丁曉霞,劉亞群,于小緯,楊 楠,張悅琪(河北北方學(xué)院附屬第一醫(yī)院呼吸與危重癥監(jiān)護室,河北 張家口 075000)
肺癌是導(dǎo)致癌癥患者死亡的重要原因,肺鱗癌是常見的肺癌亞型之一,其化療和放療敏感性較低[1-2]。由于肺鱗癌容易發(fā)生轉(zhuǎn)移,并且目前缺乏有效的診斷性生物標(biāo)志物,確診時患者往往已處于中晚期,導(dǎo)致患者預(yù)后較差[3-4]。因此,積極尋找用于肺鱗癌診斷和預(yù)后預(yù)測的生物標(biāo)志物至關(guān)重要。微小RNA(microRNA,miRNA)是一類不具有編碼能力的小分子RNA,在基因轉(zhuǎn)錄中發(fā)揮重要作用,參與細(xì)胞增殖、遷移、侵襲和凋亡等生物行為學(xué)過程[5-6]。脂質(zhì)運載蛋白1(lipocalin-1,LCN1) 能夠間接導(dǎo)致肺組織基質(zhì)降解增加,造成肺組織結(jié)構(gòu)重塑,使病情加重。miRNA 可長期穩(wěn)定存在,且其異常表達會影響腫瘤的發(fā)生發(fā)展[7-8]。miRNA 既可以發(fā)揮抑癌作用,也可以發(fā)揮促癌作用,并且在多數(shù)人類惡性腫瘤中異常表達[9-10]。有研究顯示,miR-146b-3p 可作為診斷非小細(xì)胞肺癌的重要標(biāo)志物[11]。還有研究顯示,miR-146a 在肺鱗癌組織中表達下調(diào),其異常表達能抑制肺鱗癌細(xì)胞的遷移和侵襲[12]?;谶@些研究結(jié)果,我們推測miR-146b-3p可能在肺癌中發(fā)揮重要作用。本研究探討miR-146b-3p差異表達對肺鱗癌細(xì)胞生物學(xué)行為的影響,并初步分析其可能的作用機制,以期為肺鱗癌的治療提供理論依據(jù)。
NCI-H226、NCI-H2170 細(xì)胞株購于中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院細(xì)胞資源中心;RPMI 1640培養(yǎng)基、AnnexinV-FITC 凋亡檢測試劑盒購于上海經(jīng)科化學(xué)科技有限公司;胎牛血清購于愛必信(上海)生物科技有限公司;細(xì)胞計數(shù)儀購于Invitrogen 有限公司;RNA 提取試劑TRIzol 及轉(zhuǎn)染試劑Lipofectamine 2000 均購自南京森貝伽生物科技有限公司;逆轉(zhuǎn)錄試劑盒Prime-ScriptTMRT Master Mix 購自上海妍琦生物科技有限公司,PCR 試劑盒Quanti Fast SYBR Green PCR Kit 購自武漢極捷生物科技有限公司;BCA 蛋白濃度測定試劑盒、SDS-PAGE 凝膠配制試劑盒購自北京伊塔生物科技有限公司;CCK-8 試劑盒購自上海吉至生化科技有限公司;BCL2、BAX、CCNB1、CDK2 多克隆抗體、LCN1多克隆抗體以及HRP 標(biāo)記的羊抗兔免疫球蛋白G(H+L)二抗購自上??泼羯锟萍加邢薰?;雙熒光素酶報告基因系統(tǒng)試劑盒購自成都安森盛源科技有限公司;ST-360 型酶標(biāo)儀購自上海晚成醫(yī)療器械有限公司;細(xì)胞周期試劑盒購于杭州聯(lián)科生物技術(shù)股份有限公司;ELx808 酶標(biāo)儀購自北京澤平科技有限責(zé)任公司;FACS VantageTM流式細(xì)胞儀購自南京華奧生物醫(yī)藥技術(shù)有限公司。
