◎ 林 杰
(廈門市產(chǎn)品質(zhì)量監(jiān)督檢驗(yàn)院,福建 廈門 361004)
克羅諾桿菌是一種危險(xiǎn)性極高的致病菌。有研究表明,嬰幼兒奶粉、奶酪、腌肉、飲用水和蔬菜等多種日常食品中均可能檢測出此種致病菌[1]。在一些新生兒克羅諾桿菌感染事件的調(diào)查結(jié)果中,這些受感染的新生兒都是食用了嬰幼兒奶粉后才出現(xiàn)了相關(guān)癥狀,經(jīng)檢測確定為克羅諾桿菌感染。近年來,隨著一系列與此種病菌相關(guān)的奶粉召回以及其他重大事件的爆發(fā),克羅諾桿菌污染問題已經(jīng)受到了全世界的廣泛關(guān)注?;诖耍接懭绾慰焖偻瓿蓪κ称分惺欠窈锌肆_諾桿菌檢測的必要性。
克羅諾桿菌原名阪崎腸桿菌,在人和動(dòng)物的腸道內(nèi)生活,屬于兼性厭氧革蘭氏陰性桿菌,隸屬于腸桿菌科??肆_諾桿菌是一種致病劑量較低的食源性致病菌,廣泛存在于嬰幼兒奶粉、肉類、飲用水和蔬菜中。寄生在人和動(dòng)物的腸道之后(是一種有周生鞭毛,能運(yùn)動(dòng)的無芽孢桿菌),可引起菌血癥、腦膜炎、壞死性小腸結(jié)腸炎等疾病。近年來發(fā)生的多起克羅諾桿菌感染事件表明,嬰幼兒是該菌感染的高危人群,一旦引發(fā)相關(guān)疾病,致死率最高可達(dá)80%。目前,已經(jīng)探明的克羅諾桿菌共有7個(gè)菌種,分別為阪崎克羅諾桿菌、丙二酸鹽克羅諾桿菌、蘇黎世克羅諾桿菌、莫金斯克羅諾桿菌、康帝蒙提克羅諾桿菌、尤尼沃斯克羅諾桿菌和都柏林克羅諾桿菌(可進(jìn)一步分為都柏林亞種、奶粉亞種、洛桑亞種)。
目前,世界各國已經(jīng)從分類、分型、檢測、生化特性、致病性和污染源等方面對克羅諾桿菌進(jìn)行研究,結(jié)果表明,與其他食源性致病菌相比,該菌對絕大多數(shù)人都不存在致病性,即使攝入人體內(nèi),也能夠在腸道內(nèi)與其他菌群“和諧相處”。但對包含嬰幼兒在內(nèi)的一些特定人群,克羅諾桿菌的致病率和致死率卻較高,而目前學(xué)界尚未探明克羅諾桿菌因何原因致特定人群感染嚴(yán)重疾病?;诖?,只能采取“一刀切”政策,即對各類可能與人類、動(dòng)物(主要是家養(yǎng)寵物、養(yǎng)殖牲畜、家禽等)密切接觸的物品進(jìn)行檢測時(shí),將克羅諾桿菌作為一項(xiàng)重點(diǎn)檢測內(nèi)容。
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)技術(shù)英文全稱Polymerase Chain Reaction,簡稱PCR,可被視為“生物體外特殊DNA復(fù)制”。此種鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的過程如下。①將一種物質(zhì)的DNA自生物體內(nèi)取出,放置于95 ℃的高溫環(huán)境下,此時(shí),DNA會“變性”成單鏈狀態(tài)。②降低環(huán)境溫度(一般控制在60 ℃左右)后,單鏈與引物的堿基會自動(dòng)完成“互補(bǔ)配對”。③再次升高環(huán)境溫度(此時(shí)無需升高至步驟①的程度,只需控制在72 ℃左右即可,而該溫度是最適合DNA聚合酶反應(yīng)的溫度),此時(shí),DNA聚合酶會沿著磷酸到五碳糖的方向完成互補(bǔ)鏈的合成??