摘 要:【目的】為創(chuàng)制胚敗育特異種質(zhì)和優(yōu)質(zhì)胚敗育杧果生產(chǎn)提供參考?!痉椒ā恳曰ê蟮?4、16、18、20周4 個(gè)發(fā)育時(shí)期的‘貴妃’杧果的胚正常果和胚敗育果作為研究對(duì)象,基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù),探討胚正常和胚敗育杧果中乙烯、生長(zhǎng)素、赤霉素、脫落酸、油菜素甾醇和茉莉酸6 種植物激素生物合成途徑中差異表達(dá)基因的表達(dá)趨勢(shì),研究其在胚正常和胚敗育杧果中的作用和差異。選取15 個(gè)具有指示和標(biāo)記作用的關(guān)鍵差異表達(dá)基因進(jìn)行熒光實(shí)時(shí)定量PCR,對(duì)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序和分析結(jié)果的可靠性進(jìn)行驗(yàn)證。【結(jié)果】‘貴妃’杧果胚正常和胚敗育果實(shí)中參與植物激素生物合成途徑的關(guān)鍵基因表達(dá)情況在不同發(fā)育階段存在明顯差異,且呈現(xiàn)一定規(guī)律。胚敗育果中調(diào)控乙烯合成的關(guān)鍵基因在花后第14、16 周的表達(dá)量高于胚正常果,而調(diào)控生長(zhǎng)素合成的關(guān)鍵基因表達(dá)量低于胚正常果;調(diào)控茉莉酸合成的關(guān)鍵基因大多在胚敗育果中表達(dá)量更高。熒光實(shí)時(shí)定量PCR 的結(jié)果與轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果基本一致,表明結(jié)果真實(shí)可靠?!窘Y(jié)論】乙烯、生長(zhǎng)素和脫落酸共同調(diào)控了‘貴妃’杧果胚敗育果的早熟,赤霉素調(diào)控了胚正常果果形更大,杧果在受到外界環(huán)境脅迫的時(shí)候,更容易產(chǎn)生胚敗育果。
關(guān)鍵詞:杧果;胚敗育;植物激素;轉(zhuǎn)錄組;發(fā)育時(shí)期
中圖分類號(hào):S667.7 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A 文章編號(hào):1003—8981(2023)04—0068—11
杧果Mangifera indica 主要分布于東南亞熱帶和亞熱帶地區(qū)[1],是一種高大常綠喬木果樹,其果實(shí)風(fēng)味獨(dú)特、營(yíng)養(yǎng)豐富,富含糖、纖維素和多種維生素[2]。因其栽培范圍廣、果實(shí)營(yíng)養(yǎng)價(jià)值高且外觀漂亮,深受人們喜愛[3]。其果實(shí)作為一種重要的熱帶和亞熱帶水果,被稱為“熱帶水果之王”[4],是繼葡萄、柑橙、香蕉、蘋果之后的世界第五大水果[5-6]。
胚敗育是指由于自身或其他外界因素,種子植物受精胚的發(fā)育過程中途停止,導(dǎo)致胚退化消失或僅留下部分硬化的種痕[7]。胚敗育存在于許多植物中,如葡萄、荔枝、龍眼、枇杷、櫻桃、棗、柿、黃皮、柑橘等[8]。因果實(shí)胚敗育后不能形成種子,對(duì)許多果樹來說,會(huì)形成“無核果實(shí)”這一良好的栽培性狀,但另一方面,胚敗育嚴(yán)重制約了雜交育種。因此,調(diào)控胚的發(fā)育具有重要意義[9]。
胚敗育現(xiàn)象在杧果生產(chǎn)中普遍存在[10],在部分品種中表現(xiàn)尤其突出?!F妃’杧果是海南和云南杧果種植區(qū)的主栽品種,在云南被稱為“金鳳凰”,其在正常的氣候和栽培條件下會(huì)產(chǎn)生一定比例的成熟胚敗育果實(shí),在特定的年份甚至整棵樹乃至整片果園出現(xiàn)胚敗育的現(xiàn)象。盡管‘貴妃’杧果敗育果實(shí)比正常果實(shí)小,但是由于其成熟期早,且具有色澤艷麗、果核極薄、含糖量高、風(fēng)味濃郁等獨(dú)特的品質(zhì)優(yōu)勢(shì),在云南省元江干熱河谷等杧果主產(chǎn)區(qū)的銷售價(jià)格明顯高于胚正常果實(shí)。果實(shí)品質(zhì)已成為當(dāng)前及未來經(jīng)濟(jì)林果樹產(chǎn)業(yè)健康發(fā)展和市場(chǎng)競(jìng)爭(zhēng)力的核心[11],所以敗育果具有較大的商業(yè)前景。
植物的生長(zhǎng)發(fā)育依賴于植物激素介導(dǎo)的基因表達(dá)調(diào)控,植物激素在胚發(fā)育過程中起著至關(guān)重要的作用。例如:生長(zhǎng)素(IAA)、細(xì)胞分裂素(CTK)、赤霉素(GA)和油菜素甾醇(BR)通常促進(jìn)植物的生長(zhǎng),并顯著影響植物的株高和器官大小,乙烯(ET)、脫落酸(ABA)、水楊酸(SA)和茉莉酸(JA)調(diào)控植物的脅迫響應(yīng)和延緩植物的生長(zhǎng)[12];IAA、GA 和BR 在胚發(fā)育過程中起正向調(diào)控作用,ABA 和JA 起負(fù)向調(diào)控作用[13-14]。
