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        雞PPARγ基因轉(zhuǎn)錄本5的兩個(gè)上游開(kāi)放閱讀框功能分析

        2023-02-07 06:27:32婁鈺琦褚衍凱黃佳新徐海冬羅昊玉
        關(guān)鍵詞:報(bào)告基因突變型載體

        王 寧 ,婁鈺琦 ,褚衍凱 ,黃佳新 ,徐海冬 ,羅昊玉 ,婁 明 ,牟 芳

        (1.農(nóng)業(yè)農(nóng)村部雞遺傳育種重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,哈爾濱 150030;2.黑龍江省普通高等學(xué)校動(dòng)物遺傳育種與繁殖重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,哈爾濱 150030;3.東北農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科學(xué)技術(shù)學(xué)院,哈爾濱 150030)

        過(guò)氧化物酶體增殖物激活受體γ(Peroxisome proliferator-activated receptor gamma,PPARγ)是配體激活型轉(zhuǎn)錄因子,被配體激活后,PPARγ 與RXRα結(jié)合形成異二聚體,特異性結(jié)合于靶基因調(diào)控區(qū)PPAR 反應(yīng)元件,調(diào)控靶基因轉(zhuǎn)錄[1]。PPARγ是脂肪生成的重要調(diào)控因子,對(duì)維持正常胰島素敏感性及葡萄糖、脂質(zhì)穩(wěn)態(tài)至關(guān)重要[2]。此外,PPARγ 與肥胖癥、Ⅱ型糖尿病等代謝性疾病發(fā)生發(fā)展關(guān)系密切[3]。

        真核生物基因5'非翻譯區(qū)(5' untranslated region,5'UTR)在基因轉(zhuǎn)錄后調(diào)控中發(fā)揮重要作用,調(diào)控mRNA 穩(wěn)定性、運(yùn)輸、定位及翻譯效率等[4-5]。5'UTR 調(diào)控作用依賴于其所包含的順式調(diào)控元件,目前已鑒定出的5'UTR順式調(diào)控元件包括RNA G-四鏈體(G-quadruplexes,RG4)、內(nèi)部核糖體進(jìn)入位點(diǎn)(Internal ribosomal entry sites,IRES)、上游起始密碼子(Upstream start codons,uAUG)及上游開(kāi)放閱讀框(Upstream open reading frames,uORF)等[6]。PPARγ基因受多個(gè)啟動(dòng)子調(diào)控,例如人和小鼠PPARγ基因分別存在4個(gè)和2個(gè)啟動(dòng)子[7-8]。由于多啟動(dòng)子使用和選擇性拼接,導(dǎo)致人PPARγ基因至少產(chǎn)生7個(gè)5'UTR不同轉(zhuǎn)錄異構(gòu)體[9]。PPARγ基因 mRNA 和蛋白半衰期均較短[10],提示轉(zhuǎn)錄后調(diào)控在PPARγ基因表達(dá)中發(fā)揮重要作用。雞PPARγ基因有3 個(gè)啟動(dòng)子,產(chǎn)生5 個(gè)5'UTR不同的PPARγ轉(zhuǎn)錄本(cPPARγs1-5)[11]。雞PPARγ基因轉(zhuǎn)錄本 1(cPPARγ1)和PPARγ基因轉(zhuǎn)錄本 3(cPPARγ3)分別具有一個(gè)uORF,研究發(fā)現(xiàn)cPPARγ1 和cPPARγ3 的 uORF 均 抑 制 雞PPARγ基 因 翻譯[10,12]。雞PPARγ轉(zhuǎn)錄本 5(cPPARγ5)的 5'UTR 具有兩個(gè) uORFs,但這兩個(gè) uORFs 對(duì)雞PPARγ基因表達(dá)的影響尚不清楚。本研究采用報(bào)告基因和定點(diǎn)突變等技術(shù),開(kāi)展cPPARγ5 兩個(gè)uORFs 功能分析。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)材料

        pcDNA3.1(+)真核表達(dá)載體(購(gòu)自美國(guó)Invitrogen 公司), pGL3-basic 熒光素酶報(bào)告基因載體(購(gòu)自美國(guó)Promega 公司),海腎報(bào)告基因載體pGL3-TK(購(gòu)自美國(guó)Promega 公司),5'UTR 轉(zhuǎn)錄后分析用報(bào)告基因載體psiCHECK2(本實(shí)驗(yàn)室保存)[12]。雞永生化前脂肪細(xì)胞系ICP1(本實(shí)驗(yàn)室保存),雞胚成纖維細(xì)胞系DF1(購(gòu)自中國(guó)科學(xué)院上海生科院細(xì)胞資源中心)。

