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        常見鹽漬食品中嗜鹽微生物分布及其胞外酶活

        2023-09-13 07:00:34張申奧陳飛龍蘇亦鳴陳紹興
        關(guān)鍵詞:古菌酯酶物種

        張申奧,陳飛龍,陳 博,蘇亦鳴,陳紹興

        (安徽師范大學(xué) 生命科學(xué)學(xué)院,安徽 蕪湖 241000)

        嗜鹽微生物生活于高鹽環(huán)境中,如鹽湖、鹽礦、海洋曬鹽地、 鹽堿土壤以及海產(chǎn)品和一些鹽漬食品,屬于極端環(huán)境微生物的一種[1]。 它們中有些類群能合成生物可降解塑料,在生物醫(yī)學(xué)和環(huán)境治理等領(lǐng)域具有廣泛應(yīng)用前景[2-5]。 鹽漬食品是由新鮮蔬菜、瓜果、肉制品等經(jīng)腌制、發(fā)酵制成的風(fēng)味食品。嗜鹽菌在發(fā)酵過程中起到促進(jìn)作用。 目前,已在多種腌制、鹽漬食品或海產(chǎn)品等高鹽食品中分離鑒定出嗜鹽菌。 2010 年,陳學(xué)云等在鹽干帶魚中鑒定了多種耐鹽的葡萄球菌(Staphylococcus)[6];同年,王宇等在腌制咸魚中分離到了一株中度嗜鹽菌,鑒定結(jié)果表明該菌隸屬于Halobacillus 屬[7];2011 年,孫業(yè)盈等在蜢子蝦醬中分離純化鑒定了一株中度嗜鹽菌,定為鹽脫氮枝芽孢桿菌(Virgibacillus halodenitrificans)[8];2012 年,呂彥等從蟹醬中分離出了一株中度嗜鹽菌,系統(tǒng)發(fā)育分析將3 株嗜鹽菌鑒定為葡萄球菌屬(Staphylococcus)中的3 個(gè)不同的種,分別為琥珀葡萄球菌(Staphylococcus succinus)、科氏葡萄球菌(Staphylococcus cohnii)和馬胃葡萄球菌(Staphylococcus equorum)[9]。

        高鹽食品中存在著大量的嗜鹽菌,嗜鹽菌的大量繁殖,可能會(huì)引發(fā)食品安全問題。 20 世紀(jì)90 年代,曾發(fā)生過嗜鹽菌污染食物導(dǎo)致中毒的事件。 因此對鹽漬食品中的嗜鹽菌的分離鑒定研究,是評價(jià)食品的安全性和防止嗜鹽菌污染食品的前期基礎(chǔ)[10]。另外,嗜鹽古菌是一類生活于極端高鹽環(huán)境的化能異養(yǎng)型原核微生物,其所分泌的胞外酶(外泌酶)具有在高鹽條件下仍能保持活性的特點(diǎn),在制革工業(yè)、高鹽有機(jī)廢水處理和泡菜加工等腌制食品方面有重要用途[11]。 嗜鹽微生物分泌的蛋白酶、肽酶、堿性磷酸酶等不僅能夠促進(jìn)原料底物進(jìn)行分解及生物轉(zhuǎn)化,顯著縮短發(fā)酵周期,還能將肽和寡肽轉(zhuǎn)化為前體氨基酸從而形成海鮮調(diào)味品特有的風(fēng)味物質(zhì),有利于海鮮調(diào)味品鮮美醇香氣味的形成[12]。例如,目前高鹽腌制食品生產(chǎn)的一個(gè)主要問題是發(fā)酵時(shí)間長。 有研究發(fā)現(xiàn)Halobacterium sp. SP1 的添加能加速魚露的發(fā)酵過程[13],研究表明其分泌的胞外蛋白酶發(fā)揮了關(guān)鍵的作用,經(jīng)蛋白酶作用產(chǎn)生的多肽和氨基酸不僅賦予了魚露豐富的營養(yǎng)價(jià)值,同時(shí)對魚露的風(fēng)味和香氣也有著重要的提升[13]。另外,嗜鹽古菌胞外蛋白酶、 淀粉酶和酯酶分別在肽合成、調(diào)味劑和食品腌制、多不飽和脂肪酸生產(chǎn)等方面具有較廣泛的應(yīng)用價(jià)值[14]。