RNA 測(cè)序(RNA-Seq)是一種將讀長(zhǎng)較短的序列組裝成基因組規(guī)模轉(zhuǎn)錄譜的轉(zhuǎn)錄組分析技術(shù),為轉(zhuǎn)錄組組成和RNA 表達(dá)模式分析及基因鑒定提供了一種全面而有效的方法[15]。近幾年來,由于測(cè)序成本的持續(xù)降低,轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)在農(nóng)作物研究方面的應(yīng)用越來越廣泛[16]。胚敗育為‘貴妃’杧果生產(chǎn)中的重要現(xiàn)象,直接影響著果實(shí)的價(jià)值和果園收益,但針對(duì)‘貴妃’杧果胚敗育現(xiàn)象的轉(zhuǎn)錄組研究鮮見報(bào)道。
本研究中利用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù),以‘貴妃’杧果花后第14、16、18 和20 周的正常果和敗育果為材料,篩選ET、IAA、GA、ABA、BR、JA這6 種植物激素的生物合成途徑中的差異表達(dá)基因(differentially expressed genes,DEGs), 分析其在不同發(fā)育時(shí)期的正常果和敗育果中的表達(dá)差異,以期揭示杧果胚敗育果實(shí)中激素生物合成的分子機(jī)制,為胚敗育特異種質(zhì)創(chuàng)制和高品質(zhì)胚敗育果栽培提供參考。
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
以‘貴妃’杧果的正常果和敗育果為試驗(yàn)材料。樣品采自2016 年在大塑料桶中種植的試驗(yàn)樹,栽培管理?xiàng)l件相同。2021 年1 月,選擇生長(zhǎng)發(fā)育良好、樹勢(shì)一致、花期一致的30 株杧果樹,對(duì)每個(gè)花序進(jìn)行掛牌標(biāo)記,并于花后第14、16、18、20周4 個(gè)時(shí)期定期采樣。同一株樹上,既有正常果,又有敗育果。每次采樣時(shí),在每株樹上隨機(jī)采集正常果和敗育果各5 ~ 10 個(gè),迅速切取果肉進(jìn)行液氮預(yù)冷,每10 棵樹做1 個(gè)混樣,每個(gè)時(shí)期的正常果和敗育果均采集3 個(gè)混樣,即3 次生物學(xué)重復(fù)。將樣品貯存于-80 ℃超低溫冰箱中待用。
1.2 試驗(yàn)方法
1.2.1 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
分別從各時(shí)期正常果和敗育果的果肉中提取總RNA,參考趙鳳霞等[17] 的方法,構(gòu)建cDNA文庫,片段長(zhǎng)度為150 bp。經(jīng)文庫質(zhì)檢合格后,使用Illumina HiSeq 平臺(tái)進(jìn)行雙端測(cè)序。對(duì)下機(jī)后的原始測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行過濾、測(cè)序錯(cuò)誤率檢查、GC 含量分布檢查,獲得用于后續(xù)分析使用的clean reads。使用Trinity 軟件對(duì)clean reads 進(jìn)行拼接,將拼接得到的轉(zhuǎn)錄本序列作為參考序列,以Corset 層次聚類后得到的最長(zhǎng)Cluster 序列作為Unigene 進(jìn)行后續(xù)分析。采用RSEM 軟件中的bowtie2,將每個(gè)樣品的clean reads 與參考序列比對(duì),采用FPKM(fragments per kilobase of transcript per millionfragments mapped)值計(jì)算基因的表達(dá)水平。正常果和敗育果樣品間的差異表達(dá)基因篩選條件為差異倍數(shù)的絕對(duì)值不小于1,且錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率小于0.05。
1.2.2 KEGG 注釋
使用BLAST 2.7.1 軟件將差異表達(dá)基因序列與KEGG 數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對(duì)(e=1×10-5),獲得差異表達(dá)基因的KEGG 注釋信息。6 種植物激素生物合成路徑來自于KEGG 在線數(shù)據(jù)庫(http://www.genome.jp/kegg/),包括半胱氨酸和甲硫氨酸代謝通路(ET 生物合成路徑,通路ID 00270),色氨酸代謝通路(IAA 生物合成路徑,通路ID00380),二萜生物合成通路(GA 生物合成路徑,通路ID 00904),類胡蘿卜素生物合成通路(ABA生物合成路徑,通路ID 00906),油菜素甾醇生物合成通路(BR 生物合成路徑,通路ID 00905)和α- 亞麻酸代謝通路(JA 生物合成路徑,通路ID 00592)。使用RStudio 軟件繪制差異表達(dá)基因的熱圖。
