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        單核苷酸多態(tài)性微陣列技術(shù)用于胎兒右位主動(dòng)脈弓的產(chǎn)前診斷

        2022-12-13 10:56:24付華鈺許涓涓林莉莉
        關(guān)鍵詞:分析檢測

        李 萌 付華鈺 李 嬌 許涓涓 李 喬 林莉莉

        廣西壯族自治區(qū)婦幼保健院(南寧,530001)

        胎兒主動(dòng)脈弓異常主要是因主動(dòng)脈弓位置、大小或長度及其分支等異常,發(fā)病率1%~3%[1],主動(dòng)脈弓發(fā)育異常見的類型為右位主動(dòng)脈弓(RAA),發(fā)病率約為1/1000[2]。目前不論是產(chǎn)前篩查還是產(chǎn)后確診,都能對RAA及其分支異常進(jìn)行診斷。本文聯(lián)合單核苷酸多態(tài)性微陣列(SNP array)技術(shù)和染色體核型分析對151例胎兒RAA孕婦進(jìn)行產(chǎn)前診斷,探討胎兒 RAA與染色體異常的關(guān)系,并分析SNP array 在胎兒RAA產(chǎn)前診斷中的意義。

        1 對象與方法

        1.1 對象

        2016年1月-2020年12月就診于本院,經(jīng)超聲診斷為 RAA的胎兒151例納入本研究,妊娠時(shí)間≥17周,孕婦年齡20~43歲。經(jīng)孕婦知情同意后,采集羊水或臍血樣本進(jìn)行遺傳學(xué)分析,所有樣本均進(jìn)行了SNP array檢測。

        1.2 檢測方法

        1.2.1染色體核型分析孕婦知情并簽署同意書后,孕17~22周者經(jīng)腹羊膜腔穿刺術(shù)抽取羊水30ml,其中20 ml用于染色體核型分析;對于孕>22周者經(jīng)皮臍靜脈穿刺獲取1~2 ml臍帶血,0.5 ml用于染色體核型分析。每份標(biāo)本計(jì)數(shù)至少20個(gè)分裂相,分析至少5個(gè)核型,若出現(xiàn)嵌合體,計(jì)數(shù)分析至100個(gè)分裂相。參照人類遺傳學(xué)國際命名體制(ISCN 2016)對染色體核型命名。

        1.2.2SNParray檢測孕婦知情并簽署同意書后,穿刺獲取胎兒的羊水或臍帶血樣本。采用廈門致善的Lab-Aid 820核酸提取試劑盒,根據(jù)試劑盒說明書,提取臍帶血中的基因組DNA;利用北京天根生公司生產(chǎn)的微量樣品基因組DNA提取試劑盒提取絨毛和羊水中的基因組DNA。DNA采用分光光度計(jì)測定濃度及純度。采用illumina公司的HumanCytoSNP-12芯片進(jìn)行SNP array分析,根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)操作流程對基因組DNA依次進(jìn)行全基因組擴(kuò)增、片段化、雜交和熒光染色,采用illumina公司的iScan芯片掃描儀對制備的基因芯片進(jìn)行掃描,獲得的數(shù)據(jù)通過KaryoStudio1.4.3軟件進(jìn)行分析。通過與DGV、ISCA、OMIM、DECIPHER、ClinVar等數(shù)據(jù)庫進(jìn)行分析,根據(jù)染色體微陣列分析相關(guān)指南[3],將所檢出的染色體拷貝數(shù)變異(CNV)進(jìn)行致病性分類:①致病性CNV;②可能致病性CNV;③臨床意義不明CNV;④可能良性CNV;⑤良性CNV。

        1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

        采用SPSS 22.0數(shù)據(jù)分析。計(jì)數(shù)資料比較采用卡方檢驗(yàn)。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 染色體核型分析

        151例RAA胎兒的羊水或臍帶血樣本中,染色體核型異常檢出5例(3.3%),分別為唐氏綜合征2例,13-三體綜合征2例,8號(hào)嵌合三體綜合征1例。見表1。

        2.2 SNP array檢測

        151例 RAA胎兒的羊水或臍帶血樣本中,SNP array檢出異常17例(11.3%)。其中13例為致病性, 5例與染色體分析結(jié)果一致。另12例染色體核型未見異常而芯片檢出染色體微缺失/微重復(fù)綜合征,其中8例染色體致病性微缺失, 1例 可疑致病性, 3例臨床意義不明。8例致病性胎兒中,6例為DiGeorge綜合征, 涉及22q11染色體區(qū)段,缺失片段在1.64~3.03Mb。該片段缺失包含了22q11deletion綜合征最關(guān)鍵的基因TBX1,該基因單倍體劑量不足可導(dǎo)致先天性心臟缺陷、精神分裂癥、面部畸形、胸腺和甲狀旁腺異常、喂養(yǎng)和吞咽困難等。1例Xp21.1區(qū)域有0.05Mb的微缺失,該片段缺失包含DMD基因部分片段,DMD基因缺失與杜氏肌營養(yǎng)不良相關(guān)。還有1例涉及Xp11.22區(qū)域存在約0.53Mb純合缺失, 該缺失片段包含1個(gè)OMIM致病基因PHF8基因,該基因與X連鎖Siderius型智力障礙綜合征有關(guān)。另1例為可疑致病,2號(hào)染色體q11.1q37.3區(qū)域存在約147Mb嵌合重復(fù),嵌合比例為20%~30%,2號(hào)染色體長臂重復(fù)包含2q31.1重復(fù)綜合征(OMIM#613681),2q35重復(fù)綜合征(OMIM#185900)區(qū)域。還有3例為臨床意義不明其中有1例樣本11號(hào)染色體p12q13.4區(qū)域存在約33.8Mb純合性區(qū)域(AOH),其臨床意義不明。見表1。