        1.2 引物設(shè)計(jì)及合成

        根據(jù)Promega公司提供的psiCHECK2報(bào)告基因載體序列信息,設(shè)計(jì)hRluc和hFluc基因qRT-PCR表達(dá)檢測(cè)引物hRluc-F1/R1 和hFluc-F1/R1。根據(jù)已報(bào)道雞PPARγ基因轉(zhuǎn)錄本序列(NM_0010 01460.1),設(shè)計(jì)全長(zhǎng)編碼區(qū)(CDS)克隆引物cPPARγ-F/R。根據(jù)已報(bào)道雞cPPARγ5 mRNA 序列(GenBank 登錄號(hào):KP736525),設(shè)計(jì) cPPARγ5 的5'UTR 區(qū)克隆引物 cPPARγ5-F1/R1 和 qRT-PCR 表達(dá)檢測(cè)引物cPPARγ5-F2/R2。hRluc基因qRT-PCR表達(dá)檢測(cè)選擇hFluc基因作為內(nèi)參基因;雞PPARγ基因qRT-PCR 表達(dá)檢測(cè)選擇NONO基因(TATA-binding protein gene)作為內(nèi)參基因。利用Primer Premier 5.0軟件進(jìn)行引物設(shè)計(jì),使用NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)BLAST檢測(cè)引物特異性,引物信息見(jiàn)表1。

        表1 引物信息Table 1 Primers used in this study

        1.3 載體構(gòu)建

        1.3.1cPPARγ5 的 5'UTR 及其 uORF 突變的報(bào)告基因載體構(gòu)建

        cPPARγ5 野生型 5'UTR 片段及其 3 個(gè) uORF 突變型5'UTR片段由蘇州金唯智生物科技有限公司合成。uORF 突變是指uATG 突變?yōu)閡TGA,這3 個(gè)uORF 突變型5'UTR 片段分別是兩個(gè)uORFs 單獨(dú)突變型5'UTR片段(M1和M2)及兩個(gè)uORFs同時(shí)突變型5'UTR 片段(M12)。將這些合成的突變型5'UTR片段和野生型5'UTR 片段分別插入到psi-CHECK2M載體hRluc基因上游NheⅠ酶切位點(diǎn),得到重組質(zhì)粒psiCHECK2M-cPPARγ5-5'UTR-WT、psiCHECK2M-cPPARγ5-5'UTR-M12、psiCHECK-2M-cPPARγ5-5'UTR-M1和psiCHECK2M-cPPARγ5-5'UTR-M2,送至蘇州金唯智生物科技有限公司測(cè)序,驗(yàn)證無(wú)誤后用于后續(xù)研究。

        1.3.2 野生型和uORF突變型cPPARγ5真核表達(dá)載體構(gòu)建

        利用引物cPPARγ-F/R,以ICP1 細(xì)胞cDNA 為模板擴(kuò)增雞PPARγ基因CDS片段(兩端攜帶EcoRⅠ和XhoⅠ酶切位點(diǎn)),將其插入到pcDNA3.1 表達(dá)載體EcoRⅠ和XhoⅠ酶切位點(diǎn),將載體命名為pcDNA3.1-CDS。然后將合成的雞cPPARγ5 轉(zhuǎn)錄本野生型 5'UTR 片段和 3 個(gè) uORF 突變型 5'UTR 片段(兩端攜帶NheⅠ和XhoⅠ酶切位點(diǎn))分別插入到pcDNA3.1-CDS 載體NheⅠ和XhoⅠ酶切位點(diǎn),得到重組質(zhì)粒pcDNA3.1-cPPARγ5-WT、pcDNA3.1-cPPARγ5-M12、pcDNA3.1-cPPARγ5-M1 和 pcDNA3.1-cPPARγ5-M2,送至蘇州金唯智生物科技有限公司測(cè)序,驗(yàn)證無(wú)誤后用于后續(xù)研究。