1.2.3 反轉(zhuǎn)錄熒光實(shí)時(shí)定量PCR(qRT-PCR)驗(yàn)證
以所篩選激素合成路徑中的差異表達(dá)基因?yàn)闃颖?,進(jìn)一步篩選出15 個(gè)具有指示和標(biāo)記作用的關(guān)鍵差異表達(dá)基因,采用Actin 作為內(nèi)參基因,使用beacon Designer 軟件設(shè)計(jì)引物, 進(jìn)行qRTPCR表達(dá)量驗(yàn)證。使用與轉(zhuǎn)錄組測(cè)序相同處理的樣本提取高質(zhì)量RNA,采用20 μL 反應(yīng)體系,反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)條件為65 ℃ 5 min,37 ℃ 2 min,55 ℃15 min,85 ℃ 5 min。迅速將獲得的cDNA 置于冰上,用于后續(xù)試驗(yàn),或立即保存(-20 ℃)。qRT-PCR 所采用的設(shè)備為7500 型熒光定量PCR儀(ABI,美國(guó)),反應(yīng)體系10 μL,反應(yīng)條件:95 ℃ 2 min;95 ℃ 10 s,60 ℃ 30 s,40 個(gè)循環(huán)。然后繪制溶解曲線,采用 2-ΔΔCt 法計(jì)算基因的相對(duì)表達(dá)量。
2 結(jié)果與分析
2.1 敗育果和正常果的表型差異
同一株‘貴妃’杧果樹上,既有正常果也有敗育果,且敗育果的成熟期比正常果早1 ~ 2 周。在果實(shí)發(fā)育早期,同一發(fā)育時(shí)期的敗育果果皮著色比正常果更濃,色澤更艷麗,正常果的生長(zhǎng)速度和成熟果實(shí)大小均明顯大于敗育果(圖1);到花后第14 周,正常果與敗育果的果實(shí)大小已經(jīng)有明顯區(qū)別(圖1A)。
將不同發(fā)育時(shí)期的‘貴妃’杧果果實(shí)沿腹縫線方向剖開,可以發(fā)現(xiàn)正常果的種子較厚,種仁飽滿且發(fā)育正常,而敗育果的種子極薄,其種仁在果實(shí)發(fā)育早期即開始退化,花后第14 周的種仁已退化成為直徑小于1 mm 的白色點(diǎn)狀組織(圖1B),在成熟果中種仁退化后僅保留了直徑小于1 mm 的黑色點(diǎn)狀組織(圖1H)。
2.2 敗育果和正常果激素合成路徑中的差異基因
用于qRT-PCR 的15 個(gè)基因分別是:乙烯信號(hào)途徑的metK 基因、ACS1_2_6 基因和ACO 基因;生長(zhǎng)素信號(hào)途徑的ALDH 基因和E3.5.1.4 基因;赤霉素信號(hào)途徑的GA3 基因和KAO 基因;脫落酸信號(hào)途徑的ZEP 基因、NCED 基因和CYP707A基因;油菜素甾醇信號(hào)途徑的CYP85A1 基因和CYP92A6 基因;茉莉酸信號(hào)途徑的ACX 基因、MFP2 基因和ACAA1 基因。15 個(gè)基因的qRT-PCR產(chǎn)物為100 ~ 192 bp。
2.2.1 ET 生物合成路徑
ET 是一種被人們熟知且被廣泛應(yīng)用于農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的小分子氣體植物激素。ET 是以甲硫氨酸為合成前體, 在metK、ACC 合成酶(ACS)、ACC氧化酶(ACO)的催化作用下,逐步合成ET。由于植物中甲硫氨酸的含量有限,甲硫基被循環(huán)利用來補(bǔ)充甲硫氨酸和維持ET 的生物合成[18]。從RNA-seq 數(shù)據(jù)中獲得了12 個(gè)參與ET 生物合成路徑的差異基因,分別屬于metK、ACS1_2_6、ACO、speD、DEP1、TAT 和ISS1 基因家族(圖2)。在花后第14、16 周時(shí),ACO 基因作為ET 合成的限速酶,在敗育果中的表達(dá)量更高,而在花后第18 周時(shí),在正常果中的含量更高。
2.2.2 IAA 生物合成路徑
植物通過3 種途徑將色氨酸轉(zhuǎn)化為IAA,分別是吲哚-3- 丙酮酸途徑、色胺途徑和吲哚-3- 乙腈途徑[19]。其中,吲哚-3- 丙酮酸途徑是首個(gè)被完全闡明的IAA 生物合成途徑,也是植物IAA 合成途徑中最基本、最重要的途徑[20]。從RNA-seq 數(shù)據(jù)中篩選獲得了11 個(gè)參與IAA 生物合成路徑的差異基因,分別屬于YUCCA、TAA1、DDC、ALDH和E3.5.1.4 基因家族(圖3)。YUCCA 基因是吲哚-3- 丙酮酸途徑的限速酶,其表達(dá)模式在IAA合成中起著至關(guān)重要的作用[21]。YUCCA 基因主要在花后第14、16 周表達(dá),且在正常果中的表達(dá)量更高。除ALDH 基因外,其他基因的表達(dá)模式均與YUCCA 基因一致。
