00),兩者間呈極顯著負(fù)相關(guān)(Plt;0.01)。

        2.3" 農(nóng)藝性狀與產(chǎn)量間灰色關(guān)聯(lián)度分析

        由表3可知,農(nóng)藝性狀對(duì)產(chǎn)量的重要程度依次為出仁率gt;生育期gt;脂肪含量gt;百果重gt;蛋白質(zhì)含量gt;百仁重gt;結(jié)果枝數(shù)gt;側(cè)枝長gt;主莖高gt;單株結(jié)果數(shù)gt;總分枝數(shù)gt;油酸含量gt;亞油酸含量,表明產(chǎn)量與亞油酸含量、油酸含量、總分枝數(shù)的關(guān)聯(lián)度較小,屬次要影響因素;與出仁率、生育期、脂肪含量、百果重的關(guān)聯(lián)度較大,屬主要影響因素。

        2.4" 農(nóng)藝性狀與產(chǎn)量間通徑分析

        通徑分析分為直接效應(yīng)(直接通徑系數(shù))和間接效應(yīng)(間接通徑系數(shù)),可以展示各農(nóng)藝性狀對(duì)產(chǎn)量的重要程度[14]。由表4可知,農(nóng)藝性狀對(duì)產(chǎn)量的直接通徑系數(shù)排序依次為主莖高V2gt;側(cè)枝長V3gt;總分枝數(shù)V4gt;結(jié)果枝數(shù)V5gt;脂肪含量V11gt;單株結(jié)果數(shù)V6gt;蛋白質(zhì)含量V12gt;出仁率V9gt;生育期V1gt;百果重V7gt;亞油酸含量V14。

        對(duì)產(chǎn)量直接效應(yīng)最大的為主莖高(11.208),它通過百果重、出仁率、側(cè)枝長、生育期、脂肪含量、亞油酸含量、蛋白質(zhì)含量對(duì)產(chǎn)量起負(fù)向的間接效應(yīng),最終的總間接效應(yīng)小于直接效應(yīng)。亞油酸含量對(duì)產(chǎn)量影響的負(fù)向直接效應(yīng)削減了其通過主莖高、側(cè)枝長、百果重、出仁率對(duì)產(chǎn)量影響的正向間接效應(yīng)。

        決策系數(shù)能夠展示農(nóng)藝性狀對(duì)產(chǎn)量的綜合效應(yīng)[15]。百果重、亞油酸含量的決策系數(shù)為正值,表明對(duì)產(chǎn)量起正向作用,是主要決策變量;生育期、側(cè)枝長、主莖高、出仁率、脂肪含量、蛋白質(zhì)含量、總分枝數(shù)、單株結(jié)果數(shù)、結(jié)果枝數(shù)的決策系數(shù)為負(fù)值,對(duì)產(chǎn)量起負(fù)向作用,應(yīng)適當(dāng)控制。綜上,在生產(chǎn)上以高產(chǎn)為選育目標(biāo)時(shí),應(yīng)提高百果重,并選擇適中的結(jié)果枝數(shù)、單株結(jié)果數(shù)、總分枝數(shù)、側(cè)枝長、主莖高。

        2.5" 花生品種間農(nóng)藝性狀的主成分分析

        主成分分析采取降維的方法,將多個(gè)性狀變量轉(zhuǎn)化成相互獨(dú)立的因子,盡可能地反映原始變量信

        息[16]。由表5可知,14個(gè)花生品種性狀提取出前4個(gè)主成分,能代表14個(gè)農(nóng)藝性狀83.692%的原始信息值。主成分1特征值為5.227,貢獻(xiàn)率為37.334%,其中亞油酸和油酸含量占比較大,與花生油亞比有關(guān),油酸含量越高,油亞比值越高。主成分2特征值為2.842,貢獻(xiàn)率為20.300%,其中主莖高、生育期、總分枝數(shù)占比較大,與花生長勢有關(guān),可稱株型因子,主莖高降低有利于提高單株結(jié)果數(shù)、結(jié)果枝數(shù)和總分枝數(shù)。主成分3特征值為2.070,貢獻(xiàn)率為14.785%,其中特征值最大的是結(jié)果枝數(shù),其次是側(cè)枝長。決定第4主成分的主要是脂肪含量,貢獻(xiàn)率達(dá)11.273%。