傮w而言,PCR技術(shù)可視為“模擬DNA天然復(fù)制的過程”,特異性依賴于與靶序列兩端互補(bǔ)的寡核苷酸引物,經(jīng)過上述3個(gè)階段后,會合成一條新的與模板DNA鏈互補(bǔ)的半保留復(fù)制鏈重復(fù)循環(huán)變性--退火--延伸3過程,就可獲得更多的“半保留復(fù)制鏈”,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。每完成一個(gè)循環(huán)需2~4 min,2~3 h就能將待擴(kuò)增目的基因擴(kuò)增放大幾百萬倍[2]。由此可見,使用PCR技術(shù)監(jiān)測克羅諾桿菌時(shí),即使按照最傳統(tǒng)、最原始的PCR合成方法,只需數(shù)個(gè)小時(shí)便可確定被檢測物品內(nèi)是否含有克羅諾桿菌。
此種技術(shù)的本質(zhì)仍然是PCR技術(shù),是指在DNA擴(kuò)增反應(yīng)的過程中,使用熒光化學(xué)物質(zhì),對PCR循環(huán)后產(chǎn)物的總量進(jìn)行測量,并通過內(nèi)參法或外參法,對檢測樣品中特定的DNA序列進(jìn)行定量分析。具體而言,在PCR擴(kuò)增的指數(shù)時(shí)期,檢測模板的CT值(循環(huán)閾值)以及其拷貝數(shù)之間存在一種線性關(guān)系,而此種關(guān)系可以作為定量的依據(jù)。采用熒光定量PCR技術(shù)檢測克羅諾桿菌的具體方法分為2種。①SYBRGreen I法。在PCR反應(yīng)過程中,加入過量的SYBR熒光染料,該染料具有特異性,摻入DNA的雙鏈后,能夠發(fā)射熒光信號,而沒有摻入鏈中的染料分子不會發(fā)射熒光信號。因此,SYBR熒光信號增加速度與PCR產(chǎn)物增加速度完全一致,只需繪制出SYBR定量PCR擴(kuò)增熒光曲線圖,并與克羅諾桿菌DNA天然復(fù)制的曲線圖進(jìn)行比對,即可判斷檢測樣本中是否含有克羅諾桿菌。②TaqMan探針法。此種方法的本質(zhì)與SYBRGreen I法并無二致,同樣需要使熒光信號的積累(增長)與PCR產(chǎn)物的形成保持同步。實(shí)現(xiàn)方法為:在探針的完整程度尚未被破壞時(shí),報(bào)告基團(tuán)發(fā)射的熒光信號會被淬滅基團(tuán)吸收;當(dāng)PCR處于擴(kuò)增階段時(shí),Taq酶的5′-3′外切酶的活性將受探針酶的“切割”,進(jìn)而降解。此時(shí),報(bào)告熒光基團(tuán)和淬滅熒光基團(tuán)將會分離,之后便可使熒光監(jiān)測系統(tǒng)收到相應(yīng)的(熒光)信號。而隨著一條DAN鏈的形成,一個(gè)新的熒光分子也會同時(shí)間形成。
等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)全稱“基于恒溫?cái)U(kuò)增的核酸擴(kuò)增技術(shù)”,包含環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增、交叉引物擴(kuò)增、鏈替代擴(kuò)增、重組酶聚合酶擴(kuò)增、依賴核酸序列的擴(kuò)增、依賴解旋酶的擴(kuò)增和滾環(huán)擴(kuò)增共7種具體類型[3]。受篇幅所限,本文以環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增為例進(jìn)行介紹。使用該技術(shù)檢測克羅諾桿菌等病原菌的過程如下。