        1.3.3cPPARγ5 的 5'UTR 及其 uORF 突變的啟動(dòng)子報(bào)告基因載體構(gòu)建

        將合成的cPPARγ5 野生型 5'UTR 片段和 3 個(gè)uORF突變型5'UTR片段(兩端攜帶XhoⅠ和HindⅢ酶切位點(diǎn))分別插入到pGL3-basic 報(bào)告基因載體XhoⅠ和HindⅢ酶切位點(diǎn),得到重組質(zhì)粒pGL3-basic-cPPARγ5-WT、pGL3-basic-cPPARγ5-M12、pGL3-basic-cPPARγ5-M1 和 pGL3-basic-cPPARγ 5-M2,送至蘇州金唯智生物科技有限公司測(cè)序,驗(yàn)證無(wú)誤后用于后續(xù)研究。

        1.4 細(xì)胞培養(yǎng)

        ICP1 細(xì)胞培養(yǎng)在DMEM/F12 完全培養(yǎng)基中,DF1 細(xì)胞培養(yǎng)在DMEM High Glucose 完全培養(yǎng)基中,這兩種培養(yǎng)基均含有1%青鏈霉素和10%胎牛血清。放置在含5% CO2的37 ℃細(xì)胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng),24~48 h傳代一次。

        1.5 雙熒光素酶報(bào)告基因活性檢測(cè)

        將ICP1 和DF1 細(xì)胞分別接種于24 孔板中,待細(xì)胞生長(zhǎng)至70%匯合度時(shí),按照LipofectamineTM2000 Transfection Reagen(tInvitrogen,美國(guó))說(shuō)明書(shū)操作,將構(gòu)建完成的報(bào)告基因載體分別轉(zhuǎn)染細(xì)胞,轉(zhuǎn)染48 h 時(shí)利用Dual-Luciferase?Reporter Assay System(Promega,美國(guó))試劑盒,按照說(shuō)明書(shū)檢測(cè)報(bào)告基因活性。cPPARγ5 的 5'UTR 及其 uORF 突變報(bào)告基因載體和啟動(dòng)子報(bào)告基因載體分別利用螢火蟲(chóng)熒光素酶(hFluc)活性和海腎熒光素酶(hRluc)活性進(jìn)行校正,其相對(duì)活性分別為hRluc/hFluc和hFluc/hRluc。

        1.6 總RNA 提取和qRT-PCR檢測(cè)

        利用RNeasy Plus Mini Kit(QIAGEN,德國(guó))試劑盒,按照說(shuō)明書(shū)提取總RNA。利用Prime-ScriptTMRT reagent Kit with gDNA Eraser(Perfect Real Time)(購(gòu)自寶日醫(yī)生物技術(shù)(北京)有限公司)試劑盒,按照說(shuō)明書(shū)進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄。使用ABI 7500實(shí)時(shí)熒光定量PCR 儀進(jìn)行qRT-PCR 反應(yīng),反應(yīng)體系為:cDNA模板(50 ng·μL-1)1 μL,F(xiàn)ast Start Universal SYBR Green Master(ROX)(2×)5 μL,上下游引 物(10 μmol·L-1)各 0.2 μL, 滅 菌 蒸 餾 水3.6 μL。反應(yīng)條件為:95 ℃ 預(yù)變性 10 min;95 ℃變性15 s,60 ℃復(fù)性延伸40 s,共40 個(gè)循環(huán)。分別以NONO和hFluc基因?yàn)閮?nèi)參基因,PPARγ和hFluc基因相對(duì)表達(dá)量計(jì)算方法為2-ΔΔCt。

