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        線粒體DNA D-Loop區(qū)突變與弱精癥的相關(guān)性

        2023-12-21 09:53:30陳孟權(quán)單婷婷黃蕊孔萬仲
        關(guān)鍵詞:精子細(xì)胞精癥精液

        陳孟權(quán),單婷婷,黃蕊,孔萬仲

        1.溫州市中醫(yī)院 檢驗(yàn)科,浙江 溫州 325000;2.浙江中醫(yī)藥大學(xué) 醫(yī)學(xué)技術(shù)與信息工程學(xué)院,浙江 杭州 310053

        據(jù)世界衛(wèi)生組織(World Health Organization,WHO)和中華醫(yī)學(xué)會(huì)男性不育癥診療指南規(guī)定,夫婦雙方未采用任何避孕措施同居生活1年以上,其中男方因素導(dǎo)致女方不孕者,稱為男性不育癥。近年來由于環(huán)境污染嚴(yán)重、生活壓力大、飲食習(xí)慣不良和生活習(xí)慣變化等多因素共同作用,因不孕不育就診的患者逐年增加,據(jù)WHO統(tǒng)計(jì),全球有10%~15%的育齡夫婦存在不孕不育問題,甚至一些發(fā)展中國家的某些地區(qū)可高達(dá)30%,其中男性因素導(dǎo)致不育的占50%[1-3]。男性不育癥患者較為常見的臨床表現(xiàn)主要是弱精癥,即經(jīng)精液常規(guī)檢查主要表現(xiàn)為精子前向運(yùn)動(dòng)百分率<32%或精子總活力<40%[4]。

        線粒體作為精子細(xì)胞中唯一的細(xì)胞器,在氧化磷酸化、細(xì)胞生長(zhǎng)、信息傳遞和遺傳等生理過程中均發(fā)揮重要的作用,其主要分布在精子尾部中段,為精子運(yùn)動(dòng)和功能提供能量保障。線粒體DNA(mtDNA) 作為線粒體的獨(dú)立遺傳物質(zhì),存在于線粒體內(nèi)膜和基質(zhì)內(nèi),是一條全長(zhǎng)為16 569 bp的環(huán)狀閉合雙鏈DNA分子,負(fù)責(zé)編碼37個(gè)基因,包括22個(gè)tRNA基因、2個(gè)rRNA基因(16S rRNA和12S rRNA)以及13個(gè)組成呼吸鏈復(fù)合體部分亞基的多肽基因[5-7]。mtDNA由于缺乏組蛋白保護(hù)及完整有效的DNA修復(fù)系統(tǒng),容易受到活性氧(reactive oxygen species, ROS)及其他自由基的損傷,導(dǎo)致其突變率相比核基因組高出10~100倍[8-11]。

        D-Loop區(qū)是mtDNA的非編碼區(qū)域,包含了mtDNA輕重鏈轉(zhuǎn)錄啟動(dòng)子和重鏈復(fù)制起始點(diǎn),在mtDNA復(fù)制和轉(zhuǎn)錄過程中發(fā)揮重要的調(diào)控作用[12]。D-Loop區(qū)中存在高突變區(qū)域(hypervariable region)[13],其高頻率的突變可能引起mtDNA的復(fù)制和轉(zhuǎn)錄功能出現(xiàn)異常,造成mtDNA數(shù)量減少、呼吸鏈相關(guān)蛋白和ATP合成不足以及線粒體功能障礙等,使得精子獲能不足、動(dòng)力下降等,最終將導(dǎo)致弱精癥[14]。本研究將通過對(duì)弱精癥患者精子mtDNA的D-Loop區(qū)基因進(jìn)行測(cè)序,分析其基因變異類型和變異頻率的差異,探討精子mtDNA D-Loop區(qū)基因突變和弱精癥的相關(guān)性及其臨床應(yīng)用價(jià)值。

        1 對(duì)象和方法

        1.1 研究對(duì)象 選取2019年7月至2021年3月溫州市中醫(yī)院診治的男性不育癥患者134例,年齡23~42歲,平均年齡33歲,有1年以上不育史,精液常規(guī)分析提示精子前向運(yùn)動(dòng)率<32%,符合第五版《WHO人類精液檢驗(yàn)與處理實(shí)驗(yàn)室手冊(cè)》中弱精癥的相關(guān)診斷標(biāo)準(zhǔn),且其配偶的婦產(chǎn)科相關(guān)檢查均正常。同時(shí)選取129例因女性不孕就診的健康男性精液作為對(duì)照組,年齡22~40歲,平均年齡32歲,精液常規(guī)等檢查結(jié)果均正常。

        全部研究對(duì)象留取樣本時(shí)均符合以下標(biāo)準(zhǔn):①禁欲時(shí)間為2~7 d;②無泌尿系統(tǒng)感染史、附睪炎病史、睪丸損傷史、精索靜脈曲張治療史及相關(guān)性腺器官發(fā)育異常史;③常規(guī)精液檢測(cè)相關(guān)參數(shù)均齊全;④符合本研究相關(guān)入組標(biāo)準(zhǔn)。本研究經(jīng)溫州市中醫(yī)院倫理委員會(huì)批準(zhǔn)(WTCM-KT-2021045),所有患者均知情同意。