通過TCGA 在線數(shù)據(jù)庫下載肺鱗癌臨床樣本數(shù)據(jù),比較miR-146b-3p、LCN1在癌旁組織與肺鱗癌組織中的表達情況,并分析LCN1 與肺鱗癌患者臨床表型的關(guān)系。使用Kaplan-Meier Plotter 數(shù)據(jù)庫評估LCN1 mRNA水平對肺鱗癌患者總生存期的影響。利用Star-Base 數(shù)據(jù)庫在線預(yù)測靶基因數(shù)據(jù)庫預(yù)測miR-146b-3p的靶基因。
將NCI-H226、NCI-H2170 細(xì)胞接種至含10%胎牛血清的RPMI 1640 培養(yǎng)基,在37 ℃、5%CO2飽和濕度條件下培養(yǎng),待細(xì)胞貼壁生長,胰酶消化液消化后傳代培養(yǎng),實驗取對數(shù)生長期細(xì)胞。
采用TRIzol 法提取細(xì)胞或組織中的總RNA,采用紫外分光光度計法測定RNA 的濃度。按TaqMan?MicroRNA Reverse Transcription kit 逆轉(zhuǎn)錄試劑盒說明書以RNA 為模板進行逆轉(zhuǎn)錄獲得cDNA 并置于4 ℃保存,進行熒光定量PCR 擴增,反應(yīng)條件:95 ℃預(yù)變性10 min;95 ℃變性15 s,60 ℃退火45 s,65 ℃延伸1 min,4 ℃ 10 min,擴增40個循環(huán)。以β-actin 為內(nèi)參,miR-146b-3p 上 游 引 物 序 列 :5′-CCTGGCA CTGAGAACTGAAT-3′,下游序列:5′-GCACCAGAA CTGAGTCCACA-3′;β-actin 上游引物序列:5′-CATC CCTTCTCCCCACACAC-3′,下游序列:5′-AGTCCCAG GGCTTTGATTTG-3′。以2-ΔΔCt法計算miR-146b-3p 的相對表達水平。
將對數(shù)生長期的NCI-H2170 和NCI-H226 細(xì)胞分為miR-NC 組和miR-146b-3p 組,根據(jù)Lipofectamine 2000 說明書分別轉(zhuǎn)染miR-146b-3p NC 和miR-146b-3p質(zhì)粒,24 h后更換完全培養(yǎng)基。采用G418篩選出能夠穩(wěn)定過表達miR-146b-3p的NCI-H2170和NCI-H226細(xì)胞系。采用RT-PCR 檢測miR-146b-3p 水平以評估轉(zhuǎn)染效率。
將對數(shù)生長期的NCI-H2170 和NCI-H226 細(xì)胞分為shNC 組、shLCN1 1#組、shLCN1 2#組和miR-146b-3p+LCN1 組,并根據(jù)Lipofectamine 2000 說明書分別轉(zhuǎn)染shNC、shLCN1 1#、shLCN1 2#質(zhì)粒,24 h 后更換完全培養(yǎng)基。用嘌呤霉素篩選出穩(wěn)定敲低LCN1 的NCI-H2170 和NCI-H226 細(xì)胞系。采用Western blot 檢測LCN1 蛋白水平以評估轉(zhuǎn)染效率,篩選穩(wěn)定質(zhì)粒構(gòu)建miR-146b-3p+LCN1 組(共轉(zhuǎn)染miR-146b-3p+LCN1 2#質(zhì)粒)。
將miR-NC 組、miR-146b-3p 組、shNC 組、shLCN1 1#組、shLCN1 2#組和miR-146b-3p+LCN1 組細(xì)胞置于CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24 h,分別于0、1、2、3、4、5 d 時對細(xì)胞增殖活性進行檢測。每孔加入CKK-8 10 μL,在37 ℃、5%CO2的培養(yǎng)箱中繼續(xù)培養(yǎng)1 h,隨后用酶標(biāo)儀測定450 nm波長處的光密度(optical density,OD)值。