        表1 RAA胎兒的染色體與SNP array檢測結(jié)果

        2.3 檢測結(jié)果比較

        151例樣本如單獨(dú)采用SNP array對染色體異常的檢出率為11.3%(17/151),而單獨(dú)采用染色體核型分析的異常檢出率為3.3%(5/151),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=7.06,P<0.05),說明SNP array技術(shù)在檢測染色體微小畸變方面優(yōu)于染色體核型分析。在12例染色體核型分析未見異常的RAA胎兒中,SNP array檢出8例致病性CNV,增加了5.3%(8/151)的致病檢出率。

        3 討論

        RAA主要發(fā)病機(jī)制是正常胚胎生長發(fā)育時(shí),左側(cè)第4腮動(dòng)脈弓形成主動(dòng)脈弓,右側(cè)第4腮動(dòng)脈弓形成無名動(dòng)脈和右鎖骨下動(dòng)脈。如果左側(cè)第4腮動(dòng)脈弓閉鎖,右側(cè)相應(yīng)血管保留,則形成 RAA[4]。胎兒超聲篩查易發(fā)現(xiàn)胎兒RAA及結(jié)構(gòu)異常,其與染色體異常密切相關(guān)[5-6]。本文中SNP array技術(shù)在檢出染色體非整倍體或染色體重排方面, 與常規(guī)核型分析技術(shù)無很大區(qū)別,但SNP array檢測能發(fā)現(xiàn)常規(guī)核型分析不能檢出的CNV,尤其對產(chǎn)前超聲發(fā)現(xiàn)結(jié)構(gòu)異常者的染色體有高分辨率和高敏感性的優(yōu)點(diǎn),目前SNP array檢測技術(shù)被國內(nèi)與國際細(xì)胞遺傳協(xié)會(huì)推薦為首選方法[7-8]。

        本研究中的151例產(chǎn)前超聲提示RAA的胎兒中,傳統(tǒng)核型分析檢出5 例染色體數(shù)目異常,檢出率為3.3%, 主要為染色體非整倍體綜合征。本研究與相關(guān)文獻(xiàn)[9-10]報(bào)道顯示,大多數(shù)RAA胎兒具有正常的染色體數(shù)目。在核型正常的146例胎兒中通過SNP array檢測8例攜帶致病性CNVs,1例可疑致病性CNVs,3例臨床意義不明的CNVs,證明SNP array技術(shù)檢測出的亞顯微染色體異常,大部分不能通過常規(guī)染色體核型檢測出來,SNP array的檢出染色體異常的敏感性遠(yuǎn)高于傳統(tǒng)的核型分析技術(shù), SNP array技術(shù)能檢測全基因組亞顯微水平的染色體變異,包括染色體微重復(fù)、微缺失、雜合性缺失以及嵌合體等。

        主動(dòng)脈弓異常與染色體異常,特別是與22q11.2微缺失的密切相關(guān), 該區(qū)域涉及艾斯伯格綜合征(Digeor syndrome),包含關(guān)鍵基因TBX1。Allessandra等[11]的研究顯示22q11.2微缺失綜合征患者臨床表現(xiàn)為異質(zhì)性,部分患者有常見的結(jié)構(gòu)畸形,但是缺乏典型的精神發(fā)育遲緩等臨床癥狀,說明某些染色體外顯率和表現(xiàn)度方面的差異,可造成患者臨床表型的各異。本研究中檢出的12例CNVs胎兒中,有6例22q11.2微缺失綜合征(2/30,6.7%),均表現(xiàn)為2種以上的畸形,1例胎兒單純的RAA合并迷走右鎖骨下動(dòng)脈,而另1例合并室間隔缺損、法洛四聯(lián)癥、胼胝體缺如、單臍動(dòng)脈。說明 RAA異常不論是否合并其他心內(nèi)外畸形,都可能與遺傳相關(guān)。本研究RAA胎兒中 22q11.2微缺失綜合征的檢出率4.0%,與文獻(xiàn)報(bào)道[12]接近。這些結(jié)果都表明,RAA胎兒與22q11.2綜合征有一定的相關(guān)性,即使沒有發(fā)現(xiàn)其他心內(nèi)外畸形,RAA也可能與遺傳異常相關(guān)。

        本病例中檢測到1例樣本Xp21.1區(qū)域約0.048Mb純合缺失,為致病CNVs。該片段缺失包含DMD基因部分片段,DMD基因缺失與杜氏肌營養(yǎng)不良相關(guān)。還有一例X染色體p11.22區(qū)域存在約0.53Mb純合缺失,為致病性CNVs。該片段缺失在ClinGen、ClinVar及Decipher數(shù)據(jù)庫中均未見致病性病例報(bào)道。該缺失片段包含1個(gè)OMIM致病基因PHF8基因,該基因與X連鎖Siderius型智力障礙綜合征有關(guān),且為單倍劑量不足敏感性基因,有文獻(xiàn)報(bào)道該基因截短突變可導(dǎo)致智力障礙、顱面部異?;虼搅?腭裂等表型[13]。另外本文檢出3例臨床意義不明的病例。但因?yàn)槠浒幕蚩赡芘c疾病相關(guān),對于遺傳咨詢和進(jìn)一步追蹤隨訪提供了理論依據(jù)。

        綜上所述,目前胎兒RAA是侵入性產(chǎn)前診斷的重要指征,經(jīng)B超檢測到RAA的胎兒,染色體異常發(fā)生率較高,以非整倍體為主。行SNP array分析檢查可獲得更多的遺傳學(xué)信息,為胎兒 RAA的遺傳咨詢、預(yù)后評(píng)估以及臨床干預(yù)提供全面和準(zhǔn)確的信息。

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