        1.2 方法

        1.2.1 精液基因組DNA提?。壕簶颖窘?jīng)離心后收集精子細(xì)胞層,采用基因組DNA提取試劑盒[購于天根生化科技(北京)有限公司]提取精子總DNA,按照試劑盒說明書進(jìn)行操作。

        1.2.2 引物合成及PCR擴(kuò)增:根據(jù)已報(bào)道的mtDNA D-Loop區(qū)引物序列[12],委托上海捷瑞生物工程有限公司合成,見表1。按要求配置20 μL的PCR反應(yīng)體系,反應(yīng)程序?yàn)椋?5 ℃預(yù)變性5 min;95 ℃變性 30 s,58 ℃退火30 s,72 ℃延伸1 min,共35個(gè)循環(huán);72 ℃再延伸7 min;4 ℃保存,產(chǎn)物使用1.5%瓊脂糖凝膠電泳和紫外凝膠成像系統(tǒng)(Tanon)確 認(rèn)。

        表1 mtDNA D-Loop區(qū)擴(kuò)增引物設(shè)計(jì)

        1.2.3 PCR產(chǎn)物測(cè)序及分析:將PCR產(chǎn)物送尚亞生物技術(shù)有限公司進(jìn)行測(cè)序,所有樣本采用雙向重復(fù)測(cè)序,保證測(cè)序的準(zhǔn)確性。以劍橋標(biāo)準(zhǔn)序列(rCRS)為參照,對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行分析,查找突變位點(diǎn)。

        1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理方法 采用SPSS21.0軟件對(duì)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。計(jì)數(shù)資料以例(%)表示,組間比較采用χ2檢驗(yàn)或Fisher’s確切概率法。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 兩組精子細(xì)胞mtDNA D-Loop區(qū)突變情況 通過對(duì)弱精癥組(n=134)和對(duì)照組(n=129)的D-Loop區(qū)進(jìn)行測(cè)序,共發(fā)現(xiàn)247種突變,其中弱精癥組患者精子細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)178種,對(duì)照組精子細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)182 種,兩組顯示出相近的單核苷酸多態(tài)性(SNP) (2 232/134=16.66,2 259/129=17.51)。有62種突變的發(fā)生率>5%,其中大多在HV-1區(qū)(55.31%)和HV-2區(qū)(32.47%)。D-Loop區(qū)域的4個(gè)新突變均為核苷酸缺失突變,見圖1、表2。

        圖1 4種新突變的測(cè)序結(jié)果比對(duì)圖

        表2 4個(gè)D-Loop區(qū)域的新突變位點(diǎn)[例(%)]

        2.2 兩組精子細(xì)胞mtDNA D-Loop區(qū)突變的差異性分析 對(duì)發(fā)生率>5%的62種突變的分析顯示,突變以替換突變?yōu)橹鳎?7.03%),其中替換突變54個(gè),缺失突變5個(gè),插入突變3個(gè),且替換突變數(shù)量與其他兩種突變的差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.01);替換突變大多為T>C(42.2%)、A>G(23.03%)以及C>T(22.78%)等,且不同替換類型在兩組間的分布差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.389),見圖2。本研究發(fā)現(xiàn)有11種突變?cè)趦山M間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),見表3。

        圖2 兩組間不同類型替換突變的差異

        表3 兩組精子細(xì)胞mtDNA D-Loop區(qū)突變分析[例(%)]

        2.3 弱精癥患者精子活動(dòng)力水平與mtDNA D-Loop區(qū)突變的關(guān)系 根據(jù)精子細(xì)胞前向運(yùn)動(dòng)百分率將弱精癥患者分為輕度68例(20%~32%)、中度48例(10%~20%)及重度18 例(<10%),其中mtDNA DLoop區(qū)基因突變發(fā)生率>5%的有92種,分析發(fā)現(xiàn)有4種突變?cè)诓煌瑖?yán)重程度的弱精癥患者間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),見表4。

        表4 不同嚴(yán)重程度弱精癥患者精子細(xì)胞mtDNA D-Loop區(qū)突變分析[例(%)]

        3 討論

        臨床上男性不育大多表現(xiàn)為弱精癥,即精子前向運(yùn)動(dòng)力減弱,從而引起不孕不育。作為細(xì)胞“動(dòng)力工廠”的線粒體,是精子細(xì)胞的重要能量來源,若線粒體功能發(fā)生障礙,將影響精子細(xì)胞正常的生命活動(dòng)和運(yùn)動(dòng)能力[15]。mtDNA由于其特殊的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)而具有較高的突變率[16],尤其作為mtDNA復(fù)制和轉(zhuǎn)錄調(diào)控區(qū)的D-Loop區(qū),不僅包含了H鏈、L鏈轉(zhuǎn)錄啟動(dòng)子和H鏈復(fù)制起始點(diǎn),還存在兩個(gè)極具不穩(wěn)定性的高突變區(qū)域(HV-1、HV-2),這些區(qū)域的高頻突變可能導(dǎo)致復(fù)制和轉(zhuǎn)錄等功能紊亂[16-19]。