2.2.3 GA 生物合成路徑
GA 是雙胍類化合物中的一類植物激素,在植物的整個(gè)生活史中起著至關(guān)重要的作用。因能促進(jìn)漿果體積及其簇長(zhǎng)的生長(zhǎng),GA 被廣泛應(yīng)用于無核葡萄生產(chǎn)[22-23]。由異戊烯基焦磷酸酯合成的牻牛兒基牻牛兒基焦磷酸(geranylgeranyl-PP)是高等植物GA 生物合成的前體[19]。從RNA-seq 數(shù)據(jù)中篩選出6 個(gè)參與GA 生物合成路徑的差異基因,分別屬于GA3、KAO、GA20ox、GA3ox 和GA2ox基因家族(圖4)。其中,GA3 和KAO 參與GA的合成,GA3ox、GA20ox 和GA2ox 參與GA 之間的轉(zhuǎn)化。與敗育果相比,GA3 和KAO 這2 個(gè)參與GA 合成的關(guān)鍵基因均為在正常果中的表達(dá)量更高,可能與正常果果形更大有關(guān)。
2.2.4 ABA 生物合成路徑
ABA 是抑制種子萌發(fā)的主要內(nèi)源激素[24]。ABA 生物合成基因ZEP 和NCED 可提高種子中ABA 的水平[25],而ABA 分解代謝基因CYP707A基因家族降低了ABA 的水平[26]。ABA 合成和降解的動(dòng)態(tài)平衡決定了其穩(wěn)態(tài)的維持。通過RNAseq數(shù)據(jù)分析,篩選了參與ABA 生物合成路徑的11 個(gè)差異表達(dá)基因,分別屬于9 個(gè)基因家族(圖5)。不同的基因家族在不同發(fā)育階段有不同的表達(dá)模式,其中:ABA 生物合成關(guān)鍵基因ZEP 在敗育果中表達(dá)量高;ABA 生物合成關(guān)鍵基因NCED在花后第14 周的敗育果中表達(dá)量高,在花后第16周的正常果中表達(dá)量高,在其他2 個(gè)時(shí)期表達(dá)量均較低;ABA 代謝關(guān)鍵基因CYP707A 的表達(dá)模式類似于NCED。與其他激素相比,ABA 合成代謝相關(guān)基因的表達(dá)模式是復(fù)雜的。
2.2.5 BR 生物合成路徑
BR 是一類含有多羥基的甾醇類化合物的總稱,其中油菜素內(nèi)酯(brassinolide,BL)是一種活性最高的BR。BR 的生物合成路徑主要有2 條(圖6):一條是依賴于油菜甾烷醇途徑,油菜甾醇經(jīng)過催化形成油菜甾烷醇,再通過早期的C6氧化途徑或者晚期的C6 氧化途徑轉(zhuǎn)化為BL 的合成前體BR[27-28];還有一條不依賴于油菜甾烷醇途徑,也是BR 合成的主要途徑,由油菜甾醇經(jīng)過8 步催化,合成BL[29]。通過對(duì)RNA-seq 數(shù)據(jù)中參與BR 生物合成路徑的關(guān)鍵基因的表達(dá)量分析, 獲得了屬于CYP724、CYP90D1、CYP92A6和CYP85A1 基因家族的6 個(gè)差異基因。BR 合成的2 條路徑合成1 個(gè)共同的中間產(chǎn)物6- 脫氧油菜素甾醇,以此為底物合成BR,均需要CYP92A6和CYP85A1 的調(diào)控。CYP92A6 主要在花后第14—18 周表達(dá),且在敗育果中的表達(dá)量更高;CYP85A1 正好相反,主要在花后第20 周表達(dá),且在正常果中的表達(dá)量更高。
2.2.6 JA 生物合成路徑
JA 是植物體內(nèi)一類重要的脂質(zhì)激素,介導(dǎo)植物對(duì)生物脅迫和非生物脅迫的防御反應(yīng),其生物合成經(jīng)歷了依次發(fā)生在葉綠體、過氧化物酶體、細(xì)胞質(zhì)中的多步催化過程[30]。通過對(duì)不同發(fā)育階段正常果和敗育果的RNA-seq 數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,獲得了參與JA 生物合成路徑的16 個(gè)關(guān)鍵基因,分別屬于DAD1、LOX2S、AOS、AOC、OPR、OPCL1、ACX、MFP2 和ACAA1 基因家族(圖7),這些基因大多在敗育果中的表達(dá)量更高。
2.3 qRT-PCR 驗(yàn)證
為了進(jìn)一步驗(yàn)證轉(zhuǎn)錄組測(cè)序和分析結(jié)果的可靠性,以在轉(zhuǎn)錄組測(cè)序中使用的花后第14、16、18、20 周的‘貴妃’杧果正常果和敗育果的同一批果肉為材料提取RNA 后,使用qRT-PCR 對(duì)15 個(gè)差異表達(dá)基因進(jìn)行表達(dá)量驗(yàn)證,結(jié)果如圖8所示。由圖8 可知,在這4 個(gè)發(fā)育時(shí)期,15 個(gè)差異表達(dá)基因在‘貴妃’杧果敗育果和正常果中均表現(xiàn)出不同程度的表達(dá)變化。15 個(gè)基因的qRTPCR分析結(jié)果與轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果基本一致,表明結(jié)果真實(shí)可靠。