將miR-NC 組、miR-146b-3p 組、shNC 組、shLCN1 1#組、shLCN1 2#組和miR-146b-3p+LCN1 組細(xì)胞分別接種到6 孔板中,并輕輕轉(zhuǎn)動,使細(xì)胞分散均勻。用PBS 清洗3 次,再用40 g/L 多聚甲醛固定20 min。結(jié)晶紫染色液染色,光學(xué)顯微鏡下觀察細(xì)胞集落。
將miR-NC 組、miR-146b-3p 組、shNC 組、shLCN1 1#組、shLCN1 2#組和miR-146b-3p+LCN1 組細(xì)胞以1×105個/孔的密度接種于6 孔板,消化離心,棄去上清液,收集細(xì)胞團塊,PBS 重懸細(xì)胞,離心,清洗1 次,振蕩,使細(xì)胞沉淀充分分散,先加入300 μL、4 ℃預(yù)冷PBS,再將上樣管置于渦旋振蕩器上振蕩,加700 μL、4 ℃預(yù)冷的純乙醇沉懸,4 ℃固定過夜。第2天,離心棄去上清液,PBS洗1次,加500 μL PI染液,室溫避光孵育15 min,上流式細(xì)胞儀檢測,用Flowjo 軟件分析細(xì)胞周期時相分布。
取miR-NC 組、miR-146b-3p 組、shNC 組、shLCN1 1#組、shLCN1 2#組和miR-146b-3p+LCN1 組細(xì)胞進行消化、離心、重懸。將細(xì)胞接種于6 孔板內(nèi)并置于37 ℃、5%CO2的培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24 h。以1 500 r/min 離心10 min 去除上清液。加入5 μL AnnexinV-FITC 混勻,再加入5 μL PI混勻,隨后室溫下避光孵育15 min。采用流式細(xì)胞儀檢測細(xì)胞凋亡情況。
構(gòu)建野生型報告基因載體LCN1-WT 與突變型報告基因載體LCN1-MT,將載體分別與miR-NC 或miR-146b-3p 共轉(zhuǎn)染到肺鱗癌細(xì)胞中。置于37 ℃、5%CO2培養(yǎng)箱繼續(xù)培養(yǎng)48 h,用雙熒光素酶檢測試劑盒測量各組細(xì)胞中的熒光素酶活性。
16 只裸鼠購自成都達碩實驗動物有限公司,動物生產(chǎn)許可證號:SCXK(川)2020-030,在標(biāo)準(zhǔn)環(huán)境中飼養(yǎng),自由采食飲水。將小鼠分為對照組和觀察組,每組8 只,對照組裸鼠于右側(cè)腹股溝皮下注射0.2 m L(1×107/mL)轉(zhuǎn)染miR-NC 的NCI-H2170 細(xì)胞懸液,觀察組裸鼠于右側(cè)腹股溝皮下注射0.2 mL(1×107/mL)已轉(zhuǎn)染miR-146b-3 的NCI-H2170 細(xì)胞懸液。待成瘤后,每2 d 用微米卡尺測量腫瘤體積,于第2 周末處死小鼠,剝離移植瘤并稱重,RT-PCP 檢測移植瘤組織中miR-146b-3p的表達。
收集miR-NC組、miR-146b-3p組、shNC組、shLCN1 1#組、shLCN1 2#組、miR-146b-3p+LCN1組對數(shù)生長期的NCI-H2170 和NCI-H226 細(xì)胞,加入SDS Loading buffer,沸水浴中煮沸10 min,電泳后轉(zhuǎn)至PVDF 膜,用5%脫脂牛奶室溫封閉1 h。加入用封閉液稀釋的抗體(1∶5 000),4 ℃孵育過夜。次日PBS 洗滌6 min,重復(fù)3 次,然后加入封閉液稀釋的HRP 標(biāo)記的羊抗兔二抗(1∶1 000),室溫孵育60 min,PBS 洗滌6 min,重復(fù)3 次,ECL 化學(xué)發(fā)光液進行顯影,以β-actin 作為內(nèi)參,利用BCA 蛋白檢測試劑盒檢測蛋白濃度,具體操作遵照試劑盒說明書進行。