        本研究結(jié)果顯示所有研究對(duì)象在D-Loop區(qū)均有不同程度的突變,發(fā)生率>5%的突變有62 種,其中位于HV-1區(qū)(55.31%)的突變明顯多于HV-2區(qū)(32.47%),替換突變數(shù)量(87.03%)明顯高于其他突變類型,替換突變中以T>C占比最大(42.2%),其次為A>G(23.03%)和C>T(22.78%),同時(shí)我們還發(fā)現(xiàn)了4個(gè)未見報(bào)道過的新突變。

        此前,已有多位學(xué)者發(fā)現(xiàn)mtDNA D-Loop區(qū)在各類腫瘤、慢性肝腎疾病、類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎等疾病中表現(xiàn)出高突變率。SULTANA等[20]提出D-Loop區(qū)突變可能抑制電子傳遞鏈的進(jìn)行,造成高水平ROS釋放堆積,是腫瘤的誘發(fā)劑及啟動(dòng)劑。DRAGONI等[21]發(fā)現(xiàn)腦部病變時(shí)D-Loop區(qū)的甲基化水平明顯增高。ALTAFI等[22]通過比較腦腫瘤組織及其相鄰組織的mtDNA序列,發(fā)現(xiàn)兩者D-Loop區(qū)突變存在明顯差異。WANG等[23]研究發(fā)現(xiàn)mtDNA D-Loop區(qū)突變與胃腸道腫瘤進(jìn)展存在相關(guān)性。位于D310區(qū)的微衛(wèi)星序列,表現(xiàn)為多聚C單核苷酸重復(fù)序列,目前已被證實(shí)與乳腺癌有關(guān)[24-25]。研究[26-29]顯示mtDNA D-Loop區(qū)突變與類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎發(fā)病年齡、慢性腎功能衰竭、潰瘍性結(jié)腸炎以及喉癌之間均存在相關(guān)性。這些研究表明,D-Loop區(qū)突變的積累可能導(dǎo)致呼吸鏈環(huán)節(jié)發(fā)生異常,ROS大量堆積,進(jìn)而造成細(xì)胞損傷和疾病發(fā)生[12]。

        有不少研究報(bào)道弱精癥患者存在mtDNA拷貝數(shù)異常[30-32]和大片段缺失現(xiàn)象[33-34],本課題組前期研究[35]提示弱精癥組mtDNA拷貝數(shù)降低,但未發(fā)現(xiàn)大片段缺失,而D-Loop區(qū)與mtDNA復(fù)制轉(zhuǎn)錄過程息息相關(guān),在弱精癥相關(guān)研究中卻較少被提及,在弱精癥發(fā)生發(fā)展過程中的表現(xiàn)和作用亦不明確。本研究通過分析發(fā)現(xiàn),有11種突變?cè)谌蹙Y患者和對(duì)照組之間存在顯著性差異,其中T16172C、CAA16179C、C16257A、C16261T、T16304C可能會(huì)增加弱精癥風(fēng)險(xiǎn),而CA16179C、A16182C、A16183C、A16230G、T16249C、G16319A則相反。此前有報(bào)道T16172C和A16183C在子宮內(nèi)膜異位癥中亦呈現(xiàn)相同的表現(xiàn)[36], T16304C與卵巢癌發(fā)病年齡有關(guān)[37],C16179T與精子活力和濃度下降顯著相關(guān)[38],本研究中CAA16179C、CA16179C、A16182C和A16183C在弱精癥患者中均有顯著差異,可能與緊鄰16184-16193的微衛(wèi)星結(jié)構(gòu)(C5TC4)有關(guān),這些突變可能造成該微衛(wèi)星結(jié)構(gòu)的多胞嘧啶單核苷酸重復(fù)模式改變,增加其不穩(wěn)定性。C16257A和C16261T作為弱精癥的風(fēng)險(xiǎn)因素,同時(shí)也被報(bào)道參與組成漢族人群II型糖尿病和中重癥新冠肺炎的風(fēng)險(xiǎn)因素(G5417A/C16257A/C16261T),參與ROS堆積和線粒體破壞[39-40]。此外,本研究通過比較發(fā)現(xiàn)4種突變?cè)诓煌潭热蹙Y之間存在顯著性差異,其中T16140C、C16291T可能是弱精癥患者精子活力進(jìn)一步下降的風(fēng)險(xiǎn)因素,T16092C和T16311C則可能是弱精癥患者病情進(jìn)展的保護(hù)性因素,需要進(jìn)一步研究明確其相關(guān)性。

        綜上所述,本研究結(jié)果表明,弱精癥患者精子細(xì)胞mtDNA D-Loop區(qū)存在顯著差異,可能在弱精癥發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮重要作用,對(duì)弱精癥的臨床診療具有一定提示意義,同時(shí)也為線粒體DNA點(diǎn)突變?cè)谌蹙Y機(jī)制研究方面提供新的思路和證據(jù)。

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