        主成分綜合得分(表6)反映農(nóng)藝性狀的綜合表現(xiàn)?;ㄓ?510、商花33號(hào)、周科花16、鄭農(nóng)花22號(hào)的主成分綜合得分居前4名,表明這4個(gè)品種農(nóng)藝性狀綜合表現(xiàn)最好。

        2.6" 農(nóng)藝性狀的TOPSIS分析

        TOPSIS決策分析方法常用來衡量多個(gè)性狀指標(biāo)與最佳指標(biāo)的接近程度[17]。表7表明,權(quán)重較大的為莢果產(chǎn)量、生育期,其次是單株結(jié)果數(shù)、百果重、百仁重、出仁率;權(quán)重最低的為結(jié)果枝數(shù)。與最佳向量(D+i)距離較近的有商花33號(hào)、 花育9510、 花育9301;與最差向量(D-i)距離較近的有商花33號(hào)、 花育9510; 與綜合向量(Ci)距離較大的有商花

        33號(hào)、鄭農(nóng)花22號(hào)、花育9122、冀農(nóng)10-26-12-3,表明這4個(gè)品種的綜合性狀最佳。

        3" 討論

        3.1" 農(nóng)藝性狀的遺傳變異性

        殷君華等用變異系數(shù)衡量大果花生9個(gè)農(nóng)藝性狀的遺傳穩(wěn)定性,發(fā)現(xiàn)總分枝數(shù)的遺傳變異最豐富,出米率代表品種的固有特性,遺傳最穩(wěn)定[7]。范小玉等研究發(fā)現(xiàn),亞油酸含量的變異系數(shù)最大,對(duì)環(huán)境最敏感,出米率的遺傳最穩(wěn)定[9]。郭敏杰等研究發(fā)現(xiàn),單株飽果數(shù)的變異性最大,生育期、出米率的變異系數(shù)較小,在品種間穩(wěn)定性最好[18]。本研究表明,亞油酸含量的變異系數(shù)最大,易受環(huán)境變化的影響,有較大改良空間,與范小玉等的觀點(diǎn)[9]一致;生育期的變異系數(shù)最小,花生熟期改良較難,與郭敏杰等的觀點(diǎn)[18]一致。

        花生的各主要農(nóng)藝性狀與產(chǎn)量密切相關(guān)。王允等發(fā)現(xiàn),單株莢果產(chǎn)量與出米率、單株結(jié)果數(shù)、結(jié)果枝數(shù)正相關(guān)[19]。本研究結(jié)果表明,莢果產(chǎn)量與出仁率、亞油酸含量、脂肪含量、總分枝數(shù)、主莖高、百仁重、結(jié)果枝數(shù)、百果重呈正相關(guān),與油酸含量、單株結(jié)果數(shù)、側(cè)枝長、生育期、蛋白質(zhì)含量呈負(fù)相關(guān)。王慧敏等研究發(fā)現(xiàn),花生單株產(chǎn)量與單株分枝數(shù)呈顯著正相關(guān),與百仁重、百果重呈極顯著正相關(guān)[20]。本研究結(jié)果與上述研究結(jié)果略有差異,可能是由環(huán)境和品種的差異造成的。

        3.2" 農(nóng)藝性狀的綜合評(píng)價(jià)

        灰色關(guān)聯(lián)度評(píng)價(jià)在玉米、燕麥、谷子等作物中已被廣泛運(yùn)用于新品種評(píng)價(jià)[21-23]。本研究中,花生莢果產(chǎn)量與出仁率、生育期、脂肪含量、百果重的關(guān)聯(lián)度較大,是主要影響因素;相關(guān)性分析的結(jié)果得到間接驗(yàn)證。關(guān)聯(lián)度和相關(guān)性分析無法闡釋各農(nóng)藝性狀對(duì)產(chǎn)量影響的作用方向,只能展示相對(duì)重要程度;通徑分析卻能說明各農(nóng)藝性狀如何發(fā)揮直接或間接影響[14]。通徑分析表明,亞油酸含量和百果重的決策系數(shù)是正值,對(duì)產(chǎn)量起正向效應(yīng),為主要決策變量?;疑P(guān)聯(lián)度、通徑分析中決策系數(shù)一致表明,百果重對(duì)產(chǎn)量的直接效應(yīng)和綜合作用最大,是影響產(chǎn)量的關(guān)鍵性狀,這與已有研究結(jié)果[24]趨同。