數(shù)據(jù)采用SPSS 17.0 軟件進行統(tǒng)計學(xué)處理,計量資料以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(±s)表示,2 組間的表達差異采用t檢驗分析,多組間比較采用單因素方差分析。Kaplan-Meier生存曲線分析患者總生存期。P<0.05 表示差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。
GEO數(shù)據(jù)庫分析顯示,肺鱗癌組織中miR-146b-3p表達水平明顯低于癌旁組織(P<0.05)。RT-PCR 實驗結(jié)果顯示,miR-146b-3p 組中miR-146b-3p 表達明顯高于miR-NC 組(P<0.05)。細(xì)胞增殖實驗結(jié)果顯示,與miR-NC 組相比,miR-146b-3p 組增殖能力明顯降低(P<0.05)。細(xì)胞克隆實驗結(jié)果顯示,與miR-NC 組相比,miR-146b-3p 組克隆細(xì)胞數(shù)明顯減少(P<0.05)。細(xì)胞周期實驗結(jié)果顯示,與miR-NC組相比,miR-146b-3p組G0/G1 期細(xì)胞數(shù)明顯增加(P<0.05),S 期細(xì)胞數(shù)明顯減少(P<0.05)。細(xì)胞凋亡實驗結(jié)果顯示,與miRNC 組相比,miR-146b-3p 組細(xì)胞凋亡率明顯增高(P<0.05)。Western blot結(jié)果顯示,與miR-NC組相比,miR-146b-3p 組細(xì)胞BCL2、CCNB1 和CDK2 蛋白減少(P<0.05),BAX蛋白增加(P<0.05),見圖1。
圖1 miR-146b-3p抑制肺鱗癌細(xì)胞增殖并促進其凋亡
裸鼠移植瘤實驗結(jié)果顯示,觀察組移植瘤體積(468.57±50.63)mm3和體質(zhì)量(0.38±0.04)g明顯小于對照組的體積(287.91±50.63)mm3和體質(zhì)量(0.19±0.02)g(P<0.05)。隨著時間的推移,移植瘤體積不斷增大,但是觀察組的增長速度明顯慢于對照組(P<0.05)。RT-PCR 結(jié)果顯示,在裸鼠移植瘤組織中,觀察組中miR-146b-3p mRNA 相對表達量明顯高于對照組(P<0.05),見圖2。
生物信息學(xué)分析結(jié)果表明,miR-146b-3p 序列3′-UTR 區(qū)與LCN1 存在結(jié)合位點。雙熒光素酶報告實驗顯示,miR-146b-3p mimic 與LCN1-WT 共轉(zhuǎn)染致熒光素酶活性降低(P<0.05)。Western blot 和RTPCR實驗結(jié)果顯示,與miR-NC組相比,miR-146b-3p組中LCN1 mRNA 和蛋白表達水平明顯降低(P<0.05),見圖3。
圖3 miR-146b-3p與LCN1的靶向關(guān)系
TCGA 數(shù)據(jù)庫分析顯示,肺鱗癌組織中LCN1 表達高于癌旁組織(P<0.05),M1 期患者LCN1 表達高于M0 期患者(P<0.05),預(yù)后不良患者LCN1 表達高于預(yù)后良好患者(P<0.05),LCN1 高表達患者總生存率明顯低于LCN1低表達患者(P<0.05),見圖4。
圖4 LCN1在肺鱗癌不同臨床特征患者癌組織中的表達水平