        作者從市場中常見的高鹽食品中分離鑒定嗜鹽菌,并對其多樣性及相關(guān)胞外酶活性進(jìn)行研究,以期為高鹽食品中嗜鹽菌的群落結(jié)構(gòu)以及高鹽食品安全評價(jià)提供幫助。 挖掘高鹽食品中的嗜鹽微生物資源,以期找到高產(chǎn)胞外酶的嗜鹽菌株,為極端環(huán)境微生物資源的開發(fā)和利用奠定基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 樣品的采集

        7 種高鹽食品:海蜒、蝦皮、海帶、什錦菜、醬油蜜瓜、寶塔菜和辣醬(圖1),均購于安徽省蕪湖市大潤發(fā)超市。 其中海蜒產(chǎn)自浙江寧波,蝦皮產(chǎn)自江蘇揚(yáng)州,海帶產(chǎn)自山東威海,什錦菜產(chǎn)自江蘇南京,醬油蜜瓜產(chǎn)自江蘇南京,寶塔菜產(chǎn)自江蘇南京,辣醬產(chǎn)自安徽蕪湖。

        圖1 不同高鹽食品和嗜鹽微生物的分離Fig. 1 Salted-foods and culture-dependent isolation

        1.2 嗜鹽微生物的分離與純化

        1.2.1 培養(yǎng)基制備 分離高鹽食品中嗜鹽微生物的培養(yǎng)基為AS-168 培養(yǎng)基和NOM 培養(yǎng)基。 AS-168 培養(yǎng)基(組分g/L):酸水解酪蛋白氨基酸5.0,酵母粉5.0,谷氨酸單鈉1.8,檸檬酸鈉3.0,MgSO4·7H2O 20.0,KCl 2.0,NaCl 200.0,F(xiàn)eCl2·4H2O 0.036,MnCl2·4H2O 0.0036;NOM 培養(yǎng)基(組分g/L):酵母粉0.05,魚蛋白胨0.25,丙酮酸鈉1.0,KCl 5.4,CaCl20.29,NH4Cl 0.27,MgSO4·7H2O 26.8,MgCl2·6H2O 23,NaCl 184。 pH 調(diào)至7.5,1×105Pa 滅菌20 min。 配制固體培養(yǎng)基時(shí),在滅菌前每升加入瓊脂粉15.0 g。

        1.2.2 菌株的分離與純化 于超凈臺(tái)中收集海帶表面白色鹽霜于無菌試管中,加入5 mL 質(zhì)量分?jǐn)?shù)20% 的NaCl 溶液懸浮,在漩渦振蕩儀中混合5 min。吸取1 mL 混合液于1.5 mL EP 管中,并以此為原液,按照10-1、10-2和10-3進(jìn)行多梯度稀釋。 分別吸取200 μL 液體涂布于NOM(或者AS-168)培養(yǎng)基,隨后放入培養(yǎng)箱,37 ℃倒置培養(yǎng)。對于海蜒和蝦皮,超凈臺(tái)中取1 g 樣品于無菌研缽中碾成粉末,加入5 mL 滅過菌的質(zhì)量分?jǐn)?shù)20% NaCl 溶液懸浮。后續(xù)操作同海帶。 對于辣醬、寶塔菜、什錦菜、醬油蜜瓜,直接吸取其鹽腌水(辣醬為油液)作為原液,其余操作同海帶。 培養(yǎng)10 d 后,挑取每個(gè)培養(yǎng)基上長出的不同類型的單菌落至新的固體培養(yǎng)基上劃線,繼續(xù)培養(yǎng)。 7 d 后,再次進(jìn)行平板劃線分離進(jìn)行菌株的進(jìn)一步純化。

        1.3 基于16S rRNA 基因的初步分子鑒定

        1.3.1 菌株P(guān)CR 擴(kuò)增模板DNA 的提取 水裂解法(適用于純水裂解型嗜鹽古菌):挑取適量的菌體,懸入含有50 μL 滅菌的蒸餾水的離心管中。 使用漩渦振蕩儀充分振蕩混勻,12 000 r/min 離心3 min。收集上清液作為嗜鹽古菌PCR 擴(kuò)增所需的模板DNA。