        本研究用主成分法提取出油亞比、株型等4個(gè)主成分因子,代表83.692%的14個(gè)性狀指標(biāo)原始信息量。從油亞比上看,第1主成分值越大,則百仁重、出仁率、百果重、亞油酸含量越大,油酸含量、單株結(jié)果數(shù)、結(jié)果枝數(shù)、總分枝數(shù)、結(jié)果枝數(shù)越低。因此該主成分值應(yīng)適中,才可平衡產(chǎn)量和油亞比值。從株型上看,主成分2的值越大,則總分枝數(shù)、結(jié)果枝數(shù)越大,側(cè)枝長、主莖高越短。綜合主成分1和主成分2,可知百果重與主莖高存在較大負(fù)相關(guān)性,相關(guān)性分析結(jié)果進(jìn)一步得到驗(yàn)證。主成分3值越大,則結(jié)果枝數(shù)越多,蛋白質(zhì)含量越低。主成分4值越大,則側(cè)枝長越長,脂肪含量越低。蛋白質(zhì)含量和脂肪含量越高,花生品質(zhì)越好,因此主成分3和主成分4值越低越好。

        TOPSIS評(píng)價(jià)綜合性狀,表現(xiàn)較好的有商花33號(hào)、鄭農(nóng)花22號(hào)、花育9122、冀農(nóng)10-26-12-3;在主成分綜合得分中,花育9510、商花33號(hào)、周科花16、鄭農(nóng)花22號(hào)排名在前4位。性狀之間既相互促進(jìn),又互相制約;在選育綜合性狀優(yōu)良的花生新品種時(shí),應(yīng)協(xié)調(diào)好主成分之間的關(guān)系,結(jié)合多種分析方法綜合考慮。主成分分析和TOPSIS結(jié)論一致得出,商花33號(hào)、鄭農(nóng)花22號(hào)綜合性狀優(yōu)良。本研究中變異性分析、相關(guān)分析、TOPSIS評(píng)價(jià)、主成分分析、通徑分析、關(guān)聯(lián)度分析6種多元評(píng)價(jià)方法互相印證,由此得出的結(jié)論更可靠、全面。

        4" 結(jié)論

        本研究運(yùn)用多元方法綜合評(píng)價(jià)12個(gè)花生品種的14個(gè)農(nóng)藝性狀,結(jié)果表明,產(chǎn)量與主莖高、脂肪含量、亞油酸含量、結(jié)果枝數(shù)、總分枝數(shù)、百果重、出仁率、百仁重呈正相關(guān),與蛋白質(zhì)含量、油酸含量、單株結(jié)果數(shù)、側(cè)枝長、生育期呈負(fù)相關(guān)。出仁率、生育期、脂肪含量、百果重是影響產(chǎn)量的主要因素。14個(gè)農(nóng)藝性狀隸屬4個(gè)主成分,解釋了83.692%的農(nóng)藝性狀原始信息量。主成分綜合得分排名與TOPSIS綜合評(píng)價(jià)一致,得出商花33號(hào)、鄭農(nóng)花22號(hào)這2個(gè)品種綜合性狀優(yōu)良,可作為重點(diǎn)資源材料利用并加大推廣力度。綜上,以高產(chǎn)作為選育目標(biāo)時(shí),應(yīng)重點(diǎn)提高百果重、出仁率,適當(dāng)控制側(cè)枝長、主莖高,并選擇適宜的單株結(jié)果數(shù)、結(jié)果枝數(shù)、總分枝數(shù)。

        參考文獻(xiàn):

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