        1.7 Western blot分析

        使用PBS 清洗3 遍細(xì)胞,加入含有PMSF(1 mmol·L-1)的RIPA 細(xì)胞裂解液(購(gòu)自碧云天生物技術(shù)有限公司),吹打混勻后于冰上孵育15min,充分裂解細(xì)胞,12 000 r·min-1離心5 min,取上清,利用BCA法測(cè)定樣品蛋白濃度。然后取20 μg樣品蛋白進(jìn)行12%SDS-PAGE電泳分離,結(jié)束后將樣品轉(zhuǎn)至NC 膜上,置于5%脫脂奶粉中室溫封閉1 h;將膜用 PBST 洗滌后加入 1∶1 000 稀釋的雞 PPARγ 一抗(購(gòu)自北京中杉金橋生物技術(shù)有限公司),室溫震蕩孵育2 h;將膜用PBST 洗滌后加入1∶5 000 稀釋的HRP標(biāo)記的二抗(山羊抗兔)(購(gòu)自北京中杉金橋生物技術(shù)有限公司),室溫震蕩孵育1 h,將膜用PBST洗滌后進(jìn)行ECL顯色反應(yīng)。

        1.8 mRNA穩(wěn)定性檢測(cè)

        將cPPARγ5 的野生型 5'UTR 及其 uORF 突變的報(bào)告基因載體分別轉(zhuǎn)染細(xì)胞,轉(zhuǎn)染24 h 后,加入放線菌素D 至終濃度為5 μg·mL-1,分別處理0(對(duì)照)、3、6、9 和12 h。收集細(xì)胞,提取細(xì)胞總RNA,利用PrimeScriptTMRT reagent Kit with gDNA Eraser(Perfect Real Time)(購(gòu)自寶日醫(yī)生物技術(shù)(北京)有限公司)試劑盒,按照說(shuō)明書(shū)進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄。利用qRT-PCR 檢測(cè)hRluc基因mRNA 表達(dá),以hFluc基因?yàn)閮?nèi)參基因,以0 h的mRNA表達(dá)量作為標(biāo)準(zhǔn),利用2-ΔΔCt分別計(jì)算各報(bào)告基因載體hRluc基因mRNA半衰期。

        1.9 數(shù)據(jù)分析

        本研究qRT-PCR 數(shù)據(jù)和熒光素酶相對(duì)活性試驗(yàn)數(shù)據(jù)均使用Graphpad Prism 7.0 軟件分析顯著性,數(shù)據(jù)表示為平均值(Mean)±標(biāo)準(zhǔn)誤(SEM)。使用Student'st-test進(jìn)行差異分析,*P<0.05表示差異顯著,**P<0.01 表示差異極顯著。使用線性回歸分析法進(jìn)行uORF對(duì)hRluc基因mRNA穩(wěn)定性分析。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 cPPARγ5 5'UTR區(qū)uORF分析

        雞cPPARγ5 的 5'UTR 序 列 長(zhǎng) 度 為 252 nt(KP736525)。生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),該5'UTR 存在兩個(gè)uORFs,分別位于-213/-199 和-168/-139區(qū),命名為uORF1和uORF2(見(jiàn)圖1)。

        圖1 雞PPARγ基因轉(zhuǎn)錄本5(cPPARγ5)5'UTR區(qū)的uORF分析Fig.1 uORF analysis of the 5'UTR of chicken PPARγ transcript variant 5(cPPARγ5)