        酚-氯仿抽提法[15](適用于嗜鹽細(xì)菌和純水不裂解型嗜鹽古菌):采用相同的方法制備菌懸液,再用酚氯仿溶液(苯酚∶氯仿體積比1∶1,)抽提,12 000 r/min離心3 min;收集上清液,再用等體積的氯仿抽提,12 000 r/min 離心3 min;收集上清液作為嗜鹽細(xì)菌及純水不裂解型嗜鹽古菌PCR 擴(kuò)增所需的模板DNA。

        1.3.2 PCR 擴(kuò)增16S rRNA 基因 分別利用嗜鹽古菌和嗜鹽細(xì)菌的16S rRNA 通用引物進(jìn)行PCR 擴(kuò)增。 分別以F8/R1462 和27F/1492R 為嗜鹽古菌和細(xì)菌的16S rRNA 基因PCR 擴(kuò)增的引物[15]。 將電泳檢測成功的PCR 產(chǎn)物送生物公司測序。

        1.3.3 測序結(jié)果分析 獲得各菌株16S rRNA 基因的測序峰圖,利用BioEdit 軟件[14]檢查測序峰圖的質(zhì)量,去除兩側(cè)峰型較差的序列,選取中間可信度高的序列進(jìn)行后續(xù)分析。 將已選中的序列利用工具EZbioCloud(https://www.ezbiocloud.net/)進(jìn)行同源性搜索,得到與菌株親緣關(guān)系最近的物種信息及其相似度,確定各個(gè)菌株的分類地位。 將本研究所分離到的43 株嗜鹽菌的16S rRNA 基因序列提交GenBank,獲得序列登錄號:MZ768566-MZ768608。

        1.4 胞外酶活鑒定

        根據(jù)文獻(xiàn)對嗜鹽菌的胞外淀粉酶、酯酶、明膠酶、觸酶、蛋白酶、氧化酶進(jìn)行酶活鑒定[15]。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 7 種高鹽食品中可培養(yǎng)嗜鹽微生物的分布情況統(tǒng)計(jì)

        2.1.1 7 種高鹽食品中可培養(yǎng)嗜鹽微生物物種分布情況 對經(jīng)過純培養(yǎng)分離并根據(jù)菌落的形態(tài)和顏色挑取43 株進(jìn)行16S rRNA 基因測序和序列相似性分析。 結(jié)果顯示,從市售常見高鹽食品中共分離出21 種嗜鹽微生物,分屬13 個(gè)屬。 如表1 所示,其中嗜鹽古菌分別來自Halorubrum、Haloarcula、Halobacterium、Halarchaeum 這4 個(gè)屬的7 個(gè)種;嗜鹽 細(xì) 菌 分 別 來 自 Halobacillus、Staphylococcus、Chromohalobacter、Gracilibacillus、Lentibacillus、Salinicoccus、Salimicrobium、Nesterenkonia、Alkalibacillus這9 個(gè)屬的14 個(gè)種。

        表1 21 種代表嗜鹽微生物分類地位Table 1 Taxonomic status of 21 representatives of halophilic microorganisms

        嗜鹽古菌4 個(gè)屬分別隸屬于Halobacteria 綱,Haloferacales 和Halobacteriales 目,Halorubraceae、Haloarculaceae 和Halobacteriaceae 科。 嗜鹽細(xì)菌9個(gè) 屬 分 別 隸 屬 于 Bacillales、Oceanospirillale 和Micrococcales 目 ;Bacillaceae、Staphylococcaceae、Halomonadaceae 和Micrococcaceae 科。

        2.1.2 7 種高鹽食品中可培養(yǎng)嗜鹽微生物優(yōu)勢物種分析 在AS-168 培養(yǎng)基培養(yǎng)條件下,海蜒樣品中的優(yōu)勢物種為Nesterenkonia 屬物種,占比87.5%;蝦皮樣品中的優(yōu)勢物種為Salinicoccus 屬物種,占比83.3%; 海帶樣品中的優(yōu)勢物種為Haloarcula 屬物種,占比88.2%; 什錦菜樣品中的優(yōu)勢物種為Lentibacillus 屬物種,占比74.4%;辣醬樣品中的優(yōu)勢物種為Staphylococcus 屬物種,占比100.0%;寶塔菜樣品中的優(yōu)勢物種為Gracilibacillus 屬物種,占比40.0%,見圖2。