①將內(nèi)引物與目的基因相結(jié)合,在BstDNA聚合酶的作用下,可延伸為雙鏈。②外引物與雙鏈DNA的5′端會相互結(jié)合,并在一端形成環(huán)狀結(jié)構(gòu)。另一端經(jīng)歷的過程與此相同,最終會形成“兩端都有環(huán)狀結(jié)構(gòu),類似一個(gè)啞鈴”的結(jié)構(gòu)形態(tài)。③啞鈴狀結(jié)構(gòu)形態(tài)的單鏈DNA兼具模板和引物的功能,一旦受到Bst聚合酶的催化作用,便可延伸。④內(nèi)引物同樣能夠與環(huán)狀結(jié)構(gòu)相結(jié)合,并在聚合酶催化作用下延伸。相較于PCR技術(shù),環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)無需模板的熱變形、溫度循環(huán)等過程,在30~60 min內(nèi),即可完成對檢測樣本的核酸擴(kuò)增反應(yīng),檢測過程簡單、快速且特異性較強(qiáng)。
從克羅諾桿菌本身的特性出發(fā),可針對其特點(diǎn)制定出一種專用于檢測該菌的分子生物檢測技術(shù)。比如克羅諾桿菌具有革蘭氏陰性、α-葡萄糖苷酶活性、可產(chǎn)生黃色素等特性?;诖耍袑W(xué)者創(chuàng)設(shè)了一種只適用于克羅諾桿菌的檢測過程。①使用必不可少的重要物質(zhì)——萬古霉素(一種糖肽類抗生素)和月桂基硫酸鹽,目的在于:檢測樣本中可能含有多種真菌、細(xì)菌(其中的很多菌種并不具有致病性,但在檢測過程中有可能影響對克羅諾桿菌的檢測結(jié)果),需要抑制陽性細(xì)菌的生長,從而保證克羅諾桿菌等革蘭氏陰性菌有較大的生長優(yōu)勢。②使用顯色培養(yǎng)基對經(jīng)過初步處理的樣本進(jìn)行培養(yǎng),原理在于:克羅諾桿菌內(nèi)獨(dú)有的α-葡萄糖苷酶被活性水解后,會使培養(yǎng)基的第五顏色出現(xiàn)明顯的變化。而考慮到檢測樣本中可能同時(shí)存在不止一種腸桿菌科細(xì)菌,故需借助硝基苯-α-葡萄糖吡喃苷等物質(zhì)加以區(qū)分(體現(xiàn)在顏色方面,上文提到,克羅諾桿菌能夠產(chǎn)生黃色素,故與硝基苯-α-葡萄糖吡喃苷等反應(yīng)之后,培養(yǎng)基底物的顏色變化會產(chǎn)生明確的指向性,有助于檢測人員判斷)。③根據(jù)培養(yǎng)基底物顏色變化,進(jìn)一步提出其他革蘭氏陰性菌等雜菌之外,便可以根據(jù)克羅諾桿菌的發(fā)酵特性、氧化酶活性、檸檬酸水解活性等生化特性,再一次確定檢測樣本中是否真正含有克羅諾桿菌。該檢測方式基于克羅諾桿菌的特性而設(shè)定,從原理上來說,只要有一個(gè)過程并不符合對應(yīng)的結(jié)果,比如培養(yǎng)基底物顏色變化環(huán)節(jié),如果并未出現(xiàn)克羅諾桿菌與硝基苯-α-葡萄糖吡喃苷反應(yīng)后對應(yīng)的顏色,實(shí)際上已經(jīng)說明檢測樣本中不含有該菌。從相反方向進(jìn)行分析,進(jìn)入最后一個(gè)環(huán)節(jié)——基于發(fā)酵特性、氧化酶活性進(jìn)行檢測時(shí),是為了對最終檢測結(jié)果進(jìn)行“定性”。