        2.2 cPPARγ5的uORF對(duì)報(bào)告基因表達(dá)的影響

        為探索雞cPPARγ5 兩個(gè)uORFs 功能,分別構(gòu)建野生型5'UTR(psi-CHECK2M-cPPARγ5-5'UTRWT)、兩個(gè)uORFs單獨(dú)突變(psiCHECK2M-cPPARγ 5-5'UTR-M1 和 psiCHECK2M-cPPARγ5-5'UTRM2)以及兩者同時(shí)突變(psiCHECK2M-cPPARγ5-5'UTR-M12)的報(bào)告基因載體。將這些報(bào)告基因載體分別轉(zhuǎn)染DF1 和ICP1 細(xì)胞,48 h 后檢測(cè)報(bào)告基因活性。結(jié)果顯示,在DF1和ICP1細(xì)胞中,uORF1 和uORF2 單獨(dú)突變型(psiCHECK2M-cPPARγ 5-5'UTR-M1 和 psiCHECK2M-cPPARγ5-5'UTRM2)報(bào)告基因活性均顯著或極顯著高于野生型(psiCHECK2M-cPPARγ5-5'UTR-WT)報(bào)告基因活性;uORFs 雙突變型(psiCHECK2M-cPPARγ5-5'UTR-M12)報(bào)告基因活性極顯著高于psiCHECK 2M-cPPARγ5-5'UTR-M1 和psiCHECK2M-cPPARγ 5-5'UTR-M2 報(bào)告基因活性,如圖2A 所示。其中,在DF1 細(xì)胞中,uORFs 雙突變型、uORF1 和uORF2 單獨(dú)突變型報(bào)告基因活性分別為野生型報(bào)告基因活性的2.8、2.0 和1.4 倍。在ICP1 細(xì)胞中,uORFs 雙突變型、uORF1 和uORF2 單獨(dú)突變型報(bào)告基因活性分別為野生型報(bào)告基因活性的8.5、6.8 和2.8 倍,數(shù)據(jù)說(shuō)明這兩個(gè)uORFs 具有協(xié)同作用。

        為進(jìn)一步了解uORF抑制報(bào)告基因活性分子機(jī)制,采用qRT-PCR 檢測(cè)各個(gè)報(bào)告基因載體轉(zhuǎn)染細(xì)胞的hRluc基因mRNA 表達(dá)情況。結(jié)果發(fā)現(xiàn),在DF1 細(xì)胞中,uORF1 突變型報(bào)告基因載體(psi-CHECK2M-cPPARγ5-5'UTR-M1)轉(zhuǎn)染細(xì)胞的hRluc基因mRNA 表達(dá)水平顯著高于野生型,uORF2 突變型報(bào)告基因載體(psiCHECK2M- cPPARγ5-5'UTR-M2)和uORFs 雙突變型報(bào)告基因載體(psi-CHECK2M-cPPARγ5- 5'UTR-M12)轉(zhuǎn)染細(xì)胞的hRluc基因mRNA表達(dá)水平無(wú)顯著變化。在ICP1細(xì)胞中,uORF1突變型報(bào)告基因載體(psiCHECK2M-cPPARγ5-5'UTR-M1)和uORF2 突變型報(bào)告基因載體(psiCHECK2M-cPPARγ5-5'UTR-M2)轉(zhuǎn)染細(xì)胞的hRluc基因mRNA 表達(dá)水平顯著高于野生型,如圖2B 所示,uORFs 雙突變型報(bào)告基因載體(psi-CHECK2M-cPPARγ5-5'UTR-M12)轉(zhuǎn) 染 細(xì) 胞 的hRluc基因mRNA 表達(dá)水平無(wú)顯著變化。對(duì)比雙熒光素酶報(bào)告基因活性檢測(cè)結(jié)果(見(jiàn)圖2A)和hRluc基因mRNA表達(dá)分析結(jié)果(見(jiàn)圖2B),雖然uORF突變后hRluc基因mRNA表達(dá)在DF1和ICP1細(xì)胞中均升高,但mRNA 表達(dá)升高幅度遠(yuǎn)小于報(bào)告基因活性。與野生型相比,在DF1 細(xì)胞中,uORF1 突變型轉(zhuǎn)染細(xì)胞的hRluc基因mRNA 表達(dá)僅是野生型的1.2倍;在ICP1細(xì)胞中,uORF2突變型和uORFs雙突變型轉(zhuǎn)染細(xì)胞的hRluc基因mRNA 表達(dá)僅是野生型的1.15 倍。綜上,這兩個(gè)uORFs 突變主要抑制下游主閱讀框(Main open reading frame,mORF)翻譯。

        圖2 uORF突變對(duì)報(bào)告基因活性和報(bào)告基因mRNA表達(dá)的影響Fig.2 Effects of uORF mutation on activity and mRNA expression of reporter gene