Western blot 實驗結(jié)果顯示,與shNC 組相比,shLCN1 1#組和shLCN1 2#組中LCN1 蛋白表達明顯降低(P<0.05)。細(xì)胞增殖實驗結(jié)果顯示,與shNC組相比,shLCN1 1#組和shLCN1 2#組中細(xì)胞增殖能力降低(P<0.05)。細(xì)胞克隆實驗結(jié)果顯示,與shNC 組相比,shLCN1 1#組和shLCN1 2#組中克隆細(xì)胞數(shù)明顯減少(P<0.05)。細(xì)胞周期實驗結(jié)果顯示,與shNC組相比,shLCN1 1#組和shLCN1 2#組G0/G1 期細(xì)胞數(shù)明顯增加,S 期細(xì)胞數(shù)明顯減少(P<0.05)。細(xì)胞凋亡實驗結(jié)果顯示,與shNC 組相比,shLCN1 1#組和shLCN1 2#組中凋亡率明顯增高(P<0.05),見圖5。
圖5 敲低LCN1表達抑制肺鱗癌細(xì)胞增殖并促進其凋亡
Western blot 實驗結(jié)果顯示,與miR-NC 組及miR-146b-3p+LCN1組相比,miR-146b-3p組中LCN1蛋白相對表達水平下降(P<0.05)。細(xì)胞增殖實驗結(jié)果表明,與miR-NC 組及miR-146b-3p+LCN1 組相比,miR-146b-3p 組中增殖能力降低(P<0.05)。細(xì)胞克隆實驗結(jié)果顯示,與miR-NC 組及miR-146b-3p+LCN1 組相比,miR-146b-3p組中克隆細(xì)胞數(shù)明顯減少(P<0.05)。細(xì)胞周期實驗結(jié)果顯示,與miR-NC 組及miR-146b-3p+LCN1 組相比,miR-146-3p 組中G0/G1 期細(xì)胞數(shù)量明顯增加,S 期細(xì)胞數(shù)量明顯減少(P<0.05)。細(xì)胞凋亡實驗結(jié)果顯示,與miR-NC 組及miR-146b-3p+LCN1組相比,miR-146b-3p組中凋亡細(xì)胞數(shù)明顯增加(P<0.05),見圖6。
圖6 miR-146b-3p靶向LCN1抑制肺鱗癌細(xì)胞增殖并促進其凋亡
肺鱗癌是非小細(xì)胞肺癌的常見類型,早期并無明顯特異性,確診時大多已處于中晚期,錯過了最佳手術(shù)時機,因而通常采取化療等保守治療,但長期使用各種類型的抗癌藥物會導(dǎo)致機體出現(xiàn)耐藥性,從而影響治療效果[13-17]。隨著腫瘤精準(zhǔn)治療的快速發(fā)展,對腫瘤生物學(xué)行為和基因的調(diào)控成為了研究重點。其中miRNA 在腫瘤細(xì)胞增殖、遷移、侵襲、分化、凋亡、化療耐藥等多種生理過程中起到關(guān)鍵作用[18-19]。本研究旨在尋找影響肺鱗癌生物學(xué)行為的潛在標(biāo)志物,為臨床治療提供理論依據(jù)。
本研究通過生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),miR-146b-3p在肺鱗癌組織中低表達;LCN1 在肺鱗癌組織中高表達,且LCN1 差異表達與肺鱗癌臨床預(yù)后不良及M 分期有關(guān)。構(gòu)建miR-146b-3p 過表達細(xì)胞模型進行一系列體外功能試驗,結(jié)果顯示,肺鱗癌細(xì)胞過表達miR-146b-3p后,miR-146b-3p表達水平增加,細(xì)胞增殖和克隆能力降低,細(xì)胞周期受到阻滯,細(xì)胞凋亡明顯增加,提示miR-146b-3p 過表達可抑制肺鱗癌細(xì)胞增殖,阻滯細(xì)胞周期,并誘導(dǎo)腫瘤細(xì)胞凋亡。進一步行Western blot分析顯示,肺鱗癌細(xì)胞過表達miR-146b-3p后,細(xì)胞BCL2、CCNB1和CDK2蛋白減少,BAX 蛋白增加,表明過表達miR-146b-3p 可調(diào)節(jié)肺鱗癌細(xì)胞凋亡相關(guān)蛋白表達。