免疫磁珠是一種新型免疫學(xué)檢測技術(shù),是指將固化試劑的優(yōu)點(diǎn)與免疫反應(yīng)的高度特異性相結(jié)合,并基于免疫學(xué)開展的檢測技術(shù)。具體原理為:運(yùn)用核-殼的合成方法,完成含有超順磁性物質(zhì)高分子表面覆蓋的復(fù)合材料,以及具有較強(qiáng)穩(wěn)定性,能夠進(jìn)行后期標(biāo)記物質(zhì)的合成。在檢測過程中,利用這些物質(zhì)表面的功能集團(tuán)(主要有氨基、羧基等),實(shí)現(xiàn)抗體的共價(jià)或非共價(jià)偶聯(lián)。在此基礎(chǔ)上,將特定的抗原或抗體(可視為檢測樣本)與上述物質(zhì)相結(jié)合之后,在外加磁場的吸引作用下,檢測樣本中的很多物質(zhì)會發(fā)生定向移動(dòng),進(jìn)而完成分離、監(jiān)測、基因純化等目的。采用此種方法檢測樣本中是否含有克羅諾桿菌的原理為:克羅諾桿菌抗體能夠與磁珠相結(jié)合,形成一種“抗克羅諾桿菌免疫磁珠”,可明顯提升核酸檢測靈敏度[4]。
該技術(shù)是指利用抗體分子、抗原分子特異性相結(jié)合的特點(diǎn),使處于游離狀態(tài)的雜蛋白和結(jié)合于固相載體的目的蛋白相結(jié)合。在此基礎(chǔ)上,利用經(jīng)過特殊標(biāo)記的標(biāo)記物,對檢測樣本進(jìn)行定性、定量分析。具體而言,抗原或抗體會吸附在檢測樣本固相的表面,且免疫活性在很長一段時(shí)間內(nèi)都能有效留存。此時(shí)向其中加入酶,可通過共價(jià)鍵形成酶結(jié)合物,并保持各自的免疫活性與酶活性。此時(shí)再加入檢測底物,根據(jù)顏色的變化情況,可確定免疫反應(yīng)是否發(fā)生。從一定程度上來看,此種技術(shù)與上文提到的克羅諾桿菌特定生物化學(xué)檢測技術(shù)有部分相似之處。
此種技術(shù)是將重組酶聚合酶等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)與免疫層析試紙條技術(shù)相結(jié)合,形成一種能夠在20 min內(nèi)確定檢測樣本中是否含有克羅諾桿菌的技術(shù)。具體的檢測過程如下。①將檢測樣本從-80 ℃的環(huán)境中取出,置于冰盒上,取100 μL加入10 mL LB液體培養(yǎng)基中,37 ℃、200 r·min-1過夜培養(yǎng)。次日取出,按照細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒說明書提取細(xì)菌DNA,DNA于-20 ℃保存?zhèn)溆谩"谕瓿赡z體金試紙條的制備。③選擇NC膜,完成樣品展開液的優(yōu)化處理之后,重點(diǎn)針對檢測樣本的特異性和靈敏度進(jìn)行檢測。具體方法遵照GB/T 4789.40—2016標(biāo)準(zhǔn)。將檢測結(jié)果與標(biāo)準(zhǔn)參照表進(jìn)行對比,即可了解樣本中是否存在克羅諾桿菌[5]。
克羅諾桿菌對特定人群有較強(qiáng)的致病性,而感染人群(主要是嬰幼兒)的途徑包含多種食品(主要是嬰幼兒奶粉)。從保證食品安全角度來看,針對流入市場的食品進(jìn)行全方位檢測是必要的,也是無可置疑的。但從行業(yè)發(fā)展及管理的角度來看,檢測過程耗時(shí)同樣是大問題。如一些新鮮的果蔬,如果檢測時(shí)間較長,新鮮度便會降低,導(dǎo)致賣不上價(jià)?;诖?,必須找到能夠在短時(shí)間內(nèi)精準(zhǔn)確定樣本中是否含有克羅諾桿菌的方法。本文介紹的PCR技術(shù),針對克羅諾桿菌的特定檢測技術(shù)都能夠產(chǎn)生良好的效果,可推廣應(yīng)用。