        圖2 7 種高鹽食品在AS-168 和NOM 培養(yǎng)基中可培養(yǎng)嗜鹽微生物物種組成(屬級水平)Fig. 2 Species composition of halophilic microorganisms in AS-168 and NOM mediumsin in 7 different salted-foods(genus level)

        在NOM 培養(yǎng)基培養(yǎng)條件下,海蜒樣品中的優(yōu)勢物種為Halobacillus 屬和Halobacterium 屬物種,占比均為36.0%; 蝦皮樣品中的優(yōu)勢物種為Salimicrobium 屬物種,占比31.2%;海帶樣品中的優(yōu)勢物種為Haloarcula 屬物種,占比78.4%;辣醬樣品中優(yōu)勢物種為Nesterenkonia 屬物種,占比52.2%;寶塔菜樣品中的優(yōu)勢物種為Gracilibacillus 屬物種,占比100.0%; 醬油蜜瓜樣品中的優(yōu)勢物種為Lentibacillus 屬物種,占比100.0%。

        2.2 7 種高鹽食品中可培養(yǎng)嗜鹽微生物比較

        2.2.1 不同樣品中可培養(yǎng)嗜鹽微生物物種組成比較 在AS-168 培養(yǎng)基培養(yǎng)條件下,從海蜒樣品中共分離出2 個(gè)屬的2 種嗜鹽微生物,均為嗜鹽細(xì)菌;從蝦皮樣品中共分離出1 個(gè)屬的2 種嗜鹽微生物,均為嗜鹽細(xì)菌;從海帶樣品中共分離出2 個(gè)屬的2 種嗜鹽微生物,其中嗜鹽古菌1 個(gè)屬的1 種,嗜鹽細(xì)菌1 個(gè)屬的1 種;從什錦菜樣品中共分離出2 個(gè)屬的2 種嗜鹽微生物,均為嗜鹽細(xì)菌;從辣醬樣品中共分離出1 個(gè)屬的1 種嗜鹽微生物,均為嗜鹽細(xì)菌;從寶塔菜樣品中共分離出4 個(gè)屬的5 種嗜鹽微生物,其中嗜鹽古菌3 個(gè)屬的3 種,嗜鹽細(xì)菌1個(gè)屬的2 種;從醬油蜜瓜樣品中未分離出任何嗜鹽微生物。

        在NOM 培養(yǎng)基培養(yǎng)條件下,從海蜒樣品中共分離出6 個(gè)屬的6 種嗜鹽微生物,其中嗜鹽古菌4個(gè)屬的4 種,嗜鹽細(xì)菌2 個(gè)屬的2 種;從蝦皮樣品中共分離出嗜鹽微生物5 個(gè)屬的5 種,其中嗜鹽古菌2 個(gè)屬的2 種,嗜鹽細(xì)菌2 個(gè)屬的2 種;從海帶樣品中共分離出2 個(gè)屬的2 種嗜鹽微生物,均為嗜鹽古菌; 從什錦菜樣品中未分離出任何嗜鹽微生物;從辣醬樣品中共分離出6 個(gè)屬的8 種嗜鹽微生物,其中嗜鹽古菌4 個(gè)屬的6 種,嗜鹽細(xì)菌2 個(gè)屬的2 種;從寶塔菜樣品中共分離出1 個(gè)屬的1 種嗜鹽微生物,均為嗜鹽細(xì)菌;從醬油蜜瓜樣品中共分離出1 個(gè)屬的1 種嗜鹽微生物,均為嗜鹽細(xì)菌,見表2。 可見在AS-168 培養(yǎng)基培養(yǎng)條件下,易分離出嗜鹽細(xì)菌;在NOM 培養(yǎng)基培養(yǎng)條件下,易分離出嗜鹽古菌。

        表2 21 個(gè)嗜鹽微生物物種在7 種高鹽食品中的分布Table 2 Distribution of 21species of halophilic microorganisms in 7 different salted-foods