3 結(jié)論與討論
本研究中利用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù),分析了4 個(gè)發(fā)育時(shí)期‘貴妃’杧果胚敗育果和胚正常果中,調(diào)控6 種植物激素生物合成的關(guān)鍵基因的表達(dá)模式,結(jié)果表明ET、IAA 和ABA 共同調(diào)控了‘貴妃’杧果胚敗育果的早熟,GA 調(diào)控了胚正常果果形更大,杧果在受到外界環(huán)境脅迫的時(shí)候,更容易產(chǎn)生胚敗育果。
早期的杧果胚敗育研究主要集中在生理機(jī)制和栽培技術(shù)方面,與激素相關(guān)的研究主要聚焦在外源激素處理對(duì)杧果果實(shí)發(fā)育、果實(shí)品質(zhì)的影響等方面。近年來,隨著轉(zhuǎn)錄組技術(shù)的發(fā)展和成本的降低,轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)在杧果研究中的應(yīng)用逐漸增多,但對(duì)關(guān)鍵成分生物合成及代謝機(jī)制的研究報(bào)道較為鮮見。
本研究結(jié)果表明,合成ET 的關(guān)鍵基因在花后第14、16 周時(shí)在敗育果中的表達(dá)量更高,而在花后第18 周時(shí)在正常果中的表達(dá)量更高。ET 作為一種多功能的植物激素,其主要功能之一就是促進(jìn)果實(shí)成熟。對(duì)于杧果這類呼吸躍變型水果而言,果實(shí)中ET 含量升高,則果實(shí)成熟會(huì)被啟動(dòng)。ACS和ACO 基因在植物果實(shí)發(fā)育過程中通過催化ET的合成來促進(jìn)果實(shí)成熟。本研究結(jié)果表明,ACO基因在胚敗育杧果中的表達(dá)量高峰比胚正常果早2 周左右,同一株‘貴妃’杧果樹上的敗育果比正常果提前1 ~ 2 周成熟,這證實(shí)ACO 基因的高表達(dá)主導(dǎo)了胚敗育‘貴妃’杧果早熟性狀的形成。
許多植物的內(nèi)源IAA 合成水平隨著果實(shí)的生長(zhǎng)發(fā)育逐漸降低[31-32]。本研究結(jié)果表明,調(diào)控‘貴妃’杧果IAA 合成的大部分基因是在果實(shí)發(fā)育前期表達(dá),說明杧果果實(shí)發(fā)育過程中IAA 的合成與其他植物存在著一致性規(guī)律。在IAA 合成途徑中,將色氨酸轉(zhuǎn)化為IAA 有3 條途徑,根據(jù)調(diào)節(jié)杧果果實(shí)中IAA 合成不同途徑關(guān)鍵基因的表達(dá)模式,可以推測(cè)在‘貴妃’杧果中,前期主要通過吲哚-3- 丙酮酸途徑和色胺途徑合成IAA,后期主要通過吲哚-3- 乙腈途徑合成IAA。此外,杧果果實(shí)的IAA 合成途徑中除ALDH 基因以外,YUCCA、TAA1、DDC 和E3.5.1.4 共4 個(gè)基因家族的11 個(gè)IAA 合成相關(guān)基因在敗育果中的表達(dá)量均低于正常果。IAA 是促進(jìn)果實(shí)體積增長(zhǎng)的重要激素,正常果中的IAA 合成基因表達(dá)量高于敗育果,說明其IAA 合成比敗育果旺盛,這可能是正常果體積遠(yuǎn)大于胚敗育果的主要原因。此外,周麗萍等[33]認(rèn)為IAA 水平的下降可導(dǎo)致細(xì)胞對(duì)ET 更為敏感,這可能是敗育果比正常果成熟早的另一個(gè)原因。
ABA 和GA 在生物合成中共享甲羥戊酸途徑的早期部分[34-35]。在本研究中,調(diào)控ABA 合成前期的基因大多在胚敗育果中表達(dá)量高,調(diào)控GA 合成的基因大多在胚正常果中表達(dá)量高,據(jù)此推測(cè),ABA 和GA 合成的共同底物牻牛兒基牻牛兒基焦磷酸在胚敗育果中主要參與ABA 的合成,在胚正常果中主要參與GA 的合成。Wu 等[36] 經(jīng)研究發(fā)現(xiàn),在凱特杧果果實(shí)中ABA 信號(hào)可以直接誘導(dǎo)一些響應(yīng)因子的表達(dá),導(dǎo)致杧果果實(shí)成熟相關(guān)基因的上調(diào)。結(jié)合本研究結(jié)果推測(cè),ABA 在胚敗育果中的含量可能高于胚正常果,這可能是敗育果成熟早的原因之一。但是因?yàn)閰⑴cABA 合成后期的基因和參與ABA 代謝的基因在不同發(fā)育時(shí)期的表達(dá)模式不一致,所以這一結(jié)論還有待驗(yàn)證。
GA 的合成水平與果實(shí)大小相關(guān),在杧果生產(chǎn)中,為了促進(jìn)果實(shí)膨大,果農(nóng)也會(huì)廣泛使用噴施外源GA 的方法[37]。本研究結(jié)果表明,在‘貴妃’杧果果實(shí)GA 合成途徑中,參與GA 合成的關(guān)鍵基因GA3 和KAO 均為在正常果中的表達(dá)量更高,這可能是正常果比敗育果體積更大的另一個(gè)原因。