        2.3 cPPARγ5 的 uORF 對(duì) mRNA 穩(wěn)定性調(diào)控分析

        在ICP1 細(xì)胞中,uORF1 單突變以及uORF1 和uORF2 雙突變導(dǎo)致hRluc基因mRNA 表達(dá)水平升高(見(jiàn)圖2B),推測(cè)cPPARγ5的uORF可能影響mRNA穩(wěn)定性。為驗(yàn)證這一推測(cè),分別檢測(cè)3 種uORF 突變型對(duì)hRluc基因mRNA 穩(wěn)定性的影響。半衰期測(cè)定結(jié)果顯示,野生型報(bào)告基因載體(psiCHECK2M-cPPARγ5-5'UTR-WT)轉(zhuǎn) 染 細(xì) 胞 的hRluc基 因mRNA 半衰期為7.20 h,uORFs 雙突變型報(bào)告基因載體(psiCHECK2M-cPPARγ5-5'UTR-M12)轉(zhuǎn)染細(xì)胞的hRluc基因 mRNA 半衰期為 7.43 h(見(jiàn)圖 3A),uORF1 突變型報(bào)告基因載體(psiCHECK2M-cPPARγ5-5'UTR-M1)轉(zhuǎn)染細(xì)胞的hRluc基因mRNA半衰期為6.15 h(見(jiàn)圖3B),uORF2突變型報(bào)告基因載體(psiCHECK2M-cPPARγ5-5'UTR-M2)轉(zhuǎn)染細(xì)胞的hRluc基因 mRNA 的半衰期為 8.35 h(見(jiàn)圖 3C)。與野生型相比,這3 種uORF 突變型報(bào)告基因載體轉(zhuǎn)染細(xì)胞的hRluc基因mRNA 降解速率均無(wú)顯著差異,說(shuō)明cPPARγ5 的兩個(gè) uORFs 對(duì) mRNA 穩(wěn)定性無(wú)顯著影響。

        圖3 uORF突變對(duì)報(bào)告基因mRNA穩(wěn)定性的影響Fig.3 Effects of uORF mutation on mRNA stability of reporter gene

        2.4 cPPARγ5 的 uORF 對(duì) PPARγ 基因的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控

        為排除uORF 僅在報(bào)告基因表達(dá)中發(fā)揮作用,進(jìn)一步分析這兩個(gè)uORFs 對(duì)PPARγ基因表達(dá)的影響。將構(gòu)建的真核表達(dá)載體pcDNA3.1-cPPARγ5-WT、 pcDNA3.1-cPPARγ5-M12、 pcDNA3.1-cPPARγ5-M1 和 pcDNA3.1-cPPARγ5-M2 分別轉(zhuǎn)染DF1和ICP1細(xì)胞,采用qRT-PCR和Western blot 分別檢測(cè)雞PPARγ基因mRNA 和蛋白表達(dá)。qRTPCR 結(jié)果顯示,在ICP1 細(xì)胞中,與野生型相比,uORF1 突變型表達(dá)載體(pcDNA3.1-cPPARγ5-M1)轉(zhuǎn)染細(xì)胞的PPARγ基因mRNA 表達(dá)水平顯著增加(P<0.05),但上調(diào)幅度較小;uORF2突變型表達(dá)載體(pcDNA3.1-cPPARγ5-M2)和uORFs 雙突變型表達(dá)載體(pcDNA3.1-cPPARγ5-M12)轉(zhuǎn)染細(xì)胞的PPARγ基因mRNA 表達(dá)呈上調(diào)趨勢(shì),但無(wú)顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)變化(見(jiàn)圖4A)。在DF1 細(xì)胞中,uORF1 突變型表達(dá)載體(pcDNA3.1-cPPARγ5-M1)和uORFs雙突變型表達(dá)載體(pcDNA3.1-cPPARγ5-M12)轉(zhuǎn)染細(xì)胞的PPARγ基因mRNA 表達(dá)顯著升高,但上調(diào)幅度較小;uORF2 突變型表達(dá)載體(pcDNA3.1-cPPARγ5-M2)轉(zhuǎn)染細(xì)胞的PPARγ基因mRNA 表達(dá)無(wú)顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)變化(見(jiàn)圖4A)。Western blot 結(jié)果顯示,在ICP1 和DF1 細(xì)胞中,與野生型相比,3 個(gè)uORF突變型的PPARγ蛋白表達(dá)均極顯著升高,其中uORFs雙突變型表達(dá)載體(pcDNA3.1-cPPARγ5-M12)的 PPARγ 蛋白表達(dá)最高,分別上調(diào)約 1.7 倍(ICP1細(xì)胞)和1.3倍(DF1細(xì)胞),如圖4B所示。以上結(jié)果表明,cPPARγ5 的兩個(gè)uORFs 均抑制下游PPARγ mORF翻譯。