        2.2.2 不同培養(yǎng)基分離可培養(yǎng)嗜鹽微生物的比較用AS-168 培養(yǎng)基共分離出嗜鹽菌9 個(gè)屬的12 種,其中嗜鹽古菌3 個(gè)屬的3 種,分屬Halorubrum、Halobacterium 和Haloarcula 屬; 嗜鹽細(xì)菌6 個(gè)屬的9 種,分屬Chromohalobacter、Gracilibacillus、Lentibacillus、Nesterenkonia、Salinicoccus 和Staphylococcus屬。 而用NOM 培養(yǎng)基中共分離出嗜鹽菌11 個(gè)屬的15 種,其 中 嗜 鹽 古 菌4 個(gè) 屬 的7 種,分 屬Halorubrum、Halobacterium、Haloarcula 和Halarchaeum 屬,完全覆蓋了AS-168 培養(yǎng)基中分離出的嗜鹽古菌; 嗜鹽細(xì)菌7 個(gè)屬的8 種,分屬Alkalibacillus、Gracilibacillus、Halobacillus、Lentiba -cillus、Nesterenkonia、Salinicoccus 和 Salimicrobium屬(圖3)。 可見,NOM 培養(yǎng)基培養(yǎng)出的嗜鹽微生物豐富度明顯高于AS-168 培養(yǎng)基。

        其中,Halarchaeum 屬嗜鹽古菌只在NOM 培養(yǎng)基中分離到;Chromohalobacter 和Staphylococcus 屬嗜鹽細(xì)菌只在AS -168 培養(yǎng)基中分離到;Alkalibacillus、Halobacillus 和Salimicrobium 屬 嗜 鹽細(xì)菌只在NOM 培養(yǎng)基分離到。 NOM 培養(yǎng)基相對于AS-168 培養(yǎng)基而言屬于寡營養(yǎng)型培養(yǎng)基,嗜鹽微生物可能更加適應(yīng)在寡營養(yǎng)條件生存。

        2.3 21 種代表嗜鹽微生物胞外酶活測定

        在所分離到的21 種嗜鹽菌中,胞外產(chǎn)淀粉酶的有3 株,占比14.3%;產(chǎn)酯酶7 株,占比33.3%;產(chǎn)明膠酶1 株,占比4.8%;產(chǎn)觸酶8 株,占比38.1%;未分離出產(chǎn)蛋白酶和氧化酶的嗜鹽菌,見表3。

        嗜鹽古菌N-9 具有胞外明膠酶活性 (圖3(a)); 嗜鹽細(xì)菌168-11 菌株具有胞外淀粉酶、酯酶、觸酶活性;嗜鹽古菌N-11 菌株具有胞外淀粉酶(圖3(b))、酯酶活性;嗜鹽細(xì)菌N-18 菌株具有胞外淀粉酶(圖3(b))、觸酶活性;嗜鹽細(xì)菌N-34 菌株具有胞外酯酶、觸酶活性;嗜鹽細(xì)菌N-16 菌株具有胞外酯酶活性(圖3(c))。

        由表3 得出,產(chǎn)胞外淀粉酶的168-11、N-11、N-18 菌株在各自生境中的占比分別為100%、2.2%、25.0%。 產(chǎn)胞外酯酶的168-9、168-11、N-11、N-34 菌株在各自生境中的占比分別為20.0%、100%、2.2%、4.0%,此外產(chǎn)胞外酯酶的N-14 菌株在辣醬、蝦皮、海蜒樣品中均分離得到,占比分別為8.7%、12.5%、8.0%; 產(chǎn)胞外酯酶的N-16 菌株在辣醬、蝦皮樣品中均被分離得到,占比分別為13.0%、83.3%;產(chǎn)胞外酯酶的N-29 菌株在蝦皮、海蜒樣品中均分離得到,占比分別為31.3%、12.0%。產(chǎn)胞外明膠酶的N-9 菌株在其生境中占比為2.2%。 可見,產(chǎn)胞外酶菌株相較于不產(chǎn)胞外酶菌株而言,前者在其生境中具有一定的優(yōu)勢度。 其中,168-11、N-16 菌株更是其生境中的優(yōu)勢物種。