主導(dǎo)BR 生物合成的CYP724、CYP90D1、CYP92A6 和CYP85A1 共4 基因家族的6 個(gè)關(guān)鍵基因在不同時(shí)期的胚敗育果和正常果中的表達(dá)不存在一致性規(guī)律,說明杧果胚敗育果的發(fā)育成熟與BR 無明確關(guān)系。
JA 主要是作為抗性激素在植物抗逆的生物過程中起重要作用。本研究結(jié)果表明,調(diào)控JA 合成的DAD1、LOX2S、AOS、AOC、OPR、OPCL1、ACX、MFP2 和ACAA1 共9 個(gè)基因家族的16 個(gè)關(guān)鍵基因大多在敗育果中表達(dá)量更高,其原因可能有2 種:一是胚敗育現(xiàn)象的出現(xiàn)與植物受到環(huán)境的脅迫有關(guān),在受到脅迫的環(huán)境下更容易出現(xiàn)胚敗育現(xiàn)象,這也與Shaban 等[38] 的研究結(jié)果一致;二是敗育果的發(fā)育存在缺陷對(duì)于植物本身而言就屬于一種脅迫,更容易誘導(dǎo)JA 合成關(guān)鍵基因的高表達(dá)。
從研究結(jié)果可以看出,不同植物激素合成代謝相關(guān)基因在不同發(fā)育階段的‘貴妃’杧果正常果和敗育果中的表達(dá)模式較為復(fù)雜,尤其是ABA和BR 合成代謝相關(guān)基因幾乎不存在一致性的規(guī)律,這可能與本研究中樣品采集時(shí)期較少有關(guān)。下一步將從坐果初期開始定期采樣,直至果實(shí)成熟,利用更多發(fā)育時(shí)期的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)對(duì)‘貴妃’杧果胚敗育果發(fā)育過程中的植物激素合成代謝相關(guān)基因的表達(dá)模式開展進(jìn)一步研究。因?yàn)橹参锛に卣{(diào)控的生物過程多且復(fù)雜,既有獨(dú)立作用,也有協(xié)同調(diào)控,所以僅采用轉(zhuǎn)錄組分析不能完全闡明植物激素在胚敗育果和胚正常果中的作用,今后還應(yīng)進(jìn)行靶向代謝組分析,并進(jìn)行相關(guān)驗(yàn)證。
參考文獻(xiàn):
[1] SHERMAN A, RUBINSTEIN M, ESHED R, et al. Mango(Mangifera indica L.) germplasm diversity based on singlenucleotide polymorphisms derived from the transcriptome[J].BMC Plant Biology,2015,15(1):277.
[2] IQUEBAL M A, JAISWAL S, MAHATO A K, et al. MiSNPDb:a web-based genomic resources of tropical ecology fruitmango (Mangifera indica L.) for phylogeography and varietaldifferentiation[J]. Scientific Reports,2017,7(1):14968.
[3] SURAPANENI M, VEMIREDDY L R, BEGUM H, et al.Population structure and genetic analysis of different utility typesof mango (Mangifera indica L.) germplasm of Andhra Pradeshstate of India using microsatellite markers[J]. Plant Systematicsand Evolution,2013,299(7):1215-1229.
[4] KHAN A S, ALI S, KHAN I A. Morphological and molecularcharacterization and evaluation of mango germplasm: anoverview[J]. Scientia Horticulturae,2015,194:353-366.
[5] 辛雅萱, 黎若竹, 李鑫, 等. 杧果葉綠體基因組密碼子使用偏好性分析[J]. 中南林業(yè)科技大學(xué)學(xué)報(bào),2021,41(9):148-156,165.
XIN Y X, LI R Z, LI X, et al. Analysis on codon usage biasof chloroplast genome in Mangifera indica[J]. Journal ofCentral South University of Forestry amp; Technology,2021,41(9):148-156,165.