        圖4 uORF突變對(duì)cPPARγ5 mRNA和蛋白表達(dá)的影響Fig.4 Effects of uORF mutation on the expression of cPPARγ5 mRNA and protein

        2.5 5'UTR區(qū)啟動(dòng)子活性檢測(cè)

        5'UTR 在基因組中相應(yīng)DNA 序列通常是啟動(dòng)子一部分。在前述研究中所使用5'UTR報(bào)告基因載體和表達(dá)載體中,uORF 突變可能影響5'UTR 啟動(dòng)子活性,導(dǎo)致報(bào)告基因和PPARγ基因表達(dá)發(fā)生變化。為驗(yàn)證這一推測(cè),將構(gòu)建的啟動(dòng)子報(bào)告基因載 體 pGL3- basic、 pGL3- basic- cPPARγ5- WT、pGL3-basic-cPPARγ5-M1、pGL3-basic-cPPARγ 5-M2 和 pGL3-basic-cPPARγ5-M12 分別轉(zhuǎn)染 ICP1細(xì)胞。報(bào)告基因活性結(jié)果顯示,pGL3-basic-cPPARγ5-WT、pGL3-basic-cPPARγ5-M1、pGL3-basic-cPPARγ5-M2 和 pGL3-basic-cPPARγ5-M12報(bào)告基因活性均極顯著高于pGL3-basic 空載體報(bào)告基因活性(P<0.01),約是pGL3-basic 空載體報(bào)告基因活性5~6倍(見(jiàn)圖5)。

        圖5 cPPARγ5 5'UTR區(qū)啟動(dòng)子活性分析Fig.5 Promoter activity analysis of the 5'UTR of cPPARγ5

        與野生 型 pGL3-basic-cPPARγ5-WT 相比,pGL3-basic-cPPARγ5-M12 啟動(dòng)子活性顯著升高,但升高幅度較?。籶GL3-basic-cPPARγ5-M1 和pGL3-basic-cPPARγ5-M2 啟動(dòng)子活性無(wú)顯著變化(見(jiàn)圖5)。上述結(jié)果表明,cPPARγ5 的5'UTR 區(qū)具有啟動(dòng)子活性,uORFs雙突變?cè)鰪?qiáng)啟動(dòng)子活性,但uORF1或uORF2單獨(dú)突變對(duì)啟動(dòng)子活性影響較小。

        3 討 論

        uORF 普遍存在于真核生物基因mRNA,是真核生物基因表達(dá)轉(zhuǎn)錄后調(diào)控重要元件之一[6,13]。大量研究證實(shí),多數(shù)uORF 主要抑制基因翻譯[14-15],但也有部分uORF 促進(jìn)基因翻譯[16]。除翻譯調(diào)控外,研究發(fā)現(xiàn)uORF還可調(diào)節(jié)mRNA穩(wěn)定性,例如TPO基因 uORF 可導(dǎo)致其 mRNA 降解[17],而GCN4和YAP1 基因 uORF 可增強(qiáng)其 mRNA 穩(wěn)定性[18]。本研究采用報(bào)告基因、qRT-PCR、Western blot 及定點(diǎn)突變等技術(shù)分析發(fā)現(xiàn),cPPARγ5 的uORFs(uORF1 和uORF2)并不影響mRNA 穩(wěn)定性,但抑制下游mORF翻譯。