促凋亡蛋白BAX 和抗凋亡蛋白BCL2在凋亡信號介導(dǎo)的凋亡過程中起關(guān)鍵作用,BAX 過表達可拮抗BCL2 表達,促進細(xì)胞凋亡。因此,上調(diào)BCL2 表達、下調(diào)BAX 表達可抑制細(xì)胞凋亡。眾所周知,miRNA 通過抑制或降解靶基因mRNA 發(fā)揮生物學(xué)功能[14]。既往研究顯示,miR-146b-5p 可通過靶向調(diào)節(jié)ZNRF2 表達誘導(dǎo)乳腺癌細(xì)胞增殖、遷移和侵襲[20]。因此,結(jié)合本研究結(jié)果推測miR-146b-3p 可抑制肺鱗癌細(xì)胞增殖,調(diào)節(jié)細(xì)胞周期相關(guān)蛋白,進而阻滯細(xì)胞周期,并通過上調(diào)BAX 和下調(diào)BCL2蛋白表達誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡。本研究通過裸鼠移植瘤實驗進一步發(fā)現(xiàn),miR-146b-3p 過表達可抑制裸鼠移植瘤的生長,證實了miR-146b-3p 過表達在肺鱗癌中發(fā)揮抑制作用。
LCN1 是脂質(zhì)運載蛋白家族的成員,是淚液中重要的脂質(zhì)結(jié)合蛋白,分布在多種組織和腺體中,并與多種疾病的發(fā)生有關(guān)[21-22]。既往研究顯示,LCN1 在乳腺癌中高表達,且其異常表達與臨床病理特征和生存率較低有關(guān)[23]。本研究通過miRNA 靶基因數(shù)據(jù)庫預(yù)測miR-146b-3p 調(diào)控肺鱗癌細(xì)胞的靶基因,結(jié)果顯示,miR-146b-3p 存在與LCN1 靶向結(jié)合的位點,LCN1 是miR-146b-3p 的靶基因。Western blot 結(jié)果顯示,miR-146b-3p 組中LCN1 蛋白表達水平明顯低于miR-NC組,推測miR146b-3p 可以調(diào)控LCN1 蛋白表達。本研究發(fā)現(xiàn),肺鱗癌組織中LCN1 表達高于癌旁組織,且與肺鱗癌患者M 分期存在一定關(guān)聯(lián)。為進一步分析LCN1 在肺鱗癌中發(fā)揮的生物學(xué)功能,本研究通過構(gòu)建LCN1 敲低細(xì)胞模型進行體外功能實驗,結(jié)果顯示,LCN1 敲低可以抑制肺鱗癌細(xì)胞生長、增殖,阻滯細(xì)胞周期,并誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡。提示LCN1 在肺鱗癌中高表達,敲低LCN1表達可影響肺鱗癌生物學(xué)行為。
本研究結(jié)果顯示,miR-146b-3p 過表達降低了肺鱗癌細(xì)胞增殖能力,減少了克隆細(xì)胞數(shù),阻滯了細(xì)胞生長周期,增加了凋亡細(xì)胞數(shù)量;而miR-146b-3p 和LCN1 共轉(zhuǎn)染后,逆轉(zhuǎn)了miR-146b-3p 對肺鱗癌的抑制作用。故我們推測,miR-146b-3p 在肺鱗癌中發(fā)揮促癌作用,其可能通過靶向抑制LCN1 表達調(diào)控肺鱗癌生物學(xué)行為。
綜上,本研究發(fā)現(xiàn)miR-146b-3p 在肺鱗癌細(xì)胞中低表達,LCN1在肺鱗癌細(xì)胞中高表達,且miR-146b-3p與LCN1 存在靶向結(jié)合位點。上調(diào)miR-146b-3p 可以抑制肺鱗癌細(xì)胞增殖,誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡,并影響細(xì)胞生長周期。而miR-146b-3p 過表達可以抑制移植瘤生長,其作用機制可能是通過靶向LCN1實現(xiàn)的。