[6] 陳業(yè)淵, 黨志國(guó), 林電, 等. 中國(guó)杧果科學(xué)研究70 年[J]. 熱帶作物學(xué)報(bào),2020,41(10):2034-2044.
CHEN Y Y, DANG Z G, LIN D, et al. Mango scientific researchin China in the past 70 years[J]. Chinese Journal of TropicalCrops,2020,41(10):2034-2044.
[7] 杜強(qiáng), 劉孟軍, 趙錦. 果樹胚敗育研究概述[J]. 河北林果研究,2006,21(1):65-68.
DU Q, LIU M J, ZHAO J. Advances in research on embryoabortion of fruit trees[J]. Hebei Journal of Forestry and OrchardResearch,2006,21(1):65-68.
[8] 張文穎, 王晨, 湯崴, 等. 果樹果實(shí)胚敗育研究進(jìn)展[J]. 分子植物育種,2018,16(12):4043-4054.
ZHANG W Y, WANG C, TANG W, et al. Advances study onembryo abortion of fruit trees[J]. Molecular Plant Breeding,2018,16(12):4043-4054.
[9] 任海燕, 弓桂花, 王永康, 等. 植物胚敗育相關(guān)基因研究進(jìn)展[J]. 中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào),2019,35(27):137-141.
REN H Y, GONG G H, WANG Y K, et al. Advances in therelative genes of plant embryo abortion[J]. Chinese AgriculturalScience Bulletin,2019,35(27):137-141.
[10] OGATA T, TAMURA H, HAMADA K, et al. Effect of gibberelinon setting and growth of non-pollinated parthenocarpic fruit inmango[J]. Acta Horticulturae,2010,884:597-604.
[11] 李昕輝, 張勖, 王森, 等. 外施GA3 對(duì)中秋酥脆棗內(nèi)源激素及果實(shí)品質(zhì)的影響[J]. 經(jīng)濟(jì)林研究,2021,39(2):155-163,170.
LI X H, ZHANG X, WANG S, et al. Effects of exogenous GA3on endogenous hormones and fruit quality of Mid-Autumn CrispyJujube[J]. Non-wood Forest Research,2021,39(2):155-163,170.
[12] KAKEI Y, MOCHIDA K, SAKURAI T, et al. Transcriptomeanalysis of hormone-induced gene expression in Brachypodiumdistachyon[J]. Scientific Reports,2015,5(1):14476.
[13] 王玖瑞, 梁海永, 劉孟軍. 棗雄性不育種質(zhì)胚敗育與內(nèi)源激素變化的關(guān)系[J]. 植物遺傳資源學(xué)報(bào),2008,9(3):367-371.
WANG J R, LIANG H Y, LIU M J. The relationship betweenendogenous hormone changes and embryo abortion duringfruit development of Chinese jujube male sterile germplasm[J].Journal of Plant Genetic Resources,2008,9(3):367-371.
[14] JU L, JING Y X, SHI P T, et al. JAZ proteins modulate seedgermination through interaction with ABI 5 in bread wheat andArabidopsis[J]. New Phytologist,2019,223:246-260.
[15] ELBL P, LIRA B S, ANDRADE S C S, et al. Comparativetranscriptome analysis of early somatic embryo formation and seeddevelopment in Brazilian pine, Araucaria angustifolia (Bertol.)Kuntze[J]. Plant Cell Tissue and Organ Culture,2015,120(3):903-915.
[16] BRODERICK S R, WIJERATNE S, WIJERATN A J, et al.RNA-sequencing reveals early, dynamic transcriptome changesin the corollas of pollinated petunias[J]. BMC Plant Biology,2014,14:307.
[17] 趙鳳霞, 米琳, 丁燕芳, 等.‘ 中煙100’ 根系響應(yīng)鐮刀菌侵染的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析及生理生化變化研究[J]. 山東農(nóng)業(yè)科學(xué),2021,53(4): 51-58.
ZHAO F X, MI L, DING Y F, et al. Deep sequencing-basedtranscriptome profiling analysis of Zhongyan 100 root infected byFusarium oxysporum and study on physiological and biochemicalchanges[J]. Shangdong Agricultural Sciences,2021,53(4):51-58.
[18] BLEECKER A B, KENDE H. Ethylene: a gaseous signalmolecule in plants[J]. Annual Review of Cell amp; DevelopmentalBiology,2000,16(1):1-18.
[19] CHEN Z, LU X Y, GAO J L, et al. Integrating transcriptomicand metabolomic analysis of hormone pathways in Acer rubrumduring developmental leaf senescence[J]. BMC Plant Biology,2020,20:410.
[20] NORMANLY J. Auxin metabolism[J]. Physiologia Plantarum,1997,100(3):431-442.
[21] CHENG Y F, DAI X H, ZHAO Y D. Auxin biosynthesis by theYUCCA flavin monooxygenases controls the formation of floralorgans and vascular tissues in Arabidopsis[J]. Genes amp; Development,2006,20(13):1790-1799.