        2.4 討論

        高鹽腌漬和發(fā)酵食品由于富含游離氨基酸、小分子糖、醇、酸類物質(zhì)、維生素等,對嗜鹽古菌有較好的篩選和富集作用,蘊(yùn)藏豐富的新種資源和產(chǎn)酶菌株資源[17]。 目前,對于鹽湖、鹽礦和曬鹽場等高鹽環(huán)境的嗜鹽微生物的物種多樣性組成方面的研究已經(jīng)有了較多積累。 雖然有關(guān)于高鹽食品中分離并鑒定出了嗜鹽古菌的新物種報(bào)道較多,而對于市售常見的高鹽產(chǎn)品中的嗜鹽古菌的多樣性研究較少。由于高鹽食品的制作原料、制作方法、添加劑的使用多種多樣,由此造成的高鹽食品中微生物生境的不同,形成了各自獨(dú)特的微生物組成結(jié)構(gòu)。作者對7種高鹽食品中的嗜鹽微生物進(jìn)行了較為系統(tǒng)的研究,拓寬了對不同高鹽生境中嗜鹽菌的組成的認(rèn)識(shí)。

        作者通過純培養(yǎng)技術(shù),共從7 種高鹽食品生境中挑取了不同形態(tài)的菌株43 株測序,經(jīng)過基于16S rRNA 基因的序列相似性分析,初步確定了7 種高鹽食品生境中共有21 個(gè)種13 個(gè)屬的嗜鹽微生物。其 中 包 括 Halorubrum、Haloarcula、Halobacterium、Halarchaeum 4 個(gè)屬的嗜鹽古菌菌株,Halobacillus、Staphylococcus、Chromohalobacter、Gracilibacillus、Lentibacillus、Salinicoccus、Salimicrobium、Nesterenkonia、Alkalibacillus 9 個(gè)屬的嗜鹽細(xì)菌菌株。這些菌株之前也被一些學(xué)者從其相應(yīng)生境中分離得到,且與作者在本研究中得到的結(jié)果具有一定相似性。 如江蘇大學(xué)韓冬在分析4 種產(chǎn)地的鹽漬海帶中嗜鹽古菌多樣性中,其中山東榮成、福建霞浦2 種產(chǎn)地的鹽漬海帶的嗜鹽古菌優(yōu)勢物種來自Haloarcula屬[17],與本研究得到結(jié)果一致。西華大學(xué)張琦在四川泡菜鹽鹵中分離出54 株嗜鹽細(xì)菌,分屬3 個(gè)屬,Staphylococcus 屬為其中之一[18]。 在本研究中作者也分離出Staphylococcus 屬菌株,且為辣醬樣品中的優(yōu)勢物種。 大連工業(yè)大學(xué)李可心在盤錦地區(qū)蜢蝦醬中分離出62 株嗜鹽菌,其中Salinicoccus 屬4 株,Lentibacillus 屬3 株,均為主要物種[19]。本研究中,蝦皮樣品中優(yōu)勢物種來自Salinicoccus 屬; 醬油蜜瓜樣品中唯一分離出菌株來自Lentibacillus 屬,什錦菜樣品中優(yōu)勢物種也來自Lentibacillus 屬。

        3 結(jié) 語

        以嗜鹽古菌作為產(chǎn)酶來源已經(jīng)成為一個(gè)新的研究熱點(diǎn),主要應(yīng)用于化工、制藥、石油、水產(chǎn)、發(fā)酵等工業(yè)生產(chǎn)中[20]。作者從21 種嗜鹽菌株中篩選出了胞外產(chǎn)淀粉酶3 株,產(chǎn)酯酶7 株,產(chǎn)明膠酶1 株,產(chǎn)觸酶8 株。 初步判斷,產(chǎn)酶菌株在其生境中同時(shí)也具有一定的優(yōu)勢度,且有些菌株具有產(chǎn)多種胞外酶的特征。 高鹽生境具有一定的復(fù)雜性,某些嗜鹽菌為了適應(yīng)復(fù)雜的生存環(huán)境進(jìn)化出產(chǎn)多種胞外酶的特性。 因此相較于不產(chǎn)酶菌株,產(chǎn)酶菌株更具有生存優(yōu)勢。

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