        前期研究表明,uORF 對(duì)下游mORF 翻譯的抑制作用受uORF 數(shù)量、長(zhǎng)度、uORF 距下游CDS 起始密碼子距離及uORF起始密碼子及其上下游序列影響,uORF 抑制作用可累加,即同一轉(zhuǎn)錄本中uORF 數(shù)量越多,對(duì)下游基因抑制作用越強(qiáng)[19]。Zhang 等在果蠅中發(fā)現(xiàn),基因含有一個(gè)uORF 時(shí),其翻譯效率降低8.38%~30.40%,而基因含有多個(gè)uORF 時(shí),其翻譯效率降低18.4%~60.7%[20]。Chew等對(duì)人、鼠和斑馬魚(yú)轉(zhuǎn)錄本中uORF的生物信息學(xué)分析顯示,uORF 數(shù)量與翻譯效率呈負(fù)相關(guān)[21]。本研究結(jié)果與上述報(bào)道相似,uORF1 和uORF2 雙突變對(duì)報(bào)告基因活性和PPARγ 蛋白表達(dá)的抑制作用顯著高于這兩個(gè)uORF 單獨(dú)突變的抑制作用(見(jiàn)圖4A 和 4B),說(shuō)明 uORF1 和 uORF2 對(duì)下游 mORF 的翻譯抑制具有協(xié)同作用。

        本研究發(fā)現(xiàn),uORF 突變導(dǎo)致hRluc和PPARγ基因mRNA 表達(dá)升高(見(jiàn)圖2A 和圖4A),進(jìn)一步mRNA 穩(wěn)定性分析顯示,uORF 突變對(duì)hRluc基因mRNA 穩(wěn)定性無(wú)顯著影響,如圖3 所示,這表明uORF 突變促進(jìn)基因轉(zhuǎn)錄。許多基因5'UTR 相應(yīng)DNA 序列具有啟動(dòng)子活性,例如Nomura 等發(fā)現(xiàn)V(1b)加壓素受體基因5'UTR 的相應(yīng)DNA 序列具有啟動(dòng)子活性,uORF 抑制5'UTR 啟動(dòng)子活性,抑制該 基因轉(zhuǎn) 錄[22]; Li 等發(fā) 現(xiàn)WNK8 基 因 5'UTR 相應(yīng)DNA序列具有啟動(dòng)子活性,uORF突變可增強(qiáng)該基因啟動(dòng)子活性,促進(jìn)基因轉(zhuǎn)錄[23]。本試驗(yàn)證明cPPARγ5 的 5'UTR 相應(yīng) DNA 序列確實(shí)具有啟動(dòng)子活性,且uORF突變一定程度上增強(qiáng)啟動(dòng)子活性,如圖5 所示,這一結(jié)果表明uORF 突變導(dǎo)致hRluc和PPARγ基因mRNA表達(dá)升高,原因是uORF突變引起5'UTR啟動(dòng)子活性增強(qiáng)。

        雞和哺乳動(dòng)物脂肪生成和代謝不同,例如,雞僅有白色脂肪組織且具有天然高血糖和胰島素抗性,雞脂肪細(xì)胞脂肪分解受胰高血糖素調(diào)節(jié)[24];雞脂肪細(xì)胞分化不需要胰島素,但需要脂肪酸[25]。McClelland 等研究表明人、鼠和雞PPARγ基因5'UTR序列相似性較低,長(zhǎng)度也存在較大差異,且人和鼠PPARγ基因5'UTR中不存在uORF[9-10]。這些數(shù)據(jù)提示,哺乳動(dòng)物和雞PPARγ基因轉(zhuǎn)錄后調(diào)控不同,本研究及cPPARγ1和cPPARγ3的uORF研究均發(fā)現(xiàn),uORF在雞PPARγ基因表達(dá)轉(zhuǎn)錄后調(diào)控中發(fā)揮作用[10,12],uORF 介導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控可能是哺乳動(dòng)物和雞脂肪生成、脂肪發(fā)育和胰島素敏感性表現(xiàn)差異的一個(gè)重要原因。本研究不足之處是缺乏體內(nèi)研究,未來(lái)有必要利用CRISPR/Cas9 技術(shù)分析uORFs 在體內(nèi)PPARγ基因表達(dá)調(diào)控、雞脂肪生成、脂肪細(xì)胞表型維持、胰島素抵抗以及雞體脂過(guò)度沉積中作用和機(jī)制。

        4 結(jié) 論

        cPPARγ5 兩個(gè) uORF 不影響 mRNA 穩(wěn)定性,但抑制下游PPARγ基因mORF的翻譯。

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