[22] WANG X C, ZHAO M Z, WU W M, et al. Comparativetranscriptome analysis of berry-sizing effects of gibberellin (GA3)on seedless Vitis vinifera L.[J]. Genes amp; Genomics,2017,39(5):493-507.
[23] ACHEAMPONG A K, ZHENG C L, HALALY T, et al.Abnormal endogenous repression of GA signaling in a seedlesstable grape cultivar with high berry growth response to GAapplication[J]. Frontiers in Plant Science,2017,8:850.
[24] PENFIELD S. Seed dormancy and germination[J]. CurrentBiology,2017,27(17):R874-R878.
[25] NAMBARA E, OKAMOTO M, TATEMATSU K, et al. Abscisicacid and the control of seed dormancy and germination[J]. SeedScience Research,2010,20(2):55-67.
[26] KUSHIRO T, OKAMOTO M, NAKABAYASHI K, et al.The Arabidopsis cytochrome P450 CYP707A encodes ABA8’-hydroxylases: key enzymes in ABA catabolism[J]. The EMBOJournal,2004,23:1647-1656.
[27] FUJIOKA S, SAKURAI A. Brassinosteroids[J]. Natural ProductReports,1997,14(1):1-10.
[28] FUJIOKA S, SAKURAI A. Biosynthesis and metabolism ofbrassinosteroids[J]. Physiologia Plantarum,1997,100(3):710-715.
[29] OHNISHI T, GODZA B, WATANABE B, et al. CYP90A1/CPD,a brassinosteroid biosynthetic cytochrome P450 of Arabidopsis,catalyzes C-3 oxidation[J]. The Journal of Biological Chemistry,2012,287(37):31551-31560.
[30] ACOSTA I F, FARMER E E. Jasmonates[J]. The ArabidopsisBook,2010,8:129.
[31] 陳昆松, 張上隆, 呂均良, 等. 脫落酸、吲哚乙酸和乙烯在獼猴桃果實(shí)后熟軟化進(jìn)程中的變化[J]. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué),1997,30(2):54-57.
CHEN K S, ZHANG S L, LYU J L, et al. Variation of abscisicacid, indole-3-acetic acid and ethylene in kiwifruit during fruitripening[J]. Scientia Agricultura Sinica,1997,30(2):54-57.
[32] 生吉萍, 羅云波, 申琳. 轉(zhuǎn)反義ACC 合成酶基因番茄與普通番茄果實(shí)植物內(nèi)源激素含量的變化[J]. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué),2000,33(3):43-48.
SHENG J P, LUO Y B, SHEN L. The content of hormones inantisense ACS tomato as compared with tomato cv. lichun[J].Scientia Agricultura Sinica,2000,33(3):43-48.
[33] 周麗萍, 陳尚武, 張維一. 病原浸染對(duì)采后葡萄激素水平的影響[J]. 植物生理學(xué)報(bào),1998,24(1):1-5.
ZHOU L P, CHEN S W, ZHANG W Y. Changes of endogenoushormones in postharvest grape after infected with pathogenicfungi[J]. Acta Phytophysiologicao Sinica,1998,24(1):1-5.
[34] 郭聰聰, 沈永寶, 史鋒厚. 白皮松種子萌發(fā)過程中呼吸代謝和內(nèi)源激素對(duì)溫度變化的響應(yīng)[J]. 中南林業(yè)科技大學(xué)學(xué)報(bào),2021,41(3):25-36.
GUO C C, SHEN Y B, SHI F H. Response of respiration andhormones during germination of Pinus bungeana seeds totemperature changes[J]. Journal of Central South University ofForestry amp; Technology,2021,41(3):25-36.
[35] YOSHIOKA T, ENDO T, SATOH S. Restoration of seedgermination at supraoptimal temperatures by fluridone, aninhibitor of abscisic acid biosynthesis[J]. Plant amp; Cell Physiology,1998,39(3):307-312.
[36] WU S B, WU D, SONG J, et al. Metabolomic and transcriptomicanalyses reveal new insights into the role of abscisic acid inmodulating mango fruit ripening[J]. Horticulture Research,2022,9:102.
[37] 朱敏, 鄧穗生, 麥賢家, 等. GA3 和CPPU 對(duì)海南貴妃杧產(chǎn)量和果實(shí)品質(zhì)的影響[J]. 熱帶作物學(xué)報(bào),2014,35(9):1784-1790.
ZHU M, DENG S S, MAI X J, et al. Effects of two plant growthregulators on yield and fruit quality of Hainan Guifei mango(Mangifera indica L.)[J]. Chinese Journal of Tropical Crops,2014,35(9):1784-1790.
[38] SHABAN A E A, IBRAHIM A S A. Comparative study onnormal and nubbin fruits of some mango cultivars[J]. AustralianJournal of Basic and Applied Sciences,2009,3(3):2166-2175.
[ 本文編校:聞 麗]